983 resultados para Clone
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La replication et lassemblage du virus de lhepatite C (VHC) sont regules finement dans le temps et lespace par les interactions proteiques entre le virus avec lhote. La comprehension de la biologie du virus ainsi que sa pathogenicite passe par les connaissances relatives aux interactions virus/hote. Afin didentifier ces interactions, nous avons exploite une approche dimmunoprecipitation (IP) couplee a une detection par spectrometrie de masse (MS), pour ensuite evaluer le role des proteines identifiees dans le cycle viral par une technique de silencage genique. Les proteines virales Core, NS2, NS3/4A, NS4B, NS5A et NS5B ont ete exprimees individuellement dans les cellules humaines 293T et immunoprecipitees afin disoler des complexes proteiques qui ont ete soumis a lanalyse MS. Ainsi, 98 proteines de lhote ont ete identifiees avec un enrichissement significatif et illustrant une specificite dinteraction. Lenrichissement de proteines connues dans la litterature a demontre la force de lapproche, ainsi que la validation de 6 nouvelles interactions virus/hote. Enfin, le role de ces interactants sur la replication virale a ete evalue dans un criblage genomique par ARN interferant (ARNi). Deux systemes rapporteurs de la replication virale ont ete utilises : le systeme de replicon sous-genomique (Huh7-Con1-Fluc) et le systeme infectieux (J6/JFH-1/p7Rluc2a), ainsi quun essai de toxicite cellulaire (Alamar Blue). Parmi les proteines de lhote interagissant avec le VHC, 28 proteines ont demontre un effet significatif sans effet de toxicite cellulaire, suggerant fortement un role dans la replication du VHC. Globalement, letude a mene a lidentification de nouvelles interactions virus/hote et lidentification de nouvelles cibles therapeutiques potentielles.
Derivation de cellules souches pluripotentes induites autologues a partir du clonage somatique equin
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Le recours aux cellules souches pour ameliorer la reparation et guerison des blessures et maladies musculosquelettiques chez le cheval est de plus en plus frequent. Les developpements recents dans la reprogrammation cellulaire ont permis le developpement de nouvelles sources de cellules souches pour ces therapies regeneratives. Des cellules souches pluripotentes induites (iPS) autologues peuvent etre derivees de cellules adultes par la reprogrammation directe a travers l'expression induite des genes de pluripotence. Le clonage par transfert nucleaire (SCNT) suivi de la derivation de cellules souches embryonnaires (ES) permet la reprogrammation indirecte des cellules adultes. Cependant, lefficacite de ces deux methodes pour la derivation de cellules pluripotentes genetiquement stables est faible. Nous avons donc combine les techniques SCNT et iPS dans le but de developper un protocole efficace de derivation de cellules iPS autologues a partir de fibroblastes de la peau equine. Quatre facteurs de reprogrammation ont ete introduits dans les cellules fibroblastes de ftus clones (ntFF) ainsi que les cellules ES provenant dembryons clones (ntES) pour induire leur reprogrammation en cellules iPS autologues. Les cellules ntFF-iPS et ntES-iPS ont des capacites proliferatives avancees et expriment des marqueurs de pluripotence importants. Par contre, les cellules ntES ont une efficacite de reprogrammation significativement superieure aux cellules nt-FF et forment des colonies trois fois plus rapidement. Contrairement aux cellules ntES, les cellules ntES-iPS demontrent une augmentation de lexpression des marqueurs de pluripotence et survivent a la culture cellulaire prolongee. Les resultats presentes dans ce memoire attestent que lutilisation de la reprogrammation secondaire de cellules FF et ES clonees permet la production de cellules souches pluripotentes autologues stables chez le cheval.
