Cross-presentation by WASp deficient B cells and dendritic cells

The immune system comprises of different cell types whose role is to protect us against pathogens. This thesis investigates a very important mechanism for our organism protection in a specific disorder: cross-presentation in Wiskott-Aldrich Syndrome (WAS). WAS is caused by loss-of-function mutations in the cytoskeletal regulator WASp and WAS patients suffer from eczema, thrombocytopenia, and immunodeficiency. X-linked neutropenia (XLN) is caused by gain-of-function mutations in WASp and XLN patients suffer from severe congenital neutropenia and immunodeficiency. This thesis was focused on the role of B and T lymphocytes and dendritic cells (DCs). This work will be divided into two main topics: 1) In the first part I studied the capacity of B cells to take up, degrade and present antigen. Moreover I studied the capacity of B cells to induce T cell proliferation. 2) In the second part, I studied T cell proliferation induced by dendritic cells. To increase our understanding about this mechanism, additional experiments were performed, including acidification capacity of CD8+ and CD8- DCs, reactive oxygen species (ROS) production since it is directly connected to acidification. These assays were measured by flow cytometry. Localization of Rac1 and Rac2 GTPases was assessed by confocal microscopy. Proliferation, acidification and ROS production assays were performed also with cells from X-linked neutropenia (XLN) mice. From this study we concluded that B cells cannot induce CD8+ T cell proliferation however they take up and present antigen. Moreover I have shown that increased cross-presentation by WASp KO DCs with ovalbumin is associated with decreased capacity to acidify endosomal compartment; and WASp KO CD8- DCs have increased Rac2 localization to the phagosome. XLN dendritic cells have similar acidification and ROS production capacity than wildtype cells. In conclusion, our data suggests that WASp regulates antigen processing and presentation in DCs.

Avaliação do desempenho agronômico da Bertalha (Basella alba L. Syn B. rubra) em Ouro Preto d'Oeste, Estado de Rondônia

RESUMOQuatro cultivares de bertalha (Basella alba L. syn B. rubra) foram comparadas em um experimento instalado em Ouro Preto D'Oeste, Rondônia, de janeiro a abril de 1985. As cultivares usadas foram: INPA 80, INPA 81, TATÁ e CALCUTÁ. Os resultados apresentaram diferenças significativas entre cultivares para a produção de galhos e folhas no segundo corte e produção toral. A cultivar TATÁ foi a que melhor se comportou, produzindo, respectivamente 685 e 992 g/planta no 2ocorte e produção total.

DESENVOLVIMENTO DE ÁRVORES NATIVAS EM ENSAIOS DE ESPÉCIES. 4. CASTANHA-DO-BRASIL (Bertholletia excelsa Η. B. K.), DEZ ANOS APÓS O PLANTIO

Três parcelas experimentais de Bertholletia excelsa (Castanha-do- Brasil) foram implantadas na Estação Experimental de Silvicultura Tropical do INPA/Manaus, em 1980, com o objetivo de obter dados sobre o crescimento da espécie com fins de produção de madeira e frutos. O sistema de plantio adotado foi em plena abertura, sobre Latossolo vermelho-amarelo, no espaçamento de 3,0 x 3,0 m. Foram observados, aos 10 anos, os seguintes resultados, diâmetro médio (DAP) de 13,9 cm e a altura total média de 15,41 m; os valores máximos de diâmetros e alturas encontrados foram de 21,7 cm e 23,0 m. respectivamente; a área basal média por hectare foi de 11,7098 nr. correspondendo a um volume médio de 117391 m3/ha; a espécie apresentou ótima desrama natural, boa adaptação ao Latossolo vermelho - amarelo, 69,44% de sobrevivência média, boa forma de fuste, não tendo sido verificadas doenças ou pragas.

A calculadora gráfica na promoção da escrita matemática na aprendizagem de modelos contínuos não lineares: um estudo com alunos do 11.º ano de Matemática B

Relatório de estágio de mestrado em Ensino de Matemática no 3.º Ciclo do Ensino Básico e no Ensino Secundário

Substituição do fubá de milho (Zea Mays, L.) por farinha de pupunha (Bactris Gasipaes, H. B. K.) em rações para Alevinos de Tambaqui (Colossoma Macropomum, Cuvier 1818)1

São apresentados os resultados da substituição do fubá de milho por farinha de pupunha, através do desempenho em crescimento e composição corporal de alevinos de tambaqui, alimentados durante 112dias com quatro dietas, constituídas de uma ração padrão e três níveis de substituição do fubá de milho. Osresultados demonstram que a farinha de pupunha pode substituir completamente o fubá de milho nas dietas para estes alevinos, sem afetar seu desempenho e composição corporal.

