The genome of the fire ant Solenopsis invicta.

Ants have evolved very complex societies and are key ecosystem members. Some ants, such as the fire ant Solenopsis invicta, are also major pests. Here, we present a draft genome of S. invicta, assembled from Roche 454 and Illumina sequencing reads obtained from a focal haploid male and his brothers. We used comparative genomic methods to obtain insight into the unique features of the S. invicta genome. For example, we found that this genome harbors four adjacent copies of vitellogenin. A phylogenetic analysis revealed that an ancestral vitellogenin gene first underwent a duplication that was followed by possibly independent duplications of each of the daughter vitellogenins. The vitellogenin genes have undergone subfunctionalization with queen- and worker-specific expression, possibly reflecting differential selection acting on the queen and worker castes. Additionally, we identified more than 400 putative olfactory receptors of which at least 297 are intact. This represents the largest repertoire reported so far in insects. S. invicta also harbors an expansion of a specific family of lipid-processing genes, two putative orthologs to the transformer/feminizer sex differentiation gene, a functional DNA methylation system, and a single putative telomerase ortholog. EST data indicate that this S. invicta telomerase ortholog has at least four spliceforms that differ in their use of two sets of mutually exclusive exons. Some of these and other unique aspects of the fire ant genome are likely linked to the complex social behavior of this species.

Abundant Occurrence of Basal Radial Glia in the Subventricular Zone of Embryonic Neocortex of a Lissencephalic Primate, the Common Marmoset Callithrix jacchus.

Subventricular zone (SVZ) progenitors are a hallmark of the developing neocortex. Recent studies described a novel type of SVZ progenitor that retains a basal process at mitosis, sustains expression of radial glial markers, and is capable of self-renewal. These progenitors, referred to here as basal radial glia (bRG), occur at high relative abundance in the SVZ of gyrencephalic primates (human) and nonprimates (ferret) but not lissencephalic rodents (mouse). Here, we analyzed the occurrence of bRG cells in the embryonic neocortex of the common marmoset Callithrix jacchus, a near-lissencephalic primate. bRG cells, expressing Pax6, Sox2 (but not Tbr2), glutamate aspartate transporter, and glial fibrillary acidic protein and retaining a basal process at mitosis, occur at similar relative abundance in the marmoset SVZ as in human and ferret. The proportion of progenitors in M-phase was lower in embryonic marmoset than developing ferret neocortex, raising the possibility of a longer cell cycle. Fitting the gyrification indices of 26 anthropoid species to an evolutionary model suggested that the marmoset evolved from a gyrencephalic ancestor. Our results suggest that a high relative abundance of bRG cells may be necessary, but is not sufficient, for gyrencephaly and that the marmoset's lissencephaly evolved secondarily by changing progenitor parameters other than progenitor type.

Posterior quadrantic epilepsy surgery: technical variants, surgical anatomy, and case series.

OBJECTIVE: Patients with intractable epilepsy due to extensive lesions involving the posterior quadrant (temporal, parietal, and occipital lobes) form a small subset of epilepsy surgery. This study was done with a view to analyze our experience with this group of patients and to define the changes in the surgical technique over the last 15 years. We also describe the microsurgical technique of the different surgical variants used, along with their functional neuroanatomy. METHODS: In this series there were 13 patients with a median age of 17 years. All patients had extensive presurgical evaluation that provided concordant evidence localizing the lesion and seizure focus to the posterior quadrant. The objective of the surgery was to eliminate the effect of the epileptogenic tissue and preserve motor and sensory functions. RESULTS: During the course of this study period of 15 years, the surgical procedure performed evolved toward incorporating more techniques of disconnection and minimizing resection. Three technical variants were thus utilized in this series, namely, (i) anatomical posterior quadrantectomy (APQ), (ii) functional posterior quadrantectomy (FPQ), and (iii) periinsular posterior quadrantectomy (PIPQ). After a median follow-up period of 6 years, 12/13 patients had Engel's Class I seizure outcome. CONCLUSION: The results of surgery for posterior quadrantic epilepsy have yielded excellent seizure outcomes in 92% of the patients in the series with no mortality or major morbidity. The incorporation of disconnective techniques in multilobar surgery has maintained the excellent results obtained earlier with resective surgery.

Training in flexible intensive insulin therapy improves quality of life, decreases the risk of hypoglycaemia and ameliorates poor metabolic control in patients with type 1 diabetes.

AIM: Intensified insulin therapy has evolved to be the standard treatment of type 1 diabetes. However, it has been reported to increase significantly the risk of hypoglycaemia. We studied the effect of structured group teaching courses in flexible insulin therapy (FIT) on psychological and metabolic parameters in patients with type 1 diabetes. METHODS: We prospectively followed 45 type 1 diabetic patients of our outpatient clinic participating in 5 consecutive FIT teaching courses at the University Hospital of Basel. These courses consist of 7 weekly ambulatory evening group sessions. Patients were studied before and 1, 6, and 18 months after the course. Main outcome measures were glycated haemoglobin (HbA1c), severe hypoglycaemic events, quality of life (DQoL), diabetes self-control (IPC-9) and diabetes knowledge (DWT). RESULTS: Quality of life, self-control and diabetes knowledge improved after the FIT courses (all p<0.001). The frequency of severe hypoglycaemic events decreased ten-fold from 0.33 episodes/6 months at baseline to 0.03 episodes/6 months after 18 months (p<0.05). Baseline HbA1c was 7.2+/-1.1% and decreased in the subgroup with HbA1c > or = 8% from 8.4% to 7.8% (p<0.05). CONCLUSIONS: In an unselected, but relatively well-controlled population of type 1 diabetes, a structured, but not very time consuming FIT teaching programme in the outpatient setting improves psychological well-being and metabolic parameters.

