Gene-based approach to human gene-phenotype correlations

Elucidating the genetic basis of human phenotypes is a major goal of contemporary geneticists. Logically, two fundamental and contrasting approaches are available, one that begins with a phenotype and concludes with the identification of a responsible gene or genes; the other that begins with a gene and works toward identifying one or more phenotypes resulting from allelic variation of it. This paper provides a conceptual overview of phenotype-based vs. gene-based procedures with emphasis on gene-based methods. A key feature of a gene-based approach is that laboratory effort first is devoted to developing an assay for mutations in the gene under regard; the assay then is applied to the evaluation of large numbers of unrelated individuals with a variety of phenotypes that are deemed potentially resulting from alleles at the gene. No effort is directed toward chromosomally mapping the loci responsible for the phenotypes scanned. Example is made of my laboratory’s successful use of a gene-based approach to identify genes causing hereditary diseases of the retina such as retinitis pigmentosa. Reductions in the cost and improvements in the speed of scanning individuals for DNA sequence anomalies may make a gene-based approach an efficient alternative to phenotype-based approaches to correlating genes with phenotypes.

The KMDB/MutationView: a mutation database for human disease genes

The KMDB/MutationView is a graphical database of mutations in human disease-causing genes and its current version consists of nine category-based sub-databases including diseases of eye, heart, ear, brain, cancer, syndrome, autoimmunity, muscle and blood. The KMDB/MutationView stores mutation data of 97 genes involved in 87 different disease and is accessible through http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp.

Switch from monoallelic to biallelic human IGF2 promoter methylation during aging and carcinogenesis.

We have previously linked aging, carcinogenesis, and de novo methylation within the promoter of the estrogen receptor (ER) gene in human colon. We now examine the dynamics of this process for the imprinted gene for insulin-like growth factor II (IGF2). In young individuals, the P2-4 promoters of IGF2 are methylated exclusively on the silenced maternal allele. During aging, this promoter methylation becomes more extensive and involves the originally unmethylated allele. Most adult human tumors, including colon, breast, lung, and leukemias, exhibit increased methylation at the P2-4 IGF2 promoters, suggesting further spreading during the neoplastic process. In tumors, this methylation is associated with diminished or absent IGF2 expression from the methylated P3 promoter but maintained expression from P1, an upstream promoter that is not contained within the IGF2 CpG island. Our results demonstrate a remarkable evolution of methylation patterns in the imprinted promoter of the IGF2 gene during aging and carcinogenesis, and provide further evidence for a potential link between aberrant methylation and diseases of aging.

Utilità e limiti della diagnosi di patologie polmonari e pleuriche asbesto-correlate

L’apparato respiratorio rappresenta il bersaglio di numerose sostanze tossiche aerodisperse che rivestono un ruolo chiave nella patogenesi della maggior parte delle patologie polmonari e pleuriche, sia benigne che maligne. Nonostante per alcune di esse siano noti specifici fattori di rischio, le sole attività di prevenzione primaria non sono sufficienti a limitarne la diffusione. Si rende quindi necessario attuare adeguate misure di prevenzione secondaria per la diagnosi di malattie potenzialmente curabili allo stadio iniziale, in modo da aumentare l’efficacia dei trattamenti terapeutici e le possibilità di guarigione. Un approccio non invasivo per lo studio dei meccanismi fisiopatologici alla base delle patologie polmonari e pleuriche potrebbe essere effettuato anche con nuove metodiche (es. naso elettronico), al fine di identificare e validare nuovi biomarcatori per un più specifico approccio diagnostico. Il lavoro scientifico ha riguardato inizialmente l’identificazione di un indicatore o di un gruppo di indicatori dotati di potere diagnostico sufficientemente elevato per poter discriminare precocemente, nell’ambito di soggetti con pregressa esposizone ad asbesto, patologie benigne, sia polmonari che pleuriche, da patologie maligne. Successivamente l’attenzione è stata rivolta alla diagnosi precoce di patologie neoplastiche a carico del solo parenchima polmonare, valutando il potere discriminante di un pattern di composti organici volatili (VOCs, tra cui pentano, 2-metilpentano, esano, etilbenzene, eptanale e trans-2-nonenale) raccolti con metodiche non invasive e dotati di potere diagnostico tale da discriminare patologie benigne da patologie maligne potenzialmente curabili in soggetti ad alto rischio di sviluppare cancro del polmone. Infine abbiamo tentato di ottimizzare i parametri di impostazione e raccolta di un nuovo strumento: il naso elettronico. Su di esso esistono alcuni lavori in letteratura in cui ne vengono descritte le potenzialità in ambito diagnostico per il riconoscimento di specifici pattern suggestivi di patologie polmonari, sia flogistiche (TBC, BPCO) che neoplastiche (mesotelioma, NSCLC). Purtroppo nessuno di questi lavori definisce le condizioni ottimali di utilizzo, i limiti dello strumento e le interferenze di fattori ambientali e soggettivi riguardo al segnale elaborato. Il lavoro si è concentrato soprattutto sull’indagine delle condizioni ottimali di utilizzo e sull’eventuale condizionamento del segnale da parte di determinate variabili ambientali (es. umidità) o individuali (es. fumo, cibo, alcol).

