Predição genômica utilizando painéis de marcadores moleculares com diferentes densidades, em bovinos da raça Nelore

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Efeito da utilização de diferentes matrizes genômicas e parentesco na avaliação genética de bovinos de corte

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Assinaturas de seleção em bovinos da raça Canchim

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Análise de pedigree e estimativas de parâmetros genéticos para características reprodutivas em bovinos da raça Brahman

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia Animal - FEIS

Parâmetros genéticos para características indicadoras de eficiência reprodutiva e produtiva de ovinos da raça Santa Inês

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos para características reprodutivas e de temperamento em bovinos da raça Nelore

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos para características reprodutivas e de temperamento em bovinos da raça Nelore

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Female fertility in a Guzerat dairy subpopulation: Heterogeneity of variance components for calving intervals

The objectives of the present study were to determine if variance components of calving intervals varied with age at calving and if considering calving intervals as a longitudinal trait would be a useful approach for fertility analysis of Zebu dairy herds. With these purposes, calving records from females born from 1940 to 2006 in a Guzerat dairy subpopulation in Brazil were analyzed. The fixed effects of contemporary groups, formed by year and farm at birth or at calving, and the regressions of age at calving, equivalent inbreeding coefficient and day of the year on the studied traits were considered in the statistical models. In one approach, calving intervals (Cl) were analyzed as a single trait, by fitting a statistical model on which both animal and permanent environment effects were adjusted for the effect of age at calving by random regression. In a second approach, a four-trait analysis was conducted, including age at first calving (AFC) and three different female categories for the calving intervals: first calving females; young females (less than 80 months old, but not first calving); or mature females (80 months old or more). Finally, a two-trait analysis was performed, also including AFC and Cl, but calving intervals were regarded as a single trait in a repeatability model. Additionally, the ranking of sires was compared among approaches. Calving intervals decreased with age until females were about 80 months old, remaining nearly constant after that age. A quasi-linear increase of 11.5 days on the calving intervals was observed for each 10% increase in the female's equivalent inbreeding coefficient. The heritability of AFC was 0.37. For Cl. the genetic-phenotypic variance ratios ranged from 0.064 to 0.141, depending on the approach and on ages at calving. Differences among genetic variance components for calving intervals were observed along the animal's lifetime. Those differences confirmed the longitudinal aspect of that trait, indicating the importance of such consideration when accessing fertility of Zebu dairy females, especially in situations where the available information relies on their calving intervals. Spearman rank correlations among approaches ranged from 0.90 to 0.95, and changes observed in the ranking of sires suggested that the genetic progress of the population could be affected by the approach chosen for the analysis of calving intervals. (C) 2012 Elsevier ay. All rights reserved.

Contribution and perspectives of quantitative genetics to plant breeding in Brazil

The purpose of this article is to show how quantitative genetics has contributed to the huge genetic progress obtained in plant breeding in Brazil in the last forty years. The information obtained through quantitative genetics has given Brazilian breeders the possibility of responding to innumerable questions in their work in a much more informative way, such as the use or not of hybrid cultivars, which segregating population to use, which breeding method to employ, alternatives for improving the efficiency of selection programs, and how to handle the data of progeny and/or cultivars evaluations to identify the most stable ones and thus improve recommendations.

Efeito da dieta líquida sobre o desempenho de leitões neonatos e seus reflexos na matriz suína

