New genes of Xanthomonas citri subsp citri involved in pathogenesis and adaptation revealed by a transposon-based mutant library

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Proteome of the phytopathogen Xanthomonas citri subsp citri: a global expression profile

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Molecular characterization of bacterial populations of different soils

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Relações filogenéticas e diversidade de isolados de Guignardia spp oriundos de diferentes hospedeiros nas regiões ITS1-5,8S-ITS2

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Generalized linear mixed models for the genetic evaluation of binary reproductive traits: a simulation study

The objective of this study was to evaluate the use of probit and logit link functions for the genetic evaluation of early pregnancy using simulated data. The following simulation/analysis structures were constructed: logit/logit, logit/probit, probit/logit, and probit/probit. The percentages of precocious females were 5, 10, 15, 20, 25 and 30% and were adjusted based on a change in the mean of the latent variable. The parametric heritability (h²) was 0.40. Simulation and genetic evaluation were implemented in the R software. Heritability estimates (ĥ²) were compared with h² using the mean squared error. Pearson correlations between predicted and true breeding values and the percentage of coincidence between true and predicted ranking, considering the 10% of bulls with the highest breeding values (TOP10) were calculated. The mean ĥ² values were under- and overestimated for all percentages of precocious females when logit/probit and probit/logit models used. In addition, the mean squared errors of these models were high when compared with those obtained with the probit/probit and logit/logit models. Considering ĥ², probit/probit and logit/logit were also superior to logit/probit and probit/logit, providing values close to the parametric heritability. Logit/probit and probit/logit presented low Pearson correlations, whereas the correlations obtained with probit/probit and logit/logit ranged from moderate to high. With respect to the TOP10 bulls, logit/probit and probit/logit presented much lower percentages than probit/probit and logit/logit. The genetic parameter estimates and predictions of breeding values of the animals obtained with the logit/logit and probit/probit models were similar. In contrast, the results obtained with probit/logit and logit/probit were not satisfactory. There is need to compare the estimation and prediction ability of logit and probit link functions.

Structural characteristics and forage mass of Tifton 85 pastures managed under three post-grazing residual leaf areas

The experiment was carried out on Cynodon spp cv. Tifton 85 pastures grazed by sheep under rotational stocking, with the objective of evaluating the structural characteristics as well as the forage mass of the pastures subjected to three grazing intensities in successive cycles. Treatments were composed of three residual leaf area indices (rLAI; 2.4; 1.6 and 0.8), allocated in completely randomized blocks with seven replications, totaling 21 experimental units. Tiller population density, pasture height, leaf area index, forage morphological composition and pasture forage mass were evaluated. The rLAI modified the tiller population density, which increased linearly with decrease in the rLAI of the pastures. Dry masses of leaf blade, stem and dead material were inferior when the rLAI imposed were lower, which resulted in differentiated forage production among the treatments. Tifton 85 pastures grazed by sheep in rotational stocking under tropical conditions with different rLAI show a modified sward structure over successive grazing cycles, mainly by alteration in the height and LAI of the plants at pre-grazing and by light interception post-grazing, which change the tiller population density. The residual leaf area index of 1.6 is the most suitable for pasture management for being equivalent to the heights of entrance and exit of animals on and from paddocks of 33 and 19 cm, respectively, which avoid great accumulation of dead material and excessive stem elongation, in addition to ensuring tillering in the sward.

