Multi-trait and random regression mature weight heritability and breeding value estimates in Nelore cattle

Mature weight breeding values were estimated using a multi-trait animal model (MM) and a random regression animal model (RRM). Data consisted of 82 064 weight records from 8 145 animals, recorded from birth to eight years of age. Weights at standard ages were considered in the MM. All models included contemporary groups as fixed effects, and age of dam (linear and quadratic effects) and animal age as covariates. In the RRM, mean trends were modelled through a cubic regression on orthogonal polynomials of animal age and genetic maternal and direct and maternal permanent environmental effects were also included as random. Legendre polynomials of orders 4, 3, 6 and 3 were used for animal and maternal genetic and permanent environmental effects, respectively, considering five classes of residual variances. Mature weight (five years) direct heritability estimates were 0.35 (MM) and 0.38 (RRM). Rank correlation between sires' breeding values estimated by MM and RRM was 0.82. However, selecting the top 2% (12) or 10% (62) of the young sires based on the MM predicted breeding values, respectively 71% and 80% of the same sires would be selected if RRM estimates were used instead. The RRM modelled the changes in the (co)variances with age adequately and larger breeding value accuracies can be expected using this model. �� South African Society for Animal Science.

Cryptococcus gattii and Cryptococcus albidus in captive domestic Pigeon (Columba livia)

Cryptococcosis in animals is an important fungal disease caused by the encapsulated yeast Cryptococcus neoformans. This report describes the occurrence of Cryptococcus gattii and Cryptococcus albidus in domestic pigeon (Columba livia), living together with other birds in a breeding center. The animal presented a pinkish, vascularized mass with gelatinous aspect localized subcutaneously under the right lower eyelid, with approximately 2cm in diameter. At microbiological exam it was isolated Cryptococcus gatti from the eyelid mass, lungs and liver, C. albidus from the trachea and both Cryptococcus species from muscle and kidney.

Genetic parameter estimates and principal component analysis of breeding values of reproduction and growth traits in female Canchim cattle

Phenotypic data from female Canchim beef cattle were used to obtain estimates of genetic parameters for reproduction and growth traits using a linear animal mixed model. In addition, relationships among animal estimated breeding values (EBVs) for these traits were explored using principal component analysis. The traits studied in female Canchim cattle were age at first calving (AFC), age at second calving (ASC), calving interval (CI), and bodyweight at 420 days of age (BW420). The heritability estimates for AFC, ASC, CI and BW420 were 0.03��0.01, 0.07��0.01, 0.06��0.02, and 0.24��0.02, respectively. The genetic correlations for AFC with ASC, AFC with CI, AFC with BW420, ASC with CI, ASC with BW420, and CI with BW420 were 0.87��0.07, 0.23��0.02, -0.15��0.01, 0.67��0.13, -0.07��0.13, and 0.02��0.14, respectively. Standardised EBVs for AFC, ASC and CI exhibited a high association with the first principal component, whereas the standardised EBV for BW420 was closely associated with the second principal component. The heritability estimates for AFC, ASC and CI suggest that these traits would respond slowly to selection. However, selection response could be enhanced by constructing selection indices based on the principal components. �� CSIRO 2013.

Involvement of pituitary gonadotropins, gonadal steroids and breeding season in sex change of protogynous dusky grouper, Epinephelus marginatus (Teleostei: Serranidae), induced by a non-steroidal aromatase inhibitor

