Chemistry and structure by design: ordered CuNi(CN)4 sheets with copper(II) in a square-planar environment

Layered copper–nickel cyanide, CuNi(CN)4, a 2-D negative thermal expansion material, is one of a series of copper(II)-containing cyanides derived from Ni(CN)2. In CuNi(CN)4, unlike in Ni(CN)2, the cyanide groups are ordered generating square-planar Ni(CN)4 and Cu(NC)4 units. The adoption of square-planar geometry by Cu(II) in an extended solid is very unusual.

Structure-based energetics of protein interfaces guides foot-and-mouth disease virus vaccine design

Virus capsids are primed for disassembly, yet capsid integrity is key to generating a protective immune response. Foot-and-mouth disease virus (FMDV) capsids comprise identical pentameric protein subunits held together by tenuous noncovalent interactions and are often unstable. Chemically inactivated or recombinant empty capsids, which could form the basis of future vaccines, are even less stable than live virus. Here we devised a computational method to assess the relative stability of protein-protein interfaces and used it to design improved candidate vaccines for two poorly stable, but globally important, serotypes of FMDV: O and SAT2. We used a restrained molecular dynamics strategy to rank mutations predicted to strengthen the pentamer interfaces and applied the results to produce stabilized capsids. Structural analyses and stability assays confirmed the predictions, and vaccinated animals generated improved neutralizing-antibody responses to stabilized particles compared to parental viruses and wild-type capsids.

Categories & order systems: Claude Parent and The Serving Library intersections of architecture, art and editorial design

This paper discusses the work of Claude Parent and The Serving Library, considering the critiques generated by their intersecting of architecture, art and editorial design. Through focus on the ways in which hosting environment, architecture and forms of expanded publishing can serve to dissolve disciplinary boundaries and activities of production, spectatorship and reception, it draws on the lineage of 1960s/70s Conceptual Art in considering these practices as a means through which to escape medium specificity and spatial confinement. Relationships between actual and virtual space are then read against this broadening of aesthetic ideas and the theory of critical modernity.

Effect of Different Solvent Ratios (Water/Ethylene Glycol) on the Growth Process of CaMoO(4) Crystals and Their Optical Properties

In this paper, calcium molybdate (CaMoO(4)) crystals (meso- and nanoscale) were synthesized by the coprecipitation method using different solvent volume ratios (water/ethylene glycol). Subsequently, the obtained suspensions were processed in microwave-assisted hydrothermal/solvothermal systems at 140 degrees C for 1 h. These meso- and nanocrystals processed were characterized by X-ray diffraction (X R I)), Fourier transform Raman (FT-Raman), Fourier transform infrared (FT-IR). ultraviolet visible (UV-vis) absorption spectroscopies, held-emission gun scanning electron microscopy (FEG-SEM). transmission electron microscopy (TEM). and photoluminescence (PL) measurements. X RI) patterns and FT-Raman spectra showed that these meso- and nanocrystals have a scheelite-type tetragonal structure without the presence of deleterious phases. FT-IR spectra exhibited a large absorption band situated at around 827 cm(-1), which is associated with the Mo-O anti-symmetric stretching vibrations into the [MoO(4)] clusters. FEG-SEM micrographs indicated that the ethylene glycol concentration in the aqueous solution plays an important role in the morphological evolution of CaMoO(4) crystals. High-resolution TEM micrographs demonstrated that the mesocrystals consist of several aggregated nanoparticles with electron diffraction patterns of monocrystal. In addition, the differences observed in the selected area electron diffraction patterns of CaMoO(4) crystals proved the coexistence of both nano- and mesostructures, First-principles quantum mechanical calculations based on the density functional theory at the B3LYP level were employed in order to understand the band structure find density of states For the CaMoO(4). UV-vis absorption measurements evidenced a variation in optical band gap values (from 3.42 to 3.72 cV) for the distinct morphologies. The blue and green PI. emissions observed in these crystals were ascribed to the intermediary energy levels arising from the distortions on the [MoO(4)] clusters clue to intrinsic defects in the lattice of anisotropic/isotropic crystals.

