Analyses of the community compositions of root rot pathogenic fungi in the soybean rhizosphere soil

Soybean ( Glycine max [L.] Merr.) root rot is an important disease of soybean under continuous cropping, and root rot is widely distributed throughout the world. This disease is extremely harmful, and it is difficult to prevent and control. The study aimed to elucidate the composition of root rot pathogenic fungal communities in the continuous cropping of soybean. In this study, we employed PCRDGGE technology to analyze the communities of root rot pathogenic fungi in soybean rhizosphere soil subjected to continuous cropping during a season with a high incidence of root rot in Heilongjiang province, China, the main soybean producing area in China. The results of 13 DGGE bands were analyzed by phylogenetic revealed that the predominant root rot pathogenic fungi in rhizosphere soil in the test area were Pythium ultimum and Fusarium species. The results of cluster analysis showed that the duration of continuous cropping, the soybean variety and the plant growth stage all had significant effects on the diversity of root rot pathogenic fungi in rhizosphere soil.

Chemical profile and antifungal potential of essential oils from leaves and flowers of Salvia algeriensis (Desf.): A comparative study

Salvia is a plant genus widely used in folk medicine in the Mediterranean area since antiquity. A large number of Salvia essential oils have been reported against diverse microorganisms. In the current study, chemical composition of essential oils from leaves and flowers of Salvia algeriensis (Desf.) was determined using gas chromatography-electron impact mass spectrometry (GC-EIMS) as well as their antifungal activity against phytopathogenic fungi Alternaria solani and Fusarium oxysporum exploring disk method. The GC-EIMS analysis identified 59 compounds (84.8%) in the essential oil obtained from leaves of S. algeriensis. Its major constituents were benzaldehyde (9.7%), eugenol (8.7%) and phenylethyl alcohol (8.4%). In flowers oil, 34 compounds (92.8%) were detected. The main ones were viridiflorol (71.1%) and globulol (8.6%). The essential oil obtained from leaves exhibited the highest antifungal activity, where the effective dose inhibiting 50% of mycelial fungal (ED50) against A. solani was 0.90 μL mL-1 with minimum inhibitory concentration (MIC) equal to 2 μL mL-1, whereas the ED50 and MIC in F. oxysporum culture was 1.84 μL mL-1 and 3 μL mL-1 respectively. The mycelial inhibition by flowers oil varies from 1.77 μL mL-1 (ED50) with A. solani culture (MIC 6.5 μL mL-1) to the lowest effect recorded (ED50 3.00 μL mL-1 and MIC 9.33 μL mL-1) against F. oxysporum. To our best knowledge, this is the first report on S. algeriensis, their leaves oil can constitute an alternative biocontrol against phytopathogenic fungi commonly controlled by chemical fungicides.

EFFECT OF SORGHUM SEED TREATMENT IN BURKINA FASO VARIES WITH BASELINE CROP PERFORMANCE AND GEOGRAPHICAL LOCATION

Sorghum [ Sorghum bicolor (L.) Moench] is a major subsistence crop throughout the region of Sahel. With the exception of seeds and labour, no agricultural inputs are in general used in sorghum production since the grain is of a relatively low commercial value and the risk of losing the crop to drought, flooding, etc. is substantial. A meta-analysis of 118 field experiments was carried out to identify conditions in which two protective seed treatments could support a yield increase of sorghum in Burkina Faso. The two treatments were: i) treatment with the pesticide Calthio C (thiram and chlorpyrifos) and ii) treatment with an aqueous extract from the plant Eclipta alba . Both treatments were found to produce a yield increase (Medians: Calthio C +199 kg ha-1, P<2x10-9; E. alba +90.5 kg ha-1 P<4x10-4). A strong relative effect of Calthio C on yield (+36%) was found for field experiments with a low baseline yield. A strong relative effect of E. alba extract on yield (+22%) was found for experiments with a low baseline of emergence. ANOVA of the 118 field tests showed that baseline crop performance (yield and emergence) and the effect of seed treatments were strongly linked to geographical location (twelve different villages included). Roots from sorghum in the village showing the strongest effect of both seed treatments (>40% yield increase) were found to carry a comparatively high load of the infectious ascomycetes: Fusarium equiseti , Macrophomina phaseolina and Curvularia lunata .

