Automatic prostate segmentation in cone-beam computed tomography images using rigid registration.

We propose to evaluate automatic three-dimensional gray-value rigid registration (RR) methods for prostate localization on cone-beam computed tomography (CBCT) scans. In total, 103 CBCT scans of 9 prostate patients have been analyzed. Each one was registered to the planning CT scan using different methods: (a) global RR, (b) pelvis bone structure RR, (c) bone RR refined by local soft-tissue RR using the CT clinical target volume (CTV) expanded with a 1, 3, 5, 8, 10, 12, 15 or 20-mm margin. To evaluate results, a radiation oncologist was asked to manually delineate the CTV on the CBCT scans. The Dice coefficients between each automatic CBCT segmentation - derived from the transformation of the manual CT segmentation - and the manual CBCT segmentation were calculated. Global or bone CT/CBCT RR has been shown to yield insufficient results in average. Local RR with an 8-mm margin around the CTV after bone RR was found to be the best candidate for systematically significantly improving prostate localization.

Crescimento e esporulação de isolados de Verticillium lecanii sob diferentes condições nutricionais

O objetivo deste trabalho foi determinar as melhores condições de crescimento e esporulação de dois isolados de Verticillium lecanii (Zimm.) Viégas, cultivados em vários meios de cultura, fontes de C, fontes orgânicas e inorgânicas de N e relações C:N. Após 20 dias de cultivo, BDA e Meio Completo mostraram ser os melhores meios de cultura, e a lactose e o amido foram as fontes de C que mais favoreceram o crescimento dos isolados JAB 02 e JAB 45, respectivamente; baixa esporulação foi apresentada por JAB 02, enquanto JAB 45 obteve boa esporulação em glicose e maltose. JAB 02 desenvolveu melhor quando a fonte orgânica de N era casitona; JAB 45 obteve bom desenvolvimento em presença de casitona e peptona, mas houve pouca esporulação em presença de triptona e caseína hidrolisada. As fontes inorgânicas de N que favoreceram o melhor desenvolvimento dos isolados foram (NH4)2HPO4 e NaNO3, porém, JAB 02 apresentou baixa esporulação. Entre as relações C:N analisadas, JAB 02 obteve melhor crescimento na relação 60:1 e JAB 45 nas relações 5:1, 10:1 e 20:1; baixa esporulação foi obtida por JAB 02 nas relações testadas, mas não se verificou efeito da relação C:N do meio sobre a esporulação dos isolados.

Chronic low-frequency rTMS of primary motor cortex diminishes exercise training-induced gains in maximal voluntary force in humans.

Although there is consensus that the central nervous system mediates the increases in maximal voluntary force (maximal voluntary contraction, MVC) produced by resistance exercise, the involvement of the primary motor cortex (M1) in these processes remains controversial. We hypothesized that 1-Hz repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) of M1 during resistance training would diminish strength gains. Forty subjects were divided equally into five groups. Subjects voluntarily (Vol) abducted the first dorsal interosseus (FDI) (5 bouts x 10 repetitions, 10 sessions, 4 wk) at 70-80% MVC. Another group also exercised but in the 1-min-long interbout rest intervals they received rTMS [Vol+rTMS, 1 Hz, FDI motor area, 300 pulses/session, 120% of the resting motor threshold (rMT)]. The third group also exercised and received sham rTMS (Vol+Sham). The fourth group received only rTMS (rTMS_only). The 37.5% and 33.3% gains in MVC in Vol and Vol+Sham groups, respectively, were greater (P = 0.001) than the 18.9% gain in Vol+rTMS, 1.9% in rTMS_only, and 2.6% in unexercised control subjects who received no stimulation. Acutely, within sessions 5 and 10, single-pulse TMS revealed that motor-evoked potential size and recruitment curve slopes were reduced in Vol+rTMS and rTMS_only groups and accumulated to chronic reductions by session 10. There were no changes in rMT, maximum compound action potential amplitude (M(max)), and peripherally evoked twitch forces in the trained FDI and the untrained abductor digiti minimi. Although contributions from spinal sources cannot be excluded, the data suggest that M1 may play a role in mediating neural adaptations to strength training.

