Avaliação de populações de possíveis rizobactérias em solos sob espécies florestais

Embora estudos recentes relatem a utilização de RCPC (Rizobactérias Promotoras de Crescimento de Plantas) no Brasil, raríssimos trabalhos avaliam a presença natural dessas espécies bacterianas no solo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de RPCP em duas amostras de solo sob diferentes tipos de manejo, através da construção e do seqüenciamento de bibliotecas de DNA metagenômico. Utilizaram-se oligonucleotídeos específicos para amplificação da região hipervariável do espaço intergênico dos genes ribossomais 16S-23S de DNA extraído de diferentes solos, sob Eucalyptus sp. e sob mata. Os fragmentos obtidos foram inseridos em vetor e clonados. As bibliotecas geraram 495 clones, que foram seqüenciados e identificados através de comparações realizadas pelo software Blast. O solo sob Eucalyptus sp. apresentou maior número de RPCP do que sob mata. Os filos Actinobacteria e Proteobacteria eram maiores no solo sob Eucalyptus sp., estando o filo Firmicutes ausente no solo sob mata. Somente oito espécies diferentes de RPCP foram detectadas: Bacillus subtilis, Bacillus megaterium, Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium elkanii, Bradyrhizobium sp., Frankia sp., Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas gladioli. O trabalho forneceu valiosos dados sobre a presença de RPCP em solos com espécies florestais e sua possível utilização em reflorestamentos, assim como para o melhor conhecimento desses microrganismos nos solos do Brasil.

Gastroesophageal reflux disease and vocal disturbances

CONTEXTO: A doença do refluxo gastroesofágico (DRGE) é uma doença crônica na qual o conteúdo gastroduodenal reflui para o esôfago. O quadro clínico da DRGE é usualmente referido como pirose e regurgitação (manifestações típicas). Manifestações atípicas (distúrbios da voz e asma) podem também ser referidas. OBJETIVO: Analisar os aspectos clínicos, endoscópicos, manométricos e pHmétricos de pacientes portadores da DRGE com distúrbios da voz. MÉTODO: Foram estudados 50 pacientes com a DRGE, sendo 25 com distúrbios da voz (grupo 1 - G1) e 25 sem estes sintomas (controles, grupo 2 - G2). Todos os pacientes foram submetidos a endoscopia, manometria e pHmetria esofágica (dois sensores). Os pacientes do G1 foram submetidos a videolaringoscopia. RESULTADOS: Achados endoscópicos: DRGE não-erosiva foi observada em 95% dos pacientes de G1 e em 88% de G2. Videolaringoscopia: congestão das pregas vocais, assimetria, nódulos e pólipos foram diagnosticados nos pacientes do G1. Manometria esofágica: pressão no esfíncter inferior do esôfago (mm Hg): 11,6 ± 5,2 em G1 e 14,0 ± 6,2 em G2 (P = 0,14); pressão no esfíncter superior do esôfago (mm Hg): 58,4 ± 15,9 em G1 e 69,5 ± 30,7 nos controles. Achados pHmétricos: índice de DeMeester: 34,0 ± 20,9 em G1 e 15,4 ± 9,4 em G2 (P<0,001); número de episódios de refluxo no sensor distal: 43,0 ± 20,4 em G1 e 26, 4 ± 17,2 em G2 (P<0,003); percentagem do tempo com pH esofágico menor que 4 unidades (sensor distal): 9,0% ± 6,4% em G1 e 3,4% ± 2,1% em G2 (P<0,001); número de episódios de refluxo no sensor proximal: 7,5 ± 10,9 em G1 e 5,3 ± 5,7 em G2 (P = 0,38); percentagem de tempo com pH esofágico menor que quatro unidades (sensor proximal): 1,2% ± 2,7% em G1 e 0,5% ± 0,7% em G2 (P = 0,210). CONCLUSÕES: Os aspectos clínicos, endoscópicos e manométricos em pacientes com a DRGE e distúrbios da voz não diferem dos pacientes sem estes sintomas. A intensidade do refluxo gastroesofágico é maior nos pacientes com distúrbios da voz. Os pacientes sem distúrbios da voz podem também apresentar episódios de refluxo gastroesofágico no sensor proximal.