Optimização das condições de cultura da Saccharomyces Cerevisiae e de outros fungos produtores de oligossacáridos

Este estudo envolve o controlo e a optimização das condições de culturas dos microrganismos: Saccharomyces cerevisiae CCMI 396, S. cerevisiae v. lab., Aspergillus oryzae CCMI 125, Aspergillus japonicus CCMI 443, Fusarium oxysporum CCMI 866, Aspergillus niger CCMI 296 com vista à produção de oligossacáridos. Determinaram-se os parâmetros característicos das culturas de duas diferentes estirpes de Saccharomyces com diferentes fontes de carbono e em diferentes condições ambientais. O perfil de crescimento da S. cerevisiae CCMI 396 foi semelhante nos diferentes meios de cultura estudados, sendo a velocidade específica de crescimento mais elevada no meio com glucose a pH 5 e a 30°C (0,36h-1). A S. cerevisiae v. lab. Teve velocidade específica de crescimento idêntica nas mesmas condições da outra estirpe, no entanto, o perfil de crescimento foi diferente nos outros meios de cultura. Estudou-se o efeito da adição de sumo de laranja ou de tomate ao meio de cultura com sacarose e avaliou-se a evolução glucídica no meio de cultura durante o ensaio por HPLC com detector RI. Determinou-se a frutosiltransferase no sobrenadante e na fracção intracelular e determinou-se a evolução dos oligossacáridos. Numa segunda parte deste trabalho efectuaram-se culturas dos quatro fungos filamentosos com vista a avaliar a capacidade de produção, nomeadamente, de fruto­oligassacáridos. Os resultados mostraram que a espécie Aspergillus japonicus CCMI 443 originou, nas mesmas condições de cultura, valores superiores, sendo a percentagem de produção FOStotais/GluCtotais de 61% para as enzimas intracelulares e 40% para as enzimas no sobrenadante. ABSTRACT; This study involves control and optimization of the cultures of microorganisms: Saccharomyces cerevisiae CCMI 396, S. cerevisiae v. lab., Aspergillus oryzae CCMI 125, Aspergillus japonicus CCMI 443, Fusarium oxysporum CCMI 866, Aspergillus níger CCMI 296 for oligosaccharides production. Were determined the parameters characteristic of the cultures of two different strains of Saccharomyces with different sources of carbon and in different environmental conditions. The growth profile of S. cerevisiae CCMI 396 was similar in different cultures media, but the highest specific growth was obtained in a medium with glucose, pH 5, at 30°C (0.36h-1). S. cerevisiae v. lab. had similar growth profile in a medium with glucose but with others culture media was different. We studied the effect of adding orange juice or tomato to the culture medium with sucrose and evaluated the evolution glucidic in the culture medium during the test by HPLC with RI detector. Fructosyltransferase was determined in the extracellular and the intracellular fractions and determined the evolution of oligosaccharides. ln the second part of this work were carried out cultures of four filamentous fungi in order to assess production capacity, in particular, fructoligosaccharides. The results showed that the specie Aspergillus japonicus CCMI 443 originated in the same culture conditions, higher values and the percentage of production FOStotal/Guctotal of 61% for intracellular enzymes and 40% for extracellular enzymes.

