Increased accommodation of nascent RNA in a product site on RNA polymerase II during arrest.

RNA polymerases encounter specific DNA sites at which RNA chain elongation takes place in the absence of enzyme translocation in a process called discontinuous elongation. For RNA polymerase II, at least some of these sequences also provoke transcriptional arrest where renewed RNA polymerization requires elongation factor SII. Recent elongation models suggest the occupancy of a site within RNA polymerase that accommodates nascent RNA during discontinuous elongation. Here we have probed the extent of nascent RNA extruded from RNA polymerase II as it approaches, encounters, and departs an arrest site. Just upstream of an arrest site, 17-19 nucleotides of the RNA 3'-end are protected from exhaustive digestion by exogenous ribonuclease probes. As RNA is elongated to the arrest site, the enzyme does not translocate and the protected RNA becomes correspondingly larger, up to 27 nucleotides in length. After the enzyme passes the arrest site, the protected RNA is again the 18-nucleotide species typical of an elongation-competent complex. These findings identify an extended RNA product groove in arrested RNA polymerase II that is probably identical to that emptied during SII-activated RNA cleavage, a process required for the resumption of elongation. Unlike Escherichia coli RNA polymerase at a terminator, arrested RNA polymerase II does not release its RNA but can reestablish the normal elongation mode downstream of an arrest site. Discontinuous elongation probably represents a structural change that precedes, but may not be sufficient for, arrest by RNA polymerase II.

A Schistosoma mansoni fatty acid-binding protein, Sm14, is the potential basis of a dual-purpose anti-helminth vaccine.

Molecular cloning of components of protective antigenic preparations has suggested that related parasite fatty acid-binding proteins could form the basis of the protective immune crossreactivity between the parasitic trematode worms Fasciola hepatica and Schistosoma mansoni. Molecular models of the two parasite proteins showed that both molecules adopt the same basic three-dimensional structure, consisting of a barrel-shaped molecule formed by 10 antiparallel beta-pleated strands joined by short loops, and revealed the likely presence of crossreactive, discontinuous epitopes principally derived from amino acids in the C-terminal portions of the molecules. A recombinant form of the S. mansoni antigen, rSm14, protected outbred Swiss mice by up to 67% against challenge with S. mansoni cercariae in the absence of adjuvant and without provoking any observable autoimmune response. The same antigen also provided complete protection against challenge with F. hepatica metacercariae in the same animal model. The results suggest that it may be possible to produce a single vaccine that would be effective against at least two parasites, F. hepatica and S. mansoni, of veterinary and human importance, respectively.

Análise da estrutura populacional e do desequilíbrio de ligação de um painel de acessos de sorgo: uma abordagem usando teoria da coalescência

A estrutura populacional e o desequilíbrio de ligação são dois processos fundamentais para estudos evolutivos e de mapeamento associativo. Tradicionalmente, ambos têm sido investigados por meio de métodos clássicos comumente utilizados. Tais métodos certamente forneceram grandes avanços no entendimento dos processos evolutivos das espécies. No entanto, em geral, nenhum deles utiliza uma visão genealógica de forma a considerar eventos genéticos ocorridos no passado, dificultando a compreensão dos padrões de variação observados no presente. Uma abordagem que possibilita a investigação retrospectiva com base no atual polimorfismo observado é a teoria da coalescência. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar, com base na teoria da coalescência, a estrutura populacional e o desequilíbrio de ligação de um painel mundial de acessos de sorgo (Sorghum bicolor). Para tanto, análises de mutação, migração com fluxo gênico e recombinação foram realizadas para cinco regiões genômicas relacionadas à altura de plantas e maturidade (Dw1, Dw2, Dw4, Ma1 e Ma3) e sete populações previamente selecionadas. Em geral, elevado fluxo gênico médio (Μ = m/μ = 41,78 − 52,07) foi observado entre as populações considerando cada região genômica e todas elas simultaneamente. Os padrões sugeriram intenso intercâmbio de acessos e história evolutiva específica para cada região genômica, mostrando a importância da análise individual dos locos. A quantidade média de migrantes por geração (Μ) não foi simétrica entre pares recíprocos de populações, de acordo com a análise individual e simultânea das regiões. Isso sugere que a forma pela qual as populações se relacionaram e continuam interagindo evolutivamente não é igual, mostrando que os métodos clássicos utilizados para investigar estrutura populacional podem ser insatisfatórios. Baixas taxas médias de recombinação (ρL = 2Ner = 0,030 − 0,246) foram observadas utilizando o modelo de recombinação constante ao longo da região. Baixas e altas taxas médias de recombinação (ρr = 2Ner = 0,060 − 3,395) foram estimadas utilizando o modelo de recombinação variável ao longo da região. Os métodos tradicional (r2) e via coalescência (E[r2 rhomap]) utilizados para a estimação do desequilíbrio de ligação mostraram resultados próximos para algumas regiões genômicas e populações. No entanto, o r2 sugeriu padrões descontínuos de desequilíbrio em várias ocasiões, dificultando o entendimento e a caracterização de possíveis blocos de associação. O método via coalescência (E[r2 rhomap]) forneceu resultados que pareceram ter sido mais consistentes, podendo ser uma estratégia eventualmente importante para um refinamento dos padrões não-aleatórios de associação. Os resultados aqui encontrados sugerem que o mapeamento genético a partir de um único pool gênico pode ser insuficiente para detectar associações causais importantes para características quantitativas em sorgo.

