ChemInform Abstract: Enantioselective Formal Total Synthesis of (-)-Homogynolide-A

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Synthesis based on cyclohexadienes. Part 17. Total synthesis of the sesquiterpenes of Eremophila georgei diels

The first stereoselective total synthesis of the novel sesquiterpenes 1 and 2 is described. The preparation of the key intermediate 27 involved a rearrangement of a bicyclo[3.2.1] octane framework to an isomeric bicyclo[3.2.1]octane skeleton via a bicyclo[2.2.2]octane derivative.

PLIC: protein-ligand interaction clusters

Most of the biological processes are governed through specific protein-ligand interactions. Discerning different components that contribute toward a favorable protein-ligand interaction could contribute significantly toward better understanding protein function, rationalizing drug design and obtaining design principles for protein engineering. The Protein Data Bank (PDB) currently hosts the structure of similar to 68 000 protein-ligand complexes. Although several databases exist that classify proteins according to sequence and structure, a mere handful of them annotate and classify protein-ligand interactions and provide information on different attributes of molecular recognition. In this study, an exhaustive comparison of all the biologically relevant ligand-binding sites (84 846 sites) has been conducted using PocketMatch: a rapid, parallel, in-house algorithm. PocketMatch quantifies the similarity between binding sites based on structural descriptors and residue attributes. A similarity network was constructed using binding sites whose PocketMatch scores exceeded a high similarity threshold (0.80). The binding site similarity network was clustered into discrete sets of similar sites using the Markov clustering (MCL) algorithm. Furthermore, various computational tools have been used to study different attributes of interactions within the individual clusters. The attributes can be roughly divided into (i) binding site characteristics including pocket shape, nature of residues and interaction profiles with different kinds of atomic probes, (ii) atomic contacts consisting of various types of polar, hydrophobic and aromatic contacts along with binding site water molecules that could play crucial roles in protein-ligand interactions and (iii) binding energetics involved in interactions derived from scoring functions developed for docking. For each ligand-binding site in each protein in the PDB, site similarity information, clusters they belong to and description of site attributes are provided as a relational database-protein-ligand interaction clusters (PLIC).

Succinate esters: odd-even effects in melting points

Dialkyl succinates show a pattern of alternating behavior in their melting points, as the number of C atoms in the alkane side chain increases, unlike in the dialkyl oxalates Joseph et al. (2011). Acta Cryst. B67, 525-534]. Dialkyl succinates with odd numbers of C atoms in the alkyl side chain show higher melting points than the immediately adjacent analogues with even numbers. The crystal structures and their molecular packing have been analyzed for a series of dialkyl succinates with 1 - 4 C atoms in the alkyl side chain. The energy difference (Delta E) between the optimized and observed molecular conformations, density, Kitaigorodskii packing index (KPI) and C-H center dot center dot center dot O interactions are considered to rationalize this behavior. In contrast to the dialkyl oxalates where a larger number of moderately strong C-H center dot center dot center dot O interactions were characteristic of oxalates with elevated melting points, here the molecular packing and the density play a major role in raising the melting point. On moving from oxalate to succinate esters the introduction of the C2 spacer adds two activated H atoms to the asymmetric unit, resulting in the formation of stronger C-H center dot center dot center dot O hydrogen bonds in all succinates. As a result the crystallinity of long-chain alkyl substituted esters improves enormously in the presence of hydrogen bonds from activated donors.

BODIPY appended copper(II) complexes of curcumin showing mitochondria targeted remarkable photocytotoxicity in visible light

Copper(II) complexes of BODIPY (borondipyrromethene) derivatives (L-1, L-2) and curcumin (Hcur), viz. Cu(L-1)(cur)]Cl (1) and Cu(L-2)(cur)]Cl (2), where L-1 and L-2 are the non-iodinated and diiodinated BODIPY appended dipicolylamine ligands, are prepared and characterized and their photocytotoxic activity in visible light studied. Binding to copper(II) has rendered stability to curcumin from its hydrolytic degradation in buffer medium. The complexes show mitochondrial localization in HeLa cells emphasizing the findings that both 1 and 2 are mitochondria-targeting complexes and induce cancer cell death. Complex 1 with a fluorophoric BODIPY moiety in L-1 gave IC50 values of 7.9(+/- 0.3) mu M in visible light (400-700 nm) and 29.1(+/- 0.5) mu M in the dark. Complex 2 having a diiodo BODIPY moiety in L-2 as a photosensitizer gave IC50 values of 3.8(+/- 0.2) mu M in visible light and 32.1(+/- 0.4) mu M in the dark. The PDT effect of 2 is comparable to that of Photofrin (R), an FDA approved PDT drug. Cell death follows an apoptotic pathway with the formation of reactive oxygen species (ROS).

