Minimal requirements for parameters to be used for the development of predictive models for microbial source tracking. The example of the pair somatic coliphages and phages infecting Bacteroides

Several methods and approaches for measuring parameters to determine fecal sources of pollution in water have been developed in recent years. No single microbial or chemical parameter has proved sufficient to determine the source of fecal pollution. Combinations of parameters involving at least one discriminating indicator and one universal fecal indicator offer the most promising solutions for qualitative and quantitative analyses. The universal (nondiscriminating) fecal indicator provides quantitative information regarding the fecal load. The discriminating indicator contributes to the identification of a specific source. The relative values of the parameters derived from both kinds of indicators could provide information regarding the contribution to the total fecal load from each origin. It is also essential that both parameters characteristically persist in the environment for similar periods. Numerical analysis, such as inductive learning methods, could be used to select the most suitable and the lowest number of parameters to develop predictive models. These combinations of parameters provide information on factors affecting the models, such as dilution, specific types of animal source, persistence of microbial tracers, and complex mixtures from different sources. The combined use of the enumeration of somatic coliphages and the enumeration of Bacteroides-phages using different host specific strains (one from humans and another from pigs), both selected using the suggested approach, provides a feasible model for quantitative and qualitative analyses of fecal source identification.

Separation of ammonia and carbon dioxide by adsorption

Tässä työssä on tutkittu ammoniakin ja hiilidioksidin erottamista adsorptio prosessilla ja suunniteltiin paineen muunteluun perustuvan adsorptioprosessin (PSA) käyttöä. Työn tarkoituksena oli laskea adsorptioon perustuvan prosessin kannattavuus melamiinitehtaan poistokaasujen erotuksessa. Tätä varten työssä suunniteltiin tehdasmitta-kaavainen prosessi ja arvioitiin sen kannattavuus. Työssä mitattiin adsorptiotasapainot, joiden perusteella sovitettiin sopiva kokeellinen adsorptioisotermi. Adsorptioisotermi lisättiin simulointiohjelmaan, jonka avulla suunniteltiin kaksi vaihtoehtoista pilot laitteistoa kaasujen erottamiseksi. Toisella pilot laitteistolla saadaan mitattua vain läpäisykäyrät, mutta paremmalla versiolla saadaan myös tietoa erotettujen komponenttien puhtaudesta. Suunnittelun tärkeimpiä lähtökohtia on molempien komponenttien mahdollisimman korkea puhtaus ja talteenottoaste. Täysimittakaavainen tehdas suunniteltiin simulointiohjelmiston avulla kahdelle eri kapasiteetille ja arvioitiin niiden kustannukset ja kannattavuus. Adsorptioprosessit osoittautuivat kannattaviksi kaasuseoksen erottamisessa kummassakin tapauksessa

Fulvestrant with or without selumetinib, a MEK 1/2 inhibitor, in breast cancer progressing after aromatase inhibitor therapy: A multicentre randomised placebo-controlled double-blind phase II trial, SAKK 21/08.

BACKGROUND: Second line endocrine therapy has limited antitumour activity. Fulvestrant inhibits and downregulates the oestrogen receptor. The mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway is one of the major cascades involved in resistance to endocrine therapy. We assessed the efficacy and safety of fulvestrant with selumetinib, a MEK 1/2 inhibitor, in advanced stage breast cancer progressing after aromatase inhibitor (AI). PATIENTS AND METHODS: This randomised phase II trial included postmenopausal patients with endocrine-sensitive breast cancer. They were ramdomised to fulvestrant combined with selumetinib or placebo. The primary endpoint was disease control rate (DCR) in the experimental arm. ClinicalTrials.gov Indentifier: NCT01160718. RESULTS: Following the planned interim efficacy analysis, recruitment was interrupted after the inclusion of 46 patients (23 in each arm), because the selumetinib-fulvestrant arm did not reach the pre-specified DCR. DCR was 23% (95% confidence interval (CI) 8-45%) in the selumetinib arm and 50% (95% CI 27-75%) in the placebo arm. Median progression-free survival was 3.7months (95% CI 1.9-5.8) in the selumetinib arm and 5.6months (95% CI 3.4-13.6) in the placebo arm. Median time to treatment failure was 5.1 (95% CI 2.3-6.7) and 5.6 (95% CI 3.4-10.2) months, respectively. The most frequent treatment-related adverse events observed in the selumetinib-fulvestrant arm were skin disorders, fatigue, nausea/vomiting, oedema, diarrhoea, mouth disorders and muscle disorders. CONCLUSIONS: The addition of selumetinib to fulvestrant did not show improving patients' outcome and was poorly tolerated at the recommended monotherapy dose. Selumetinib may have deteriorated the efficacy of the endocrine therapy in some patients.