Inovação e indústria da moda: um modelo de inovação em estilos e tendências.

Este trabalho tem como intuito propor um modelo de inovação para a indústria da moda feminina. O modelo visa compreender o comportamento de estilos e tendências determinados e difundidos pelas empresas. A construção deste modelo é justificada pela contribuição que um estudo sobre inovação pode proporcionar à indústria da moda, a qual enfrenta baixos padrões de competitividade no mercado externo e interno. Além disso, embora existam muitos artigos sobre o assunto, poucos foram os modelos de inovação para a indústria da moda encontrados por esta pesquisa. Uma avaliação destes modelos indicou que existe espaço para a proposta de um modelo que aborde o comportamento de estilos e tendências ao longo do tempo. A estrutura de composição do modelo é sustentada por três pilares conceituais: teoria econômica neoschumpeteriana, modelos de inovação e modelos de inovação para a indústria da moda. A característica central do modelo é avaliar se existem estilos que permanecem em moda de maneira contínua ou descontínua. Como existe similaridade conceitual entre os estilos, no que se refere à identidade de gênero (androginia e feminilidade), foi efetuada uma aglutinação de alguns estilos dentro desta denominação. Nem todos os estilos se encaixaram nesta classificação. Então, estes estilos foram denominados como neutros. Como a pesquisa tem abordagem fenomenológica, qualitativa e longitudinal, foi adotada a metodologia hipotética dedutiva para a construção do modelo. Para verificação da validade das hipóteses foi usada uma análise exploratória dos dados por meio de estatística descritiva e decomposição da estrutura de variabilidade através de uma análise de componentes principais (PCA). Ambas as análises forneceram evidências a respeito das hipóteses em questão, as quais também foram testadas através de um teste binomial e de uma análise de variância multivariada por meio de permutações. Os resultados comprovaram que existem estilos que permanecem em moda de maneira contínua e que existem períodos de polarização das aglutinações de estilo.

Resistência à abrasão de aço Hadfield para britadores: efeito do tamanho do abrasivo e do pH do meio.

Neste trabalho, foi investigado o efeito do tamanho do abrasivo e do pH do meio na resistência ao desgaste abrasivo do aço H-13 com matriz martensítica e do aço Hadfield com matriz austenítica. Ensaios de abrasão foram realizados utilizando o equipamento roda de borracha a úmido, variando o tamanho do abrasivo entre 0,15 e 2,40 mm e o pH do meio entre 5,5 e 12,8. As microestruturas dos materiais estudados foram analisadas utilizando microscopia óptica, as superfícies de desgaste e as partículas de desgaste foram analisadas em microscópio eletrônico de varredura. A macrodureza e a microdureza, antes e após os ensaios, foram obtidas utilizando durômetro Vickers. A topografia da região central da superfície de desgaste foi obtida utilizando Perfilometria 3D, visando obter valores de profundidade de penetração do abrasivo. Os resultados mostraram que o aço Hadfield é mais resistente do que o aço H-13 em todos os valores de pH e tamanhos de abrasivo utilizados. Para os dois materiais, a perda de massa aumenta linearmente até um tamanho crítico de abrasivo (TCA) e, após este, a mesma continua a aumentar, mas com uma intensidade menor. Para os dois materiais e para todos os tamanhos de abrasivo, o aumento do pH do meio resultou em menores perdas de massa, sendo este efeito maior para os dois menores tamanhos de abrasivo. Para maiores valores de pH, foram observadas menores profundidades de penetração do abrasivo. A microdureza da superfície de desgaste do aço H-13 sofreu um pequeno aumento com o aumento do tamanho do abrasivo enquanto que para o aço Hadfield esse aumento foi mais intenso. A análise das partículas de desgaste mostraram que, para todas as condições ensaiadas, os debris do aço H-13 tinham duas morfologias, contínuas e descontínuas enquanto que os cavacos do aço Hadfield foram sempre descontínuos. Para os dois materiais, foram observados dois micromecanismos de desgaste, sendo eles microcorte e microsulcamento. Por fim, os resultados apresentados neste trabalho sugerem que a análise de desempenho do aço Hadfield em serviço deve considerar o pH do meio bem como a granulometria do abrasivo em contato.