Quantitative structure-activity relationships for a series of inhibitors of cruzain from Trypanosoma cruzi: Molecular modeling, CoMFA and CoMSIA studies

Human parasitic diseases are the foremost threat to human health and welfare around the world. Trypanosomiasis is a very serious infectious disease against which the currently available drugs are limited and not effective. Therefore, there is an urgent need for new chemotherapeutic agents. One attractive drug target is the major cysteine protease from Trypanosoma cruzi, cruzain. In the present work, comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) studies were conducted on a series of thiosemicarbazone and semicarbazone derivatives as inhibitors of cruzain. Molecular modeling studies were performed in order to identify the preferred binding mode of the inhibitors into the enzyme active site, and to generate structural alignments for the three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D QSAR) investigations. Statistically significant models were obtained (CoMFA. r(2) = 0.96 and q(2) = 0.78; CoMSIA, r(2) = 0.91 and q(2) = 0.73), indicating their predictive ability for untested compounds. The models were externally validated employing a test set, and the predicted values were in good agreement with the experimental results. The final QSAR models and the information gathered from the 3D CoMFA and CoMSIA contour maps provided important insights into the chemical and structural basis involved in the molecular recognition process of this family of cruzain inhibitors, and should be useful for the design of new structurally related analogs with improved potency. (C) 2009 Elsevier Inc. All rights reserved.

Systemförvaltning hos Banverket – design av gemensam process för ändringshantering

Vår uppdragsgivare för detta arbete var IT-avdelningen på Banverkets huvudkontor. Deras upp-drag till oss var att kartlägga nuläget i ändringshanteringen i systemförvaltningen. Utifrån den kartläggningen skulle vi även utveckla en gemensam process med tillhörande processbeskrivning för ändringshanteringen. Ändringshantering är alla de aktiviteter som uppstår från det att ett förändringsbehov inkommer till dess att förändringen är införd. Banverket har under 2003 arbetat fram en metodik för systemförvaltning, som fortfarande är under utveckling. Metodikens stöd för det operativa arbetet, i synnerhet ändringshanteringen, är inte tillräcklig. Förvaltningsledare har hittills skapat sina egna processer kring hur ändringshan-teringen ska gå till och de finns inte dokumenterade, utan existerar som enskild kunskap. Detta leder till att systemförvaltningen blir personbunden och konsekvensen blir bland annat att det är resurskrävande att byta ut personen i förvaltningen samt att det tar längre tid vid överlämning av förvaltningen till ny person. Vi genomförde semistrukturerade intervjuer med nio systemförvaltare och förvaltningsledare för att kunna beskriva deras arbetssätt i nuläget. Till hjälp i beskrivningen av arbetssättet använde vi handlingsgrafer enligt metoden FA/SIM. Med handlingsgraferna kunde vi jämföra de olika arbetssätten. Vid jämförelsen kunde vi se att det fanns ett antal handlingar som är återkommande i de flesta nulägesbeskrivningarna. Vi analyserade dessa handlingar med hjälp av affärsaktsteorin för att få svar på om ändringshanteringen är affärstydlig. Vi kunde se att förvaltningsledarna saknar ett bra stöd för vilken information som bör komma in med varje förändringsbehov. Detta leder till att förvaltningsledaren känner en osäkerhet i om den prioriterat rätt och kan leda till att han/hon hamnar i ett underläge i en eventuell förhandling med leverantören. I acceptanstestningen märkte vi att den inte utförs på ett strukturerat sätt samt att det finns en tendens till att förvaltningsledaren i vissa fall förlitar sig på den testning leverantören utför. Den ändringshanteringsprocess vi utvecklat är en grund till ett gemensamt arbetssätt, men en viss fördjupning av detaljnivån i processen måste ske mot varje förvaltningsobjekt. Vi menar att för att säkerställa att rätt och jämförbar information om de olika förändringsbehoven kommer in behöver förvaltningsledaren arbeta fram någon form av frågemall. Genom att genomföra en nyt-tovärdering enligt PENG-modellen tror vi att förvaltningsledaren hittar de frågor som han/hon behöver ha svar på i prioriteringsfasen och som bör ingå i frågemallen. Acceptanstestningen bör ske på ett strukturerat sätt och vi föreslår att förvaltningsledaren arbetar fram ett testprotokoll för sitt förvaltningsobjekt samt identifierar några för verksamheten kritiska funktionaliteter som också bör ingå i testprotokollet.