Statistical Analysis of Spectral Images

Tämä diplomityö liittyy Spektrikuvien tutkimiseen tilastollisen kuvamallin näkökulmasta. Diplomityön ensimmäisessä osassa tarkastellaan tilastollisten parametrien jakaumien vaikutusta väreihin ja korostumiin erilaisissa valaistusolosuhteissa. Havaittiin, että tilastollisten parametrien väliset suhteet eivät riipu valaistusolosuhteista, mutta riippuvat kuvan häiriöttömyydestä. Ilmeni myös, että korkea huipukkuus saattaa aiheutua värikylläisyydestä. Lisäksi työssä kehitettiin tilastolliseen spektrimalliin perustuvaa tekstuurinyhdistämisalgoritmia. Sillä saavutettiin hyviä tuloksia, kun tilastollisten parametrien väliset riippuvuussuhteet olivat voimassa. Työn toisessa osassa erilaisia spektrikuvia tutkittiin käyttäen itsenäistä komponenttien analyysia (ICA). Seuraavia itsenäiseen komponenttien analyysiin tarkoitettuja algoritmia tarkasteltiin: JADE, kiinteän pisteen ICA ja momenttikeskeinen ICA. Tutkimuksissa painotettiin erottelun laatua. Paras erottelu saavutettiin JADE- algoritmilla, joskin erot muiden algoritmien välillä eivät olleet merkittäviä. Algoritmi jakoi kuvan kahteen itsenäiseen, joko korostuneeseen ja korostumattomaan tai kromaattiseen ja akromaattiseen, komponenttiin. Lopuksi pohditaan huipukkuuden suhdetta kuvan ominaisuuksiin, kuten korostuneisuuteen ja värikylläisyyteen. Työn viimeisessä osassa ehdotetaan mahdollisia jatkotutkimuskohteita.

Secondary metabolismin in Annonaceae: potencial source of drugs

Several species of Annona (Annonaceae) are used in traditional Mexican medicine by their anti-anxiety, anticonvulsant and tranquilizing properties. It has been reported that the alkaloids isolated from some species of the Annona have affinity to serotonergic 5-HT1A receptors and modulate dopaminergic transmission, which is involved in depressive disorders. In this review it is showed the results of the antidepressant-like effect of an alkaloid extract from the aerial parts of Annona cherimola (TA) in mice. The antidepressant-like effect was evaluated in the forced swimming test. To elucidate a possible mechanism of action, experiments of synergism with antidepressant drugs, such as imipramine (IMI), clomipramine (CLIMI), and fluoxetine (FLX), were carried out. The neurotransmitter content (DA: dopamine, 5HT: serotonin and its metabolites, HVA: homovanillic acid and 5HIAA:5-hydroxyindoleacetic) in the whole brain of mice were also determined by HPLC method. The results showed that repeated treatment with TA produced antidepressant-like effects in mice. This effect was not related to an increase in locomotor activity. Administration of TA facilitated the antidepressant effect of IMI and CLIMI as well as increased the turnover of DA and 5-HT. The alkaloids: 1,2-dimethoxy-5, 6.6 to 7-tetrahydro-4H-dibenzoquinoline-3,8,9,10-tetraol, anonaine, liriodenine, and nornuciferine were the main constituents of TA.