Two experiments were performed using the aromatase inhibitor (AI) letrozole (100mg/kg) to promote sex change, from female-to-male, in protogynous dusky grouper. One experiment was performed during the breeding season (spring) and the other at the end of the breeding season (summer). During the spring, AI promoted sex change after 9weeks and the sperm produced was able to fertilize grouper oocytes. During the summer, the sex change was incomplete; intersex individuals were present and sperm was not released by any of the animals. Sex changed gonads had a lamellar architecture; cysts of spermatocytes and spermatozoa in the lumen of the germinal compartment. In the spring, after 4weeks, 11ketotestosterone (11KT) levels were higher in the AI than in control fish, and after 9weeks, coincident with semen release, testosterone levels increased in the AI group, while 11KT returned to the initial levels. Estradiol (E2) levels remained unchanged during the experimental period. Instead of decreasing throughout the period, as in control group, 17 ��-OH progesterone levels did not change in the AI-treated fish, resulting in higher values after 9weeks when compared with control fish. fsh�� and lh�� gene expression in the AI animals were lower compared with control fish after 9weeks. The use of AI was effective to obtain functional males during the breeding season. The increase in androgens, modulated by gonadotropins, triggered the sex change, enabling the development of male germ cells, whereas a decrease in E2 levels was not required to change sex in dusky grouper. �� 2013 Elsevier Inc.

Genetic parameters for scrotal circumference, breeding soundness examination and sperm defects in young Nellore bulls

A total of 51,161 records of scrotal circumference measurements at 18 mo of age (SCI 8) and 17,648 records of sperm defects and breeding soundness of Nellore bulls (mean age of 22.5 mo), raised under extensive conditions, were analyzed to estimate coefficients of heritability and genetic correlations of morphological semen traits by Bayesian inference. The observed semen traits were classified as minor (MID). major (MAD), and total sperm defects (TD). The animals were classified according to breeding soundness as satisfactory and unsatisfactory potential breeders. The (co)variance components and breeding values were estimated by Gibbs sampling using the GIBBS2F90 program under an animal model that included contemporary group as fixed effect, age of animal as linear covariate, and direct additive genetic effects as random effects. Heritabilities of 0.40 �� 0.02, 0.16 �� 0.02, 0.04 �� 0.01, 0.15 �� 0.01, and 0.10 �� 0.01 were obtained for SCI8, MID, MAD, TD, and breeding soundness, respectively. The SC18 showed a positive and moderate correlation with breeding soundness (0.56 �� 0.04) and a negative and low correlation with MID (-0.23 �� 0.03), MAD (-0.16 �� 0.02), and TD (-0.24 �� 0.02). In conclusion, scrotal circumference showed the best response to selection among the traits studied and was favorably correlated with breeding soundness and sperm morphology in young Nellore bulls. �� 2013 American Society of Animal Science. All rights reserved.

Valor econ��mico e impacto da sele����o para precocidade reprodutiva de f��meas na ra��a Nelore

Coordena����o de Aperfei��oamento de Pessoal de N��vel Superior (CAPES)

Strategies to improve the efficiency of genomic selection in animal breeding programs

P��s-gradua����o em Zootecnia - FCAV

A genomic assisted breeding program for cassava to improve nutritional quality and industrial traits of storage root

A mandioca �� cultivada como "mandioca mansa" para consumo in natura e "mandioca para ind��stria" como fonte de amidos e farinhas. Ra��as locais foram utilizadas para descoberta de "muta����es espont��neas" e desenvolvimento de abordagem evolutiva e de melhoramento para estudos de fun����o g��nica. Recursos de Gen��mica e Prote��mica foram obtidos. An��lises de express��o g��nica por blot de RNA e microarranjos foram desenvolvidos para identifica����o de express��o diferencial. "Mandioca a��ucarada" foi identificada, sendo relacionada com falta de express��o do gene da BEI e de uma muta����o "nonsence" na sequ��ncia do gene GBSSI causando a forma����o do amido serose. "Mandioca avermelhada" apresentou falta de express��o do gene CasLYB, e a "amarela" uma regula����o de repress��o do gene CasHYb. An��lise Prote��mica do complexo caroten��ide-prote��na, juntamente com a an��lise de express��o de gene da CAP4, revelaram uma dupla fita de cDNA associada ao elevado ac��mulo de caroten��ide. Sequenciamento do gene da GBSSI identificou 22 hapl��tipos e grande diversidade de nucleot��dios. Popula����es segregantes de cruzamentos de fen��tipos bioqu��micos diferenciados com cultivares elites dos Cerrados foram obtidas.

