Shoot control of hypernodulation and aberrant root formation in the har1-1 mutant of Lotus japonicus

The har1-1 mutant of Lotus japonicus B-129-S9 Gifu is characterized by two phenotypes: greater than normal nodulation (hypernodulation) and significantly inhibited root growth in the presence of its microsymbiont Mesorhizobium loti strain NZP2235. We demonstrate that the two traits co-segregate, suggesting a single genetic alteration involving developmental pleiotropy. A cross between the mutant and genotype Funakura (with wild-type root and nodule morphology) demonstrated Mendelian recessive segregation of both phenotypes (root and nodule) in 216 F2 individuals. Using DNA-amplification fingerprinting polymorphisms in Gifu har1-1 and Funakura, the mutant locus was positioned between two markers at about 7 and 13 cM distance. Reciprocal hypocotyl grafting of shoots and roots showed that the hypernodulation and reduced root phenotypes are both predominantly controlled by the shoot.

Characterization of the retinoid orphan-related receptor-alpha coactivator binding interface: A structural basis for ligand-independent transcription

The retinoid orphan-related receptor-alpha (RORalpha) is a member of the ROR subfamily of orphan receptors and acts as a constitutive activator of transcription in the absence of exogenous ligands. To understand the basis of this activity, we constructed a homology model of Rill using the closely related TRbeta as a template. Molecular modeling suggested that bulky hydrophobic side chains occupy the RORa ligand cavity leaving a small but distinct cavity that may be involved in receptor stabilization. This model was subject to docking simulation with a receptor-interacting peptide from the steroid receptor coactivator, GR-interacting protein-1, which delineated a coactivator binding surface consisting of the signature motif spanning helices 3-5 and helix 12 [activation function 2 (AF2)]. Probing this surface with scanning alanine mutagenesis showed structural and functional equivalence between homologous residues of RORalpha and TRbeta. This was surprising (given that Rill is a ligand-independent activator, whereas TRbeta has an absolute requirement for ligand) and prompted us to use molecular modeling to identify differences between Rill and TRbeta in the way that the All helix interacts with the rest of the receptor. Modeling highlighted a nonconserved amino acid in helix 11 of RORa (Phe491) and a short-length of 3.10 helix at the N terminus of AF2 which we suggest i) ensures that AF2 is locked permanently in the holoconformation described for other liganded receptors and thus 2) enables ligand-independent recruitment of coactivators. Consistent with this, mutation of RORa Phe491 to either methionine or alanine (methionine is the homologous residue in TRbeta), reduced and ablated transcriptional activation and recruitment of coactivators, respectively. Furthermore, we were able to reconstitute transcriptional activity for both a deletion mutant of Ill lacking All and Phe491 Met, by overexpression of a GAL-AF2 fusion protein, demonstrating ligand-independent recruitment of AF2 and a role for Phe491 in recruiting AF2.

Transcriptional regulation of the sodium-sulfate cotransporter NaSi-1 gene

Inorganic sulfate is one of the most abundant anions in mammalian plasma and is essential for proper cell growth and development, as well as detoxification and activation of many biological compounds. To date, little is understood how physiological levels of sulfate are maintained in the body. Our studies, and of others, have identified the NAS(i)-1 protein to be a functional sulfate transporter in the kidney and intestine, and due to this localization, constitutes a strong candidate gene for maintaining body sulfate homeostasis. Several factors, including hormones and metabolic conditions, have been shown to alter NAS(i)-1 mRNA and protein levels in vivo. In this study, we describe the transcriptional regulation of NaSi-1, with a focus on the mouse NaSi-1 gene (Nas1) that was recently cloned in our laboratory. Vitamin D (1,25-(OH)(2)D-3) and thyroid hormone (T-3) led to an increase in Nas1 promoter activity in OK cells. Mutational analysis of the Nas1 promoter resulted in identification of a direct repeat 6-type vitamin-D-responsive element (DR6 VDRE) at -525 to -508 and an imperfect inverted repeat 0-type T-3 responsive element (IRO T3RE) at -426 to -425 which conferred 1,25-(OH)(2)D-3 and T-3 responsiveness respectively. These findings suggest for vitamin D and thyroid hormone regulation of NaSi-1, may provide important clues to the physiological control of sulfate homeostasis.

