Avaliação dos Processos de Software utilizando CMMI

Atualmente, as empresas distinguem-se das demais pelos produtos e serviços fornecidos com qualidade e dentro dos prazos estabelecidos. Uma empresa de desenvolvimento de software não foge a essa regra e para isso os processos envolvidos nas diversas fases de levantamento, desenvolvimento, implementação e suporte devem estar documentados, ser do conhecimento geral da Organização e colocados em prática diariamente nas diversas atividades dos colaboradores. Para isso deve contribuir uma melhoria contínua desses mesmos processos. O CMMI-DEV, Capability Maturity Model Integration for Development, possibilita a introdução de boas práticas nas diversas áreas do processo de desenvolvimento de software, mas também a avaliação dessas áreas e respetiva identificação de aspetos a necessitarem de ser melhorados ou até disseminados por toda a organização. Este trabalho envolveu efetuar uma análise teórica do CMMI-DEV e sua posterior utilização prática num ambiente de trabalho empresarial para avaliação dos processos dessa empresa. Para a concretização deste segundo aspeto, foi elaborado um questionário para avaliar os processos de uma organização, segundo o modelo CMMI-DEV 1.3, avaliada a facilidade de utilização do questionário de avaliação dos processos por parte dos inquiridos. Foi realizada ainda uma análise aos resultados obtidos nos referidos questionários.

Canine visceral leishmaniasis: study of methods for the detection of IgG in serum and eluate samples

The Brazilian Ministry of Health recommends the culling and euthanasia of dogs with a positive serological test for canine visceral leishmaniasis (CVL). In the Municipality of Rio de Janeiro, the technique used for the diagnosis of CVL is the indirect fluorescent antibody test (IFAT), using blood samples eluted on filter paper (eluate). A dog survey was conducted over a period of one year in the region of Carapiá, in order to evaluate the diagnosis of CVL in this region. All animals underwent clinical examination, and blood samples (serum and eluate) were collected for analysis by enzyme immunoassay (ELISA) and IFAT. A skin biopsy was obtained for parasitological examination (culture). A total of 305 animals were studied and Leishmania chagasi was isolated from nine animals. Sensitivity and specificity were 100% and 96.6% for ELISA, respectively, 100% and 65.5% for IFAT (cut-off at a 1:40 dilution), 100% and 83.4% for IFAT (cut-off at a 1:80 dilution), and 22.2% and 97.0% for eluate IFAT. In conclusion, ELISA was the best tool for the diagnosis of CVL among the serological techniques tested. The present results suggest the need for a better evaluation of filter paper IFAT as the only diagnostic method for CVL in the Municipality of Rio de Janeiro.

C4d Detection in Renal Allograft Biopsies: Immunohistochemistry vs. Immunofluorescence

Introduction. Peritubular capillary complement 4d staining is one of the criteria for the diagnosis of antibody-mediated rejection, and research into this is essential to kidney allograft evaluation. The immunofluorescence technique applied to frozen sections is the present gold-standard method for complement 4d staining and is used routinely in our laboratory. The immunohistochemistry technique applied to paraffin-embedded tissue may be used when no frozen tissue is available. Material and Methods. The aim of this study is to evaluate the sensitivity and specificity of immunohistochemistry compared with immunofluorescence. We describe the advantages and disadvantages of the immunohistochemistry vs. the immunofluorescence technique. For this purpose complement 4d staining was performed retrospectively by the two methods in indication biopsies (n=143) and graded using the Banff 07 classification. Results. There was total classification agreement between methods in 87.4% (125/143) of cases. However, immunohistochemistry staining caused more difficulties in interpretation, due to nonspecific staining in tubular cells and surrounding interstitium. All cases negative by immunofluorescence were also negative by immunohistochemistry. The biopsies were classified as positive in 44.7% (64/143) of cases performed by immunofluorescence vs. 36.4% (52/143) performed by immunohistochemistry. Fewer biopsies were classified as positive diffuse in the immunohistochemistry group(25.1% vs. 31.4%) and more as positive focal (13.2% vs. 11.1%). More cases were classified as negative by immunohistochemistry (63.6% vs. 55.2%). Study by ROC curve showed immunohistochemistry has a specificity of 100% and a sensitivity of 81.2% in relation to immunofluorescence (AUC: 0.906; 95% confidence interval: 0.846-0.949; p=0.0001). Conclusions. The immunohistochemistry method presents an excellent specificity but lower sensitivity to C4d detection in allograft dysfunction. The evaluation is more difficult, requiring a more experienced observer than the immunofluorescence method. Based on these results, we conclude that the immunohistochemistry technique can safely be used when immunofluorescence is not available.

