Addressing missing data in geochemistry: a non-linear approach

Exploratory analysis of petroleum geochemical data seeks to find common patterns to help distinguish between different source rocks, oils and gases, and to explain their source, maturity and any intra-reservoir alteration. However, at the outset, one is typically faced with (a) a large matrix of samples, each with a range of molecular and isotopic properties, (b) a spatially and temporally unrepresentative sampling pattern, (c) noisy data and (d) often, a large number of missing values. This inhibits analysis using conventional statistical methods. Typically, visualisation methods like principal components analysis are used, but these methods are not easily able to deal with missing data nor can they capture non-linear structure in the data. One approach to discovering complex, non-linear structure in the data is through the use of linked plots, or brushing, while ignoring the missing data. In this paper we introduce a complementary approach based on a non-linear probabilistic model. Generative topographic mapping enables the visualisation of the effects of very many variables on a single plot, while also dealing with missing data. We show how using generative topographic mapping also provides an optimal method with which to replace missing values in two geochemical datasets, particularly where a large proportion of the data is missing.

Acute primary actinomycosis involving the hard palate of a diabetic patient

Actinomycosis is a relatively rare infection caused by saprophytic bacteria of the oral cavity and gastrointestinal tract that can become pathogenic. The chronic hyperglycemia of diabetes mellitus induces events that promote structural changes in various tissues and are associated with problems in wound healing. This infection remains largely unknown to most clinicians because of its different presentations, and palatal involvement is extremely rare. This report describes the case of a 46-year-old woman who was diagnosed with actinomycosis involving the hard palate. The main clinical, histopathologic, and therapeutic characteristics and differential diagnosis of actinomycosis are reviewed. To date, 3 cases of actinomycosis involving the hard palate have been reported.

Acute primary actinomycosis involving the hard palate of a diabetic patient

Actinomycosis is a relatively rare infection caused by saprophytic bacteria of the oral cavity and gastrointestinal tract that can become pathogenic. The chronic hyperglycemia of diabetes mellitus induces events that promote structural changes in various tissues and are associated with problems in wound healing. This infection remains largely unknown to most clinicians because of its different presentations, and palatal involvement is extremely rare. This report describes the case of a 46-year-old woman who was diagnosed with actinomycosis involving the hard palate. The main clinical, histopathologic, and therapeutic characteristics and differential diagnosis of actinomycosis are reviewed. To date, 3 cases of actinomycosis involving the hard palate have been reported.

Tooth wear in Irish teenagers: a laboratory and epidemiological study

Aim: To investigate the characteristics, development and determinants of toothwear among Irish schoolchildren. Methods: A cross-sectional (examination at 16-years-old) and longitudinal (examinations at 5-,12-,14-years) study were conducted. Two indices were used to measure toothwear, children/parents completed a demographic profile and questionnaire on oral hygiene and dietary practices, health, and lifestyle in both studies. Saliva was collected from consenting 16-year-olds. The explanatory variables for the cross-sectional and longitudinal study were derived from children/parents responses. Differences in salivary profiles were determined for subsets; the protein concentration was determined with Bradford protein assay and protein carbonyl concentration (a protein oxidation marker) was determined spectrophotometrically. Gel-electrophoresis and mass spectrometry determined proteins and ion chromatography inorganic ions. Statistical significance was accepted at p<0.05. Results: At 16-years-old the prevalence of toothwear with dentine visible was 44%. No difference in salivary flow rates existed. In unstimulated saliva a higher mean, protein carbonyl (p<0.0001) and total calcium concentration (p<0.002) existed for the group with moderate toothwear. In stimulated saliva the moderate toothwear group had a lower mean protein concentration(p<0.0001). The 2-DE protein spots prepared for a sub-group differed between those with toothwear and without. Mass spectrometry, identified one of the different proteins as IgA. For 16-year-olds, the self-reported factors indicated that brushing after breakfast was associated with lower toothwear scores(p<0.03). Nail-biting, being asthmatic or reporting a dry mouth were associated with higher toothwear scores(all p<0.05). Eating an apple daily or less was associated with less toothwear(p<0.002). In the longitudinal study toothwear into dentine at age five or 12-years was associated with more toothwear at age 14(all p<0.05). Discussion: The results illustrate the multifactorial aetiology of toothwear. The biochemical and physical correlates of saliva with toothwear requires further research. Conclusion: The impact of previous toothwear, salivary, dietary and personal factors on toothwear in the early permanent dentition is demonstrated.

