NOR (NAND) network design : error-compensation procedures for fan-in and fan-out restricted networks (NETTRA-E1-FIFO and NETTRA-E2-FIFO /

Thesis (M. S.)--University of Illinois at Urbana-Champaign.

A code for zero-one integer linear programming by implicit enumeration, a programming manual for ILLIP.

Issued also as thesis (M.S.) University of Illinois.

Wave group analysis based on Kimura's method /

"September 1987."

MAC3D : numerical model for reservoir hydrodynamics with application to bubble diffusers /

"July 1998."

Beach Profile Analysis System (BPAS) /

"June 1982."

Combined diffraction and reflection by a vertical wedge : PCDFRAC user's manual /

"August 1988."

User's manual for COLMIS : a collection management information system for solid waste management.

"Volume 2 primarily for the systems analyst and data processor, contains flow charts, a computer program, input information and a sample problem."

High velocity jet noise source location and reduction.

"February 22, 1977."

Draft PC-TARE user's guide.

Cover title.

Hydraulic analysis of box culverts.

Errata sheet inserted.

Flood record compilation and frequency plot.

Cover title.: Electronic computer program for flood record compilation and frequency plot (BPR program HY-5) Developed by: U. S. Dept. of Commerce, Bureau of Public Roads.

Os livros brancos e outros documentos de defesa: fontes da difusão e da orientação doutrinária

O presente trabalho tem por finalidade apresentar uma contribuição teórica para os estudos de defesa, tendo como objeto de análise os livros brancos e também demais documentos oficiais relacionados ao tema. Inspirado no realismo neoclássico e nos conceitos estruturalistas empreendeu-se uma pesquisa quantitativa da dinâmica dos processos de elaboração da política declarada de defesa e seu correspondente alinhamento na construção ou desconstrução das estruturas de defesa no Pós-Segunda Grande Guerra, com vistas a compreender os novos caminhos que os sistemas de defesa selecionaram nesse início de século. Os documentos oficiais de defesa surgiram com escopo principal de promover a estabilidade e reduzir as incertezas no ambiente internacional, e pôde ser verificado que a difusão, desses documentos, ocorreu por ondas, durante o período da Guerra Fria, no Pós-Guerra Fria e depois dos atentados de 11 de setembro. A pesquisa também teve por escopo apresentar fatores domésticos e externos que contribuíram ou não para a difusão da documentação e também para a orientação doutrinária de defesa, usando como método de pesquisa o teste de Wald e a técnica implementada por Benoit, Laver e Garry, que desenvolveram uma forma de análise de textos políticos com auxílio de programa de computador, para estimar o posicionamento de cada documento por meio da contagem de palavras. Em que pese à pesquisa ser basicamente quantitativa, foram produzidos dois capítulos essencialmente qualitativos que tiveram o objetivo de prover os instrumentos quantitativos com um necessário arcabouço teórico, sendo feita uma análise mais qualitativa em 52 documentos de defesa e uma discussão teórica entre as principais correntes de pensamento que tratam do tema defesa. E por fim buscou-se atestar a validade desses documentos de defesa quanto aos propósitos que se destinam.

Structural basis and prediction of substrate specificity in protein serine/threonine kinases

The large number of protein kinases makes it impractical to determine their specificities and substrates experimentally. Using the available crystal structures, molecular modeling, and sequence analyses of kinases and substrates, we developed a set of rules governing the binding of a heptapeptide substrate motif (surrounding the phosphorylation site) to the kinase and implemented these rules in a web-interfaced program for automated prediction of optimal substrate peptides, taking only the amino acid sequence of a protein kinase as input. We show the utility of the method by analyzing yeast cell cycle control and DNA damage checkpoint pathways. Our method is the only available predictive method generally applicable for identifying possible substrate proteins for protein serine/threonine kinases and helps in silico construction of signaling pathways. The accuracy of prediction is comparable to the accuracy of data from systematic large-scale experimental approaches.

The abundance of short proteins in the mammalian proteome

Short proteins play key roles in cell signalling and other processes, but their abundance in the mammalian proteome is unknown. Current catalogues of mammalian proteins exhibit an artefactual discontinuity at a length of 100 aa, so that protein abundance peaks just above this length and falls off sharply below it. To clarify the abundance of short proteins, we identify proteins in the FANTOM collection of mouse cDNAs by analysing synonymous and nonsynonymous substitutions with the computer program CRITICA. This analysis confirms that there is no real discontinuity at length 100. Roughly 10% of mouse proteins are shorter than 100 aa, although the majority of these are variants of proteins longer than 100 aa. We identify many novel short proteins, including a dark matter'' subset containing ones that lack detectable homology to other known proteins. Translation assays confirm that some of these novel proteins can be translated and localised to the secretory pathway.