井筒中钻井信息的传输动态分析

井眼轨道闭环控制校术是当今钻井技术领域的研究热点,而地面与井下的信息传输是这一高新技术中的重要环节。目前,地面与井下的无线信息传输系统主要是采用钻井液脉冲方式,如何提高传输深度和传输速率一直都是粘井液脉冲传输系统的研究主题。本文基于多相流理论,研究了粘井液脉冲信号的传输速度及其影响因素,分析了信号的动态传输特性和衰减规律。研究表明：脉冲信号在井筒中的往复传播类似于阻尼振荡；信号频率和钻井液粘度是影响信号衰减的主要可控因素。本文的研究对现有钻井液脉冲传输系统的改进具有参考价值。

Influencia de diferentes períodos de destete sobre la ganancia media en conejos de engorde procedentes de conejas primiparas

El presente trabajo se realizó con el objetivo de estudiar el efecto del destete a los 15, 30 y 45 días, sobre la ganancia media en conejos con alimento concentrado comercial tipo único, y ad-libitum, hasta los 75 días de vida, procedentes de hembras primiparas. Para la evaluación estadística se empleó un diseño completamente aleatorio (DCA) con cuatro repeticiones por periodos de destete. Cada unidad experimental o repetición correspondió a una camada, en las que se registraron loe pesos vivos cada 15 días y el número de crías vivas por camada. Esta última característica con el objetivo de corregir las ganancias a un tamaño de camada uniforme de existir regresión lineal significativa. Cada camada se alojó en una jaula de 0.49 m2. En el análisis de varianza (ANDEVA) dé la ganancia media por gazapo al cabo de 30 días, se observaron diferencias significativas entre periodos de destete resultando un promedio de 0,344 kg y 0.510 kg para destetes de 15 días y 30 días respectivamente. En el Análisis de varianza de la ganancia media por gazapo al cabo de 45, 60 y 75 días, se observaron diferencias no significativas al 10%. Resultado que se corroboró con el procedimiento de comparación de medias de Duncan. Las ganancias medias por gazapo obtenido en las camadas a los 75 días de vida resultó de 1.676 kg, 1. 939 kg y 1.846 kg para los destete de 15, 30 y 45 días respectivamente. Durante. El ensayo fue evidente el estrés post destete, acentuándose más en las camadas destetadas a los 15 días. Analizando el efecto de los períodos de destete sobre la ganancia media en conejos a los 45, 60 y 75 días de vida. Se determinó que dicho efecto no es significativo debido al rango de ganancia media mostrado por las variables en estudio y que estas no fueron afectadas por la covariable número de conejos por camada.

The ensemble statistics of the energy of a random system subjected to harmonic excitation

This paper is concerned with the ensemble statistics of the response to harmonic excitation of a single dynamic system such as a plate or an acoustic volume. Random point process theory is employed, and various statistical assumptions regarding the system natural frequencies are compared, namely: (i) Poisson natural frequency spacings, (ii) statistically independent Rayleigh natural frequency spacings, and (iii) natural frequency spacings conforming to the Gaussian orthogonal ensemble (GOE). The GOE is found to be the most realistic assumption, and simple formulae are derived for the variance of the energy of the system under either point loading or rain-on-the-roof excitation. The theoretical results are compared favourably with numerical simulations and experimental data for the case of a mass loaded plate. © 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Peligro aviario: Caracterización de la vegetación y determinación de las especies que son atractivas para la fauna silvestre en las areas verdes del Aeropuerto Internacional Augusto C. Sandino, Managua, Nicaragua

