Docking and small angle X-ray scattering studies of purine nucleoside phosphorylase

Docking simulations have been used to assess protein complexes with some success. Small angle X-ray scattering (SAXS) is a well-established technique to investigate protein spatial configuration. This work describes the integration of geometric docking with SAXS to investigate the quaternary structure of recombinant human purine nucleoside phosphorylase (PNP). This enzyme catalyzes the reversible phosphorolysis of N-ribosidic bonds of purine nucleosides and deoxynucleosides. A genetic deficiency due to mutations in the gene encoding for PNP causes gradual decrease in T-cell immunity. Inappropriate activation of T-cells has been implicated in several clinically relevant human conditions such as transplant rejection, rheumatoid arthritis, lupus, and T-cell lymphomas. PNP is therefore a target for inhibitor development aiming at T-cell immune response modulation and has been submitted to extensive structure-based drug design. The present analysis confirms the trimeric structure observed in the crystal. The potential application of the present procedure to other systems is discussed. (C) 2003 Elsevier B.V. All rights reserved.

The kinetic mechanism of human uridine phosphorylase 1: Towards the development of enzyme inhibitors for cancer chemotherapy

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Effects of Spider Venom Toxin PWTX-I (6-Hydroxytrypargine) on the Central Nervous System of Rats

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Alterations of the TP53 Gene in Gastric and Esophageal Carcinogenesis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Divergent diagrams of folds and simultaneous conjugacy of involutions

In this work we show that the smooth classification of divergent diagrams of folds (f(1),..., f(s)) : (R-n, 0) -> (R-n x(...)xR(n), 0) can be reduced to the classification of the s-tuples (p(1)., W) of associated involutions. We apply the result to obtain normal forms when s <= n and {p(1),...,p(s)} is a transversal set of linear involutions. A complete description is given when s = 2 and n >= 2. We also present a brief discussion on applications of our results to the study of discontinuous vector fields and discrete reversible dynamical systems.

Liquid crystalline formulations containing modified surface TiO2 nanoparticles obtained by sol-gel process

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

First order reversal curve analysis of nanocrystalline Pd80Co20 alloy films

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Electrochemical reduction and cathodic stripping voltammetric determination of clotrimazole

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Preparation and thermal study of Mg-diclofenac compound in solid state

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alchornea glandulosa Ethyl Acetate Fraction Exhibits Antiangiogenic Activity: Preliminary Findings from In Vitro Assays Using Human Umbilical Vein Endothelial Cells

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Anti-angiogenic effects of pterogynidine alkaloid isolated from Alchornea glandulosa

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Medium-term protocols for in vivo evaluation of chemical modifiers of carcinogenesis

Cancer development is a long-term multistep process which allows interventional measure before the clincial disease emerges. the detection of natural substances which can block the process of carcinogenesis is a important as the identification of anti-tumoral drugs since they might be used in chemoprevention of cancer in high-risk groups. In vivo rodent models of chemical caecinogenesis have been used to study plant-derived inhibitors of carcinofenesis such as indols, coumarins, isothiocyanates, flavones, phenols and allyl-sulfides. Since the standard in vivo rodent bioassay is prolonged and expensive, shorter reliable protocols are needed. Two in vivo medium-term protocols for evaluation of modifiers of carcinogenesis are presented, one related to liver and the other to bladder cancer. Both protocols use rats, last 8 and 36 weeks and are based on the two-step concept of carcinogenesis: initiation and promotion. The protocols use respectively the development of altered foci of hepatocytes expressing immunochistochemically the placental form of gluthation S-transferase and the appearence of pre-neoplastic urothelium and papillomas as the end-points. the use of these protocols for detection of plantpderived inhibitors of carcinogenesis appear warranted.

Anestésicos locais: interação com membranas biológicas e com o canal de sódio voltagem-dependente

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

ABSORÇÃO DE CÁDMIO E CRESCIMENTO DEFEIJOEIRO (Phaseolus vulgaris, L. cv carioca)

A absorção de cádmio e seus efeitos no crescimento de feijoeiro (Phaseolus vulgaris, L. cv carioca) foi estudada em solução nutritiva completa de Hoagland & Arnon acrescida de doses de cádmio com concentrações entre 10 e 200 mmol L-1. Os teores de cádmio em folhas e raízes aumentaram à medida que aumentou a concentração de cádmio na solução nutritiva. Os teores de cádmio nas raízes foram maiores que nas folhas. Os resultados mostraram que a inibição do crescimento de folhas e raízes provocadas pela presença de cádmio são reversíveis.

Comparação de diferentes estratégias para a análise de características de crescimento e de carcaça de suínos cruzados: modelos finito e infinitesimal poligênico

Foi utilizada uma análise de segregação com o uso da inferência Bayesiana para estimar componentes de variância e verificar a presença de genes de efeito principal (GEP) influenciando duas características de carcaça: gordura intramuscular (GIM), em %, e espessura de toucinho (ET), em mm; e uma de crescimento, ganho de peso (g/dia) dos 25 aos 90 kg de peso vivo (GP). Para este estudo, foram utilizadas informações de 1.257 animais provenientes de um delineamento de F2, obtidos do cruzamento de suínos machos Meishan e fêmeas Large White e Landrace. No melhoramento genético animal, os modelos poligênicos finitos (MPF) podem ser uma alternativa aos modelos poligênicos infinitesimais (MPI) para avaliação genética de características quantitativas usando pedigrees complexos. MPI, MPF e MPI combinado com MPF foram empiricamente testados para se estimar componentes de variâncias e número de genes no MPF. Para a estimação de médias marginais a posteriori de componentes de variância e de parâmetros, foi utilizada uma metodologia Bayesiana, por meio do uso da Cadeia de Markov, algoritmos de Monte Carlo (MCMC), via Amostrador de Gibbs e Reversible Jump Sampler (Metropolis-Hastings). em função dos resultados obtidos, pode-se evidenciar quatro GEP, sendo dois para GIM e dois para ET. Para ET, o GEP explicou a maior parte da variação genética, enquanto, para GIM, o GEP reduziu significativamente a variação poligênica. Para a variação do GP, não foi possível determinar a influência do GEP. As herdabilidades estimadas ajustando-se MPI para GIM, ET e GP foram de 0,37; 0,24 e 0,37, respectivamente. Estudos futuros com base neste experimento que usem marcadores moleculares para mapear os genes de efeito principal que afetem, principalmente GIM e ET, poderão lograr êxito.