The inv(16) encodes an acute myeloid leukemia 1 transcriptional corepressor

The inv(16) is one of the most frequent chromosomal translocations associated with acute myeloid leukemia (AML). The inv(16) fusion protein acts by dominantly interfering with AML-1/core binding factor β-dependent transcriptional regulation. Here we demonstrate that the inv(16) fusion protein cooperates with AML-1B to repress transcription. This cooperativity requires the ability of the translocation fusion protein to bind to AML-1B. Mutational analysis and cell fractionation experiments indicated that the inv(16) fusion protein acts in the nucleus and that repression occurs when the complex is bound to DNA. We also found that the inv(16) fusion protein binds to AML-1B when it is associated with the mSin3A corepressor. An AML-1B mutant that fails to bind mSin3A was impaired in cooperative repression, suggesting that the inv(16) fusion protein acts through mSin3 and possibly other corepressors. Finally, we demonstrate that the C-terminal portion of the inv(16) fusion protein contains a repression domain, suggesting a molecular mechanism for AML-1-mediated repression.

The t(8;21) chromosomal translocation in acute myelogenous leukemia modifies intranuclear targeting of the AML1/CBFα2 transcription factor

Targeting of gene regulatory factors to specific intranuclear sites may be critical for the accurate control of gene expression. The acute myelogenous leukemia 8;21 (AML1/ETO) fusion protein is encoded by a rearranged gene created by the ETO chromosomal translocation. This protein lacks the nuclear matrix-targeting signal that directs the AML1 protein to appropriate gene regulatory sites within the nucleus. Here we report that substitution of the chromosome 8-derived ETO protein for the multifunctional C terminus of AML1 precludes targeting of the factor to AML1 subnuclear domains. Instead, the AML1/ETO fusion protein is redirected by the ETO component to alternate nuclear matrix-associated foci. Our results link the ETO chromosomal translocation in AML with modifications in the intranuclear trafficking of the key hematopoietic regulatory factor, AML1. We conclude that misrouting of gene regulatory factors as a consequence of chromosomal translocations is an important characteristic of acute leukemias.

ETO, fusion partner in t(8;21) acute myeloid leukemia, represses transcription by interaction with the human N-CoR/mSin3/HDAC1 complex

The t(8;21) translocation between two genes known as AML1 and ETO is seen in approximately 12–15% of all acute myeloid leukemia (AML) and is the second-most-frequently observed nonrandom genetic alteration associated with AML. AML1 up-regulates a number of target genes critical to normal hematopoiesis, whereas the AML1/ETO fusion interferes with this trans-activation. We discovered that the fusion partner ETO binds to the human homolog of the murine nuclear receptor corepressor (N-CoR). The interaction is mediated by two unusual zinc finger motifs present at the carboxyl terminus of ETO. Human N-CoR (HuN-CoR), which we cloned and sequenced in its entirety, encodes a 2,440-amino acid polypeptide and has a central domain that binds ETO. N-CoR, mammalian Sin3 (mSin3A and B), and histone deacetylase 1 (HDAC1) form a complex that alters chromatin structure and mediates transcriptional repression by nuclear receptors and by a number of oncoregulatory proteins. We found that ETO, through its interaction with the N-CoR/mSin3/HDAC1 complex, is also a potent repressor of transcription. This observation provides a mechanism for how the AML1/ETO fusion may inhibit expression of AML1-responsive target genes and disturb normal hematopoiesis.

PlasmoDB: An integrative database of the Plasmodium falciparum genome. Tools for accessing and analyzing finished and unfinished sequence data

The Plasmodium falciparum Genome Database (http://PlasmoDB.org) integrates sequence information, automated analyses and annotation data emerging from the P.falciparum genome sequencing consortium. To date, raw sequence coverage is available for >90% of the genome, and two chromosomes have been finished and annotated. Data in PlasmoDB are organized by chromosome (1–14), and can be accessed using a variety of tools for graphical and text-based browsing or downloaded in various file formats. The GUS (Genomics Unified Schema) implementation of PlasmoDB provides a multi-species genomic relational database, incorporating data from human and mouse, as well as P.falciparum. The relational schema uses a highly structured format to accommodate diverse data sets related to genomic sequence and gene expression. Tools have been designed to facilitate complex biological queries, including many that are specific to Plasmodium parasites and malaria as a disease. Additional projects seek to integrate genomic information with the rich data sets now becoming available for RNA transcription, protein expression, metabolic pathways, genetic and physical mapping, antigenic and population diversity, and phylogenetic relationships with other apicomplexan parasites. The overall goal of PlasmoDB is to facilitate Internet- and CD-ROM-based access to both finished and unfinished sequence information by the global malaria research community.