Desempenho de bovinos confinados alimentados com dietas à base de farelo de algodão, uréia ou amiréia

O objetivo deste experimento foi avaliar o desempenho de bovinos em confinamento alimentados com rações suplementadas com concentrados protéicos à base de farelo de algodão (AL), uréia (UR) ou amiréia (AM), tendo como volumoso silagem de milho. O confinamento teve duração de 80 dias. As rações foram compostas mantendo a proporção volumoso:concentrado no nível de 63:37, com aproximadamente 13% PB. Não se constataram diferenças quanto ao ganho de peso diário (GDP) durante o período experimental total entre os tratamentos AL, UR ou AM (1,14; 1,17; e 1,23 kg/anim. dia), ou na ingestão de MS em % PV (2,63; 2,60; e 2,60% PV), em g/kg0,75 dia (136,19; 134,74; e 134,81) ou kg/anim. dia (9,42; 9,35; e 9,40), respectivamente. Os valores de ingestão de PB foram de 1,28; 1,24; e 1,34 kg de PB/anim. dia e de 18,54; 17,86; e 19,24 g/kg0,75 dia para os tratamentos AL, UR ou AM, não diferindo entre si. Valores obtidos para conversão alimentar da matéria seca foram de 8,41; 8,01; e 7,67 kg MSI/kg GPD e para conversão protéica, 1,15; 1,06; e 1,09 kg PBI/kg GPD, respectivamente, para os tratamentos AL, UR e AM, que foram semelhantes.

Avaliação da digestibilidade de nutrientes, em bovinos, de alguns alimentos concentrados pela técnica de três estádios

Este trabalho foi realizado com o objetivo de determinar a digestibilidade de componentes nutricionais não-degradados no rúmen por meio da técnica de três estádios. Foram avaliados oito alimentos concentrados: grão de girassol integral (GI), torta de girassol com uma (TG1x) e com duas passagens pela prensa (TG2x), grão de soja integral (SI) e parcialmente desengordurado (SD), farelo de soja (FS), farelo de gérmen de milho desengordurado (GM) e concentrado comercial (CC) com 36% de PB. Os alimentos foram incubados no rúmen de bovinos por 33, 20 e 12 horas, correspondendo a taxas de passagens de 3, 5 e 8%/h, respectivamente. Os resíduos não-degradados no rúmen foram submetidos à digestão com solução de pepsina com pH 1,9 durante 1 hora e, posteriormente, em solução de pancreatina com pH 7,8 durante 24 horas, ambas a 38ºC. Nos resíduos desta incubação, foram determinados a MS, MO e os teores de nitrogênio total. A digestibilidade intestinal in vitro da MS não degradada no rúmen, considerando taxa de passagem de 5%/h, variou de 7,88 a 37,72%, sendo que o CC e a SI apresentaram as maiores digestibilidades. A digestibilidade da PB não-degradada no rúmen variou de 13,67 a 81,76% para mesma taxa de passagem. O GI apresentou a menor e o CC e o FS as maiores digestibilidades da PB. A digestibilidade da MO variou de 7,93 a 37,14% para a mesma taxa de passagem, sendo que o GI foi o menos digestível e o CC e a SI, os mais digestíveis. Os menores valores para a proteína digestível não degradável no rúmen (PNDR D), em g/kgMS, foram obtidos nas tortas de girassol com uma ou duas passagens, sugerindo que estes alimentos não devem ser empregados quando se deseja maiores teores de PNDR D.

Desempenho de poedeiras comerciais submetidas ou não a diferentes métodos de debicagem

Foram utilizadas 288 aves da linhagem Isa Babcock avaliando o efeito da debicagem leve, severa e da não debicagem sobre o desempenho de poedeiras, distribuídas em delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 3x3 (primeira debicagem x segunda debicagem), com quatro repetições de oito aves cada. A primeira debicagem foi realizada aos nove dias e a segunda debicagem às 12 semanas. Avaliou-se consumo de ração, peso das aves, percentagem de postura e conversão alimentar em quatro períodos de 28 dias cada. de acordo com os resultados, aves com debicagem severa apresentaram menor consumo de ração e menor percentagem de postura(P<0,05).