Base de dados de informação nutricional, relacionados com doenças crônicas não transmissíveis, de alimentos comercializados no Brasil

A recente evolução das doenças crônicas não transmissíveis (DCNT), possivelmente associadas às mudanças de hábitos alimentares, tem sido um desafio para a promoção da alimentação saudável em vários países, inclusive no Brasil, onde o sódio tem sido o foco de atenção, pela possibilidade da redução da sua elevada ingestão ser uma das medidas com melhor custo benefício para saúde pública. É necessário conhecer o conteúdo de sódio e de componentes específicos, relacionados às DCNT nos alimentos comercializados no país, para orientar o consumidor na seleção adequada dos alimentos e mesmo para modificar sua composição; no entanto, nas bases de dados, o conteúdo desse mineral está presente em um número reduzido de alimentos. O objetivo da presente pesquisa foi a elaboração de uma base de dados de alimentos processados com componentes específicos associados às DCNT, dando ênfase ao sódio, e avaliar o uso dessa base de dados para estimar a sua ingestão. Informações nutricionais de rótulos e de websites de indústrias de alimentos foram coletadas para inclusão na base de dados, elaborada de acordo com as diretrizes do International collaborative project to compare and monitor the nutritional composition of processed foods, coordenado pelo The George Institute for Global Health (Austrália). A avaliação da variação do conteúdo de sódio foi realizada para alguns alimentos processados presentes na base de dados, considerando os de maior consumo nacional. O conteúdo de sódio em refeições de restaurantes populares de São Paulo foi analisado por espectrofotometria de absorção atômica de chama e estimado pela base de dados elaborada para comparação. Na base de dados estão incluídas informações de 2.319 alimentos distribuídos em 14 grupos. Foi observada grande variação no conteúdo de sódio entre diferentes tipos de pães de forma industrializados, de salsichas, de linguiças, de queijos e iogurtes. O conteúdo de sódio analisado nas refeições (base integral) variou de 215,9 mg a 427,9 mg por 100 kcal, enquanto que o conteúdo de sódio estimado variou de 204,2 mg a 486,8 mg por 100 kcal (418 kJ). A análise do coeficiente de correlação entre valores analíticos e estimados do conteúdo de sódio em refeições mostrou forte correlação entre esses dados para dois restaurantes (r=0,703 e 0,897) e moderada correlação para outros dois (r=0,513 e 0,622) dos cinco restaurantes estudados, indicando que através da base de dados elaborada é possível obter uma estimativa da ingestão de sódio. A importância de se conhecer o conteúdo de sódio de refeições e/ou alimentos está na possibilidade de uso dessas informações para orientar a redução do sal empregado no preparo da refeição, e ampliar para o consumidor informações que permitam identificar alternativas para redução do consumo de sal.

