Research in Progress: Medical Research Council United Kingdom Refractory Asthma Stratification Programme (RASP-UK)

The UK Refractory Asthma Stratification Programme(RASP-UK) will explore novel biomarker stratificationstrategies in severe asthma to improve clinicalmanagement and accelerate development of newtherapies. Prior asthma mechanistic studies have notstratified on inflammatory phenotype and theunderstanding of pathophysiological mechanisms inasthma without Type 2 cytokine inflammation is limited.RASP-UK will objectively assess adherence tocorticosteroids (CS) and examine a novel compositebiomarker strategy to optimise CS dose; this will alsoaddress what proportion of patients with severe asthmahave persistent symptoms without eosinophilic airwaysinflammation after progressive CS withdrawal. There will be interactive partnership with the pharmaceutical industry to facilitate access to stratified populations for novel therapeutic studies.

A 1-D Vaneless Diffuser Model Accounting for the Effects of Spanwise Flow Stratification

The radial vaneless diffuser, though comparatively simple in terms of geometry, poses a significant challenge in obtaining an accurate 1-D based performance prediction due to the swirling, unsteady and distorted nature of the flow field. Turbocharger compressors specifically, with the ever increasing focus on achieving a wide operating range, have been recognised to operate with significant regions of spanwise separated flow, particularly at off design conditions.
Using a combination of single passage Computational Fluid Dynamics (CFD) simulations and extensive gas stand test data for three geometries, the current study aims to evaluate the onset and impact of spanwise flow stratification in radial vaneless diffusers, and how the extent of the aerodynamic blockage presented to the flow throughout the diffuser varies with both geometry and operating condition. Having analysed the governing performance parameters and flow phenomena, a novel 1-D modelling method is presented and compared to an existing baseline method as well as test data to quantify the improvement in prediction accuracy achieved.

Integration of copy number and transcriptomics provides risk stratification in prostate cancer: A discovery and validation cohort study

BACKGROUND: Understanding the heterogeneous genotypes and phenotypes of prostate cancer is fundamental to improving the way we treat this disease. As yet, there are no validated descriptions of prostate cancer subgroups derived from integrated genomics linked with clinical outcome.

METHODS: In a study of 482 tumour, benign and germline samples from 259 men with primary prostate cancer, we used integrative analysis of copy number alterations (CNA) and array transcriptomics to identify genomic loci that affect expression levels of mRNA in an expression quantitative trait loci (eQTL) approach, to stratify patients into subgroups that we then associated with future clinical behaviour, and compared with either CNA or transcriptomics alone.

FINDINGS: We identified five separate patient subgroups with distinct genomic alterations and expression profiles based on 100 discriminating genes in our separate discovery and validation sets of 125 and 103 men. These subgroups were able to consistently predict biochemical relapse (p = 0.0017 and p = 0.016 respectively) and were further validated in a third cohort with long-term follow-up (p = 0.027). We show the relative contributions of gene expression and copy number data on phenotype, and demonstrate the improved power gained from integrative analyses. We confirm alterations in six genes previously associated with prostate cancer (MAP3K7, MELK, RCBTB2, ELAC2, TPD52, ZBTB4), and also identify 94 genes not previously linked to prostate cancer progression that would not have been detected using either transcript or copy number data alone. We confirm a number of previously published molecular changes associated with high risk disease, including MYC amplification, and NKX3-1, RB1 and PTEN deletions, as well as over-expression of PCA3 and AMACR, and loss of MSMB in tumour tissue. A subset of the 100 genes outperforms established clinical predictors of poor prognosis (PSA, Gleason score), as well as previously published gene signatures (p = 0.0001). We further show how our molecular profiles can be used for the early detection of aggressive cases in a clinical setting, and inform treatment decisions.

INTERPRETATION: For the first time in prostate cancer this study demonstrates the importance of integrated genomic analyses incorporating both benign and tumour tissue data in identifying molecular alterations leading to the generation of robust gene sets that are predictive of clinical outcome in independent patient cohorts.

Challenging the cancer molecular stratification dogma: Intratumoral heterogeneity undermines consensus molecular subtypes and potential diagnostic value in colorectal cancer

Purpose:
A number of independent gene expression profiling studies have identified transcriptional subtypes in colorectal cancer (CRC) with potential diagnostic utility, culminating in publication of a CRC Consensus Molecular Subtype classification. The worst prognostic subtype has been defined by genes associated with stem-like biology. Recently, it has been shown that the majority of genes associated with this poor prognostic group are stromal-derived. We investigated the potential for tumor misclassification into multiple diagnostic subgroups based on tumoral region sampled.