Adenovirus respiratory infection: significant increase in diagnosis using PCR comparing with antigen detection and culture methods

Adenovirus (AdV) respiratory infections are usually described as being associated with high mortality rates. Laboratory diagnosis is essential for the establishment of the appropriate therapy, and for guiding the implementation of preventive measures in order to prevent the spread of the infection. Aiming to analyze the sensitivity and specificity of the laboratorial diagnosis methods available, we compared antigen detection by indirect immunofluorescence assay (IF), and a specific nested polymerase chain reaction (PCR), to detect AdV in respiratory samples collected from patients admitted to hospital with acute respiratory disease. Positive samples were inoculated into a cell culture to confirm the results. We analyzed 381 samples from the nasopharyngeal aspirates collected during the year 2008; of these, 2.6% tested were positive for adenovirus through IF and 10% through PCR; positive isolation was obtained in 40% and 26% of these cases, respectively. Most infected patients were children under six months of age, and despite of the fact that a significant number of patients required intensive care, the mortality rate was low (5%). In conclusion, molecular methods were found to be useful for rapid diagnosis of adenovirus infections with higher sensitivity than antigen detection; their introduction permitted a significant increase in diagnoses of adenovirus infections.

Análise energética do corpo central do edifício do DEMI-UNL através do software EnergyPlus: modelo de simulação dinâmica multizona à luz do RSECE-Energia

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Mecânica

Ensinar ciências a alunos com incapacidade intelectual recorrendo ao software Scratch: um estudo de caso

Este estudo procura a valorização do ensino dirigido a alunos com Incapacidade Intelectual. Tem como objetivos conceber um recurso didático, integrando as ferramentas do Scratch, para alunos com Incapacidade Intelectual; averiguar a exequibilidade do uso desse recurso em ambiente natural de ensino e promover o envolvimento de alunos com Incapacidade Intelectual na realização de tarefas propostas na disciplina de Ciências da Natureza. Pretendemos dar resposta às seguintes questões de investigação: (1) A utilização do Scratch é adequada e exequível no trabalho quotidiano de alunos com Incapacidade Intelectual? (2) Em que medida o Scratch pode contribuir para um melhor envolvimento dos alunos com Incapacidade Intelectual na realização das tarefas propostas? Para este efeito, planificamos duas aulas. Na primeira, abordou-se o conteúdo a tratar – Poluição – e na segunda aula utilizou-se o Scratch, desafiando os alunos a desenvolverem diversas tarefas de forma mais ativa. O presente estudo segue uma abordagem metodológica de natureza qualitativa, centrando-se num estudo de caso, onde se aborda a importância do uso das Tecnologias de Informação e Comunicação, mais concretamente o software educativo Scratch, como sendo uma ferramenta potenciadora do envolvimento dos alunos. Este estudo foi aplicado a três alunos com Incapacidade Intelectual que tinham sido atribuídos à docente investigadora no presente ano letivo. Os dados foram recolhidos através da análise dos Programas Educativos Individuais dos alunos participantes; da entrevista realizada à docente de Educação Especial; de gravações áudio, de fotografias, de trabalhos realizados pelos alunos participantes e de notas de campo da investigadora. Foi centralidade do estudo a conceção de uma proposta didática e o desenvolvimento dos respetivos recursos, utilizando o software educativo Scratch. Quer a proposta didática quer os recursos a ela associados constituem em si mesmo parte dos resultados do trabalho desenvolvido. Os dados obtidos neste estudo permitem sustentar a ideia de que é possível trabalhar com alunos com Necessidades Educativas Especiais, nomeadamente Incapacidade Intelectual, recorrendo ao software educativo Scratch e que o uso desta ferramenta proporcionou um maior envolvimento e autonomia dos alunos nas tarefas propostas.

Utilização do software Scratch no ensino das ciências da natureza e da matemática com alunos portadores de dislexia

O estudo que apresentamos tem como objetivos de investigação contribuir para o desenvolvimento global das crianças com Necessidades Educativas Especiais, nomeadamente, portadoras de Dislexia, designadamente em aulas onde são lecionados conteúdos de Ciências da Natureza e de Matemática, e conceber um recurso didático apoiado nas TIC que seja adequado à utilização em sala de aula por alunos com dislexia. Neste sentido, o estudo foi orientado pelas seguintes questões de investigação: A utilização do Scratch é adequada e exequível no trabalho quotidiano de alunos portadores de Dislexia? e Em que medida o Scratch pode contribuir para um melhor envolvimento dos alunos portadores de Dislexia na realização das tarefas propostas? O presente trabalho segue uma metodologia de carácter qualitativo, centrando-se no estudo de caso. Tentou-se dar uma resposta à reduzida utilização do software Scratch no ensino das Ciências da Natureza e Matemática como instrumentos viáveis para uma aprendizagem de sucesso em alunos portadores de Dislexia. Este estudo foi aplicado a três alunos do 4º ano, com este diagnóstico, de um agrupamento de escolas do concelho de Viseu. Para dar resposta às questões de investigação supracitadas foram implementadas e projetadas duas atividades no software Scratch para serem desenvolvidas em duas situações formativas contextualizadas. O subdomínio que se pretendeu trabalhar foi “A importância da água para os seres vivos” articulando com o conteúdo dos volumes. Os dados foram recolhidos através da análise dos Programas Educativos Individuais de cada um dos alunos participantes, das entrevistas às docentes de Educação Especial, de gravações áudio, fotografias, trabalhos dos alunos e os registos da professora investigadora. Os resultados obtidos permitiram caracterizar o modo como os alunos, portadores de dislexia, se envolveram com o Scratch na aquisição de conhecimento. Permitiram ainda demonstrar aos professores que é possível construir atividades nesta ferramenta envolvendo conteúdos curriculares interdisciplinares.