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Les cellules souches ont attir lattention du public ces dernires annes, grce non-seulement leur utilisation comme thrapies visant sattaquer certains types de cancers, mais aussi en relation avec leur potentiel dans le domaine de la mdecine regnrative. Il est tabli que le destin cellulaire des cellules souches embryonnaires (ESC) est rgul de faon intensive par un groupe de facteur cls agissant sur leur pluripotence. Il est nanmoins envisageable que certains dterminants influenant lauto-renouvellement et la diffrenciation de ces cellules soient toujours inconnus. Afin de tester cette hypothse, nous avons gnr, en utilisant une mthode par infections virales, une collection de ESC contenant des dltions chromosomales chevauchantes que nous avons baptise DelES (Deletion in ES cells). Cette librairie contient plus de 1000 clones indpendants dont les rgions dltes couvrent environ 25% du gnome murin. laide de cette ressource, nous avons conduit un criblage de formation de corps embryodes (EB), dmontrant que plusieurs clones dlts avaient un phnotype de diffrenciation anormal. Nos tudes de complmentation sur un groupe de clones ont par la suite permis lidentification de Rps14 - un gne codant pour une protine ribosomale (RP) comme tant haploinsuffisant pour la formation de EB. Dans un deuxime temps, lanalyse approfondie des rsultats de notre crible a permis didentifier un groupe de gnes codants pour des RP qui semblent essentiels pour la diffrenciation des ESC, mais dispensables pour leur auto-renouvellement. De manire intressante, les phnotypes anormaux de formation en EB les plus marqus sont associs des dltions de RP qui se retrouvent au site de sortie des ARN messagers (ARNm) du ribosome, soit Rps5, Rps14 et Rps28. tonnament, alors quun dbalancement des RP conduit gnralement une rponse de type p53, lhaploinsuffisance de ces trois gnes ne peut tre renverse par une simple rduction des niveaux dexpression de ce gne suppresseur de tumeurs. Finalement, nos tudes de profilage polysomal et de squenage haut-dbit montrent une signature spcifique de gnes lis au msoderme chez un clone htrozygote pour Rps5, suggrant ainsi une explication au phnotype de diffrenciation p53-indpendant identifi chez ces ESC. Nos travaux rapportent donc la cration dune ressource intressante de gnomique fonctionnelle qui a permis de mettre jour le rle essentiel que jouent les RP dans le processus de formation de EB. Nos rsultats permettent aussi de documenter une rponse p53-indpendante suite un dbalancement de RP dans un contexte opposant lauto-renouvellement et la diffrenciation des ESC.
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La prvalence des allergies alimentaires IgE-mdies aurait tripl au cours de la dernire dcennie avec des tudes Nord-Amricaines atteignant les 8% chez les enfants. Quoiquil ny ait ce jour aucun traitement curatif pour les allergies alimentaires, limmunothrapie oral (OIT) constitue une nouvelle approche exprimentale prometteuse. Cette dernire consiste en ladministration de doses progressive dallergnes par voie orale sur une priode prolonge dans le but dinstaurer un tat de dsensibilisation et possiblement une tolrance orale soutenue. Cette approche a t dmontre scuritaire et permettrait la dsensibilisation haute dose de plus de 80% des participants allergiques aux arachides, lait ou ufs. Dans cette thse, nous prsentons 2 tudes de phase 1 portant sur des protocoles dOIT, destins optimiser lefficience du traitement chez les sujets avec allergies alimentaires multiples. Prs de 30% des enfants avec allergie alimentaire sont allergiques plus dun aliment, une proportion qui augmente 70% lorsquon considre les cas les plus svres. Ces enfants sont risque augment de ractions accidentelles et souffrent dun impact plus grand sur leur qualit de vie. Dans la premire tude, en crant un mlange individualis avec un ratio stochiomtrique 1:1 entre les protines des aliments allergiques de lenfant, nous dmontrons quil est possible de dsensibiliser jusqu 5 aliments simultanment avec un profil dinnocuit similaire une monothrapie. Dans la seconde tude, nous utilisons un traitement lomalizumab, un anticorps monoclonal anti-IgE, pour permettre une dsensibilisation orale multi-allergnique fortement acclre. Lorsque compar lapproche sans omalizumab, ce protocole sassocie une nette diminution du temps requis pour atteindre les doses dentretien, passant dune mdiane de 21 4 mois, sans affecter le profil dinnocuit. Alors que ces tudes fournissent des approches cliniques raisonnables pour dsensibiliser la population multi-allergique, plusieurs questions persistent, notamment en ce qui a trait linduction de tolrance permanente. Une barrire majeure cet gard rside dans notre pitre comprhension des mcanismes sous-jacents limmunothrapie. Prenant avantage dchantillons cliniques bien caractriss provenant des essais cliniques ci-haut mentionns, nous utilisons les nouvelles technologies de squenage TCR pour suivre la distribution clonale des lymphocytes T spcifiques aux arachides durant une immunothrapie orale. Nous dmontrons que lOIT sassocie des changements significatifs dans les frquences des clones spcifiques, suggrant un processus dpuisement clonal et de remplacement. Nous dmontrons par ailleurs que le test de prolifration lymphocytaire, traditionnellement utilis pour valuer la rponse cellulaire allergique, est domin par une distribution polyclonale hautement non-spcifique. Cette observation a des implications majeures considrant que la plupart de la littrature actuelle sur la rponse T se base sur cette technique. En somme, cette thse jette les bases pour des programmes de recherche translationnelle pour optimiser et personnaliser les protocoles cliniques actuels et dvelopper de nouvelles avenues dinvestigation et de traitement pour amliorer la prise en charge des sujets avec allergies alimentaires.