"Avalia����o androl��gica e criopreserva����o de s��men de Ateles (macaco-aranha) mantidos em cativeiro"

A biotecnologia aplicada �� reprodu����o �� uma ferramenta tamb��m importante para conserva����o de esp��cies amea��adas de extin����o. Algumas esp��cies de primatas n��o-humanos neotropicais t��m sido amplamente agredidas por a����es antr��picas, ocasionando a inclus��o de 26 esp��cies brasileiras na lista oficial de animais amea��ados de extin����o do IBAMA. As esp��cies de primatas n��o humanos Ateles belzebuth e Ateles paniscus, participantes do g��nero Ateles, popularmente chamados de macaco-aranha, encontram-se particularmente amea��adas. Poucos estudos s��o realizados acerca do status populacional destas esp��cies e menos ainda sobre dados reprodutivos e reprodu����o assistida. O presente trabalho pretendeu avaliar as caracter��sticas androl��gicas de exemplares de primatas n��o humanos do g��nero Ateles em cativeiro e comparar a performance dos diluentes TES e CEBRAN II, este ��ltimo �� base de ringer lactato, como criopreservadores de s��men destas esp��cies. O experimento foi realizado utilizando 06 exemplares machos de primatas n��o humanos do g��nero Ateles (02 exemplares de Ateles marginatus e 04 exemplares de Ateles paniscus) mantidos sob as mesmas condi����es de cativeiro no Centro Nacional de Primatas (CENP-SVS/MS), em Ananindeua, Par��. Os animais utilizados foram submetidos a exame cl��nico-androl��gico e biometria testicular, antes da colheita seminal realizada por eletroejacula����o. Foram realizadas avalia����es f��sicoqu��micas e de patologias esperm��ticas, al��m de avalia����o de motilidade e vigor no s��men a fresco e p��s-dilui����o com os diluentes TES e CEBRAN II. As al��quotas de s��men dilu��das com os dois diluentes, na propor����o 2:1, foram envasadas em minitubos com capacidade para 0,25 ml e criopreservados em nitrog��nio l��quido. Ap��s descongela����o, as doses envasadas foram avaliadas em teste de termo-resist��ncia (T.T.R.). As m��dias de volume e concentra����o esperm��ticas obtidas foram, respectivamente, 1,94 ml (�� 0,83) e 3.020.000 sptz/ml (��275,97). O pH 8 foi observado em todas as amostras e todos os exemplares apresentaram coagula����o seminal. O ��ndice de patologias esperm��ticas encontrados foi alto (69,8% �� 9,05) indicando que pode haver influ��ncia da sazonalidade reprodutiva nas caracter��sticas seminais encontradas nos animais deste experimento. Os resultados de avalia����o de motilidade e vigor do s��men a fresco, dilu��do e no T.T.R. n��o puderam ser analisadas estatisticamente, pois somente o s��men de 03 animais demonstrou espermatoz��ides vi��veis p��s-descongela����o, com resultados que sugerem que o diluente TES apresenta melhor efici��ncia na preserva����o de s��men de Ateles do que o diluente CEBRAN II.

Etnoecologia, pesca e manejo comunit��rio de quel��nios aqu��ticos na v��rzea do Baixo rio Amazonas

