Clifford Geertz, 1926-2006: Meaning, method, and Indonesian economic history

Clifford Geertz was best known for his pioneering excursions into symbolic or interpretive anthropology, especially in relation to Indonesia. Less well recognised are his stimulating explorations of the modern economic history of Indonesia. His thinking on the interplay of economics and culture was most fully and vigorously expounded in Agricultural Involution. That book deployed a succinctly packaged past in order to solve a pressing contemporary puzzle, Java's enduring rural poverty and apparent social immobility. Initially greeted with acclaim, later and ironically the book stimulated the deep and multi-layered research that in fact led to the eventual rejection of Geertz's central contentions. But the veracity or otherwise of Geertz's inventive characterisation of Indonesian economic development now seems irrelevant; what is profoundly important is the extraordinary stimulus he gave to a generation of scholars to explore Indonesia's modern economic history with a depth and intensity previously unimaginable.

Some factors affecting white stem borer Scirpophaga innotata (Walker) (Lepidoptera : Pyralidae) injury to rice

The amount of injury to rice caused by white stem borer Sciryophaga innotata depends on cultivar, and stage of plant and insect development, as well as insect abundance. Of the cultivars tested, IR64, IR42, Cisadane and Ketan. IR64 were the most susceptible and Ketan the least susceptible to feeding damage. Third and fourth instars consumed more stem dry matter than other stages, although yield reduction depended on the number of tillers injured. On the wider stemmed Ketan, fewer tillers were injured than the narrower IR64. Larvae are more likely to move among tillers in the third instar stage, which tends to coincide with maximum tillering and may result in more tillers injured and in yield reduction. Later instar larvae burrow downwards to the internode where they pupate. Larvae appear to move less among tillers in 'resistant' cultivars. Management strategies should target this pest at third instar and when its abundance in the field warrants control. Fewer than 10% of the neonates establish successfully on stems, and this mortality needs to be taken into account when deciding on control, as does the ability of rice plants to compensate for injury. (C) 1998 Published by Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

Season-specific directional movement in migratory Australian butterflies

Large numbers of adults of certain species of butterfly flying in an apparently 'purposeful' manner are often noted by entomologists and the general public. Occasionally, these are recorded in the literature. Using these records we summarise information regarding the direction of movement in Australian butterflies and test whether there are consistent patterns that could account for known seasonal shifts in geographical range. The data were analysed using contingency tables and directionality statistics. Vanessa itea, Vanessa kershawi, Danaus plexippus, Danaus chrysippus and Badamia exclamationis flew predominately south in the spring-summer and north in the autumn-winter. Tirumala hamata has a strong southern component to its flight in spring but, as in Euploea core, appears non-directional in the autumn. For many supposedly known migratory species, the number of literature records are few, particularly in one season (mainly autumn). Thus, for Appias paulina, four of seven records were south in the spring-summer, as were six of nine records for Catopsilia pomona, and three of five for Zizina labradus. For Belenois java, flight records were only available for the spring and these showed geographical differences; predominantly north-west in northern Australia (Queensland) and south-west in southern Australia (Victoria, New South Wales). There were too few records for Papilio demoleus in the literature (four only) to draw any conclusions. Major exceptions to the seasonal trend of south in the spring and north in the autumn were Junonia villida, which showed a predominant north-westward direction in both seasons, and Eurema smilax, with a predominant southern or western flight in both seasons. We discuss these species specific trends in migration direction in relation to seasonal shifts in suitable habitat conditions, possible cues used in orientation and in timing changes in direction.

