Utilização de sistema de informação geográfica na avaliação do uso da terra em Botucatu (SP)

Foi utilizado o SIG-IDRISI, com o objetivo de verificar a adequação do uso da terra em 1997/98, na parte inicial da Bacia do Rio Pardo, Botucatu/Pardinho (SP), visando à obtenção de subsídios para o planejamento adequado do uso da área. As classes e subclasses de capacidade de uso foram determinadas de acordo com o Sistema de Classificação da Capacidade de Uso das Terras. As terras da área estudada foram discriminadas como: classe VIe, terras susceptíveis à erosão (90,49%); classe Va, terras planas, não-sujeitas à erosão, limitadas por excesso de água (3,48%); classe IVe, terras severamente limitadas por risco de erosão (0,50%); classe IIIa, terras planas com excesso de água (3,34%); classe IIIe, terras com declividade moderada e deflúvio rápido, riscos severos de erosão (1,32%); e classe IIe, terras produtivas, com risco ligeiro a moderado de erosão (0,87%). Pela análise conjunta da capacidade de uso e do uso atual das terras, verificou-se que 89,28% das áreas não apresentaram conflito de utilização; 2,24% estavam cultivadas com culturas anuais e perenes, adequação para tal uso, e 8,48% da área com pastagens deveria ser substituída por reflorestamento e, ou, preservação ambiental.

Dessorção, extração e fracionamento de manganês em latossolos

A pesquisa sobre a avaliação da disponibilidade de manganês tem apresentado resultados discordantes, em grande parte em decorrência dos teores considerados disponíveis pelos diversos extratores. O conhecimento das formas químicas em que se encontra o elemento e suas relações com os teores disponíveis são importantes para a previsão do seu comportamento no sistema solo-planta. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo estudar a influência da calagem e de doses de manganês sobre a dessorção, extração e fracionamento desse elemento em amostras de seis Latossolos. Essas amostras, submetidas ou não à calagem, receberam o manganês nas doses de 0, 16 e 32 mg dm-3 e permaneceram incubadas por 30 dias. Terminada a incubação, o Mn foi determinado utilizando-se os extratores Mehlich-1, Mehlich-3, DTPA e EDTA. As amostras foram submetidas a um fracionamento que separou o Mn na fração trocável (Tr), matéria orgânica (MO), óxido de manganês (OxMn), óxido de ferro amorfo (OxFeA), óxido de ferro cristalino (OxFeC) e residual (R), além dos teores totais. A dessorção foi avaliada mediante extrações sucessivas com resina de troca catiônica. Concluiu-se que o elemento foi retido, principalmente, na fração trocável e matéria orgânica. De modo geral, a calagem provocou redução nos teores trocáveis e aumento nas frações óxidos de ferro amorfo e de manganês. Na ausência da calagem, a ordem de dessorção apresentada foi Tr >> MO > OxFeA, com o Mehlich-3 sendo o melhor extrator para o Mn lábil. A calagem provocou acentuado decréscimo nos teores de Mn dessorvidos. O Mehlich-1 mostrou-se inadequado para a determinação dos teores disponíveis de Mn em solos corrigidos, condição na qual o DTPA foi o extrator mais indicado.

