Hui and Walter's latent-class model extended to estimate diagnostic test properties from surveillance data: a latent model for latent data

Diagnostic test sensitivity and specificity are probabilistic estimates with far reaching implications for disease control, management and genetic studies. In the absence of 'gold standard' tests, traditional Bayesian latent class models may be used to assess diagnostic test accuracies through the comparison of two or more tests performed on the same groups of individuals. The aim of this study was to extend such models to estimate diagnostic test parameters and true cohort-specific prevalence, using disease surveillance data. The traditional Hui-Walter latent class methodology was extended to allow for features seen in such data, including (i) unrecorded data (i.e. data for a second test available only on a subset of the sampled population) and (ii) cohort-specific sensitivities and specificities. The model was applied with and without the modelling of conditional dependence between tests. The utility of the extended model was demonstrated through application to bovine tuberculosis surveillance data from Northern and the Republic of Ireland. Simulation coupled with re-sampling techniques, demonstrated that the extended model has good predictive power to estimate the diagnostic parameters and true herd-level prevalence from surveillance data. Our methodology can aid in the interpretation of disease surveillance data, and the results can potentially refine disease control strategies.

Liquid coordination complexes: a new class of Lewis acids as safer alternatives to BF3 in synthesis of polyalphaolefins

Liquid coordination complexes (LCCs) are a new class of liquid Lewis acids, prepared by combining an excess of a metal halide (e.g. GaCl3) with a basic donor molecule (e.g. amides, amines or phosphines). LCCs were used to catalyse oligomerisation of 1-decene to polyalphaolefins (PAOs). Molecular weight distribution and physical properties of the produced oils were compliant with those required for low viscosity synthetic (Group IV) lubricant base oils. Kinematic viscosities at 100 °C of ca. 4 or 6 cSt were obtained, along with viscosity indexes above 120 and pour points below −57 °C. In industry, to achieve similar properties, BF3 gas is used as a catalyst. LCCs are proposed as a safer and economically attractive alternative to BF3 gas for the production of polyalphaolefins.

Pyrrolo-1,5-benzoxazepines:a new class of apoptotic agents

Some members of a series of novel pyrrolo-1,5-benzoxazepines (PBOXs) potently induce apoptosis in a number of human cancerous cell lines including HL-60 cells and the drug-resistant chronic myelogenous leukaemia cell line, K562. The apoptotic induction seems to be independent of the mitochondrial peripheral-type benzodiazepine receptor (PBR), which binds these PBOXs with high affinity, due to a lack of correlation between their affinities for the receptor and their apoptotic potencies and their high apoptotic activity in PBR-deficient cells. PBOX-6, a potent member of the series, induces a transient activation of c-Jun N-terminal kinase (JNK) in a dose-dependent manner, which correlates with induction of apoptosis. Expression of a cytoplasmic inhibitor of the JNK signal transduction pathway, Jip-1, prevents JNK activity and significantly reduces the extent of apoptosis induced by PBOX-6. This demonstrates the requirement for JNK in the cellular response to this apoptotic agent. In addition, PBOX-6 activates caspase-3-like proteases in K562 and HL-60 cells. The caspase-3 inhibitor, Z-Asp-Glu-Val-Asp-fluoromethylketone (z-DEVD-fmk), blocks caspase-3-like protease activity in both cell types but only prevents PBOX-6-induced apoptosis in HL-60 cells, suggesting that the requirement for caspase-3-like proteases in the apoptotic pathway is dependent on the cell type.

Socialized credit and the working-class family economy: a comparative history of Britain and France 1900-2000

This paper provides a comparative analysis of working class consumer credit in Britain and France from the early twentieth century through to the 1980s. It indicates a number of similarities between the two nations in the earlier part of the period: in particular, in the operation of doorstep credit systems. For the British case study, we explore consumer finance offered by credit drapers (sometimes known as tallymen) whilst in France the paper explores a similar system that functioned in the coalmining communities around the city of Lens. Both methods operated on highly socialised relationships that established the trust on which credit was offered and long-term creditor/borrower relationships established. In the second part of the paper, we analyse the different trajectories taken in post-war France and Britain in this area of working class credit. In France this form of socialized credit gradually dwindled due to factors such as ‘Bancarisation’, which saw the major banks emerge as modern bureaucratized providers of credit for workers and their families. In contrast, in Britain the tallymen (and other related forms of doorstep credit providers) were offered a new lease of life in the 1960s and 1970s. This was a period during which British credit providers utilised multiple methods to evade the hire purchase controls put in place by post-war governments. Thus, whilst the British experience was one of fragmented consumer loan types (including the continuation of doorstep credit), the French experience (like elsewhere in Europe) was one of greater consolidation. The paper concludes by reflecting on the role of these developments in the creation of differential experiences of credit inclusion/exclusion in the two nations and the impact of this on financial inequality.