Formas de aplicação de inoculante e seus efeitos sobre a nodulação da soja

Atualmente, tem-se difundido a aplicação de inoculante no sulco de semeadura na cultura da soja, mas há poucas informações que dão suporte a essa prática e comprovam sua eficiência em diferentes ambientes manejados sob plantio direto. Este trabalho teve como objetivo avaliar a viabilidade da aplicação de inoculantes na cultura da soja, via semente e sulco de semeadura, em solo já cultivado ou não com soja. Foram realizados dois experimentos em campo a partir de dezembro de 2004 em Latossolo Vermelho-Amarelo, seguindo o mesmo método e tratamentos, porém em dois locais distintos, com ou sem cultivo anterior de soja. Foram testados oito tratamentos: (1) inoculação via semente (inoculante + fungicida + micronutriente); (2) sem inoculação (fungicida + micronutriente); (3) testemunha (semente pura, sem tratamento); (4) aplicação no sulco-dose 1 (dose do inoculante recomendada no sulco); (5) aplicação no sulco-dose 2 (duas vezes a dose recomendada no sulco); (6) aplicação no sulco-dose 3 (três vezes a dose recomendada no sulco); (7) sulco-dose 1 + inoculação via semente; e (8) adubação com N (200 kg ha-1 N). Foram avaliados massa de matéria seca de nódulos e número de nódulos totais e nódulos viáveis e não-viáveis aos 30 e 75 dias após emergência. A melhor nodulação foi obtida com aplicação de inoculante + fungicida + micronutriente via semente no solo ainda não cultivado. No solo previamente cultivado com soja, destacaram-se os tratamentos uma e duas vezes a dose do inoculante no sulco. Menores valores de massa seca de nódulos na soja foram obtidos no tratamento com adubação mineral. A aplicação via sulco do inoculante mostrou-se uma prática viável, em razão da semelhança dos resultados obtidos com a aplicação tradicional via semente.

Medições de dose no cristalino e na tiróide em tomografia computorizada: projecto

Mestrado em Radiações Aplicadas às Tecnologias da Saúde. Área de especialização: Protecção Contra Radiações

Avaliação da dose absorvida na tiróide, em cintigrafias com 123I e Na99mTcO4 utilizando modelos biocinéticos e métodos de Monte Carlo

Mestrado em Radiações Aplicadas às Tecnologias da Saúde. Área de especialização: Protecção contra Radiações

Quantificação da eficiência da proteção da tiróide no exame de ortopantomografia

Mestrado em Radiações Aplicadas às Tecnologias da Saúde - Área de especialização: Proteção Contra Radiações

Efeito da combinação de antibióticos e sinvastatina sobre microrganismos de interesse endodôntico e na expressão de marcadores odontoblásticos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influência da espessura do substrato dental sobre a eficácia clareadora e citotoxicidade de diferentes protocolos de clareamento

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Biodisponibilidade ambiental de iodo e iodúrias em crianças de Santa Maria e São Miguel, Açores

Dissertação de Mestrado, Ciências Biomédicas, 14 de Outubro de 2015, Universidade dos Açores.

Frequency of TERT promoter mutations in human cancers

Reactivation of telomerase has been implicated in human tumorigenesis, but the underlying mechanisms remain poorly understood. Here we report the presence of recurrent somatic mutations in the TERT promoter in cancers of the central nervous system (43%), bladder (59%), thyroid (follicular cell-derived, 10%) and skin (melanoma, 29%). In thyroid cancers, the presence of TERT promoter mutations (when occurring together with BRAF mutations) is significantly associated with higher TERT mRNA expression, and in glioblastoma we find a trend for increased telomerase expression in cases harbouring TERT promoter mutations. Both in thyroid cancers and glioblastoma, TERT promoter mutations are significantly associated with older age of the patients. Our results show that TERT promoter mutations are relatively frequent in specific types of human cancers, where they lead to enhanced expression of telomerase.