Fracionamento, dessorção e extração química de zinco em latossolos

O conhecimento das formas químicas do Zn no solo, bem como de suas relações com os teores disponíveis para as plantas, é importante para a previsão do comportamento desse micronutriente. Este trabalho teve como objetivo estudar a influência da calagem e de doses de Zn sobre a dessorção, extração e fracionamento desse elemento em amostras de seis Latossolos. As amostras, com e sem calagem, receberam 0, 20 e 40 mg dm-3 de Zn e foram incubadas por 30 dias. Após a incubação, foram determinados os teores de Zn pelos extratores Mehlich-1, Mehlich-3, DTPA e EDTA. Os teores de Zn foram determinados nas frações: trocável, matéria orgânica, óxido de manganês, óxido de ferro amorfo e óxido de ferro cristalino, residual, além dos teores totais. A dessorção foi avaliada mediante extrações sucessivas com resina de troca catiônica. Com a aplicação de Zn, esse elemento foi retido, principalmente, nas frações trocável e matéria orgânica. A calagem provocou drástica redução nos teores de Zn trocável e aumento nas frações: matéria orgânica, óxidos de ferro amorfo e cristalino e óxidos de manganês. Nos solos sem calagem, todos os extratores correlacionaram-se significativamente com a fração Zn trocável, enquanto, nos solos com calagem, essa correlação foi significativa com o Zn na fração orgânica. Nos solos sem calagem, o teor de Zn dessorvido das frações decresceu na seguinte ordem: trocável = matéria orgânica > óxido de manganês > óxido de ferro amorfo >> óxido de ferro cristalino, com os extratores EDTA, Mehlich-1 e Mehlich-3, apresentando as melhores correlações com o total dessorvido. A calagem provocou ausência de dessorção para o Zn

Alterações nos atributos químicos de um Latossolo distroférrico decorrentes da granulometria e doses de calcário em sistemas plantio direto e convencional

Atualmente, percebe-se o interesse na calagem superficial, sem prévia incorporação, para instalação do sistema plantio direto (SPD). Dessa forma, objetivou-se determinar os efeitos de granulometria e doses de calcários no SPD, em fase de implantação, e no sistema de plantio convencional (SPC) sobre o pH, H + Al, Ca2+ e Mg2+. O experimento foi realizado no ano agrícola de 1998/99, na FCA/UNESP-Botucatu (SP), em Latossolo Vermelho. O delineamento experimental foi de blocos ao acaso, com parcelas subsubdivididas e quatro repetições. As parcelas representaram os sistemas de plantio (SPD e SPC); as subparcelas, a granulometria dos calcários [grosso (PRNT = 56 %) e fino (PRNT = 90 %)], e as subsubparcelas, as doses de 2, 4 e 6 t ha-1 (calcário grosso) e 1,2; 2,4 e 3,6 t ha-1 (fino). O solo foi amostrado, a 0-5, 5-10, 10-20 e 20-40 cm de profundidade, 1, 3 e 12 meses após a aplicação dos corretivos. A análise de variância não detectou interação tripla entre os fatores. A aplicação de calcário superficial no SPD, independentemente da granulometria e da dose, alterou positivamente os atributos químicos do solo (0-5 e 5-10 cm), 12 meses após a calagem. O corretivo continuou reagindo, independentemente do sistema de plantio, de forma intensa, mesmo após três meses. A aplicação de doses mais elevadas de calcário, com maior granulometria, sugeriu efeito residual prolongado.

Clinical review: Update on neurally adjusted ventilatory assist - report of a round-table conference.

ABSTRACT: Conventional mechanical ventilators rely on pneumatic pressure and flow sensors and controllers to detect breaths. New modes of mechanical ventilation have been developed to better match the assistance delivered by the ventilator to the patient's needs. Among these modes, neurally adjusted ventilatory assist (NAVA) delivers a pressure that is directly proportional to the integral of the electrical activity of the diaphragm recorded continuously through an esophageal probe. In clinical settings, NAVA has been chiefly compared with pressure-support ventilation, one of the most popular modes used during the weaning phase, which delivers a constant pressure from breath to breath. Comparisons with proportional-assist ventilation, which has numerous similarities, are lacking. Because of the constant level of assistance, pressure-support ventilation reduces the natural variability of the breathing pattern and can be associated with asynchrony and/or overinflation. The ability of NAVA to circumvent these limitations has been addressed in clinical studies and is discussed in this report. Although the underlying concept is fascinating, several important questions regarding the clinical applications of NAVA remain unanswered. Among these questions, determining the optimal NAVA settings according to the patient's ventilatory needs and/or acceptable level of work of breathing is a key issue. In this report, based on an investigator-initiated round table, we review the most recent literature on this topic and discuss the theoretical advantages and disadvantages of NAVA compared with other modes, as well as the risks and limitations of NAVA.