Phylogenetic analyses of C4 photosynthesis evolution in grasses: genetics of convergence and convergence of genes

Summary : During the evolutionary diversification of organisms, similar ecological constraints led to the recurrent appearances of the same traits (phenotypes) in distant lineages, a phenomenon called convergence. In most cases, the genetic origins of the convergent traits remain unknown, but recent studies traced the convergent phenotypes to recurrent alterations of the same gene or, in a few cases, to identical genetic changes. However, these cases remain anecdotal and there is a need for a study system that evolved several times independently and whose genetic determinism is well resolved and straightforward, such as C4 photosynthesis. This adaptation to warm environments, possibly driven by past atmospheric CO2 decreases, consists in a CO2-concentrating pump, created by numerous morphological and biochemical novelties. All genes encoding C4 enzymes already existed in C3 ancestors, and are supposed to have been recruited through gene duplication followed by neo-functionalization, to acquire the cell specific expression pattern and altered kinetic properties that characterize Ca-specific enzymes. These predictions have so far been tested only in species-poor and ecologically marginal C4 dicots. The monocots, and especially the grass family (Poaceae), the most important C4 family in terms of species number, ecological dominance and economical importance, have been largely under-considered as suitable study systems. This thesis aimed at understanding the evolution of the C4 trait in grasses at a molecular level and to use the genetics of C4 photosynthesis to infer the evolutionary history of the C4 phenotype and its driving selective pressures. A molecular phylogeny of grasses and affiliated monocots identified 17 to 18 independent acquisitions of the C4 pathway in the grass family. A relaxed molecular clock was used to date these events and the first C4 evolution was estimated in the Chloridoideae subfamily, between 32-25 million years ago, at a period when atmospheric CO2 abruptly declined. Likelihood models showed that after the COZ decline the probability of evolving the C4 pathway strongly increased, confirming low CO2 as a likely driver of C4 photosynthesis evolution. In order to depict the genetic changes linked to the numerous C4 origins, genes encoding phopshoenolpyruvate carboxylase (PEPC), the key-enzyme responsible for the initial fixation of atmospheric CO2 in the C4 pathway, were isolated from a large sample of C3 and C4 grasses. Phylogenetic analyses were used to reconstruct the evolutionary history of the PEPC multigene family and showed that the evolution of C4-specific PEPC had been driven by positive selection on 21 codons simultaneously in up to eight C4 lineages. These selective pressures led to numerous convergent genetic changes in many different C4 clades, highlighting the repeatability of some evolutionary processes, even at the molecular level. PEPC C4-adaptive changes were traced and used to show multiple appearances of the C, pathway in clades where species tree inferences were unable to differentiate multiple C4 appearances and a single appearance followed by C4 to C3 reversion. Further investigations of genes involved in some of the C4 subtypes only (genes encoding decarboxylating enzymes NADP-malic enzyme and phosphoenolpyruvate carboxykinase) showed that these C4-enzymes also evolved through strong positive selection and underwent parallel genetic changes during the different Ca origins. The adaptive changes on these subtype-specific C4 genes were used to retrace the history of the C4-subtypes phenotypes, which revealed that the evolution of C4-PEPC and C4-decarboxylating enzymes was in several cases disconnected, emphasizing the multiplicity of the C4 trait and the gradual acquisition of the features that create the CO2-pump. Finally, phylogenetic analyses of a gene encoding the Rubisco (the enzyme responsible for the fixation of CO2 into organic compounds in all photosynthetic organisms) showed that C4 evolution switched the selective pressures on this gene. Five codons were recurrently mutated to adapt the enzyme kinetics to the high CO2 concentrations of C4 photosynthetic cells. This knowledge could be used to introgress C4-like Rubisco in C3 crops, which could lead to an increased yield under predicted future high CO2 atmosphere. Globally, the phylogenetic framework adopted during this thesis demonstrated the widespread occurrence of genetic convergence on C4-related enzymes. The genetic traces of C4 photosynthesis evolution allowed reconstructing events that happened during the last 30 million years and proved the usefulness of studying genes directly responsible for phenotype variations when inferring evolutionary history of a given trait. Résumé Durant la diversification évolutive des organismes, des pressions écologiques similaires ont amené à l'apparition récurrente de certains traits (phénotypes) dans des lignées distantes, un phénomène appelé évolution convergente. Dans la plupart des cas, l'origine génétique des traits convergents reste inconnue mais des études récentes ont montré qu'ils étaient dus dans certains cas à des changements répétés du même gène ou, dans de rares cas, à des changements génétiques identiques. Malgré tout, ces cas restent anecdotiques et il y a un réel besoin d'un système d'étude qui ait évolué indépendamment de nombreuses fois et dont le déterminisme génétique soit clairement identifié. La photosynthèse dite en Ça répond à ces critères. Cette adaptation aux environnements chauds, dont l'évolution a pu être encouragé par des baisses passées de la concentration atmosphérique en CO2, est constituée de nombreuses nouveautés morphologiques et biochimiques qui créent une pompe à CO2. La totalité des gènes codant les enzymes Ç4 étaient déjà présents dans les ancêtres C3. Leur recrutement pour la photosynthèse Ç4 est supposé s'être fait par le biais de duplications géniques suivies par une néo-fonctionnalisation pour leur conférer l'expression cellule-spécifique et les propriétés cinétiques qui caractérisent les enzymes C4. Ces prédictions n'ont jusqu'à présent été testées que dans des familles C4 contenant peu d'espèces et ayant un rôle écologique marginal. Les graminées (Poaceae), qui sont la famille C4 la plus importante, tant en termes de nombre d'espèces que de dominance écologique et d'importance économique, ont toujours été considérés comme un système d'étude peu adapté et ont fait le sujet de peu d'investigations évolutives. Le but de cette thèse était de comprendre l'évolution de la photosynthèse en C4 chez les graminées au niveau génétique et d'utiliser les gènes pour inférer l'évolution du phénotype C4 ainsi que les pressions de sélection responsables de son évolution. Une phylogénie moléculaire de la famille des graminées et des monocotylédones apparentés a identifié 17 à 18 acquisitions indépendantes de la photosynthèse chez les graminées. Grâce à une méthode d'horloge moléculaire relâchée, ces évènements ont été datés et la première apparition C4 a été estimée dans la sous-famille des Chloridoideae, il y a 32 à 25 millions d'années, à une période où les concentrations atmosphériques de CO2 ont décliné abruptement. Des modèles de maximum de vraisemblance ont montré qu'à la suite du déclin de CO2, la probabilité d'évoluer la photosynthèse C4 a fortement augmenté, confirmant ainsi qu'une faible concentration de CO2 est une cause potentielle de l'évolution de la photosynthèse C4. Afin d'identifier les mécanismes génétiques responsables des évolutions répétées de la photosynthèse C4, un segment des gènes codant pour la phosphoénolpyruvate carboxylase (PEPC), l'enzyme responsable de la fixation initiale du CO2 atmosphérique chez les plantes C4, ont été séquencés dans une centaine de graminées C3 et C4. Des analyses phylogénétiques ont permis de reconstituer l'histoire évolutive de la famille multigénique des PEPC et ont montré que l'évolution de PEPC spécifiques à la photosynthèse Ça a été causée par de la sélection positive agissant sur 21 codons, et ce simultanément dans huit lignées C4 différentes. Cette sélection positive a conduit à un grand nombre de changements génétiques convergents dans de nombreux clades différents, ce qui illustre la répétabilité de certains phénomènes évolutifs, et ce même au niveau génétique. Les changements sur la PEPC liés au C4 ont été utilisés pour confirmer des évolutions indépendantes du phénotype C4 dans des clades où l'arbre des espèces était incapable de différencier des apparitions indépendantes d'une seule apparition suivie par une réversion de C4 en C3. En considérant des gènes codant des protéines impliquées uniquement dans certains sous-types C4 (deux décarboxylases, l'enzyme malique à NADP et la phosphoénolpyruvate carboxykinase), des études ultérieures ont montré que ces enzymes C4 avaient elles-aussi évolué sous forte sélection positive et subi des changements génétiques parallèles lors des différentes origines de la photosynthèse C4. Les changements adaptatifs sur ces gènes liés seulement à certains sous-types C4 ont été utilisés pour retracer l'histoire des phénotypes de sous-types C4, ce qui a révélé que les caractères formant le trait C4 ont, dans certains cas, évolué de manière déconnectée. Ceci souligne la multiplicité du trait C4 et l'acquisition graduelle de composants participant à la pompe à CO2 qu'est la photosynthèse C4. Finalement, des analyses phylogénétiques des gènes codant pour la Rubisco (l'enzyme responsable de la fixation du CO2 en carbones organiques dans tous les organismes photosynthétiques) ont montré que l'évolution de la photosynthèse Ça a changé les pressions de sélection sur ce gène. Cinq codons ont été mutés de façon répétée afin d'adapter les propriétés cinétiques de la Rubisco aux fortes concentrations de CO2 présentes dans les cellules photosynthétiques des plantes C4. Globalement, l'approche phylogénétique adoptée durant cette thèse de doctorat a permis de démontré des phénomène fréquents de convergence génétique sur les enzymes liées à la photosynthèse C4. Les traces génétiques de l'évolution de la photosynthèse C4 ont permis de reconstituer des évènements qui se sont produits durant les derniers 30 millions d'années et ont prouvé l'utilité d'étudier des gènes directement responsables des variations phénotypiques pour inférer l'histoire évolutive d'un trait donné.