A microsatellite library for Carica papaya L. cv. Sunrise solo

Em áreas experimentais das Fazendas de Ensino e Pesquisa da UNESP/Campus de Ilha Solteira e Jaboticabal foram selecionadas e marcadas 20 plantas hermafroditas e 20 femininas dos cultivares Sunrise Solo, Improved Sunrise Solo cv.72/12 e Baixinho de Santa Amália. As sementes provenientes dos frutos selecionados foram plantadas para analisar-se a eficiência da autofecundação e a freqüência dos sexos nas progênies. Posteriormente, amostras de tecido foliar jovem das plantas matrizes foram coletadas para a extração de DNA. Foram construídas cinco bibliotecas enriquecidas de seqüências microsatélites, utilizando-se as sondas (TCA)10, (TC)13, (GATA)4, (CAC)10 e (TGAG)8. Foi possível o desenvolvimento de primers somente com a biblioteca que utilizou a sonda (TCA)10 . Esta permitiu o desenho de 32 pares de primers. Destes, 31 apresentaram padrão de banda única em agarose Metaphor e em acrilamida. Para o primer S36 foram observadas 2 bandas, mas sem polimorfismo para diferenciação da forma sexual na cultura do mamoeiro. No entanto, estes primers poderão ser testados na investigação de outras características em populações segregantes desta espécie e de espécies afins, análises de germoplasma, identificação de cultivares, evolução parental e marcas em melhoramento assistido.

Efeito da utilização de diferentes diluidores para a produção in vitro de embriões bovinos

Objetivou-se avaliar as características morfológica e funcional do sêmen bovino congelado comparando-se a eficácia de dois diferentes diluidores. O ejaculado de quatro touros foi dividido em duas partes iguais, uma submetida ao diluidor Tris e gema de ovo (A) e outra ao diluidor à base de lecitina de soja (Andromed®) (B). No experimento I, cinco palhetas dos diluidores A e B de cada touro foram descongeladas e avaliadas quanto à motilidade, vigor, concentração, morfologia espermática e teste de termor-resistência lento. Foram feitas, ainda, avaliação da integridade de membranas, por meio da associação das sondas iodeto de propídio, isotiocionato de fluoresceína - Pisum sativum e carbocianina catiônica lipofílica, e avaliação funcional da membrana plasmática com teste hiposmótico. A avaliação da integridade da cromatina foi realizada pelo método de coloração com laranja de acridina. No experimento II, o sêmen com os diferentes diluidores foi utilizado na fecundação in vitro, sendo observadas taxas de clivagem e desenvolvimento embrionário in vitro. em relação aos resultados obtidos, apenas a porcentagem de espermatozoides no sêmen congelado foi discretamente maior com o diluidor A, concluindo-se que o diluidor composto por lecitina de soja pode substituir o composto por Tris e gema de ovo, respeitando-se as variações individuais de cada touro utilizado no presente experimento.

Physical and mechanical properties of ceramics from clays of the west of S. Paulo State, Brazil

Argilas de interesse da indústria de cerâmica estrutural foram caracterizadas. Algumas propriedades físicas de diversas massas cerâmicas, preparadas a partir de material coletado em depósitos artificiais, também foram analisadas. Todas as massas investigadas exibem alta concentração de componentes finos (< 2 mim) e considerável grau de plasticidade, o que é compatível com a presença de elevado teor de argilominerais. Corpos de prova cerâmicos foram preparados por prensagem a seco e queimados em temperaturas ao redor de 855 °C. Os parâmetros resistência mecânica à flexão, retração linear, absorção de água, cor aparente e perda de peso foram medidos. Como resultado, as aplicações industriais destas matérias primas foram analisadas e revistas, bem como novas aplicações foram propostas.

