Circular proteins - no end in sight

Circular proteins are a recently discovered phenomenon. They presumably evolved to confer advantages over ancestral linear proteins while maintaining the intrinsic biological functions of those proteins. In general, these advantages include a reduced sensitivity to proteolytic cleavage and enhanced stability. In one remarkable family of circular proteins, the cyclotides, the cyclic backbone is additionally braced by a knotted arrangement of disulfide bonds that confers additional stability and topological complexity upon the family. This article describes the discovery, structure, function and biosynthesis of the currently known circular proteins. The discovery of naturally occurring circular proteins in the past few years has been complemented by new chemical and biochemical methods to make synthetic circular proteins; these are also briefly described.

Synthesis and structural analysis of the N-terminal domain of the thyroid hormone-binding protein transthyretin

Transthyretin (TTR) is a 55 kDa protein responsible for the transport of thyroid hormones and retinol in human serum. Misfolded forms of the protein are implicated in the amyloid diseases familial amyloidotic polyneuropathy and senile systemic amyloidosis. Its folding properties and stabilization by ligands are of current interest due to their importance in understanding and combating these diseases. To assist in such studies we developed a method for the solid phase synthesis of the monomeric unit of a TTR analogue and its folding to form a functional 55 kDa tetramer. The monomeric unit of the protein was chemically synthesized in three parts, comprising amino acid residues 151, 5499 and 102127, and ligated using chemoselective thioether ligation chemistry. The synthetic protein was folded and assembled to a tetrameric structure in the presence of the TTRs native ligand, thyroxine, as shown by gel filtration chromatography, native gel electrophoresis, TTR antibody recognition and thyroid hormone binding. In the current study the solution structure of the first of these fragment peptides, TTR(151) is examined to determine its intrinsic propensity to form beta-sheet structure, potentially involved in amyloid fibril formation by TTR. Despite the presence of extensive beta-structure in the native form of the protein, the Nterminal fragment adopts an essentially random coil conformation in solution.

Play Preferences and Behavior of Preschool Children with Autistic Spectrum Disorder in the Clinical Environment

The play of children with autistic spectrum disorder (ASD) is a valuable medium for assessment and intervention, and its analysis has the potential to aid diagnosis. This study investigated spontaneous play behavior and play object preferences for 24 preschool children with ASD in a typical occupational therapy clinical environment. Play behavior was rated and choice of play object noted at 10-second intervals from a 15-minute video recording of unstructured play. Statistical analyses indicated that play behavior was consistent with descriptions in the literature. In addition, the children demonstrated clear preferences for play objects in the form of popular characters (e.g., Thomas the Tank Engine) and those with sensorimotor properties. We propose that the inclusion of preferred play objects in a clinical environment may increase intrinsic motivation to play, and thereby enhance assessment and intervention.

Influence of ageing, heat shock treatment and in vivo total antioxidant status on gene-expression profile and protein synthesis in human peripheral lymphocytes

Ageing results in a progressive, intrinsic and generalised imbalance of the control of regulatory systems. A key manifestation of this complex biological process includes the attenuation of the universal stress response. Here we provide the first global assessment of the ageing process as it affects the heat shock response, utilising human peripheral lymphocytes and cDNA microarray analysis. The genomic approach employed in our preliminary study was supplemented with a proteomic approach. In addition, the current study correlates the in vivo total antioxidant status with the age-related differential gene expression as well as the translational kinetics of heat shock proteins (hsps). Most of the genes encoding stress response proteins on the 4224 element microarray used in this study were significantly elevated after heat shock treatment of lymphocytes obtained from both young and old individuals albeit to a greater extent in the young. Cell signaling and signal transduction genes as well as some oxidoreductases showed varied response. Results from translational kinetics of induction of major hsps, from 0 to 24 It recovery period were broadly consistent with the differential expression of HSC 70 and HSP 40 genes. Total antioxidant levels in plasma from old individuals were found to be significantly lower by comparison with young, in agreement with the widely acknowledged role of oxidant homeostasis in the ageing process. (C) 2002 Elsevier Science Ireland Ltd. All rights reserved.