Shorter time to diagnosis and improved stage at presentation in Swiss patients with retinoblastoma treated from 1963 to 2004

Rapport de synthèse : Le rétinoblastome est la tumeur de l'oeil la plus fréquente chez l'enfant. Un diagnostic précoce est important pour sauver le globe oculaire et la survie du patient. Le but de notre étude est de déterminer l'évolution de l'intervalle diagnostique, c'est-à-dire le délai entre les premiers symptômes et la date du diagnostic officiel du rétinoblastome, sur une période de 40 ans en Suisse. Matériel et méthode : Il s'agit d'une étude rétrospective faite sur 139 patients suisses traités pour rétinoblastome durant trois différentes périodes : (1) 1963-1983 ; (2) 1984-1993 ; et (3) 1994-2004. On compare certaines caractéristiques : le sexe du patient, la latéralité de la maladie, les premiers symptômes, leurs observateurs, l'intervalle diagnostique, l'âge au diagnostic, le stade de la maladie, l'histoire familiale. Résultats : 37 patients (26.6%) ont été traités dans la première période ; 44 (31.7%) dans la période 2 et 58 (41.7%) dans la période 3. L'intervalle diagnostique diminue de façon significative de 6.97 mois dans la période 1 à 3.58 dans la période 2 à 2.25 dans la période 3 pour le total des malades. Ceci reste significatif pour les rétinoblastomes unilatéraux. De plus, dans ce même groupe, on observe une diminution significative des stades avancés de la maladie, groupe E selon Murphree (61.5% dans la période 1 ; 46.7% dans la période 2 et 22.2 % dans la période 3). Lorsque la maladie est bilatérale, les mêmes observations se font de façon un peu moins marquée. Il n'y a aucun patient diagnostiqué au stade E de la maladie en présence d'une anamnèse familiale positive. Leucocorie (48.2%) et strabisme (20.1 %) sont les symptômes les plus fréquents durant les 3 périodes. Les seuls facteurs qui influencent significativement le risque d'avoir un stade E de la maladie sont la durée de l'intervalle diagnostic et la période de diagnostic. Conclusion : On constate un progrès dans le diagnostic du rétinoblastome en Suisse, surtout lors de maladie unilatérale. De même, des améliorations sont notées dans la maladie bilatérale mais de façon non significative. Il est donc important de mieux enseigner aux médecins à reconnaître les symptômes oculaires de la maladie et à référer les patients plus tôt aux spécialistes. Abstract : OBECTIVES : Retinoblastoma is the most frequent intraocular malignancy in children. Early diagnosis is essential for globe salvage and patient survival. The aim of our study was to determine how time to diagnosis of retinoblastoma has evolved over a 40-year period in Switzerland. METHOD AND PATIENTS : A retrospective study of 139 Swiss patients with retinoblastoma was performed comparing 3 periods: (1) 1963-1983; (2) 1984-1993; and (3) 1994-2004. Factors taken into account were gender, laterality of retínoblastoma, age at first symptoms, type and first observer of symptoms, time to diagnosis, age at diagnosis, disease stage, and family history. RESULTS : Thirty-seven patients (26.6%) were treated in period 1, 44 (31.7%) in period 2, and S8 (41.7%) in period 3.Overall, the diagnostic interval decreased in a significant way from 6.97 months in period 1 to 3.58 in period 2 and to 2.25 in period 3. When looking separately at unilateral and bilateral disease, the decrease oí the diagnostic interval remained statistically significant in unilateral retinoblastoma; there was also a significant reduction in the number of patients with advanced group E disease (Murphree classification) (61.5% in period 1, 46.7% in period 2, 22.2% in period 3). In bilateral disease, the same observations were made to a lesser extent. However, there were no cases with group E disease in 10 patients with positive family history. Leukornria (48.2%) and strabismus (20.1 %) were the 2 most frequent symptoms throughout the 3 periods. The only factors that statistically influenced the chances of having a diagnosis of group E disease were the diagnostic interval and period of diagnosis. Conclusion : Progress has been made in the diagnosis of retinoblastoma in Switzerland, notably in unilateral disease. Improvement to a lesser extent has also been observed in bilateral cases but without statistical significance. Greater effort is needed to teach physians-in-training to recognize the importance of ocular symptoms and refer patients earlier.

