Crystal structure of an acidic platelet aggregation inhibitor and hypotensive phospholipase A(2) in the monomeric and dimeric states: insights into its oligomeric state

Phospholipases A(2) belong to the superfamily of proteins which hydrolyzes the sn-2 acyl groups of membrane phospholipids to release arachidonic acid and lysophospholipids. An acidic phospholipase A(2) isolated from Bothrops juraracussu snake venom presents a high catalytic, platelet aggregation inhibition and hypotensive activities. This protein was crystallized in two oligomeric states: monomeric and dimeric. The crystal structures were solved at 1.79 and 1.90 Angstrom resolution, respectively, for the two states. It was identified a Na+ ion at the center of Ca2+-binding site of the monomeric form. A novel dimeric conformation with the active sites exposed to the solvent was observed. Conformational states of the molecule may be due to the physicochemical conditions used in the crystallization experiments. We suggest dimeric state is one found in vivo. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Structural bioinformatics study of PNP from Schistosoma mansoni

The parasite Schistosoma mansoni lacks the de novo pathway for purine biosynthesis and depends on salvage pathways for its purine requirements. Schistosomiasis is endemic in 76 countries and territories and amongst the parasitic diseases ranks second after malaria in terms of social and economic impact and public health importance. The PNP is an attractive target for drug design and it has been submitted to extensive structure-based design. The atomic coordinates of the complex of human PNP with inosine were used as template for starting the modeling of PNP from S. mansoni complexed with inosine. Here we describe the model for the complex SmPNP-inosine and correlate the structure with differences in the affinity for inosine presented by human and S. mansoni PNPs. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Interaction of shikimic acid with shikimate kinase (Retracted Article. See vol 334, pg 967, 2005)

The crystal structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis (MtSK) complexed with MgADP and shikimic acid (shikimate) has been determined at 2.3 Angstrom resolution, clearly revealing the amino acid residues involved in shikimate binding. In MtSK, the Glu61 strictly conserved in SK forms a hydrogen bond and salt-bridge with Arg58 and assists in positioning the guanidinium group of Arg58 for shikimate binding. The carboxyl group of shikimate interacts with Arg58, Gly81, and Arg136, and hydroxyl groups with Asp34 and Gly80. The crystal structure of MtSK-MgADP-shikimate will provide crucial information for elucidation of the mechanism of SK-catalyzed reaction and for the development of a new generation of drugs against tuberculosis. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Structural insights into the catalytic mechanism of sphingomyelinases D and evolutionary relationship to glycerophosphodiester phosphodiesterases

Spider venom sphingomyelinases D catalyze the hydrolysis of sphingomyelin via an Mg2+ ion-dependent acid-base catalytic mechanism which involves two histidines. In the crystal structure of the sulfate free enzyme determined at 1.85 angstrom resolution, the metal ion is tetrahedrally coordinated instead of the trigonal-bipyramidal coordination observed in the sulfate bound form. The observed hyperpolarized state of His47 requires a revision of the previously suggested catalytic mechanism. Molecular modeling indicates that the fundamental structural features important for catalysis are fully conserved in both classes of SMases D and that the Class II SMases D contain an additional intra-chain disulphide bridge (Cys53-Cys201). Structural analysis suggests that the highly homologous enzyme from Loxosceles bonetti is unable to hydrolyze sphingomyelin due to the 95G1y -> Asn and 134Pro -> Glu mutations that modify the local charge and hydrophobicity of the interfacial face. Structural and sequence comparisons confirm the evolutionary relationship between sphingomyelinases D and the glicerophosphodiester phosphoesterases which utilize a similar catalytic mechanism. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Aproveitamento do resíduo da produção de etanol a partir de farelo de mandioca, como fonte de fibras dietéticas

O presente trabalho teve por objetivo analisar resíduos do farelo de mandioca resultantes de processos de hidrólise enzimática para obtenção de etanol; visando o aproveitamento destes como fonte de fibras dietéticas. Foram realizados quatro ensaios enzimáticos utilizando as enzimas amilolíticas, a-amilase e amiloglucosidase, complementadas ou não com celulase e/ou pectinase. Os resíduos foram caracterizados quanto à composição centesimal, pH, acidez, perfil de açúcares e quanto às fibras (FDA, FDN, celulose, hemicelulose, lignina, açúcares neutros). Realizou-se também a análise microscópica dos resíduos. Pelos resultados obtidos na caracterização dos resíduos calculou-se a energia metabolizável aparente (EM). Observou-se que independente do ensaio enzimático todos os resíduos podem ser usados como fonte de fibras insolúveis. Os resíduos resultantes dos ensaios com pectinase apresentaram uma proporção aproximada de 1:1:1 de amido, fibras e açúcares, sendo a glicose o açúcar majoritário, e com energia metabolizável aparente de cerca de 2,6 kcal/g. Já os resíduos, onde não se utilizou a pectinase a proporção foi de 2:1:1 aproximadamente e a energia 3,1 kcal/g. A análise microscópica dos resíduos mostrou a presença de amido não hidrolisado preso às células em todos os ensaios enzimáticos sendo que, nos resíduos dos ensaios com pectinase a quantidade observada foi bem inferior aos demais. Uma possível alternativa para diminuir o valor calórico dos resíduos seria a lavagem com água após a prensagem para extração do hidrolisado para fermentação.

