Year-class formation in Pacific herring (Clupea pallasi) estimated from spawning-date distributions of juveniles in San Francisco Bay, California

Inter and intra-annual variation in year-class strength was analyzed for San Francisco Bay Pacific herring (Clupea pallasi) by using otoliths of juveniles. Juvenile herring were collected from March through June in 1999 and 2000 and otoliths from subsamples of these collections were aged by daily otolith increment analysis. The composition of the year classes in 1999 and 2000 were determined by back-calculating the birth date distribution for surviving juvenile herring. In 2000, 729% more juveniles were captured than in 1999, even though an estimated 12% fewer eggs were spawned in 2000. Spawning-date distributions show that survival for the 2000 year class was exceptionally good for a short (approximately 1 month) period of spawning, resulting in a large abundance of juvenile recruits. Analysis of age at size shows that growth rate increased significantly as the spawning season progressed both in 1999 and 2000. However, only in 2000 were the bulk of surviving juveniles a product of the fast growth period. In the two years examined, year-class strength was not predicted by the estimated number of eggs spawned, but rather appeared to depend on survival of eggs or larvae (or both) through the juvenile stage. Fast growth through the larval stage may have little effect on year-class strength if mortality during the egg stage is high and few larvae are available.

Nesting Success of Kemp’s Ridley Sea Turtles, Lepidochelys kempi, at Rancho Nuevo, Tamaulipas, Mexico, 1982–2004

The Kemp’s ridley sea turtle, Lepidochelys kempi, was on the edge of extinction owing to a combination of intense egg harvesting and incidental capture in commercial fishing trawls. Results from a cooperative conservation strategy initiated in 1978 between Mexico and the United States to protect and restore the Kemp’s ridley turtle at the main nesting beach at Rancho Nuevo, Tamaulipas, Mexico are assessed. This strategy appears to be working as there are signs that the species is starting to make a recovery. Recovery indicators include: 1) increased numbers of nesting turtles, 2) increased numbers of 100+ turtle nesting aggregations (arribadas), 3) an expanding nesting season now extending from March to August, and 4) significant nighttime nesting since 2003. The population low point at Rancho Nuevo was in 1985 (706 nests) and the population began to significantly increase in 1997 (1,514 nests), growing to over 4,000 nests in 2004. The size and numbers of arribadas have increased each year since 1983 but have yet to exceed the 1,000+ mark; most arribadas are still 200–800+ turtles.

The Origin, Evolution, and Demise of the U.S. Sea Turtle Fisheries

Fishing was America's first industry, and turtling played an important role in the nation's developing fisheries. However, before the European settlers arrived in the New World, Native Americans had already developed spiritual and gastronomic relationships with sea turtles. There are indications that ancient Florida tribes had eaten sea turtles and then placed the skulls in burial mounds (Johnson, 1952).

Inhibition of Protease Activity in Muscle Extracts and Surimi from Pacific Whiting, Merluccius productus, and Arrowtooth Flounder, Atheresthes stomias

Muscle extracts of Pacific whiting, Merluccius productus, and arrowtooth flounder, Atheresthes stomias, were assayed for proteolytic activity using azocasein as a substrate. Pacific whiting extracts showed maximum activity at pH 5.0-5.2 and a temperature of 50°C, while arrowtooth flounder extracts had maximum activity at pH 5.5 and 55°C. Three sources of inhibitors (potatoes, egg white, beef plasma protein) were evaluated in vitro for inhibition of protease activity. All three were found to be effective inhibitors in crude muscle extracts. Further studies utilizing these inhibitors in surimi showed that potato was equivalent to both egg white and beef plasma protein in preserving the gel forming characteristics ofheated kamaboko in both species.

Submersible Observations on Lingcod, Ophiodon elongatus, Nesting Below 30 m off Sitka, Alaska

A research submersible was used to delineate the depth distribution of lingcod, Ophiodon elongatus, nests (egg masses) below 30 m. Although nests were not seen deeper than 97 m, behavior and dark coloration distinctive of nest-guarding lingcod were seen as deep as 126 m. Males guarding nests were distinctly colored, i.e., dark with little or no mottling, and most were obviously scarred. Two types of guarding behaviors were observed: 1) Males lying directly on or beside the nest and remaining nearly motionless unless touched and 2) males lying on a sentry post and defending the nest when other fish swam close.