Uso da cutina na estimativa das digestões total e parcial de alguns componentes de rações contendo diferentes fontes de nitrogênio, em bovinos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Algoritmos genéticos e processamento paralelo aplicados à definição e treinamento de redes neurais perceptron de múltiplas camadas

ln this work, it was deveIoped a parallel cooperative genetic algorithm with different evolution behaviors to train and to define architectures for MuItiIayer Perceptron neural networks. MuItiIayer Perceptron neural networks are very powerful tools and had their use extended vastIy due to their abiIity of providing great resuIts to a broad range of appIications. The combination of genetic algorithms and parallel processing can be very powerful when applied to the Iearning process of the neural network, as well as to the definition of its architecture since this procedure can be very slow, usually requiring a lot of computational time. AIso, research work combining and appIying evolutionary computation into the design of neural networks is very useful since most of the Iearning algorithms deveIoped to train neural networks only adjust their synaptic weights, not considering the design of the networks architecture. Furthermore, the use of cooperation in the genetic algorithm allows the interaction of different populations, avoiding local minima and helping in the search of a promising solution, acceIerating the evolutionary process. Finally, individuaIs and evolution behavior can be exclusive on each copy of the genetic algorithm running in each task enhancing the diversity of populations

Economic valuation of collecting water to billing in the aspersion irrigated bean in the no tillage system and conventional crop

The law's project n.676/2000 approved the collecting of billing water for farmers in a maximum foreseen value of US$ 0.01 m(-3) of extracted water in the São Paulo State. As the irrigated agriculture is the activity that consumes more water, the farmers profitability can be affected. This work was to analyze the economic impact of billing water in the aspersion irrigated bean crop to consider the system of conventional production and no tillage system in the Paranapanema municipal district, São Paulo State, Brazil. The indicators used to analyze the economic results were unit variable cost, market price and unit profitability. The results showed that for the aspersion irrigated bean crop in conventional system, the participation of cost to the recourse water in cost variable totality was of 2.5% and in no tillage system the participation was of 2.2%. The fall of profitability just the billing water in conventional crop system and in no tillage system was US$ 0.01 kg(-1).

Avaliação de diferentes tipos de atmosferas modificadas na vida útil de carambolas minimamente processadas

Este trabalho teve por objetivo a avaliação da vida útil potencial de carambolas cv. Golden Star, minimamente processadas, armazenadas em diferentes tipos de embalagens plásticas, para a concepção da atmosfera modificada. Os frutos colhidos fisiologicamente maturos apresentaram coloração verde-amarelada, sólidos solúveis (SS) médios de 6,8 ºBrix e massa média de 185 g. Antes da aplicação dos tratamentos, os frutos foram selecionados, higienizados em solução de hipoclorito de sódio (NaOCl) a 100 mg. L-1, resfriados por 12 horas a 15 ± 0,5 °C, seccionados transversalmente, sendo então novamente higienizados em solução de NaOCl a 10 mg.L-1, por 3 minutos. em seguida, os pedaços em forma de estrelas foram acondicionados em bandejas rígidas de poliestireno, com capacidade para 250 g, e revestidas com os seguintes materiais: T1: filme plástico perfurado de polietileno de baixa densidade (PEBD), de 0,006 mm; T2: filme plástico poliolefínico com antiembassamento da Dupont® (AGF), de 0,015 mm; T3: filme plástico poliolefínico da Dupont® (HF), de 0,015 mm; T4: filme plástico de PEBD, de 60 µm; T5: filme plástico de PEBD, de 80 µm; T6: filme plástico de polipropileno (PP), de 22 µm, e T7: bandeja rígida de polietileno tereftalato (PET), com capacidade para 500 mL, com tampa do mesmo material. As embalagens foram então armazenadas em câmara frigorífica a 12 ± 0,5 °C e 90 ± 3% de U.R, por 18 dias. Observou-se que não houve diferença significativa quanto aos sólidos solúveis (SS) e acidez titulável (AT). O maior número de microrganismos e valor de pH foram observados nos frutos embalados nos filmes plásticos de PEBD de 0,006 mm, AGF e HF de 0,015 mm da Dupont®. Entretanto, os frutos acondicionados nas embalagens PET apresentaram o maior teor de ácido ascórbico. da mesma forma, somente nas embalagens PET é que se conseguiu modificação atmosférica eficiente do ponto de vista da manutenção dos atributos de qualidade durante o AR. Assim, esse tratamento proporcionou adequado controle microbiológico e manutenção das características de qualidade por 18 dias para as carambolas minimamente processadas.