Addition of sedimentary rock to kaolinitic clays: influence on sintering process

Foram avaliadas, durante o processo de sinterização, as propriedades mecânicas de peças cerâmicas a base de argila com adição de rocha sedimentar. Foram preparados corpos de prova com 0, 20, 40, 60 e 80% em peso de rocha adicionada ao material argiloso. As peças foram sinterizadas nas temperaturas de 500, 800, 900, 1000, 1100 e 1200 °C e, posteriormente, submetidas à análise de difração de raios X e a ensaios tecnológicos Os resultados de difração de raios X mostram que a rocha sedimentar apresenta argilominerais micáceos enquanto o material argiloso possui a caulinita como fase principal. Técnicas de análises térmicas e difração de raios X das diferentes misturas mostram reações que indicam transformação (inversão do quartzo), decomposição (perda de hidróxidos) e formação de fase (mulita) durante o aquecimento das amostras. Os ensaios tecnológicos mostram que a adição da rocha sedimentar melhora algumas propriedades do material sinterizado, auxiliada pela presença de fundentes. Entretanto, a presença de quartzo na rocha dificulta a formação da fase mulita. A formação de novas fases e as transformações ocorridas no aquecimento e resfriamento das amostras ajuda explicar as propriedades tecnológicas dos materiais cerâmicos.

Fluorescent in situ hybridization (FISH) as a diagnostic tool for Williams-Beuren syndrome

Fluorescent in situ hybridization (FISH) with commercial probes covering the elastin gene (ELN) was used to determine the frequency of the 7q11.23 deletion in 18 children clinically diagnosed with Williams-Beuren syndrome (WBS). A de novo deletion was detected in 15 of the children (83%). Diagnostic investigation for WBS started late in childhood (median = 5.8 years). All the children showed facial features typical of the syndrome, mental retardation and developmental delay. Over-friendliness was observed in the majority of cases. Clinodactyly of the 5th finger (n = 13), cardiovascular disease (n = 9), loquacity (n = 9), low birthweight (n = 8), and failure to thrive (n = 9) were observed only in those children with the deletion. Respiratory problems (n = 9), though not previously reported in the literature, was a common finding in the group studied. Our results confirmed that FISH is useful in identifying 7q11.23 deletions in cases of WBS. Clinical manifestations were more evident in the deletion-positive children.

O uso da gastrostomia percutânea endoscópica

A gastrostomia percutânea endoscópica foi introduzida na prática clínica como via alternativa de alimentação enteral. É procedimento que não necessita de anestesia ou laparotomia, como a gastrostomia cirúrgica. A gastrostomia percutânea endoscópica tem como objetivos a manutenção do aporte nutricional e a melhoria da qualidade de vida e sobrevida dos pacientes. É indicada quando o paciente necessita de dieta enteral por período superior a um mês. A freqüência de complicações varia de 1,0% a 10,0% e a mortalidade de 0,3% a 1,0%. É propósito deste trabalho abordar aspectos relevantes desse método de alimentação enteral, aprimorar seu manejo, bem como facilitar o manejo pelos pacientes que dele se utilizam. Para isso, vamos comentar as indicações e contra-indicações da gastrostomia percutânea endoscópica, técnica de colocação, material das sondas, antibiótico profilático, início de utilização, custo do procedimento, além de suas complicações, aspectos legais e éticos.

