The Literary relations between La Fontaine and the "Astrée" of Honoré d'Urfé : a dissertation presented to the faculty of the department of philosophy of the university of Pennsylvania in partial fulfilment of the requirements for the degree of doctor of philosophy / by Walther P. Fischer

Collection : Publications of the University of Pennsylvania ; n° 6

Isolation and partial characterization of host cell wall surface glycoproteins: their involvement in agglutination, attachment and appressorium formation by piptocephalis virginiana

Cell surface proteins obtained by alkaline extraction from isolated cell walls of Mortierella pusilla and M. candelabrum, host and nonhost, respectively, to the mycoparasite, Piptocephalis virginiana, were tested for their ability to agglutinate mycoparasite spores. The host cell wall protein extract had a high agglutinating activity (788 a.u. mg- t ) as compared with the nonhost extract (21 a.li. mg- t ). SDS-polyacrylamide gel electrophoresis of the cell wall proteins revealed four protein bands, a, b, c, and d (Mr 117, 100, 85 and 64 kd, respectively) at the host surface, but not at the nonhost surface, except for the faint band c. Deletion of proteins b or c from the host cell wall protein extract significantly reduced its agglutinating activity. Proteins band c, obtained as purified preparations by a series of procedures, were shown to be two glycoproteins. Carbohydrate analysis by gas chromatography demonstrated that glucose and Nacetylglucosamine were the major carbohydrate components of the glycoproteins. It was further shown that the agglutinating activity of the pure preparation containing both band c was 500-850 times that of the single glycoproteins, suggesting the involvement of both glycoproteins in agglutination. The results suggest that the glycoproteins band c are the two subunits of agglutinin present at the host cell surface. The two glycoproteins band c purified from the host cell wall protein extract were further examined after various treatments for their possible role in agglutination, attachment and appressorium formation by the mycoparasite. Results obtained by agglutination and attachment tests showed: (1) the two glycoprotein-s are not only an agglutinin responsible for the mycoparasite spore agglutination, but may also serve as a receptor for the specific recognition, attachment and appressorium formation by the mycoparasite; (2) treatment of the rnycoparasite spores with various sugars revealed that arabinose, glucose and N-acetylglucosamine inhibited the agglutination and attachment activity of the glycoproteins, however, the relative percentage of appressorium formation was not affected by the above sugars; (3) the two glycoproteins are relatively stable with respect to their agglutinin and receptor functions. The present results suggest that the agglutination and attachment may be mediated directly by certain sugars present at the host and mycoparasite cell surfaces while the appressorlum formation may be the response of complementary combinations of both sugar and protein, the two parts of the glycoproteins at the interacting surfaces of two fungi.

Isolation and partial characterization of a complementary protein from the mycoparasite, Piptocephalis virginiana, which specifically binds to two glycoproteins b and c of the host cell surface

Presence of surface glycoprotein in Piptocephalis virginiana that recognizes the host glycoproteins band c, reported earlier from our laboratory, was detected by immunofluorescence microscopy. Germinated spores of P. virginiana treated with Mortierella pusilla cell wall protein extract, primary antibodies prepared against glycoproteins band c and FITC-goat anti-rabbit IgG conjugate showed fluorescence. This indicated that on the surfaces of the biotrophic mycoparasite P. virginiana , there might be a complementary molecule which recognizes the glycoproteins band c from M. pusilla. Immunobinding analysis identified a glycoprotein of Mr 100 kDa from the mycoparasite which binds with the host glycoproteins band c, separately as well as collectively. Purification of this glycoprotein was achieved by (i) 60% ammonium sulfate precipitation, (ii) followed by heat treatment, and (iii) Sephadex G-IOO gel filtration. The glycoprotein was isolated by preparative polyacrylamide gel electrophoresis by cutting and elution. The purity of the protein ·was ascertained by SDS-PAGE and Western blot analysis. Positive reaction to periodic acid-Schiff reagent revealed the glycoprotein nature of this 100 kDa protein. Mannose was identified as a major sugar component of this glycoprotein by using a BoehringerMannheim Glycan Differentiation Kit. Electrophoretically purified glycoprotein was used to raIse polyclonal antibody in rabbit. The specificity of the antibody was determined by dot-immunobinding test and western-blot analysis. Immunofluorescence mIcroscopy revealed surface localization of the protein on the germ tube of Piptocephalis virginiana. Fluorescence was also observed at the surfaceJ of the germinated spores and hyphae of the host, M. pusilla after treatment with complementary protein from P. virginiana, primary antibody prepared against the complementary protein and FITC-goat anti-rabbit IgG conjugate.