Vicilinas de sementes de leguminosas selvagens:purificação, caracterização, efeito de deletério e mecanismo de ação para bruquídeos e para fungos fitopatogênicos

Globulins fractions of legume seeds of Crotalaria pallida, Erytrina veluntina and Enterolobium contortisiliquum were isolated and submitted to assays against serine, cysteine and aspartic proteinases, as also amylase present in midgut of C. maculatus and Z. subfasciatus. Hemagglutination assays indicated presence of a lectin in E. veluntina globulin fractions. This lectin had affinity to human erythrocytes type A, B and O. Vicilins were purified by chromatography on Sephacryl S-300 followed of a chromatography on Sephacryl S-200, which was calibrated using protein markers. Vicilins from C. pallida (CpV) and E. veluntina (EvV) seeds had a molecular mass of 124.6 kDa and E. contortisiliquum a molecular mass of 151kDa. Eletrophoresis in presence of SDS showed that CpV was constituted by four subunities with apparent molecular mass of 66, 63, 57 and 45 kDa, EvV with three subunities with apparent molecular mass of 45kDa and EcV four subunities, two with 37.1 kDa and two with 25.8 kDa. Non denaturantig eletrophoresis displayed single bands with high homogeneity, where CpV had lower acidic behavior. All vicilins are glycoproteins with carbohydrate contents at 1 to1.5%. Bioassays were done to detect deleterious effects of vicilins against C. maculatus and Z. subfasciatus larvae. CpV, EvV and EcV exhibited a WD50 of 0.28, 0.19 and 1.03%; LD50 0.2, 0.26, and 1.11% respectively to C. maculatus. The dose responses of CpV, EvV and EcV to Z. subfasciatus were: WD50 of 0.12, 0.14, 0.65% and LD50 of 0.09, 0.1, and 0.43% respectively. The mechanism of action of these proteins to bruchids should be based on their properties of bind to chitin present in mid gut of larvae associated with the low digestibility of vicilin. In assays against phytopatogenous fungus, only EcV was capable of inhibit F. solani growth at concentrations of 10 and 20 µg and its action mechanism should be also based in the affinity of EcV to chitin present in the fungi wall

Incidência de fungos em pós-colheita de banana 'Prata anã'(Musa AAB)

Este trabalho teve por objetivo determinar a ocorrência e a freqüência de fungos em banana 'Prata anã' e elucidar o agente causal das podridões em pós-colheita de frutos provenientes do norte de Minas Gerais. Dois métodos de isolamento foram adotados: diluição em placas, a partir da lavagem de frutos verdes, e direto de frutos maduros. Os fungos Colletotrichum musae, Trichoderma harzianum, Fusarium equisetii, Penicillium sp. Aspergillus parasiticus, Trichothecium roseum, Colletotrichum acutatum, Alternaria sp., Cladosporium musae e Curvularia lunata foram os mais freqüentemente associados aos frutos. A patogenicidade desses fungos foi testada pela substituição de discos da casca de frutos verdes por discos de micélio. Colletotrichum musae apresentou área média lesionada em torno do ponto de inoculação igual a 5,8 cm², enquanto para os demais fungos testados não passou de 1,50 cm². Os resultados mostraram que C. musae é o agente primário das podridões dos frutos examinados com 100 % de incidência e os demais fungos limitaram-se a necrosar os ferimentos em torno do ponto de inoculação. O modo de infecção latente, causada por C. musae, parece favorecer, primeiramente, a colonização interna dos tecidos e, posteriormente, a ação dos fungos oportunistas, que aceleram as podridões nos frutos e na coroa.

Pseudomonas fluorescentes provenientes da rizosfera de solanáceas no controle de Ralstonia solanacearum em tomateiro

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2015.

Intoxicaciones por plantas y micotoxinas en rumiantes diagnosticadas en Uruguay

Resumen Las intoxicaciones por plantas y micotoxinas ocasionan importantes pérdidas económicas en países pecuarios, principalmente por muertes de animales y mermas en la producción. Este trabajo fue realizado con el propósito de brindar al veterinario que actúa en el diagnóstico de enfermedades de animales productivos, información breve y accesible sobre las intoxicaciones por plantas y micotoxinas diagnosticadas en rumiantes de Uruguay. Para llevar a cabo el mismo se utilizaron como fuentes bibliográficas: revistas científicas arbitradas, tesis de grado, libros y comunicaciones en congresos, jornadas nacionales e internacionales. Se encontraron 37 géneros y 45 especies de plantas tóxicas, distribuidos en 20 familias botánicas. En cuanto a los hongos toxicogénicos, se hallaron 13 especies pertenecientes a 9 géneros de 6 familias diferentes. Entre las plantas diagnosticadas, la familia Asteraceae (Compositae) cuenta con la mayor cantidad de especies tóxicas, seguida por Gramineae, Solanaceae y Fabaceae (Leguminoseae). Los principales géneros de hongos toxicogénicos Aspergillus, Penicillium, Fusarium y Claviceps han sido diagnosticados en el país. Desde el punto de vista patológico, las plantas y micotoxinas hepatotóxicas resultaron ser las más numerosas. La información presentada en las tablas, permitirá a los veterinarios un fácil abordaje en esta temática