Caracterização físico-química, bioquímica e funcional da jabuticaba armazenada sob diferentes temperaturas

O presente trabalho teve como objetivo avaliar a qualidade pós-colheita de jabuticabas submetidas a diferentes temperaturas de armazenamento refrigerado (AR). Após a colheita, os frutos fisiologicamente maduros foram acondicionados em bandejas de poliestireno expandido (EPS), revestidas por filme plástico de polietileno de baixa densidade (PEBD) e armazenados sob refrigeração a 0; 3; 6; 9 e 12 ± 1ºC e U.R. 87 ± 2%, sendo avaliados a cada 5 dias. Os frutos foram avaliados quanto à perda de massa, atividade respiratória, pH, acidez titulável, sólidos solúveis, ácido ascórbico, textura, pectina total e solúvel, atividade da enzima polifenoloxidase (PFO), compostos fenólicos e atividade antioxidante. Para frutos refrigerados a 9 e 12ºC, o pico respiratório atrasou em relação aos demais tratamentos, além de apresentarem as menores taxas respiratórias. O teor de sólidos solúveis aumentou com o tempo de armazenamento para todas as temperaturas, contudo, em 9 e 12ºC, esse aumento foi em menor proporção. A firmeza e o teor de ácido ascórbico também foram superiores nos frutos armazenados a 9 e 12ºC, enquanto os contéudos de pectina solúvel foram menores. Observou-se a diminuição da atividade da enzima PFO ao longo dos 30 dias do AR, independentemente da temperatura utilizada; entretanto, os menores valores foram encontrados nos frutos mantidos a 9 e 12ºC. Os frutos armazenados a 12ºC apresentaram os maiores conteúdos de compostos fenólicos totais e a maior atividade antioxidante ao final do experimento. Nesse sentido, a temperatura de 12ºC foi a mais efetiva na manutenção da qualidade pós-colheita das jabuticabas.

Radiação gama e atmosfera modificada passiva na qualidade de goiabas 'Pedro Sato'

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da irradiação gama associada à atmosfera modificada passiva na qualidade pós-colheita de goiabas 'Pedro Sato', verificando suas características físico-químicas. Foram utilizadas goiabas provenientes da região de Vista Alegre do Alto-SP,Brasil. Após a colheita, as goiabas foram imediatamente transportadas ao Laboratório de Frutas e Hortaliças, pertencente ao Departamento de Gestão e Tecnologia Agroindustrial, da Faculdade de Ciências Agronômicas - UNESP - Câmpus de Botucatu-SP, onde foram armazenadas a 10ºC e 90-95%UR, em câmara frigorífica, por 28 dias. Os tratamentos foram: controle 1 (sem embalagem e sem irradiação); controle 2 (embalagem de poliestireno (PS) + polietileno de baixa densidade (PEBD) e sem irradiação); tratamento 1 (PS+PEBD e 0,2kGy); tratamento 2 (PS+PEBD e 0,6kGy), e tratamento 3 (PS+PEBD e 1,0kGy). As análises realizadas foram: firmeza, sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT) e índice de maturação. Foi utilizado o delineamento inteiramente casualizado, com esquema fatorial 5 x 5 (tratamento x tempo). Concluiu-se que as altas doses de irradiação promoveram efeito negativo nas características físico-químicas da goiaba 'Pedro Sato', e que apenas a menor dose utilizada (0,2kGy) associada à atmosfera modificada conservou frutos com maior qualidade e aceitabilidade, indicado por maiores índice de maturação e teor de sólidos solúveis obtidos.