A class of efficient short-chain fluorinated catanionic surfactants

There have been many attempts to find suitable replacements for fluorinated surfactants due to problems related to their bioaccumulation and resistance to biodegradation. Meeting the exceptional performances of these compounds, however, remains largely an unaccomplished challenge. Currently, a solution might be found through the synthesis of new classes of fluorinated compounds that possess reduced environmental impact by following the recommended strategies for their greener and safer design. In this article we report a novel approach by designing a family of catanionic fluorinated surfactants that shows potential for improved degradation, good water solubility, and low Krafft points. Furthermore, these surfactants exhibit excellent fluorine efficiency and effectiveness of surface tension reduction.

Trabalho colaborativo docente na gestão do currículo do ensino básico: do discurso às práticas

A diversidade, complexidade e imprevisibilidade que caracterizam a sociedade actual exigem da Escola uma articulação eficaz entre as aprendizagens e a realidade sociocultural dos alunos, de modo a promover a formação de cidadãos instruídos, competentes, críticos e aptos para aprender a aprender ao longo da vida. Neste sentido, é crucial contextualizar e gerir o currículo, adequando-o à multiplicidade e idiossincrasias dos alunos e seus contextos, assegurando-lhes aprendizagens funcionais e de qualidade. A implementação do processo de Reorganização Curricular do Ensino Básico, consubstanciado através da promulgação do Decreto-Lei n.º 6/2001, de 18 de Janeiro, ambiciona(va) melhorar a eficácia de resposta da escola ao seu mandato social, atribuindo a esta a centralidade na reconceptualização do currículo nacional em função dos contextos com que trabalha. Para tal, a auto-implicação, a negociação e a colaboração são pressupostos indispensáveis a um processo de gestão curricular centrado na escola e operacionalizado no contexto das suas diferentes estruturas. Nesta perspectiva, estruturas de gestão curricular intermédia como o conselho de turma e o departamento curricular, assumem particular ênfase na promoção e desenvolvimento de práticas de colaboração docente fulcrais a processos de gestão curricular. Assim, analisar e aprofundar conhecimento sobre condições facilitadoras, bem como factores de dificultação, do desenvolvimento de práticas de colaboração docente no contexto das referidas estruturas, identificadas na sequência da implementação da orientação de política curricular traduzida no referido decreto-lei constituiu o principal objectivo subjacente a este estudo. Procurou-se relacionar esta análise com dimensões de cultura profissional e organizacional, que a literatura e a investigação revistas documentam como factores relevantes na transformação de práticas curriculares. O presente estudo decorreu em dois momentos: o primeiro, no ano lectivo de 2006/2007, assumiu uma natureza predominantemente quantitativa, privilegiando-se como técnica de recolha de dados o inquérito por questionário aplicado 2718 professores que se encontravam a leccionar Ciências da Natureza, Ciências Naturais ou Ciências Físico-Químicas na rede de escolas públicas com 2º e 3º Ciclos da Direcção Regional de Educação do Norte (DREN) e do Centro de Área Educativa (CAE) de Aveiro, o qual foi complementado com a realização de uma entrevista semi-estruturada a seis professores de Ciências Físicas e Naturais; o segundo momento, realizado no ano lectivo de 2007/2008, adoptou uma metodologia de investigação, essencialmente, qualitativa – estudo de caso – desenvolvido numa escola básica com 2º e 3º ciclos com doze professores pertencentes a um conselho de turma e com oito professores de Ciências Físicas e Naturais afectos ao departamento curricular de Matemática e Ciências Experimentais. Este momento caracterizou-se pela: i) realização de dois percursos formativos, um com professores do conselho de turma e outro com os professores de Ciências Físicas e Naturais; ii) observação de reuniões de trabalho em contexto das estruturas supramencionadas; iii) planificação, implementação e avaliação de uma aula em regime de co-docência, abordando uma temática na perspectiva Ciência, Tecnologia e Sociedade e iv) realização de entrevistas a todos os professores participantes, aos Presidentes do Conselho Executivo e do Conselho Pedagógico e à Coordenadora do Departamento Curricular de Matemática e Ciências Experimentais. O sistema de análise de dados utilizado visou a compreensão das dinâmicas de trabalho docente desenvolvidas no processo de gestão curricular no contexto das estruturas de gestão intermédia em análise. Neste sentido, privilegiaram-se a análise estatística e de conteúdo como técnicas de tratamento dos dados. Os resultados deste estudo apontam para a prevalência de uma cultura docente fortemente individualizada, balcanizada e burocratizada, facto que restringe o desenvolvimento de práticas de gestão curricular e de dinâmicas de trabalho docente sustentadas e adequadas ao contexto e necessidades específicas dos alunos. Sugerem, igualmente, que o desenvolvimento de práticas de colaboração docente não é consequência directa da decisão espontânea e voluntarismo dos professores ou de uma imposição externa não assumida pelos mesmos, mas sim de uma convergência de factores de responsabilização, reconhecimento da utilidade e eficácia da colaboração, e incentivo organizacional que se revelaram pouco significativos no estudo em causa. Por outro lado, indiciam que uma efectiva colaboração docente implica transformações no plano das culturas, que não decorrem dos normativos, e é potenciada por processos de negociação, onde os diferentes actores educativos partilham responsabilidades e uma autonomia cimentada numa visão colectiva e integradora do projecto educativo e curricular da escola. No sentido de contribuir para a consolidação do conhecimento no domínio em estudo, consideramos necessária a realização de outras investigações centradas no mesmo objecto de estudo, mas desenvolvidas em outros contextos escolares.