O presente estudo descreve, registra e compara estrat��gias de pesca e manejo comunit��rio de quel��nios aqu��ticos em tr��s comunidades da v��rzea de Santar��m. Avaliou-se tamb��m o consumo de quel��nios, incluindo prefer��ncias, rejei����es e tabus alimentares, e uso destes como recursos terap��uticos na medicina popular. As t��cnicas de pesca de quel��nios empregadas foram descritas, compreendendo varia����es espacial e sazonal de uso e esp��cies capturadas e seletividade das t��cnicas fundamentadas nos saberes locais. Analisaram-se ainda o rendimento das pescarias e as rela����es entre investimento e retorno das mesmas. Os dados foram coletados entre junho de 2007 a julho de 2008. Realizaram-se conversas informais, acompanhamento das atividades pesqueiras e observa����o participante nas comunidades. Entrevistas semi-estruturadas tamb��m foram realizadas adotando-se o m��todo recordat��rio alimentar, monitoramento do consumo anual de quel��nios e recorda����es das ��ltimas pescarias de quel��nios. Os primeiros relatos de manejo de quel��nios na Amaz��nia s��o datados da ��poca do contato entre popula����es amer��ndias e europeias. Na d��cada de 70 a����es do governo brasileiro foram implementadas fundamentadas no gerenciamento centralizado no poder do Estado. Hoje, pr��ticas de comanejo de quel��nios ocorrem em v��rios lugares na Amaz��nia, como nas comunidades Ilha de S��o Miguel, Costa do Aritapera e ��gua Preta. Mesmo pautados na demanda comunit��ria os manejos dessas tr��s comunidades apresentam perspectivas diferenciadas em virtude do variado grau de experi��ncia com sistemas de manejo comunit��rio. A Ilha de S��o Miguel j�� realiza o manejo de quel��nios h�� cerca de 40 anos com certo grau de sucesso, enquanto na ��gua Preta o co-manejo vem sendo estabelecido h�� 22 anos de forma menos rigorosa e na Costa do Aritapera n��o se obteve ��xito em sua recente implementa����o. De modo geral, a inclus��o dos principais usu��rios dos recursos naturais em seu manejo ainda se constitui uma tarefa de dif��cil execu����o. O grande desafio para o manejo de quel��nios e outros recursos da fauna cineg��tica na Amaz��nia �� o reconhecimento legal de seu uso. O consumo de quel��nios �� uma tradi����o enraizada na cultura amaz��nica, entretanto �� criminalizado, constrangendo a maior parte da popula����o a assumir seu uso. Por ser considerada atividade ilegal n��o h�� estimativas da quantidade de animais explorados, tornando dif��cil a implanta����o de formas de manejo comunit��rio sustent��veis. Percebeu-se na dieta dos ribeirinhos desse estudo a participa����o de peixe como principal fonte de prote��na animal, enquanto o consumo de quel��nios registrado foi relativamente pequeno. Constataram-se diferen��as quanto ��s esp��cies de quel��nios consumidas. Em geral, tracaj�� (Podocnemis unifilis) (carne e ovos) configura-se como quel��nio mais consumido nas tr��s comunidades, sendo a pitiu (Podocnemis sextuberculata) (carne e ovos) consumida principalmente na Costa do Aritapera. As tartarugas (Podocnemis expansa) s��o pouco utilizadas, n��o houve registros de coleta de seus ovos, sendo sua carne consumida principalmente na Ilha de S��o Miguel. Tais varia����es podem estar relacionadas �� combina����o de fatores ecol��gicos e ao hist��rico do manejo presentes em cada comunidade. N��o foram observadas diferen��as culturais nas comunidades estudadas quanto ao uso de quel��nios. Tartaruga �� a esp��cie mais rejeitada, usada principalmente na medicina popular; tracaj�� e pitiu em geral s��o os quel��nios preferidos, sendo os tr��s considerados reimosos (animais sujeitos a tabus alimentares em algumas circunst��ncias, como doen��as, menstrua����o, gravidez e p��s-parto). A esp��cie mais capturada foi o tracaj��, seguindo-se a pitiu e em menor propor����o a tartaruga. O tracaj�� �� encontrado em v��rios ambientes, sendo coletado durante o ano todo nas tr��s comunidades; pitius s��o capturadas principalmente na Costa do Aritapera no per��odo da seca e da vazante, quando est��o concentradas durante a migra����o ao sa��rem das ��reas inund��veis em dire����o aos rios e ��s praias de desova, enquanto tartarugas s��o pescadas nos lagos protegidos da Ilha de S��o Miguel, na enchente e na cheia. As t��cnicas de pesca apresentam uso diferenciado em fun����o do n��vel do rio. Os pescadores reconhecem tais varia����es sazonais, as quais aliadas a um conjunto de saberes locais s��o utilizadas na sele����o das t��cnicas de pesca de quel��nios. A pesca de quel��nios �� realizada em geral de modo oportuno, durante as pescarias de peixes. O rendimento das pescarias de quel��nio foi maior quando estas n��o inclu��ram a captura de peixes e quando realizadas com uso da m��o. O rendimento com base na CPUE_N diferiu entre as comunidades estudadas e entre os per��odos de pesca, por��m n��o houve diferen��a significativa no rendimento das pescarias entre esses par��metros quando a biomassa foi utilizada nos c��lculos de CPUE. O pescador, em geral, n��o est�� preocupado em maximizar seu rendimento, j�� que a maior parte das pescarias n��o se destina a comercializa����o. O rendimento, desta forma, acaba refletindo mais o acerto de um bom local de pesca do que o esfor��o de deslocamento empregado na mesma.Quando a mancha era boa os pescadores gastavam pouco tempo, enquanto em manchas menos produtivas gastavam mais tempo. Alguns pontos a serem adotados com vistas �� concretiza����o e sucesso do manejo comunit��rio s��o sugeridos nesse estudo: (1) defini����o clara dos direitos de acesso aos recursos e das san����es em caso de infra����o dos acordos; (2) estabelecimento de programas de capacita����o de lideran��as comunit��rias; (3) cria����o de um fundo comunit��rio para desenvolvimento de outras atividades econ��micas e investimento na melhoria da qualidade de vida dos moradores e nas pr��prias a����es envolvidas no manejo; (4) reconhecimento e uso do conhecimento ecol��gico local e do direito de se utilizar o recurso; (5) amplia����o regional do modelo comunit��rio para outras ��reas, considerando que algumas esp��cies realizam grandes migra����es; (6) monitoramento das popula����es exploradas; (7) avalia����o peri��dica da efetiva����o do manejo e seu papel para os moradores locais; (8) reparti����o dos benef��cios entre os comunit��rios. No caso espec��fico dos quel��nios recomendam-se tamb��m a prote����o de outros ambientes al��m das ��reas de nidifica����o e a determina����o de um sistema de cotas voltado ao aproveitamento de ovos que seriam perdidos com possibilidade de comercializa����o para criadores.

