Ecology of antimicrobial resistance: humans, animals, food and environment

Antimicrobial resistance is a major health problem. After decades of research, numerous difficulties in tackling resistance have emerged, from the paucity of new antimicrobials to the inefficient contingency plans to reduce the use of antimicrobials; consequently, resistance to these drugs is out of control. Today we know that bacteria from the environment are often at the very origin of the acquired resistance determinants found in hospitals worldwide. Here we define the genetic components that flow from the environment to pathogenic bacteria and thereby confer a quantum increase in resistance levels, as resistance units (RU). Environmental bacteria as well as microbiomes from humans, animals, and food represent an infinite reservoir of RU, which are based on genes that have had, or not, a resistance function in their original bacterial hosts. This brief review presents our current knowledge of antimicrobial resistance and its consequences, with special focus on the importance of an ecologic perspective of antimicrobial resistance. This discipline encompasses the study of the relationships of entities and events in the framework of curing and preventing disease, a definition that takes into account both microbial ecology and antimicrobial resistance. Understanding the flux of RU throughout the diverse ecosystems is crucial to assess, prevent and eventually predict emerging scaffolds before they colonize health institutions. Collaborative horizontal research scenarios should be envisaged and involve all actors working with humans, animals, food and the environment.

Phenotypic and genotypic characterisation of antimicrobial resistance in Escherichia coli indicator of animal, food and human origin.

This thesis presents AMR phenotypic evaluation and whole genome sequencing analysis of 288 Escherichia coli strains isolated from different sources (livestock, companion animal, wildlife, food and human) in Italy. Our data reflects general resistance trends in Europe, reporting tetracycline, ampicillin, sulfisoxazole and aminoglycosides resistance as the most common phenotypic AMR profile among livestock, pets, wildlife and humans. Identification of human and animal (livestock and companion animal) AMR profiles in niches with a rare (fishery, mollusc) or absent (vegetable, wild animal, wild boar) direct exposure to antimicrobials, suggests widespread environmental pollution with ARGs conferring resistance to these antimicrobials. Phenotypic resistance to highest priority critically important antimicrobials was mainly observed in food-producing animals and related food such as rabbit, poultry, beef and swine. Discrepancies between AMR phenotypic pattern and genetic profile were observed. In particular, phenotypic aminoglycoside, cephalosporin, meropenem, colistin resistance and ESBL profile did not have a genetic explanation in different cases. This data could suggest the diffusion of new genetic variants of ARGs, associated to these antimicrobial classes. Generally, our collection shows a virulence profile typical of extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) pathotype. Different pandemic and emerging ExPEC lineages were identified, in particular in poultry meat (ST10; ST23; ST69, ST117; ST131). Rabbit was suggested as a source of ST20-ST40 potential hybrid pathogens. Wildlife carried a high average number (10) of VAGs (mostly associated to ExPEC pathotype) and different predominant ExPEC lineages (ST23, ST117, ST648), suggesting its possible involvement in maintenance and diffusion of virulence determinants. In conclusion, our study provides important knowledge related to the phenotypic/genetic AMR and virulence profiles circulating in E. coli in Italy. The role of different niches in AMR dynamics has been discussed. In particular, food-producing animals are worthy of continued investigation as a source of potential zoonotic pathogens, meanwhile wildlife might contribute to VAGs spread.

Dynamic food systems and climate-induced risks transmission for food and nutritional security