Experimental Design:
We performed multi-region tissue RNA extraction/transcriptomic analysis using Colorectal Specific Arrays on invasive front, central tumor and lymph node regions selected from tissue samples from 25 CRC patients.

Results:
We identified a consensus 30 gene list which represents the intratumoral heterogeneity within a cohort of primary CRC tumors. Using a series of online datasets, we showed that this gene list displays prognostic potential (HR=2.914 (CI 0.9286-9.162) in stage II/III CRC patients, but in addition we demonstrated that these genes are stromal derived, challenging the assumption that poor prognosis tumors with stem-like biology have undergone a widespread Epithelial Mesenchymal Transition (EMT). Most importantly, we showed that patients can be simultaneously classified into multiple diagnostically relevant subgroups based purely on the tumoral region analysed.

Conclusions:
Gene expression profiles derived from the non-malignant stromal region can influence assignment of CRC transcriptional subtypes, questioning the current molecular classification dogma and highlighting the need to consider pathology sampling region and degree of stromal infiltration when employing transcription-based classifiers to underpin clinical decision-making in CRC.

Le rôle et l'influence de la relation élève-enseignant sur l'adaptation scolaire et sociale des élèves dans les écoles primaires québécoises

Cette étude explore pour la première fois auprès d'une population québécoise le lien existant entre la qualité de la relation élève-enseignant (REE) et l'adaptation scolaire d'élèves ayant un trouble du comportement. La qualité du lien affectif des 80 élèves participants est étudiée sous l'angle de la théorie de l'attachement et mesurée à l'aide du STRS (Student-Teacher Relationship Scale) ainsi que du TSRI (Teacher-Student Relationship Inventory). Des analyses de corrélation font ressortir de nombreux liens entre la qualité de la REE et les variables d'adaptation scolaire utilisées: la compétence académique (notes et habitudes de travail), les habiletés sociales/ appréciation par les pairs, les problèmes de comportement extériorisés, puis finalement, la motivation/satisfaction scolaire de l'élève. De plus, la qualité de la REE en fin d'année scolaire a été comparée selon la fréquentation de l'élève à l'un ou l'autre des services: 1) des classes spéciales traditionnelles (N=30) et 2) des classes kangourou, dont la philosophie est axée sur l'établissement d'une REE positive (N=50). Les résultats de cette comparaison indiquent peu de différence significative dans l'évolution des élèves selon les deux services et pas de différence au niveau de la qualité de la REE pour cet échantillon.

Des chiffres et des êtres. étude introductive à l'identification de la représentation sociale de la statistique chez des étudiants de premier cycle en Sciences humaines et sociales en France

Qu'on le déplore ou que l'on s'en félicite, la statistique est présente dans notre vie de tous les jours. Paradoxalement, les compétences pour l'appréhender semblent faire défaut, à tel point que plus d'un militent pour que la statistique fasse partie des compétences minimales de tout citoyen (statistical literacy). Mais au niveau de l'enseignement, de nombreux obstacles apparaissent quant à l'acquisition de ces compétences : ainsi, de multiples recherches ont-elles identifié maints obstacles, que ceux-ci soient d'ordre affectif ou cognitif. Toutefois ces recherches adoptent le point de vue de l'enseignant ou du chercheur et il n'en existe que peu qui se sont interrogées sur la représentation que les étudiants ont de la statistique. Tel est l'objectif général de la présente recherche. Après avoir caractérisé ce qu'est une représentation sociale et abouti à poser "qu'est statistique ce que l'on se donne comme étant statistique", une enquête a été menée en France auprès de 614 étudiants de différentes sections en Sciences humaines et sociales. Il s'en dégage qu'une vingtaine de mots rend compte de la statistique, tels mathématiques, pourcentages, chiffrs et calculs. Cependant, au-delà de ce discours commun, des différences apparaissent entre les sections quant aux mots utilisés pour caractériser la statistique : pour certains, les mots utilisés, peu nombreux, assimilent la statistique aux statistiques ; pour d'autres, elle est conçue comme des mathématiques utilisées dans le cadre d'études, de recherches. D'autres discours se distinguent soit par la proximité de la statistique avec la méthodologie du questionnaire, soit par son utilisation professionnelle : la référence aux mathématiques y est alors nettement atténuée. De ces résultats se dégagent des prolongements en termes de recherche (étude longitudinale de la représentation sociale de la statistique), en termes de pédagogie (conditions propices à la problématisation) et en termes de rapport au savoir (thêmata). Cette recherche invite les formateurs et les chercheurs en didactique à faire un pas de côté par rapport à leur propre représentation et à envisager celle potentiellement différente des apprenants ; à côté des chiffrs, il y a aussi des êtres.