Geometry, petrology and growth of a shallow crustal laccolith : the Torres del Paine Mafic Complex (Patagonia)

1. ABSTRACTS - RÉSUMÉSSCIENTIFIC ABSTRACT - ENGLISH VERSIONGeometry, petrology and growth of a shallow crustal laccolith: the Torres del Paine Mafi c Complex (Patagonia)The Torres del Paine intrusive complex (TPIC) is a composite mafic-granitic intrusion, ~70km2, belonging to a chain of isolated Miocene plutons in southern Patagonia. Their position is intermediate between the Mesozoic-Cenozoic calc-alkaline subduction related Patagonian batholith in the West and the late Cenozoic alkaline basaltic back-arc related plateau lavas in the East. The Torres del Paine complex formed during an important reconfiguration of the Patagonian geodynamic setting, with a migration of magmatism from the arc to the back-arc, possibly related to the Chile ridge subductionThe complex intruded the flysch of the Cretaceous Cerro Toro and Punta Barrosa Formations during the Miocene, creating a well-defined narrow contact aureole of 200-400 m width.In its eastern part, the Torres del Paine intrusive complex is a laccolith, composed of a succession of hornblende-gabbro to diorite sills at its base, with a total thickness of ~250m, showing brittle contacts with the overlying granitic sills, that form spectacular cliffs of more than 1000m. This laccolith is connected, in the western part, to its feeding system, with vertical alternating sheets of layered gabbronorite and Hbl-gabbro, surrounded and percolated by diorites. ID-TIMS U-Pb on zircons on feeder zone (FZ) gab- bros yield 12.593±0.009Ma and 12.587±0.009Ma, which is identifcal within error to the oldest granite dated so far by Michel et al. (2008). In contrast, the laccolith mafic complex is younger than than the youngest granite (12.50±0.02Ma), and has been emplaced from 12.472±0.009Ma to 12.431 ±0.006Ma, by under-accretion beneath the youngest granite at the interface with previously emplaced mafic sills.The gabbronorite crystallization sequence in the feeder zone is dominated by olivine, plagioclase, clinopyroxene and orthopyroxene, while amphibole forms late interstitial crystals. The crystallization sequence is identical in Hornblende-gabbro from the feeder zone, with higher modal hornblende. Gabbronorite and Hornblende-gabbro both display distinct Eu and Sr positive anomalies. In the laccolith, a lower Hornblende-gabbro crystallized in sills and evolved to a high alkali shoshonitic series. The Al203, Ti02, Na20, K20, Ba and Sr composition of these gabbros is highly variable and increases up to ~50wt% Si02. The lower hornblende-gabbro is characterized by kaersutite anhedral cores with inclusions of olivine, clino- and orthopyroxene and rare apatite and An70 plagioclase. Trace element modelling indicates that hornblende and clinopyroxene are in equilibrium with a liquid whose composition is similar to late basaltic trachyandesitic dikes that cut the complex. The matrix in the lower hornblende gabbro is composed of normally zoned oligoclase, Magnesio-hornblende, biotite, ilmenite and rare quartz and potassium feldspar. This assemblage crystallized in-situ from a Ba and Sr-depleted melts. In contrast, the upper Hbl-gabbro is high-K calc-alkaline. Poikilitic pargasite cores have inclusions of euhedral An70 plagioclase inclusions, and contain occasionally clinopyroxene, olivine and orthopyroxene. The matrix composition is identical to the lower hornblende-gabbro and similar to the diorite. Diorite bulk rock compositions show the same mineralogy but different modal proportions relative to hornblende-gabbrosThe Torres del Paine Intrusive Complex isotopic composition is 87Sr/86Sr=0.704, 143Nd/144Nd=0.5127, 206Pb/204Pb=18.70 and 207Pb/204Pb=15.65. Differentiated dioritic and granitic units may be linked to the gabbroic cumulates series, with 20-50% trapped interstitial melt, through fractionation of olivine-bearing gabbronorite or hornblende-gabbro fractionation The relative homogeneity of the isotopic compositions indicate that only small amounts of assimilation occurred. Two-pyroxenes thermometry, clinopyroxene barometry and amphibole-plagioclase thermometry was used to estimate pressure and temperature conditions. The early fractionation of ultramafic cumulates occurs at mid to lower crustal conditions, at temperatures exceeding 900°C. In contrast, the TPIC emplacement conditions have been estimated to ~0.7±0.5kbar and 790±60°C.Based on field and microtextural observations and geochemical modelling, fractionation of basaltic-trachyandesitic liquids at intermediate to lower crustal levels, has led to the formation of the Torres del Paine granites. Repetitive replenishment of basaltic trachy- andesitic liquid in crustal reservoirs led to mixed magmas that will ascend via the feeder zone, and crystallize into a laccolith, in the form of successive dioritic and gabbroic sills. Dynamic fractionation during emplacement concentrated hornblende rich cumulates in the center of individual sills. Variable degrees.of post-emplacement compaction led to the expulsion of felsic liquids that preferentially concentrated at the top of the sills. Incremental sills amalgamation of the entire Torres del Paine Intrusive Complex has lasted for ~160ka.RESUME SCIENTIFIQUE - VERSION FRANÇAISEGéométrie, pétrologie et croissance d'un laccolite peu profond : Le complexe ma- fique du Torres del Paine (Patagonie)Le Complexe Intrusif du Torres del Paine (CITP) est une intrusion bimodale, d'environ 70km2, appartenant à une chaîne de plutons Miocènes isolés, dans le sud de la Patago-nie. Leur position est intermédiaire entre le batholite patagonien calco-alcalin, à l'Ouest, mis en place au Mesozoïque-Cenozoïque dans un contexte de subduction, et les basal-tes andésitiques et trachybasaltes alcalins de plateau, plus jeune, à l'Est, lié à l'ouverture d'un arrière-arc.A son extrémité Est, le CITP est une succession de sills de gabbro à Hbl et de diorite, sur une épaisseur de ~250m, avec des évidences de mélange. Les contacts avec les sills de granite au-dessus, formant des parois de plus de 1000m, sont cassants. Ce laccolite est connecté, dans sa partie Ouest, à une zone d'alimentation, avec des intrusions sub-ver- ticales de gabbronorite litée et de gabbro à Hbl, en alternance. Celles-ci sont traversées et entourées par des diorites. Les zircons des gabbros de la zone d'alimentation, datés par ID-TIMS, ont cristallisés à 12.593±0.009Ma et 12.587±0.009Ma, ce qui correspond au plus vieux granite daté à ce jour par Michel et al. (2008). A l'inverse, les roches manques du laccolite se sont mises en place entre 12.472±0.009Ma et 12.431 ±0.006Ma, par sous-plaquage successifs à l'interface avec le granite le plus jeune daté à ce jour (12.50±0.02Ma).La séquence de cristallisation des gabbronorites est dominée par Ol, Plg, Cpx et Opx, alors que la Hbl est un cristal interstitiel. Elle est identique dans les gabbros à Hbl de la zone d'alimentation, avec ~30%vol de Hbl. Les gabbros de la zone d'alimentation montrent des anomalies positives en Eu et Sr distinctes. Dans le laccolite, le gabbro à Hbl inférieur évolue le long d'une série shoshonitique, riche en éléments incompatibles. Sa concentration en Al203, Ti02, Na20, K20, Ba et Sr est très variable et augmente rapide-ment jusqu'à ~50wt% Si02. Il est caractérisé par la présence de coeurs résorbés de kaer- sutite, entourés de Bt, et contenant des inclusions d'OI, Cpx et Opx, ou alors d'Ap et de rares Plg (An70). Hbl et Cpx ont cristallisés à partir d'un liquide de composition similaire aux dykes trachy-andesite basaltique du CITP. La matrice, cristallisée in-situ à partir d'un liquide pauvre en Ba et Sr, est composée d'oligoclase zoné de façon simple, de