Lichenicidin biosynthesis and search for novel antibacterial peptides

A estirpe Bacillus licheniformis I89 possui a capacidade de produzir alguns compostos com actividade antibacteriana. No presente estudo, a separação desses compostos foi realizada através da aplicação de vários procedimentos, incluindo extracção em fase sólida e cromatografia liquida de alta pressão. Dois destes compostos bioactivos constituem o lantibiótico de classe II lichenicidina e são caracterizados pela massas molecular de 3250 Da (Bliα) e 3020 Da (Bliβ). O cluster responsável pela biossíntese da lichenicidina foi heterologamente expresso em Escherichia coli, constituindo a primeira descrição da produção de um lantibiótico totalmente in vivo num hospedeiro Gram-negativo. Este sistema foi subsequentemente explorado com o objectivo de relacionar cada proteína codificada no cluster genético da lichenicidina na produção dos péptidos Bliα e Bliβ. O desenvolvimento do sistema de trans complementação possibilitou a produção de variantes destes péptidos. A análise das massas moleculares destas variantes assim como a análise dos padrões de fragmentação obtidos por MS/MS permitiu a revisão de algumas das características estruturais previamente proposta para Bliα e Bliβ. A análise dos genes hipoteticamente envolvidos na protecção da estirpe produtora contra a acção antibiótica da lichenicidina revelou, que em E. coli, a sua ausência não resulta no aumento da susceptibilidade a este composto. Verificou-se também que a presença destes genes não é essencial para a produção de lichenicidina em E. coli. Foi também confirmado experimentalmente que a membrana externa da E. coli constitui uma barreira natural para a entrada dos péptidos na célula. De facto, uma das características intrigantes da produção de lichenicidina por uma bactéria de Gram negativo reside no mecanismo de transporte dos dois péptidos através da membrana externa. Neste estudo foi demonstrado que na ausência da proteína de membrana TolC, a massa molecular de Bliα e Bliβ não foi identificada no sobrenadante de E. coli, demonstrando assim que a sua presença no ambiente extra-celular não se devia a um processo de lise bacteriana. Foi ainda avaliada a capacidade da maquinaria biossintética da lichenicidina para produzir o lantibiótico haloduracina, através do processamento de chimeras lichenicidina-haloduracina, contudo, os resultados foram negativos. Verificou-se ainda que em determinadas condições de incubação, a diferenciação da morfologia original da estirpe B. licheniformis I89 pode ocorrer. Esta dissociação implicou a transição da colónia parental e rugosa para uma colónia de aparência mais simples e suave. Desta forma, as diferenças das duas morfologias em termos de taxa de crescimento, esporulação e actividade antibiótica foram investigadas. Considerando especificamente Bliα e Bliβ verificou-se que a abundância destes péptidos nas culturas do fenótipo fino é geralmente inferior aquela identificada nas culturas do fenótipo parental. Por último, a diversidade de elementos genéticos constituintes de péptido sintetases não ribossomais (NRPS) foi investigada em lagoas no centro de Portugal e em solos provenientes de caves do sul de Portugal, revelando a presença de potenciais novas NRPS nestes ambientes.