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Hevea latex is a natural biological liquid of very complex composition .Besides rubber hydrocarbons,it contains many proteinous and resinous substances,carbohydrates,inorganic matter,water,and others.The Dry Rubber Content (DRC) of latex varies according to season, tapping system,weather,soil conditions ,clone,age of the tree etc. The true DRC of the latex must be determined to ensure fair prices for the latex during commercial exchange.The DRC of Hevea latex is a very familiar term to all in the rubber industry.It has been the basis for incentive payments to tappers who bring in more than the daily agreed poundage of latex.It is an important parameter for rubber and latex processing industries for automation and verious decesion making processes.This thesis embodies the efforts made by me to determine the DRC of rubber latex following different analytical tools such as MIR absorption,thermal analysis.dielectric spectroscopy and NIR reflectance.The rubber industry is still Looking for a compact instrument that is accurate economical,easy to use and environment friendly.I hope the results presented in this thesis will help to realise this goal in the near future.
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Code clones are portions of source code which are similar to the original program code. The presence of code clones is considered as a bad feature of software as the maintenance of software becomes difficult due to the presence of code clones. Methods for code clone detection have gained immense significance in the last few years as they play a significant role in engineering applications such as analysis of program code, program understanding, plagiarism detection, error detection, code compaction and many more similar tasks. Despite of all these facts, several features of code clones if properly utilized can make software development process easier. In this work, we have pointed out such a feature of code clones which highlight the relevance of code clones in test sequence identification. Here program slicing is used in code clone detection. In addition, a classification of code clones is presented and the benefit of using program slicing in code clone detection is also mentioned in this work.
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Die hier vorliegende Arbeit wurde im Rahmen eines europischen Projektes mit dem Titel Improving Fraxinus (Ash) productivity for European needs by testing, selection, propagation and promotion of improved genetic resources an der Niederschsischen Forstlichen Versuchsanstalt, Abteilung Waldgenressourcen erstellt. Im Rahmen des Projektes wurden 62 Plusbume aus einem 15 Jahre alten europischen Herkunfts-/ Nachkommenschaftsversuch in den Niederschsischen Forstmtern Bovenden und Dannenberg nach den Kriterien Stammform und Wuchsleistung fr die vegetative Vermehrung ausgewhlt. Ziel dieser Arbeit war die Optimierung bestehender in vitro Protokolle sowie die Entwicklung eines bisher noch nicht existierenden Kryokonservierungsprotokolls fr in vitro Sprossspitzen. Im ersten Teil dieser Arbeit wird die Entwicklung des in vitro Protokolls fr Fraxinus excelsior dargestellt. Die Optimierung der Methoden zur Etablierung, Vermehrung und Bewurzelung erfolgte durch Versuchsreihen mit unterschiedlichen Klonen, so dass insgesamt 26 der selektierten Plusbume erfolgreich in vitro etabliert werden konnten. Achselknospen frischer Triebe der Pfropflinge der Mutterbume stellten die beste Explantatquelle dar. Die Explantate wurden mit 0,2 % Quecksilberchlorid (HgCl2) oberflchensterilisiert bevor sie auf hormonfreies Woody Plant Medium (WPM) transferiert wurden. Nach zwei Wochen erfolgte ein Transfer auf WPM mit 4 mg/l 6-Benzylaminopurine (BAP) und 0,15 mg/l Indole-3-butyric acid (IBA). Die besten Vermehrungsraten wurden auf WPM mit 4 mg/l BAP, 0,15 mg/l IBA und 0,01 mg/l TDZ und 0,7 % Agar in Honigglsern mit einem Plastikdeckel erzielt. Als Bewurzelungsmedium wurde 0,5 konzentriertes Murashige und Skoog (MS) Medium mit 2 mg/l IBA, 0,25 mg/l BAP und 0,8 % Agar verwandt. Im zweiten Teil der Arbeit werden die Versuchsreihen zur Entwicklung des Kryokonservierungsprotokolls von in vitro Sprossspitzen dargestellt. Zur Entwicklung der Methode wurden die Vorbehandlungsbedingungen verbessert und zwei Techniken, die Alginat- / Dehydrati-onsmethode und die Vitrifikationsmethode mit Hilfe der sogenannten PVS2-Lsung (Plant Vitrification solution number 2) getestet. Die optimierte PVS2-Methode erwies sich als die fr Esche besser geeignete Technik und lie sich erfolgreich zur Kryokonservierung juveniler und adulter Kulturen anwenden. Die Regenerationsraten lagen zwischen 50 und 100 % fr juvenile bzw. 50 und 80 % fr adulte Kulturen.