Evolución tectónica del borde norte de la cuenca del Bajo Segura. Implicaciones en la evolución de la falla de Crevillente (sector Abanilla-Alicante)

En este estudio presentamos los resultados del análisis estructural del borde norte de la cuenca del Bajo Segura, en la cordillera Bética oriental. En este borde se desarrolla el sinclinal de Crevillente; se trata de un pliegue de propagación de falla con geometría de crecimiento y vergente al sur asociado a la falla de Crevillente (sector Abanilla-Alicante). El estudio cuantitativo de la discordancia progresiva asociada a dicho pliegue ha puesto de manifiesto que la actividad de esta falla se inició en el Tortoniense, aumentó durante el Messiniense y, a partir de ese momento se ha mantenido constante o ha disminuido durante el Plioceno y el Cuaternario. La escasez de depósitos cuaternarios deformados no implica que no exista actividad cuaternaria de la falla de Crevillente (sector Abanilla-Alicante), ya que la mayoría de los depósitos más recientes son discontinuos o se localizan al sur, alejados de la zona de máxima deformación. Por otro lado, el hecho de que la actividad de la falla del Bajo Segura, situada en el borde meridional de la cuenca, se iniciara durante el Plioceno, parece indicar una migración de la deformación hacia el sur.

Water reduction in waste-activated sludge by resettling and filtration in batch. Phase (1): pilot-scale experiments to optimize performance

This article describes an effective procedure for reducing the water content of excess sludge production from a wastewater treatment plant by increasing its concentration and, as a consequence, minimizing the volume of sludge to be managed. It consists of a pre-dewatering sludge process, which is used as a preliminary step or alternative to the thickening. It is made up of two discontinuous sequential stages: the first is resettling and the second, filtration through a porous medium. The process is strictly physical, without any chemical additives or electromechanical equipment intervening. The experiment was carried out in a pilot-scale system, consisting of a column of sedimentation that incorporates a filter medium. Different sludge heights were tested over the filter to verify the influence of hydrostatic pressure on the various final concentrations of each stage. The results show that the initial sludge concentration may increase by more than 570% by the end of the process with the final volume of sludge being reduced in similar proportions and hydrostatic pressure having a limited effect on this final concentration. Moreover, the value of the hydrostatic pressure at which critical specific cake resistance is reached is established.

A Finite Element Numerical Algorithm for Modelling and Data Fitting in Complex Systems

Numerical modelling methodologies are important by their application to engineering and scientific problems, because there are processes where analytical mathematical expressions cannot be obtained to model them. When the only available information is a set of experimental values for the variables that determine the state of the system, the modelling problem is equivalent to determining the hyper-surface that best fits the data. This paper presents a methodology based on the Galerkin formulation of the finite elements method to obtain representations of relationships that are defined a priori, between a set of variables: y = z(x1, x2,...., xd). These representations are generated from the values of the variables in the experimental data. The approximation, piecewise, is an element of a Sobolev space and has derivatives defined in a general sense into this space. The using of this approach results in the need of inverting a linear system with a structure that allows a fast solver algorithm. The algorithm can be used in a variety of fields, being a multidisciplinary tool. The validity of the methodology is studied considering two real applications: a problem in hydrodynamics and a problem of engineering related to fluids, heat and transport in an energy generation plant. Also a test of the predictive capacity of the methodology is performed using a cross-validation method.

Simulating Granite Emplacement and Deformation with Centrifuge Analogue Modelling

The Greater Himalayan leucogranites are a discontinuous suite of intrusions emplaced in a thickened crust during the Miocene southward ductile extrusion of the Himalayan metamorphic core. Melt-induced weakening is thought to have played a critical role in strain localization that facilitated the extrusion. Recent advancements in centrifuge analogue modelling techniques allow for the replication of a broader range of crustal deformation behaviors, enhancing our understanding of large hot orogens. Polydimethylsiloxane (PDMS) is commonly used in centrifuge experiments to model weak melt zones. Difficulties in handling PDMS had, until now, limited its emplacement in models prior to any deformation. A new modelling technique has been developed where PDMS is emplaced into models that have been subjected to some shortening. This technique aims to better understand the effects of melt on strain localization and potential decoupling between structural levels within an evolving orogenic system. Models are subjected to an early stage of shortening, followed by the introduction of PDMS, and then a final stage of shortening. Theoretical percentages of partial melt and their effect on rock strength are considered when adding a specific percentage of PDMS in each model. Due to the limited size of the models, only PDMS sheets of 3 mm thickness were used, which varied in length and width. Within undeformed packages, minimal surface and internal deformation occurred when PDMS is emplaced in the lower layer of the model, showing a vertical volume increase of ~20% within the package; whereas the emplacement of PDMS into the middle layer showed internal dragging of the middle laminations into the lower layer and a vertical volume increase ~30%. Emplacement of PDMS results in ~7% shortening for undeformed and deformed models. Deformed models undergo ~20% additional shortening after two rounds of deformation. Strain localization and decoupling between units occur in deformed models where the degree of deformation changes based on the amount of partial melt present. Surface deformation visible by the formation of a bulge, mode 1 extension cracks and varying surface strain ellipses varies depending if PDMS is present. Better control during emplacement is exhibited when PDMS is added into cooler models, resulting in reduced internal deformation within the middle layer.