Formação pela experiência: Revelando novas faces e rompendo os disfarces da odontologia \'in vitro\'

Os cursos de graduação em odontologia vêm privilegiando uma formação fundamentada na técnica, com práticas curativistas e individualizadas, tornando-se incapazes de formar a força de trabalho necessária à resolução dos problemas de saúde bucal da população. Com a implementação das Diretrizes Curriculares Nacionais (DCN) para os cursos de graduação em odontologia, uma série de mudanças curriculares vêm sendo executadas no sentido de favorecer a formação adequada. Acredita-se que a educação pela experiência configure-se como um conjunto de ferramentas viável e eficaz para garantir a formação adequada e coerente com os princípios do Sistema Único de Saúde (SUS). Cita-se, como uma dessas possibilidades, os Estágios Curriculares Supervisionados (ECS), previstos nas DCN para serem desenvolvidos de forma articulada e com complexidade crescente ao longo do processo de formação. O estudo destina-se a compreender a articulação ensino-trabalho-cidadania por diferentes olhares e, aliado a experiências vivenciais dessa articulação, construir um modelo de Estágio Curricular Supervisionado (ECS) em serviço público de saúde, no âmbito da Atenção Primária em Saúde (APS), para cursos de graduação em odontologia. Trata-se de um estudo qualitativo dividido em duas fases. Na primeira, foi experienciado um modelo de estágio vinculado à um projeto de pesquisa que se propõe à inovar as práticas de saúde bucal no SUS, utilizando-se de uma proposta de clínica ampliada. Nessa etapa, participaram a pesquisadora, estagiários e preceptores que foram entrevistados e/ou escreveram diários de campo. Na segunda fase, alunos de odontologia, profissionais e gestores de serviços de saúde do município de São Paulo manifestaram suas percepções por meio de grupos focais e entrevistas individuais, respectivamente. O material coletado foi analisado por intermédio da hermenêutica dialética e da triangulação de dados. Os dados descortinam a intimidade das clínicas de uma Faculdade de odontologia, revelando o que se denominou de ensino da odontologia \'in vitro\', distante da realidade e limitado no sentido de solucionar os problemas de saúde bucal do público atendido. Em contrapartida, foi evidente os benefícios que as vivências no mundo real, nos mais variados espaços, podem trazer para esses estudantes. Para os estagiários do modelo experienciado, a prática em clínica ampliada permite extrapolar a odontologia \'in vitro\' e se aproximar da realidade. Preceptores e gestores manifestam opiniões convergentes e explicitam, ainda, o poder transformador que a presença de estudantes denota para os serviços além de induzir à educação permanente dos profissionais que atuam como preceptores. Com bases nessas colocações, foi elaborado um modelo de ECS para cursos de odontologia, de modo a permitir que os estudantes experienciem a realidade de saúde e trabalhem na dimensão da clínica do corpo vivo, subjetivado e complexo. Deseja-se oferecer ao estudante a possibilidade de refletir e experienciar os espaços onde as ações em saúde são produzidas, em um processo de ensino-aprendizagem centrado metodologias ativas, com a mediação pedagógica desenvolvida por preceptores e docentes. Acredita-se que suas características, pensadas em função da triangulação dos diferentes olhares que compuseram o estudo, revertem-se de força suficiente para inquietar o instituído e metamorfosear a formação disfarçada da odontologia.

Mujeres, salud y profesiones sanitarias: revisión historiográfica y estudio de casos en la sanidad española contemporánea

La reconstrucción histórica de las prácticas de salud de las mujeres, tomando el caso español como campo de pruebas y modelo de análisis, constituye una de las líneas directrices de éste trabajo. Sobre la base de una importante cantidad de estudios empíricos, ajenos y propios, centrados muy en especial en el área de la enfermería, se puede delinear una imagen de conjunto sobre el trabajo sanitario de las mujeres, en el espacio geográfico y temporal objeto de nuestro estudio y contestar así a una serie de cuestiones en las que lo experto, la experiencia, la autoridad y los procesos de legitimación profesional están omnipresentes. La segunda de las vertientes abordadas es la de las mujeres como pacientes y usuarias de prácticas de salud. Las llamadas “patologías de mujeres” como la clorosis o la neurastenia y el significado histórico del protagonismo de las mujeres en las campañas y programas de educación sanitaria son otros tantos ejemplos que permiten desvelar discursos cargados de elementos ideológicos tradicionales pese a su aparente barniz de modernidad. Como principales conclusiones, hay que destacar la importancia que alcanzaron los discursos androcéntricos en temas concernientes a salud y mujer de forma global, o los más específicos como el del culto a la fecundidad para justificar unas tareas sociales diferentes y complementarias a las del hombre, además de señalar la conveniencia de explorar nuevos caminos a recorrer, tanto desde el punto de vista temático como en lo relativo a los recursos heurísticos.