The trans-membrane protein p25 forms highly specialized domains that regulate membrane composition and dynamics

Trans-membrane proteins of the p24 family are abundant, oligomeric proteins predominantly found in cis-Golgi membranes. They are not easily studied in vivo and their functions are controversial. We found that p25 can be targeted to the plasma membrane after inactivation of its canonical KKXX motif (KK to SS, p25SS), and that p25SS causes the co-transport of other p24 proteins beyond the Golgi complex, indicating that wild-type p25 plays a crucial role in retaining p24 proteins in cis-Golgi membranes. We then made use of these observations to study the intrinsic properties of these proteins, when present in a different membrane context. At the cell surface, the p25SS mutant segregates away from both the transferrin receptor and markers of lipid rafts, which are enriched in cholesterol and glycosphingolipids. This suggests that p25SS localizes to, or contributes to form, specialized membrane domains, presumably corresponding to oligomers of p25SS and other p24 proteins. Once at the cell surface, p25SS is endocytosed, together with other p24 proteins, and eventually accumulates in late endosomes, where it remains confined to well-defined membrane regions visible by electron microscopy. We find that this p25SS accumulation causes a concomitant accumulation of cholesterol in late endosomes, and an inhibition of their motility - two processes that are functionally linked. Yet, the p25SS-rich regions themselves seem to-exclude not only Lamp1 but also accumulated cholesterol. One may envision that p25SS accumulation, by excluding cholesterol from oligomers, eventually overloads neighboring late endosomal membranes with cholesterol beyond their capacity (see Discussion). In any case, our data show that p25 and presumably other p24 proteins are endowed with the intrinsic capacity to form highly specialized domains that control membrane composition and dynamics. We propose that p25 and other p24 proteins control the fidelity of membrane transport by maintaining cholesterol-poor membranes in the Golgi complex.

Abono Perman??ncia em uma institui????o federal de ensino superior: aplica????o e desdobramentos

A preocupa????o principal deste artigo ?? descrever a implementa????o do Abono Perman??ncia em uma Institui????o Federal de Ensino Superior e as implica????es que o mesmo acarretou a seus servidores e ?? pr??pria institui????o. O objetivo pretendido aqui n??o est?? em exaurir o assunto ent??o tratado, mas mostrar o quanto este pode ser importante, partindo do pressuposto de seu significado intr??nseco na motiva????o para o trabalho. O principal interessado no assunto ?? o servidor p??blico e este pode usufruir desse benef??cio dado sua idade para aposentar. Trata-se de uma pesquisa descritiva, cuja coleta foi atrav??s de entrevistas semi-estruturadas e individuais com funcion??rios que trabalham diretamente com os processos de Abono Perman??ncia, e tamb??m atrav??s de an??lise de documentos e observa????o direta dos sistemas gerenciais de processos administrativos da institui????o. Este estudo contribui nas discuss??es sobre benef??cios sociais na Gest??o de Pessoas e a utiliza????o desses recursos na Administra????o P??blica. Pode-se concluir que o Abono Perman??ncia traz diversas contribui????es como, por exemplo, a motiva????o pessoal em continuar trabalhando, por??m, apresenta algumas limita????es no pr??prio incentivo ao benef??cio, que pode n??o ser interessante em determinados tetos salariais.

Preparation and characterization of Nickel-and cobalt-doped magnetites

Trabalho apresentado no I Simpósio Mineiro de Ciências dos Materiais, Ouro Preto, Novembro de 2001.

O desenho da criança de cinco anos : investigando/refletindo as formas produzidas a partir de imagem da arte

O desenho infantil comprova significados e sentidos estabelecidos historicamente e revela experiências comuns da criança pensar e idealizar o mundo. Diante dessa constatação, o cerne desta pesquisa é investigar e refletir sobre as nuances no desenho da criança de cinco anos quando apresentadas às imagens de arte, analisando e compreendendo como ela se expressa verbal e graficamente diante de informações mediadas pelo professor de arte, quando manifestam suas experiências individuais e/ou em grupo, representando suas vivências e apropriando-se da linguagem artística, e assim constituindo-se como autoras. Para sustentar a pesquisa, adotamos os princípios da pesquisa qualitativa utilizando como recurso a observação participante em sala de aula, que vem ao encontro às nossas propostas por oportunizar o registro de dados in locus, potencializando assim, a estratégia da produção de dados. Os sujeitos dessa pesquisa são vinte e uma crianças de cinco anos que frequentaram o Grupo Cinco, do Centro de Educação Infantil Criarte/Ufes. A pesquisa buscou entender o desenho infantil como expressão intrínseca da criança, que, oportunizado por ações que colaboram para esse fazer, dará significados ao objeto, que, associado a sua história, sua vivência, possivelmente contribuirá para a formação artística e imagética da criança, significando sua expressão e criação. Trazemos para esse estudo conceitos do desenho infantil, bem como questões que abarcam todo o processo de elaboração e maturação do desenho, fundamentados nas pesquisas de Rosa Iavelberg, Analice Pilar, César Cola, Arno Stern e Viktor Lowenfeld, dentre outros, os quais possibilitaram nossa análise a partir do desenho e da fala das crianças. As reflexões apresentadas procuram contribuir para compreendermos o processo de diálogo, envolvimento e representação gráfica das crianças com as imagens de arte.

