The programming language python in earth system simulations

-scale vary from a planetary scale and million years for convection problems to 100km and 10 years for fault systems simulations. Various techniques are in use to deal with the time dependency (e.g. Crank-Nicholson), with the non-linearity (e.g. Newton-Raphson) and weakly coupled equations (e.g. non-linear Gauss-Seidel). Besides these high-level solution algorithms discretization methods (e.g. finite element method (FEM), boundary element method (BEM)) are used to deal with spatial derivatives. Typically, large-scale, three dimensional meshes are required to resolve geometrical complexity (e.g. in the case of fault systems) or features in the solution (e.g. in mantel convection simulations). The modelling environment escript allows the rapid implementation of new physics as required for the development of simulation codes in earth sciences. Its main object is to provide a programming language, where the user can define new models and rapidly develop high-level solution algorithms. The current implementation is linked with the finite element package finley as a PDE solver. However, the design is open and other discretization technologies such as finite differences and boundary element methods could be included. escript is implemented as an extension of the interactive programming environment python (see www.python.org). Key concepts introduced are Data objects, which are holding values on nodes or elements of the finite element mesh, and linearPDE objects, which are defining linear partial differential equations to be solved by the underlying discretization technology. In this paper we will show the basic concepts of escript and will show how escript is used to implement a simulation code for interacting fault systems. We will show some results of large-scale, parallel simulations on an SGI Altix system. Acknowledgements: Project work is supported by Australian Commonwealth Government through the Australian Computational Earth Systems Simulator Major National Research Facility, Queensland State Government Smart State Research Facility Fund, The University of Queensland and SGI.

A Land That Has Yet to Heal: The Burmese Civil War (1948 – present)

Since its independence from Great Britain in 1948, the state of Burma has been at war with itself. Ethnic and religious tension fuel the conflict and has led to territorial disputes while no resolution to this strife is expected under a fragile and corrupt central government. Additionally, proxy wars have delayed any peaceful negotiations. The combinations of failing social welfare programs and prolonged peace talks have led many Burmese people join the military as soldiers in either the Burmese military or any one of the numerous ethnic paramilitary groups in the country. Human rights violations are common in Burma, including rape, pillaging, and ethnic cleansing. Essentially, Burma has had the longest ongoing civil war due to combination of grievances, many of which predate the 21st century.

TRIPPy: Trailed Image Photometry in Python

Photometry of moving sources typically suffers from a reduced signal-to-noise ratio (S/N) or flux measurements biased to incorrect low values through the use of circular apertures. To address this issue, we present the software package, TRIPPy: TRailed Image Photometry in Python. TRIPPy introduces the pill aperture, which is the natural extension of the circular aperture appropriate for linearly trailed sources. The pill shape is a rectangle with two semicircular end-caps and is described by three parameters, the trail length and angle, and the radius. The TRIPPy software package also includes a new technique to generate accurate model point-spread functions (PSFs) and trailed PSFs (TSFs) from stationary background sources in sidereally tracked images. The TSF is merely the convolution of the model PSF, which consists of a moffat profile, and super-sampled lookup table. From the TSF, accurate pill aperture corrections can be estimated as a function of pill radius with an accuracy of 10 mmag for highly trailed sources. Analogous to the use of small circular apertures and associated aperture corrections, small radius pill apertures can be used to preserve S/Ns of low flux sources, with appropriate aperture correction applied to provide an accurate, unbiased flux measurement at all S/Ns.

PycoTCP: Una libreria Python per l'Internet of Threads

Grazie all'evoluzione dei servizi di rete indirizzare le interfacce di rete come se fossero i veri destinatari delle comunicazioni è diventato obsoleto. Per questo è nato il concetto di Internet of Threads, in cui gli indirizzi IP sono assegnati ad ogni processo in esecuzione nel computer mediante una rete ethernet virtuale. Attualmente esistono progetti che forniscono la gestione della rete virtuale e librerie che forniscono lo stack TCP/IP da integrare all'interno dei propri programmi. Queste librerie richiedono però la modifica e ricompilazione del proprio codice, anche a causa della loro interfaccia differente dai Berkeley Socket. Attraverso PycoTCP è possibile sperimentare all'interno di un ambiente IoTh senza riscrivere il proprio codice. Inoltre unifica le API fornite dalle librerie sottostanti esponendo una interfaccia identica a quella standard del Python, in modo che non sia necessario imparare un altro metodo di programmazione per utilizzare il nuovo paradigma.

