Increased aerobic metabolism is essential for the beneficial effects of caloric restriction on yeast life span

Calorie restriction is a dietary regimen capable of extending life span in a variety of multicellular organisms. A yeast model of calorie restriction has been developed in which limiting the concentration of glucose in the growth media of Saccharomyces cerevisiae leads to enhanced replicative and chronological longevity. Since S. cerevisiae are Crabtree-positive cells that present repression of aerobic catabolism when grown in high glucose concentrations, we investigated if this phenomenon participates in life span regulation in yeast. S. cerevisiae only exhibited an increase in chronological life span when incubated in limited concentrations of glucose. Limitation of galactose, raffinose or glycerol plus ethanol as substrates did not enhance life span. Furthermore, in Kluyveromyces lactis, a Crabtree-negative yeast, glucose limitation did not promote an enhancement of respiratory capacity nor a decrease in reactive oxygen species formation, as is characteristic of conditions of caloric restriction in S. cerevisiae. In addition, K. lactis did not present an increase in longevity when incubated in lower glucose concentrations. Altogether, our results indicate that release from repression of aerobic catabolism is essential for the beneficial effects of glucose limitation in the yeast calorie restriction model. Potential parallels between these changes in yeast and hormonal regulation of respiratory rates in animals are discussed.

Disruption of the circadian clock within the cardiomyocyte influences myocardial contractile function, metabolism, and gene expression

Virtually every mammalian cell, including cardiomyocytes, possesses an intrinsic circadian clock. The role of this transcriptionally based molecular mechanism in cardiovascular biology is poorly understood. We hypothesized that the circadian clock within the cardiomyocyte influences diurnal variations in myocardial biology. We, therefore, generated a cardiomyocyte-specific circadian clock mutant (CCM) mouse to test this hypothesis. At 12 wk of age, CCM mice exhibit normal myocardial contractile function in vivo, as assessed by echocardiography. Radiotelemetry studies reveal attenuation of heart rate diurnal variations and bradycardia in CCM mice (in the absence of conduction system abnormalities). Reduced heart rate persisted in CCM hearts perfused ex vivo in the working mode, highlighting the intrinsic nature of this phenotype. Wild-type, but not CCM, hearts exhibited a marked diurnal variation in responsiveness to an elevation in workload (80 mmHg plus 1 mu M epinephrine) ex vivo, with a greater increase in cardiac power and efficiency during the dark (active) phase vs. the light (inactive) phase. Moreover, myocardial oxygen consumption and fatty acid oxidation rates were increased, whereas cardiac efficiency was decreased, in CCM hearts. These observations were associated with no alterations in mitochondrial content or structure and modest mitochondrial dysfunction in CCM hearts. Gene expression microarray analysis identified 548 and 176 genes in atria and ventricles, respectively, whose normal diurnal expression patterns were altered in CCM mice. These studies suggest that the cardiomyocyte circadian clock influences myocardial contractile function, metabolism, and gene expression.

Screening of ARHSP-TCC Patients Expands the Spectrum of SPG11 Mutations and Includes a Large Scale Gene Deletion

Autosomal recessive spastic paraplegia with thinning of corpus callosum (ARHSP-TCC) is a complex form of HSP initially described in Japan but subsequently reported to have a worldwide distribution with a particular high frequency in multiple families from the Mediterranean basin. We recently showed that ARHSP-TCC is commonly associated with mutations in SPG11/KIAA1840 on chromosome 15q. We have now screened a collection of new patients mainly originating from Italy and Brazil, in order to further ascertain the spectrum of mutations in SPG11, enlarge the ethnic origin of SPG11 patients, determine the relative frequency at the level of single Countries (i.e., Italy), and establish whether there is one or more common mutation. In 25 index cases we identified 32 mutations; 22 are novel, including 9 nonsense, 3 small deletions, 4 insertions, 1 in/del, 1 small duplication, 1 missense, 2 splice-site, and for the first time a large genomic rearrangement. This brings the total number of SPG11 mutated patients in the SPATAX collection to 111 cases in 44 families and in 17 isolated cases, from 16 Countries, all assessed using homogeneous clinical criteria. While expanding the spectrum of mutations in SPG11, this larger series also corroborated the notion that even within apparently homogeneous population a molecular diagnosis cannot be achieved without full gene sequencing. (C) 2008 Wiley-Liss, Inc.

