Controls on intense silicate weathering in a tropical river, southwestern India

The Silicate Weathering Rate (SWR) and associated Carbon dioxide Consumption Rate (CCR) in tropical silicate terrain is assessed through a study of the major ion chemistry in a small west flowing river of Peninsular India, the Nethravati River. The specific features of the river basin are high mean annual rainfall and temperature, high runoff and a Precambrian basement composed of granitic-gneiss, charnockite and minor metasediments. The water samples (n = 56) were collected from three locations along the Nethravati River and from two of its tributaries over a period of twelve months. Chemical Weathering Rate (CWR) for the entire watershed is calculated by applying rainwater correction using river chloride as a tracer. Chemical Weathering Rate in the Nethravati watershed is estimated to 44 t.km(-2).y(-1) encompassing a SWR of 42 t.km(-2).y(-1) and a maximum carbonate contribution of 2 t.km(-2).y(-1). This SWR is among the highest reported for granito-gneissic terrains. The assessed CCR is 2.9 . 10(5) mol.km(-2).y(-1). The weathering index (Re). calculated from molecular ratios of dissolved cations and silica in the river, suggests an intense silicate weathering leading to kaolinite-gibbsite precipitation in the weathering covers. The intense SWR and CCR could be due to the combination of high runoff and temperature along with the thickness and nature of the weathering cover. The comparison of silicate weathering fluxes with other watersheds reveals that under similar morpho-climatic settings basalt weathering would be 2.5 times higher than the granite-gneissic rocks. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

Caracterización, evaluación preliminar y adaptabilidad de cuatro variedades de frijol común (Phaseolus vulgaris L.) en tres localidades de San Ramón, Matagalpa, postrera 2012

El presente trabajo se realizó con el objetivo de determinar la variabilidad fenotípica y adaptabilidad de tres variedades criollas o acriolladas (CCR, HVR, Rojo Nica) de frijol común ( Phaseolus vulgaris L .) y una variedad mejorada (INTA Rojo) en tres fincas del municipio de San Ramón, Matagalpa (Guadalupe: 1, 2 y 3) durante el cic lo agrícola postrera, 2012. Para el ensayo se estableció una sola repetición de los tratamientos por localidad en parcelas de cinco metros de ancho por diez metros de largo . Como parcela útil se tomó los cinco surcos centrales de cinco metros de largo por dos metros de ancho ( 10 m 2 ) . P ar a la caracterización se utilizaron 13 variables cualitativas donde el tamaño de muestra fue de 25 plantas por parcela útil . Para las 12 variables cuantita tivas la muestra varió de acuerdo a la variable evaluada . La interacción Genotipo x Ambiente (G x A) se determinó a través del Análisis Efectos Principales Aditivos e Interacciones Multiplicativas (AMMI), esto permitió una mejor interpretación del efecto principal de las variedades y de los ambientes. Los resultados de dicha interacción demostraron que los materiales genéticos se comportaron de manera diferente en las distintas fincas. La variedad acriollada CCR y la finca Guadalupe 2 mostraron los mayores valores promedios en cuanto al rendimiento de grano, aunque t ambién resultaron los más inestables. El análisis AMMI permitió detectar interacciones positivas y negativas entre los diferentes materiales genéticos y fincas resaltando el comportamiento de INTA Rojo en la finca Guadalupe 2 (ambiente de alta productividad) y la variedad H - vaina roja en la finca Guadalupe 3 (ambiente de baja productividad) . Las variedades Rojo Nica y H - vaina roja resultaron estables pero deficientes en cuanto al rendimiento . En términos generales, el presente estudio permitió c onocer mejor fenotípicamente las variedades criollas o acriolladas del frijol común que están siendo utilizadas por los agricultores de la comunidad de Guadalupe.