Formação cívica e formação de professores: limites e potencialidades

A reorganização curricular do Ensino Básico de 2001 representou uma mudança de paradigma: uma aposta na flexibilidade, na integração e na autonomia. Uma das principais inovações desta reforma foi a criação de áreas curriculares não disciplinares, entre elas a Formação Cívica. Uma década volvida qual o impacto desta decisão? Estudos anteriores revelaram o uso administrativo e burocrático da Formação Cívica, ao serviço do Diretor de Turma e das suas responsabilidades de gestão da turma e resolução de conflitos. Num cenário de defraudamento das expetativas iniciais depositadas neste domínio não disciplinar e convencidos que estávamos da importância de potenciar espaços reais de promoção da Cidadania nas escolas desencadeámos um estudo de modelização dupla investigação-formação que nos permitisse compreender qual o papel da formação de professores neste domínio e os respetivos limites e potencialidades da Formação Cívica. Com base no pressuposto de que a ação de qualquer professor em contexto de sala de aula depende do conhecimento profissional que possui acerca de um determinado domínio curricular e reconhecendo a ausência de mecanismos de formação específica para a concretização dos tempos letivos de Formação Cívica, estruturámos o nosso trabalho com o intuito de contribuir para a construção de conhecimento sobre a natureza da formação de professores em Formação Cívica. Realizado no contexto da formação contínua de professores, o presente estudo desenvolveu-se em duas etapas fundamentais que se foram interligando entre momentos de investigação, reflexão, formação, recolha e análise de dados. A abordagem metodológica que se delineou para todas as fases assumiu um cariz qualitativo e crítico-interpretativo. Numa primeira fase, realizámos um estudo exploratório que nos permitiu identificar conceções, práticas e contextos no domínio da Formação Cívica. Selecionámos uma escola no distrito de Aveiro e entrevistámos 10 professores do 3.º CEB, coordenação e direção da escola, analisámos documentos oficiais e observámos aulas. Concluímos que a operacionalização da Formação Cívica está refém de um conjunto de condicionalismos, entre eles: a ausência de orientações curriculares; a sobreposição de funções do Diretor de Turma; o não reconhecimento das funções pedagógicas de uma área não disciplinar; a ausência de preparação científica e pedagógica dos professores responsáveis por este tempo letivo. A segunda fase do estudo contemplou a conceção, desenvolvimento, implementação e avaliação de um percurso formativo projetado com base nos resultados do estudo exploratório e da revisão da literatura realizada para o efeito. O percurso formativo, desenvolvido na modalidade de Oficina de Formação (OF), envolveu e alicerçou-se no potencial das tecnologias (participação numa comunidade online; criação de blogues; desenvolvimento de recursos digitais) e envolveu sete professores. Dos professores participantes na OF, foram analisados em detalhe o percurso formativo de três professoras de diferentes escolas do ensino básico e com diferentes níveis de experiência letiva em Formação Cívica. A realização deste percurso formativo permitiu-nos: i) identificar processos de reconstrução do conceito de cidadania e do lugar da Formação Cívica; ii) identificar uma visão mais alargada e transformadora da Formação Cívica ao invés de abordagens restritas de cariz administrativo; ii) analisar a importância da partilha de experiências, do feedback, do suporte e da reflexão no processo formativo para o desenvolvimento das práticas pedagógico-didáticas; iv) conceptualizar o conhecimento profissional docente associado à Formação Cívica. Consideramos que este estudo contribui para a necessária reflexão sobre o espaço e o papel da Educação para a Cidadania no sistema educativo Português, assim como para o debate da afirmação da Formação Cívica (com esta ou outra designação mas necessariamente com novos contornos), em particular no currículo do ensino básico. Sustentamos ainda a importância fundamental da formação contínua (de carácter ativo e reflexivo) e da construção partilhada do conhecimento para o desenvolvimento profissional dos professores de Formação Cívica, necessário para dar resposta aos desafios da Educação para a Cidadania.