eMelanoBase: An online locus-specific variant database for familial melanoma

A proportion of melanoma,prone individuals in both familial and non,familial contexts has been shown to carry inactivating mutations in either CDKN2A or, rarely, CDK4. CDKN2A is a complex locus that encodes two unrelated proteins from alternately spliced transcripts that are read in different frames. The alpha transcript (exons 1a, 2, and 3) produces the p16INK4A cyclin-dependent kinase inhibitor, while the beta transcript (exons 1beta and 2) is translated as p14ARF, a stabilizing factor of p53 levels through binding to MDM2. Mutations in exon 2 can impair both polypeptides and insertions and deletions in exons 1alpha, 1beta, and 2, which can theoretically generate p16INK4A,p14ARF fusion proteins. No online database currently takes into account all the consequences of these genotypes, a situation compounded by some problematic previous annotations of CDKN2A related sequences and descriptions of their mutations. As an initiative of the international Melanoma Genetics Consortium, we have therefore established a database of germline variants observed in all loci implicated in familial melanoma susceptibility. Such a comprehensive, publicly accessible database is an essential foundation for research on melanoma susceptibility and its clinical application. Our database serves two types of data as defined by HUGO. The core dataset includes the nucleotide variants on the genomic and transcript levels, amino acid variants, and citation. The ancillary dataset includes keyword description of events at the transcription and translation levels and epidemiological data. The application that handles users' queries was designed in the model,view. controller architecture and was implemented in Java. The object-relational database schema was deduced using functional dependency analysis. We hereby present our first functional prototype of eMelanoBase. The service is accessible via the URL www.wmi.usyd.e, du.au:8080/melanoma.html.

GUI Behavior from Source Code Analysis

When developing interactive applications, considering the correctness of graphical user interfaces (GUIs) code is essential. GUIs are critical components of today's software, and contemporary software tools do not provide enough support for ensuring GUIs' code quality. GUIsurfer, a GUI reverse engineering tool, enables evaluation of behavioral properties of user interfaces. It performs static analysis of GUI code, generating state machines that can help in the evaluation of interactive applications. This paper describes the design, software architecture, and the use of GUIsurfer through an example. The tool is easily re-targetable, and support is available to Java/Swing, and WxHaskell. The paper sets the ground for a generalization effort to consider rich internet applications. It explores the GWT web applications' user interface programming toolkit.

A Generic Library for GUI Reasoning and Testing

Graphical user interfaces (GUIs) make software easy to use by providing the user with visual controls. Therefore, correctness of GUI's code is essential to the correct execution of the overall software. Models can help in the evaluation of interactive applications by allowing designers to concentrate on its more important aspects. This paper presents a generic model for language-independent reverse engineering of graphical user interface based applications, and we explore the integration of model-based testing techniques in our approach, thus allowing us to perform fault detection. A prototype tool has been constructed, which is already capable of deriving and testing a user interface behavioral model of applications written in Java/Swing.

Modelo de especifica����o e controlo de execu����es paralelas e distribu��das

O desenvolvimento actual de aplica����es paralelas com processamento intensivo (HPC - High Performance Computing) para alojamento em computadores organizados em Cluster baseia-se muito no modelo de passagem de mensagens, do qual �� de real��ar os esfor��os de defini����o de standards, por exemplo, MPI - Message - Passing Interface. Por outro lado, com a generaliza����o do paradigma de programa����o orientado aos objectos para ambientes distribu��dos (Java RMI, .NET Remoting), existe a possibilidade de considerar que a execu����o de uma aplica����o, de processamento paralelo e intensivo, pode ser decomposta em v��rios fluxos de execu����o paralela, em que cada fluxo �� constitu��do por uma ou mais tarefas executadas no contexto de objectos distribu��dos. Normalmente, em ambientes baseados em objectos distribu��dos, a especifica����o, controlo e sincroniza����o dos v��rios fluxos de execu����o paralela, �� realizada de forma explicita e codificada num programa principal (hard-coded), dificultando poss��veis e necess��rias modifica����es posteriores. No entanto, existem, neste contexto, trabalhos que prop��em uma abordagem de decomposi����o, seguindo o paradigma de workflow com interac����es entre as tarefas por, entre outras, data-flow, control-flow, finite - state - machine. Este trabalho consistiu em propor e explorar um modelo de execu����o, sincroniza����o e controlo de m��ltiplas tarefas, que permita de forma flex��vel desenhar aplica����es de processamento intensivo, tirando partido da execu����o paralela de tarefas em diferentes m��quinas. O modelo proposto e consequente implementa����o, num prot��tipo experimental, permite: especificar aplica����es usando fluxos de execu����o; submeter fluxos para execu����o e controlar e monitorizar a execu����o desses fluxos. As tarefas envolvidas nos fluxos de execu����o podem executar-se num conjunto de recursos distribu��dos. As principais caracter��sticas a real��ar no modelo proposto, s��o a expansibilidade e o desacoplamento entre as diferentes componentes envolvidas na execu����o dos fluxos de execu����o. S��o ainda descritos casos de teste que permitiram validar o modelo e o prot��tipo implementado. Tendo consci��ncia da necessidade de continuar no futuro esta linha de investiga����o, este trabalho �� um contributo para demonstrar que o paradigma de workflow �� adequado para expressar e executar, de forma paralela e distribu��da, aplica����es complexas de processamento intensivo.

