Study of the Reliability of Statistical Timing Analysis for Real-Time Systems

Presented at 23rd International Conference on Real-Time Networks and Systems (RTNS 2015). 4 to 6, Nov, 2015, Main Track. Lille, France.

Vitamin A and lipid peroxidation in patients with different forms of leprosy

Leprosy, a chronic infectious disease, is caused by a Mycobacterium leprae infection. After India, Brazil has the second greatest number of cases in the world. Increase of oxidative stress and antioxidant deficiency are present in infected subjects and can be related to infection progression. We studied alterations in serum levels of lipid peroxidation (LPO) and vitamin A in patients with different forms of leprosy. Four groups of leprosy patients and a control group (healthy subjects) were selected, and their vitamin A serum levels and LPO profile, measured as malonaldehyde (MDA) were measured by spectrophotometric assays. The mean MDA serum levels (µmol/L) were 3.80 ± 0.5 for control group and 10.54 ± 1.1 in the leprosy patients and this increase was gradual, being more accentuated in severe forms of the disease. Also, the vitamin A serum levels (µg/dL) were diminished in the infected subjects (38.51 ± 4.2), mainly in lepromatous form, when compared with the control group (53.8 ± 5.6). These results indicate that LPO can be an important factor in Mycobacterium leprae infection, which can be related to increases in phagocytic activity and the general breakdown of antioxidants, contributing to an increase of LPO during infection progression. The evaluation of oxidant/antioxidant status in these patients can be an important factor in the treatment, control, and/or prognosis of this disease.

Dermatophyte susceptibilities to antifungal azole agents tested in vitro by broth macro and microdilution methods

The in vitro susceptibility of dermatophytes to the azole antifungals itraconazole, fluconazole and ketoconazole was evaluated by broth macro and microdilution methods, according to recommendations of the CLSI, with some adaptations. Twenty nail and skin clinical isolates, four of Trichophyton mentagrophytes and 16 of T. rubrum were selected for the tests. Itraconazole minimal inhibitory concentrations (MIC) varied from < 0.03 to 0.25 µg/mL in the macrodilution and from < 0.03 to 0.5 µg/mL in the microdilution methods; for fluconazole, MICs were in the ranges of 0.5 to 64 µg/mL and 0.125 to 16 µg/mL by the macro and microdilution methods, respectively, and from < 0.03 to 0.5 µg/mL by both methods for ketoconazole. Levels of agreement between the two methods (± one dilution) were 70% for itraconazole, 45% for fluconazole and 85% for ketoconazole. It is concluded that the strains selected were inhibited by relatively low concentrations of the antifungals tested and that the two methodologies are in good agreement especially for itraconazole and ketoconazole.

Influenza virus and proteolytic bacteria co-infection in respiratory tract from individuals presenting respiratory manifestations

A role for proteolytic bacteria in the exacerbation of influenza virus has been shown in natural hosts such as pigs and humans. Four hundred seven samples were collected from the respiratory tract of individuals presenting clinical manifestations, during influenza season (2003-2005) in São Paulo City. The aim of this study was to evaluate the incidence of determined bacteria co-infecting virus in human respiratory tract. Tests, such as bacteriological, immunofluorescence (IF), RT/PCR and hemagglutination (HA) were used for bacterial and viral investigation. Thirty seven (9.09%) positive for influenza virus were screened by IF. The RT/PCR confirmed the presence of influenza virus in these samples. Bacterial and agar casein tests demonstrated that 18 (48.64%) individuals were infected with proteolytic bacteria such as Staphylococcus spp., Streptococcus spp. and Pseudomonas spp. Among these samples, 13 (35.13%) were co-infected with influenza A virus. Influenza type B, co-infecting bacteria were found in five (13.51%) samples. In vitro the S. aureus protease increased the influenza HA titer after contact for 30 min at 25 ºC. Results revealed the occurrence of co-infection with proteolytic bacteria and influenza in the evaluated individuals. This finding corroborates that virus versus bacteria synergism could be able to potentiate respiratory infection, increasing damage to hosts.