Quantificação de fibra alimentar em algumas populações de cubiu (Solanum sessiliflorum dunal), camu-camu (Myrciaria dubia (H.B.K) Mc Vaugh) e açaí (Euterpe oleracea mart)

Considerando a relevância da fibra alimentar na proteção, manutenção e recuperação da saúde e a escassez de tabelas de composição química dos alimentos no que se refere a frutos amazônicos, determinou-se o teor de fibra alimentar em algumas populações de cubiu (Solanum sessiliflonun Dunal), camu-camu (Myrciaria dubia (H.B.K) Mc Vaugh) e açaí (Euterpe oleracea Mart) pelo método enzímico-gravimétrico. Os frutos tiveram diversas procedências: cubiu, da Estação Experimental do INPA/CPCA, camu-camu do município de Barcelos e ao longo da bacia do Rio Amazonas e açaí da bacia do Rio Solimões. Verificou-se que a concentração de fibra alimentar total e insolúvel nas amostras de açaí provenientes de Benjamin Constant (7,66±0,33 g e 6,60±0.IX g) e Anamã (7,45±0,25 g e 6,51±0,04 g), foi significativamente maior (p<0,05), quando comparada com os de outras procedências. Com relação ao cubiu, as maiores concentrações de fibra alimentar total foram detectadas nas amostras Alejo (4,38±0,0 g) e ACSI (3,88±0,18 g), salientando-se que fração analisada inclui a casca, cuja contribuição foi significativamente maior (p<0,05) nas frações insolúvel, solúvel e total. Da mesma forma, os teores de fibra alimentar total (6,18±0,25 g) e insolúvel (5,08±0,14 g) da casca do camu-camu, foram superiores aos encontrados nas demais amostras. Portanto, os frutos analisados apresentaram um potencial relevante como fonte de fibra alimentar, sendo mais uma opção para contribuir na adequação nutricional da população Amazônica e do país.

Açaí (Euterpe oleracea mart.) e camu-camu (Myrciaria dubia (H.B.K.) Mc Vaugh) possuem ação anti anêmica?

Avaliou-se o impacto da utilização do açaí e camu-camu em pré-escolares de uma Unidade Filantrópica de Manaus-AM. Foram selecionadas 85 crianças voluntárias, de dois a seis anos incompletos, de ambos os sexos, distribuídas aleatoriamente em 5 grupos, tendo como fonte de ferro e vitamina C: açaí e açaí + camu-camu, perfazendo um total de 2 mg de ferro e 40 mg de ácido ascórbico, assim como o ferro aminoácido quelato na concentração de 1 e 2 mg de ferro. O ferro foi distribuído diariamente na colação por um período de 120 dias. Na caracterização da anemia considerou-se o ponto de corte de hemoglobina <11g/dL. Os resultados demonstraram que de um universo de 85 crianças 6 (7%) apresentaram um quadro de desnutrição crônica, sendo ao final da intervenção reduzido para 4 (4,7%). O maior impacto da utilização do açaí foi como fonte energética, refletido no ganho de peso significativo das crianças (1,76 kg), mesmo quando adicionado de camu-camu (1,69 kg). Em relação a concentração de hemoglobina, não foi constatada diferença significativa entre as crianças dos diferentes grupos, independente da fonte de ferro: açaí (0,71 g/dL); açaí + camu-camu (0,60 g/dL), Ferro 2 mg (0,88 g/dL); água (0,85 g/ dL) e Ferro 1 mg (0,54 g/dL). Entretanto, a recuperação de crianças anêmicas foi maior no grupo que recebeu ferro aminoácido quelato na concentração de 2 mg de ferro. Conclui-se que o açaí tem um grande potencial como fonte energética e pouca expressividade como fonte de ferro, mesmo adicionado de camu-camu.