Further ultrastructural evidence that spirochaetes may play a role in the aetiology of Alzheimer's disease

Recently it was reported that, at autopsy, in neuropathologically confirmed cases of Alzheimer's disease spirochaetes were found in blood and cerebrospinal fluid using dark-field microscopy. Moreover, the spirochaetes were isolated and cultured from brain tissue. We now show, using scanning electron microscopy and atomic force microscopy that the helically shaped microorganisms isolated and cultured from the Alzheimer brains possess axial filaments. This indicates that these microorganisms taxonomically indeed belong to the order Spirochaetales. A morphometric analysis reinforces this notion.

Une méta-analyse GWA de la glycémie après 2h d'HGPO révèle que GIPR est associé avec la sécrétion de l'insuline en réponse au glucose et que l'ADCY5 est un nouveau gène de suseptibilité au diabète de type 2. [A meta-analysis of GWA blood glucose after 2 h of OGTT revealed that GIPR is associated with the secretion of insulin based on glucose and ADCY5 is a new susceptibility gene for type 2 diabetes.]

Introduction: Les études GVvA (Genome-wide association ,-studies) ont identifié et confirmé plus de 20 gènes de susceptibilité au DT2 et ont contribué à mieux comprendre sa physiopathologie. L'hyperglycémie à jeun (GJ), et 2 heures après une HGPO (G2h) sont les deux mesures cliniques du diagnostic du DT2. Nous avons identifié récemment la G6P du pancréas (G6PC2) comme déterminant de la variabilité physiologique de la GJ puis Ie récepteur à la mélatonine (MTNRIB) qui de plus lie la régulation du rythme circadien au DT2. Dans ce travail nous avons étudié la génétique de la G2h à l'aide de l'approche GWA. Résultats: Nous avons réalisé une méta-analyse GWA dans le cadre de MAGIC (Meta-Analysis of Glucose and Insulin related traits Consortium) qui a inclus 9 études GWA (N=15'234). La réplication de 29 loci (N=6958-30 121, P < 10-5 ) a confirmé 5 nouveaux loci; 2 étant connus comme associés avec Ie DT2 (TCF7L2, P = 1,6 X 10-10 ) et la GJ (GCKR, p = 5,6 X 10-10 ); alors que GIPR (p= 5,2 X 10-12), VSP13C (p= 3,9 X 10-8) et ADCY5 (p = 1,11 X 10-15 ) sont inédits. GIPR code Ie récepteur au GIP (gastric inhibitory polypeptide) qui est sécrété par les ceIlules intestinales pour stimuler la sécrétion de l'insuline en réponse au glucose (l'effet incrétine). Les porteurs du variant GIPR qui augmente la G2h ont également un indice insulinogénique plus bas, (p= 1,0 X 10-17) mais ils ne présentent aucune modification de leur glycémie suite à une hyperglycémie provoquée par voie veineuse (p= 0,21). Ces résultats soutiennent un effet incrétine du locus GIPR qui expliquerait ~9,6 % de la variance total de ce trait. La biologie de ADCY5 et VPS13C et son lien avec l'homéostasie du glucose restent à élucider. GIPR n'est pas associé avec le risque de DT2 indiquant qu'il influence la variabilité physiologique de la G2h alors que le locus ADCY5 est associé avec le DT2 (OR = 1,11, P = 1,5 X 10-15). Conclusion: Notre étude démontre que l'étude de la G2h est une approche efficace d'une part pour la compréhension de la base génétique de la physiologie de ce trait clinique important et d'autre part pour identifier de nouveaux gènes de susceptibilité au DT2.

Meta-analysis identifies multiple loci associated with kidney function-related traits in east Asian populations.

Chronic kidney disease (CKD), impairment of kidney function, is a serious public health problem, and the assessment of genetic factors influencing kidney function has substantial clinical relevance. Here, we report a meta-analysis of genome-wide association studies for kidney function-related traits, including 71,149 east Asian individuals from 18 studies in 11 population-, hospital- or family-based cohorts, conducted as part of the Asian Genetic Epidemiology Network (AGEN). Our meta-analysis identified 17 loci newly associated with kidney function-related traits, including the concentrations of blood urea nitrogen, uric acid and serum creatinine and estimated glomerular filtration rate based on serum creatinine levels (eGFRcrea) (P < 5.0 × 10(-8)). We further examined these loci with in silico replication in individuals of European ancestry from the KidneyGen, CKDGen and GUGC consortia, including a combined total of ∼110,347 individuals. We identify pleiotropic associations among these loci with kidney function-related traits and risk of CKD. These findings provide new insights into the genetics of kidney function.