Partial characterization of the cloned dihydrofolate reductase gene of Saccharomyces cerevisiae

The cloned dihydrofolate reductase gene of Saccharomyces cerevisiae (DFR 1) is expressed in Escherichia coli. Bacterial strain JF1754 transformed with plasmids containing DFR 1 is at least 5X more resistant to inhibition by the folate antagonist trimethoprim. Expression of yeast DFR 1 in E. coli suggests it is likely that the gene lacks intervening sequences. The 1.8 kbp DNA fragment encoding yeast dhfr activity probably has its own promotor, as the gene is expressed in both orientations in E. coli. Expression of the yeast dhfr gene cloned into M13 viral vectors allowed positive selection of DFR 1 - M13 bacterial transfectants in medium supplemented with trimethoprim. A series of nested deletions generated by nuclease Bal 31 digestion and by restriction endonuclease cleavage of plasmids containing DFR 1 physically mapped the gene to a 930 bp region between the Pst 1 and Sal 1 cut sites. This is consistent with the 21,000 molecular weight attributed to yeast dhfr in previous reports. From preliminary DNA sequence analysis of the dhfr DNA fragment the 3' terminus of DFR 1 was assigned to a position 27 nucleotides from the Eco Rl cut site on the Bam Hi - Eco Rl DNA segment. Several putative yeast transcription termination consensus sequences were identified 3' to the opal stop codon. DFR 1 is expressed in yeast and it confers resistance to the antifolate methotrexate when the gene is present in 2 - 10 copies per cell. Plasmid-dependent resistance to methotrexate is also observed in a rad 6 background although the effect is somewhat less than that conferred to wild-type or rad 18 cells. Integration of DFR 1 into the yeast genome showed an intermediate sensitivity to folate antagonists. This may suggest a gene dosage effect. No change in petite induction in these yeast strains was observed in transformed cells containing yeast dhfr plasmids. The sensitivity of rad 6 , rad 18 and wild-type cell populations to trimethoprim were unaffected by the presence of DFR 1 in transformants. Moreover, trimethoprim did not induce petites in any strain tested, which normally results if dhfr is inhibited by other antifolates such as methotrexate. This may suggest that the dhfr enzyme is not the only possible target of trimethoprim in yeast. rad 6 mutants showed a very low level of spontaneous petite formation. Methotrexate failed to induce respiratory deficient mutants in this strain which suggested that rad 6 might be an obligate grande. However, ethidium bromide induced petites to a level approximately 50% of that exhibited by wild-type and rad 18 strains.

The isolation, partial purification and preliminary characterization of a growth factor from chick embryo brains

Chicl( brain growth factor (CBGF) is a mitogen isolated from embryonic chick brains thought to have a potential role as a trophic factor involved in nerve dependent amphibian limb regeneration. In addition, CBGF stimulates 3H-thymidine incorporation in chick embryo brain astrocytes in vitro. In this study, cultured chick embryo brain non-neuronal cells were employed in a bioassay to monitor CBGF activity throughout various stages of its pllrification. Cell culture and assay conditions were optimized. Nonneuronal cells grew best on collagen-coated culture dishes in complete medium, were most responsive to a growth stimulus [10% fetal bovine serum (FBS)] at the second and third subcultures, and were healthiest when rendered "quiescent" in medium supplemented with 1% FBS. The most effective bioassay conditions consisted of a minimum 14.5 hour "quiescence" time (24 hours was used), a 6 hour "prestimulation" time, and a 24 hour 3H-thymidine labeling time. Four-day subconfluent primary non-neuronal cells consisted of 6.63% GFAP positive cells; as a result cultures were thought to be mainly composed of astroblasts. CBGF was purified from 18-day chick embryo brains by ultrafiltration through Amicon PM-30 and YM-2 membranes, size exclusion chromatography through a Biogel P6 column, and analytical reverse-phase high-performance liquid chromatography (rp-HPLC). The greatest activity resided in rp-HPLC fraction #7 (10 ng/ml) which was as effective as 10% FBS at stimulating 3H-thymidine incorporation in chick embryo brain nonneuronal cells. Although other researchers report the isolation of a mitogenic fraction consisting of 5'-GMP from the embryonic chick brain, UV absorbance spectra, rp-HPLC elution profiles, and fast atom bombardment (FAB) mass spectra indicated that CBGF is neither 5'-GMP nor 51-AMP. 2 Moreover, commercially available 5t-GMP was inhibitory to 3H-thymidine incorporation in the chick non-neuronal cells, while Sf-AMP had no effect. Upon treatment with pronase, the biological activity of fraction P6-3 increased; this increase was nearly 30% greater than what would be expected from a simple additive effect of any mitogenic activity of pronase alone together with P6-3 alone. This may suggest the presence of an inhibitor protein. The bioactive component may be a protein protected by a nucleoside/nucleotide or simply a nucleoside/nucleotide acting alone. While the FAB mass spectrum of rp-HPLC fraction #7 did not reveal molecular weight or sequence information, the ion of highest molecular weight was observed at m/z 1610; this is consistent with previous estimations of CBGF's size. 3