Candida bracarensis: Evaluation of virulence factors and its tolerance to Amphotericin B and Fluconazole

Candida bracarensis is an uncommon Candida species found during an epidemiological study of candidiasis performed in Braga, Portugal. Initially, it was identified as C. glabrata, but recently detailed analyses pointed out their differences. So, little information is still available about C. bracarensis virulence factors and antifungal susceptibilities. Therefore, the main goal of this work is to evaluate the ability of C. bracarensis to form biofilms, to produce hydrolytic enzymes (proteases, phospholipases and hemolysins), as well as its susceptibility to amphotericin B and fluconazole. It was shown, for the first time, that all C. bracarensis strains were able to form biofilms and display proteinase and hemolytic activities. Moreover, although planktonic cells presented antifungal susceptibility, amphotericin B and fluconazole were unable to inhibit biofilm formation and eradicate pre-formed biofilms. Due to the propensity of C. bracarensis to display antifungal resistance and virulence attributes, the control of these emerging pathogens is recommended.

Os Óleos Essenciais de Piper reticulatum L. e P. crassinervium H. B. K.

Os óleos essenciais das folhas e galhos finos de Piper reticulatum e de P. crassinervium, coletados na região norte do Brasil, foram obtidos por arraste à vapor e analisados através de GC/MS. O óleo de P. reticulatum é constituido principalmente por β-elemeno (24,6%) e β-cariofileno (16,7%). Os principais compostos identificados no óleo de P. crassinervium foramβ-cariofileno (17,7%), γ-elemeno (14,4%) e β-elemeno (10,9%).

Ocorrência de Tuthillia cognata Hodkinson, Brown & Burckhardt, 1986(Hemiptera: Homoptera, Psyllidae) em plantios experimentais de camu-camu Myrciaria dubia (H.B.K.) Mc Vaugh em Manaus (Amazonas, Brasil)

O cultivo de camu-camu Myrciaria dubia (H.B.K.) Mc Vaugh tem apresentado inúmeros problemas fitossanitários, dentre os quais, Tuthillia cognata Hodkinson et al. (Hemiptera: Homoptera, Psyllidae), que constantemente é citada como praga secundária. Os objetivos deste estudo foram determinar o nível e a intensidade de infestação (%) por T. cognata e estudar aspectos do ciclo biológico e do comportamento de T. cognata, em plantios experimentais de camu-camu. Foram selecionados, de forma aleatória, 17 e 14 exemplares nos plantios I e II, respectivamente. Para cada uma das variáveis estudadas, foram calculados a média aritmética, o desviopadrão, a variância e a amplitude de variação. Foi verificado um nível de infestação de 82% (plantio I) e 57% (plantio II), uma intensidade de infestação de 94% (plantio I) e 75% (plantio II) e uma média de seis ninfas/folha em cada plantio, o que indica que T. cognata representa uma das pragas-chave dessa cultura. Foram observados adultos de Chrysoperla sp. (Neuroptera: Chrysopidae) e ninfas de Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera), que podem atuar como prováveis agentes de controle biológico de T. cognata.

Jet energy measurement and its systematic uncertainty in proton-proton collisions at s√=7 TeV with the ATLAS detector

The jet energy scale (JES) and its systematic uncertainty are determined for jets measured with the ATLAS detector using proton–proton collision data with a centre-of-mass energy of s√=7 TeV corresponding to an integrated luminosity of 4.7 fb −1 . Jets are reconstructed from energy deposits forming topological clusters of calorimeter cells using the anti- kt algorithm with distance parameters R=0.4 or R=0.6 , and are calibrated using MC simulations. A residual JES correction is applied to account for differences between data and MC simulations. This correction and its systematic uncertainty are estimated using a combination of in situ techniques exploiting the transverse momentum balance between a jet and a reference object such as a photon or a Z boson, for 20≤pjetT<1000 GeV and pseudorapidities |η|<4.5 . The effect of multiple proton–proton interactions is corrected for, and an uncertainty is evaluated using in situ techniques. The smallest JES uncertainty of less than 1 % is found in the central calorimeter region ( |η|<1.2 ) for jets with 55≤pjetT<500 GeV . For central jets at lower pT , the uncertainty is about 3 %. A consistent JES estimate is found using measurements of the calorimeter response of single hadrons in proton–proton collisions and test-beam data, which also provide the estimate for pjetT>1 TeV. The calibration of forward jets is derived from dijet pT balance measurements. The resulting uncertainty reaches its largest value of 6 % for low- pT jets at |η|=4.5 . Additional JES uncertainties due to specific event topologies, such as close-by jets or selections of event samples with an enhanced content of jets originating from light quarks or gluons, are also discussed. The magnitude of these uncertainties depends on the event sample used in a given physics analysis, but typically amounts to 0.5–3 %.