Para além do biológico, o sujeito com a síndrome de Klinefelter

Este estudo traz à tona nossa intenção de pesquisa: Compreender a história de vida de um sujeito com a Síndrome de Klinefelter, o Ramon. A Síndrome de Klinefelter é muito peculiar e vem ganhando destaque na área médica, não por sua prevalência na população, mas por sua complexidade. Na área da educação, a produção acerca dessa síndrome é incipiente encontramos apenas um estudo em Portugal. No nosso país, no entanto, ressalta-se o ineditismo dessa pesquisa. Nesse estudo pensamos, juntamente com Lev Semionovich Vigotski e outros autores que imprimem em seus textos raízes sócio-históricas, num Ramon para além do biológico, ou seja, para além dos seus limites orgânicos: um sujeito rico em subjetividade que foi valorizada. Objetivamos, assim, compreender a subjetividade desse sujeito que é singular na coletividade, assim, pensar no Ramon é pensar nos outros, nos seus pares e nas intrínsecas redes de dialogismos tecidas na imensa trama que é a vida. Buscamos também observar como ocorreu a inclusão desse sujeito no âmbito escolar. A fim de atingir os objetivos traçados, utilizamos a perspectiva histórico-cultural do desenvolvimento humano atrelando os pressupostos dessa opção teórica à metodologia história de vida. Para entender os detalhes, os indícios, as miudezas, os resquícios da história de vida do sujeito que parecem insignificantes, mas que são imprescindíveis para se compreender alguns processos de grande dimensão, nos apoiamos no paradigma indiciário de Ginzburg. Nessa pesquisa, nossos encontros com esse jovem de 22 anos são descritos e analisados, levando em conta os aspectos subjetivos. Nesses encontros, ouvimos várias narrativas para compor a história de vida do sujeito pesquisado: a do próprio Ramon, da sua mãe Marlene e das professoras da APAE e da Educação de Jovens e Adultos, ouvimos, portanto, Ramon em diferentes contextos: em casa, na APAE, na escola de ensino comum (EJA) e na casa da professora da APAE. Para colher os dados, recorremos às entrevistas biográficas semiestruturadas, as quais foram adequadas à singularidade de cada sujeito ouvido. Todas as entrevistas foram gravadas e transcritas em sua totalidade e os dados obtidos foram analisados levando-se em conta o contexto histórico e social de Ramon, assim, observamos as relações dialógicas estabelecidas por Ramon com seus pares e tentamos compreendê-las para melhor entender a construção subjetiva desse sujeito que para além de biológico, é social, cultural, que aprende, apreende e que, para além disso...muito nos ensina!

Variação na dieta da tartaruga verde, Chelonia mydas, e o impacto da ingestão de lixo ao longo da costa brasileira

