Inferencia bayesiana sobre los parámetros de dispersión genéticos y ambientales en modelos animales con efectos maternos

Los modelos 'modelos animales con efectos maternos' (MAM)son modelos lineales mixtos que se utilizan para ajustar registros de caracteres bajo la influencia de efectos maternos. Uno de los desafíos más importantes en el marco de los MAM es la estimación de los parámetros de dispersión o 'componentes de (co)varianza' (CVC). En esta tesis se introducen desde una perspectiva bayesiana contribuciones teóricas y metodológicas con relación a la estimación de CVC para MAM sujetos a estructuras de covarianza novedosas. En primer lugar, se describe una implementación del análisis bayesiano jerárquico vía el algoritmo del muestreo de Gibbs. Luego, se considera una especificación conjugada diferente para la distribución a priori de la matriz de covarianza genética, basada en la distribución Wishart invertida generalizada, y se presenta una estrategia para determinar los correspondientes hiperparámetros. Esta estrategia fue comparada contra otras especificaciones a priori mediante un estudio de simulación estocástica, y produjo estimaciones precisas de los parámetros genéticos, con menores errores estándares y mejor tasa de convergencia. En segundo lugar, se presenta una formulación alternativa del MAM que incluye un parámetro de correlación ambiental entre pares de observaciones madre-progenie, y se desarrolla un procedimiento de estimación basado en un algoritmo de muestreo por grilla. El procedimiento fue programado y ejecutado exitosamente, y se obtuvo la primera estimación del parámetro de correlación con datos de campo para peso al destete en bovinos de carne. Por último, se considera el problema de la estimación de CVC en una población multirracial, donde en general es necesario especificar una estructura de covarianza heterogénea para los valores de cría. En particular, se demuestra que el modelo basado en la descomposición de la matriz de covarianza genética es equivalente al que deriva de la teoría genética cuantitativa. Además, se extiende el modelo para incluir efectos maternos y se describe la implementación de un análisis bayesiano jerárquico con el objetivo de estimar los CVC. El procedimiento fue implementado con éxito en datos experimentales de peso al destete y se obtuvieron por primera vez estimaciones para el conjunto completo de CVC.

Rendimiento de dos líneas comerciales de pollos parrilleros

p.105-109

Efecto de la densidad de plantación sobre la productividad comercial en rosas para corte

p.7-12

Evaluación económica de las decisiones sobre fertilidad del suelo mediante el uso de modelos dinámicos

p.209-217

Variability in water and nitrogen availability at plot scale and its effect on Maize (Zea Mays L.) production

p.21-30

Comportamiento de varias cepas de Azospirillum sobre trigo (Triticum aestivum) y sorgo (Sorghum vulgare)

p.39-45

Dinámica del carbono en sistemas agrícolas bajo siembra directa : nuevas evidencias obtenidas mediante el uso de 13 C sobre la importancia de las raíces, la calidad de los residuos y el laboreo

El carbono orgánico del suelo (COS) es uno de los principales determinantes de la productividad de los ecosistemas, afectando la fertilidad del suelo y su capacidad de secuestrar CO2. La agricultura es uno de los principales cambios de uso del suelo que afecta significativamente el COS. En esta tesis se examinan, mediante experimentos de campo y usando al 13C como trazador isotópico, tres aspectos de la dinámica de C en sistemas agrícolas: 1) la importancia de las raíces en la formación de COS, 2) los efectos de la cantidad y calidad de los residuos sobre la tasa de descomposición y humificación del COS y 3) la dinámica del COS en sistemas de agricultura continua iniciados sobre pastizales naturales nunca laboreados. Los resultados obtenidos muestran que 1) en cultivos de soja y maíz, la formación de COS se deriva principalmente de la biomasa subterránea y en menor medida de los residuos aéreos, al menos en la fracción de la materia orgánica particulada (MOP). También, se observó 2) que el agregado de residuos de maíz con alta relación C:N aumentó la tasa de descomposición de la MOAM (materia orgánica asociada a los minerales) cuando se la compara con el agregado de residuos de soja (baja relación C:N), efecto conocido como priming. Sin embargo, también existió una mayor formación de materia orgánica bajo cultivos de maíz, y por ende se conservaron las reservas de COS, pero su ciclado fue más rápido. Finalmente, 3) los cultivos en sistemas de siembra directa establecidos sobre suelos nunca laboreados presentaron niveles de COS similares a los de los pastizales naturales remplazados. Estos resultados cuestionan parte de nuestro conocimiento sobre los sistemas agrícolas bajo siembra directa, aportando nuevas evidencias experimentales y destacando el uso de marcadores isotópicos de 13C para comprender el flujo de C en los agroecosistemas.