Clinical and epidemiological features of 123 cases of cryptococcosis in Mato Grosso do Sul, Brazil

To identify the clinical and epidemiological profile of cryptococcosis diagnosed at the University Hospital of the Federal University of Mato Grosso do Sul, Brazil, medical records of 123 patients admitted from January 1995 to December 2005 were analyzed. One hundred and four cases (84.5%) had HIV infection, six (4.9%) had other predisposing conditions and 13 (10.6%) were immunocompetent. Male patients predominated (68.3%) and their age ranged from 19 to 69 years (mean: 35.9). Most patients (73.2%) were born and lived lifelong in the state of Mato Grosso do Sul. Involvement of the central nervous system occurred in 103 patients (83.7%) and headache and vomiting were the most frequent symptoms. In 77 cases it was possible to identify the Cryptococcus species: 69 (89.6%) C. neoformans and eight (10.4%) C. gattii. Amphotericin B was the drug of choice for treatment (106/123), followed by fluconazole in 60% of cases. The overall lethality rate was 49.6%, being 51% among the HIV infected patients and 41.2% among the non-HIV infected (p > 0.05). Although cryptococcosis exhibited in our region a similar behavior to that described in the literature, the detection of an important rate of immunocompetent individuals and five C. gattii cryptococcosis in HIV-infected patients is noteworthy.

Symmetry and order parameter dynamics of the human odometer

Bipedal gaits have been classified on the basis of the group symmetry of the minimal network of identical differential equations (alias cells) required to model them. Primary bipedal gaits (e.g., walk, run) are characterized by dihedral symmetry, whereas secondary bipedal gaits (e.g., gallop-walk, gallop- run) are characterized by a lower, cyclic symmetry. This fact has been used in tests of human odometry (e.g., Turvey et al. in P Roy Soc Lond B Biol 276:4309–4314, 2009, J Exp Psychol Hum Percept Perform 38:1014–1025, 2012). Results suggest that when distance is measured and reported by gaits from the same symmetry class, primary and secondary gaits are comparable. Switching symmetry classes at report compresses (primary to secondary) or inflates (secondary to primary) measured distance, with the compression and inflation equal in magnitude. The present research (a) extends these findings from overground locomotion to treadmill locomotion and (b) assesses a dynamics of sequentially coupled measure and report phases, with relative velocity as an order parameter, or equilibrium state, and difference in symmetry class as an imperfection parameter, or detuning, of those dynamics. The results suggest that the symmetries and dynamics of distance measurement by the human odometer are the same whether the odometer is in motion relative to a stationary ground or stationary relative to a moving ground.

Frequency of human bocavirus respiratory infections among at-risk patients in São Paulo, Brazil

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Human Bocavirus (HBoV) has been described since 2005 as an etiological agent of respiratory virus infections. From 2001 to 2008 we investigated the etiology of HBoV among adults and children in different groups at risk of presenting complications arising from acute respiratory infection, the investigation was carried out in a tertiary hospital health care system in Brazil. METHODS: HBoV DNA was assayed in 598 respiratory samples from community and hospitalized patients by PCR. RESULTS: Of the 598 tested samples, 2.44% (8/328) of children, including five children with heart disease, and 0.4% (1/270) of adult bone-marrow-transplant were HBoV positive. CONCLUSIONS: These data suggested lower HBoV frequency among different at-risk patients and highlights the need to better understand the real role of HBoV among acute respiratory symptomatic patients.

CO-INFECTION OF DENGUE VIRUS BY SEROTYPES 1 AND 4 IN PATIENT FROM MEDIUM SIZED CITY FROM BRAZIL

SUMMARY The natural co-infection with dengue virus can occur in highly endemic areas where different serotypes have been observed for many years. We report one case of DENV-1/DENV-4 co-infection in human serum detected by molecular tests. Phylogenetic analysis of the sequences obtained indicated the presence of genotype V and II for DENV-1 and DENV-4, respectively.