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Previous BAC clone analysis of the Platyrrhini owl monkey KIRs have shown an unusual genetic structure in some loci. Therefore, cDNAs encoding KIR molecules from eleven Aotus vociferans monkeys were characterized here; tenputative KIR loci were found, some of which encoded atypical proteins such as KIR4DL and transcripts predicted to encode a D0+D1 configuration (AOTVOKIR2DL1*01v1) which appear to be unique in the Aotus genus. Furthermore, alternative splicing was found as a likely mechanism for producing activator receptors in A. vociferans species. KIR proteins from New World monkeys may be split into three new lineages according to domain by domain phylogenetic analysis. Although the A. vociferans KIR family displayed a high divergence among paralogous genes, individual loci were limited in their genetic polymorphism. Selection analysis showed that both constrained and rapid evolution may operate within the AvKIR family. The frequent alternative splicing (as a likely mechanism generating activator receptors), the presence of KIR4DL and KIR2DL1 (D0+D1) molecules and other data reported here suggest that the KIR family in Aotus has had a rapid evolution, independent from its Catarrhini counterparts.from its Catarrhini counterparts.
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La butirilcolinesterasa humana (BChE; EC 3.1.1.8) es una enzima polimrfica sintetizada en el hgado y en el tejido adiposo, ampliamente distribuida en el organismo y encargada de hidrolizar algunos steres de colina como la procana, steres alifticos como el cido acetilsaliclico, frmacos como la metilprednisolona, el mivacurium y la succinilcolina y drogas de uso y/o abuso como la herona y la cocana. Es codificada por el gen BCHE (OMIM 177400), habindose identificado ms de 100 variantes, algunas no estudiadas plenamente, adems de la forma ms frecuente, llamada usual o silvestre. Diferentes polimorfismos del gen BCHE se han relacionado con la sntesis de enzimas con niveles variados de actividad cataltica. Las bases moleculares de algunas de esas variantes genticas han sido reportadas, entre las que se encuentra las variantes Atpica (A), fluoruro-resistente del tipo 1 y 2 (F-1 y F-2), silente (S), Kalow (K), James (J) y Hammersmith (H). En este estudio, en un grupo de pacientes se aplic el instrumento validado Lifetime Severity Index for Cocaine Use Disorder (LSI-C) para evaluar la gravedad del consumo de cocana a lo largo de la vida. Adems, se determinaron Polimorfismos de Nucletido Simple (SNPs) en el gen BCHE conocidos como responsables de reacciones adversas en pacientes consumidores de cocana mediante secuenciacin del gen y se predijo el efecto delos SNPs sobre la funcin y la estructura de la protena, mediante el uso de herramientas bio-informticas. El instrumento LSI-C ofreci resultados en cuatro dimensiones: consumo a lo largo de la vida, consumo reciente, dependencia psicolgica e intento de abandono del consumo. Los estudios de anlisis molecular permitieron observar dos SNPs codificantes (cSNPs) no sinnimos en el 27.3% de la muestra, c.293A>G (p.Asp98Gly) y c.1699G>A (p.Ala567Thr), localizados en los exones 2 y 4, que corresponden, desde el punto de vista funcional, a la variante Atpica (A) [dbSNP: rs1799807] y a la variante Kalow (K) [dbSNP: rs1803274] de la enzima BChE, respectivamente. Los estudios de prediccin In silico establecieron para el SNP p.Asp98Gly un carcter patognico, mientras que para el SNP p.Ala567Thr, mostraron un comportamiento neutro. El anlisis de los resultados permite proponer la existencia de una relacin entre polimorfismos o variantes genticas responsables de una baja actividad cataltica y/o baja concentracin plasmtica de la enzima BChE y algunas de las reacciones adversas ocurridas en pacientes consumidores de cocana.