Padrões de assimetria associados à ecologia de cinco espécies de lagartos tropicais Cnemidophorus (Squamata, Teiidae) em áreas de restinga ao longo da costa leste brasileira

O estudo da instabilidade do desenvolvimento (ID) em organismos pode ser útil para identificar os primeiros sinais de estresse ambiental. Alterações na ID também influenciam a aptidão dos organismos. A variação entre a simetria dos lados esquerdo e direito, manifestada como assimetria flutuante (AF), é um indicador da ID. Ao quantificarmos a literatura científica referente aos estudos de assimetria em répteis identificamos as seguintes tendências: perturbações ambientais aumentam a AF nas populações, fêmeas tendem a escolher machos com características sexuais simétricas, a instabilidade térmica durante o desenvolvimento do ovo pode produzir indivíduos com maior assimetria, a ocorrência de lesões é mais frequente em indivíduos assimétricos para um determinado lado e há uma correlação negativa entre a assimetria e o desempenho locomotor. Considerando os nossos critério de busca, não encontramos estudos sobre assimetria em répteis na América do Sul. Neste estudo, utilizamos diferentes caracteres merísticos e métricos bilaterais para identificar a AF em diferentes populações de cinco espécies de lagartos do gênero Cnemidophorus (C. abaetensis, C. lacertoides, C. littoralis, C. nativo, C. ocellifer) em 15 áreas de restinga ao longo da costa leste do Brasil. A AF foi maior em populações de Cnemidophorus com maior densidade, menor em populações de restingas com maior degradação ambiental e a sua relação com a concentração de mercúrio variou dependendo da espécie. Provavelmente os agentes estressores ambientais avaliados atuam com intensidades diferentes. O nível de degradação ambiental e a concentração de mercúrio causariam a deterioração precoce dos indivíduos com maiores valores de AF. Isso resulta em uma relação inversa entre esses estresses e a AF das populações. Indivíduos com vestígios de autotomia caudal tiveram maiores valores de AF, o que pode ser um indicativo de que indivíduos com menor aptidão efetuam mais autotomia caudal do que aqueles com maior aptidão. Lagartos com evidências de autotomia também tiveram maior tamanho corpóreo, provavelmente devido a estes estarem expostos a mais tempo aos riscos de predação. Não encontramos diferenciação entre as espécies na frequência de autotomia caudal sendo esta talvez melhor explicada por fatores ambientais como a intensidade de predação. Os índices de AF para caracteres múltiplos se mostraram mais eficientes do que a AF de caracteres individuais nas comparações entre indivíduos vivendo em populações com diferentes níveis de estresse e entre indivíduos com e sem autotomia caudal

Caracterização de reservatórios não convencionais Shale Gas na Formação Barreirinha Bacia do Amazonas

Os folhelhos pretos devonianos da Formação Barreirinha caracterizamse pela alta radioatividade na porção basal, grande extensão areal, espessura e profundidade de soterramento variável que vão de exposição na superfície até mais de 3000 m. Eles são as principais rochas geradoras do sistema petrolífero convencional da Bacia do Amazonas, e recentemente foram consideradas como promissores plays de gás não convencional. Folhelhos são geralmente caracterizados por uma matriz fechada, que faz com que sejam relativamente impermeáveis em relação ao fluxo de gás, a menos que ocorram fraturas, e dependendo das suas características geológicas e geoquímicas podem funcionar com um Sistema Petrolífero autossuficiente, atuando tanto como rocha fonte, quanto como reservatório de gás (reservatório Shale Gas). Assim, o gás natural termogênico ou biogênico gerado pode ser armazenado em folhelhos ricos em matéria orgânica na forma livre, adsorvida, ou em estado dissolvido. Em contraste com os sistemas petrolíferos convencionais, reservatórios Shale Gas, possuem mecanismos de aprisionamento e armazenamento únicos, sendo necessária a utilização de técnicas de avaliações específicas. No entanto, folhelhos prolíficos geralmente podem ser reconhecidos a partir de alguns parâmetros básicos: arquitetura geológica e sedimentar, propriedades geoquímicas e petrofísicas e composição mineralógica. Tendo em vista a carência de pesquisas de caráter descritivo, com cunho exploratório dos folhelhos geradores da Formação Barreirinha, esta dissertação tem como objetivo introduzir uma metodologia de identificação de intervalos de folhelho gerador com potencial para reservatório Shale Gas. Começando com uma investigação regional sobre o contexto geológico e sedimentar, seguido de uma avaliação abrangente enfocando as características geoquímicas, petrofísicas e litofácies dos folhelhos a partir da integração de parâmetros obtidos de perfis geofísicos de poço, análises geoquímicas e aplicação dos conceitos de Estratigrafia de Sequencia.