WPAC: wireless payment and access control: dispositivos m��veis no pagamento de servi��os e controlo de acessos

A r��pida evolu����o dos dispositivos m��veis e das tecnologias de comunica����o sem fios transformou o telem��vel num poderoso dispositivo de computa����o m��vel. A necessidade de estar sempre contact��vel, comum �� civiliza����o moderna, tem aumentado a depend��ncia deste dispositivo, sendo transportado pela maioria das pessoas num ambiente urbano e assumindo um papel talvez mais importante que a pr��pria carteira. A ubiquidade e capacidade de computa����o dos telem��veis aumentam o interesse no desenvolvimento de servi��os m��veis, al��m de tradicionais servi��os de voz. Um telem��vel pode em breve tornar-se um elemento activo nas nossas tarefas di��rias, servindo como um instrumento de pagamento e controlo de acessos, proporcionando assim novas interfaces para servi��os existentes. A unifica����o de v��rios servi��os num ��nico dispositivo �� um desafio que pode simplificar a nossa rotina di��ria e aumentar o conforto, no limite deixaremos de necessitar de dinheiro f��sico, cart��es de cr��dito ou d��bito, chaves de resid��ncia e de ve��culos autom��veis, ou inclusive documentos de identifica����o como bilhetes de identidade ou passaportes. O interesse demonstrado pelos intervenientes, desde os fabricantes de telem��veis e operadores de rede m��vel at�� ��s institui����es financeiras, levaram ao aparecimento de m��ltiplas solu����es de servi��os m��veis. Por��m estas solu����es respondem geralmente a problemas espec��ficos, apenas contemplando um fornecedor de servi��os ou uma determinada opera����o de pagamento, como seja a compra de bilhetes ou pagamento de estacionamento. Estas solu����es emergentes consistem tamb��m tipicamente em especifica����es fechadas e protocolos propriet��rios. A defini����o de uma arquitectura gen��rica, aberta interoper��vel e extens��vel �� necess��ria para que os servi��os m��veis possam ser adoptados de uma forma generalizada por diferentes fornecedores de servi��os e para diversos tipos de pagamento. A maior parte das solu����es actuais de pagamento m��vel depende de comunica����es atrav��s da rede m��vel, algumas utilizam o telem��vel apenas como uma interface de acesso �� internet enquanto outras possibilitam o envio de um SMS (Short Message Service) para autorizar uma transac����o, o que implica custos de comunica����o em todas as opera����es de pagamento. Este custo de opera����o torna essas solu����es inadequadas para a realiza����o de micropagamentos e podem por isso ter uma aceita����o limitada por parte dos clientes. As solu����es existentes focam-se maioritariamente em pagamentos �� dist��ncia, n��o tirando partido das caracter��sticas do pagamento presencial e n��o oferecendo por isso uma verdadeira alternativa ao modelo actual de pagamento com cart��es de cr��dito/d��bito. As capacidades computacionais dos telem��veis e suporte de diversos protocolos de comunica����o sem fio local n��o t��m sido aproveitadas, vendo o telem��vel apenas como um terminal GSM (Global System for Mobile Communications) e n��o oferecendo servi��os adicionais como seja a avalia����o din��mica de risco ou controlo de despesas. Esta disserta����o prop��e e valida, atrav��s de um demonstrador, uma aquitectua aberta para o pagamento e controlo de acesso baseado em dispositivos m��veis, intitulada WPAC (Wireless Payment and Access Control). Para chegar �� solu����o apresentada foram estudadas outras solu����es de pagamento, desde o aparecimento dos cart��es de d��bito at�� a era de pagamentos electr��nicos m��veis, passando pelas solu����es de pagamento atrav��s da internet. As capacidades dos dispositivos m��veis, designadamente os telem��veis, e tecnologias de comunica����o sem fios foram tamb��m analisadas a fim de determinar o estado tecnol��gico actual. A arquitectura WPAC utiliza padr��es de desenho utilizados pela ind��stria em solu����es de sucesso, a utiliza����o de padr��es testados e a reutiliza����o de solu����es com provas dadas permite aumentar a confian��a nesta solu����o, um destes exemplos �� a utiliza����o de uma infra-estrutura de chave p��blica para o estabelecimento de um canal de comunica����o seguro. Esta especifica����o �� uma arquitectura orientada aos servi��os que utiliza os Web Services para a defini����o do contracto do servi��o de pagamento. A viabilidade da solu����o na orquestra����o de um conjunto de tecnologias e a prova de conceito de novas abordagens �� alcan��ada com a constru����o de um prot��tipo e a realiza����o de testes. A arquitectura WPAC possibilita a realiza����o de pagamentos m��veis presenciais, isto ��, junto do fornecedor de bens ou servi��os, seguindo o modelo de pagamento com cart��es de cr��dito/d��bito no que diz respeito aos intervenientes e rela����es entre eles. Esta especifica����o inclui como aspecto inovador a avalia����o din��mica de risco, que utiliza o valor do pagamento, a exist��ncia de pagamentos frequentes num per��odo curto de tempo, e a data, hora e local do pagamento como factores de risco; solicitando ao cliente o conjunto de credenciais adequado ao risco avaliado, desde c��digos pessoais a dados biom��tricos. �� tamb��m apresentada uma alternativa ao processo normal de pagamento, que apesar de menos c��moda permite efectuar pagamentos quando n��o �� poss��vel estabelecer um canal de comunica����o sem fios, aumentando assim a toler��ncia a falhas. Esta solu����o n��o implica custos de opera����o para o cliente na comunica����o com o ponto de venda do comerciante, que �� realizada atrav��s de tecnologias de comunica����o local sem fios, pode ser necess��ria a comunica����o atrav��s da rede m��vel com o emissor do agente de pagamento para a actualiza����o do agente de software ou de dados de seguran��a, mas essas transmiss��es s��o ocasionais. O modelo de seguran��a recorre a certificados para autentica����o dos intervenientes e a uma infra-estrutura de chave p��blica para cifra e assinatura de mensagens. Os dados de seguran��a inclu��dos no agente de software m��vel, para desabilitar a c��pia ou corrup����o da aplica����o mas tamb��m para a compara����o com as credenciais inseridas pelo cliente, devem igualmente ser encriptados e assinados de forma a garantir a sua confidencialidade e integridade. A arquitectura de pagamento utiliza o standard de Web Services, que �� amplamente conhecido, aberto e interoper��vel, para defini����o do servi��o de pagamento. Existem extens��es �� especifica����o de Web Services relativas �� seguran��a que permitem trocar itens de seguran��a e definem o modo de cifra e assinatura de mensagens, possibilitando assim a sua utiliza����o em aplica����es que necessitem de seguran��a como �� o caso de servi��os de pagamento e controlo de acesso. O contracto de um Web Service define o modo de invoca����o dos servi��os, transmiss��o de informa����o e representa����o de dados, sendo normalmente utilizado o protocolo SOAP que na pr��tica n��o �� mais que um protocolo de troca de mansagens XML (eXtensible Markup Language). O envio e recep����o de mensagens XML; ou seja, a transmiss��o de simples sequ��ncias de caracteres, �� suportado pela maioria dos protocolos de comunica����o, sendo portanto uma solu����o abrangente que permite a adop����o de diversas tecnologias de comunica����o sem fios. O prot��tipo inclui um agente de software m��vel, implementado sobre a forma de uma MIDlet, aplica����o Java para dispositivos m��veis, que implementa o protocolo de pagamento comunicando sobre uma liga����o Bluetooth com o ponto de venda do comerciante, simulado por uma aplica����o desenvolvida sobre a plataforma .NET e que por isso faz prova da heterogeneidade da solu����o. A comunica����o entre o comerciante e o seu banco para autoriza����o do pagamento e transfer��ncia monet��ria utiliza o protocolo existente para a autoriza����o de pagamentos, com base em cart��es de cr��dito/d��bito. A defini����o desta especifica����o aberta e gen��rica em conjunto com o forte interesse demonstrado pelos intervenientes, proporciona uma boa perspectiva em termos de adop����o da solu����o, o que pode impulsionar a implementa����o de servi��os m��veis e dessa forma simplificar as rotinas di��rias das pessoas. Solu����es m��veis de pagamento reduzem a necessidade de transportar v��rios cart��es de cr��dito/d��bito na nossa carteira. A avalia����o din��mica de risco permite aumentar a seguran��a dos pagamentos, com a solicita����o de mais credenciais ao cliente para pagamentos com um maior risco associado, sendo um ponto importante quer para os clientes quer para as institui����es financeiras pois diminui o risco de fraude e aumenta a confian��a no sistema. Esta solu����o de pagamento electr��nico pode tamb��m facilitar a consulta de pagamentos efectuados e saldos, mantendo um hist��rico dos movimentos, o que n��o �� poss��vel nos cart��es de cr��dito/d��bito sem uma visita a uma ATM (Automated Teller Machine) ou utiliza����o de homebanking.