Para ser competitivo atualmente, o sistema intensivo de produção de suínos deve estar pautado na eficiência. A fim de obter esta eficiência produtiva, o avanço genético das ultimas décadas buscou por fêmeas suínas cada vez mais prolíficas. A prolificidade contudo, veio acompanhada por uma queda no consumo voluntário de alimento por parte das fêmeas, bem como um aumento na produção de leite, e no número de leitões nascidos; o aumento da leitegada, levou a uma redução do peso ao nascimento e um aumento da heterogeneidade entre os leitões. Como forma de contornar o problema, são oferecidas aos leitões dietas formuladas com ingredientes de alto valor biológico a partir dos sete dias de vida, procurando suprir a demanda nutricional do animal durante o período de amamentação e preparar seu sistema digestório para o desmame. Contudo, grande parte das dietas formuladas para os leitões neonatos são oferecidas aos animais em sua forma sólida. Neste projeto, avaliamos os efeitos sobre a performance de leitões neonatos e da performance reprodutiva da fêmea suína do oferecimento de uma dieta líquida para os leitões neonatos, dieta esta que foi disponibilizada aos animais através de um sistema automatizado que realizou a mistura do alimento em sua forma sólida com a água. Para tais avaliações, os leitões ao nascer foram alocados em três grupos distintos, recebendo a dieta em sua forma líquida, em sua forma sólida ou então apenas o leite materno. Foram avaliadas variáveis zootécnicas relacionadas aos leitões, como peso, ganho diário de peso, consumo de ração, conversão alimentar, mortalidade pré-desmame; frequência de dias com diarreia nos leitões em fase de maternidade e creche. Foram eutanasiados leitões aos 14 e aos 28 dias de idade, para a realização do exame morfométrico da altura de vilosidade, profundidade de cripta e a relação entre a altura de vilosidade e profundidade de cripta nas porções do duodeno, jejuno e íleo. Avaliamos também o impacto do uso da dieta líquida sobre o catabolismo sofrido pela fêmea durante a lactação, através da aferição do peso e da espessura de toucinho desta fêmeas durante o período lactacional e também a duração do intervalo desmame estro e a duração do estro subsequente ao desmame. Não verificamos contudo um melhor desempenho zootécnico dos leitões nos períodos de maternidade e creche, tão pouco uma alteração favorável quanto a frequência de dias com diarreia nas duas fases em relação aos leitões que não consumiram nenhum tipo de suplementação. Quanto aos parâmetros morfométricos do intestino delgado, apenas aos 28 dias de idade os leitões que receberam a dieta líquida apresentaram maiores alturas de vilosidades no íleo em relação aos leitões que consumiram a dieta sólida e os animais do grupo controle apresentaram menores profundidades de cripta no mesmo seguimento e idade quando comparados aos demais animais. Contudo, estas alterações não foram o suficiente para garantir diferenças na relação altura de vilosidade:profundidade de cripta. E ainda, a suplementação independente de sua forma não reduziu o catabolismo sofrido pela fêmea suína durante a lactação

Adaptabilidade e estabilidade de progênies de meios-irmãos de pinhão-manso em diferentes regiões do Brasil.

RESUMO: Programas de melhoramento do pinhão-manso (Jatropha curcas L.) intensificaram-se nos últimos cinco anos, tendo sido selecionadas, localmente, plantas em diversas regiões do Brasil. O objetivo deste trabalho foi quantificar a interação genótipos x ambientes da produção de grãos de pinhão-manso, avaliada em três regiões brasileiras, e o progresso genético obtido com a seleção. A partir de progênies de meios-irmãos, selecionadas pela Embrapa Semiárido e pela EPAMIG, foram instalados, no ano de 2008, três testes de progênies, nos municípios de Planaltina, DF, Nova Porteirinha, MG e Pelotas, RS, utilizando-se delineamento de blocos ao acaso, com três repetições e cinco plantas por parcela. Como testemunhas foram utilizadas sementes de plantas não selecionadas e um dos materiais genéticos comercializados no Brasil. A interação genótipo x ambiente foi significativa. Foram identificadas oito progênies de adaptabilidade geral, três progênies de baixa adaptabilidade, duas progênies de adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e duas progênies de adaptabilidade específica a ambientes desfavoráveis, em diferentes regiões do Brasil. As estimativas de progresso genético indicam eficiência da seleção massal, com ganhos de 28, 76 e 177%, nos municípios de Planaltina, DF, de Nova Porteirinha, MG, e de Pelota, RS, respectivamente. Observa-se que os ganhos de seleção obtidos pelo método centroide são mais equilibrados entre ambientes e, por isso, preferíveis. As novas médias, estimadas com o plantio das progênies selecionadas, em toneladas por hectare, são de 2,34 ton.ha-1, em Planaltina, DF; de 2,37 ton.ha-1, em Nova Porteirinha, MG, e de 2,09 ton.ha-1 , em Pelotas, RS. ABSTRACT: Physic nut (Jatropha curcas L.) breeding programs have intensified in the past five years, locally selecting plants from various Brazilian regions. The objective of this study was to quantify the genotype x environment interaction of the physic nut grain production and the genetic progress obtained with the selection. From Half-sib progenies selected by Embrapa and EPAMIG, in 2008, three progeny trials were installed in the cities of Planaltina-DF, Nova Porteirinha-MG and Pelotas-RS, using a randomized block design with three replications of five plants per plot. Non-selected plant seeds and genetic material commercialized in Brazil were used as control. The genotype x environment interaction was significant for the J. curcas grain yield expression. We identified eight progenies of broad adaptability, three progenies of low adaptability, two progenies of specific adaptability to favorable environments and two progenies of specific adaptability to unfavorable environments of different Brazilian regions. Estimates of genetic progress indicate mass selection efficiency, with genetic gains of 28%, 76% and 177% in the Planaltina-DF, New Porteirinha-MG and Pelotas-RS, respectively. The genetic gains obtained by the centroid method were more balanced among environments, and therefore, preferable. The new means estimated with the cultivating of the selected progenies are: 2.34 ton.ha-1 in Planaltina-DF, 2.37 ton.ha-1 in Nova Porteirinha- MG and 2.09 ton.ha-1 in Pelotas-RS.