Estimación de la capacidad de carga turística de la Reserva Natural Volcán Mombacho, Granada, Nicaragua

Este estudio identifica los principales factores que inciden en la determinación de la CCT de los senderos El Cráter, El Puma y El Cafetal de la Reserva Natural Volcán Mombacho. La Capacidad de carga turística se consideró tal y como propone Cifuentes en su metodología, en tres niveles: Capacidad de Carga Física (CCF), Capacidad de Carga Real (CCR) y Capacidad de Carga Efectiva (CCE) (Cifuentes, M. 1999). Se estimó la Capacidad de Manejo (CM) de la RNVM, en 74.24%, obteniendo en el sendero El Cráter una CCE de 442 visitas/día, en el sendero El Puma de 93 visitas/día, y en el sendero El Cafetal de 753 visitas/día. Si se lograse un incremento de la CM en un 80%; el sendero El Cráter in crementaría su CCE a 476 visitas/día; el sendero El Puma a 101 visitas/día; y el sendero El Cafetal a 811 visitas/día. Este escenario está calculado para visitantes con propósitos eco turísticos. Debido a que las visitas de estudiantes de colegio, muestran un comportamiento diferente, se realizó el cálculo considerando dichos elementos en los factores de corrección para los Sendero El Cráter y El Cafetal (El Puma no es frecuentado por estudiantes de colegio). La CCE para estudiantes en el sendero El Cráter fue de 236 visitas/día, con una CM del 74.24%, y para un escenario del 80% de CM se calcula en 255 visitas/día; para el sendero El Cafetal se calculó en 403 visitas/día a un 74.24% de CM y 434 visitas/día a una CM del 80%. Las visitas máximas reportadas para el año 2003 fueron en los meses de Enero y Junio, con 298 y 305 visitas/día; en el año 2002 se reportan los meses de Marzo y Mayo con 366 y 298 visitas/día; la visitación al Sendero El Cráter no excede aún la CCE calculada, no así si los visitantes fueran estudian tes de colegio. Si la tendencia de la visitación continua incrementándose con los años, se requerirá que la administración de la RNVM restringa el número de visitas en los períodos picos de las mismas.

Efecto de la hipertermia sobre la proliferación de células CC531 in vitro

El cáncer colorrectal (CCR) es un problema mundial, con una incidencia anual de aproximadamente un millón de casos, y una mortalidad anual de más de 500.000. Así, el CCR es la segunda causa de mortalidad por cáncer entre hombres y mujeres. Además, se prevé que el número absoluto de casos aumentará en las próximas dos décadas como resultado del envejecimiento y la expansión de las poblaciones, tanto en los países desarrollados como en los países en desarrol lo (1, 2). Gran parte de los carcinomas colorrectales son adenocarcinomas glandulares, caracterizados por la invasión de tejidos o estructuras circundantes y por su potencial de metastatizar, por vía linfática o vascular. De hecho, alrededor del 50% de los pacientes con cáncer de colon desarrollan metástasis hepáticas, bien en la presentación del tumor o en la recidiva de la enfermedad. Por este motivo, las metástasis hepáticas del CCR constituyen un problema clínico de primera magnitud. En la última década , la cirugía ha aumentado sus indicaciones desde pacientes con no más de tres metástasis , hasta pacientes con una masa tumoral hepática inicialmente no resecable, pero susceptibles de reducir el volumen tumoral mediante quimioterapia o de incrementar la m asa hepática remanente hasta proporciones compatibles con la supervivencia del enfermo (embolizaciones, ligadura de vasos portales, etc.). Hoy por hoy, la técnica curativa indiscutida es la resección quirúrgica del parénquima hepático invadido por tumor; s in embargo, solo una pequeña parte de los pacientes que presentan metástasis hepáticas son aptos para someterse a resección quirúrgica (

Estudio comparativo entre tumor primario y metastásico de la trimetilación de la Histona H3 en el modelo in vivo de metástasis hepática de cáncer colorrectal murino.

Los mecanismos epigenéticos, entre los que está implicada la modificación covalente de histonas, son esenciales para el mantenimiento estable de la actividad génica en las células. Estos mecanismos también están implicados en la aparición de enfermedades como el cáncer colorrectal (CCR), siendo la metástasis hepática una de las formas más agresivas de la misma al producir una drástica disminución de la esperanza de vida del enfermo. Las modificaciones en las histonas, conocidas recientemente como código histónico, afectan a la estructura de la cromatina y juegan un papel importante en el desarrollo de la tumorogénesis. Sin embargo, se sabe poco acerca de aquellas células que adquieren la capacidad de metastatizar, y es por ello que en el presente trabajo se estudian las diferencias epigenéticas entre células tumorales primarias y células tumorales metastásicas para el patrón de trimetilación de la histona H3 en tres residuos diferentes del aminoácido lisina: lisina 4 (H3K4me3), lisina 9 (H3K9me3) y lisina 27 (H3K27me3).