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Introduccin: El incremento de la resistencia antibitica se considera un problema de salud pblica con consecuencias clnicas y econmicas, por lo tanto se determinar la prevalencia de resistencia antibitica en Infeccin del Tracto Urinario (ITU, el perfil microbiolgico y los patrones de susceptibilidad en una poblacin peditrica atendida en la Fundacin Cardioinfantil. Materiales y mtodos: Estudio observacional de corte transversal, retrospectivo, entre 1 mes a 18 aos de edad, con diagnstico de ITU comunitaria atendidos entre Enero de 2011 y Diciembre de 2013. Se excluyeron pacientes con dispositivos en la va urinaria, instrumentacin quirrgica previa, trayectos fistulosos entre la va urinaria y sistema digestivo, ITU luego de 48 horas de hospitalizacin y recada clnica en tratamiento. Se estableci la prevalencia de ITU resistente y se realiz un anlisis descriptivo de la informacin. Resultados: Se evaluaron 385 registros clnicos, con una mediana de 1.08 aos (RIQ 0.8 4.08), el 73.5% eran nias. La fiebre predomin (76.5%), seguido de emesis (32.0%), disuria (23.7%) y dolor abdominal (23.1%). El uropatgeno ms frecuente fue E.coli (75%), seguido de Proteus mirabilis (8.5%) y Klebsiella spp. (8.3%). La Ampicilina, el Trimetropim sulfametoxazol, la Ampicilina sulbactam y el cido nalidixico tuvieron mayor tasa de resistencia. La prevalencia de BLEE fue 5.2% y AmpC 3.9%. La prevalencia de resistencia antimicrobiana fue de 11.9%. Conclusiones: La E.coli es el uropatogeno ms frecuentemente aislado en ITU, con resistencia a la ampicilina en 60.2%, cefalosporinas de primera generacin en 15.5%, trimetropin sulfametoxazol en 43.9%, cefepime 4.8%. La prevalencia de resistencia antimicrobiana fue de 11.9%.
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Los solventes orgnicos son sustancias qumicas que por sus propiedades fsico-qumicas son fcilmente inhalados o absorbidos por la piel, pueden causar daos de diversa ndole en la salud. En Colombia existen normas que contemplan las medidas de proteccin, sin embargo persiste la informalidad en el sector de pintores de autos, por lo cual los trabajadores expuestos, a largo plazo pueden ver afectada su salud. En este estudio se analiz la relacin entre individuos expuestos laboralmente a los solventes orgnicos versus no expuestos con respecto a la longitud de sus telmeros y formacin de fragilidades. Se emplearon muestras de sangre extradas por venopuncin, recolectada en dos tubos: uno con Heparina, destinado al cultivo de linfocitos, para obtener cromosomas metafsicos y evaluar en ellos la presencia de fragilidades; el otro tubo con EDTA, fue empleado para la extraccin de ADN y se utiliz para obtener los valores de longitud telomrica mediante la tcnica de PCR cuantitativa. Los anlisis estadsticos se realizaron aplicando la prueba de rangos de Wilcoxon, en el caso de la presencia de fragilidades se analiz la razn No.Fragilidades/No.Metafases, aplicando el mtodo de Wilcoxon se encontr que existe diferencia estadsticamente significativa entre expuestos y no expuestos (p = 0,036), en donde los expuestos presentan mayor frecuencia de fragilidades. Por otra parte el valor relativo de longitud telomrica del grupo de expuestos fue mayor que el observado en el grupo de no expuestos, esta diferencia fue estadsticamente significativa (Wilcoxon, p = 0.002).