Differential top-antitop cross-section measurements as a function of observables constructed from final-state particles using pp collisions at s√=7 TeV in the ATLAS detector

Various differential cross-sections are measured in top-quark pair (tt¯) events produced in proton--proton collisions at a centre-of-mass energy of s√=7 TeV at the LHC with the ATLAS detector. These differential cross-sections are presented in a data set corresponding to an integrated luminosity of 4.6 fb−1. The differential cross-sections are presented in terms of kinematic variables of a top-quark proxy referred to as the pseudo-top-quark whose dependence on theoretical models is minimal. The pseudo-top-quark can be defined in terms of either reconstructed detector objects or stable particles in an analogous way. The measurements are performed on tt¯ events in the lepton+jets channel, requiring exactly one charged lepton and at least four jets with at least two of them tagged as originating from a b-quark. The hadronic and leptonic pseudo-top-quarks are defined via the leptonic or hadronic decay mode of the W boson produced by the top-quark decay in events with a single charged lepton.The cross-section is measured as a function of the transverse momentum and rapidity of both the hadronic and leptonic pseudo-top-quark as well as the transverse momentum, rapidity and invariant mass of the pseudo-top-quark pair system. The measurements are corrected for detector effects and are presented within a kinematic range that closely matches the detector acceptance. Differential cross-section measurements of the pseudo-top-quark variables are compared with several Monte Carlo models that implement next-to-leading order or leading-order multi-leg matrix-element calculations.

Measurement of Spin Correlation in Top-Antitop Quark Events and Search for Top Squark Pair Production in pp Collisions at s√=8 TeV Using the ATLAS Detector

A measurement of spin correlation in tt¯ production is presented using data collected with the ATLAS detector at the Large Hadron Collider in proton-proton collisions at a center-of-mass energy of 8 TeV, corresponding to an integrated luminosity of 20.3 fb−1. The correlation between the top and antitop quark spins is extracted from dilepton tt¯ events by using the difference in azimuthal angle between the two charged leptons in the laboratory frame. In the helicity basis the measured degree of correlation corresponds to Ahelicity=0.38±0.04, in agreement with the Standard Model prediction. A search is performed for pair production of top squarks with masses close to the top quark mass decaying to predominantly right-handed top quarks and a light neutralino, the lightest supersymmetric particle. Top squarks with masses between the top quark mass and 191 GeV are excluded at the 95% confidence level.

Search for direct pair production of a chargino and a neutralino decaying to the 125 GeV Higgs boson in root s=8 TeV pp collisions with the ATLAS detector

A search is presented for the direct pair production of a chargino and a neutralino pp→χ~±1χ~02, where the chargino decays to the lightest neutralino and the W boson, χ~±1→χ~01(W±→ℓ±ν), while the neutralino decays to the lightest neutralino and the 125 GeV Higgs boson, χ~02→χ~01(h→bb/γγ/ℓ±νqq). The final states considered for the search have large missing transverse momentum, an isolated electron or muon, and one of the following: either two jets identified as originating from bottom quarks, or two photons, or a second electron or muon with the same electric charge. The analysis is based on 20.3 fb−1 of s√=8 TeV proton-proton collision data delivered by the Large Hadron Collider and recorded with the ATLAS detector. Observations are consistent with the Standard Model expectations, and limits are set in the context of a simplified supersymmetric model.

Search for massive supersymmetric particles decaying to many jets using the ATLAS detector in pp collisions at s√=8TeV

Results of a search for decays of massive particles to fully hadronic final states are presented. This search uses 20.3 fb−1 of data collected by the ATLAS detector in s√=8TeV proton--proton collisions at the LHC. Signatures based on high jet multiplicities without requirements on the missing transverse momentum are used to search for R-parity-violating supersymmetric gluino pair production with subsequent decays to quarks. The analysis is performed using a requirement on the number of jets, in combination with separate requirements on the number of b-tagged jets, as well as a topological observable formed from the scalar sum of the mass values of large-radius jets in the event. Results are interpreted in the context of all possible branching ratios of direct gluino decays to various quark flavors. No significant deviation is observed from the expected Standard Model backgrounds estimated using jet-counting as well as data-driven templates of the total-jet-mass spectra. Gluino pair decays to ten or more quarks via intermediate neutralinos are excluded for a gluino with mass mg~<1TeV for a neutralino mass mχ~01=500GeV. Direct gluino decays to six quarks are excluded for mg~<917GeV for light-flavor final states, and results for various flavor hypotheses are presented.