La conduite avec facultés affaiblies : les contrevenants et les services offerts dans les établissements de détention du Québec

Rapport de stage présenté à la Faculté des études supérieures en vue de l’obtention du grade de Maître ès science (M. Sc.) en criminologie Option stage en analyse criminologique

La conduite avec facultés affaiblies : les contrevenants et les services offerts dans les établissements de détention du Québec

Rapport de stage présenté à la Faculté des études supérieures en vue de l’obtention du grade de Maître ès science (M. Sc.) en criminologie Option stage en analyse criminologique

Radiocarbon ages from Novaya Zemlya, Russia

Recent observations on postglacial emergence and past glacier extent for one of the least accessible areas in the Arctic, northern Novaya Zemlya are here united. The postglacial marine limit formed 5 to 6 ka is registered on the east and west coasts of the north island at 10 ± 1 and 18 ± 2 m aht, respectively. This modest and late isostatic response along with deglacial ages of >9.2 ka on adjacent marine cores from the northern Barents Sea indicate either early (>13 ka) deglaciation or modest ice sheet loading (<1500 m thick ice sheet) of Novaya Zemlya. Older and higher (up to 50 m aht) raised beaches were identified beneath a discontinuous glacial drift. Shells from the drift and underlying sublittoral sediments yield minimum limiting 14C ages of 26 to 30 ka on an earlier deglacial event(s). The only moraines identified are within 4 km of present glacier margins and reflect at least three neoglacial advances in the past 2.4 ka.

(Table 1) Argon dating of ash layers from DSDP Hole 18-178

Ash layers from Deep Sea Drilling Project site 178 in the northeast Pacific Ocean have been dated by the 40Ar-39Ar stepwise heating technique to resolve published discrepancies concerning the length of time explosive volcanism has affected the eastern Aleutian arc and Alaskan Peninsula. The results of the investigation indicate that the record of ash-fall deposition at site 178 extends back at least 6.5 m.y. Assuming that 6.5 m.y. ago marks the onset of renewed calc-alkalic volcanism of the volcanic arc, proposed models of continuous and discontinuous motion between the Pacific and North American lithospheric plates can be evaluated. If appreciable time elapsed between the onset of subduction and the onset of arc volcanism, the 6.5-m.y. record of ash-fall deposition in the north-east Pacific is most compatible with models of continuous plate motion throughout late Cenozoic time.

(Table 1) Age and sedimentation rates of Pleistocene/Holocene sequences at DSDP Sites 86-580 and 94-611

The recovery from the North Atlantic (Site 611) of a continuous Pleistocene sedimentary record with a siliceous microfaunal component made it possible to compare the high-latitude abundance pattern of the radiolarian species Cycladophora davisiana in the Atlantic with that produced from analyses of a high-latitude record (Site 580) from the northwest Pacific. Previous studies had shown that the late Pleistocene (0-0.45 Ma) abundance variations of this species in these high-latitude regions were similar. Cycladophora davisiana maxima in the North Atlantic record reach abundance levels three to four times higher than C. davisiana maxima registered in sediments from the northwest Pacific site. This difference in magnitude of abundance peaks is most likely an effect of the more northerly location of Site 611 (53°N) compared with that of Site 580 (42°N), since high-latitude time-slice studies have shown a direct relationship between increasing latitude and C. davisiana abundance. Discontinuous preservation of radiolarians in sediments from North Atlantic Site 611 allows only tentative correlation of the North Atlantic and northwest Pacific C. davisiana abundance curves. These correlations are confined to those portions of the cores where ages are tightly constrained by magnetic boundaries, and to intervals with comparable sedimentation rates.

(Table 1) Radiolarian abundances and preservation in DSDP Hole 96-618 samples

Radiolarians are present in samples from six of the seven Deep Sea Drilling Project Leg 96 sites examined. The age of the siliceous fauna in these samples ranges from late Pleistocene through Holocene, with some Cretaceous radiolarians redeposited in Pleistocene sequences. Radiolarian preservation is discontinuous at these sites except for intraslope basin Site 618, where the sediments throughout the first five cores contain radiolarians.