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Els organismes responen a la temperatura i a molts altres estressos sintetitzant un grup de protenes anomenat protenes de xoc de calor (HSPs). En plantes les sHsps, d'entre 15 i 30 kDa formen el grup ms abundant i divers, classificat en funci de la seva localitzaci subcel.lular i homologia en: mitocondrials, cloroplstiques, de reticle endoplasmtic i citoplsmiques de classe I i II. Les sHsps-CI s'ha descrit que s'indueixen per estrs trmic, hdric i oxidatiu (perxid d'hidrgen, llum UV, oz) i en resposta a algunes hormones. Tamb s'expressen durant el desenvolupament, per exemple durant l'embriognesi, on es creu que podrien tenir un paper protector de l'embri enfront la dessecaci. Tot i que hi ha abundants treballs que correlacionen la resistncia a l'estrs i l'acumulaci de sHsps-CI, els mecanismes moleculars d'aquesta activitat sn poc conguts. Tot i aix, per diverses sHsps-CI ha estat descrita una activitat xaperona in vitro i, ms recentment, que la seva sobreexpressi augmenta la viabilitat de cl.lules d'E.coli en condicions d'estrs trmic. L'estudi de l'acumulaci de sHsps-CI en surera (Quercus suber) mitjanant immunodetecci en electroforesi bidimensional mostra uns patrons d'acumulaci complexos i formats per dos grups d'espcies proteiques principals, a l'entorn dels 10 i 17 kDa respectivament, que mostren una inducci diferencial en funci del teixit i l'estrs. Mentre que les espcies proteiques de 17 kDa s'indueixen per temperatura per no per estrs oxidatiu, les de ca. 10 kDa ho fan per estrs oxidatiu i no per temperatura. Ambds grups d'espcies proteiques s'acumulen conjuntament en fel.lema. Assajos de PCR i RT-PCR han perms clonar parcialment tres noves sHsps-CI en surera: Qshsp10-CI, QshspC-CI i QshspD-CI. Aquest fet confirma la multigenecitat de les sHsps-CI en surera que apuntava el patr bidimensional. Dels nous clons obtinguts destaca especialment Qshsp10-CI, un gen que presenta un cod stop enmig del domini -cristal.l que fa que a la protena que se'n dedueix li manqui un 55% del domini -cristal.l i tota l'extensi C-terminal. Es tractaria de la sHsp ms petita i ms truncada descrita fins al moment. L'anlisi de l'expressi de Qshsp10-CI mitjanant RT-PCR mostra expressi en plantes tractades amb H2O2 per no en les que han estat sotmeses a un xoc de calor. Aprofitant l'oportunitat que oferia aquesta sHsp-CI de ser utilitzada com a model per l'estudi de la importncia del domini -cristal.l i l'extensi C-terminal en l'activitat protectora enfront l'estrs, es va voler determinar la capacitat que tenia d'augmentar la viabilitat de cl.lules d'E. coli en condicions d'estrs trmic i oxidatiu. Els resultats mostren que la protena recombinant QsHsp10-CI, tot i la important truncaci que t, s capa de protegir cl.lules d'E. coli en condicions d'estrs trmic i, remarcablement, en condicions d'estrs oxidatiu. Tots aquests resultats indiquen que les espcies proteiques de ca. 10 kDa podrien correspondre a Qshsp10-CI i tenir un paper en les cl.lules del fel.lema en la protecci enfront l'estrs oxidatiu. L'estrs oxidatiu provoca lesions al DNA que poden produir errors en la replicaci, transcripci o traducci i generar protenes aberrants. Donades les condicions d'estrs oxidatiu a les quals es troben sotmeses les cl.lules del fel.lema, s'ha volgut estudiar la variabilitat dels seus cids nucleics. La determinaci de la taxa de mutaci de la regi codificant del gen Qshsp17.4-CI en mRNA i DNA de fel.lema i pex radicular, un teixit jove i en creixement actiu va mostrar unes taxes sorprenentment elevades en l'mRNA (1/1784 pb) i el DNA genmic (1/1520 pb) del fel.lema. Aquestes taxes sn les ms altes descrites en un genoma nuclear eucariota i sn similars a les dels virus d'RNA d'evoluci rpida com el virus de l'Hepatitis C. Amb aquestes taxes de mutaci, un ter dels mRNAs del fel.lema de la surera contindrien missatges aberrants i la supervivncia de les cel.lules es veuria compromesa. Aix implica que el fel.lema hauria de ser considerat com un mosaic de cl.lules genticament heterognies i, per tant, una sola seqncia no defineix en tota la seva amplitud un gen en aquest teixit. No es va detectar cap mutaci en pex de rel. Amb l'objectiu d'aprofundir en el coneixement de les mutacions que es donen en aquests dos teixits i per tal de poder fer una anlisi qualitativa ms completa que permets especular sobre el seu origen, es va aplicar un mtode de selecci de seqncies mutants en base a la utilitzaci d'enzims de restricci. Les mutacions detectades en fel.lema es corresponen amb les relacionades, en altres sistemes no nuclears (plasmidis, fags i DNA bacteri), amb l'estrs oxidatiu. En conseqncia, l'estrs oxidatiu al qual estan sotmeses les cl.lules del fel.lema podria ser el causant de l'elevada taxa de mutaci detectada. D'acord amb aix, el tipus majoritari de productes d'oxidaci de les bases del DNA que s'acumulen en brots de plntules de surera en resposta al perxid d'hidrgen produeixen el mateix tipus de mutacions detectades en l'mRNA del fel.lema de la surera. La major sensibilitat d'aquest nou mtode ha perms, a ms, detectar mutacions en molcules d'mRNA de rel, un teixit en el qual no s'havia trobat cap mutaci utilitzant el mtode de clonatge i seqenciaci directa. Tot i aix, el tipus de mutacions predominants no estan relacionades amb l'estrs oxidatiu sin amb erros en la reparaci dels cids nucleics.