Age-Related Changes in Visual Spatial Working Memory Cognits: Frontal-Parietal EEG Coherence During Delay

This study explored changes in scalp electrophysiology across two Working Memory (WM) tasks and two age groups. Continuous electroencephalography (EEG) was recorded from 18 healthy adults (18-34 years) and 12 healthy adolescents (14-17) during the performance of two Oculomotor Delayed Response (ODR) WM tasks; (i.e. eye movements were the metric of motor response). Delay-period, EEG data in the alpha frequency was sampled from anterior and parietal scalp sites to achieve a general measure of frontal and parietal activity, respectively. Frontal-parietal, alpha coherence was calculated for each participant for each ODR-WM task. Coherence significantly decreased in adults moving across the two ODR tasks, whereas, coherence significantly increased in adolescents moving across the two ODR tasks. The effects of task in the adolescent and adult groups were large and medium, respectively. Within the limits of this study, the results provide empirical support that WM development during adolescence include complex, qualitative, change.

Partial piece of post office registration to J.M. Ball of Toronto, Ont.

Partial piece of post office registration to J.M. Ball of Toronto, Ont. Half of ticket is missing. Text is affected, Jul. 5, 1875.

Envelope (partial) to Colonel Nelles, 4th Lincoln Militia, Grimsby from M.A. Hale of Quebec

Envelope (partial) to Colonel Nelles, 4th Lincoln Militia, Grimsby from M.A. Hale of Quebec. The envelope is stained and torn, but text is not affected, Feb. 7, 1839.

Does friendship give us non-derivative partial reasons ?

Une des façons d’approcher la question de l’existence de raisons partiales non-dérivatives d’une quelconque sorte consiste à expliquer ce que sont les raisons partiales et ensuite à chercher à savoir s’il y a des raisons de cette sorte. Si de telles raisons existent, alors il est au moins possible qu’il y ait des raisons partiales d’amitié. C’est cette approche que j’adopterai ici, et elle produit des résultats intéressants. Le premier a trait à la structure des raisons partiales. C’est au moins une condition nécessaire pour qu’une raison soit partiale qu’elle aie une composante relationnelle explicite. Cette composante, techniquement parlant, est un relatum dans la relation d’être une raison qui elle-même est une relation entre la personne à qui la raison s’applique et la personne concernée par l’action pour laquelle il y a une raison. La deuxième conclusion de ce texte est que cette composante relationnelle est aussi requise dans de nombreuses sortes de raisons admises comme impartiales. Afin d’éviter de banaliser la distinction entre raisons partiales et impartiales nous devons appliquer une condition suffisante additionnelle. Finalement, bien qu’il pourrait s’avérer possible de distinguer les raisons impartiales ayant une composante relationnelle des raisons partiales, cette approche suggère que la question de savoir si l’éthique est partiale ou impartiale devra se régler au niveau de l’éthique normative, ou à tout le moins, qu’elle ne pourra se régler au niveau du discours sur la nature des raisons d’agir.

Decisive Coalitions and Coherence Properties

In a seminal contribution, Hansson has demonstrated that the family of decisive coalitions associated with an Arrovian social welfare function forms an ultrafilter. If the population under consideration is infinite, his result implies the existence of nondictatorial social welfare functions. He goes on to show that if transitivity is weakened to quasi-transitivity as the coherence property imposed on a social relation, the set of decisive coalitions is a filter. We examine the structure of decisive coalitions and analogous concepts with alternative coherence properties, namely, acyclicity and Suzumura consistency, and without assuming that the social relation is complete.

