Molecular genetics of Usher syndrome -inherited deafness and blindness

Usher syndrome (USH) is an inherited blindness and deafness disorder with variable vestibular dysfunction. The syndrome is divided into three subtypes according to the progression and severity of clinical symptoms. The gene mutated in Usher syndrome type 3 (USH3), clarin 1 (CLRN1), was identified in Finland in 2001 and two mutations were identified in Finnish patients at that time. Prior to this thesis study, the two CLRN1 gene mutations were the only USH mutations identified in Finnish USH patients. To further clarify the Finnish USH mutation spectrum, all nine USH genes were studied. Seven mutations were identified: one was a previously known mutation in CLRN1, four were novel mutations in myosin VIIa (MYO7A) and two were a novel and a previously known mutation in usherin (USH2A). Another aim of this thesis research was to further study the structure and function of the CLRN1 gene, and to clarify the effects of mutations on protein function. The search for new splice variants resulted in the identification of eight novel splice variants in addition to the three splice variants that were already known prior to this study. Studies of the possible promoter regions for these splice variants showed the most active region included the 1000 bases upstream of the translation start site in the first exon of the main three exon splice variant. The 232 aa CLRN1 protein encoded by the main (three-exon) splice variant was transported to the plasma membrane when expressed in cultured cells. Western blot studies suggested that CLRN1 forms dimers and multimers. The CLRN1 mutant proteins studied were retained in the endoplasmic reticulum (ER) and some of the USH3 mutations caused CLRN1 to be unstable. During this study, two novel CLRN1 sequence alterations were identified and their pathogenicity was studied with cell culture protein expression. Previous studies with mice had shown that Clrn1 is expressed in mouse cochlear hair cells and spiral ganglion cells, but the expression profile in mouse retina remained unknown. The Clrn1 knockout mice display cochlear cell disruption/death, but do not have a retinal phenotype. The zebrafish, Danio rerio, clrn1 was found to be expressed in hair cells associated with hearing and balance. Clrn1 expression was also found in the inner nuclear layer (INL), photoreceptor layer and retinal pigment epithelium layer (RPE) of the zebrafish retina. When Clrn1 production was knocked down with injected morpholino oligonucleotides (MO) targeting Clrn1 translation or correct splicing, the zebrafish larvae showed symptoms similar to USH3 patients. These larvae had balance/hearing problems and reduced response to visual stimuli. The knowledge this thesis research has provided about the mutations in USH genes and the Finnish USH mutation spectrum are important in USH patient diagnostics. The extended information about the structure and function of CLRN1 is a step further in exploring USH3 pathogenesis caused by mutated CLRN1 as well as a step in finding a cure for the disease.

Familjära förmaksflimrets karaktär i långtids EKG registrering

Målsättningen med denna studie var att karaktärisera familjära fall av förmaksflimmer (FA) och bestämma förekomsten av fokalt fött FA i detta material. Undersökningsmaterialet bestod av FA patienter på Mejlans rytmkardiologiska klinik, samt familjemedlemmar till dessa. För detta arbete analyserades 24 eller 48 timmars ambulatoriskt EKG på 42 personer. Bland dessa fanns 17 familjer av flera generationer vilka studerades närmare, främst med avseende på förekomsten av fokala triggrar. 40% av FA fallen uppfyllde de uppställda kriterierna för fokalt FA. Denna siffra är signifikant lägre än de ca 80% som tidigare rapporterats vid non-familjärt enskilt FA. Detta kunde tyda på en vid familjärt FA ökad känslighet i förmaken för ändå förekommande men lågfrekventa fokala triggrar. Undersökningen visade att en detaljanalys av 24 timmars Holter registrering är ett användbart sätt att kartlägga förmaksflimrets bakgrund.

Thermal decomposition of zirconyl oxalates I. Barium zirconyl oxalate

Conditions for the preparation of stoichiometric barium zirconyl oxalate heptahydrate (BZO) have been standardized. The thermal decomposition of BZO has been investigated employing TG, DTG and DTA techniques and chemical and gas analysis. The decomposition proceeds through four steps and is not affected much by the surrounding gas atmosphere. Both dehydration and oxalate decomposition take place in two steps. The formation of a transient intermediate containing both oxalate and carbonate groups is inferred. The decomposition of oxalate groups results in a carbonate of composition Ba2Zr2OsCO3, which decomposes between 600 and 800 ~ and yields barium zirconate. Chemical analysis, IR spectra and X-ray powder diffraction data support the identity of the intermediate as a separate entity.