A Gradient based algorithm for blind inversion of Wiener System using multi-variate score functions

A Wiener system is a linear time-invariant filter, followed by an invertible nonlinear distortion. Assuming that the input signal is an independent and identically distributed (iid) sequence, we propose an algorithm for estimating the input signal only by observing the output of the Wiener system. The algorithm is based on minimizing the mutual information of the output samples, by means of a steepest descent gradient approach.

Speaker recognition improvement using blind inversion of distortions

In this paper we propose the inversion of nonlinear distortions in order to improve the recognition rates of a speaker recognizer system. We study the effect of saturations on the test signals, trying to take into account real situations where the training material has been recorded in a controlled situation but the testing signals present some mismatch with the input signal level (saturations). The experimental results shows that a combination of several strategies can improve the recognition rates with saturated test sentences from 80% to 89.39%, while the results with clean speech (without saturation) is 87.76% for one microphone.

Trust as a source of sustainable competitive advantage

Tämän pro gradu -tutkielman tarkoituksena oli selvittää, miten luottamus vaikuttaa yrityksen kilpailuetuun. Luottamus on monitieteellinen ilmiö joka on saanut varsin paljon huomiota viimeaikaisissa tutkimuksissa. Myös jatkuvasti kehittyvässä yrityksen teoriassa yrityksen kilpailukyky ja sen pysyvyys ovat olleet mielenkiinnon kohteena. Luottamuksen ja kilpailuedun suhdetta on tästä huolimatta tutkittu vain vähän. Luottamus on nähty ikään kuin implisiittisesti yrityksen teoriassa, mutta ei eksplisiittisesti. Tämä tutkielma analysoi luottamuksen ja yrityksen kilpailukyvyn teorioita sekä näiden yhtymäkohtia. Tutkimuksen lopputuloksena esitellään nämä teoriat toisiinsa yhdistävä malli. Tutkielma on teoreettinen ja osin käsiteanalyyttinen, tutkimusote on syntetisoiva ja exploratiivinen, sillä se pyrkii osoittamaan aiemmin erillisten teorioiden yhtymäkohdat. Esiteltävä malli osoittaa, että luottamuksen ja yrityksen pysyvän kilpailuedun teoriat voidaan liittää toisiinsa, tärkeimmän yhdistävän tekijän ollessa yhteistyökyvykkyys. Luottamus on yhteistyökyvykkyyden välttämätön ennakkoedellytys. Kyky tehdä yhteistyötä on, paitsi jo itsessään erittäin tärkeä dynaaminen kyvykkyys, myös muiden dynaamisten kyvykkyyksien luomista ja hyväksikäyttöä edesauttava tekijä. Sikäli yhteistyö voidaan nähdä yrityksen teoriassa muut dynaamiset kyvykkyydet mahdollistavana meta-kyvykkyytenä ja luottamus sen edellytyksenä.

GPS-signal Source Based on Direct Digital Synthesis

This thesis presents the design and implementation of a GPS-signal source suitable for receiver measurements. The developed signal source is based on direct digital synthesis which generates the intermediate frequency. The intermediate frequency is transfered to the final frequency with the aid of an Inphase/Quadrature modulator. The modulating GPS-data was generated with MATLAB. The signal source was duplicated to form a multi channel source. It was shown that, GPS-signals ment for civil navigation are easy to generate in the laboratory. The hardware does not need to be technically advanced if navigation with high level of accuracy is not needed. It was also shown that, the Inphase/Quadrature modulator can function as a single side band upconverter even with a high intermediate frequency. This concept reduces the demands required for output filtering.