Dentofacial parameters associated with the unilateral palatally impacted canine

Aims To investigate the relationship between unilateral PIC and specific dentofacial parameters. Materials and methods A sample of 216 subjects, with 108 subjects in the retrospective and prospective samples respectively. Dental parameters: The following dental parameters were assessed: Inter-canine and intermolar width; palatal depth and palatal area; anterior Bolton tooth-size discrepancy (TSD); maxillary arch shape and ratio and maxillary central and lateral incisor shape and ratio. Facial parameters: Three-dimensional (3D) images were taken for subjects in the prospective sample only, and were used to assess the following facial parameters: Face shape; face ratio and 3D distances and angles. Results Dental parameters: Inter-canine width was significantly smaller in the test group compared to the control group in the retrospective (p= 0.0002) and prospective (p= 0.0018) samples respectively. Anterior Bolton TSD was significantly higher in the prospective test group compared to controls (p= 0.0070). Arch ratio was significantly smaller in the test group than the control group for the retrospective sample (p= 0.0029), whereas no significant difference was recorded in the prospective sample (p= 0.1017). Arch shape distribution was significantly different in the retrospective sample (p= 0.009). Tooth shape distribution was significantly different for the maxillary right central incisor in the retrospective sample (p= 0.030). Tooth ratio showed no significant difference for both samples. Facial parameters: Basal width was significantly smaller in the test compared to the control group (p= 0.0001). No significant difference was found in all other 3D distances and angles measured. Conclusion Inter-canine width was significantly smaller in unilateral PIC subjects compared to controls. Anterior Bolton TSD was significantly higher in prospective unilateral PIC compared to controls. Maxillary arch ratio was significantly smaller in retrospective subjects. Square/tapered tooth shape was significantly more common in the retrospective group. Basal width was significantly smaller in subjects with unilateral PIC than controls.

A vueltas con la naturaleza del cambio fonético-fonológico: los casos de Nj y Lj

Las etapas del cambio fonético-fonológico han sido descritas desde hace décadas, especialmente desde un punto de vista articulatorio y casi siempre partiendo de los testimonios escritos de que se podía disponer. No obstante, recientemente han ido surgiendo nuevas teorías que defienden que el cambio puede ser explicado a través del estudio de la variación y los procesos fonéticos propios del habla actual, puesto que ambos están relacionados con fenómenos de hipo (e hiper) articulación y, a la postre, de coarticulación. Una de ellas es la Fonología Evolutiva (Blevins 2004), aun cuando no ofrece una explicación satisfactoria para la difusión del cambio. En este estudio, se ha recurrido a estas teorías para esclarecer las causas de la evolución de dos contextos de yod segunda: /nj/ y /lj/, que llevaron a la fonologización de // y //, en un primer estadio de la historia del español.

A Rare Cause of Myoclonus: A Cupric Conundrum

A woman aged 22 years presented with a 3-year history of jerks when brushing her teeth and a tremor when carrying drinks. Examination revealed a bilateral jerky tremor, stimulus-sensitive myoclonus, and difficulty with tandem gait. Thyroid and liver function test results were normal, but she had rapidly progressive renal failure. Serum copper, ceruloplasmin, and manganese levels were normal, but her urinary copper level was elevated on 2 occasions. Pathological findings on organ biopsy prompted genetic testing to confirm the diagnosis. The differential diagnosis, tissue biopsy findings, and final genetic diagnosis are discussed.