A randomized controlled trial evaluating the quality of life and the sense of coherence in seniors wearing complete conventional dentures or mandibular two-implant overdentures

La supériorité des prothèses mandibulaires retenues par deux implants (IODs) sur les prothèses conventionnelles (CDs) nécessitent d’être éclaircies notamment en rapport à leur influence sur la qualité de vie reliée à la santé bucco-dentaire (OHRQoL) ainsi que sur la stabilité de cet effet de traitement. De plus, l’influence des facteurs psychologiques, tel que le sens de cohérence (SOC), sur l’effet de traitement reste encore inconnue. Le but de cette étude est de déterminer l’amplitude de l’influence du port des IODs et des CDs sur l’OHRQoL et d’évaluer la stabilité de l’effet de traitement dans le temps, tout en prenant en considération le niveau du SOC. MÉTHODOLOGIE: Des participants édentés (n=172, âge moyen 71, SD = 4.5) ayant reçu des CDs ou des IODs ont été suivis sur une période de deux ans. L’OHRQoL a été évaluée à l’aide du questionnaire « Oral Health Impact Profile (OHIP -20) » et ce avant le traitement et à chacun des deux suivis. Le SOC a été évalué à l’aide du questionnaire « The Orientation to Life (SOC -13) » à chacun des deux suivis. Des analyses statistiques ont été effectuées pour évaluer les différences intra et entre groupes (analyses statistiques descriptives, bivariées et multivariées). RÉSULTATS: Une amélioration statistiquement significative de l’OHRQoL entre les statuts avant et après traitement a été notée dans les deux groupes (Wilks’s Lambda = 0.473, F (1,151) = 157.31, p < 0.0001). L’amplitude de l’effet du traitement IOD est 1.5 fois plus grande que celle du traitement CD. Ces résultats ont été stables pendant les deux années d’étude et ils n’ont pas été influencés par le SOC. CONCLUSION: Le traitement IOD amène une meilleure OHRQoL à long terme en comparaison avec le traitement CD et ce sans influence du niveau du SOC. Ces résultats sont cliniquement significatifs et confirment la supériorité des IODs sur les CDs.

Construction d'une échelle décrivant les niveaux de compétence de collaboration, à partir d'indicateurs validés par des enseignants cliniciens en médecine

La collaboration est une compétence essentielle que les futurs médecins doivent développer. La détermination des niveaux de compétence est cruciale dans la planification de cet apprentissage. Les échelles descriptives suscitent un intérêt croissant, car elles décrivent en termes qualitatifs les performances attendues. Nous inspirant de la méthodologie mixte de Blais, Laurier, & Rousseau (2009), nous avons construit en cinq étapes une échelle de niveau de compétence de collaboration: 1) formulation d’une liste d’indicateurs situés à quatre niveaux de la formation médicale (préclinique, externat, résidence junior et sénior) par les chercheurs (n= 3) et un groupe d’éducateurs (n=7), leaders pédagogiques possédant une expertise pour la compétence de collaboration; 2) sondage en ligne comprenant quatre questionnaires portant sur les niveaux de 118 indicateurs, auprès d’enseignants cliniciens représentant les différentes spécialités (n=277); 3) analyse, avec le modèle partial credit de Rasch, des réponses aux questionnaires appariés par calibration concurrente; 4) détermination des niveaux des indicateurs par les éducateurs et les chercheurs; et 5) rédaction de l’échelle à partir des indicateurs de chaque niveau. L’analyse itérative des réponses montre une adéquation au modèle de Rasch et répartit les indicateurs sur l’échelle linéaire aux quatre niveaux. Les éducateurs déterminent le niveau des 111 indicateurs retenus en tenant compte des résultats du sondage et de la cohérence avec le curriculum. L’échelle comporte un paragraphe descriptif par niveau, selon trois capacités : 1) participer au fonctionnement d’une équipe; 2) prévenir et gérer les conflits; et 3) planifier, coordonner et dispenser les soins en équipe. Cette échelle rend explicites les comportements collaboratifs attendus à la fin de chaque niveau et est utile à la planification de l’apprentissage et de l’évaluation de cette compétence. La discordance entre les niveaux choisis par les éducateurs et ceux issus de l’analyse des réponses des enseignants cliniciens est principalement due au faible choix de réponse du niveau préclinique par les enseignants et aux problèmes d’adéquation pour les indicateurs décrivant la gestion des conflits. Cette recherche marque une avan- cée dans la compréhension de la compétence de collaboration et démontre l’efficacité de la méthodologie de Blais (2009) dans un contexte de compétence transversale, en sciences de la santé. Cette méthodologie pourrait aider à approfondir les trajectoires de développement d’autres compétences.

Essays in partial identification and applications to treatment effects and policy evaluation.