PET/CT com 18-fluor-fluorodeoxiglucose no seguimento do melanoma maligno cutâneo

Introdução – O melanoma maligno cutâneo (MMC) é considerado uma das mais letais neoplasias e no seu seguimento recorre-se, para além dos exames clínicos e da análise de marcadores tumorais, a diversos métodos imagiológicos, como é o exame Tomografia por Emissão de Positrões/Tomografia Computorizada (PET/CT, do acrónimo inglês Positron Emission Tomography/Computed Tomography) com 18fluor-fluorodeoxiglucose (18F-FDG). O presente estudo tem como objetivo avaliar a utilidade da PET/CT relativamente à análise da extensão e à suspeita de recidiva do MMC, comparando os achados imagiológicos com os descritos em estudos CT. Metodologia – Estudo retrospetivo de 62 estudos PET/CT realizados em 50 pacientes diagnosticados com MMC. Excluiu-se um estudo cujo resultado era duvidoso (nódulo pulmonar). As informações relativas aos resultados dos estudos anatomopatológicos e dos exames imagiológicos foram obtidas através da história clínica e dos relatórios médicos dos estudos CT e PET/CT. Foi criada uma base de dados com os dados recolhidos através do software Excel e foi efetuada uma análise estatística descritiva. Resultados – Dos estudos PET/CT analisados, 31 foram considerados verdadeiros positivos (VP), 28 verdadeiros negativos (VN), um falso positivo (FP) e um falso negativo (FN). A sensibilidade, especificidade, o valor preditivo positivo (VPP), o valor preditivo negativo (VPN) e a exatidão da PET/CT para o estadiamento e avaliação de suspeita de recidiva no MMC são, respetivamente, 96,9%, 96,6%, 96,9%, 96,6% e 96,7%. Dos resultados da CT considerados na análise estatística, 14 corresponderam a VP, 12 a VN, três a FP e cinco a FN. A sensibilidade, especificidade, o VPP e o VPN e a exatidão da CT para o estadiamento e avaliação de suspeita de recidiva no MMC são, respetivamente, 73,7%, 80,0%, 82,4%, 70,6% e 76,5%. Comparativamente aos resultados CT, a PET/CT permitiu uma mudança na atitude terapêutica em 23% dos estudos. Conclusão – A PET/CT é um exame útil na avaliação do MMC, caracterizando-se por uma maior acuidade diagnóstica no estadiamento e na avaliação de suspeita de recidiva do MMC comparativamente à CT isoladamente.

Sedimentation pelagique et encroûtements cryptalgaires: les calcaires gremeleux du Carixien portugais

In Portugal, Carixian is generally represented by alternative layers of marly limestones characterized by nodule and lumpy levels. These layers are particularly developped [show preferential development] on passage areas to a sedimentary basin, particularly along the slope of tilted blocks between the Meseta and Berlenga's horst. This facies is included in the range of the «nodular limestone» and of the «ammonitico-rosso». Limestones are radiolaria micrites with fragments of pelagic organisms (ammonoids, thin shelled gastropods). These layers can be affected by intensive bioturbation (Brenha) which is responsible for dismantlement, specially where the initial thickness does not exceed a few centimetres. This process can lead to the isolation of residual nodules (Brenha, São Pedro de Muel, Peniche) which can be mobilised by massive sliding (Peniche). The isolated elements, shell fragments or residual nodules, can also be incrustated, thus developing oncolitic cryptalgal structures. At Brenha the lump structure developed progressively into a sequence overlapping the normal sedimentary one (thick limestone beds alternating with bituminous shales). Cryptalgal structures correspond to rather unstable environment conditions on mobile margins. These structures are known in deep pelagic sediments corresponding to well defined events of the geodynamic evolution (end of the initial rifting). Cryptalgal accretions disappear towards the sedimentary basin, and the nodular levels are less important. In the articulation areas with the Tomar platform, small mounds and cupules (Alcabideque) developed within the alternating marly-limestone levels. They represent the so called «mud mounds» of metric dimensions. The upper part of these «mud mounds» is hardened, showing track remains and supporting some brachiopods and pectinids. Hence the lumpy facies of Portugal is included among the range of sedimentaty environments and can be used as «geodynamic tracer».