Mg-Hbl, Bt, llm ainsi que de rares Qtz et KF. Le gabbro à Hbl supérieur, quant à lui, appartient à une suite chimique calco-alcaline riche en K. Des coeurs poecilitiques de pargasite con-tiennent de nombreuses inclusions de Plg (An70) automorphe, ainsi que des Ol, Cpx et Opx. La composition de la matrice est identique à celle des gabbros à Hbl inférieurs et toutes deux sont similaires à la minéralogie des diorites. Les analyses sur roches totales de diorites montrent la même variabilité que celles de gabbros à Hbl, mais avec une ten-eur en Si02 plus élevée.La composition isotopique des liquides primitifs du CITP a été mesurée à 87Sr/86Sr=0.704, 143Nd/144Nd=0.5127, 206Pb/204Pb=18.70 et 207Pb/204Pb=15.65. Les granites et diorites différenciés peuvent être reliés à des cumulais gabbronoritiques (F=0.74 pour les granites et F=1-0.5 pour les diorites) et gabbroïques à Hbl (fractionnement supplémentaire pour les granites, avec F=0.3). La cristallisation de 20 à 50%vol de liquide interstitiel piégé dans les gabbros du CITP explique leur signature géochimique. Seules de faibles quantités de croûte continentale ont été assimilées. La température et la pression de fractionnement ont été estimées, sur la base des thermobaromètres Opx-Cpx, Hbl-Plg et Cpx, à plus de 900°C et une profondeur correspondant à la croûte inférieure-moyenne. A l'inverse, les conditions de cristallisation de la matrice des gabbros et diorites du laccolite ont été estimées à 790±60°C et ~0.7±0.5kbar.Je propose que les liquides felsiques du CITP se soient formés par cristallisation frac-tionnée en profondeur des assemblages minéralogiques observés dans les gabbros du CITP, à partir d'un liquide trachy-andesite basaltique. La percolation de magma dans les cristaux accumulés permet la remontée du mélange à travers la zone d'alimentation, vers le laccolite, où des sills se mettent en place successivement. L'amalgamation de sills dans le CITP a duré ~160ka.Le CITP s'est formé durant une reconfiguration importante du contexte géodynamique en Patagonie, avec un changement du magmatisme d'arc vers un volcanisme d'arrière- arc. Ce changement est certainement lié à la subduction de la ride du Chili.RESUME GRAND PUBLIC - VERSION FRANÇAISEGéométrie, pétrologie et croissance d'une chambre magmatique peu profonde : Le complexe mafique du Torres del Paine (Patagonie)Le pourtour de l'Océan Pacifique est caractérisé par une zone de convergence de plaques tectoniques, appelée zone de subduction, avec le plongement de croûte océa-nique sous les Andes dans le cas de la Patagonie. De nombreux volcans y sont associés, formant la ceinture de feu. Mais seuls quelques pourcents de tout le magma traversant la croûte terrestre parviennent à la surface et la majeure partie cristallise en profondeur, dans des chambres magmatiques. Quelles est leur forme, croissance, cristallisation et durée de vie ? Le complexe magmatique du Torres del Paine représente l'un des meilleurs endroits au monde pour répondre à ces questions. Il se situe au sud de la Patagonie, formant un massif de 70km2. Des réponses peuvent être trouvées à différentes échelles, variant de la montagne à des minéraux de quelques 1000ème de millimètres.Il est possible de distinguer trois types de roches : des gabbros et des diorites sur une épaisseur de 250m, surmontées par des parois de granite de plus de 1000m. Les contacts entre ces roches sont tous horizontaux. Entre granites et gabbro-diorite, le contact est net, indiquant que le second magma s'est mis en place au contact avec un magma plus ancien, totalement solidifié. Entre gabbros et diorites, les contacts sont diffus, souvent non-linéaires, indiquant à l'inverse la mise en contact de magmas encore partiellement liquides. Dans la partie Ouest de cette chambre magmatique, les contacts entre roches sont verticaux. Il s'agit certainement du lieu de remplissage de la chambre magmatique.Lors du refroidissement d'un magma, différents cristaux vont se former. Leur stabilité et leur composition varient en fonction de la pression, de la température ou de la chimie du magma. La séquence de cristallisation peut être définie sur la base d'observations microscopiques et de la composition chimique des minéraux. Différents gabbros sont ainsi distingués : le gabbro à la base est riche en hornblende, d'une taille de ~5mm, sans inclusion de plagioclase mais avec des cristaux d'olivine, clinopyroxene et orthopyroxene inclus ; le gabbro supérieur est lui-aussi riche en hornblende (~5mm), avec les mêmes inclusions additionnées de plagioclase. Ces cristaux se sont formés à une température supérieure à 900°C et une profondeur correspondant à la croûte moyenne ou inférieure. Les minéraux plus fin, se trouvant hors des cristaux de hornblende des deux gabbros, sont similaires à ceux des diorites : plagioclase, biotite, hornblende, apatite, quartz et feldspath alcalin. Ces minéraux sont caractéristiques des granites. Ils ont cristallisé à ~790°C et ~2km de profondeur.La cristallisation des minéraux et leur extraction du magma par gravité provoque un changement progressif de la composition de ce dernier. Ainsi, après extraction d'olivine et d'orthopyroxene riches en Mg, de clinopyroxene riche en Ca, de plagioclase riche en Ca et Al et d'hornblende riche en Ca, Al et Mg, le liquide final sera appauvri en ces élé-ments. Un lien peut ainsi être proposé entre les diorites dont la composition est proche du liquide de départ, les granites dont la composition est similaire au liquide final, et les gabbros dont la minéralogie correspond aux minéraux extraits.L'utilisation de zircons, un minéral riche en U dont les atomes se transforment en Pb par décomposition radioactive au cours de millions d'années, permet de dater le refroidissement des roches qui les contiennent. Ainsi, il a été observé que les roches de la zone d'alimentation, à l'Ouest du complexe magmatique, ont cristallisés il y a 12.59±0.01 Ma, en même temps que les granites les plus vieux, se trouvant au sommet de la chambre magmatique, datés par Michel et al. (2008). Les deux roches pourraient donc avoir la même origine. A l'inverse, les gabbros et diorites de la chambre magmatique ont cristallisé entre 12.47±0.01Ma et 12.43±0.01Ma, les roches les plus vieilles étant à la base.En comparant la composition des roches du Torres del Paine avec celles d'autres en-tités géologiques de Patagonie, les causes du magmatisme peuvent être recherchées. A l'Ouest, on trouve en effet des intrusions granitiques, plus anciennes, caractéristiques de zones de convergence de plaque tectonique, alors qu'à l'Est, des laves basaltiques plus jeunes sont caractéristiques d'une dynamique d'extension. Sur la base des compositions chimiques des roches de ces différentes entités, l'évolution progressive de l'une à l'autre a pu être démontrée. Elle est certainement due à l'arrivée d'une dorsale océanique (zone d'extension crustale et de création de croûte océanique par la remontée de magma) dans la zone de subduction, le long des Andes.Je propose que, dans un premier temps, des magmas granitiques sont remontés dans la chambre magmatique, laissant d'importants volumes de cristaux dans la croûte pro-fonde. Dans un second épisode, les cristaux formés en profondeur ont été transportés à travers la croûte continentale, suite au mélange avec un nouveau magma injecté. Ces magmas chargés de cristaux ont traversé la zone d'alimentation avant de s'injecter dans la chambre magmatique. Différents puises ont été distingués, injectés dans la chambre magmatique du sommet à la base concernant les granites, puis à la base du granite le plus jeune pour les gabbros et diorites. Le complexe magmatique du Torres del Paine s'est construit sur une période totale de 160'000±20'000 ans.