Spectroscopic studies of the Eu3+ and Er3+ ions in the fluorozirconate LaZr2F11 matrix

An investigation by optical spectroscopy of the Eu3 + and Er3 + active ions in the crystallized fluorozirconate matrix LaZr2F11 is presented. The D-5(1) --> F-7(0-5) emission lines of Eu3 + are used to extract the F-7(0-5) energy scheme and the observed extinctions permit the deduction of irreducible representations (IRREPS) associated with corresponding sub-levels in the D-2 symmetry. The crystal field analysis was carried out on a 387 x 387 basis set, comprising the F-7, D-5(1,2,3) F-5(1,2), (5)G(1,2,3) and P-3(1,2,3,4,5,6) terms of the Eu-3 (+) 4f(6) configuration. The deviation and rms are 6.8 and 7.9 cm (-1), respectively for 38 levels and ten parameters. The experimental crystal field parameters are in good agreement with the ab-initio ones. Moreover, the relative intensities of the D-5(0) --> F-7(2,3,4) emissions are well reproduced by an 'ab-initio' calculation, except for three lines. The Er3 + ions introduced in LaZr2F11, microcrystals also lie in an unique crystallographic site. A total of 31 energy levels were recorded and the crystal field analysis led to 6.6 and 7.8 cm (-1) for the deviation and rms, respectively, for nine variable parameters taken into account. The experimental CF parameters for Er3 + and Eu3 + are very similar, which seems to show that the host lattice contracts around the smaller Er3 + ion. The informations given by both Eu3 + and Eu3 + optical probes in LaZr2F11 are very consistent with the structure previously determined for the isotypic PrZr2F11 fluoride. (C) 2000 Elsevier B.V. B.V. All rights reserved.

Predisposing genes and increased chromosome aberrations in lung cancer cigarette smokers

Genotoxic effects linking cigarette smoking with lung cancer have not been consistently demonstrated, therefore claims for the cause-effect relationships are vigorously contested. Using matched populations of 22 lung cancer patients who have been cigarette smokers (LCP), 22 non-cancerous cigarette smokers (SC) and 13 non-smokers (NSC), we have applied the fluorescence in situ hybridization (FISH) tandem probe assay to elucidate the frequency of chromosome breakage among the participants. Two probes were used, a classical satellite probe which hybridizes to the large heterochromatin region of chromosome 1, and an alpha-satellite probe which targets a small region adjacent to the heterochromatin probe. The highest frequency of structural aberrations was observed in LCP (1.4 +/- 0.1) followed by SC (1.25 +/- 0.1) and NSC (0.4 +/- 0.1). Aberration frequencies were not significantly different between LCP and SC (p > 0.05), however, a statistically significant difference was detected between the smoker populations combined (LCP and SC) and the NSC (p < 0.001). The breakage frequencies showed a positive correlation with duration of smoking for LCP (r = 0.5; p < 0.01), but not for SC (P > 0.05). In addition, the aberration frequencies were influenced by the inheritance of polymorphic glutathione S-transferase (GST) genes. LCPs missing one or the other GST (GSTM1 or GSTT1) genes were found to have significantly higher chromosome breaks compared to LCPs with both genes present (p < 0.05), Our data indicate that genetic predisposition and chromosome aberrations may be mechanistically related to the initiation of lung carcinogenesis; therefore, they may be useful biomarkers for lung cancer among cigarette smokers. (C) 1997 Elsevier B.V. B.V.

The thermohydrodynamical picture of a charged Brownian particle

We study a charged Brownian gas with a non uniform bath temperature, and present a thermohydrodynamical picture. Expansion on the collision time probes the validity of the local equilibrium approach and the relevant thermodynamical variables. For the linear regime we present several applications (some novel).