Low-Frequency Noise in Field-Effect Devices Functionalized With Dendrimer/Carbon-Nanotube Multilayers

Low-frequency noise in an electrolyte-insulator- semiconductor (EIS) structure functionalized with multilayers of polyamidoamine (PAMAM) dendrimer and single-walled carbon nanotubes (SWNT) is studied. The noise spectral density exhibits 1/f(gamma) dependence with the power factor of gamma approximate to 0.8 and gamma = 0.8-1.8 for the bare and functionalized EIS sensor, respectively. The gate-voltage noise spectral density is practically independent of the pH value of the solution and increases with increasing gate voltage or gate-leakage current. It has been revealed that functionalization of an EIS structure with a PAMAM/SWNTs multilayer leads to an essential reduction of the 1/f noise. To interpret the noise behavior in bare and functionalized EIS devices, a gate-current noise model for capacitive EIS structures based on an equivalent flatband-voltage fluctuation concept has been developed.

Estimating complex cortical networks via surface recordings-A critical note

We discuss potential caveats when estimating topologies of 3D brain networks from surface recordings. It is virtually impossible to record activity from all single neurons in the brain and one has to rely on techniques that measure average activity at sparsely located (non-invasive) recording sites Effects of this spatial sampling in relation to structural network measures like centrality and assortativity were analyzed using multivariate classifiers A simplified model of 3D brain connectivity incorporating both short- and long-range connections served for testing. To mimic M/EEG recordings we sampled this model via non-overlapping regions and weighted nodes and connections according to their proximity to the recording sites We used various complex network models for reference and tried to classify sampled versions of the ""brain-like"" network as one of these archetypes It was found that sampled networks may substantially deviate in topology from the respective original networks for small sample sizes For experimental studies this may imply that surface recordings can yield network structures that might not agree with its generating 3D network. (C) 2010 Elsevier Inc All rights reserved

Mechanosensitivity of astrocytes on optimized polyacrylamide gels analyzed by quantitative morphometry

Cells are able to detect and respond to mechanical cues from their environment. Previous studies have investigated this mechanosensitivity on various cell types, including neural cells such as astrocytes. In this study, we have carefully optimized polyacrylamide gels, commonly used as compliant growth substrates, considering their homogeneity in surface topography, mechanical properties, and coating density, and identified several potential pitfalls for the purpose of mechanosensitivity studies. The resulting astrocyte response to growth on substrates with shear storage moduli of G` = 100 Pa and G` = 10 kPa was then evaluated as a function of coating density of poly-D-lysine using quantitative morphometric analysis. Astrocytes cultured on stiff substrates showed significantly increased perimeter, area, diameter, elongation, number of extremities and overall complexity if compared to those cultured on compliant substrates. A statistically significant difference in the overall morphological score was confirmed with an artificial intelligence-based shape analysis. The dependence of the cells` morphology on PDL coating density seemed to be weak compared to the effect of the substrate stiffness and was slightly biphasic, with a maximum at 10-100 mu g ml(-1) PDL concentration. Our finding suggests that the compliance of the surrounding tissue in vivo may influence astrocyte morphology and behavior.

THE SOUTHERN BRAZILIAN SHELF: GENERAL CHARACTERISTICS, QUATERNARY EVOLUTION AND SEDIMENT DISTRIBUTION

Extending from latitude 34 degrees S to 22 degrees S the Southern Brazilian shelf constitutes the only part of the Brazilian shelf with a subtropical to temperate environment. The studies on the different geological aspects of the area began in the 1960`s and have recently been reassessed after studies related to the determination of the Economic Exclusive Zone. In terms of morphology, the Southern Brazilian shelf may be divided into three sectors, the Sao Paulo Bight, the Florianopolis-Mostardas Sector and the Rio Grande Cone, characterized by conspicuous differences in terms of geological determining factors, bathymetry, declivities and the presence of canyons and channels. Despite the existence of hundreds of radiocarbon datings the sea level changes curve of southern Brazil during the Last Glacial Cycle is still a matter of debate. A recent controversy on the Middle and late Holocene sea level changes curve raised the question of the amplitude of the oscillations which occurred in the period. Also, a few but relatively consistent radiocarbon datings suggest the occurrence of a high sea level during Isotope Stage 3. In terms of sedimentary cover the Southern Brazilian shelf exhibits a very strong hydrodynamic control, both latitudinal and bathymetrical. The sector southward from 25 degrees S is characterized by the influence of the plume of water carrying sediments originating from the Rio de La Plata. Actually its presence is conspicuous up to 28 degrees S, with the area between this latitude and 25 degrees S constituting a transitional zone. In terms of bathymetry the outer shelf is marked by the ""floor-polisher"" effect of the Brazil Current, which is responsible for the maintenance of a relict facies in areas deeper than 100 meters.

