961 resultados para fast sample preparation method


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Background: The antibody Ki-67 is a reliable and easy tool to accurately assess the growth fraction of neoplasms in humans and animals, and it has been used to predict the clinical outcome. Therefore, the aim of the present study was to investigate the immunohistochemical expression pattern of Ki-67 in normal and neoplastic perianal glands of dogs to evaluate the possible use of this proliferation marker as an ancillary method of perianal tumor diagnosis. We studied 42 cases of perianal gland neoplasms including adenomas (n = 15), epitheliomas (n = 15), and carcinomas (n = 12). As controls, 13 tissue samples from normal perianal glands were used. A Ki-67 index was established by a computer-assisted image analysis and compared with manual counting. Results: Out of the 42 cases of perianal gland neoplasms, 34 were from males and eight from females. Recurrence was reported in 14 cases, being higher (8/12) in carcinomas. Immunostaining for Ki-67 revealed that the carcinomas showed a higher proliferation rate (9.87%) compared to groups of epitheliomas (2.66%) and adenomas (0.36%). For adenomas and epitheliomas of the perianal glands the computer-assisted counting and the manual counting gave similar results; however, only the computer-assisted image analysis was efficient to predict the perianal gland carcinoma recurrence.Conclusion: Since there were significant differences in the number of Ki-67-positive nuclei, this marker proved to be effective in helping the classification of perianal gland neoplasms and to refine the diagnosis criteria, especially in those samples with high variation in morphology/area. Also, higher Ki-67 index is related to recurrence in cases of perianal gland carcinomas. Further, the computer-assisted image analysis proved to be a fast and reliable method to assess the Ki-67 index in perianal gland neoplasms. © 2013 Pereira et al.; licensee BioMed Central Ltd.

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The X-ray Fluorescence (XRF) analysis is a technique for the qualitative and quantitative determination of chemical constituents in a sample. This method is based on detection of the characteristic radiation intensities emitted by the elements of the sample, when properly excited. A variant of this technique is the Total Reflection X-ray Fluorescence (TXRF) that utilizes electromagnetic radiation as excitation source. In total reflection of X-ray, the angle of refraction of the incident beam tends to zero and the refracted beam is tangent to the sample support interface. Thus, there is a minimum angle of incidence at which no refracted beam exists and all incident radiation undergoes total reflection. In this study, we evaluated the influence of the energy variation of the beam of incident x-rays, using the MCNPX code (Monte Carlo NParticle) based on Monte Carlo method. © 2013 AIP Publishing LLC.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Os sequenciadores de nova geração como as plataformas Illumina e SOLiD geram uma grande quantidade de dados, comumente, acima de 10 Gigabytes de arquivos-texto. Particularmente, a plataforma SOLiD permite o sequenciamento de múltiplas amostras em uma única corrida (denominada de corrida multiplex) por meio de um sistema de marcação chamado Barcode. Esta funcionalidade requer um processo computacional para separação dos dados por amostra, pois, o sequenciador fornece a mistura de todas amostras em uma única saída. Este processo deve ser seguro a fim de evitar eventuais embaralhamentos que possam prejudicar as análises posteriores. Neste contexto, o presente trabalho propõe desenvolvimento de um modelo probabilístico capaz de caracterizar sistema de marcação utilizado em sequenciamentos multiplex. Os resultados obtidos corroboraram a suficiência do modelo obtido, o qual permite, dentre outras coisas, identificar faltas em algum passo do processo de sequenciamento; adaptar e desenvolver de novos protocolos para preparação de amostras, além de atribuir um Grau de Confiança aos dados gerados e guiar um processo de filtragem que respeite as características de cada sequenciamento, não descartando sequências úteis de forma arbitrária.

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Pós-graduação em Alimentos e Nutrição - FCFAR

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Diversas estratégias para preparo de amostra, determinação e fracionamento, tais como espectrometria de absorção atômica com atomização eletrotérmica em forno de grafite (GF AAS) e espectrometria de emissão óptica com plasma acoplado indutivamente com configuração axial (ICP OES), foram empregadas para o fracionamento de bário em Castanha-do-Pará. Esse alimento é amplamente apreciado tanto pelo valor nutricional, quanto pelo sabor agradável. A análise química de Castanha-do-Pará não é trivial devido à matriz complexa. O fracionamento de bário em Castanha-do-Pará foi estudado devido à toxicidade desse elemento e a correlação entre a forma química e a absorção. Os teores totais de bário nas amostras de Castanha-do-Pará variaram entre 860 e 2084 mg kg-1. Extrações sequenciais foram feitas com base na solubilidade em diferentes meios e composição química envolvendo lipídios, proteínas e compostos de baixa massa molecular (LMW). Teores mais elevados de bário foram determinados nas frações LMW e insolúvel em água que variaram entre 778-1606 e 551-1520 mg kg-1, respectivamente. Esses resultados indicaram a indisponibilidade de bário presente nesse alimento ao organismo humano. Baseando-se nos teores de bário e enxofre nas diferentes frações e em cálculos estequiométricos para as possíveis reações envolvidas pode-se inferir que bário se encontra principalmente na forma de BaSO4. Experimentos termogravimétricos também confirmaram essa suposição.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)