Thermal decomposition of zirconyl oxalates I. Barium zirconyl oxalate

Conditions for the preparation of stoichiometric barium zirconyl oxalate heptahydrate (BZO) have been standardized. The thermal decomposition of BZO has been investigated employing TG, DTG and DTA techniques and chemical and gas analysis. The decomposition proceeds through four steps and is not affected much by the surrounding gas atmosphere. Both dehydration and oxalate decomposition take place in two steps. The formation of a transient intermediate containing both oxalate and carbonate groups is inferred. The decomposition of oxalate groups results in a carbonate of composition Ba2Zr2O5CO3, which decomposes between 600 and 800° and yields barium zirconate. Chemical analysis, IR spectra and X-ray powder diffraction data support the identity of the intermediate as a separate entity.Die Bedingungen für die Herstellung von stöchiometrischem Barium-zirconyl-oxalat Heptahydrat (BZO) wurden standardisiert. Die thermische Zersetzung von BZO wurde unter Einsatz der TG-, DTG- und DTA, sowie der chemischen und Gasanalyse untersucht. Die Zersetzung verläuft über vier Stufen und wird von der umgebenden Gasathmosphäre nicht besonders beeinflusst. Sowohl die Dehydratisierung als auch die Oxalatzersetzung erfolgt in zwei Stufen. Die Bildung einer intermediären Übergangsverbindung mit sowohl Oxalat- als auch Carbonatgruppen wirken hierbei mit. Die Zersetzung der Oxalatgruppen ergibt ein Carbonat der Zusammensetzung Ba2Zr2O5CO3, das zwischen 600 und 800° zersetzt wird und Bariumzirconat ergibt. Die Angaben der chemischen Analyse, der IR-Spekren und der Röntgen-Pulver-Diffraktion unterstützen die Identität der Intermediärverbindung als eine separate Einheit.On a standardisé les conditions de préparation de l'oxalate heptahydraté de zirconyle et de baryum (BZO) stoechiométrique. On a étudié la décomposition thermique de BZO par TG, TGD et ATD ainsi que par analyses chimiques et analyses des gaz. La décomposition a lieu en quatre étapes et n'est pas trop influencée par l'atmosphère ambiante. La déshydratation et la décomposition de l'oxalate ont lieu en deux étapes. Il se forme un composé intermédiaire de transition contenant à la fois les groupes oxalate et carbonate. La décomposition des groupes oxalate fournit un carbonate de composition Ba2Zr2O5CO3 qui se décompose entre 600 et 800° pour fournir du zirconate de baryum. L'analyse chimique, les spectres IR et la diffraction des rayons X sur poudre, apportent les preuves de l'existence d'un composé intermédiaire comme entité séparée.

Begränsat tillträde Unga invandrares känsla av tillhörighet i en finlandssvensk kontext

Att ha tillträde till olika arenor i samhället är viktigt, speciellt för unga är känslan av tillhörighet väsentligt för välbefinnandet. I min pro gradu-avhandling synliggör jag de ungas beskrivningar av sina liv och sina erfarenheter av vad det innebär att vara ”invandrare” i Helsingforsregionen med svenska som första främmande språk. Språkkunskaper och förmåga att uttrycka sig samt att använda språket väl blir allt mer relevant i det mångkulturella samhället där människor med olika kulturella bakgrunder möts. Med hjälp av språkkunskaper ges tillträde till den värld som uttrycks och förutsätts via språket. Min teoretiska referensram är förankrad i finländsk och svensk forskning om invandring, tillhörighet, etnicitet och identitetsom tar fasta på ungdomar. Viktiga källor är bland andra Tuomas Martikainen & Lotta Haikkola (2010) och Karmela Liebkind (2000, 2007 m.fl.) Tore Otterups (2005) avhandling om ungdomars flerspråkighet och identitetskonstruktion ger bakgrundskunskap till min studie. Med hjälp av kvalitativa temaintervjuer som undersökningsmetod ger min studie en bild av invandrarungdomarnas uppfattningar, erfarenheter och känslor. De unga som är intervjuade i min pro gradu-avhandling studerar alla vid en svenskspråkig skolinstans i södra Finland. Mina informater är alla födda utanför Finlands gränser och ingendera föräldern är född finländsk, de har alla lärt sig svenska som första främmande språk i Finland. Mitt material består av elva temaintervjuer. De unga i min pro gradu-avhandling poängterar att deras känsla av tillhörighet och tillträde till olika kulturella kontexter är sammankopplat med språkkunskaper. Forskningsresultaten visar att språkkunskaper ger tillträde och ökade möjligheter i det mångkulturella samhället som vi lever i.