Energy consumption of European and African shrews

Is the extremely high oxygen consumption of shrews due to an unusually high basal metabolism? In an attempt to answer this long-standing question, we have measured the oxygen consumption of 13 species of shrews of different origin: from Europe - Sorex araneus, S. Minutus, Neomys fodiens, Crocidura russula, and Suncus etruscus; from Africa - Crocidura bottegi, C. bicolor, C. jouvenetae; C. poensis, C. theresae, C. Wimmeri, C. flavescens, and C. giffardi, The measurements, taken over a period of 20-30 minutes, were made in small, closed-system chambers at 25°C. The metabolic rat our shrews of the subfamily Soricinae lies between the eman and minimum values of the Soricini (M=126.2 W0.52 cal/h and M=82.6 W0.53 cal/h, respectively), as recorded in the literature. Zhe average for the African Crocidurinae is much lower (M= 43.6 W0.67). The metabolic rate of the European Croccidura russula agrees with that of the African species. Thus, the Crocidurinae are characterized by a relatively low metabolic rate; the Soricinae, and in particular the tribe of the Soricini, by an extremely high metabolic rate. The tribes Neomyini and Blarinini occupy an intermediate position. These differences are also to be found at the level of the basal metabolism. This main difference between the two sub-families can most likely be explained by evolution in geographical isolation under differential climatic conditions: the Crocidurinae having evolved in tropical Africa and the Soricinae in temperate Eurasia