Mutant huntingtin's effects on striatal gene expression in mice recapitulate changes observed in human Huntington's disease brain and do not differ with mutant huntingtin length or wild-type huntingtin dosage.

To test the hypotheses that mutant huntingtin protein length and wild-type huntingtin dosage have important effects on disease-related transcriptional dysfunction, we compared the changes in mRNA in seven genetic mouse models of Huntington's disease (HD) and postmortem human HD caudate. Transgenic models expressing short N-terminal fragments of mutant huntingtin (R6/1 and R6/2 mice) exhibited the most rapid effects on gene expression, consistent with previous studies. Although changes in the brains of knock-in and full-length transgenic models of HD took longer to appear, 15- and 22-month CHL2(Q150/Q150), 18-month Hdh(Q92/Q92) and 2-year-old YAC128 animals also exhibited significant HD-like mRNA signatures. Whereas it was expected that the expression of full-length huntingtin transprotein might result in unique gene expression changes compared with those caused by the expression of an N-terminal huntingtin fragment, no discernable differences between full-length and fragment models were detected. In addition, very high correlations between the signatures of mice expressing normal levels of wild-type huntingtin and mice in which the wild-type protein is absent suggest a limited effect of the wild-type protein to change basal gene expression or to influence the qualitative disease-related effect of mutant huntingtin. The combined analysis of mouse and human HD transcriptomes provides important temporal and mechanistic insights into the process by which mutant huntingtin kills striatal neurons. In addition, the discovery that several available lines of HD mice faithfully recapitulate the gene expression signature of the human disorder provides a novel aspect of validation with respect to their use in preclinical therapeutic trials.

Utilização da medida do clorofilômetro no manejo da adubação nitrogenada em plantas de pimentão

O adequado manejo da adubação nitrogenada ao longo do ciclo da cultura do pimentão é complicado pela falta de um índice do N disponível no solo e por ser a análise química de folhas um método de diagnose demorado. Foi realizado um experimento em vasos, em um túnel de plástico pertencente ao Departamento de Recursos Naturais/Ciência do Solo, da FCA/UNESP, Botucatu (SP), com o objetivo de avaliar o índice de suficiência de nitrogênio (ISN), calculado com base nas medidas do clorofilômetro, como ferramenta auxiliar no manejo da adubação nitrogenada em plantas de pimentão. O experimento foi composto de doses de N (4,9; 9,8; 14,7; 19,6; e 24,5 g de N 50 kg-1 de solo - uma planta) aplicadas de modo convencional ou pela fertirrigação e um tratamento em que as plantas não receberam apenas a adubação nitrogenada, com sete repetições. As medidas do clorofilômetro foram realizadas a cada 15 dias em cinco folhas recém-maduras por planta. O ISN foi calculado pela relação entre a média das medidas do clorofilômetro nas plantas dos tratamentos (MCT) e a média das medidas do clorofilômetro nas plantas que receberam a maior dose (MCR), na área de referência (ISN = MCT/MCR x 100). O ISN pode ser um bom indicador do momento de aplicação do adubo nitrogenado e auxiliar no ajuste da dose de N de acordo com a exigência das plantas de pimentão, com a finalidade de aumentar a eficiência de utilização do N aplicado.