Synergistic up-regulation of the myeloid-specific promoter for the macrophage colony-stimulating factor receptor by AML1 and the t(8;21) fusion protein may contribute to leukemogenesis.

AML1 is involved in the (8;21) translocation, associated with acute myelogenous leukemia (AML)-type M2, which results in the production of the AML1-ETO fusion protein: the amino-terminal 177 amino acids of AML1 and the carboxyl-terminal 575 amino acids of ETO. The mechanism by which AML1-ETO accomplishes leukemic transformation is unknown; however, AML1-ETO interferes with AML1 transactivation of such AML1 targets as the T-cell receptor beta enhancer and the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor promoter. Herein, we explored the effect of AML1-ETO on regulation of a myeloid-specific AML1 target, the macrophage colony-stimulating factor (M-CSF) receptor promoter. We found that AML1-ETO and AML1 work synergistically to transactivate the M-CSF receptor promoter, thus exhibiting a different activity than previously described. Truncation mutants within the ETO portion of AML1-ETO revealed the region of ETO necessary for the cooperativity between AML1 and AML1-ETO lies between amino acids 347 and 540. Endogenous M-CSF receptor expression was examined in Kasumi-1 cells, derived from a patient with AML-M2 t(8;21) and the promonocytic cell line U937. Kasumi-1 cells exhibited a significantly higher level of M-CSF receptor expression than U937 cells. Bone marrow from patients with AML-M2 t(8;21) also exhibited a higher level of expression of M-CSF receptor compared with normal controls. The upregulation of M-CSF receptor expression by AML1-ETO may contribute to the development of a leukemic state in these patients.

Esquemas cognitivos, sintomas de ansiedade e depressão em mulheres de um Programa de Cessação de Tabagismo

O tabagismo é um problema de saúde pública em todo o mundo. Entre as mulheres, devido ao aumento da prevalência comparada aos homens, o tabagismo feminino tem merecido atenção. Para o enfrentamento, é necessário entender o fenômeno e criar estratégias mais adequadas que incluam aspectos emocionais e sociais da dependência do tabagismo. Este estudo buscou descrever os esquemas cognitivos, sintomas de ansiedade e depressão de 112 mulheres que procuraram tratamento para cessação do tabagismo e sua relação com o insucesso do tratamento. A coleta de dados incluiu roteiro de entrevista estruturada e escalas validadas para a população brasileira que têm o objetivo de avaliar os esquemas cognitivos, sintomas de ansiedade e de depressão, e aspectos da dependência do cigarro. O conhecimento de fatores emocionais envolvidos no tabagismo e sua cessação podem ser úteis às ações de apoio à mudança comportamental do fumante. Objetivo: Descrever o perfil psicológico de mulheres que buscam cessação do tabagismo quanto aos esquemas cognitivos, sintomas de ansiedade e depressão antes e depois do tratamento com Terapia Cognitivo- Comportamental em grupo, e analisar fatores que contribuem para o desfecho de cessação. O desenho do estudo foi longitudinal e transversal. Para avaliar os esquemas cognitivos, o Questionário de Esquemas de Young em sua forma curta foi utilizado. Os grupos de terapia cognitivo-comportamental foram realizados concomitantes ao cuidado usual por médicos do estudo. Esses profissionais foram treinados no protocolo do estudo e o seguimento foi realizado por telefone por um membro do estudo independente e cego. Resultados: Os resultados forneceram evidências de que esquemas cognitivos tiveram relação significativa com os sintomas de depressão e ansiedade, com a adesão e os resultados do tratamento (cessação do tabagismo)

Modelagem e análise das cadeias de suprimentos globais e resilientes baseadas em rede de Petri.