Regulatory approaches to genetic testing in insurance

Rapid advancements in the field of genetic science have engendered considerable debate, speculation, misinformation and legislative action worldwide. While programs such as the Human Genome Project bring the prospect of seemingly miraculous medical advancements within imminent reach, they also create the potential for significant invasions of traditional areas of privacy and human dignity through laying the potential foundation for new forms of discrimination in insurance, employment and immigration regulation. The insurance industry, which has of course, traditionally been premised on discrimination as part of its underwriting process, is proving to be the frontline of this regulatory battle with extensive legislation, guidelines and debate marking its progress.

Domestication to crop improvement: Genetic resources for sorghum and saccharum (Andropogoneae)

Background Both sorghum (Sorghum bicolor) and sugarcane (Saccharum officinarum) are members of the Andropogoneae tribe in the Poaceae and are each other's closest relatives amongst cultivated plants. Both are relatively recent domesticates and comparatively little of the genetic potential of these taxa and their wild relatives has been captured by breeding programmes to date. This review assesses the genetic gains made by plant breeders since domestication and the progress in the characterization of genetic resources and their utilization in crop improvement for these two related species. Genetic Resources The genome of sorghum has recently been sequenced providing a great boost to our knowledge of the evolution of grass genomes and the wealth of diversity within S. bicolor taxa. Molecular analysis of the Sorghum genus has identified close relatives of S. bicolor with novel traits, endosperm structure and composition that may be used to expand the cultivated gene pool. Mutant populations (including TILLING populations) provide a useful addition to genetic resources for this species. Sugarcane is a complex polyploid with a large and variable number of copies of each gene. The wild relatives of sugarcane represent a reservoir of genetic diversity for use in sugarcane improvement. Techniques for quantitative molecular analysis of gene or allele copy number in this genetically complex crop have been developed. SNP discovery and mapping in sugarcane has been advanced by the development of high-throughput techniques for ecoTILLING in sugarcane. Genetic linkage maps of the sugarcane genome are being improved for use in breeding selection. The improvement of both sorghum and sugarcane will be accelerated by the incorporation of more diverse germplasm into the domesticated gene pools using molecular tools and the improved knowledge of these genomes.

Genetic susceptibility to complex traits : moving towards informed analysis of whole-genome screens

Susceptibility to complex traits, by definition, involves aetiological polymorphisms at multiple genetic loci combined with variable contributions by environmental factors. However, the approaches taken to identifying genetic loci implicated in susceptibility to complex traits frequently overlooks the compounding contribution of multiple loci in favour of highlighting a single gene solely responsible for predisposition. It is only in a small minority of cases that this has resulted in clear disease heritability associated with polymorphisms in a single gene. More often, this approach has led to an accumulation of single-gene associations with minor contributions to disease susceptibility. As the genomic era advances and genome-wide screens become higher in resolution and throughput, the need for simultaneous consideration of multiple loci is becoming more important. With special reference to non-Hodgkin’s lymphoma (NHL), this chapter will overview the current progress made in elucidating genetic polymorphisms associated with disease susceptibility. We also present novel data from a high-resolution single nucleotide polymorphism (SNP) microarray screen for susceptibility loci that are involved in NHL. Using an ‘informed approach’, the findings are highlighted within the context of cellular pathways, and provide insight and new ideas for methods of analysis for genome-wide screens for susceptibility.

Investigation of genetic diversity and development of vaccine for Chlamydia pecorum infections in koala (Phascolarctos cinereus)

Many wild koala populations in Australia continue to experience serious declines due to factors such as disease caused by Chlamydia. This thesis is the first of its kind to investigate diversity of the chlamydial infections in wild koala populations across Australia and has made significant progress towards the development of a vaccine for koalas. The findings in this study have demonstrated that it is feasible to develop a safe and effective recombinant vaccine against Chlamydia in both disease free as well as severely diseased koalas. Most importantly, this study is also first of its kind to evaluate a multi-component vaccine that should be effective against the range of Chlamydia pecorum strains circulating in both captive as well as wild koala populations.