Assessing stool quantities generated by three specific Kato-Katz thick smear templates employed in different settings.

BACKGROUND The Kato-Katz technique is recommended for the diagnosis of helminth infections in epidemiological surveys, drug efficacy studies and monitoring of control interventions. We assessed the comparability of the average amount of faeces generated by three Kato-Katz templates included in test kits from two different providers. METHODS Nine hundred Kato-Katz thick smear preparations were done; 300 per kit. Empty slides, slides plus Kato-Katz template filled with stool and slides plus stool after careful removal of the template were weighed to the nearest 0.1 mg. The average amount of stool that was generated on the slide was calculated for each template, stratified by standard categories of stool consistency (i.e. mushy, soft, sausage-shaped, hard and clumpy). RESULTS The average amount of stool generated on slides was 40.7 mg (95 % confidence interval (CI): 40.0-41.4 mg), 40.3 mg (95 % CI: 39.7-40.9 mg) and 42.8 mg (95 % CI: 42.2-43.3 mg) for the standard Vestergaard Frandsen template, and two different templates from the Chinese Center for Disease Control and Prevention (China CDC), respectively. Mushy stool resulted in considerably lower average weights when the Vestergaard Frandsen (37.0 mg; 95 % CI: 34.9-39.0 mg) or new China CDC templates (37.4 mg; 95 % CI: 35.9-38.9 mg) were used, compared to the old China CDC template (42.2 mg; 95 % CI: 40.7-43.7 mg) and compared to other stool consistency categories. CONCLUSION The average amount of stool generated by three specific Kato-Katz templates was similar (40.3-42.8 mg). Since the multiplication factor is somewhat arbitrary and small changes only have little effect on infection intensity categories, it is suggested that the standard multiplication factor of 24 should be kept for the calculation of eggs per gram of faeces for all investigated templates.

Bibliographies on nursing; books, pamphlets, articles, audio-visual materials.

A replacement for, rather than an addition to, the bibliographies of the former National Organization for Public Health Nursing, the National League of Nursing Education, 1952, and the National League for Nursing, 1954-55.

Bibliographies on nursing; books, pamphlets, articles, audio-visual aids.

Vol. 5 issued by the National League for Nursing, Division of Nursing Education.

Bulletin /

Description based on Bulletin no. 3, Brood of diseases of bees.

Die Krankheiten des Herzens und der Aorta /

Translation of: The diseases of the heart and aorta. Dublin : Hodges and Smith, 1854.

Die Pathologie und Diagnose der Krankheiten der Brust, ins Besondere erläutert durch eine rationelle Erklärung ihrer physikalischen Zeichen nebst neuen Untersuchung über die Tone des herzens.

Translation of The pathology and diagnosis of diseases of the chest.

Nelson loose-leaf medicine /

Vol. 1. Infectious diseases. -- Vol. 2. Infectious diseases. Parasitic diseases. Chemical agents. Physical agents. -- Vol. 3. Metabolism. Endocrine glands. Lymph glands. Respiratory system. -- Vol. 4. Diseases of blood. Circulatory system. Kidney. -- Vol. 5. Diseases of digestive system. Muscles, bones, joints. -- Vol. 6. Diseases of nervous system. -- Vol. 7. Preventive medicine. -- Vol. 8. Research. Current literature.

Indian paint fungus : a method for recognizing and reducing hazard in advanced grand and white fir regeneration in eastern Oregon and Washington /

Bibliography: p. 9.