Rites, cultes et Rituels ; de l’Antiquité jusqu’à aujourd’hui. Considérations et réflexions sur le déroulement, la valeur et l’importance religieuse, sociale et anthropologique des rites et des cultes de l’Antiquité Grecque et Romaine jusqu’à la naissance du Christianisme et à la société moderne.

En lisant cet extrait de journal qui ouvre le livre « Le Sacrifice humain en Grèce ancienne » de Pierre Bonnechère, on peut se rendre compte que l’homme a toujours éprouvé, face au sacrifice humain, une sorte de mélange entre horreur, mystère et attraction, une « fascination étrange » 1 qui a amené les intellectuels, les écrivains et les artistes du monde entier à chercher à comprendre comment et pourquoi, hier comme aujourd’hui, le sacrifice humain continue à être une composante des pratiques rituelles des différents cultes, religieux ou pas, puisqu’il existe toujours des réminiscences de ces pratiques.

Stratification and peer effects: An analysis of Lisbon public schools

Educational stratification has been a difficult subject to deal with having yet no study shown a quantitative measure of it. Using the idea of distribution comparison a measure based on parents’ education is built for the primary schools in Lisbon. Upon the confirmation that Lisbon is stratified, I use the measure of peer effects based on stratification and determine its impact on test scores, concluding that the existence of stratification improves scores of students in schools with more educated parents and decreases scores of students in schools with less educated parents. Moreover, using fixed effects I derive the conclusion that the measure of peers’ characteristics helps explain most of differences among schools.

Vie professionnelle et vie familiale et sociale : une gestion du temps et de la fatigue

Sur la base d'une enquête de terrain, les auteures abordent la nécessité de repenser la division du travail tant sur le plan du travail professionnel, que domestique. Elles s'appuient sur l'expérience des TL (transports lausannois) qui ont mis en place une nouvelle gestion des horaires permettant aux conducteurs d'avoir une assez grande latitude sur leurs itinéraires des bus. Le taux d'absentéisme alarmant avait inquiété les dirigeants qui s'attachaient à faire le tour de solutions à même de réduire la fatigue des collaborateurs. Les effets indirects de cette innovation managériale a été de permettre une véritable conciliation vie privée-vie professionnelle avec, cependant, comme effet non voulu un clivage entre anciens et nouveaux - les anciens ayant priorité quant au choix d'itinéraire. Les femmes, minoritaires dans le métier, ont du mal à faire entendre leur voix pour un système qui va clairement dans le sens d'une double activité facilitée. [Auteurs]

Etendue des prestations de l'assurance-maladie sociale : le catalogue des prestations est- il suffisant pour que tous accèdent à des soins de qualité ?

Le projet "prestations de l'assurance-maladie sociale" est l'un des projets partiels élaborés par l'Office fédéral des assurances sociales (OFAS) dans le cadre de l'analyse des effets de la LAMal. Deux approches complémentaires sont adoptées pour répondre à la question du caractère suffisant du "catalogue" suisse des prestations à charge de l'assurance-maladie sociale: d'une part, la comparaison des "catalogues" des prestations remboursées en Suisse et à l'étranger et, d'autre part, l'examen de la couverture par le "catalogue" des prestations de problèmes de santé utilisés comme traceurs. [Table des matières] 1.1. Contexte. 1.2. Définition et limites du mandat. 1.3. Le "catalogue" des prestations : composition actuelle, participation d'autres assurances sociales et des pouvoirs publics. 1.4. Approches méthodologiques : comparaison internationale, étude de conditions-traceurs. 2. Analyse par comparaison internationale. 2.1. Recherche de documentation et collaborations. 2.2. Résultats : Suisse, France, Allemagne, Israël, Pays-Bas, Luxembourg, comparaison internationale des prestations générales, par catégorie, et des prestations spéciales. 3. Analyse par conditions traceurs. 3.1. Stratégie de la recherche documentaire. 3.2. Critères de choix des documents. 3.3. Variations méthodologiques et particularités. 3.4. Résultats : Accident vasculaire cérébral (ischémique), fracture de hanche, obésité, leucémie aigüe (LA), grossesse normale et nouveau-né en bonne santé. 3.5. Discussion.