Funcionalidad biodemográfica del pulgón Nasonovia Ribisnigri (Mosley) (Hemiptera : Aphididae) en cultivares de lechuga Lactuca sativa (l.) tipo mantecoso en condiciones controladas

p.5-9

Dinámica de la población de semillas de Sorghum halepense (L) Pers. en un suelo arable : I-efecto de la germinación (in situ)

p.1-9

Estrategias para accesar a la comprensión de tus estudiantes en ciertos conceptos matemáticos

En este taller (de una sesión) se proponen ciertas actividades que conectan el algebra con diversas situaciones del mundo real. La idea es hacer que los presentes desarrollen las tareas para que conozcan otras alternativas para construir conceptos como tasa de cambio o pendiente, modelamiento de datos, líneas de mejor ajuste, datos atípicos, errores en experimentos, bases de ingenierías civil, uso de modelos matemáticos para hacer predicciones y cuando los modelos matemáticos no describen la realidad de los experimentos. En el taller se realizaran tres actividades: A. FORTALEZA DE LAS VIGAS B. ATANDO NUDOS C. CONSTRUCCION DEL TRIACONTRAEDRO ROMBICO (LAMPARA DANESA) El realizar estas experiencias nos ayudaran a entender los estados de conflicto que entra el estudiante a la hora de procesar, adquirir y afianzar el conocimiento

Humans-with-Media en la producción de conocimiento matemático. El caso de Geogebra

Este documento se usa el constructo teórico Humans-with-Media para analizar una situación construida con el software Geogebra. La situación muestra un posible entendimiento de la función derivada a partir del reconocimiento de la “función tasa de variación”.

Razonamiento covariacional en estudiantes de quinto grado

Se presenta un avance de una investigación de tipo cualitativo en la cual se busca identificar las características de razonamiento presentadas en estudiantes de grado quinto al momento de enfrentarse a situaciones de tipo variacional; dichas características se discuten a la luz del marco conceptual para la covariación propuesto por Carlson, Jacobs, Coe, Larsen, y Hsu (2003). Desde las situaciones, se desprenden algunas implicaciones y recomendaciones para su implementación en el aula de clase, específicamente para un acercamiento a nociones como: función y tasa de variación, las cuales se encuentran en las bases propias del razonamiento covariacional y pueden abordarse desde los primeros grados de escolaridad como una manera de crear cimientos en la comprensión de los conceptos más relevantes del cálculo.

La influencia de las nuevas tecnologías en los hábitos de lectura: análisis de las noticias de "El País", "El Mundo" y "ABC" (2011)

En este texto se explica el cambio de hábitos que ha supuesto la lectura en formato digital. Se indican los factores que determinan la selección un formato u otro, al igual que la situación en la que se encuentra la lectura digital en España. Para ello, se analizan las noticias sobre este tema encontradas en los periódicos: ABC, El País y El Mundo durante el año 2011 -período relevante para la lectura digital- y se comparan con los resultados de las encuestas de AIMC, FGEE, etc., con el fin de sacar conclusiones certeras.

Phosphorylated DegU Manipulates Cell Fate Differentiation in the Bacillus subtilis Biofilm

Cell differentiation is ubiquitous and facilitates division of labor and development. Bacteria are capable of multicellular behaviors that benefit the bacterial community as a whole. A striking example of bacterial differentiation occurs throughout the formation of a biofilm. During Bacillus subtilis biofilm formation, a subpopulation of cells differentiates into a specialized population that synthesizes the exopolysaccharide and the TasA amyloid components of the extracellular matrix. The differentiation process is indirectly controlled by the transcription factor Spo0A that facilitates transcription of the eps and tapA (tasA) operons. DegU is a transcription factor involved in regulating biofilm formation. Here, using a combination of genetics and live single-cell cytological techniques, we define the mechanism of biofilm inhibition at high levels of phosphorylated DegU (DegU∼P) by showing that transcription from the eps and tapA promoter regions is inhibited. Data demonstrating that this is not a direct regulatory event are presented. We demonstrate that DegU∼P controls the frequency with which cells activate transcription from the operons needed for matrix biosynthesis in favor of an off state. Subsequent experimental analysis led us to conclude that DegU∼P functions to increase the level of Spo0A∼P, driving cell fate differentiation toward the terminal developmental process of sporulation.

BslA is a self-assembling bacterial hydrophobin that coats the Bacillus subtilis biofilm

Biofilms represent the predominant mode of microbial growth in the natural environment. Bacillus subtilis is a ubiquitous Gram-positive soil bacterium that functions as an effective plant growth-promoting agent. The biofilm matrix is composed of an exopolysaccharide and an amyloid fiber-forming protein, TasA, and assembles with the aid of a small secreted protein, BslA. Here we show that natively synthesized and secreted BslA forms surface layers around the biofilm. Biophysical analysis demonstrates that BslA can self-assemble at interfaces, forming an elastic film. Molecular function is revealed from analysis of the crystal structure of BslA, which consists of an Ig-type fold with the addition of an unusual, extremely hydrophobic "cap" region. A combination of in vivo biofilm formation and in vitro biophysical analysis demonstrates that the central hydrophobic residues of the cap are essential to allow a hydrophobic, nonwetting biofilm to form as they control the surface activity of the BslA protein. The hydrophobic cap exhibits physiochemical properties remarkably similar to the hydrophobic surface found in fungal hydrophobins; thus, BslA is a structurally defined bacterial hydrophobin. We suggest that biofilms formed by other species of bacteria may have evolved similar mechanisms to provide protection to the resident bacterial community.