Óleos essenciais e extratos vegetais no controle de fitopatógenos de grãos de soja.

A utilização de sementes sadias é um importante método para diminuir a ocorrência de doenças desde o inicio de seu cultivo. Uma das alternativas ao uso de agrotóxicos é a utilização de óleos essenciais e extratos de plantas que possuam propriedades tóxicas aos fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de óleos essenciais e extratos hidroalcoólicos de plantas medicinais na sanidade e germinação de sementes de soja. Os óleos essenciais e os extratos hidroalcoólicos foram diluídos em água destilada, na concentração de 2 mg/mL para os extratos e 20% para os óleos essenciais. Em seguida, as sementes foram pulverizadas com os tratamentos e secas a sombra durante 4 horas em temperatura ambiente (25ºC). Os tratamentos utilizados foram: T1=testemunha (água destilada); T2 = óleo essencial de gengibre; T3 = óleo essencial de limão Taiti; T4 = extrato de pariparoba e T5 = extrato de penicilina. Os testes de germinação e sanidade foram realizados segundo as Regras para Análises de Sementes (RAS). Os resultados obtidos no teste de germinação demonstraram que o percentual de germinação inicial das sementes não tratadas (4%) encontrava-se muito abaixo dos níveis recomendados pelas RAS (80%), não tendo como avaliar a interferência dos tratamentos na germinação. Em função deste resultado, foi realizado o teste de sanidade visando o tratamento de grãos. O óleo essencial de gengibre apresentou uma redução da incidência de 75% de Cladosporium sp; Rhizopus sp.; Fusarium spp. quando comparado à testemunha. Pode-se concluir que o óleo essencial de gengibre na concentração de 20% apresenta atividade positiva no controle de Cladosporium sp, Rhizopus sp e Fusarium spp em grãos de soja.

Avaliação probabilística do risco de giberela do trigo considerando a influencia do ENOS.

A giberela é uma importante doença na cultura do trigo cujas epidemias ocorrem sob a influência marcante de condições ambientais específicas durante o florescimento. Neste trabalho, a influência do fenômeno El Nino/Oscilação Sul (ENOS) sobre o risco de epidemias da giberela do trigo, em Passo Fundo, RS, estimado com modelos de simulação, foi avaliada via abordagem de anos análogos. Foi utilizada uma série local histórica (1957 a 2006) de dados meteorológicos para estimar um índice de risco de giberela (IRG) para diferentes datas de plantio (1 a 30/06) nos 50 anos da série. Para quantificar a influência do ENOS, foram comparadas medianas e funções probabilidade de excedância (FPE) do IRG (Prob(IRG>y)para três fases do ENOS (quente, fria e neutra) nos anos da série, utilizando métodos não paramétricos. Foi observado um efeito pronunciado do ENOS, principalmente para a fase fria, onde o risco estimado de epidemias moderadas ou severas foi nulo para todas as datas de plantio. Nas demais fases, o referido risco variou de 0,10 a 0,25.

Registro de Meloidogyne enterolobii em mudas de goiabeiras formadas em viveiros de Petrolina, PE.

Objetivou-se avaliar a qualidade das mudas de goiabeira no município de Petrolina, PE.

Potencial de hidrolisado de peixe para o controle de fitopatógenos.