Dans cette thèse, je me suis interessé à l’identification partielle des effets de traitements dans différents modèles de choix discrets avec traitements endogènes. Les modèles d’effets de traitement ont pour but de mesurer l’impact de certaines interventions sur certaines variables d’intérêt. Le type de traitement et la variable d’intérêt peuvent être défini de manière générale afin de pouvoir être appliqué à plusieurs différents contextes. Il y a plusieurs exemples de traitement en économie du travail, de la santé, de l’éducation, ou en organisation industrielle telle que les programmes de formation à l’emploi, les techniques médicales, l’investissement en recherche et développement, ou l’appartenance à un syndicat. La décision d’être traité ou pas n’est généralement pas aléatoire mais est basée sur des choix et des préférences individuelles. Dans un tel contexte, mesurer l’effet du traitement devient problématique car il faut tenir compte du biais de sélection. Plusieurs versions paramétriques de ces modèles ont été largement étudiées dans la littérature, cependant dans les modèles à variation discrète, la paramétrisation est une source importante d’identification. Dans un tel contexte, il est donc difficile de savoir si les résultats empiriques obtenus sont guidés par les données ou par la paramétrisation imposée au modèle. Etant donné, que les formes paramétriques proposées pour ces types de modèles n’ont généralement pas de fondement économique, je propose dans cette thèse de regarder la version nonparamétrique de ces modèles. Ceci permettra donc de proposer des politiques économiques plus robustes. La principale difficulté dans l’identification nonparamétrique de fonctions structurelles, est le fait que la structure suggérée ne permet pas d’identifier un unique processus générateur des données et ceci peut être du soit à la présence d’équilibres multiples ou soit à des contraintes sur les observables. Dans de telles situations, les méthodes d’identifications traditionnelles deviennent inapplicable d’où le récent développement de la littérature sur l’identification dans les modèles incomplets. Cette littérature porte une attention particuliere à l’identification de l’ensemble des fonctions structurelles d’intérêt qui sont compatibles avec la vraie distribution des données, cet ensemble est appelé : l’ensemble identifié. Par conséquent, dans le premier chapitre de la thèse, je caractérise l’ensemble identifié pour les effets de traitements dans le modèle triangulaire binaire. Dans le second chapitre, je considère le modèle de Roy discret. Je caractérise l’ensemble identifié pour les effets de traitements dans un modèle de choix de secteur lorsque la variable d’intérêt est discrète. Les hypothèses de sélection du secteur comprennent le choix de sélection simple, étendu et généralisé de Roy. Dans le dernier chapitre, je considère un modèle à variable dépendante binaire avec plusieurs dimensions d’hétérogéneité, tels que les jeux d’entrées ou de participation. je caractérise l’ensemble identifié pour les fonctions de profits des firmes dans un jeux avec deux firmes et à information complète. Dans tout les chapitres, l’ensemble identifié des fonctions d’intérêt sont écrites sous formes de bornes et assez simple pour être estimées à partir des méthodes d’inférence existantes.

Institutional Boundaries and Judicial Review - Some Thoughts on How the Court is Going About Its Business: Desperately Seeking Coherence

Cet article a précédemment été publié par la Supreme Court Law Review (Second Series).

Peut-on donner d’une clause et reprendre de l’autre? Essai sur la cause comme instrument de contrôle de la cohérence matérielle du contrat

Peut-on donner d’une clause et reprendre de l’autre? Si deux siècles de décisions et de commentaires contradictoires empêchent de répondre à cette question avec la certitude et l’assurance auxquelles nous a habitué la doctrine civiliste, il est tout de même possible d’affirmer que le droit civil prohibe la clause qui permet à un contractant de se dédire totalement de son engagement. Privant l’engagement de son cocontractant de toute raison, et le contrat dans lequel elle se trouve de toute fonction, cette clause contracticide se heurte en effet à une notion fondamentale du droit commun des contrats : la cause. C’est pour éviter que ne soient validés les contrats qui ne présentent aucun intérêt pour l’une ou l’autre des parties que le législateur québécois a choisi d’importer – et de conserver, dans son article introductif du Livre des obligations, cette notion que l’on dit la plus symbolique du droit français des obligations. En effet, bien que son rôle soit fréquemment assumé par d’autres mécanismes, la cause demeure la gardienne des fonctions du contrat synallagmatique. À ce titre, elle permet non seulement d’annuler les contrats qui ne codifient aucun échange, mais également, et surtout, de contrôler ceux dont le contenu ne permet pas de matérialiser les avantages négociés. Octroyant au juge le pouvoir d’assurer que le contrat contienne les outils nécessaires et adaptés à la réalisation de l’opération qu’il a pour fonction de mettre en œuvre, la cause lui offre donc le moyen de garantir l’adéquation entre la fin et ses moyens, bref de contrôler la cohérence matérielle du contrat.