Agriculture market instability impedes achieving the global goal of sustainable and resilient food systems. Currently, the support to producers reaches the mammoth USD 540 billion a year and is projected to reach USD 1.8 trillion by 2030. This gigantic increase requires a repurposing agricultural support strategy (RASS), considering the market country-specific circumstances. These circumstances may vary with geographic locations, marketing structures, and product value chains. The fruit production system is crucial for health-conscious consumers and profit-oriented producers for food and nutritional security. Export is one of the main driving forces behind the expansion of the fruit sector, and during the year 2010-2018, trade significantly outpaced production increases. The previous literature states that irregular and unpredictable behaviour — Chaos — can arise from entirely rational economic decision-making within markets. Different markets' direct/indirect linkages through trade create trade hubs, and uncertainty may function as an avenue to transmit adverse shocks and increase vulnerability rather than contribute to resilience. Therefore, distinguishing Chaos into an endogenous and exogenous pattern of behaviour is cradled to formulate an effective RASS for resilient food systems and to understand global food crises. The present research is aimed at studying the market dynamics of three regional trade hubs, i.e., Brazil (South America), Italy (Europe), and Pakistan (Asia), each representing advanced to traditional value chains to control uncertainty (risks). The present research encompasses 1) a systematic review to highlight the research dynamism and identify grey-areas of research. Based on the findings, we have investigated the 2) nonlinear impacts of climate-induced price responsiveness in monopsony markets. Once we highlighted the importance of marketing structures/arrangements, 3) we developed a risk transmission framework to address the co-evolving impacts in complex dynamic interactions.

Metabolomics to investigate the effects of treatments on food and of food consumption on health

Metabolomics has established itself as a discipline that can offer a unique point of view on how a technological treatment could impact on the charactersitics of a food. Even more, the same analytical platforms necessary for the purpose can also effectively unravel intricate interactions between such food and human health upon consumption. This PhD thesis investigates the application of metabolomics in understanding the impact of technological treatments on food and their subsequent effects on human health, utilizing 1H-NMR as the analytical platform. The study involves the development of standard operating procedures (SOPs) to ensure a fast and stable preparation of seafood samples, incorporating novel algorithms to enhance the accuracy of metabolome profiles. To gain insight on how metabolomics can allow exploring the effects of a technological treatment on a food, we performed three sets of experiments to investigate the application of metabolomics in studying the impact of high hydrostatic pressure (HHP) treatment on seafood metabolome during storage. The first experiment employs untargeted metabolomic analysis on chill-stored rose shrimp, revealing significant post-HHP treatment metabolic alterations and mechanisms. The investigation is extended to grey mullet in the second experiment, utilizing both untargeted and targeted metabolomic analyses to account for matrix-related effects. The third experiment assesses the targeted metabolome of striped prawns, showing that HHP significantly influences metabolic pathways, positively impacting freshness and taste through alterations in related metabolites. Shifting focus to the effects of food on humans, the study explores the impact of multistrain probiotics on cirrhosis patients using 1H-NMR. The platform reveals notable alterations in glutamine/glutamate metabolism, enhancing the patients' ammonia detoxification capacity. This research underscores the potential of metabolomics in uncovering intricate interactions between technological treatments, food, and human health, providing valuable insights for both the food industry and healthcare interventions.

As conferências nacionais do esporte na configuração da política esportiva e de lazer no governo Lula (2003-2010)

Universidade Estadual de Campinas . Faculdade de Educação Física

Circuitos de uso de crack na região central da cidade de São Paulo (SP, Brasil)

Apesar de o uso de drogas ser uma prática presente desde os primórdios da humanidade, atualmente o seu abuso adquiriu dimensões preocupantes, configurando-se como um problema de saúde pública. O surgimento do crack, droga derivada da pasta de coca, agravou esse quadro ao aumentar os danos sociais e à saúde dos usuários. Visando conhecer o impacto de sua inserção no cotidiano dos usuários, foi realizado um estudo etnográfico em locais de venda e uso de crack na região central da cidade de São Paulo (SP, Brasil). Foi utilizado um diário de campo para registrar as observações e os diálogos informais efetuados com as pessoas que circulavam no local estudado. Os resultados apontaram os circuitos percorridos pelos usuários, suas dinâmicas e as relações que estabelecem com outros atores sociais, as quais são permeadas por permanente tensão, envolvendo a prática de atos violentos nos quais os usuários são tanto agressores quanto vítimas. O estudo também sugere a importância de outros fatores como a história da região pesquisada, as políticas públicas, questões econômicas e ausência de investimentos sociais e em saúde pública. Sugere-se que o alto grau de degradação da região pesquisada não seria consequência apenas das pessoas e atividades exercidas no local, mas principalmente do processo urbano que gerou tal quadro social.