Anthropogenic and Natural Organohalogen Compounds in Blubber of Dolphins and Dugongs (Dugong dugon) from Northeastern Australia

A range of organohalogen compounds (10 polychlorinated biphenyl [PCB] congeners, DDT and metabolites, chlordane-related compounds, the potential natural organochlorine compound Q1, toxaphene, hexachlorobenzene, hexachlorocyclohexanes, dieldrin, and several yet unidentified brominated compounds) were detected in the blubber of four bottlenose dolphins (Tursiops truncatus), one common dolphin (Delphinus delphis), and seven dugongs (Dugong dugon), as well as in adipose tissue of a green turtle (Chelonia mydas) and a python (Morelia spilota) from northeast Queensland (Australia). The green turtle and dugongs accumulated lower organohalogen levels than the dolphins. Lower levels in dugongs were expected because this species is exclusively herbivorous. Highest PCB and DDT levels recorded in dugongs were 209 and 173 mug/kg lipids, respectively. Levels of the nonanthropogenic heptachlorinated compound Q1 (highest level in dugongs was 160 mug/kg lipids) were estimated using the ECD response factor of trans-nonachlor. Highest organohalogen levels were found in blubber of dolphins for sumDDT (575-52,500 mug/kg) and PCBs (600-25,500 mug/kg lipids). Furthermore, Q1 was a major organohalogen detected in all samples analyzed, ranging from 450 -9,100 mug/kg lipids. The highest concentration of Q1 determined in this study represents the highest concentration reported to date in an environmental sample. Levels of chlordane-related compounds were also high (280-7,700 mug/kg, mainly derived from trans-nonachlor), but concentrations of hexachlorobenzene, hexachlorocyclohexanes, dieldrin, and toxaphene were relatively low and contributed little to the overall organohalogen contamination. Furthermore, a series of three major (BC-1, BC-2, and BC-3) and six minor (BC-4 through BC-9) unknown brominated compounds were observable by extracting m/z 79 and m/z 81 from the GC/ECNI-MS full scan run. Structural proposals were made for the two major recalcitrant compounds (referred to as BC-1 and BC-2). BC-2 appears to be a tetrabromo-methoxy-diphenylether (512 u) and BC-1 has 14 u (corresponding with an additional CH2 group) more relative to BC-1. In general the organohalogen pattern observed in blubber of dolphins was different compared to similar samples from other locations in the world, which is apparent from the fact that the four major abundant signals in the GC/ECD chromatogram. of D. delphis originated from the four unknown compounds Q1, BC-1, BC-2, and BC-3.

Desenvolvimento de algoritmos para a determinação da máxima injeção nodal em redes de energia elétrica

A presente dissertação apresenta um conjunto de algoritmos, cujo objetivo é a determinação da capacidade máxima de energia que é possível integrar numa rede de energia elétrica, seja num único nó ou em vários nós simultaneamente. Deste modo, obtém-se uma indicação dos locais mais adequados à nova instalação de geração e quais os reforços de rede necessários, de forma a permitirem a alocação da nova energia. Foram estudados e identificados os fatores que influenciam o valor da capacidade máxima nodal, assim como as suas consequências no funcionamento da rede, em particular o carácter simultâneo associado às referidas injeções nodais. Nesse sentido, são apresentados e desenvolvidos algoritmos que têm em consideração as características técnicas da geração a ligar e as restrições físicas impostas pela rede elétrica existente. Os algoritmos desenvolvidos apresentados baseiam-se em busca gaussiana, tendo sido igualmente implementada uma heurística que tem em consideração a proximidade de outras injeções em nós adjacentes e finalmente, dada a natureza combinatória do problema, propõe-se a aplicação de algoritmos genéticos especificamente adaptados ao problema Conclui-se que os algoritmos genéticos encerram características que lhes permitem ser aplicados em qualquer topologia com resultados superiores a todos os algoritmos desenvolvidos. Os métodos apresentados foram desenvolvidos e implementados usando a linguagem de programação Python, tendo-se desenvolvido ainda um interface visual ao utilizador, baseado em wxPython, onde estão implementadas diversas ferramentas que possibilitam a execução dos algoritmos, a configuração dos seus parâmetros e ainda o acesso à informação resultante dos algoritmos em formato Excel.

