Chromatin immunoprecipitation (ChIP) methodology and readouts

The identification of direct nuclear hormone receptor gene targets provides clues to their contribution to both development and cancer progression. Until recently, the identification of such direct target genes has relied on a combination of expression analysis and in silico searches for consensus binding motifs in gene promoters. Consensus binding motifs for transcription factors are often defined using in vitro DNA binding strategies. Such in vitro strategies fail to account for the many factors that contribute significantly to target selection by transcription factors in cells beyond the recognition of these short consensus DNA sequences. These factors include DNA methylation, chromatin structure, posttranslational modifications of transcription factors, and the cooperative recruitment of transcription factor complexes. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) provides a means of isolating transcription factor complexes in the context of endogenous chromatin, allowing the identification of direct transcription factor targets. ChIP can be combined with site-specific PCR for candidate binding sites or alternatively with cloning, genomic microarrays or more recently direct high throughput sequencing to identify novel genomic targets. The application of ChIP-based approaches has redefined consensus binding motifs for transcription factors and provided important insights into transcription factor biology.

Obsessive-compulsive symptoms and attentional bias: An eye-tracking methodology

Background and objectives: Cognitive models suggest that attentional biases are integral in the maintenance of obsessive-compulsive symptoms (OCS). Such biases have been established experimentally in anxiety disorders; however, the evidence is unclear in Obsessive Compulsive disorder (OCD). In the present study, an eye-tracking methodology was employed to explore attentional biases in relation to OCS.
Methods: A convenience sample of 85 community volunteers was assessed on OCS using the Yale-Brown Obsessive Compulsive Scale-self report. Participants completed an eye-tracking paradigm where they were exposed to OCD, Aversive and Neutral visual stimuli. Indices of attentional bias were derived from the eye-tracking data.
Results: Simple linear regressions were performed with OCS severity as the predictor and eye-tracking measures of the different attentional biases for each of the three stimuli types were the criterion variables. Findings revealed that OCS severity moderately predicted greater frequency and duration of fixations on OCD stimuli, which reflect the maintenance attentional bias. No significant results were found in support of other biases.
Limitations: Interpretations based on a non-clinical sample limit the generalisability of the conclusions, although use of such samples in OCD research has been found to be comparable to clinical populations. Future research would include both clinical and sub-clinical participants.
Conclusions: Results provide some support for the theory of maintained attention in OCD attentional biases, as opposed to vigilance theory. Individuals with greater OCS do not orient to OCD stimuli any faster than individuals with lower OCS, but once a threat is identified, these individuals allocate more attention to OCS-relevant stimuli.

Integration of design of experiment, surface response methodology and multi-layer validation to predict the effect of blanching on colour of tomato juice

Response surface methodology was used to develop models to predict the effect of tomato cultivar, juice pH, blanching temperature and time on colour change of tomato juice after blanching. The juice from three tomato cultivars with adjusted pH levels ranging from 3.9 to 4.6 were blanched at temperatures from 60-100 °C for 1-5 min using the central composite design (CCD). The colour change was assessed by calculating the redness (a/b) and total colour change (∆E) after measuring the Hunter L, a and b values. Developed models for both redness and ∆E were significant (p<0.0001) with satisfactory coefficient of determination (R2 = 0.99 and 0.97) and low coefficient of variation (CV% = 1.89 and 7.23), respectively. Multilevel validation that was implemented revealed that the variation between the predicted and experimental values obtained for redness and ∆E were within the acceptable error range of 7.3 and 22.4%, respectively

Evaluation of 'Dementia Friends' programme for undergraduate nursing students: Innovative practice.

The ‘dementia friends’ programme was launched by the Alzheimer’s Society in the UK two years ago with the purpose of educating members of the public about the things they can do which can enhance the lives of people living with dementia. The aim of this project was to deliver a two-hour ‘Dementia Friendly Community Workshop’ written by the Alzheimer’s Society, to an entire cohort of first-year undergraduate nursing students in one Higher Education Institutions in Northern Ireland. Following delivery of the programme, students were asked to complete a short questionnaire on their knowledge and confidence in relation to dementia care before and after the Dementia Friendly Community programme. A total of 322 undergraduate first-year nursing students took part in the Dementia Friendly Community programme. Of these, 304 returned questionnaires; 31.25% of students stated their perceived improvement in dementia knowledge was ‘good’ while 49.01% stated their perceived improvement in dementia knowledge was ‘very good’ and 13.49% stated their perceived improvement in dementia knowledge was ‘excellent’. In relation to confidence in engaging with people with dementia, 31.91% stated ‘good’ improvement, 40.79% stated ‘very good’ improvement and 11.84% stated ‘excellent’ improvement. The Dementia Friendly Community programme was positively reviewed by the undergraduate students as it enhanced knowledge and confidence in relation to care of someone living with dementia.