Reactions of toluquinone - cyclopentadiene Diels -Alder epoxide adducts with nucleophiles under heterogeneous conditions

Toluquinone-cyclopentadiene Diels-Alder epoxide adducts react with sulfur and oxygen nucleophiles under heterogeneous conditions, leading to products resulting from the epoxide ring opening and from skeletal rearrangement, respectively. Pyrolysis of the sulfanyl adducts gave the new 3-sulfanyltoluquinones (1).

(+)- and (-)-Mutisianthol: First Total Synthesis, Absolute Configuration, and Antitumor Activity

The first synthesis of the natural product (+)-mutisianthol was accomplished in 11 steps and in 21% overall yield from 2-methylanisole. The synthesis of its enantiomer was also performed in a similar overall yield. The absolute configuration of the sesquiterpene (+)-mutisianthol was assigned as (1S,3R). Key steps in the route are the asymmetric hydrogenation of a nonfunctionalized olefin using chiral iridium catalysts and the ring contraction of 1,2-dihydronaphthalenes using thallium(III) or iodine(III). The target molecules show moderate activity against the human tumor cell lines SF-295, HCT-8, and MDA-MB-435.

SMS-avisering - utveckling av prototyp för elektronisk avisering hos speditionsföretag

Detta examensarbete på magisternivå genomfördes med MaserFrakt som uppdragsgivare. Målet var att skapa en möjlighet till att ersätta dagens pappersavi med ett SMS. Detta har vi uppnått genom att utveckla en webbaserad prototyp som kan ersätta utskriften och utskicket av avin genom att skicka ut ett fördefinierat SMS. Att pappersavin ersätts av ett SMS tjänar både MaserFrakt och deras kunder på eftersom det leder till snabbare leverans för kunderna och dessutom minskar MaserFrakt sitt godslager och sänker sina utskickskostnader då ett SMS är billigare att skicka än ett brev.Vi har även undersökt möjligheterna till en ännu tidigare avisering där SMS:et skulle gå ut redan innan godset fysiskt inkommer till MaserFrakt. Detta kom vi fram till skulle kunna vara fullt genomförbart även om man skulle vara tvungen att genomföra ett antal förändringar, till exempel skulle relationen med samarbetetspartnern DFDS behöva förstärkas så att MaserFrakt får en bättre tillgång till deras system.Vårt tillvägagångssätt har för den teoretiska delen av arbetet byggt på kvalitativa intervjuer och inläsning av olika befintliga teorier inom mobilitet, IT-tjänster, systemarkitektur samt analys av teorierna. För det praktiska framtagandet av prototypen har vi använt oss av utvalda delar ifrån David Siegels modell som beskriver hur man utvecklar webbsidor.

Datakvalitet. Ett måste för en kostnadsmedveten organisation

Uppsatsen visar resultatet av en kartläggning och analys av datakvaliteten i databasen Vägdatabanken på Vägverket. Vi har studerat datakvaliteten som den visar sig hos slutanvändarna, i detta fall de som upphandlar drift och underhåll av statliga vägar. Målet var att se hur väl Vägverkets krav på data stämmer överens med användarnas behov. För att nå målet skapades en modell med sju faser. Centralt var kartläggningen av verksamheten med hjälp av intervjuer, som blev grunden för vidare analyser. En egen modell var nödvändig eftersom arbetssättet, att utgå från användarna, inte är det vedertagna sättet att undersöka datakvalitet.Resultatet visar en rad kostnader som kan härröras till bristande datakvalitet varav många är dolda. Trovärdigheten är viktig i samband med datakvalitet. Användarna litar inte på data vilket skapar direkta kostnader, merarbete med mera. Det beror i sin tur på att det brister i insamlingen av data. Ett problem är att en rad olika arbetssätt och förhållningssätt till data i Vägdatabanken förekommer. Därför rekommenderas att Vägverket beslutar vilket arbetssätt som är ekonomiskt och funktionellt bäst.Syftet var att beskriva begreppet datakvalitet. Resultatet av praktiskt arbete och teoretiska studier ger definitionen "Datakvalitet är datas förmåga att vara förståelig och trovärdig samt tillräckligt väl uppfylla användarens behov".