Resposta de duas cultivares de arroz a doses de zinco aplicado como oxissulfato

O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de doses de Zn, aplicado como oxissulfato, nas formas granulada e em pó, em duas cultivares de arroz. O experimento foi realizado em casa de vegetação em vasos com 3 dm³ de um Latossolo Vermelho distrófico. Todos os vasos receberam calcário, macronutrientes e micronutrientes, com exceção do zinco. Foram aplicadas as doses de 0, 1, 2, 5 e 10 mg de Zn por dm³ de solo. A dose de 4 mg dm-3 de Zn aplicado como sulfato foi usada como padrão de referência. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado com quatro repetições. O oxissulfato em pó na cultivar IAC 165 e granular na IAC 202 possibilitaram produções de grãos semelhantes às obtidas com o sulfato de zinco. Houve diferença nos teores de Zn nas folhas e colmos das duas cultivares associados à maior produção de grãos. A cultivar IAC 202 foi mais eficiente na utilização de Zn no crescimento vegetativo e na produção de grãos. Os teores de Zn extraídos por Mehlich 1 e DTPA correlacionaram-se significativamente com as doses de Zn aplicadas e com os níveis de Zn no tecido vegetal. Houve correlação significativa entre os dois extratores em relação às doses de Zn aplicadas no solo.

Efeito de escória de alto forno no crescimento radicular e na produtividade de arroz

A utilização agrícola de resíduos industriais como fertilizantes decorre da necessidade de diminuir o efeito nocivo do acúmulo de nutrientes nos centros de produção. O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de escória de alto forno no crescimento radicular e na produtividade do arroz de terras altas irrigado por aspersão. O experimento foi realizado no campo, adotando-se o delineamento experimental de blocos casualizados, com cinco doses de escória de alto forno (0, 2.550, 5.100, 10.200 e 15.300 kg ha-1) com quatro repetições. A utilização de escória melhorou a condição química do solo, aumentou o crescimento e a superfície radicular, diminuiu o diâmetro das raízes e elevou os teores de silício no solo e na planta, resultando em aumento da produtividade.

2009 Cancer in Iowa Report: Data Sources, 2009

Cancer is a reportable disease as stated in the Iowa Administrative Code. Cancer data are collected by the State Health Registry of Iowa, located at The University of Iowa in the College of Public Health’s Department of Epidemiology. The staff includes more than 50 people. Half of them, situated throughout the state, regularly visit hospitals, clinics, and medical laboratories in Iowa and neighboring states to collect cancer data. A follow-up program tracks more than 99 percent of the cancer survivors diagnosed since 1973. This program provides regular updates for follow-up and survival. The Registry maintains the confidentiality of the patients, physicians, and hospitals providing data. In 2009 data will be collected on an estimated 16,000 new cancers among Iowa residents. In situ cases of bladder cancer are included in the estimates for bladder cancer, to be in agreement with the definition of reportable cases of the Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program of the National Cancer Institute. Since 1973 the Iowa Registry has been funded primarily by the SEER Program of the National Cancer Institute. Iowa represents rural and Midwestern populations and provides data included in many National Cancer Institute publications. Beginning in 1990 between 5 and 10 percent of the Registry’s annual operating budget has been provided by the state of Iowa. Beginning in 2003, the University of Iowa has been providing cost-sharing funds. The Registry also receives funding through grants and contracts with university, state, and national researchers investigating cancer-related topics.