A Contabilidade de Gestão nas Empresas de Grande Dimensão de Cabo Verde

O presente estudo é uma abordagem das empresas cabo-verdianas para a compreensão da situação da contabilidade de gestão, evidenciando os sistemas de custeio utilizados, a adequação das informações obtidas e os benefícios da sua utilização. Deste modo, para atingirmos os objectivos foi formulada uma questão de investigação e respectivas hipóteses de investigação. Verificou-se pela literatura que no mundo a contabilidade de gestão tem sofrido várias alterações de forma a responder as mudanças do meio envolvente onde as empresas estão inseridas. No entanto, as técnicas contemporâneas têm sido adoptadas de uma forma muito lenta. A metodologia utilizada foi quantitativa, onde aplicamos um questionário para a recolha de dados, enviado por correio electrónico e respondido presencialmente, à amostra constituida por 164 empresas consideradas de grande dimensão, pertencentes aos três grandes sectores de actividade, tendo recebido em tempo útil, 54 respostas (32,9%). Contudo, destas 54 empresas que responderam apenas 14 possuem contabilidade de gestão. De acordo com os resultados obtidos, concluímos que as técnicas tradicionais de contabilidade de gestão são as mais utilizadas nas empresas estudadas, como por exemplo, o orçamento e a análise de desvios. No entanto, algumas empresas já utilizam técnicas contemporâneas, mas em simultâneo com as tradicionais.The main objective of this study is to analyze the situation of management accounting in Capeverdean companies. To characterize the situation of management accounting we formulated a research question and hypothesis in order to: analyze the cost system used, the quality of the information and the benefits of adopting a management accounting system. The literature shows that management accounting has been through many modifications and has steadily evolved so that it fits the environment where companies are implanted. However, the adoption of contemporary management accounting techniques has proven to be a slow process. The methodology used to gather data was through a survey. Some questionnaires were answered at the companies and the others were sent through e-mail to the sample of 164 large companies, belonging to the three main sectors. The response rate was of 18, 94% (54 companies). However, from those 54 companies just 14 have management accounting. According to the results, we have concluded that the companies we study have a management accounting system that relies on the use of the traditional techniques, like budget and budget control. Yet, some of those already use contemporary techniques, alongside the traditional techniques.

Adaptive sequence evolution in a color gene involved in the formation of the characteristic egg-dummies of male haplochromine cichlid fishes.

BACKGROUND: The exceptionally diverse species flocks of cichlid fishes in East Africa are prime examples of parallel adaptive radiations. About 80% of East Africa's more than 1 800 endemic cichlid species, and all species of the flocks of Lakes Victoria and Malawi, belong to a particularly rapidly evolving lineage, the haplochromines. One characteristic feature of the haplochromines is their possession of egg-dummies on the males' anal fins. These egg-spots mimic real eggs and play an important role in the mating system of these maternal mouthbrooding fish. RESULTS: Here, we show that the egg-spots of haplochromines are made up of yellow pigment cells, xanthophores, and that a gene coding for a type III receptor tyrosine kinase, colony-stimulating factor 1 receptor a (csf1ra), is expressed in egg-spot tissue. Molecular evolutionary analyses reveal that the extracellular ligand-binding and receptor-interacting domain of csf1ra underwent adaptive sequence evolution in the ancestral lineage of the haplochromines, coinciding with the emergence of egg-dummies. We also find that csf1ra is expressed in the egg-dummies of a distantly related cichlid species, the ectodine cichlid Ophthalmotilapia ventralis, in which markings with similar functions evolved on the pelvic fin in convergence to those of the haplochromines. CONCLUSION: We conclude that modifications of existing signal transduction mechanisms might have evolved in the haplochromine lineage in association with the origination of anal fin egg-dummies. That positive selection has acted during the evolution of a color gene that seems to be involved in the morphogenesis of a sexually selected trait, the egg-dummies, highlights the importance of further investigations of the comparative genomic basis of the phenotypic diversification of cichlid fishes.

Biological aspects of immature stage of Nyssomyia whitmani (Antunes and Coutinho) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) in laboratory conditions

Nyssomyia whitmani (Antunes and Coutinho, 1939) has been considered as a complex of cryptic species, and some of the populations of this complex plays an important role in the transmission of Leishmania spp. in Brazil. The present study reports the biological aspects concerning the productivity out of eggs and the development time of the descendants of females obtained in Dourados municipality, Mato Grosso do Sul state. The females were captured with modified electric aspirators, fed in hamsters and further individualized in containers for breeding. At the insectary, temperature and relative humidity were maintained on average of 24.5 °C and 67.3%, respectively. From 944 females 3737 eggs were obtained, 748 (20.0%) evolved to the stage of larvae, and 93 (12.4%) of these reached adult stage. The life cycle lasted 80.6 days and the last larval instar was the longest. The use of a higher protein diet revealed a significant improvement in larval development.