PHYLOViZ: phylogenetic inference and data visualization for sequence based typing methods

Background: With the decrease of DNA sequencing costs, sequence-based typing methods are rapidly becoming the gold standard for epidemiological surveillance. These methods provide reproducible and comparable results needed for a global scale bacterial population analysis, while retaining their usefulness for local epidemiological surveys. Online databases that collect the generated allelic profiles and associated epidemiological data are available but this wealth of data remains underused and are frequently poorly annotated since no user-friendly tool exists to analyze and explore it. Results: PHYLOViZ is platform independent Java software that allows the integrated analysis of sequence-based typing methods, including SNP data generated from whole genome sequence approaches, and associated epidemiological data. goeBURST and its Minimum Spanning Tree expansion are used for visualizing the possible evolutionary relationships between isolates. The results can be displayed as an annotated graph overlaying the query results of any other epidemiological data available. Conclusions: PHYLOViZ is a user-friendly software that allows the combined analysis of multiple data sources for microbial epidemiological and population studies. It is freely available at http://www.phyloviz.net.

Analisador de espectro de baixo custo com frequ��ncia de opera����o entre 2 e 3 GHz

Com o surgimento de novos sistemas de telecomunica����es sem fios, que necessitam de maiores pot��ncias de emiss��o e largura de banda dispon��vel, surgem os regulamentos que controlam as emiss��es r��dio. S�� assim estas tecnologias podem coexistir em bandas pr��ximas, com o m��ximo desempenho e com a garantia que os n��veis de polui����o electromagn��tica n��o s��o ultrapassados. Cada vez mais, regulamentos que limitam a pot��ncia da transmiss��o t��m em vista quest��es de sa��de p��blica e por isso devem ser estritamente respeitados. Para se poder controlar as emiss��es r��dio �� necess��rio um dispositivo que consiga analisar o espectro r��dio. Um dos instrumentos fundamentais na metrologia de radiofrequ��ncia �� o analisador de espectros, que tem como principal fun����o apresentar a pot��ncia de por����es do espectro em fun����o da frequ��ncia. Existem v��rios tipos de analisadores espectrais, que se baseiam em arquitecturas de recep����o distintas. O tipo de analisador define a sua complexidade e o tipo de an��lises que consegue fazer. Com esta disserta����o pretende-se mostrar a implementa����o de um analisador de espectro port��til, de baixo custo, baseado num receptor heter��dino e com uma frequ��ncia de opera����o compreendida entre os 2 e os 3 GHz. Este projecto abrange diversas ��reas, desde o hardware de recep����o r��dio, passando pelo microcontrolador que faz a aquisi����o de dados e comunica����o com o computador, acabando na aplica����o que foi desenvolvida em Java para permitir ao utilizador uma interface de utiliza����o simples e funcional. Foi tamb��m desenvolvida com sucesso uma antena impressa adequada �� banda de frequ��ncia referida. Embora tenham existidos problemas simples, um na localiza����o do filtro passa-banda e o outro na resposta do filtro interm��dio, os objectivos foram alcan��ados obtendo-se um analisador de espectro port��til, funcional e de baixo custo, conforme pretendido. O analisador tem um erro m��ximo na detec����o de pot��ncia de 2,5 dB e o tempo de varrimento m��ximo �� cerca de 16 segundos com 500 pontos de resolu����o. Foram realizadas v��rias medi����es e uma compara����o com um analisador de espectros comercial, para demonstrar o funcionamento e desempenho do analisador desenvolvido, tendo os resultados sido bastante promissores. A funcionalidade deste analisador medir a pot��ncia do sinal ao longo do tempo �� uma mais-valia face ao analisador comercial utilizado para a compara����o.