A manifestação da fé em Cachoeira Paulista: o espaço sagrado da comunidade Canção Nova 1978-2011

A geografia da religião no Brasil pós 1990, vem apresentando temas que auxiliam os geógrafos no entendimento do espaço. Para o geógrafo da religião, os estudos têm por análise a dimensão espacial da fé, no tempo e no espaço, trata-se da análise de duas categorias: o sagrado e o profano. Esta pesquisa visa como objetivo, o estudo da comunidade católica, a Canção Nova, inserida em um movimento renovador na Igreja Católica Apostólica Romana denominada Renovação Carismática Católica (RCC) em seu espaço e no tempo de fé. Torna-se necessário desenvolver a importância do sagrado no Vale do Paraíba Paulista em seus sucessivos (re) arranjos espaciais na hierópolis de Cachoeira Paulista. A interpretação dessas organizações espaciais ocorreu ao analisar os possíveis agentes modeladores no espaço: peregrinos, turistas, visitantes, comerciantes e moradores. O Espaço Sagrado e seus respectivos espaços vinculados representaram a contribuição geográfica dessa dissertação e facilitou a compreensão do homem com o divino e sua relação na dimensão econômica, a dimensão política e a dimensão do lugar.

Análise da via Wnt e seu envolvimento no processo da tumorigênese do câncer colo-retal

O câncer colo-retal (CCR) representa o quarto tipo de câncer mais freqüente no Brasil entre homens e mulheres e a sobrevida para esse tipo de neoplasia é considerada boa, se a doença for diagnosticada em estádio inicial. Neste tipo de câncer a progressão do adenoma (tumor benigno) para o adenocarcinoma (tumor maligno) é dependente do acúmulo de mutações em diversos oncogenes e genes supressores de tumor. Estas mutações podem levar a alterações de importantes vias de sinalização que controlam estes eventos como, por exemplo, as vias Wnt e EGFR. No entanto, os mecanismos moleculares e celulares mediados por estas vias durante a progressão do CCR permanecem por serem definidos. Neste trabalho foi avaliada a participação da via Wnt e do EGFR durante a progressão do CCR usando células Caco-2, uma linhagem celular derivada de adenocarcinoma de cólon humano como modelo. As células foram tratadas com EGF, ativador da via EGFR, e cloreto de lítio (LiCl), um conhecido inibidor da enzima GSK-3β e conseqüentemente, ativador da via Wnt, ou alternativamente com a combinação de ambas drogas. Após os tratamentos, foi avaliada a morfologia celular, localização e expressão de proteínas juncionais, os padrões proliferativos e do ciclo celular e o potencial tumorigênico (migração e formação de colônias). Nossos resultados mostram que a localização subcelular das proteínas juncionais claudina-1 e β-catenina foi alterada após tratamento com EGF e LiCl, porém a expressão não foi afetada. A localização nuclear de β-catenina, um marcador da ativação da via Wnt, foi observada após tratamento com ambos os compostos, no entanto estes agentes modularam a enzima GSK-3β de forma diferencial. Além disso, tratamento com EGF aumentou a capacidade proliferativa e migratória da célula, mas não alterou a formação de colônias. LiCl, apesar de ser um conhecido ativador da via Wnt, inibiu o aumento da proliferação e migração causado pelo EGF, como visto pelo tratamento das células com EGF+LiCl, e reduziu a formação de colônias. Nossos resultados revelaram que LiCl possui uma atividade supressora de tumor o que pode representar um novo papel para este composto como um possível agente terapêutico para o tratamento do CCR.

Hautetsitako gune genomikoen analisia Sasiardia arrazan: gene gakoen identifikazioa

Sasi-ardiaren genoma osoaren sekuentziazioaz eta bioinformatikako tresnak erabiliaz, hautespenari lotutako zenbait genoma zati identifikatzea.