Se evaluó la diversidad, estructura y fenología de la flora en las áreas verdes del Aeropuerto Internacional Augusto C. Sandino con el fin de determinar las especies que son atractivas para fauna silvestre de peligro para la aviación, sea por que les provee de alimento o de refugio y hábitat. Y por otro lado, brindar recomendaciones sobre especies con potencial para formar parte de las áreas verdes del aeropuerto. Para ello, se establecieron parcelas anidadas de 2 x 2 m, 5 x 5 m y 10 x 10 m en las cuales se tomaron los datos en los estratos herbáceos, arbustivos y arbóreos respectivamente. Las parcelas se establecieron aleatoriamente en tres sitios dentro del aeropuerto: en el bosque seco al oeste del aeropuerto (BSO), en la Fuerza Aérea (FA) y en el área verde alrededor de la pista de aterrizaje (AVP). Dentro de las parcelas se contaron 117 árboles en todos los sitios, los cuales estaban agrupados en 11 especies, 10 géneros, 8 familias y 4 órdenes. Las especies arbóreas de mayor densidad fueron: Calycophyllum candidissimum(450 individuos/ ha), Albizia niopides (344), Azadirachta indica (289) y Senna siamea (261) y el sitio que presento mayor diversidad y densidad de árboles fue FA. Fueron contados 36 individuos de arbustos, pertenecientes a las especiesCapsicum annum (1) yLantana camara (35). En cuanto a especies herbáceas se contaron 11,845 individuos dentro de las unidades de muestreo, agrupados en 28 especies, 23 géneros, 14 familias y 13 órdenes, siendo el AVP el sitio que registró mayor diversidad y densidad de las mismas. Las especies herbáceas con mayores densidades fueron Cenchrus brownii (256,282.05 individuos/ha), Cynodon dactylon (141,538.46), Digitaria decumbens(106,794.87), Bothriochloa pertusa(51,282.05), Elytaria imbricada (38,846.15) y Panicum maximum (30,192.31). De las 41 especies vegetales, se determinó la fenología completa para 3�, de estas, 6 (�9.35%) florecen y fructifican todo el año:Cordia dentata, Boerhavia erecta, Chamaesyce hyssopifolia, Eleucine indica, Melanthera nivea y Rhynchosia minima. Entre las especies arbóreas mayormente atractivas para la fauna silvestre se determinaron: Albizia niopoides, Manguifera indica, Spondias mombin, Cordia dentata, Guazuma ulmifoliay Calycophyllum candidissimum al ser considerados proveedores de alimentos y refugio a la fauna silvestre, por sus frutos, flores con abundante néctar, copas con poca obstrucción visual (alta densidad de hojas) y ramificaciones horizontales propias para el perchaje de las aves de alto tamaño. Dentro de la vegetación herbáceas se determinaron especies como Tridax procumbensy Tribulus terrestis formando densos tapetes de vegetación con flores atractivas para insectos en el período seco, los cuales a la vez eran focos de atracción para aves insectívoras como: Hirundus rustica (Golondrinas), Quiscalus mexicanus (Zanate), Molotrus aeneus (Tordos), Egretta thula (Garza blanca) que permanecen en las áreas verdes alrededor de la pista de aterrizaje y que peligran colisionar con los aviones. Por otra parte, las especies de la familia Poaceae fueron registradas como proveedoras de granos a las aves del grupo de las Columbidae (Palomas). Especies de gramíneas de gran porte como Panicum maximum, P. antidotale, Sorgum halapensis, además de poseer semillas grandes (>0.3 cm), formaban corredores por donde se desplazan mamífero medianos, reptiles y aves. Dentro del mismo áreas se determinaron dos especies (B. pertusay C. dactylon) que por su baja estatura (menos de 0.3 m), reproducción vegetativa y semillas muy pequeña o ausentes, son ideales para establecer en los alrededores de la pista de aterrizaje. Mediante un ensayo se evaluó su establecimiento, el cual resulto satisfactorio al competir y ganar espacio ante otras monocotiledones y dicotiledonesas, principalmente C. dactylon

湍流不同尺度间的近程和共振作用规律及应用

从Navier-Stokes方程出发,研究了湍流不同尺度间的相互作用规律,给出相近尺度间近程粘性应力的积分和微分表达式.引入极相近尺度之间共振相互作用的概念,得到共振粘性应力的微分表达式.利用共振粘性应力张量获得不含经验关系和常数、近似封闭的大涡模拟(LES)方程组.利用近程和共振粘性应力张量获得不含经验关系和常数、近似封闭的湍流多尺度方程组.讨论了湍流多尺度方程的性质及用于湍流计算的优点,尺度间相互作用的近程特性说明:多尺度模拟是湍流计算很有价值的方法,并列举了算例.