Estudo e proposta de algoritmo para a minimização do corte de eólica no contexto de uma análise custo-benefício multicritério

Trabalho Final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Electrotécnica Ramo de Energia

Welcome to the golden land: sexual and gender-based violence against women refugees from Burma

European Master’s Degree in Human Rights and Democratisation Academic Year 2005/2006

Plataforma de gestão de guias de programação de TV digital

Com o consumismo de mais variedade e qualidade de informação, assim como, produtos interativos, surgiu a necessidade de apresentar mais conteúdos, para além da programação de televisão comum. Com os avanços tecnológicos ligados à indústria da televisão e sua distribuição nos lares portugueses pelos operadores de TV, a quantidade de oferta de canais deixou de ser um foco, passando a ser prioritário a melhoria da experiência do cliente. Com a introdução de novas funcionalidades nas caixas recetoras de sinais de transmissão de canais, como por exemplo, a capacidade de apresentar informações adicionais sobre os programas, desde da sua apresentação em modo trailer até ao elenco detalhado que o compõe, os clientes podem ter uma nova experiência de interação com os serviços de TV. A funcionalidade de gravação agendada de programas levou ao próximo ponto de melhoria de experiência do cliente. As gravações que resultavam em programas indevidamente cortados, quer no seu início quer no seu fim, foi um dos motivos que levou os operadores de TV a procurarem um melhor serviço de gestão de guias de programação digitais. A InfoPortugal, entidade detentora do seguinte projeto e EPG Provider de algumas operadoras de TV nacionais, viu-se obrigada a atualizar os seu sistemas de distribuição de conteúdos, para responder à evolução dos requisitos dos seus clientes.

Implementação de uma Interface Homem-máquina baseada em Eletroculografia

A constante evolução da tecnologia permitiu ao ser humano a utilização de dispositivos electrónicos nas suas rotinas diárias. Estas podem ser afetadas quando os utilizadores sofrem de deficiências ou doenças que afetam as suas capacidades motoras. Com o intuito de minimizar este obstáculo surgiram as Interfaces Homem-Computador (HCI). É neste panorama que os sistemas HCI baseados em Eletroculografia (EOG) assumem um papel preponderante na melhoria da qualidade de vida destes indivíduos. A Eletroculografia é o resultado da aquisição do movimento ocular, que pode ser adquirido através de diversos métodos. Os métodos mais convencionais utilizam elétrodos de superfície para aquisição dos sinais elétricos, ou então, utilizam sistemas de gravação de vídeo, que gravam o movimento ocular. O objetivo desta tese é desenvolver um sistema HCI baseado em Eletroculografia, que adquire o sinal elétrico do movimento ocular através de elétrodos de superfície. Para tal desenvolveu-se um circuito eletrónico para a aquisição do sinal de EOG, bem como um algoritmo em Python para análise do mesmo. O circuito foi desenvolvido recorrendo a seis módulos diferentes, cada um deles com uma função específica. Para cada módulo foi necessário desenhar e implementar placas de circuito impresso, que quando conectadas entre si permitem filtrar, amplificar e digitalizar os sinais elétricos, adquiridos através de elétrodos de superfície, originados pelo movimento ocular. O algoritmo criado em Python permite analisar os dados provenientes do circuito e converte-os para coordenadas. Através destas foi possível determinar o sentido e a amplitude do movimento ocular.

Integração modular em visualizadores médicos e aposição da marcação CE do Dispositivo Médico

Neste documento ´e feita a descrição detalhada da integração modular de um script no software OsiriX. O objectivo deste script ´e determinar o diâmetro central da artéria aorta a partir de uma Tomografia Computorizada. Para tal são abordados conceitos relacionados com a temática do processamento de imagem digital, tecnologias associadas, e.g., a norma DICOM e desenvolvimento de software. Como estudo preliminar, são analisados diversos visualizadores de imagens médica, utilizados para investigação ou mesmo comercializados. Foram realizadas duas implementações distintas do plugin. A primeira versão do plugin faz a invocação do script de processamento usando o ficheiro de estudo armazenado em disco; a segunda versão faz a passagem de dados através de um bloco de memória partilhada e utiliza o framework Java Native Interface. Por fim, é demonstrado todo o processo de aposição da Marcação CE de um dispositivo médico de classe IIa e obtenção da declaração de conformidade por parte de um Organismo Notificado. Utilizaram-se os Sistemas Operativos Mac OS X e Linux e as linguagens de programação Java, Objective-C e Python.

A Visual Programming Framework for Wireless Sensor Networks in Smart Home Applications

International Conference on Intelligent Sensors, Sensor Networks and Information Processing (ISSNIP 2015). 7 to 9, Apr, 2015. Singapure, Singapore.

Sistema de Informação Geográfica aplicado ao transporte de reclusos

Trabalho de Projeto apresentado como requisito parcial para obtenção do grau de Mestre em Ciência e Sistemas de Informação Geográfica