Efeito da imersão de mudas com fertilizante e cupinicida no crescimento de dois clones de eucalipto sob duas condições de umidade no substrato

Pós-graduação em Ciência Florestal - FCA

Adsorção de íons Cu(II) sobre superfícies de sílicas gel modificadas com 4-amino-2-mercaptopirimidina e com 2-mercaptopirimidina

Pós-graduação em Ciência dos Materiais - FEIS

Avalição da eficácia dos biocurativos em ratos Wistar com lesões de pele causadas por queimaduras

Pós-graduação em Pesquisa e Desenvolvimento (Biotecnologia Médica) - FMB

Conservação de pêssegos 'Biuti irradiados e armazenados com e sem refrigeração

Pós-graduação em Agronomia (Horticultura) - FCA

Caracterização de uma comunidade de árvores e sua infestação por lianas em uma floresta decídua

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Desenvolvimento de pastilhas cerâmicas à bases de Si3N4 para aplicações tribológicas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo do impacto socioeconômico da piscicultura em tanques-rede no reservatório da UHE Tucuruí-PA: o caso do Projeto Ipirá

A presente dissertação avalia o desenvolvimento da piscicultura em tanques-rede no reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí, no Estado do Pará, a partir de um estudo de caso: o projeto de piscicultura Ipirá, criado por meio um acordo firmado entre a Centrais Elétricas do Norte do Brasil – Eletrobras Eletronorte e um conjunto de famílias que tiveram seus modos de vida impactados pela construção da Hidrelétrica de Tucuruí, como alternativa para a geração de emprego e renda. Avalia-se, mas especificamente qual o impacto do projeto na melhoria das condições de vida das famílias atendidas pelo mesmo sob a perspectiva socioeconômica. Para alcançar os objetivos desse trabalho, utilizou-se além do estudo de caso, o modelo sistêmico para a aqüicultura, em especial os cálculos dos índices para a avaliação da sustentabilidade socioeconômica da aquicultura - IDES, como procedimentos metodológicos. Observou-se que o projeto de piscicultura Ipirá mostra-se potencialmente sustentável do ponto de vista socioeconômico (0,649). Os indicadores aspectos sanitários (0,123), lazer (0,113) e saúde (0,110), apresentaram em ordem decrescente, as principais contribuições na composição do IDES, ao passo que os indicadores renda (0,040) e habitação (0,79), essenciais para a manutenção familiar e condições de bem estar do ser humano, apresentaram os piores resultados. Conclui-se, a partir dos resultados gerados, que o projeto de piscicultura Ipirá não conseguiu alcançar seu objetivo principal: geração de emprego e renda, e demonstra-se não influenciar significativamente na melhoria das condições de vida das famílias atendidas, o que é reforçado pelos dados levantados em campo, onde 86% dos entrevistados sobrevivem com salário igual e menor que 1 salário mínimo mensal, complementado pelo auxílio do seguro defeso e o bolsa família. Por fim, ressalta-se a relevância do projeto Ipirá como um case de política sócio-ambiental com potencial para dinamizar a economia local e em uma perspectiva mais otimista se tornar um modelo a ser replicado e abranger todos os municípios do entorno do reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí, desde que as falhas na implantação e no seu gerenciamento sejam sanadas e as devidas providenciais sejam tomadas, como as apontadas pelo presente estudo.

Efeitos da suplementação energética e lipídica no perfil metabólico, desenvolvimento folicular e produção in vitro de embrióes em novilhas da raça Nelore (Bos taurus indicus)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Preparação pelo método poliol modificado, caracterização estrutural e espectroscópia de nanopós de niobato de potássio e neodímio e de suas condições sólidas dopadas em európio

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Influence Assessment in an Heteroscedastic Errors-in-Variables Model

The main goal of this article is to consider influence assessment in models with error-prone observations and variances of the measurement errors changing across observations. The techniques enable to identify potential influential elements and also to quantify the effects of perturbations in these elements on some results of interest. The approach is illustrated with data from the WHO MONICA Project on cardiovascular disease.