Influência da superexpressão da claudina-3 na radiorresposta de células de câncer de cólon

O câncer colorretal (CCR) é o terceiro tipo de câncer mais incidente no mundo para o sexo masculino, o segundo para o sexo feminino e a radioterapia é um dos tratamentos de primeira linha no combate a este tipo de câncer. Durante a progressão do CCR as células sofrem alterações morfogenéticas, sendo a desorganização do complexo juncional apical (CJA) um dos eventos iniciais desse processo. As junções oclusivas (JTs) são um dos principais componentes da CJA e desempenham papel importante no controle do fluxo paracelular, na determinação da polaridade celular e na transdução de sinais relacionados com a progressão tumoral. As claudinas são proteínas transmembrana, constituintes das JTs e cumprem um importante papel no controle desses eventos. Alterações na expressão das claudinas são observadas em tumores de diferentes órgãos e têm sido relacionadas com a progressão tumoral. No entanto os mecanismos que regulam essas alterações e sua consequência na progressão do CCR são poucos conhecidos. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo avaliar a influência da superexpressão da claudina-3 na radiorresposta de células CCR. Nossos resultados mostraram que a superexpressão de claudina-3 minimiza alterações morfológicas causadas pela radiação, causa diminuição da resistência elétrica transepitelial e não tem efeito na permeabilidade a macromoléculas após a irradiação. Além disso, observamos que a superexpressão de claudina-3 aumenta o potencial proliferativo das células e que esta característica torna as células mais sensíveis a radiação. Porém quando avaliamos eventos celulares relacionados a progressão tumoral observamos que apesar da radiação diminuir a capacidade migratória das progênies, as células que superexpressam claudina-3 apresentam migração mais elevada. Além disso, verificamos que a superexpressão de claudina-3 diminui a invasão e a capacidade de formação de colônias frente ao tratamento com a radiação. Em seguida fomos avaliar o efeito da inibição das vias de proliferação (MEK/ERK) e sobrevivência (PI3K-Akt) na resposta das células que superexpressam claudina-3 frente a radiação. Observamos que a inibição de MEK é capaz de sensibilizar as células que superexpressam claudina-3 à radiação no ensaio de proliferação celular, no entanto a inibição de MEK e PI3K antes da exposição à radiação é capaz aumentar a migração e a capacidade de formação de colônias de células que superexpressam claudina-3 contribuindo para o aumento do potencial maligno. Em conjunto nossos resultados mostram que a superexpressão de claudina-3 contribui para um fenótipo mais maligno, no entanto frente ao tratamento com a radiação é capaz de sensibilizar as células.

Characterization of C-C chemokine receptor subfamily in teleost fish

Chemokines and their receptors play important roles in nervous and immune systems. Little information, however, exists concerning this gene family in teleost fish. In the present Study, 17 C-C chemokine receptors genes were identified from Danio rerio, 9 from Gasterosteus aculeatus, 10 from Oryzius latipes, 8 from Takifugu rubripes and 5 from Tetraodon nigroviridis. Phylogenetic analysis showed that the orthologs to mammalian CCR6, 7, 8, 9 and CCRL1 receptors were evident in zebrafish, but the clear orthologs to mammalian CCR1, 2, 3, 4, 5 and 10 were not found in zebrafish. The gene structure of zebrafish CCR (zfCCR) was further analyzed. The open reading frame of zfCCR3-1, zfCCR3-3, zfCCR6-1, zfCCR6-2, zfCCR8-2 contain one exon, and two exons were identified for zfCCR2-1, zfCCR2-2, zfCCR4 and zfCCRLI-1, three exons for zfCCR3-2, zfCCR5 and zfCCR7, four exons for zfCCR8-1 and zfCCR9-1. The expression analyses showed that in zebrafish, most C-C chemokine receptor genes Were expressed in fertilized eggs and oocytes, and all the receptor genes were expressed in larval stages. The zfCCR2-2, zfCCR3-1, zfCCR4 and zfCCR6-2 genes were expressed in all normal organs examined, whereas not for zfCCR2-1, zfCCR3-3, zfCCR6-1, zfCCR8-1, zfCCR9-2 and zfCCRL1-2. The expression of zfCCR3-2, zfCCR5, zfCCR7, zfCCR9-1 and zfCCRLI-1 were detected in the majority organs. and zfCCR8-2 and zfCCR8-3 detected only in brain. The differential expression pattern of different paralogues in organs may indicate their difference in function, which requires further investigation. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Quantitative structure-property relationship study on reductive dehalogenation of selected halogenated aliphatic hydrocarbons in sediment slurries

In this study, by the use of partial least squares (PLS) method and 26 quantum chemical descriptors computed by PM3 Hamiltonian, a quantitative structure-property relationship (QSPR) model was developed for reductive dehalogenation rate constants of 13 halogenated aliphatic compounds in sediment slurry under anaerobic conditions. The model can be used to explain the dehalogenation mechanism. Halogenated aliphatic compounds with great energy of the lowest unoccupied molecular orbital (E-lumo), total energy (TE), electronic energy (EE), the smallest bond order of the carbon-halogen bonds (BO) and the most positive net atomic charges on an atom of the molecule (q(+)) values tend to be reductively dehalogenated slow, whereas halogenated aliphatic compounds with high values of molecular weight (Mw), average molecular polarizability (a) and core-core repulsion energy (CCR) values tend to be reductively dehalogenated fastest. (C) 2001 Published by Elsevier Science Ltd.