Os produtos obtidos da fermentação de pescados marinhos frescos registrados como fertilizantes orgânicos são ricos em nutrientes, possuem em sua composição quitina e quitosana, podendo-se constituir em um produto alternativo adequado para o controle de fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi estudar o potencial de um hidrolisado de peixe em controlar o oídio em abobrinha, F. oxysporum f. sp. lycopersici raça 3 em tomate e Pythium spp. em pepino. Nesse sentido, um fertilizante orgânico obtido da fermentação de resíduos de pescados marinhos frescos foi pulverizado semanalmente nas plantas de abobrinha, com o auxílio de um compressor de pintura 10 1b/pol2 m a 0%, 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5% e 10% (v/v) para o controle do oídio. Este mesmo fertilizante foi incorporado ao substrato nas concentrações de 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% e 100% (por volume de água necessária para atingir a capacidade de campo), em experimento realizado dentro e fora de casa de vegetação. Outros experimentos realizados avaliaram a eficiência do hidrolisado de peixe no controle do tombamento causado por Pythium spp., em pepino e a murcha-de-fusário causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raça 3, em tomate. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação e o delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com dez repetições por tratamento. Para o pepino, foi utilizada a técnica de estimular a população original do solo com aveia. Assim, o hidrolisado de peixe foi incorporado ao solo dez dias após a mistura com aveia, em concentrações de 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% e 100% do volume de água, para atingir a capacidade de campo do solo e com incubação aberta e fechada. Após dez dias de incubação, 200 ml da mistura foram adicionados ao colo das plantas de pepino no estádio de 2° folhas verdadeiras. A avaliação foi realizada após cinco dias, determinando-se o número de plântulas tombadas. O hidrolisado de peixe, tanto pulverizado na folhas quanto incorporado no substrato, não controlou o oídio da abobrinha. Por outro lado, pode ser observado o efeito do hidrolisado de peixe no desenvolvimento das plantas e no desenvolvimento de Trichoderma no substrato. A partir da concentração de 30%, não houve tombamento de plantas. Por outro lado, o tombamento foi de 100% para os tratamentos com 0 e 5% do fertilizante. Para o experimento do Fusarium, foram utilizados três isolados da raça 3 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (isolados 145, 146 e 149). Após a infestação, o substrato foi incubado por quinze dias com o hidrolisado de peixe e foi incorporado ao substrato nas seguintes concentrações: 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40% e 50% volume de água necessária para atingir a capacidade de campo. Uma muda de tomate cultivar Santa Clara suscetível à raça 3 com 30 dias de idade, foi transferida para cada vaso. A severidade da doença foi avaliada após 40 dias, por meio de escala de notas para escurecimento vascular e sintomas externos. De modo geral, todas as doses do hidrolisado de peixe reduziram, significativamente, a severidade da doença.

Bioprospecting for culturable actinobacteria with antimicrobial properties isolated from rivers in Colombian Orinoquia

Purpose: To Isolate and characterize Actinobacteria with antimicrobial activity from Guaviare River (Colombia). Methods: Water and sediment samples were collected from Guaviare River. Direct plating, heat and CaCO3 methods were used to isolate Actinobacteria. Six bacterial strains were tested using T-Streak method: Escherichia coli ATCC 23724, Staphylococus aureus ATCC 25923, Acinetobacter baumannii ATCC 19606, Bacillus subtilis ATCC 21556, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Chromobacterium violaceum ATCC 31532. Strains of Fusarium sp. H24, Trichoderma harzianum H5 and Colletotrichum gloeosporioides were tested using Kirby-Bauer method. Isolates with high antimicrobial activity were selected for further taxonomic identification. Results: A total of 374 actinobacteria isolates were obtained. Seven isolates exhibited high antimicrobial activity (p < 0.05) and were confirmed as members of Streptomycetaceae family. Of these, three isolates showed differential phenotypic and genotypic profiles, indicating that they may represent new species. Conclusions: To date, this is the first study of this type in Colombian Orinoquia and indicates that this promising source of Actinobacteria from aquatic sediments with the ability to produce antimicrobial secondary metabolites.

Book of abstracts...

2016

Wheat blast and its effect on technological quality of grain from two sowing dates.

2016