Desempenho de tambaqui cultivado em tanques-rede, em lago de várzea, sob diferentes taxas de alimentação

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da taxa de alimentação de 5%, 7,5% e 10% do peso vivo dia-1, sobre o desempenho e parâmetros metabólicos de tambaqui, Colossoma macropomum, cultivado em tanques-rede instalados em lago de várzea. Animais que receberam a taxa de alimentação de 5% do peso vivo dia-1, foram os que apresentaram melhor conversão alimentar e após 90 dias de cultivo e valores de proteínas totais plasmáticas significativamente mais baixos. O fornecimento de ração para juvenis de tambaqui, na taxa de 5% do peso vivo dia-1, sob condições de lagos de várzea, permite um desempenho satisfatório da espécie.

Copies de lettres

Registres manuscrits de copies de lettres. - Les intitulés sont repris des pièces de titre de chaque volume. - N° 1 : Livre N° 5/1 (23 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 6 janvier 1840 / Terminé le 15 novembre 1844 (277 p., avec registre). - N° 2 : Livre N° 5/2 (25 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 15 novembre 1844 / Terminé le 21 septembre 1848, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (332 p., [22] f.. - N° 3 : Livre N° 5/3 : Copie de lettres. Commencé le 24 octobre 1848 / Terminé le 28 novembre 1851, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (344 p.), [24] f.. - N° 4 : Lettres / 28 novembre 1851 - 10 septembre 1855 ([251] f.). - N° 5 : Lettres / 10 septembre 1855 - 13 janvier 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants) (451 p.), [18] f.. - N° 6 : Lettres / 13 janvier 1859 / 26 decembre 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants), 448 p. , [20] f.

Copies de lettres

Registres manuscrits de copies de lettres. - Les intitulés sont repris des pièces de titre de chaque volume. - N° 1 : Livre N° 5/1 (23 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 6 janvier 1840 / Terminé le 15 novembre 1844 (277 p., avec registre). - N° 2 : Livre N° 5/2 (25 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 15 novembre 1844 / Terminé le 21 septembre 1848, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (332 p., [22] f.. - N° 3 : Livre N° 5/3 : Copie de lettres. Commencé le 24 octobre 1848 / Terminé le 28 novembre 1851, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (344 p.), [24] f.. - N° 4 : Lettres / 28 novembre 1851 - 10 septembre 1855 ([251] f.). - N° 5 : Lettres / 10 septembre 1855 - 13 janvier 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants) (451 p.), [18] f.. - N° 6 : Lettres / 13 janvier 1859 / 26 decembre 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants), 448 p. , [20] f.

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Registres manuscrits de copies de lettres. - Les intitulés sont repris des pièces de titre de chaque volume. - N° 1 : Livre N° 5/1 (23 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 6 janvier 1840 / Terminé le 15 novembre 1844 (277 p., avec registre). - N° 2 : Livre N° 5/2 (25 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 15 novembre 1844 / Terminé le 21 septembre 1848, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (332 p., [22] f.. - N° 3 : Livre N° 5/3 : Copie de lettres. Commencé le 24 octobre 1848 / Terminé le 28 novembre 1851, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (344 p.), [24] f.. - N° 4 : Lettres / 28 novembre 1851 - 10 septembre 1855 ([251] f.). - N° 5 : Lettres / 10 septembre 1855 - 13 janvier 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants) (451 p.), [18] f.. - N° 6 : Lettres / 13 janvier 1859 / 26 decembre 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants), 448 p. , [20] f.

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Registres manuscrits de copies de lettres. - Les intitulés sont repris des pièces de titre de chaque volume. - N° 1 : Livre N° 5/1 (23 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 6 janvier 1840 / Terminé le 15 novembre 1844 (277 p., avec registre). - N° 2 : Livre N° 5/2 (25 d'archives) : Copie de lettres. Commencé le 15 novembre 1844 / Terminé le 21 septembre 1848, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (332 p., [22] f.. - N° 3 : Livre N° 5/3 : Copie de lettres. Commencé le 24 octobre 1848 / Terminé le 28 novembre 1851, suivi du répertoire alphabétique des correspondants (344 p.), [24] f.. - N° 4 : Lettres / 28 novembre 1851 - 10 septembre 1855 ([251] f.). - N° 5 : Lettres / 10 septembre 1855 - 13 janvier 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants) (451 p.), [18] f.. - N° 6 : Lettres / 13 janvier 1859 / 26 decembre 1859 (suivi du répertoire alphabétique des correspondants), 448 p. , [20] f.