Growth of skipjack, Katsuwonus pelamis, and yellowfin, Thunnus albacares, tunas in the Eastern Pacific Ocean, as estimated from tagging data

ENGLISH: The average linear growth rate of skipjack in the eastern Pacific is less than 1 mm per day except for fish 375 to 424 mm in length at release. The growth rate shows a decrease with increasing length and increasing time at liberty. The growth rate of fish in the length range of about 43 to 57 cm is apparently more rapid in the eastern Pacific than in the western Pacific. Dsing data for the northeastern and southeastern Pacific combined, K and ~ were estimated to be 0.658 (on an annual basis) and 885 mm, respectively, by the ungrouped method and 0.829 and 846 mm, respectively, by the grouped method. Sensitivity analyses have shown however, that the estimates of these parameters are poorly determined by the sum of squares method used to derive them. Estimates of K and ~ for the eastern Pacific tend to be lower and higher, respectively, than those for the western Pacific. The average linear growth rate of yellowfin in the eastern Pacific is a little less than 1 mm per day for fish between about 25 and 100 cm in length at release. The growth appears to be most rapid in Area 2 (Revillagigedo Islands) and slowest in Areas 1 (Baja California), 5 (Central America- Colombia), and 6 (Ecuador-Peru). There is considerable variation in the growth rates of individual fish. The growth does not show a decrease with increasing length or increasing time at liberty so realistic estimates of the parameters of the von Bertalanffy or other similar equations cannot be calculated from these data. If realistic estimates of these parameters are to be secured larger fish must be tagged and released or many more long-term returns from fish to about 100 cm in length at release must be obtained. The growth patterns for the eastern Pacific, central Pacific and eastern Atlantic found by most other investigators differ from one another and from those found in the present study. Some of these differences may be real and others may be due to deficiencies in the data or the methods of analysis. Estimates obtained from tagging data are believed to be realistic provided the tags do not inhibit the growth of the fish. It appears that the growth rates of single- and double-tagged fish are the same; this indicates, though not unequivocally, that the tags do not inhibit the growth. SPANISH: La tasa media de crecimiento lineal del barrilete en el Pacífico oriental es inferior a lmm/día, excepto en el caso de peces de entre 375y 424mm de longitud de liberación. La tasa de crecimiento disminuye a medida que aumenta la longitud y el tiempo en libertad. La tasa de crecimiento de peces de entre unos 43 y 57 cm de longitud parece ser mayor en el Pacífico oriental que en el occidental. A partir de datos del Pacífico nororiental y suroriental combinados, se estimaron K y loo en 0.658 (anual) y 885mm, respectivamente, usando el método no agrupado, y 0.829 y 846mm, respectivamente, usando el método agrupado. Sin embargo, los análisis de sensitividad han demostrado que el método de suma de cuadrados utilizado para derivar las estimaciones de estos parámetros las determina con poca precisión. Las estimaciones de K y loo para el Pacífico oriental suelen ser inferiores y superiores, respectivamente, a los del Pacífico occidental. La tasa media de crecimiento lineal del aleta amarilla en el Pacífico oriental es ligeramente inferior a lmm/día para los peces de entre unos 25y 100cmde longitud de liberación. El crecimiento parece ser más rápido en el Area 2(Islas Revillagigedo),y más lento en las Areas 1(Baja California), 5 (Centroamérica-Colombia), y 6 (Ecuador-Perú). Las tasas de crecimiento de peces individuales varían considerablemente. El crecimiento no muestra una disminuciónconun aumento en la longitud o en el tiempo en libertad, y por consecuencia no se se pueden calcular estimaciones realistas de los parámetros de la ecuación de von Bertalanffy u otras ecuaciones similares a partir de estos datos. Para obtener estimaciones realistas de estos parámetros sería necesario marcar peces mayores u obtener muchas más devoluciones a largo plazo de marcas de peces de unos 100cm de longitud de liberación. Los patrones de crecimiento correspondientes al Pacífico oriental, Pacífico central, y Atlántico oriental descubiertos por la mayoría de los investigadores son diferentes entre síy también de los del presente estudio. Es posibleque algunas de estas diferencias sean verdaderas, mientras que otras se deban a faltas en los datos on en los métodos analíticos utilizados. Se considera que las estimaciones obtenidas a partir de los datos de marcado son realistas, suponiendo siempre que las marcas no impidan el crecimiento de los peces. Parece ser que las tasas de crecimiento de peces con una marca y con dos son idénticas, lo cual indica, aunque sin certeza total, que las marcas no ejercen tal efecto. (PDF contains 76 pages.)