Em um cenário de aumento de competitividade, crescente expectativa por inovações do produto e necessidade de atender diferentes perfis de consumidores, o conceito de gerenciamento de cadeias de suprimentos globais (GSCM) surge como uma estratégia para coordenar mais eficazmente as atividades dispersas geograficamente dos sistemas produtivos. Na adoção do GSCM, as organizações devem lidar com rupturas que impactam no gerenciamento das suas atividades, tais como a interrupção de vias de transporte, pane no fornecimento de energia, desastres naturais e até ataques terroristas. Nesse contexto, o trabalho introduz um procedimento sistematizado para modelagem das cadeias de suprimentos visto como um sistema a eventos discretos e sua análise por simulação das atividades do GSCM baseada em técnicas formais como a rede de Petri (PN) e o Production Flow Schema (PFS). Um exemplo é também apresentado para ilustrar e comprovar as vantagens do método proposto na análise do GSCM.

Desenvolvimento artificial autônomo de um grafo sensório-motor auto-organizável.

A teoria de Jean Piaget sobre o desenvolvimento da inteligência tem sido utilizada na área de inteligência computacional como inspiração para a proposição de modelos de agentes cognitivos. Embora os modelos propostos implementem aspectos básicos importantes da teoria de Piaget, como a estrutura do esquema cognitivo, não consideram o problema da fundamentação simbólica e, portanto, não se preocupam com os aspectos da teoria que levam à aquisição autônoma da semântica básica para a organização cognitiva do mundo externo, como é o caso da aquisição da noção de objeto. Neste trabalho apresentamos um modelo computacional de esquema cognitivo inspirado na teoria de Piaget sobre a inteligência sensório-motora que se desenvolve autonomamente construindo mecanismos por meio de princípios computacionais pautados pelo problema da fundamentação simbólica. O modelo de esquema proposto tem como base a classificação de situações sensório-motoras utilizadas para a percepção, captação e armazenamento das relações causais determiníscas de menor granularidade. Estas causalidades são então expandidas espaço-temporalmente por estruturas mais complexas que se utilizam das anteriores e que também são projetadas de forma a possibilitar que outras estruturas computacionais autônomas mais complexas se utilizem delas. O modelo proposto é implementado por uma rede neural artificial feed-forward cujos elementos da camada de saída se auto-organizam para gerar um grafo sensóriomotor objetivado. Alguns mecanismos computacionais já existentes na área de inteligência computacional foram modificados para se enquadrarem aos paradigmas de semântica nula e do desenvolvimento mental autônomo, tomados como base para lidar com o problema da fundamentação simbólica. O grafo sensório-motor auto-organizável que implementa um modelo de esquema inspirado na teoria de Piaget proposto neste trabalho, conjuntamente com os princípios computacionais utilizados para sua concepção caminha na direção da busca pelo desenvolvimento cognitivo artificial autônomo da noção de objeto.

Influencia del esquema aditivo en el desarrollo del razonamiento proporcional

El objetivo de este estudio es analizar la influencia del esquema aditivo en el desarrollo del razonamiento proporcional en estudiantes de educación secundaria. 558 estudiantes de educación secundaria respondieron a un cuestionario de problemas proporcionales y no proporcionales. Los resultados indican (i) que la capacidad de los estudiantes en identificar las relaciones proporcionales en los problemas proporcionales no implica necesariamente que sean capaces de identificar correctamente las relaciones aditivas en los problemas no proporcionales y viceversa; y (ii) que el tipo de relación multiplicativa entre las cantidades (entera o no entera) influía en el nivel de éxito en la resolución de los problemas proporcionales y no proporcionales.

Evaluating EmotiBlog robustness for sentiment analysis tasks

EmotiBlog is a corpus labelled with the homonymous annotation schema designed for detecting subjectivity in the new textual genres. Preliminary research demonstrated its relevance as a Machine Learning resource to detect opinionated data. In this paper we compare EmotiBlog with the JRC corpus in order to check the EmotiBlog robustness of annotation. For this research we concentrate on its coarse-grained labels. We carry out a deep ML experimentation also with the inclusion of lexical resources. The results obtained show a similarity with the ones obtained with the JRC demonstrating the EmotiBlog validity as a resource for the SA task.