Courbe d'apprentissage lors de la réalisation des DALKs (Deep Anterior Lamellar Keratoplasty) : pièges et complications lors de nos 20 premières procédures

Objectif Analyser les résultats, les complications et les pièges rencontrés lors de la période d'apprentissage de la technique de la DALK avec réalisation d'une Big Bubble . Matériels et Méthodes : Étude rétrospective de 20 DALKs réalisées entre 2006 et 2007. L'âge moyen était de 45.21 ans (18 à 76). Le groupe comprenait 7 hommes et 13 femmes. Les indications opératoires étaient : kératocône (n=15), leucome herpétique (n=3) et taie cornéenne post-abcès bactérien (n=2). Le suivi comprenait la MAVC pré et post-opératoire, la réfraction post-opératoire, la transparence de la greffe, la qualité de l'interface donneur/receveur, et l'analyse des complications per et post-opératoires. Résultats Parmi les 20 DALKs, 8 cas ont été transformés en kératoplastie perforante à cause d'une perforation per-opératoire de la membrane de Descemet (40 % des cas). Le suivi moyen était de 7.77 mois. Les meilleures acuités visuelles corrigées moyennes pré et post-opératoires étaient de 0.158 (0.02 à 0.4) et 0.4357 (0.25 à 0.6) pour les DALKs et de 0.125 (0.1 à 0.3) et 0.463 (0.02 à 0.8) pour les DALKs transformées en kératoplastie perforante. Les greffes étaient transparentes dans tous les cas. Dans 3 cas, des plis de l'interface ont constitués une gêne de la qualité visuelle (di ou triplopie). Un haze de l'interface a été observé dans 5 cas avec disparition progressive lors du suivi. Discussion La DALK est une technique efficace dans le traitement des atteintes stromales profondes de la cornée, elle permet de préserver l'endothélium du donneur qui est sain dans ce type de pathologie. Conclusion La réalisation de la Big Bubble lors de la dissection de la Descemet et la qualité de l'interface donneur/receveur demeurent les éléments clés d'une telle procédure. Cette technique opératoire est probablement une des techniques les plus difficiles qu'un chirurgien de la cornée ait à maîtriser.

Toxicokinetics of captan and folpet biomarkers in orally exposed volunteers

The time courses of key biomarkers of exposure to captan and folpet was assessed in accessible biological matrices of orally exposed volunteers. Ten volunteers ingested 1 mg kg(-1) body weight of captan or folpet. Blood samples were withdrawn at fixed time periods over the 72 h following ingestion and complete urine voids were collected over 96 h post-dosing. The tetrahydrophthalimide (THPI) metabolite of captan along with the phthalimide (PI) and phthalic acid metabolites of folpet were then quantified in these samples. Plasma levels of THPI and PI increased progressively after ingestion, reaching peak values ~10 and 6 h post-dosing, respectively; subsequent elimination phase appeared monophasic with a mean elimination half-life (t(½) ) of 15.7 and 31.5 h, respectively. In urine, elimination rate time courses of PI and phthalic acid evolved in parallel, with respective t(½) of 27.3 and 27.6 h; relatively faster elimination was found for THPI, with mean t(½) of 11.7 h. However, phthalic acid was present in urine in 1000-fold higher amounts than PI. In the 96 h period post-treatment, on average 25% of folpet dose was excreted in urine as phthalic acid as compared with only 0.02% as PI. The corresponding value for THPI was 3.5%. Overall, THPI and PI appear as interesting biomarkers of recent exposure, with relatively short half-lives; their sensitivity to assess exposure in field studies should be further verified. Although not a metabolite specific to folpet, the concomitant use of phthalic acid as a major biomarker of exposure to folpet should also be considered. Copyright © 2011 John Wiley & Sons, Ltd.

Mitochondrial uncoupling as a regulator of life-history trajectories in birds: an experimental study in the zebra finch.

Mitochondria have a fundamental role in the transduction of energy from food into ATP. The coupling between food oxidation and ATP production is never perfect, but may nevertheless be of evolutionary significance. The 'uncoupling to survive' hypothesis suggests that 'mild' mitochondrial uncoupling evolved as a protective mechanism against the excessive production of damaging reactive oxygen species (ROS). Because resource allocation and ROS production are thought to shape animal life histories, alternative life-history trajectories might be driven by individual variation in the degree of mitochondrial uncoupling. We tested this hypothesis in a small bird species, the zebra finch (Taeniopygia guttata), by treating adults with the artificial mitochondrial uncoupler 2,4-dinitrophenol (DNP) over a 32-month period. In agreement with our expectations, the uncoupling treatment increased metabolic rate. However, we found no evidence that treated birds enjoyed lower oxidative stress levels or greater survival rates, in contrast to previous results in other taxa. In vitro experiments revealed lower sensitivity of ROS production to DNP in mitochondria isolated from skeletal muscles of zebra finch than mouse. In addition, we found significant reductions in the number of eggs laid and in the inflammatory immune response in treated birds. Altogether, our data suggest that the 'uncoupling to survive' hypothesis may not be applicable for zebra finches, presumably because of lower effects of mitochondrial uncoupling on mitochondrial ROS production in birds than in mammals. Nevertheless, mitochondrial uncoupling appeared to be a potential life-history regulator of traits such as fecundity and immunity at adulthood, even with food supplied ad libitum.

Shield morphology of curly overhair in 22 genera of Soricidae (Insectivora, Mammalia)

The structure of the shield of curly overhairs was studied in 22 genera of shrews, using scanning electron microscopy. The cross section of the shield is quadriconcave with two sides showing particular scale patterns or a relief which can be grouped into 4 morphological types: 1) a smooth type with, at most, shallow U-shaped notches; 2) a type with uniserial, V-shaped tiled notches; 3) a type with a groove and irregular notches; 4) a type with a deep ridged groove. Myosorex, which occupies a basal phyletic position, shows type 3. This type is therefore interpreted as an ancestral character state. It is found also in Feroculus and in some Sylvisorex. In the Crocidurinae, this type evolved into type 2 (Scutisorex and some Indomalayan Crocidura), and finally into type 1 (Suncus and most Crocidura). In the Soricinae, it evolved into type 4, which is common to all genera except Megasorex and Notiosorex. These two genera possess type 1 which is interpreted as being a synapomorphous character of these genera. The regression of the complex structure under dry climatic conditions supports the hypothesis that the function of the grooved form of hair is water repulsion.