Tradução, adaptação e legendagem de textos poéticos

A legendagem, sendo um modo de tradução audiovisual muito peculiar, implica verter um discurso oral, real ou ficcionado, para texto escrito. A primeira questão que nos colocamos é, como será isto exequível, sem se perder uma parte significativa do discurso oral: os elementos paralinguísticos? Depois, o que acontece nesta passagem da oralidade para a escrita? Haverá forma de contornar as perdas evidentes? Como ponto de partida para este projecto de legendagem, escolhemos dois filmes ainda não legendados em português, cujos argumentos, coincidentemente, também ainda não se encontravam traduzidos em português. Os filmes escolhidos foram Pull My Daisy e The Last Clean Shirt, documentos visuais da cultura da Beat Generation, movimento sediado nos Estados Unidos da América. A partir da tradução, adaptação e legendagem destas obras, procurámos, então, analisar as dificuldades levantadas pela tradução e introdução das marcas de oralidade existentes nos textos de partida, bem como as suas possibilidades de adaptação, tendo em conta as características do público-alvo e os constrangimentos impostos pela própria natureza deste modo de tradução. Procurou tomar-se em consideração também os problemas relacionados com a transferência da cultura da língua de partida para a língua de chegada. A legendagem destas duas curtas-metragens foi realizada através do programa de software SPOT. Depois de concluído, foi analisado todo o processo de tradução, adaptação e legendagem, considerando a necessidade de contextualizar os filmes a nível literário, artístico e cultural, bem como as decisões relativamente a alguns aspectos do resultado final da legendagem, nomeadamente no que respeita às dificuldades impostas pela transposição da oralidade para a escrita. O argumento de Pull My Daisy, nas palavras do autor Jack Kerouac, baseia-se no Acto III da peça “The Beat Generation”. Esta peça foi escrita em 1957, mas foi recentemente redescoberta em 2005, em forma manuscrita, num armazém de New Jersey. Na sua essência, este argumento consiste num improviso de Kerouac elaborado em voz off durante o filme realizado por Robert Frank e Alfred Leslie, em 1959. Desde então, ambos os realizadores desenvolveram as suas criações artísticas, tendo, por exemplo, Alfred Leslie estreado o seu trabalho mais recente, o vídeo The Cedar Bar no London Film Festival em 2002 e Robert Frank realizado vídeos para canções dos New Order, Run de 1989, e de Patti Smith, em 1996, para Summer Cannibals. A curta-metragem começa com um canção cuja letra é um excerto do poema Pull My Daisy de Allen Ginsberg e Jack Kerouac. Depois, Jack Kerouac representa e encarna com a sua própria voz cada uma das personagens do filme, enquadrando, descrevendo e comentando a acção. O argumento do filme é, assim, um exercício livre de improviso sobre as imagens montadas pelos realizadores. The Last Clean Shirt é um filme experimental de Alfred Leslie, realizado em 1964, cujas legendas originais incluídas no filme são textos do poeta americano Frank O’Hara. Este filme tem sempre o mesmo enquadramento de câmara, ao passo que a “acção” nos é sugerida pelo conteúdo das legendas que integram a obra. Isto é, se por um lado o cenário e os protagonistas do filme são os mesmos do início ao fim do filme, é o texto de O’Hara, associado ao momento da inserção dos segmentos no filme, que atrai ou distrai a atenção do espectador para uma viagem que pode ter vários destinos. Estas duas curtas-metragens constituem textos-limite que põem em evidência os desafios do processo de legendagem, graças às suas características muito especiais, enquanto obras de arte cinematográfica. Para além das dificuldades emergentes que todos os trabalhos de tradução envolvem, neste trabalho considerou-se essencial tentar tratar da melhor forma a estrutura poética livre e conferir significado suficiente e coeso no texto de chegada ao fluxo de pensamento exteriorizado no texto de partida, procurando, especialmente, não prejudicar a característica poética dos textos.

Formation of a stable cyano-bridged dinuclear iron cluster following oxidation of the superoxide reductases from Treponema pallidum and Desulfovibrio vulgaris with K(3)Fe(CN)(6)

Inorg. Chem., 2003, 42 (4), pp 938–940 DOI: 10.1021/ic0262886

The use of different concentrations of leishmanial antigen in skin testing to evaluate delayed hypersensitivity in american cutaneous leishmaniasis

Three concentrations of Leishmania mexicana amazonensis sonicated whole promastigote antigen (30, 9.6 and 3 ug N in 0.1 ml) wereprepared and 0.1 ml of each inoculated intradermally intopatients who live in one endemic leishmaniasis region in Brazil. Patients were divided into groups with active cutaneous leishmaniasis (ACL), healed cutaneous leishmaniasis (HCL), mucosal leishmaniasis (ML), and Controls (C). Skin reactions were recorded by measuring induration 48 hours after inoculation. Skin tests using 9.6 ugN/0.1 mlyielded the best diagnostic resultssince 97% of 30 patients with active lesions (cutaneous or mucosal) and 83% with HCL showed reactions of 5 mm orgreater as compared with 4% Controls. Tests using 30ug N/O. 1 ml causedan unacceptable levei of skin reactions with necrosis (10% of ACL patients tested and 17% of HCL, respectively). Tests using 3 ug N/O. 1 ml were less sensitive since only 87% of patients with active lesions and 68% with HCL had reactions of 5mm orgreater. The 3 ug N/O. 1 ml dose was utilized to ask the questions whether skin delayed hypersensitivity decreased with time after the initial lesion and whether mucosal involvement is associated with enhaced hypersensitivity to leishmanial antigen. Decreased delayed hypersensitivity was noted only in those patients who had an initial lesion more than 30 years ago. The mean induration of the reaction in 10 patients with ML was 11.3 mm ± 7.15, in 41 patients with HCL, 9.27 mm ± 6.78 and in 20patients with ACL 10. 7 mm ± 6.10 mm. The percent of patients with 5 mm orgreater induration was ML 80%, HCL 71%, ACL 90%. Thus, we could not confirm an association between enhanced delayed hypersensitivity and mucosal involvement in leishmaniasis.