Neste trabalho nós estudamos a dieta da tartaruga verde, Chelonia mydas, e os fatores envolvidos na variação de sua ecologia alimentar. Avaliamos também o impacto da ingestão de lixo, e os fatores que podem explicar a elevada ingestão destes resíduos entre os animais marinhos. No estudo da ecologia alimentar, nós avaliamos mais de 400 indivíduos, entre dados originais e da literatura, distribuídos ao longo de um gradiente latitudinal e diversos ambientes. As tartarugas se alimentaram majoritariamente de macroalgas, porém apresentaram uma grande plasticidade alimentar, tanto em relação à estratégia de forrageamento quanto à dieta. Nas regiões mais frias e com menor disponibilidade de algas, as tartarugas mudaram de uma dieta herbívora, para uma dieta baseada em matéria animal. Esta mudança de dieta acarretou também em uma mudança de estratégia de forrageamento, saindo da alimentação bentônica para uma alimentação pelágica. Estratégia esta que também foi encontrada nas áreas estuarinas. A plasticidade alimentar se deve à interação de fatores intrínsecos (restrições fisiológicas) e extrínsecos (regionais e locais). As diferenças nas estratégias de forragenamento acarretam também em diferenças na exposição a ameaças. Um exemplo disso é a ingestão de lixo, que apesar de ter sido registrada em mais de 70% das tartarugas (N = 265), representou uma ameaça maior aos animais com estratégia de forrageamento pelágica. O plástico foi o material mais ingerido, tendo como principal fonte itens relacionados à alimentação e sacolas plásticas. O estudo também mostrou que uma quantidade pequena de lixo (0,5 g) é suficiente para causar a morte. Este resultado revelou que o potencial de letalidade por ingestão de lixo é muito maior que a mortalidade observada. A verdadeira ameaça da ingestão de lixo está sendo mascarada pela elevada mortalidade relacionada às atividades pesqueiras. A ingestão de lixo é normalmente atribuída à confusão de um item alimentar específico com o resíduo, como águas-vivas e sacolas plásticas. Porém, nós mostramos que se trata de uma questão mais ampla, e usamos a tartaruga verde, aves marinhas e peixes para ressaltar a importância de outros fatores como: abundância do lixo no ambiente, estratégia de forrageamento, capacidade de detecção do resíduo e amplitude da dieta. Nós acreditamos que a ingestão de lixo ocorre devido a uma armadilha evolutiva muito mais ampla do que a previamente sugerida, e que deve afetar muito mais espécies que as que foram até hoje reportadas. Desarmar esta armadilha será particularmente difícil devido ao contínuo e crescente despejo de plástico no ambiente marinho e sua alta persistência no ambiente.

Transações com partes relacionadas : determinantes e impactos no desempenho das empresas

A literatura internacional que analisa os fatores impactantes das transações com partes relacionadas concentra-se no Reino Unido, nos EUA e no continente asiático, sendo o Brasil um ambiente pouco investigado. Esta pesquisa tem por objetivo investigar tanto os fatores impactantes dos contratos com partes relacionadas, quanto o impacto dessas transações no desempenho das empresas brasileiras. Estudos recentes que investigaram as determinantes das transações com partes relacionadas (TPRs), assim como seus impactos no desempenho das empresas, levaram em consideração as vertentes apresentadas por Gordon, Henry e Palia (2004): (a) de conflitos de interesses, as quais apoiam a visão de que as TPRs são danosas para os acionistas minoritários, implicando expropriação da riqueza deles, por parte dos controladores (acionistas majoritários); e (b) transações eficientes que podem ser benéficas às empresas, atendendo, desse modo, aos objetivos econômicos subjacentes delas. Esta pesquisa apoia-se na vertente de conflito de interesses, com base na teoria da agência e no fato de que o cenário brasileiro apresenta ter como característica uma estrutura de propriedade concentrada e ser um país emergente com ambiente legal caracterizado pela baixa proteção aos acionistas minoritários. Para operacionalizar a pesquisa, utilizou-se uma amostra inicial composta de 70 empresas com ações listadas na BM&FBovespa, observando o período de 2010 a 2012. Os contratos relacionados foram identificados e quantificados de duas formas, de acordo com a metodologia aplicada por Kohlbeck e Mayhew (2004; 2010) e Silveira, Prado e Sasso (2009). Como principais determinantes foram investigadas proxies para captar os efeitos dos mecanismos de governança corporativa e ambiente legal, do desempenho das empresas, dos desvios entre direitos sobre controle e direitos sobre fluxo de caixa e do excesso de remuneração executiva. Também foram adicionadas variáveis de controle para isolar as características intrínsecas das firmas. Nas análises econométricas foram estimados os modelos pelos métodos de Poisson, corte transversal agrupado (Pooled-OLS) e logit. A estimação foi feita pelo método dos mínimos quadrados ordinários (MQO), e para aumentar a robustez das estimativas econométricas, foram utilizadas variáveis instrumentais estimadas pelo método dos momentos generalizados (MMG). As evidências indicam que os fatores investigados impactam diferentemente as diversas medidas de TPRs das empresas analisadas. Verificou-se que os contratos relacionados, em geral, são danosos às empresas, impactando negativamente o desempenho delas, desempenho este que é aumentado pela presença de mecanismos eficazes de governança corporativa. Os resultados do impacto das medidas de governança corporativa e das características intrínsecas das firmas no desempenho das empresas são robustos à presença de endogeneidade com base nas regressões com variáveis instrumentais.