Variabilidade espacial da agregação do solo avaliada pela geometria fractal e geoestatística

Este trabalho teve por objetivo explorar a aplicabilidade da teoria de fractais no estudo da variabilidade espacial em agregação de solo. A geometria de fractais tem sido proposta como um modelo para a distribuição de tamanho de partículas. A distribuição do tamanho de agregados do solo, expressos em termos de massa, é apresentada. Os parâmetros do modelo, tais como: a dimensão fractal D, medida representativa da fragmentação do solo (quanto maior seu valor, maior a fragmentação), e o tamanho do maior agregado R L foram definidos como ferramentas descritivas para a agregação do solo. Os agregados foram coletados em uma profundidade de 0-10 cm de um Latossolo Vermelho distrófico típico álico textura argilosa, em Angatuba, São Paulo. Uma grade regular de 100 x 100 m foi usada e a amostragem realizada em 76 pontos nos quais se determinou a distribuição de agregados por via úmida, usando água, álcool e benzeno como pré-tratamentos. Pelo exame de semivariogramas, constatou-se a ocorrência de dependência espacial. A krigagem ordinária foi usada como interpolador e mapas de contorno mostraram-se de grande utilidade na descrição da variabilidade espacial de agregação do solo.

Inclusive fitness theory and eusociality.

Arising from M. A. Nowak, C. E. Tarnita & E. O. Wilson 466, 1057-1062 (2010); Nowak et al. reply. Nowak et al. argue that inclusive fitness theory has been of little value in explaining the natural world, and that it has led to negligible progress in explaining the evolution of eusociality. However, we believe that their arguments are based upon a misunderstanding of evolutionary theory and a misrepresentation of the empirical literature. We will focus our comments on three general issues.

Assessment of changes in body water by bioimpedance in acutely ill surgical patients.

OBJECTIVE: To evaluate the relationship between changes in body bioelectrical impedance (BI) at 0.5, 50 and kHz and the changes in body weight, as an index of total body water changes, in acutely ill surgical patients during the rapid infusion of isotonic saline solution. DESIGN: Prospective clinical study. SETTING: Multidisciplinary surgical ICU in a university hospital. PATIENTS: Twelve male patients treated for acute surgical illness (multiple trauma n = 5, major surgery n = 7). Selection criteria: stable cardiovascular parameters, normal cardiac function, signs of hypovolemia (CVP < or = 5 mmHg, urine output < 1 ml/kg x h). INTERVENTIONS: After baseline measurements, a 60 min fluid challenge test was performed with normal saline solution, 0.25 ml/kg/min [corrected]. MEASUREMENTS AND RESULTS: Body weight (platform digital scale), total body impedance (four-surface electrode technique; measurements at 0.5, 50 and 100 kHz) and urine output. Fluid retention induced a progressive decrease in BI at 0.5, 50 and 100 kHz, but the changes were significant for BI 0.5 and BI 100 only, from 40 min after the beginning of the fluid therapy onwards. There was a significant negative correlation between changes in water retention and BI 0.5, with individual correlation coefficients ranging from -0.72 to 0.95 (p < 0.01-0.0001). The slopes of the regression lines indicated that for each kg of water change, there was a mean decrease in BI of 18 ohm, but a substantial inter-individual variability was noted. CONCLUSION: BI measured at low frequency can represent a valuable index of acute changes in body water in a group of surgical patients but not in a given individual.

Correlação entre características de latossolos e parâmetros de equações de adsorção de cobre e zinco

A adsorção de Cu e Zn é um dos principais fenômenos responsáveis pela disponibilidade desses elementos para as plantas. Portanto, estudos sobre a adsorção desses elementos em solos podem ser ferramentas úteis para compreensão da relação entre características dos solos e retenção desses micronutrientes. Nesse sentido, o presente trabalho objetivou caracterizar a adsorção de Cu e Zn em amostras de seis Latossolos de Minas Gerais e as influências de características dos solos sobre os parâmetros de adsorção obtidos pelas equações de Langmuir e de Freundlich. Para tanto, foram utilizadas soluções de cloreto de cobre e cloreto de zinco nas concentrações 0, 10, 20, 40, 60, 80, 100, 120 e 140 mg L-1, ajustadas a pH 5,5. As equações de Langmuir e Freundlich foram eficientes na determinação dos parâmetros de adsorção de Zn e Cu, sendo os teores de argila e de matéria orgânica, respectivamente, as características mais bem relacionadas com a capacidade de adsorção desses elementos pelos solos. Os solos estudados apresentaram maior energia de ligação dos sítios de troca e maior capacidade de adsorção máxima para Cu relativamente ao Zn. O P remanescente não se correlacionou com os parâmetros de adsorção de Zn, em virtude, provavelmente, da influência da matéria orgânica em sua determinação. Este fato pode limitar sua eficiência na previsão da adsorção deste elemento em solos com alto teor de C orgânico.