Protótipo para o diagnóstico do estado dos vasos sanguíneos

De acordo com estatísticas recentes, as doenças cardiovasculares e as principais complicações associadas, como a Aterosclerose e a Hipertensão Arterial, constituem a principal causa de morte em todo o mundo. Verifica-se ainda uma incidência crescente na população jovem, mas ainda não existem métodos suficientemente eficazes para o diagnóstico precoce de Aterosclerose. Deste modo, o objectivo principal do presente trabalho consiste no desenvolvimento da instrumentação e de um método não-invasivo, rápido e barato, que permita caracterizar o estado dos vasos sanguíneos na sua norma e patologia. Neste trabalho propõe-se uma metodologia inovadora para a avaliação do estado dos vasos sanguíneos, baseada na análise do sinal fotopletismográfico de propagação da onda de pulso, tendo-se efectuado um estudo comparativo de dois métodos de aquisição de pulsos: Método 1, no qual se adquirem pulsos das digitais da mão e do pé; e Método 2, pelo qual se obtêm os pulsos da Radial e da “pedis dorsalis”. Os principais parâmetros analisados neste trabalho foram o Índice de Rigidez (m/s) e Índice de Reflexão (%), que depende essencialmente do tónus das artérias periféricas. Igualmente, foi determinada a Velocidade da Onda de Pulso pelo Método Gold-Standard e pelo Método de Frank, e o Índice de Função do Endotélio (%), que foi obtido recorrendo à Hiperemia Reactiva. No Capítulo 1 do presente trabalho, apresentam-se os aspectos mais importantes da Aterosclerose e os métodos de diagnóstico actualmente utilizados, bem como os fundamentos gerais da hemodinâmica e as propriedades mecânicas e fisiológicas dos vasos sanguíneos. No Capítulo 2 analisam-se os métodos não-invasivos utilizados em estudos clínicos para a medição da velocidade de propagação da onda de pulso, e também se apresenta uma nova metodologia para a caracterização do estado dos vasos sanguíneos, que consiste na análise de vários de parâmetros a partir do sinal fotopletismográfico da onda de pulso. No Capítulo 3 descreve-se a instrumentação utilizada na actividade experimental desenvolvida, assim como as principais características dos sensores para a aquisição do sinal fotopletismográfico. Destaca-se ainda a calibração efectuada, o software utilizado para o processamento das medidas experimentais, e a elaboração da rotina de aquisição de dados. Os dados experimentais, adquiridos através do método proposto para diferentes faixas etárias, estão apresentados no Capítulo 4, bem como a análise e discussão dos resultados obtidos. E finalmente, no Capítulo 5, apresentam-se as principais conclusões e as perspectivas futuras.

Avaliação da cultura de segurança do doente em meio hospitalar : investigação ação numa unidade de radioterapia