Características de la tematización del esquema de límite de una función

Esta investigación estudia las diferentes estructuras subyacentes en el esquema de límite de una función observadas en 23 estudiantes de Bachillerato situados en el nivel Trans del desarrollo del esquema de límite de una función. El esquema de límite de una función se caracterizó en términos de la habilidad que los estudiantes manifestaron en la construcción de la concepción dinámica del límite mediante la coordinación de los procesos de aproximación en el dominio y en el rango, diferenciando aquellas en las que las aproximaciones laterales coinciden de las que no coinciden. Nuestros resultados sugieren que los estudiantes construyen diferentes estructuras subyacentes al esquema debido a las relaciones que establecen entre el límite de una función en un punto y su representación gráfica que permiten identificar características del esquema tematizado del límite de una función.

Algunos indicadores del desarrollo del esquema de derivada de una función

El objetivo de esta investigación es caracterizar algunos indicadores del desarrollo del esquema de derivada en estudiantes de pos-secundaria. Usamos los niveles intra, inter y trans del desarrollo de un esquema propuestos por Piaget y García para caracterizar el uso flexible que los estudiantes hacen de la equivalencia lógica entre diferentes elementos matemáticos cuando resuelven un problema, como un indicador del desarrollo del esquema de derivada. Este indicador ayuda a explicar la transición entre los niveles inter y trans de desarrollo del esquema derivada.

Una descomposición genética para el concepto de recta tangente

Presentamos una descomposición genética del concepto de recta tangente vista como una trayectoria hipotética de aprendizaje. Para generar esta descomposición genética se ha realizado un análisis histórico de la génesis del concepto, un análisis de libros de texto de Bachillerato, una síntesis de los resultados de las investigaciones sobre la comprensión de la recta tangente y hemos tenido en cuenta los resultados de un cuestionario respondido por alumnos de Bachillerato. La descomposición genética integra las perspectivas analítica local y geométrica como medio para favorecer la tematización del esquema de recta tangente.

Alterações genéticas com interesse prognóstico nas doenças mieloproliferativas crónicas bcr-abl negativas

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

Modello activity oriented per la gestione della radioprotezione di una azienda sanitaria

Alla base delle analisi di radioprotezione di una azienda sanitaria si potrebbero considerare quattro settori da cui partire: le attività svolte che presentano un rischio dal punto di vista radiologico, gli apparecchi radiogeni, i locali all'interno del quale si svolgono le attività e infine i lavoratori, che devono essere classificati o meno in base ai valori di dose efficace a cui vengono esposti. In questo elaborato si vuole presentare un nuovo modello informatico di gestione, definito activity-oriented perché volto a portare le attività al centro dell'indagine di radioprotezione così da poter strutturare di conseguenza anche i dati relativi ad apparecchiature, locali e lavoratori, in modo da avere un visione completa dell’azienda così da facilitarne il monitoraggio. Tale modello è stato creato negli ultimi anni nell’azienda USL di Forlì e contemporaneamente è stato sviluppato un software che permette di automatizzare parte dei lavori di competenza dell’Esperto Qualificato. Applicando tali strumenti sull’Azienda USL della Romagna Area Territoriale di Ravenna è stato possibile passare da una gestione cartacea, priva di modellizzazione informatica, ad una gestione basata sul concetto di attività a rischio radiologico. Verranno evidenziati i passaggi che sono stati necessari per un corretto adattamento dello schema e inoltre verranno presentati i risultati ottenuti. In conclusione si vuole evidenziare come il modello descritto permetta una consistente riduzione del tempo necessario per svolgere le attività di competenza dell'Esperto Qualificato, riducendo inoltre gli errori commessi. Si ha così un guadagno di tempo impiegabile per formare i lavoratori classificati sui rischi che ci sono lavorando con radiazioni ionizzanti e quali possono essere le opportune precauzioni da utilizzare.