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Resumo:
Se aportan datos morfológicos, químicos y de distribución de seis especies de las familias Baeomycetaceae (Baeomyces) e Icmadophilaceae (Dibaeis, Icmadophila, Thamnolia) presentes en la Península Ibérica. Se publican numerosas nuevas citas de Baeomyces rufus y de Dibaeis baeomyces, que constituyen las especies más frecuentes y abundantes en la península.
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To date, 9 FMRFamide-related peptides (FaRPs) have been structurally characterised from Caenorhabditis elegans. Radioimmunometrical screening of an ethanolic extract of C. elegans revealed the presence of two additional FaRPs that were purified by reverse-phase HPLC and subjected to Edman degradation analysis and gas-phase sequencing. Unequivocal primary structures for the two FaRPs were determined as Ala-Ala-Asp-Gly-Ala-Pro-Leu-Ile-Arg-Phe-NH2 and Ser-Val-Pro-Gly-Val-Leu-Arg-Phe-NH2. Using MALDI-TOF mass. spectrometry, the molecular masses of the peptides were found to be 1032 Da (MH) and 875 Da (MH)(+), respectively. Two copies of AADGAPLIRFamide are predicted to be encoded on the precursor gene termed flp-13, while one copy of SVPGVLRFamide is located on flp-18. Synthetic replicates of the peptides were tested on Ascaris suum somatic muscle to assess bioactivity. ADDGAPLIRFamide had inhibitory effects on A. suum muscle strips, which occurred over a range of concentrations from a threshold for activity of 10 nM to 10 muM. SVPGVLRFamide was excitatory on A. suum somatic musculature from a threshold concentration for activity of 1 nM to 10 muM. The inhibitory and excitatory effects of AADGAPLIRFamide and SVPGVLRFamide, respectively, were the same for dorsal and ventral muscle strips as well as innervated and denervated preparations, suggesting that these physiological effects are not nerve cord dependent. Addition of ADDGAPLIRFamide (10 muM) to muscle strips preincubated in high-K+ and -Ca2+-free medium resulted in a normal inhibitory response. Peptide addition to muscle strips preincubated in Cl--free medium showed no inhibitory response, suggesting that the inhibitory response of the peptide may be chloride mediated. A normal excitatory response was noted following the addition of 10 muM SVPGVLRFamide to muscle strips preincubated in high-K+, Ca2+- and Cl--free media. (C) 2001 Academic Press.
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BACKGROUND: The free fatty acid receptors (FFAs), including FFA1 (orphan name: GPR40), FFA2 (GPR43) and FFA3 (GPR41) are G protein-coupled receptors (GPCRs) involved in energy and metabolic homeostasis. Understanding the structural basis of ligand binding at FFAs is an essential step toward designing potent and selective small molecule modulators.
RESULTS: We analyse earlier homology models of FFAs in light of the newly published FFA1 crystal structure co-crystallized with TAK-875, an ago-allosteric ligand, focusing on the architecture of the extracellular binding cavity and agonist-receptor interactions. The previous low-resolution homology models of FFAs were helpful in highlighting the location of the ligand binding site and the key residues for ligand anchoring. However, homology models were not accurate in establishing the nature of all ligand-receptor contacts and the precise ligand-binding mode. From analysis of structural models and mutagenesis, it appears that the position of helices 3, 4 and 5 is crucial in ligand docking. The FFA1-based homology models of FFA2 and FFA3 were constructed and used to compare the FFA subtypes. From docking studies we propose an alternative binding mode for orthosteric agonists at FFA1 and FFA2, involving the interhelical space between helices 4 and 5. This binding mode can explain mutagenesis results for residues at positions 4.56 and 5.42. The novel FFAs structural models highlight higher aromaticity of the FFA2 binding cavity and higher hydrophilicity of the FFA3 binding cavity. The role of the residues at the second extracellular loop used in mutagenesis is reanalysed. The third positively-charged residue in the binding cavity of FFAs, located in helix 2, is identified and predicted to coordinate allosteric modulators.
CONCLUSIONS: The novel structural models of FFAs provide information on specific modes of ligand binding at FFA subtypes and new suggestions for mutagenesis and ligand modification, guiding the development of novel orthosteric and allosteric chemical probes to validate the importance of FFAs in metabolic and inflammatory conditions. Using our FFA homology modelling experience, a strategy to model a GPCR, which is phylogenetically distant from GPCRs with the available crystal structures, is discussed.
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Each year the South Carolina Department of Natural Resources reports to the Office of State Budget that includes the agency's mission, goals and objectives to accomplish the mission, and performance measures regarding the goals and objectives.
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Describe las acciones desplegadas por el crucero del B.A.P. Unanue, correspondiente al invierno de 1967, en el que se investigó el área entre el 04º00´s y 17º35´S ocupándose de 168 estaciones de rutina distribuidas en 20 perfiles. Durante todo el recorrido se investigó la presencia de cardúmenes de peces por medio de los equipos de ecosonda y radar y se realizaron observaciones sobre presencia de aves y mamíferos marinos.