RESUMO Introdução e objetivos As organizações internacionais responsáveis pela Qualidade na Saúde e Segurança do doente (Organização Mundial da Saúde, União Europeia), recomendam aos Estados membros a avaliação da cultura de segurança, como condição essencial para se introduzir mudanças nos comportamentos dos profissionais e nas organizações prestadoras de cuidados de saúde, e alcançar melhores níveis de segurança e de qualidade nos cuidados de saúde prestados aos doentes. Constitui objetivo geral deste trabalho contribuir para a implementação da cultura de segurança do doente nos profissionais envolvidos na prestação de cuidados de saúde, concorrendo para a avaliação da cultura de segurança do doente e, consequentemente para a garantia da qualidade dos cuidados prestados. Metodologia 1ª fase – pré-estudo: através da revisão de literatura identificamos o instrumento mais adequado para avaliar a cultura de segurança do hospital, traduzimos e validámos o instrumento. 2ª fase – desenvolvemos um estudo exploratório-descritivo, transversal, retrospetivo, em 3 hospitais portugueses e um estudo exploratório-descritivo, longitudinal, prospetivo, de investigação-ação, numa unidade de radioterapia. Resultados O Hospital Survey on Patient Safety Culture é o instrumento que revela as adequadas características para a avaliação da cultura de segurança nos hospitais portugueses. No que diz respeito à avaliação da cultura de segurança em três hospitais portugueses, podemos destacar que o trabalho em equipa, a expectativas do supervisor e a aprendizagem organizacional são as dimensões com melhores resultados apesar da frequência das notificações e das respostas ao erro não punitivas apresentarem os piores resultados. Verificou-se que a URT se encontra em franca evolução, o que se torna visível sobretudo na adesão à notificação que aumentou à medida que o tempo foi passando. O envolvimento de todos no desenho da intervenção e nas atividades a decorrer na unidade, foi preponderante para a melhoria da segurança do doente. Conclusões Temos consciência que existem muitas questões por responder e que na realidade não há receitas nem diretrizes que possam afirmar que existem relações de causalidade, confrontando uma determinada ação com a consequente mudança cultural. No entanto, estamos convictos que o envolvimento de todos os membros da organização/unidade, o compromisso forte da liderança, uma comunicação efetiva e uma notificação não punitiva são ingredientes essenciais para a melhoria contínua da cultura de segurança do doente.

Ectopic schistosomiasis: description of five cases involving skin, one ovarian case and one adrenal case

Seven cases of patients with ectopic schistosomiasis from the State of Sergipe, Brazil, are presented (five involving skin, one ovarian and one adrenal). Data were collected from surveying the clinical records and anatomopathological reports in the files of the dermatology and pathology clinics of the University Hospital of the Federal University of Sergipe, from 1995 to 2005. The patients' mean age at diagnosis was 21.1 years. In the dermatological cases, full cures were achieved after treatment with oxamniquine. In the ovarian case, there was an association with embryonic carcinoma: this patient underwent surgery with adjuvant chemotherapy and praziquantel treatment, with satisfactory evolution. The adrenal case was associated with adenoma.

A cor como abrigo: a arquitectura como cuidado

A presente tese intitulada “A cor como abrigo: a arquitectura como cuidado” tem por objectivo fortalecer a ligação entre a “Teoria das Cores” de Goethe e a arquitectura. Para isso a nossa estratégia foi recuperar os conceitos de espaço e corpo. Ambos começam por ser tomados como realidades físicas mas pouco a pouco vai-se mostrando que tal coisa como uma abordagem ‘puramente física’ do espaço e do corpo não é possível - talvez porque não exista. Mesmo a medicina (ao contrario do que possamos pensar primeiro) é uma ciência que não só reconhece o carácter diáfano do corpo como diariamente luta para ir além de uma concepção do corpo enquanto coisa física por perceber que o corpo é determinado por formas e funções mas sobretudo como tomado por forças. Um exemplo extremo desta interacção entre espaço e corpo (ligados através da arquitectura), onde o carácter diáfano de ambos ganha evidência, é na arquitectura de hospitais, que abordamos por último: “o que é um espaço vivido que tem por principal função restaurar o corpo do seu estado de doença?” As referencias principais são J.W. Goethe, Ludwig Wittgenstein, Edmund Husserl, Gilles Deleuze, Christian Norberg- Schulz, Frank Lloyd Wright and Tadao Ando. *********************************************************************This PhD research thesis titled: "Colour as shelter: architecture as care" has as its main goal to strengthen an existing relation between Goethe's Theory of Colours and Architecture. In order to do that our strategy was to use space and body as guiding concepts. Both start as being considered from a pure physical point of view but as our theme develops we see that a “pure physical point of view” concerning space and body it is not possible – perhaps because it does not exist. Medicine (unlike we may think at first) it is a science that not only acknowledges the diaphanous character of the body as daily, tries to go beyond the conception of body as physical thing understanding that the body is determined by forms and functions but mostly taken by forces. An extreme example of the interaction between space and body (linked through architecture), where the diaphanous character of both is evident, is Healthcare architecture: "what is a lived space that has as main function to restore the body of its illness"? Main references are: J.W. Goethe, Ludwig Wittgenstein, Edmund Husserl, Gilles Deleuze, Christian Norberg-Schulz, Frank Lloyd Wright and Tadao Ando.