CHOLESTEROL MODULATION OF LIPID PROTEIN INTERACTIONS IN LIVER MICROSOMAL MEMBRANE - A SPIN LABEL STUDY

ESR spectra of spin probes were used to monitor lipid-protein interactions in native and cholesterol-enriched microsomal membranes. In both systems composite spectra were obtained, one characteristic of bulk bilayer organization and another due to a motionally restricted population, which was ascribed to lipids in a protein microenvironment. Computer spectral subtractions revealed that cholesterol modulates the order/mobility of both populations in opposite ways, i.e., while the lipid bilayer region gives rise to more anisotropic spectra upon cholesterol enrichment, the spectra of the motionally restricted population become indicative of increased mobility and/or decreased order. These events were evidenced by measurement of both effective order parameters and correlation times. The percentages of the motionally restricted component were invariant in native and cholesterol-enriched microsomes. Variable temperature studies also indicated a lack of variation of the percentages of both spectral components, suggesting that the motionally restricted one was not due to protein aggregation. The results correlate well with the effect of cholesterol enrichment on membrane-bound enzyme kinetics and on the behavior of fluorescent probes [Castuma & Brenner (1986) Biochemistry 25, 4733-4738]. Several hypothesis are put forward to explain the molecular mechanism of the cholesterol-induced spectral changes.

DUPLICATION OF THE SHORT ARM OF THE X-CHROMOSOME IN MOTHER AND DAUGHTER

An 11-year-old girl with short stature, mental retardation, and mild dysmorphic features was found to have an inverted duplication of most of the short arm of the X chromosome [dic inv dup(X)(qter --> p22.3 = p22.3 --> cen:)]. Her mother, who is also short and retarded, carries the same duplication. Fluorescence in situ hybridization with an X chromosome library, and with X centromere-specific alpha satellite and telomere probes, was useful in characterizing the duplication. In most females with structurally abnormal X chromosomes, the abnormal chromosome is inactivated. Although the duplicated X was consistently late replicating in the mother, X chromosome inactivation studies in the proband indicated that in 11 % of her lymphocytes the duplicated X was active.

Sol-gel Eu3+/Tm3+ doped transparent glass-ceramic waveguides

Eu3+ and Tm3+ doped lanthanum fluoride and lanthanum oxyfluoride are obtained from Eu3+, Tm3+ containing lanthanum fluoracetate solutions. The nature of the crystal phase obtained could be controlled by the temperature of heat treatment. Spectral characteristics of Eu3+ doped crystal phases were sufficiently different to allow utilization of Eu3+ as structural probes. Tm3+ emission at the technologically important spectral region of 1450nm could be observed for the fluoride and oxyfluoride crystal phases. The large bandwidth obtained (around 120nm) suggests potential applications in optical amplification. SiO2-LaF3-LaOF composite materials were also prepared. It is observed that for heat treatments above 800degreesC, fluorine loss, probably in the form of SiF4 hinder the observation of Tm3+ emission. Eu3+ spectroscopic characteristics clearly show the evolution of a fluoride like environment to an amorphous oxide one as the temperature of heat treatment increased. Thin films obtained by dip-coating on V-SiO2 substrates and treated at 300degreesC, 500degreesC and 800degreesC display guided modes in the visible and infrared regions. Optical characteristics (refractive index and films thickness) were obtained at 543.5, 632.8 and 1550nm. Attenuation as low as 1.8dB/cm was measured at 632.8nm. (C) 2004 Published by Elsevier B.V.

Gold nanoelectrode ensembles for direct trace electroanalysis of iodide

A procedure for the standardization of ensembles of gold nanodisk electrodes (NEE) of 30 nm diameter is presented, which is based on the analytical comparison between experimental cyclic voltammograms (CV) obtained at the NEEs in diluted solutions of redox probes and CV patterns obtained by digital simulation. Possible origins of defects sometimes found in NEEs are discussed. Selected NEEs are then employed for the study of the electrochemical oxidation of iodide in acidic solutions. CV patterns display typical quasi-reversible behavior which involves associated chemical reactions between adsorbed and solution species. The main CV characteristics at the NEE compare with those observed at millimeter sized gold disk electrodes (Au-macro), apart a slight shift in E1/2 values and slightly higher peak to peak separation at the NEE. The detection limit (DC) at NEEs is 0.3 mu M, which is more than one order of magnitude lower than DL at the Au-macro (4 RM). The mechanism of the electrochemical oxidation of iodide at NEEs is discussed. Finally, NEEs are applied to the direct determination of iodide at micromolar concentration levels in real samples, namely in some ophthalmic drugs and iodized table salt. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.