Ensino da física em cursos de engenharia: percursos colaborativos no ensino superior

A presente investigação insere-se no domínio científico da Didáctica, em particular no da Didáctica da Física no Ensino Superior. Pretende-se, com este trabalho, contribuir para o desenvolvimento do conhecimento Didáctico, nomeadamente sobre o ensino e a aprendizagem da Física no Ensino Superior e, ainda, sobre o trabalho colaborativo entre investigadores em Didáctica e professores da área das Ciências e Engenharias do Ensino Superior. O estudo empírico desenvolvido neste trabalho é constituído por duas partes, designadas por estudo A e estudo B. No estudo A analisa-se o impacto da implementação, em sala de aula, de estratégias de aprendizagem activa num contexto colaborativo entre investigadora e professora. Fá-lo através de um percurso metodológico de investigação-acção, na qual a investigadora actua como consultora. Utilizaram-se diferentes fontes e instrumentos na recolha de informação, nomeadamente notas de campo da investigadora, questionários e entrevistas a estudantes e entrevista à professora colaboradora. Foram implementadas estratégias identificadas na literatura como promotoras de aprendizagem activa dos estudantes, nomeadamente perguntas conceptuais; folhas de dúvidas; feedback; trabalho de grupo com e sem rotação de tarefas; trabalhos para casa e apresentação oral. Os resultados obtidos evidenciam que os estudantes sentiram interesse pela unidade curricular, pois compreenderam a sua utilidade no âmbito do curso que frequentavam, apreciaram positivamente as estratégias implementadas e, segundo a opinião deles, estas contribuíram para a sua aprendizagem. No estudo B procurou-se compreender a colaboração entre investigadores em Didáctica e professores do Ensino Superior, no contexto da Universidade de Aveiro. Este estudo evidenciou que é possível implementar estratégias inovadoras de ensino através de processos de colaboração entre investigadores em Didáctica e professores. Este estudo, de carácter exploratório, foi realizado através de entrevistas aos investigadores e aos professores que com eles colaboraram, procurando melhorar a qualidade das suas práticas de ensino. Através deste estudo chegou-se à conceptualização de uma proposta de Colaboração Disciplinar, uma colaboração entre investigadores em Didáctica e professores do Ensino Superior, em que os investigadores têm formação base nas unidades curriculares onde irão intervir. Esta proposta procura potenciar uma forma de trabalhar problemas complexos, como por exemplo o processo de ensino e aprendizagem, o desenvolvimento profissional dos professores, a articulação entre a investigação em Didáctica e a prática. As principais vantagens identificadas na Colaboração Disciplinar são: a proximidade disciplinar entre o investigador e o professor; a eficácia nas sugestões proporcionadas; o aumento da segurança do professor na implementação das sugestões; o desenvolvimento profissional contextualizado; a aproximação da investigação à prática. Os contributos deste estudo colocam-se a três níveis: ao nível pessoal e profissional da investigadora e da professora colaboradora; ao nível do desenvolvimento de conhecimento na referida área (no caso do primeiro estudo empírico desenvolvido), na medida em que apesar da especificidade do contexto onde o estudo ocorreu – na unidade curricular Elementos de Física do primeiro ano, primeiro semestre de diferentes cursos de Engenharia da Universidade de Aveiro, nos anos lectivos de 2007/08 e 2008/09 – considera-se que este trouxe ensinamentos que, adaptados a outros contextos, podem influenciar outros estudos e práticas; e ao nível do desenvolvimento de conhecimento sobre como dinamizar e potenciar colaborações entre investigadores da área da Didáctica e professores do Ensino Superior.

Física e contemporaneidade no ensino secundário: um contributo no âmbito da formação de professores

O presente trabalho versa a problemática da abordagem da Física Moderna e Contemporânea (FMC) no Ensino Secundário no quadro dos desafios que se colocam à educação científica actual. Num mundo em mudança em que o futuro não está garantido, o esforço educativo deve incluir a dimensão da importância do conhecimento na transformação dos indivíduos com vista à intervenção. A literatura tem apresentado a transposição para a sala de aula da Física desenvolvida ao longo do século XX, como relevante neste domínio. Esta relevância prende-se com a actualidade do conhecimento, com a associação a grande parte da tecnologia actual e ainda com a ligação ao conhecimento mais profundo da natureza e, supostamente, ao sentido do universo. Porém, uma escola de cariz essencialmente transmissivo e desencorajadora de itinerâncias pessoais, tornará muito limitativa a referida transposição. Vários são os constrangimentos da abordagem da FMC neste nível de ensino. Trata-se de um conhecimento contra-intuitivo, que suscita interpretações diversificadas e que se desenvolve formalmente com base em ferramentas matemáticas, em grande parte, não acessíveis a alunos do Ensino Secundário. A formação de professores é uma vertente essencial dentro desta problemática, podendo ser considerada, em muitos casos, deficiente ou desadequada por via do mesmo tipo de constrangimentos referidos. Este trabalho propõe-se estudar as possibilidades e potencialidades da formação de professores no contexto apresentado, a partir de um cenário alternativo que consideramos inovador. Para isso foi concebido, implementado e avaliado um Círculo de Estudos no âmbito da formação em FMC. Utilizando uma estratégia de investigação/ acção/ formação, ensaiou-se a integração de uma certa transdisciplinaridade e multidimensionalidade humana num percurso de natureza complexa, procurando-se a emergência a partir da interacção. À partida eram procurados indicadores de construção identitária e desenvolvimento da profissionalidade. Era ainda esperada a participação dos professores formandos na construção de materiais didácticos. Utilizando uma metodologia de cariz qualitativo na tipologia de estudo de caso, os dados foram recolhidos a partir de instrumentos preparados para o efeito como questionários, mas também de outras fontes como textos reflexivos dos professores e materiais didácticos elaborados pelos mesmos. Os resultados obtidos são de dois tipos. Em primeiro lugar mostram que o percurso efectuado produziu alterações ao nível do discurso dos professores, que revela valorização da itinerância e abertura à incerteza na abordagem da FMC, bem como uma maior familiarização com os conceitos. Por outro lado, os materiais de utilização em sala de aula produzidos foram considerados de interesse como contributos didácticos para utilização futura. Pensamos ainda poder afirmar que são apresentados elementos importantes para a definição de um desenho de formação de professores em FMC, com vista a um ensino e a uma aprendizagem pertinentes.