CD47 knockout mice exhibit improved recovery from spinal cord injury.

Recent data have implicated thrombospondin-1 (TSP-1) signaling in the acute neuropathological events that occur in microvascular endothelial cells (ECs) following spinal cord injury (SCI) (Benton et al., 2008b). We hypothesized that deletion of TSP-1 or its receptor CD47 would reduce these pathological events following SCI. CD47 is expressed in a variety of tissues, including vascular ECs and neutrophils. CD47 binds to TSP-1 and inhibits angiogenesis. CD47 also binds to the signal regulatory protein (SIRP)α and facilitates neutrophil diapedesis across ECs to sites of injury. After contusive SCI, TSP-1(-/-) mice did not show functional improvement compared to wildtype (WT) mice. CD47(-/-) mice, however, exhibited functional locomotor improvements and greater white matter sparing. Whereas targeted deletion of either CD47 or TSP-1 improved acute epicenter vascularity in contused mice, only CD47 deletion reduced neutrophil diapedesis and increased microvascular perfusion. An ex vivo model of the CNS microvasculature revealed that CD47(-/-)-derived microvessels (MVs) prominently exhibit adherent WT or CD47(-/-) neutrophils on the endothelial lumen, whereas WT-derived MVs do not. This implicates a defect in diapedesis mediated by the loss of CD47 expression on ECs. In vitro transmigration assays confirmed the role of SIRPα in neutrophil diapedesis through EC monolayers. We conclude that CD47 deletion modestly, but significantly, improves functional recovery from SCI via an increase in vascular patency and a reduction of SIRPα-mediated neutrophil diapedesis, rather than the abrogation of TSP-1-mediated anti-angiogenic signaling.

Early onset collagen VI myopathies: Genetic and clinical correlations.

OBJECTIVE: Mutations in the genes encoding the extracellular matrix protein collagen VI (ColVI) cause a spectrum of disorders with variable inheritance including Ullrich congenital muscular dystrophy, Bethlem myopathy, and intermediate phenotypes. We extensively characterized, at the clinical, cellular, and molecular levels, 49 patients with onset in the first 2 years of life to investigate genotype-phenotype correlations. METHODS: Patients were classified into 3 groups: early-severe (18%), moderate-progressive (53%), and mild (29%). ColVI secretion was analyzed in patient-derived skin fibroblasts. Chain-specific transcript levels were quantified by quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR), and mutation identification was performed by sequencing of complementary DNA. RESULTS: ColVI secretion was altered in all fibroblast cultures studied. We identified 56 mutations, mostly novel and private. Dominant de novo mutations were detected in 61% of the cases. Importantly, mutations causing premature termination codons (PTCs) or in-frame insertions strikingly destabilized the corresponding transcripts. Homozygous PTC-causing mutations in the triple helix domains led to the most severe phenotypes (ambulation never achieved), whereas dominant de novo in-frame exon skipping and glycine missense mutations were identified in patients of the moderate-progressive group (loss of ambulation). INTERPRETATION: This work emphasizes that the diagnosis of early onset ColVI myopathies is arduous and time-consuming, and demonstrates that quantitative RT-PCR is a helpful tool for the identification of some mutation-bearing genes. Moreover, the clinical classification proposed allowed genotype-phenotype relationships to be explored, and may be useful in the design of future clinical trials.

Establishment of the epithelial-specific transcriptome of normal and malignant human breast cells based on MPSS and array expression data.