Skillnaden mellan nykteristers egna skäl till att inte dricka alkohol och icke-nykteristers tro om dessa skäl

Denna rapport redovisar en studie av skillnader mellan nykteristers faktiska skäl till att inte dricka och icke-nykteristers tro om nykteristers skäl till att inte dricka alkohol. Studien utfördes i enkätform bland 19-25 åringar på Högskolan Dalarna samt medlemmar i Ungdomens Nykterhetsförbund. Studien visar att det finns signifikanta skillnader mellan de faktiska skäl nykterister anger till att inte dricka alkohol och vad icke-nykterister tror att nykterister har för skäl till att inte dricka alkohol.

Konstruktion av en Marknadsplats i .NET för Högskolan Dalarna

Vi har i vårat examensarbete tagit fram en e-marknadsplats i för Högskolan Dalarna. Marknadsplatsen är programmerad i asp.NET och vb.NET. Fram tills idag har skolans anslagstavlor använts flitigt för annonsering av, inte bara studentlitteratur, utan allt från pennor till bilar. Högskolan Dalarna har därför en önskan om att få en e-marknadsplats där studenter har möjlighet att annonsera.

Utveckling av en mobiltelefontjänst för att spela in TV-program på din dator från distans

Denna rapport är resultatet av kursen Examensarbete i Informatik på Högskolan Dalarna. Examensarbetet är uppdelat i två delar. Ena delen har som syfte att ge en förstagångsanvändare en introduktion i Mobile.NET. Här beskrivs även vissa skillnader mot traditionell ASP. Andra delen, som uppfyller målet har varit att utveckla en tjänst som gör det möjligt att spela in tv-program på en dator från olika mobila enheter samt pc. Det arbete som föranlett rapporten har bestått av en egenhändigt framtagen metod som hämtat inspiration från Direct-modellen samt Polyas generella metod.Slutsatserna som framkommit är att det idag inte finns tillräckligt bra wap-tjänster som lockar allmänheten att wappa. Mobiltelefonen kommer till sin fulla rätt som en förlängd fjärr-kontroll, som kan integrera människan med hemmet på långa avstånd. För att utvecklingen av wap-tjänster ska ta fart krävs högre prestanda och nya idéer om tjänster. En tanke är att fler tjänster och nya idéer kommer ta fart nu när Microsoft släppt sitt utvecklingsverktyg Mobile Internet Toolkit. Nu behöver utvecklaren inte göra en tillämpning för varje mobilenhet. Kanske kommer denna rapport väcka en ny tanke om vad wap-tjänster kan göra.

Framtagning av lämplig teknologi för konvertering av VBA-applikation till Internet Explorer

Företaget GUTAB använder idag en frågeanalysmodul som är utvecklat i Visual Basic for Applications i Microsoft Excel. GUTAB fann det intressant att veta om modulen kunde konverteras till webbläsaren Internet Explorer samt vilken teknologi som var lämplig för detta. GUTAB var även intresserade av att veta vilken teknologi som kunde användas för att skapa grafiska manipulerbara objekt.En skrivbordsundersökning genomfördes som omfattade teknologierna ASP, ASP.NET, JSP, PHP, ActiveX samt Java applets. Skrivbordsundersökningen utgjordes av två delar där den första delen redogjorde för de två klientbaserade teknologierna ActiveX och Java applets med vilka grafiska manipulerbara objekt kunde realiseras. GUTAB ansåg att ActiveX program var mest lämpliga för detta ändamål.Baserat på skrivbordsundersökningens andra del bestämde GUTAB att ASP och ASP.NET skulle användas för att testa teknologiernas kapacitet att konvertera programlogik samt grafiska objekt från VBA-applikationen i en webbapplikation då dessa två teknologier ansågs som mest lämpliga för en konvertering.Testet som genomfördes visade att det var fullt möjligt att konvertera utvald funktionalitet med båda teknologierna. Dock kunde inte grafiska objekt skapas i asp varför befintliga objekt användes för det ändamålet. Många fördelar identifierades med ASP.NET varför GUTAB beslutade att ASP.net var den mest lämpliga teknologin att använda vid en eventuell konvertering.