Prevalence and severity of dental fluorosis among students from João Pessoa, PB, Brazil

The aim of this study was to determine the prevalence and severity of dental fluorosis among 12-15-year-old students from João Pessoa, PB, Brazil before starting a program of artificial fluoridation of drinking water. The use of fluoridated dentifrice was also surveyed. A sample of 1,402 students was randomly selected. However, 31 students refused to participate and 257 were not permanent residents in João Pessoa, thus leaving a final sample of 1,114 students. Clinical exams were carried out by two calibrated dentists (Kappa = 0.78) under natural indirect light. Upper and lower front teeth were cleaned with gauze and dried, and then examined using the TF index for fluorosis. A questionnaire on dentifrice ingestion and oral hygiene habits was applied to the students. The results revealed that fluorosis prevalence in this age group was higher than expected (29.2%). Most fluorosis cases were TF = 1 (66.8%), and the most severe cases were TF = 4 (2.2%). The majority of the students reported that they had been using fluoridated dentifrices since childhood; 95% of the participants preferred brands with a 1,500 ppm F concentration, and 40% remembered that they usually ingested or still ingest dentifrice during brushing. It was concluded that dental fluorosis prevalence among students in João Pessoa is higher than expected for an area with non-fluoridated water. However, although most students use fluoridated dentifrices, and almost half ingest slurry while brushing, the majority of cases had little aesthetic relevance from the professionals' point of view, thus suggesting that fluorosis is not a public health problem in the locality.

Tooth Mobility, Periodontal Ligament Space, and the Alveolus During Periodontal Health, Disease, and Disuse

Thesis (Ph.D.)--University of Washington, 2016-07

Saúde oral e cuidados primários em Odontopediatria

Introdução: A cárie dentária é uma doença multifatorial, infeciosa, transmissível e dependente da dieta, que provoca a desmineralização das estruturas dentárias. Devido a esta natureza etiológica multifatorial é fundamental o aumento da sensibilização e educação das crianças e pais, quer por profissionais de saúde, quer pelos professores em ambiente escolar. A aquisição de hábitos de higiene oral e nutricionais adequados pela criança é um fator imperativo para a manutenção de uma boa saúde oral. Objetivos: Avaliação da Saúde Oral e cuidados primários num grupo de crianças e adolescentes pertencentes ao Agrupamento de Escolas de Alijó. Método: A amostra é constituída por 216 alunos do Agrupamento de Escolas de Alijó, agrupados em três escalões etários: 6-9 anos, 10-14 anos e 15-16 anos. Foi realizada uma observação oral com base no índice de higiene oral simplificado e no índice de cárie (CPOd/cpod- Dentes Cariados, Perdidos e Obturados). Após esta observação foi aplicado um questionário escrito sobre diversos temas relacionados com a saúde oral. Resultados: A percentagem de crianças livres de lesões cariosas aos 6, 12 e 15 anos foi de 33,3%, 28,4% e 16,2%, respetivamente. Os valores da média de número de escovagens diárias aumentam de acordo com a faixa etária. O número de escovagens médias aos 6-9anos, 10-14anos e 15-16anos foi 1,37; 1,48 e 1,55 no sexo masculino, no caso de sexo feminino estes valores passam para 1,58; 1,80 e 1,89 respetivamente. Discussão: Os números registados no presente estudo são semelhantes aos do I Estudo Nacional de Prevalência da Cárie Dentária, onde se verificou percentagens de 33%, 27% e 18,9% para os escalões referentes aos 6 anos, 9 anos e 15 anos. Existe uma melhoria significativa em cada um destes escalões nos dois estudos seguintes realizados pela DGS. Em 2008 estas percentagens foram de 51%, 44% e 28%, respetivamente para cada um dos escalões. Em 2015 existiu apenas um pequeno acréscimo, com percentagens registadas de 54,8%, 53% e 32,4%, respetivamente. A última percentagem, de 32,4%, refere-se neste caso ao escalão dos 18 anos, uma vez que a DGS substituiu o escalão de estudo dos 15 anos de idade. Quando nos referimos ao número de escovagens médio, os números registados neste estudo têm uma evolução semelhante aos encontrados no III Estudo Nacional de Prevalência da Cárie Dentária, publicado em 2015 pela DGS, que refere que aos 6 anos 53% dos inquiridos escova duas vezes ao dia e 25,7% apenas uma vez, enquanto que aos 12 anos nos deparamos com uma descida para 19,9% dos que escovam 1x por dia e um aumento para 69,9% dos que escovam duas vezes. O mesmo estudo afirma ainda que as jovens escovam mais vezes os dentes, tal como no presente estudo. Conclusão: Os últimos anos têm-se revelado determinantes na melhoria da Saúde Oral dos portugueses e a aposta na prevenção, nomeadamente nos Cuidados Primários de Saúde Oral tem apresentado uma mais-valia inquestionável. Como em todos os percursos que se iniciam, a monitorização dos resultados e a sua melhoria contínua podem conduzir à otimização das estratégias e no seu conjunto contribuir para fazer ainda mais e melhor. Este estudo permitiu aferir, que a realidade, em contextos de Saúde Oral, no Concelho de Alijó é preocupante sugerindo que existem assimetrias em Portugal e cabe a todos os intervenientes em Saúde Oral diminuí-las. O envolvimento de cada Médico Dentista neste processo é fundamental.