On Learning Counting Functions With Queries

We investigate the problem of learning disjunctions of counting functions, which are general cases of parity and modulo functions, with equivalence and membership queries. We prove that, for any prime number p, the class of disjunctions of integer-weighted counting functions with modulus p over the domain Znq (or Zn) for any given integer q ≥ 2 is polynomial time learnable using at most n + 1 equivalence queries, where the hypotheses issued by the learner are disjunctions of at most n counting functions with weights from Zp. The result is obtained through learning linear systems over an arbitrary field. In general a counting function may have a composite modulus. We prove that, for any given integer q ≥ 2, over the domain Zn2, the class of read-once disjunctions of Boolean-weighted counting functions with modulus q is polynomial time learnable with only one equivalence query, and the class of disjunctions of log log n Boolean-weighted counting functions with modulus q is polynomial time learnable. Finally, we present an algorithm for learning graph-based counting functions.

Adding Polymorphic Abstraction to ML (Detailed Abstract)

The ML programming language restricts type polymorphism to occur only in the "let-in" construct and requires every occurrence of a formal parameter of a function (a lambda abstraction) to have the same type. Milner in 1978 refers to this restriction (which was adopted to help ML achieve automatic type inference) as a serious limitation. We show that this restriction can be relaxed enough to allow universal polymorphic abstraction without losing automatic type inference. This extension is equivalent to the rank-2 fragment of system F. We precisely characterize the additional program phrases (lambda terms) that can be typed with this extension and we describe typing anomalies both before and after the extension. We discuss how macros may be used to gain some of the power of rank-3 types without losing automatic type inference. We also discuss user-interface problems in how to inform the programmer of the possible types a program phrase may have.

How Good are Genetic Algorithms at Finding Large Cliques: An Experimental Study

This paper investigates the power of genetic algorithms at solving the MAX-CLIQUE problem. We measure the performance of a standard genetic algorithm on an elementary set of problem instances consisting of embedded cliques in random graphs. We indicate the need for improvement, and introduce a new genetic algorithm, the multi-phase annealed GA, which exhibits superior performance on the same problem set. As we scale up the problem size and test on \hard" benchmark instances, we notice a degraded performance in the algorithm caused by premature convergence to local minima. To alleviate this problem, a sequence of modi cations are implemented ranging from changes in input representation to systematic local search. The most recent version, called union GA, incorporates the features of union cross-over, greedy replacement, and diversity enhancement. It shows a marked speed-up in the number of iterations required to find a given solution, as well as some improvement in the clique size found. We discuss issues related to the SIMD implementation of the genetic algorithms on a Thinking Machines CM-5, which was necessitated by the intrinsically high time complexity (O(n3)) of the serial algorithm for computing one iteration. Our preliminary conclusions are: (1) a genetic algorithm needs to be heavily customized to work "well" for the clique problem; (2) a GA is computationally very expensive, and its use is only recommended if it is known to find larger cliques than other algorithms; (3) although our customization e ort is bringing forth continued improvements, there is no clear evidence, at this time, that a GA will have better success in circumventing local minima.

Using Warp to Control Network Contention in Mermera

Parallel computing on a network of workstations can saturate the communication network, leading to excessive message delays and consequently poor application performance. We examine empirically the consequences of integrating a flow control protocol, called Warp control [Par93], into Mermera, a software shared memory system that supports parallel computing on distributed systems [HS93]. For an asynchronous iterative program that solves a system of linear equations, our measurements show that Warp succeeds in stabilizing the network's behavior even under high levels of contention. As a result, the application achieves a higher effective communication throughput, and a reduced completion time. In some cases, however, Warp control does not achieve the performance attainable by fixed size buffering when using a statically optimal buffer size. Our use of Warp to regulate the allocation of network bandwidth emphasizes the possibility for integrating it with the allocation of other resources, such as CPU cycles and disk bandwidth, so as to optimize overall system throughput, and enable fully-shared execution of parallel programs.