Charge displacement in ultraintense laser-plasma interaction

The distribution of optical held and charge density in the interaction between ultraintense ultrashort pulse laser and plasma is studied by numerical computation. The plasma considered has an exponential density profile. which corresponds to isothermal expanding. Our calculation shows that electrons are pushed forward by the incident laser, but ions, due to their much greater inertia, remain stationary. The resulting charge displacement forms a strong electrostatic field in the plasma. After the interaction of laser pulse and plasma. electrostatic energy still exists even after the laser pulse and will be absorbed by the plasma finally. This serves as an explanation to the mechanism of laser energy deposited into plasma.

Avaliação de fatores de risco relacionados com aterosclerose subclínica em mulheres hipertensas

A aterosclerose e suas complicações são a principal causa de morbidade e mortalidade no mundo ocidental. O aumento da espessura da camada médio-intimal da carótida está associado com risco para doenças cardiovasculares, pois representa um marcador de aterosclerose subclínica, podendo ser detectada precocemente em indivíduos assintomáticos. O objetivo desse estudo foi identificar variáveis clínicas e nutricionais associadas com a aterosclerose subclínica em mulheres hipertensas. Estudo transversal envolvendo uma amostra de conveniência composta por 116 mulheres hipertensas entre 40 e 65 anos. Dados clínicos, como pressão arterial (PA) sistólica e diastólica, história de tabagismo, atividade física, uso de medicamentos foram coletados; foi feita a análise do perfil lipídico, glicemia e proteína C reativa (PCR); a avaliação dietética obtida pelo Recordatório de 24 horas e pelo Registro de três dias. A espessura médio-intimal (EMI) de carótidas foi realizada pelo aparelho de ultrassonografia. As pacientes foram divididas em dois grupos, de acordo com os valores da espessura médio-intimal de carótidas: EMI 0,9mm ou EMI > 0,9mm. Houve diferença significativa entre os grupos em relação à idade (50,846,62 vs 53,547,13; p=0,044), PA sistólica (134,5216,54 vs 142,9821,47; p=0,020), pressão de pulso (PP) (49,3611,03 vs 60,15 17,77; p<0,001), HDL (48,988,54 vs 44,057,45; p=0,004) e PCR (2,311,21 vs 3,051,34; p=0,016). Não houve diferença significativa em relação aos parâmetros antropométricos, exceto em relação à reactância (65,199,69 vs 61,447,88; p=0,036), avaliada pela bioimpedância elétrica (BIA). Quanto ao padrão de consumo alimentar, somente o consumo de gordura monoinsaturada foi diferente entre os grupos, sendo o maior consumo no grupo com menor valor de EMI (7,882,09 vs 7,022,06; p=0,031). Não houve diferença em relação à frequência de tabagismo e atividade física. Quando foi feita a análise de correlação da amostra, foi encontrada uma correlação entre a EMI de carótidas e idade (r=0,25; p=0,0067), PAS (r=0,19; p=0,0086); PP (r=0,30; p=0,0009), LDL (r=0,19; p=0,0434), assim como com gordura monoinsaturada (r= -0,25; p=0,0087), PCR (r=0,31; p=0,007) e HDL (r=-0,33; p=0,0004), porém apenas as variáveis HDL, PCRus e pressão de pulso mostraram ser preditoras independentes da EMI de carótida após feita uma análise de regressão linear multivariada. A proteína C reativa, HDL colesterol e pressão de pulso são importantes preditores independentes de aterosclerose subclínica.