Caracterização do estado de saúde oral dos idosos abrangidos pelo projeto “sorrisos de porta em porta”

A esperança média de vida tem vindo a aumentar, resultando no envelhecimento da população mundial e, consequentemente, num aumento das populações com idades mais avançadas. Torna-se, por isso, importante estudar as especificidades do envelhecimento para que possamos trazer bem-estar e qualidade de vida a esta população que é cada vez mais numerosa, já que o envelhecimento traz mudanças a nível do corpo humano que se vão repercutir na saúde geral e na saúde oral. Os idosos apresentam, normalmente, pobres condições de saúde oral, sendo as doenças orais que mais acometem a esta população a perda dentária, a experiência de cárie, as altas taxas de prevalência de doença periodontal, a xerostomia e o pré-cancro/cancro oral. Além do envelhecimento populacional, têm sido notadas, ao longo do tempo, mudanças na estrutura familiar. Tudo isto leva a que o número de idosos institucionalizados aumente. Neste estudo foram utilizados dados, ainda não publicados, recolhidos no âmbito do projeto Sorrisos de Porta em Porta, que pertence à Mundo a Sorrir – Associação de Médicos Dentistas Portugueses. Este projeto visa a promoção de hábitos de saúde oral na população idosa e atua através da realização de ações de sensibilização subordinadas à temática da saúde oral no idoso e realização de rastreios de saúde oral aos idosos que se encontrem no âmbito de uma reposta social. Foram observados um total de 3586 idosos com idade igual ou superior a 65 anos, onde 70,3% eram do género masculino. A idade média (desvio padrão) encontrada foi 81,9 (±7,5) e a maioria referiu ser autónoma nos cuidados de higiene oral, no entanto, observou-se que grande parte dos idosos não realizava a escovagem diária e mais de metade destes disse não sentir necessidade de o fazer. Observou-se também, que apenas 13,7% tinham tido a sua última consulta de Medicina Dentária nos últimos 6 meses e a maioria disse visitar o Médico Dentista por razões de dor dentária. A média (desvio padrão) obtida para o Índice CPOd foi 26,3 (±8,4), sendo a componente “Perdidos” a mais significativa. Relativamente ao Índice de Placa, a maioria apresentava um acúmulo de placa bacteriana maior de 1/3 mas menor de 2/3. Quanto ao tipo de desdentação a maior percentagem era a de idosos desdentados parciais sem prótese. Foi também realizada uma pesquisa bibliográfica. Com este estudo concluiu-se que o estado de saúde oral dos idosos é bastante pobre consequência de uma pobre higiene oral e de falta de cuidados de saúde oral. Há uma grande necessidade de se instruir as pessoas relativamente à importância da Medicina Dentária e dos problemas que uma má saúde oral pode trazer para a saúde em geral.

Prótese obturadora palatina

Nos pacientes com defeitos ósseos palatinos congénitos ou adquiridos, quando a possibilidade de reconstrução cirúrgica não existe, poderá ter de se utilizar uma prótese obturadora palatina, com vista ao restabelecimento das funções do sistema estomatognático, tais como, a fonética, deglutição e mastigação. Contudo, esta necessidade não é só funcional mas também estética e psicológica, com vista a melhorar a qualidade de vida dos pacientes. As próteses obturadoras palatinas têm vindo a desenvolver há alguns séculos, com o aprimoramento das técnicas de confecção e materiais dentários que auxiliam na elaboração, cada vez mais eficientes, principalmente no que se refere a sua adaptação. Neste trabalho realizou-se uma revisão narrativa da literatura sobre próteses obturas palatinas utilizando as palavras-chave: maxillary birth bony defects; maxillary acquired bony defects; obturator prosthesis; prosthetic rehabilitation in maxillary defects; inflatable hollow obturator; prosthodontic rehabilitation of maxillary defects. Os objectivos deste trabalho foi o de conhecer os diferentes tipos de próteses obturadoras palatinas utilizadas na reabilitação de pacientes com defeitos ósseos palatinos, bem como, as suas indicações, contra-indicações, os cuidados de utilização e o protocolo clínico e laboratorial de confecção. As próteses obturadoras palatinas são assim uma solução possível na reabilitação funcional de um número grande de pacientes com defeitos ósseos palatinos, no entanto, o seu sucesso está dependente do correcto planeamento e da execução clínica e laboratorial cuidadosa.