Sa??de materno infantil no Brasil: evolu????o e programas desenvolvidos pelo Minist??rio da Sa??de

Trata-se de uma revis??o de literatura com o objetivo de descrever a evolu????o da aten????o ?? sa??de materno infantil no Brasil desde o Estado Novo at?? os dias atuais. O levantamento de dados foi realizado em livros, sites do Minist??rio da Sa??de, Legisla????es do Di??rio Oficial e artigos das bases de dados Biblioteca Virtual em Sa??de (BVS/Bireme), Medline e Scientific Eletronic Library (Scielo). As pol??ticas p??blicas de sa??de materno infantil foram definidas seguindo desde os princ??pios meramente reprodutivos at?? aqueles mais amplos, voltados para garantir uma melhor condi????o de sa??de e de vida. Nas ??ltimas d??cadas, com o aux??lio do governo e da sociedade, houve uma progress??o no atendimento da sa??de da mulher e da crian??a. No entanto, conclui-se que, apesar da evolu????o observada, o grande desafio ainda se encontra na redu????o da morbimortalidade materna, neonatal e infantil.

Conselho Nacional de Juventude: rede de pol??ticas p??blicas?

O presente trabalho representa uma tentativa de avaliar se o Conselho Nacional de Juventude da Secretaria Geral da Presid??ncia da Rep??blica pode ser entendido como uma rede de pol??ticas p??blicas, conforme a vis??o de Bonafont (2004). Para realizar essa avalia????o optou-se, inicialmente, pela abordagem da an??lise de redes de pol??ticas p??blicas qualitativa e por alguns itens avaliativos. Assim, foram realizadas entrevistas, al??m de pesquisas documentais em livros, boletins informativos, documentos oficiais, s??tios eletr??nicos e outras fontes de informa????es que auxiliaram a montar o hist??rico do Conselho, mapear as suas caracter??sticas, a estrutura, a forma de atua????o e a rela????o entre seus atores. O estudo mostra que, apesar do aumento de capital social trazido pela cria????o de um espa??o p??blico de discuss??o de pol??ticas p??blicas de juventude, o Conselho ainda n??o pode ser considerado uma rede de pol??ticas p??blicas. Identificou-se, principalmente, falta de consenso sobre o tema, aus??ncia de elabora????o de diretrizes sobre as pol??ticas p??blicas de juventude, bem como a inexist??ncia de um conceito ??nico de juventude compartilhado entre seus integrantes. Entretanto, vislumbram-se possibilidades concretas de surgimento de tal estrutura caso alguns requisitos, discutidos no artigo, estejam presentes em futuras realiza????es desse ??rg??o.

Pr??-equidade de g??nero: incorporando pol??ticas de a????o afirmativa no mundo do trabalho

A institui????o do Programa Pr??-equidade de G??nero ?? o reconhecimento p??blico da desigualdade de tratamento e de oportunidades, que ainda permanece entre mulheres e homens. A implementa????o ?? consolidada com a coloca????o em pr??tica dos planos de a????es firmados entre a Secretaria Especial de Pol??ticas para as Mulheres (SPM) e as organiza????es aderentes. A pesquisa explorat??ria teve como objetivo apresentar o programa e discuti-lo com base no modelo "policy cycle como aprendizado", de Silva e Melo (2000). Os resultados subsidiar??o pesquisa futura sobre a avalia????o do programa. Dentro da estrat??gia adotada, a coleta de dados ocorreu em documentos institucionais e dados bibliogr??ficos em mar??o de 2009, com o seguinte resultado: a avalia????o n??o trata de forma clara da efetividade e da sustentabilidade do programa. Este trabalho est?? dividido em seis partes: descri????o do m??todo utilizado; apresenta????o do Programa Pro-equidade de G??nero; avalia????o de suas duas primeiras edi????es; breve contextualiza????o das pol??ticas p??blicas no Brasil e o modelo "policy cicle como aprendizado"; rela????es entre o programa e o modelo; e considera????es finais.