INTRODUCTION: Diverse microarray and sequencing technologies have been widely used to characterise the molecular changes in malignant epithelial cells in breast cancers. Such gene expression studies to identify markers and targets in tumour cells are, however, compromised by the cellular heterogeneity of solid breast tumours and by the lack of appropriate counterparts representing normal breast epithelial cells. METHODS: Malignant neoplastic epithelial cells from primary breast cancers and luminal and myoepithelial cells isolated from normal human breast tissue were isolated by immunomagnetic separation methods. Pools of RNA from highly enriched preparations of these cell types were subjected to expression profiling using massively parallel signature sequencing (MPSS) and four different genome wide microarray platforms. Functional related transcripts of the differential tumour epithelial transcriptome were used for gene set enrichment analysis to identify enrichment of luminal and myoepithelial type genes. Clinical pathological validation of a small number of genes was performed on tissue microarrays. RESULTS: MPSS identified 6,553 differentially expressed genes between the pool of normal luminal cells and that of primary tumours substantially enriched for epithelial cells, of which 98% were represented and 60% were confirmed by microarray profiling. Significant expression level changes between these two samples detected only by microarray technology were shown by 4,149 transcripts, resulting in a combined differential tumour epithelial transcriptome of 8,051 genes. Microarray gene signatures identified a comprehensive list of 907 and 955 transcripts whose expression differed between luminal epithelial cells and myoepithelial cells, respectively. Functional annotation and gene set enrichment analysis highlighted a group of genes related to skeletal development that were associated with the myoepithelial/basal cells and upregulated in the tumour sample. One of the most highly overexpressed genes in this category, that encoding periostin, was analysed immunohistochemically on breast cancer tissue microarrays and its expression in neoplastic cells correlated with poor outcome in a cohort of poor prognosis estrogen receptor-positive tumours. CONCLUSION: Using highly enriched cell populations in combination with multiplatform gene expression profiling studies, a comprehensive analysis of molecular changes between the normal and malignant breast tissue was established. This study provides a basis for the identification of novel and potentially important targets for diagnosis, prognosis and therapy in breast cancer.

Influence of early antioxidant supplements on clinical evolution and organ function in critically ill cardiac surgery, major trauma, and subarachnoid hemorrhage patients.

INTRODUCTION: Oxidative stress is involved in the development of secondary tissue damage and organ failure. Micronutrients contributing to the antioxidant (AOX) defense exhibit low plasma levels during critical illness. The aim of this study was to investigate the impact of early AOX micronutrients on clinical outcome in intensive care unit (ICU) patients with conditions characterized by oxidative stress. METHODS: We conducted a prospective, randomized, double-blind, placebo-controlled, single-center trial in patients admitted to a university hospital ICU with organ failure after complicated cardiac surgery, major trauma, or subarachnoid hemorrhage. Stratification by diagnosis was performed before randomization. The intervention was intravenous supplements for 5 days (selenium 270 microg, zinc 30 mg, vitamin C 1.1 g, and vitamin B1 100 mg) with a double-loading dose on days 1 and 2 or placebo. RESULTS: Two hundred patients were included (102 AOX and 98 placebo). While age and gender did not differ, brain injury was more severe in the AOX trauma group (P = 0.019). Organ function endpoints did not differ: incidence of acute kidney failure and sequential organ failure assessment score decrease were similar (-3.2 +/- 3.2 versus -4.2 +/- 2.3 over the course of 5 days). Plasma concentrations of selenium, zinc, and glutathione peroxidase, low on admission, increased significantly to within normal values in the AOX group. C-reactive protein decreased faster in the AOX group (P = 0.039). Infectious complications did not differ. Length of hospital stay did not differ (16.5 versus 20 days), being shorter only in surviving AOX trauma patients (-10 days; P = 0.045). CONCLUSION: The AOX intervention did not reduce early organ dysfunction but significantly reduced the inflammatory response in cardiac surgery and trauma patients, which may prove beneficial in conditions with an intense inflammation. TRIALS REGISTRATION: Clinical Trials.gov RCT Register: NCT00515736.