New strategies to detect and understand genotype-by-environment interactions and QTL-by-environment interactions

Dissertação para obtenção do Grau de Doutor em Estatística e Gestão do Risco, especialidade em Estatística

Epstein Barr virus detection in cervical samples of women living with human immunodeficiency virus

Epstein Barr Virus (EBV) is transmitted commonly by saliva, but it has been found in genital secretions, which suggests sexual transmission and led researchers to connect EBV and cervical neoplasia. People living with human immunodeficiency virus (HIV) are reported to be at high risk of acquiring genital infections and cervical lesions. To verify the presence of EBV in the genital tract and/or it could affect cervical changes, we analyzed cervical smears from 85 HIV seropositive women for EBV DNA determination. EBV was only detected in two (2.3%) samples. The present study provides neither evidence for EBV as sexually transmitted infection nor discards this possibility.

O estado da arte na investigação sobre a utilização de software educativo para o ensino da matemática

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre no Ensino de Matemática no 3º ciclo do Ensino Básico e do Secundário

Use of elisa employing homologous and heterologous antigens for the detection of IgG and subclasses (IgG1 and IgG2) in the diagnosis of Canine visceral leishmaniasis

Indirect immunofluorescence is the method recommended for the diagnosis of visceral leishmanisis in dogs, however, the accuracy of this technique is low and its use on a large scale is limited. Since ELISA does not present these limitations, this technique might be an option for the detection of IgG or specific IgG1 and IgG2 subclasses. Canine ehrlichiosis is an important differential diagnosis of American Visceral Leishmaniasis (AVL). The present study compared ELISA using Leishmania chagasi and Leishmania braziliensis antigen for the detection of anti-Leishmania IgG and subclasses in serum samples from 37 dogs naturally infected with L. chagasi (AVL) and in samples from four dogs co-infected with L. braziliensis and L. chagasi (CI). The occurrence of cross-reactivity was investigated in control serum samples of 17 healthy dogs (HC) and 35 infected with Ehrlichia canis (EC). The mean optical density obtained for the detection of IgG was significantly higher when L. chagasi antigen was used, and was also higher in subgroup VLs (symptomatic) compared to subgroup Vla (asymptomatic). The correlation between IgG and IgG1 was low. The present results suggest that IgG ELISA using homologous antigen yields the best results, permitting the diagnosis of asymptomatic L. chagasi infection and the discrimination between cases of AVL and ehrlichiosis in dogs.

Evaluation of dengue NS1 antigen detection for diagnosis in public health laboratories, São Paulo State, 2009

The present work evaluated the diagnostic accuracy of detection of Dengue NS1 antigen employing two NS1 assays, an immunochromatographic assay and ELISA, in the diagnostic routine of Public Health laboratories. The results obtained with NS1 assay were compared with virus isolation and, in a subpopulation of cases, they were compared with the IgM-ELISA results obtained with convalescent samples. A total of 2,321 sera samples were analyzed by one of two NS1 techniques from March to October 2009. The samples were divided into five groups: groups I, II and III included samples tested by NS1 and virus isolation, and groups IV and V included patients with a first sample tested by NS1 and a second sample tested by IgM-ELISA. Sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, Kappa Index and Kappa Concordance were calculated. The results showed that NS1 testing in groups I, II and III had high sensitivity (98.0%, 99.5% and 99.3%), and predictive values and Kappa index between 0.9 - 1.0. Groups IV and V only had Kappa Concordance calculated, since the samples were analyzed according to the presence of NS1 antigen or IgM antibody. Concordance of 92.1% was observed when comparing the results of NS1-negative samples with IgM-ELISA. Based on the findings, it is possible to suggest that the tests for NS1 detection may be important tools for monitoring the introduction and spread of Dengue serotypes.

Temporal differences in blood meal detection from the midguts of Triatoma infestans

We used genus/species specific PCRs to determine the temporal persistence of host DNA in Triatoma infestans experimentally fed on blood from six common vertebrate species: humans, domestic dogs, guinea pigs, chickens, mice, and pigs. Twenty third or fourth instar nymphs per animal group were allowed to feed to engorgement, followed by fasting-maintenance in the insectary. At 7, 14, 21, or 28 days post-feeding, the midgut contents from five triatomines per group were tested with the respective PCR assay. DNA from all vertebrate species was detected in at least four of five study nymphs at seven and 14 days post-feeding. DNA of humans, domestic dogs, guinea pigs, pigs, and chickens were more successfully detected (80-100%) through day 21, and less successfully (20-100%) at day 28. Findings demonstrate that species-specific PCRs can consistently identify feeding sources of T. infestans within two weeks, a biologically relevant time interval.

Maximum likelihood detection for OFDM signals with strong nonlinear distortion effects

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Electrotécnica e de Computadores