A behavioral intervention in a cohort of Japanese-Brazilians at high cardiometabolic risk

OBJECTIVE: To assess the effect of a health promotion program on cardiometabolic risk profile in Japanese-Brazilians. METHODS: A total of 466 subjects from a study on diabetes prevalence conducted in the city of Bauru, southeastern Brazil, in 2000 completed a 1-year intervention program (2005-2006) based on healthy diet counseling and physical activity. Changes in blood pressure and metabolic parameters in the 2005-2006 period were compared with annual changes in these same variables in the 2000-2005 period. RESULTS: During the intervention, there were greater annual reductions in mean (SD) waist circumference [-0.5(3.8) vs. 1.2(1.2) cm per year, p<0.001], systolic blood pressure [-4.6(17.9) vs. 1.8(4.3) mmHg per year, p<0.001], 2-hour plasma glucose [-1.2(2.1) vs. -0.2(0.6) mmol/L per year, p<0.001], LDL-cholesterol [-0.3(0.9) vs. -0.1(0.2) mmol/L per year, p<0.001] and Framingham coronary heart disease risk score [-0.25(3.03) vs. 0.11(0.66) per year, p=0.02] but not in triglycerides [0.2(1.6) vs. 0.1(0.42) mmol/L per year, p<0.001], and fasting insulin level [1.2(5.8) vs. -0.7(2.2) IU/mL per year, p<0.001] compared with the pre-intervention period. Significant reductions in the prevalence of impaired fasting glucose/impaired glucose tolerance and diabetes were seen during the intervention (from 58.4% to 35.4%, p<0.001; and from 30.1% to 21.7%, p= 0.004, respectively). CONCLUSIONS: A one-year community-based health promotion program brings cardiometabolic benefits in a high-risk population of Japanese-Brazilians.

Implementação e validação de um método de pesquisa e quantificação de Vitamina E por HPLC

As vitaminas são substâncias orgânicas presentes em muitos alimentos, em pequenas quantidades e indispensáveis ao funcionamento do organismo. A ausência sistemática destas resulta, quase sempre, em crescimento e desenvolvimento deficientes e em casos extremos pode conduzir a doenças graves, como por exemplo, a demência (vitaminas do complexo B), o raquitismo (vitamina D), o escorbuto (vitamina C). Em 1968 a American Food and Nutrition Board reconheceu oficialmente a vitamina E como um nutriente essencial para os seres humanos, pois possui uma importante função no organismo, como antioxidante, ao inibir a oxidação de lípidos insaturados e ao prevenir o dano oxidativo celular pela inativação de radicais livres e espécies reativas de oxigênio. O interesse nesta vitamina é cada vez maior, devido às funções que desempenha no organismo como agente antioxidante, envolvido no retardamento do envelhecimento e na proteção de doenças crônicas não transmissíveis, como Parkinson, Alzheimer, cancro e doenças cardiovasculares. O presente trabalho tem como objetivo a implementação e validação de um método de pesquisa e quantificação da vitamina E na manteiga por cromatografia líquida de alta eficiência, no laboratório de Química da empresa SGS, expandindo desta forma, as capacidades da empresa nesta área. Para tal foram avaliados parâmetros como linearidade, limites de deteção e quantificação, repetibilidade, precisão intermédia e exatidão. Os resultados mostram que o método é linear para uma gama de trabalho entre 5,00 e 50,00 mg/L com um limite de deteção e quantificação de 1,27 mg/L e 3,84 mg/L, respetivamente. O método apresentou repetibilidade e precisão intermédia aceitáveis, com coeficientes de variação inferiores a 5%, limite de repetibilidade de 1,37 mg/kg e variabilidade de resultados associados ao método de 0,19 mg/L. A exatidão do método foi aferida recorrendo a ensaios de recuperação, tendo-se obtido percentagens de recuperação médias superiores a 80%.

Personalized-based dietary recommendation for weightlifting

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Eletrónica Industrial e Computadores