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The incidence-severity relationship for cashew gummosis, caused by Lasiodiplodia theobromae, was studied to determine the feasibility of using disease incidence to estimate indirectly disease severity in order to establish the potential damage caused by this disease in semiarid north-eastern Brazil. Epidemics were monitored in two cashew orchards, from 1995 to 1998 in an experimental field composed of 28 dwarf clones, and from 2000 to 2002 in a commercial orchard of a single clone. The two sites were located 10 km from each other. Logarithmic transformation achieved the best linear adjustment of incidence and severity data as determined by coefficients of determination for place, age and pooled data. A very high correlation between incidence and severity was found in both fields, with different disease pressures, different cashew genotypes, different ages and at several epidemic stages. Thus, the easily assessed gummosis incidence could be used to estimate gummosis severity levels.
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White or Guinea yam (Dioscorea rotundata), grown for its underground tubers, is an important food in West Africa. Progress in yam breeding is constrained by variable flowering behaviour, making hybridization difficult. Yam clones may be dioecious, monoecious or hermaphrodite with variable sex ratios. The proportion of plants that flower and the flowering intensity also vary with season and location. The objective of the present work was to investigate whether variation in flowering behaviour was related to factors determining rate of development (photoperiod and temperature through sowing date, location and year) or growth (cumulative solar radiation and temperature). Sex ratios, the proportion of plants that had flower buds and open flowers, and the number of flowers or spikes was recorded in one male (TDr 131) and one female (TDr 99-9) clone of white yam grown in the field in Nigeria at three locations and at different sowing dates. Clone TDr 131 was uniformly male flowering, while clone TDr 99-9 exhibited a number of sex types with gynoecious, monoecious and trimonoecious plants observed. The proportion of flowering plants was low in both clones, averaging 0.34 in clone TDr 131 and 0.13 in clone TDr 99-9. Day of vine emergence had a significant and contrasting effect on the proportion of flowering plants and on flowering intensity in the two clones. In clone TDr 131, the proportion of flowering plants and flowering intensity declined with later vine emergence at all locations (r=0.43-0.53, P<0.05), whereas in clone TDr 99-9 the proportion of flowering plants increased with later emergence (r=0.46, P<0.01). In clone TDr 131, this response was strongly associated with warmer temperatures (r=0.49-0.50; P<0.05) and greater cumulative radiation (r=0.85-0.93; P<0.001) between vine emergence and flowering, rather than photoperiod at vine emergence. This suggests that flowering behaviour in the male clone TDr 131 is strongly influenced by factors that affect growth rather than development. Clone TDr 99-9, on the other hand, exhibited no clear relations between flowering and growth or developmental factors, though the proportion of flowering plants and flowering intensity was greatest at planting dates close to the longest day and at temperatures of 25-26 degrees C. This might suggest that flowering behaviour in clone TDr 99-9 is controlled by photothermal responses.
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Tuber dormancy enables yams to survive in the ground during the dry season and post-harvest storage. Three clones of Dioscorea rotundata were harvested after five intervals and then stored in a cooler (20.6C) or at ambient temperature (27.8C). The time from harvest to sprouting was shorter as harvest was delayed. The period from sowing to sprouting for each clone was similar for tubers harvested from 140 days after planting, but tubers harvested earlier took longer to sprout. The cooler temperature delayed sprouting. Tubers of two clones sprouted after only 70 days of crop growth. If the dormancy period of these young tubers can be broken, the generation time of yam crop improvement programmes could be considerably reduced.