One-sided Radial-Fundamental Matrix Estimation

For modern consumer cameras often approximate calibration data is available, making applications such as 3D reconstruction or photo registration easier as compared to the pure uncalibrated setting. In this paper we address the setting with calibrateduncalibrated image pairs: for one image intrinsic parameters are assumed to be known, whereas the second view has unknown distortion and calibration parameters. This situation arises e.g. when one would like to register archive imagery to recently taken photos. A commonly adopted strategy for determining epipolar geometry is based on feature matching and minimal solvers inside a RANSAC framework. However, only very few existing solutions apply to the calibrated-uncalibrated setting. We propose a simple and numerically stable two-step scheme to first estimate radial distortion parameters and subsequently the focal length using novel solvers. We demonstrate the performance on synthetic and real datasets.

Simultaneous selection in progenies of yellow passion fruit using selection indices

This study aimed to evaluate the efficiency of simultaneous selection (selection indices) using estimated genetic gains in yellow passion fruit and to make a comparison between the methodologies of Mulamba & Mock and Elston. The study was conducted with 26 sib progenies of yellow passion fruit for intrinsic production characteristics including fruit number, fruit mass, fruit length and diameter, and for the fruit characteristics skin thickness, soluble solids and acidity. Two methodologies were applied: first, in the joint analysis of fruit characteristics and of intrinsic production characteristics in a single phase of selection; and second, in the analysis in two phases, in which priority was given to the intrinsic production characteristics in the first phase, and later, in the second phase, the best fruit characteristics were chosen among the progenies of the first phase. The analysis of variance was applied to the data to detect genetic variability among progenies. The Elston's selection indice was unable to provide distribution of genetic gains consistent with the purposes of the study, as it selected a single progeny of passion fruit. However, the index based on the sum of ranks of Mulamba & Mock was more suitable, as it provided a balanced distribution of gains, selecting a larger number of progenies. The methodology of selection using indices is advantageous in passion fruit, since it contributes to higher genetic gains for all the traits evaluated, and the selection in a single phase was proved efficient for progeny selection.

Foucault’s Perspective of Performance Appraisal in Public Administration

The main purpose of performance appraisal in organizations is, or should be, to improve the engagement, learning process and progress of the employees and to align individual with team and organizational performance. However, performance appraisal can also be interpreted as an instrument of normalization, discipline and surveillance. This study thus aims to explore and discuss the complex schema of intrinsic and extrinsic objectives of performance appraisal system of the Portuguese public organizations (SIADAP - Performance Evaluation Integrated System). We have developed an exploratory and qualitative case study to capture appraisers and appraises perceptions. The data were analyzed in light of foucauldian theories. According to the qualitative data, namely the discourses of the appraisers and their subordinates, the SIADAP is seen as an instrument of control and dominance that aims to introduce political rationalities, limiting the career progression of the employees. Though some key points of Foucault’s perspective were identified, foucauldian framework revealed some limitations to capture all the complexity inherent to performance appraisal. This study opens new perspectives about the SIADAP and can be of major importance as far as political reflection about performance appraisal in public organizations is concerned.

Avaliação do desempenho docente : objectivos e controvérsias

Actualmente, no campo específico da educação, a avaliação do desempenho tem vindo a assumir uma importância crescente e uma maior atenção dos investigadores pelos contextos escolares e pela relação directa entre a qualidade das abordagens de ensino e os níveis de desempenho dos alunos. No contexto do sistema educativo português, a preocupação com a eficácia passa a considerar a avaliação dos professores como uma prioridade, trazendo à discussão a profissionalidade docente e a sua avaliação. Assim, este estudo tem como objectivo a análise dos elementos potenciadores e condicionadores do actual modelo proposto pelo Decreto Regulamentar 2/2008 de 10 de Janeiro, bem como a sistematização de elementos complementares e /ou alternativos ao modelo vigente, a partir do que perspectivam os professores de uma escola secundária. Para a sua realização utilizou-se uma abordagem qualitativa suportada na grounded theory - estudo de caso. As técnicas de colheita de dados foram as entrevistas a nove docentes participantes e a análise de documentos relacionados com a política educativa da escola. O estudo permitiu concluir que o modelo apresenta dimensões controversas e que estas condicionam os objectivos intrínsecos do mesmo, sendo que a prevalência de questões burocráticas dificulta a sua implementação. Em consequência foram apresentadas algumas recomendações.