Aplica����o de an��lise de sobreviv��ncia no estudo da imobilidade t��nica e do comportamento de reintegra����o social de perdizes (Rhynchotus rufescens)

P��s-gradua����o em Gen��tica e Melhoramento Animal - FCAV

Intera����o genotipo-ambiente para idade ao primeiro parto, per��metro escrotal e peso ao sobreano em bovinos da ra��a Nelore utilizando normas de rea����o

P��s-gradua����o em Gen��tica e Melhoramento Animal - FCAV

The Buffalo Genome and the Application of Genomics in Animal Management and Improvement

The publication of the human genome sequence in 2001 was a major step forward in knowledge necessary to understand the variations between individuals. For farmed species, genomic sequence information will facilitate the selection of animals optimised to live, and be productive, in particular environments. The availability of cattle genome sequence has allowed the breeding industry to take the first steps towards predicting phenotypes from genotypes by estimating a genomic breeding value (gEBV) for bulls using genome-wide DNA markers. The sequencing of the buffalo genome and creation of a panel of DNA markers has created the opportunity to apply molecular selection approaches for this species.The genomes of several buffalo of different breeds were sequenced and aligned with the bovine genome, which facilitated the identification of millions of sequence variants in the buffalo genomes. Based on frequencies of variants within and among buffalo breeds, and their distribution across the genome compared with the bovine genome, 90,000 putative single nucleotide polymorphisms (SNP) were selected to create an Axiom (R) Buffalo Genotyping Array 90K. This SNP Chip was tested in buffalo populations from Italy and Brazil and found to have at least 75% high quality and polymorphic markers in these populations. The 90K SNP chip was then used to investigate the structure of buffalo populations, and to localise the variations having a major effect on milk production.