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Estudio de la estructura de las comunidades bentónicas sublitorales de fondo blando mediante el análisis de 11 muestras de draga colectadas entre los 03°38 ' y 09°16 'S, entre el 12 y 19 de mayo de 1995. Se determinó la biodiversidad a nivel de especies de macrobentos para las subáreas A, B, C, D. Se evaluó el nivel de similaridad entre las 11 estaciones analizadas a nivel de grupos taxonómicos (Polychaeta, Crustacea, Mollusca, Nemertinea y otros), así como la relación entre el nivel de estrés de las comunidades de las subáreas latitudinales A, B, C, D y la agremiación en el grupo dominante (Polychaeta). Fueron diferenciadas un total de 73 especies macrobénticas de las cuales el 64,38% pertenece a la clase Polychaeta. El patrón de distribución de las biomasas totales del macrobentos es más simple que el de las abundancias, con una tendencia a la ubicación de los valores máximos al norte de los 04° S. Se comprueba una relación inversa entre el grado de agremiación y el nivel de estrés medido con el índice SEP.
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El Crucero de Evaluación de la Biomasa Desovante de anchoveta y sardina en 1995 empleó el Método de Producción de Huevos (MPH), abarcando el área comprendida entre Tambo de Mora y Paita, entre las 0 y 60 mn y 4 perfiles hidrográficos hasta las150 mn. La información analizada proviene de las capturas y muestreos biológicos de los 89 lances de comprobación ejecutados (66 del BIC Humboldt y 23 del SNP-1). La composición por especies estuvo conformada principalmente por anchoveta (Engraulis ringens), sardina (Sardinops sagax sagax), jurel (Trachurus picturatus murphyi) y caballa (Scomber japonicus). Especies capturadas incidentalmente fueron el "bagre con faja" (Galeichthys peruvianus) y el calamar (Loligo gahi). La distribución latitudinal de la anchoveta abarcó toda el área explorada y longitudinalmente hasta las 60 mn. La sardina, el jurel y la caballa mostraron una distribución amplia y dispersa hasta las 120 millas de la costa. La estructura por tamaños de anchoveta indicó la predominancia de ejemplares adultos, siendo escasa la presencia de juveniles. La sardina fue predominantemente juvenil, observada tanto en área costera como lejos de ésta. Las capturas de jurel y caballa estuvieron constituidas por ejemplares adultos. Las especies anchoveta y sardina se encontraban en pleno desove principal de invierno.
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Se ejecutó un rastreo acústico en plena estación invernal, entre Tambo de Mora y Paita para determinar la distribución geográfica y vertical de las principales especies pelágicas (anchoveta peruana, sardina, jurel y caballa), basados para ello en información oceanográfica, en interpretación de ecotrazos y en los resultados de los lances y otras observaciones. Como parámetro determinante para la distribución de recursos se observó la intromisión de aguas subtropicales superficiales (ASS) que llegó hasta las 20 mn de la costa entre el Callao y Chimbote y sobre el litoral entre Chicama y Eten. En estas condiciones, la anchoveta peruana tuvo un distribución costera. La sardina mostró una distribución predominantemente muy dispersa. El jurel y la caballa fueron detectados mayormente en forma muy dispersa, con mayor continuidad al norte de las Islas Lobos de Afuera.
Comentario general del crucero de evaluación de biomasa desovante de anchoveta. BIC Humboldt 9608-09
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Comenta los resultados más relevantes obtenidos durante el crucero realizado en agosto y setiembre de 1996, para estimar la biomasa desovante de la anchoveta (Engraulis ringens) de la zona norte centro del litoral, a través del método de producción de huevos (MPH). Teniendo como escenario un ambiente frío, con condiciones favorables para la dispersión de la anchoveta, se determinó una biomasa desovante de 4,02 millones de toneladas, magnitud inferior a la estimada en el año 1995. Se detectó una distribución estratificada de la anchoveta, ubicándose los juveniles hacia la costa, y los adultos lejos de ella. Estos últimos evidenciaron una gran avance en el proceso reproductivo, aunque la frecuencia de desove disminuyó comparándola con la de 1995. La producción de huevos también se redujo y la distribución de éstos no se presentó de la forma densa observada años atrás, cuando los adultos se distribuían principalmente dentro de las 30 a 60 millas de la costa.
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Analiza la distribución de las larvas de anchoveta en el área Paita a Tambo de Mora, del 11 de agosto al 27 de setiembre, en relación con las especies de fitoplancton consideradas como alimento adecuado. Las larvas de anchoveta estuvieron distribuidas en dos zonas, una en la zona costera y la otra fuera de las 60 mn. La calidad del alimento en ambas áreas fue diferente, la zona costera se caracterizó por la presencia de especies apropiadas para las larvas de anchoveta; por fuera de las 60 mn, la calidad del alimento para ellas no fue el más adecuado. Así mismo se observó que los vientos en la zona costera estuvieron dentro de la ventana óptima ambiental, en tanto que por fuera, los vientos no resultaron favorables para las larvas de anchoveta.