Answer: plataforma em C++ para o desenvolvimento de servi��os web

Analisando as tend��ncias actuais de mercado, observa-se a necessidade da capacidade de integra����o de sistemas recorrendo �� utiliza����o de servi��os web. Actualmente o C++ �� ainda uma das mais populares linguagens de programa����o, facto justificado pelo abundante portef��lio de aplica����es, desde alto-n��vel a sistemas embebidos, com in��meras bibliotecas que tiram partido dos diversos paradigmas de programa����o que a linguagem suporta. Por��m, e ao contr��rio de outras linguagens, como C# ou Java que oferecem suporte �� cria����o de servi��os web integrado com a plataforma, existe uma lacuna no suporte ao desenvolvimento de servi��os web em C++. Para dar resposta �� lacuna existente �� criada a plataforma ANSWER, focada em C++, com ��nfase num modelo de programa����o simples, permitindo o r��pido desenvolvimento de servi��os web RPC/SOAP e REST.

Multi-agent based electricity market simulator with VPP: Conceptual and implementation issues

This paper presents a new architecture for the MASCEM, a multi-agent electricity market simulator. This is implemented in a Prolog which is integrated in the JAVA program by using the LPA Win-Prolog Intelligence Server (IS) provides a DLL interface between Win-Prolog and other applications. This paper mainly focus on the MASCEM ability to provide the means to model and simulate Virtual Power Producers (VPP). VPPs are represented as a coalition of agents, with specific characteristics and goals. VPPs can reinforce the importance of these generation technologies making them valuable in electricity markets.

Derivative-free optimization and filter methods to solve nonlinear constrained problems

In real optimization problems, usually the analytical expression of the objective function is not known, nor its derivatives, or they are complex. In these cases it becomes essential to use optimization methods where the calculation of the derivatives, or the verification of their existence, is not necessary: the Direct Search Methods or Derivative-free Methods are one solution. When the problem has constraints, penalty functions are often used. Unfortunately the choice of the penalty parameters is, frequently, very difficult, because most strategies for choosing it are heuristics strategies. As an alternative to penalty function appeared the filter methods. A filter algorithm introduces a function that aggregates the constrained violations and constructs a biobjective problem. In this problem the step is accepted if it either reduces the objective function or the constrained violation. This implies that the filter methods are less parameter dependent than a penalty function. In this work, we present a new direct search method, based on simplex methods, for general constrained optimization that combines the features of the simplex method and filter methods. This method does not compute or approximate any derivatives, penalty constants or Lagrange multipliers. The basic idea of simplex filter algorithm is to construct an initial simplex and use the simplex to drive the search. We illustrate the behavior of our algorithm through some examples. The proposed methods were implemented in Java.

Aplica����o web para tratamento estat��stico de dados de teste

Mestrado em Engenharia Electrot��cnica e de Computadores

Plataforma de gest��o de incidentes

Mestrado em Engenharia Electrot��cnica e de Computadores. ��rea de Especializa����o de Telecomunica����es.