The River Exe SAP Final Plan

This is the River Exe Salmon Action Plan Final document produced by the Environment Agency in 2003. This final Salmon Action Plan (SAP) for the River Exe catchment has been produced after consideration of feedback from external consultation. The actions presented within this Salmon Action Plan clarify the important issues and factors currently limiting the salmon stock on the river. An attempt has been made to cost these actions, identify possible sources of funding and to provide a timescale for action. This SAP aims also to promote long term collaboration between the Agency and other interested parties in managing the River Exe salmon stock and fisheries. The River Exe salmon population is currently judged to be passing its Conservation Limit. However, its apparent declining trend in egg deposition in the recent years and the high uncertainty in its stock assessment suggest the following actions as priorities: actions promoting good land management, maximising salmon natural spawning activity and protecting smolts throughout the Exe catchment. Also, the lack of information on salmon stocks and its habitat quality and availability is recognised as the main factor limiting the better management of salmon fisheries. The actions presented in this document are perceived as those required to address the important issues and factors limiting the salmon stock.

Características morfológicas de vermes adultos de Schistosoma mansoni Sambon, 1907 recuperados de camundongos alimentados com dieta hiperlípidíca na fase crônica da infecção esquistossomótica. Análise por microscopia de campo claro e confocal

Estudos em animais experimentais evidenciaram associações significativas entre esquistossomose mansoni e hipercolesterolemia. Estudos in vitro e in vivo já demonstraram que o colesterol é essencial para Schistosoma mansoni, embora este não tenha capacidade de sintetizá-lo. A captação é realizada a partir do ambiente (cultivo ou hospedeiro) através do tegumento. O colesterol está envolvido nos mecanismos de evasão do helminto contra a resposta imunológica, além de poder participar na modulação da sinalização celular e reprodução, estimulando os órgãos reprodutores dos helmintos adultos como observado na fase aguda da infecção experimental. Este trabalho tem como objetivo avaliar se o mesmo fenômeno ocorre na fase crônica. Os helmintos foram recuperados de dez camundongos submetidos à dieta hiperlipídica ou padrão (controle) foram corados pelo carmin cloridrico e montados, individualmente, em lâmina histológica com bálsamo do Canadá. A preparação foi analisada por microscopia de campo claro nos seguintes caracteres: tegumento e o sistema reprodutor nos vermes machos (lobos testiculares, vesícula seminal, lobos testiculares supranumerários e canal ginecóforo) e, nas fêmeas (ovário, oótipo, útero, ovo, glândulas vitelínicas e espermateca). Posteriormente, algumas lâminas foram separadas para visualização pela microscopia confocal dos órgãos do sistema reprodutores acima descritos. Apesar de ter sido observado uma maior quantidade de espermatozoides, uma maior quantidade de oócitos sendo liberados no grupo da dieta, não houve diferença estatística significativa (p>0,05) entre os grupos analisados. Houve um aumento na oogênese como observado na fase aguda. Dessa forma, o colesterol pode estar relacionado com a estimulação na atividade dos órgãos reprodutores dos helmintos adultos na fase crônica da infecção.