Pelin kehitys win32-alustalla käyttäen Open Source -työkaluja

Peliteollisuus on nykyään erittäin suuri ohjelmistokehityksen ala, joten on ajankohtaista tutustua ilmaisten työkalujen ja kirjastojen tarjoamiin mahdollisuuksiin. Visuaalisen viihteen tuottamiseen tarvitaan yleensä C++-ohjelmointitaidon lisäksi mallinnustaitoa ja kuvankäsittelytaitoa. Tämän lisäksi äänten tuottaminen on erittäin suuri osa toimivan kokonaisuuden saavuttamiseksi. Tässä työssä käsitellään kaikki osa-alueet ja tutkitaan Open Source -työkalujen soveltuvuutta pelin kehitykseen win32-alustalla. Lopputuloksena syntyy täysin pelattava, tosin yksinkertainen peli CrazyBunny. Työn alussa esitellään kaikki käytettävät työkalut jotka kuuluvat tarvittavaan kehitysympäristöön. Tähän esittelyyn kuuluvat myös olennaisena osana työkalujen asennuksen läpikäynti sekä käyttöönotto. Työn perustana on käytetty OGRE-ohjelmistokehystä, joka ei ole varsinainen pelimoottori. Puuttuvia ominaisuuksia on lisätty käyttämällä CEGUI-kirjastoa käyttöliittymien tekoon sekä FMOD-kirjastoa äänijärjestelmän toteutukseen. Muita käytet-tyjä työkaluja ovat Code::Blocks-kehitysympäristö, Blender-mallinnusohjelma ja Audacity-äänieditori. Pelisovelluksen toteutuksen pohjana on käytetty State-sunnittelumalliin perustuvaa järjes-telmää pelitiloja hallintaan. Tässä mallissa pelin päävalikko, pelitila ja pelin loppu on ero-tettu omiksi tilaluokikseen, jolloin sovelluksesta saadaan helpommin hallittava. Päävali-kossa tärkein osa on itse valikoiden toteutus CEGUI-kirjaston avulla. Pelitilan toteutukses-sa tutustutaan OGRE:n visuaalisiin ominaisuuksiin kuten ympäristöön, valoihin, varjoihin, kuva-alustoihin ja visuaalisiin tehosteisiin. Tämän lisäksi peliin on toteutettu äänet suosi-tulla FMOD-kirjastolla, jota useat isot alan yritykset käyttävät kaupallisissa tuotteissaan.

Embolic Strokes of Undetermined Source in the Athens Stroke Registry: an Outcome Analysis.

BACKGROUND AND PURPOSE: Information about outcomes in Embolic Stroke of Undetermined Source (ESUS) patients is unavailable. This study provides a detailed analysis of outcomes of a large ESUS population. METHODS: Data set was derived from the Athens Stroke Registry. ESUS was defined according to the Cryptogenic Stroke/ESUS International Working Group criteria. End points were mortality, stroke recurrence, functional outcome, and a composite cardiovascular end point comprising recurrent stroke, myocardial infarction, aortic aneurysm rupture, systemic embolism, or sudden cardiac death. We performed Kaplan-Meier analyses to estimate cumulative probabilities of outcomes by stroke type and Cox-regression to investigate whether stroke type was outcome predictor. RESULTS: 2731 patients were followed-up for a mean of 30.5±24.1months. There were 73 (26.5%) deaths, 60 (21.8%) recurrences, and 78 (28.4%) composite cardiovascular end points in the 275 ESUS patients. The cumulative probability of survival in ESUS was 65.6% (95% confidence intervals [CI], 58.9%-72.2%), significantly higher compared with cardioembolic stroke (38.8%, 95% CI, 34.9%-42.7%). The cumulative probability of stroke recurrence in ESUS was 29.0% (95% CI, 22.3%-35.7%), similar to cardioembolic strokes (26.8%, 95% CI, 22.1%-31.5%), but significantly higher compared with all types of noncardioembolic stroke. One hundred seventy-two (62.5%) ESUS patients had favorable functional outcome compared with 280 (32.2%) in cardioembolic and 303 (60.9%) in large-artery atherosclerotic. ESUS patients had similar risk of composite cardiovascular end point as all other stroke types, with the exception of lacunar strokes, which had significantly lower risk (adjusted hazard ratio, 0.70 [95% CI, 0.52-0.94]). CONCLUSIONS: Long-term mortality risk in ESUS is lower compared with cardioembolic strokes, despite similar rates of recurrence and composite cardiovascular end point. Recurrent stroke risk is higher in ESUS than in noncardioembolic strokes.