Halitose

A halitose é uma condição ou alteração do hálito, sendo caracterizada por um hálito desagradável emitido pela expiração. Segundo a Organização Mundial de Saúde (OMS), é considerado um problema de saúde, visto que afeta cerca de 40% da população mundial. Este problema causa desconforto e constrangimento social, sendo assim um limitador da qualidade de vida e da autoestima de quem a padece. Atualmente sabe-se que a halitose pode ser caracterizada como verdadeira, pseudo-halitose ou halitofobia. A halitose verdadeira pode ser uma halitose patológica ou fisiológica. A sua etiologia é multifatorial e o seu tratamento é multidisciplinar. Por outro lado, tanto a pseudo-halitose como a halitofobia provêm do foro psicológico, sendo necessário a ajuda de um psicólogo ou psiquiatra. Existem vários testes de diagnóstico (halímetro, cromatografia gasosa, BANA, entre outros) para avaliar a presença e a severidade desta patologia. O tratamento desta patologia consiste na eliminação das cáries e doenças periodontais, dando instruções de higiene oral para reforçar a escovagem dentária, o uso do fio dentário e a higiene das próteses. O aconselhamento dietético e a limpeza da língua também são essenciais, como também o controlo do biofilme com anti-séticos orais (Abreu et alii., 2011; Machado et alii., 2008). O objetivo desta revisão bibliográfica assenta na determinação de diversas possibilidades de prevenção e tratamento bem como a sua eficácia, sendo esta fundamental para o reconhecimento e correta interpretação da halitose. A pesquisa bibliográfica sobre o tema “Halitose: da etiologia ao tratamento” foi realizada essencialmente em motores de busca como o Pubmed e a Scielo, em três idiomas, Português, Inglês e Espanhol. selecionando artigos na sua maioria entre os anos 2006-2016. O médico médico dentista tem como função, na maioria dos casos, de tratar esta patologia ou então, quando não está associada à cavidade oral, reencaminhar o paciente para a especialidade médica adequada. Contudo, é de salientar que o paciente também possui um papel ativo no tratamento e na manutenção da halitose.

Escovagem de dentes em ambiente escolar e redução do índice de placa bacteriana: avaliação da efetividade de um projeto de saúde oral

Dada a elevada prevalência de cárie em Portugal em idades jovens, a equipa de saúde escolar do concelho de Oliveira do Bairro (distrito de Aveiro), desenvolveu, durante o ano letivo 2012/13, um projeto de educação para a saúde, denominado Senhor Dente, dirigido a crianças em idade pré‐escolar (3‐6 anos) que consistiu na implementação da escovagem na escola. Com este estudo pretendeu‐se determinar o grau de redução da placa bacteriana nas crianças abrangidas pelo referido projeto, de forma a avaliar a sua efetividade na redução das cáries dentárias. Efetuou‐se um estudo quasi experimental, no qual foi avaliado o índice de placa bacteriana individual antes e após a implementação do projeto (ninicial = 256; nfinal = 190). Antes da intervenção, estimou‐se uma prevalência de cárie dentária de 32,8% (IC 95%: 27,0‐38,6). Após a implementação da escovagem dentária na escola, observou‐se uma redução do índice de placa bacteriana de 2,45 (IC 95%: 2,38‐2,51), havendo uma associação estatisticamente significativa entre a variação no índice de placa bacteriana e o valor inicial do índice de dentes cariados, perdidos e obturados por cárie e, também, com o intervalo de tempo decorrido entre os 2 momentos de avaliação. Os resultados demonstraram a efetividade dos programas de saúde escolar que promovam a escovagem dentária diária na escola e sugerem a necessidade de avaliar qual deve ser a duração destes projetos, como forma de otimizar os recursos necessários para o seu desenvolvimento.