Preparação, caracterização e avaliação de nanocompósitos de PBAT/amido de milho e vermiculita organofilizada

Nos últimos 20-30 anos polímeros biodegradáveis vêm sendo estudados e desenvolvidos e atualmente já são comercializados. Contudo, o custo, a processabilidade e algumas propriedades ainda dificultam a penetração desses polímeros no mercado e a competição com as chamadas commodities. Não são poucos os autores que se dedicam a desenvolver aditivos e formulações para superar essas limitações. Desta forma, esta Tese se dedicou ao desenvolvimento de compósitos de Ecobras, fabricado pela Basf e comercializado pela Corn Products, utilizando como carga mineral resíduo da extração da bauxita, no município de Santa Luzia/PB, o qual consiste em sua totalidade de vermiculita. Esta vermiculita foi quimicamente modificada com sais de alquil fosfônio para melhorar a compatibilidade com a matriz polimérica e também espaçar as camadas de aluminossilicato. De fato, a modificação com o brometo de hexadecil tributil fosfônio resultou na esfoliação da vermiculita tornando-a potencialmente apropriada para a obtenção de nanocompósitos. A preparação dos compósitos foi realizada pelo método de intercalação no estado fundido e foram comparadas a utilização da câmara interna de mistura e da mini extrusora de dupla rosca, sendo esta última mais eficaz na dispersão da vermiculita, conforme revelado pela microscopia eletrônica de varredura, difração de raios-X e reometria de placas. O grau de dispersão também foi influenciado pela estrutura química do modificador da vermiculita e pelo teor dessa carga incorporada à matriz. Teores mais elevados levaram a formação de aglomerados, enquanto a modificação da carga implicou na formação de micro e nanocompósitos. Ainda houve alterações das propriedades térmicas com aumento dos valores da temperatura de transição vítrea, de cristalização e fusão, embora o grau de cristalinidade tenha sido mantido. Nitidamente, foram obtidos materiais mais rígidos, com maior módulo e menor capacidade de deformação. Cerca de 58% de perda de massa foi observada para os micro e nanocompósitos obtidos após 17 semanas de enterro em solo simulado para avaliação da biodegradabilidade, valor bem próximo ao Ecobras puro. De modo geral, a incorporação das diferentes vermiculitas retardou nas primeiras semanas a biodegradação, provavelmente em função de modificações na estrutura cristalina, conforme sugerido pelos maiores valores de temperatura de fusão observados durante o acompanhamento do processo de biodegradação. No entanto, após 7 semanas os perfis de biodegradação dos micro e nanocompósitos se aproximaram bastante do Ecobras puro. Desta forma, foi possível nesta Tese obter um nanocompósito de Ecobras com vermiculita modificada com brometo de hexadecil fosfônio utilizando ferramentas comuns de processamento no estado fundido com biodegradabilidade próxima ao polímero de partida, porém mais rígido e menos deformável

Análise da evolução termomecânica da Bacia do Amazonas

Os dados geológicos e geofísicos escolhidos para o tema de estudo pertencem a Bacia do Amazonas, na região centro-norte do Brasil. A Bacia do Amazonas é uma bacia intracratônica com cerca de 500.000 km. A mesma está limitada ao norte pelo Escudo das Guianas e ao sul pelo Escudo Brasileiro. O limite oeste com a Bacia do Solimões é marcado pelo Arco de Purus, ao passo que o Arco de Gurupá constitui seu limite leste. Possui características inerentes a uma bacia intracratônica paleozóica, com uma longa história evolutiva, marcada por discordâncias expressivas e com uma cunha sedimentar relativamente rasa se comparada às bacias cretáceas brasileiras, o que levanta controvérsia a respeito da suficiência do soterramento para a eficiência de geração de hidrocarboneto. Podem ser reconhecidas nos 5000 m do preenchimento sedimentar da Bacia do Amazonas, duas seqüências de primeira ordem: uma paleozóica, intrudida por diques e soleiras de diabásio, na passagem do Triássico para o Jurássico, e uma mesozóica-cenozóica que representam um aspecto importante na evolução térmica da matéria orgânica que ocorre na primeira seqüência. Com relação à exploração de petróleo, apesar do fomento exploratório ocorrido nos últimos anos, a bacia ainda é considerada pouco explorada sendo sua maior reserva a da província de Urucu. Um dos fatores que dificultam bastante a exploração desta bacia assim como a bacia do Solimões a oeste é o acesso restrito, pois estão situadas em áreas remotas e florestadas, de difícil acesso, com muitas reservas indígenas e florestais, o que causa restrições logísticas, operacionais e legais. O efeito térmico das intrusões ígneas é considerado como o responsável pelo acréscimo de calor necessário à maturação da matéria orgânica e conseqüente geração de hidrocarbonetos. Este trabalho contribui com a reconstrução da história térmica desta bacia a partir da modelagem das variáveis termais e da história de soterramento. Para isso, foram utilizados modelos consagrados na literatura, que permitem, de forma simples, a estimativa do fluxo térmico através do embasamento e da seqüência sedimentar. Na análise da influência de intrusões ígneas na estrutura térmica da bacia, o modelo bidimensional desenvolvido pelo método de diferenças finitas se mostrou apropriado. Utilizou-se o fluxo térmico basal calculado nas condições de contorno da modelagem da influência térmica das ígneas. Como resultado obteve-se a estruturação térmica da bacia e a historia maturação de suas rochas geradoras