Nivelación dialectal: aspectos metodológicos y teóricos para el estudio de la convergencia lingüística a través de un caso concreto: los inmigrantes de Riogordo y Colmenar en Málaga

Convergencia y divergencia dialectales en los núcleos rurales Redes sociales Actitudes individuales y construcción de estilos personales Existe una tendencia bien conocida en las lenguas hacia la convergencia entre las variedades vernáculas regionales con las prestigiosas y de mayor estatus, propias de los núcleos urbanos y centros culturales. En las comunidades rurales, sin embargo, es más frecuente que tenga lugar una resistencia a la convergencia con el estándar y que se refuerce el uso de los rasgos vernáculos. Lo que ocurre es que el estudio de los procesos de convergencia en los centros urbanos está bien representado en la bibliografía y, sin embargo, son escasos los trabajos que se han ocupado de estudiar las tendencias divergentes en núcleos poblacionales más pequeños y en zonas rurales. De ahí que esta tesis pretenda dar respuesta a ese choque de tendencias convergentes y divergentes que tiene lugar en el ámbito rural. El estudio se centra en dos localidades de la provincia de Málaga, Colmenar y Riogordo, porque ambas reúnen las características idóneas para arrojar un poco de luz sobre este tipo de procesos de contacto dialectal: están cerca de la capital y bien comunicadas con el núcleo urbano, pero a la vez tienen una identidad muy marcada, lo que las convierte en un laboratorio ideal para investigar por qué sus habitantes se inclinan por una u otra variante impulsando, de esta manera, tendencias de convergencia o bien de divergencia con el estándar. Para crear el corpus en el que se basa esta investigación se establecieron cuotas de afijación uniforme basadas en tres variables de preestratificación: sexo, edad y nivel de instrucción. Las casillas de las cuotas se fueron completando por medio del procedimiento de bola de nieve. Para investigar los procesos de divergencia dialectal se han escogido tres variables dependientes, la fricativa velar /x/, la palatal africada /ʧ/ y las líquidas /r/ y /l/ en la distensión silábica. Son buenos indicios para estudiar las tendencias que aquí interesan y, por otra parte, su presencia en la bibliografía sociolingüística no está tan bien representada como la de, por ejemplo, el proceso de escisión de /θs/ en dos unidades, mate y estridente, o su variación en la coda silábica. En el capítulo correspondiente a la variación social se estudia la correlación entre variables dependientes y de preestratificación y también se presta atención a la influencia que ejercen otras variables de postestratificación, como el modo de vida y el grado de formalidad de la situación, porque aportan información relevante sobre la atribución de prestigio patente o encubierto en las localidades rurales. En relación con la variación reticular, se revisa de qué manera interactúan el rango de la red, el sexo y el nivel de estudios de los contactos con las variables dependientes, pues son estos precisamente los indicadores que más fuerza explicativa tienen en la muestra analizada. También interesa conocer qué influencia ejerce en los usos lingüísticos de los hablantes el grado de aceptación de los valores urbanos o su apego a las costumbres locales y su mentalidad rural. Con tal fin se ha construido una Escala de Orientación Urbana, ESORURB, que mide la interacción entre usos lingüísticos y mentalidad del hablante. La tesis se cierra con un estudio de la variación individual según las aportaciones de los trabajos de la tercera ola. Para el análisis se ha escogido a una integrante de una de las redes sociales que sobresale entre su grupo de edad (la segunda generación) y estudios (sociolecto superior) por el alto porcentaje de formas estigmatizadas que emplea. El objetivo del capítulo es detectar qué valor confiere esta hablante a las variantes vernáculas, estudiando los temas de conversación que favorecen su aparición y los marcos discursivos que sirven de contexto. A partir de estos datos se establecen dos estilos conversacionales concretos asociados al empleo de las variantes, y que ella adopta de forma consciente para mostrarse ante los demás y construir una imagen concreta de sí misma.