Sea surface temperature and the subsequent freshwater survival rate of some salmon stocks: a surprising link between the climate of land and sea

Previous consideration of the relationship between climate and the survival rate of Pacific salmon eggs and fry has been confined to effects of large variation in the ambient freshwater environment; e.g., stream discharge, temperature, turbidity. This analysis shows sea surface temperatures during the last year of life of maturing adult salmon are also strongly associated with the subsequent survival rate of salmon eggs and fry is fresh water, presumably through development of the future eggs or sperm. In several stocks of three species of North American salmon, the association between the "marine" climate and egg survival is stronger than, or additive to, any estimated climatic association in fresh water. This apparent and surprising link between fresh water and the distant ocean has some interesting and complex implications for management of future salmon production.

Inshore spawning of cobia (Rachycentron canadum) in South Carolina

We documented inshore spawning of the recreationally important cobia (Rachycentron canadum) in Port Royal Sound (PRS) and St. Helena Sound (SHS), South Carolina, during the period from April to June in both 2007 and 2008. Histological analysis of ovaries confirmed the presence of actively spawning females inshore, and gonadosomatic index (GSI) values from females collected inshore (mean=7.8) were higher than the values from females caught offshore (mean=5.6); both of these mean values indicate that spawning occurred locally. Additionally, we conducted an ichthyoplankton survey in 2008 and found cobia eggs and larvae as far as 10 and 15 km inshore from the mouths of SHS and PRS, respectively. A study of egg development that we conducted in 2007 and 2008 using hatchery-reared cobia eggs provided descriptions of embryological development of cobia. Comparison of visual and quantitative characteristics of the field-collected eggs with those of the hatchery-reared eggs allowed positive identification of eggs collected in plankton samples. The ages of field-collected eggs and presence of females with hydrated oocytes in PRS and SHS observed in our ichthyoplankton survey and histological analysis indicated that wild cobia spawn in the afternoon and early evening. The inshore migration of cobia from April to June, the presence of actively spawning females, significantly higher GSI values, and the collection of eggs inside PRS and SHS all confirm that these estuaries provide spawning habitat for cobia. Because of the potential for heavy exploitation by recreational anglers as cobia move inshore to spawn in South Carolina, current management strategies may require review.

Wet-spinning of amyloid protein nanofibers into multifunctional high-performance biofibers.

Amyloid nanofibers derived from hen egg white lysozyme were processed into macroscopic fibers in a wet-spinning process based on interfacial polyion complexation using a polyanionic polysaccharide as cross-linker. As a result of their amyloid nanostructure, the hierarchically self-assembled protein fibers have a stiffness of up to 14 GPa and a tensile strength of up to 326 MPa. Fine-tuning of the polyelectrolytic interactions via pH allows to trigger the release of small molecules, as demonstrated with riboflavin-5'-phophate. The amyloid fibrils, highly oriented within the gellan gum matrix, were mineralized with calcium phosphate, mimicking the fibrolamellar structure of bone. The formed mineral crystals are highly oriented along the nanofibers, thus resulting in a 9-fold increase in fiber stiffness.

Charles M. Breder, Jr.: drawings

Among the papers of Dr. Charles M. Breder bequeathed to the Mote Marine Laboratory by the Breder family are a series of drawings of larval fish and eggs done from 1917 through 1929. The drawings were made with pencil on half and full sheets of buff colored paper. The half sheet drawings are of larval fish, most of which are not identified. The full sheet drawings often contain comments and notes related to laboratory work on fish egg development, and made during the summer of 1929 when Breder was working in the Dry Tortugas.