The extended phenotype of Scots pine Pinus sylvestris structures the understorey assemblage

Heritable variation in plant secondary compounds in dominant species has been hypothesised to effect ecosystem function and the structure of associated assemblages of plants, microbes and animals. The functioning of this extended phenotype in relation to the understorey vegetation composition was tested within a boreal forest system dominated by Pinus sylvestris which contains a range of monoterpenes, the composition of which is largely under genetic control. A variance partitioning approach was adopted to identify the relative importance of tree chemistry, environment, spatial location and tree architecture in controlling the distribution of species in the ground flora under individual trees. The monoterpene composition of the pine needles appeared to contribute significantly to controlling understorey vegetation composition, but was less important than environmental factors, though similar to spatial factors. Thus there appears to be a link between variation in the chemical composition of the single, dominant tree species within this system and the pattern of occurrence and abundance in other species at the same trophic level.

A techno-economic evaluation of changing from conventional vehicles to range extended electric vehicles

Transportation accounts for 22% of greenhouse gas emissions in the UK, and increases to 25% in Northern Ireland. Surface transport carbon dioxide emissions, consisting of road and rail, are dominated by cars. Demand for mobility is rising rapidly and vehicle numbers are expected to more than double by 2050. Car manufacturers are working towards reducing their carbon footprint through improving fuel efficiency and controlling exhaust emissions. Fuel efficiency is now a key consideration of consumers purchasing a new vehicle. While measures have been taken to help to reduce pollutants, in the future, alternative technologies will have to be used in the transportation industry to achieve sustainability. There are currently many alternatives to the market leader, the internal combustion engine. These alternatives include hydrogen fuel cell vehicles and electric vehicles, a term which is widely used to cover battery electric vehicles, plug-in hybrid electric vehicles and extended-range electric vehicles. This study draws direct comparisons measuring the differing performance in terms of fuel consumption, carbon emissions and range of a typical family saloon car using different fuel types. These comparisons will then be analysed to see what effect switching from a conventionally fuelled vehicle to a range extended electric vehicle would have not only on the end user, but also the UK government.

Hui and Walter's latent-class model extended to estimate diagnostic test properties from surveillance data: a latent model for latent data

Diagnostic test sensitivity and specificity are probabilistic estimates with far reaching implications for disease control, management and genetic studies. In the absence of 'gold standard' tests, traditional Bayesian latent class models may be used to assess diagnostic test accuracies through the comparison of two or more tests performed on the same groups of individuals. The aim of this study was to extend such models to estimate diagnostic test parameters and true cohort-specific prevalence, using disease surveillance data. The traditional Hui-Walter latent class methodology was extended to allow for features seen in such data, including (i) unrecorded data (i.e. data for a second test available only on a subset of the sampled population) and (ii) cohort-specific sensitivities and specificities. The model was applied with and without the modelling of conditional dependence between tests. The utility of the extended model was demonstrated through application to bovine tuberculosis surveillance data from Northern and the Republic of Ireland. Simulation coupled with re-sampling techniques, demonstrated that the extended model has good predictive power to estimate the diagnostic parameters and true herd-level prevalence from surveillance data. Our methodology can aid in the interpretation of disease surveillance data, and the results can potentially refine disease control strategies.

A Conventional Internal Combustion Engine Versus a Range Extended Electric Vehicle Under the Current Regulatory Regime in the United Kingdom

Transport accounts for 22% of greenhouse gas emissions in the United Kingdom and cars are expected tomore than double by 2050. Car manufacturers are continually aiming for a substantially reduced carbonfootprint through improved fuel efficiency and better powertrain performance due to the strict EuropeanUnion emissions standards. However, road tax, not just fuel efficiency, is a key consideration of consumerswhen purchasing a car. While measures have been taken to reduce emissions through stricter standards, infuture, alternative technologies will be used. Electric vehicles, hybrid vehicles and range extended electricvehicles have been identified as some of these future technologies. In this research a virtual test bed of aconventional internal combustion engine and a range extended electric vehicle family saloon car were builtin AVL’s vehicle and powertrain system level simulation tool, CRUISE, to simulate the New EuropeanDrive Cycle and the results were then soft-linked to a techno-economic model to compare the effectivenessof current support mechanisms over the full life cycle of both cars. The key finding indicates that althoughcarbon emissions are substantially reduced, switching is still not financially the best option for either theconsumer or the government in the long run.

Averaged Extended Tree Augmented Naive Classifier

This work presents a new general purpose classifier named Averaged Extended Tree Augmented Naive Bayes (AETAN), which is based on combining the advantageous characteristics of Extended Tree Augmented Naive Bayes (ETAN) and Averaged One-Dependence Estimator (AODE) classifiers. We describe the main properties of the approach and algorithms for learning it, along with an analysis of its computational time complexity. Empirical results with numerous data sets indicate that the new approach is superior to ETAN and AODE in terms of both zero-one classification accuracy and log loss. It also compares favourably against weighted AODE and hidden Naive Bayes. The learning phase of the new approach is slower than that of its competitors, while the time complexity for the testing phase is similar. Such characteristics suggest that the new classifier is ideal in scenarios where online learning is not required.

Learning Extended Tree Augmented Naive Structures

This work proposes an extended version of the well-known tree-augmented naive Bayes (TAN) classifier where the structure learning step is performed without requiring features to be connected to the class. Based on a modification of Edmonds' algorithm, our structure learning procedure explores a superset of the structures that are considered by TAN, yet achieves global optimality of the learning score function in a very efficient way (quadratic in the number of features, the same complexity as learning TANs). We enhance our procedure with a new score function that only takes into account arcs that are relevant to predict the class, as well as an optimization over the equivalent sample size during learning. These ideas may be useful for structure learning of Bayesian networks in general. A range of experiments shows that we obtain models with better prediction accuracy than naive Bayes and TAN, and comparable to the accuracy of the state-of-the-art classifier averaged one-dependence estimator (AODE). We release our implementation of ETAN so that it can be easily installed and run within Weka.

The neoliberalisation of the Cathedral Quarter and its contestations

Over time Belfast has been well researched as a site of ethnosectarian conflict, segregation and fear see (Boal et al 1976) and (Gaffiken and Morrisey 2011). The study of socio-spatial patterns of ‘ethnocracy’ is useful, but this article will argue how it is equally important to understand local forms of urban restructuring in terms of global processes that are linked to neoliberalism. To better understand the neoliberal urbanisation of Belfast this article is organised into two parts. The first part will demonstrate how the Northern Ireland State has sought legitimacy in the free market as ‘therapy’ for the production of neutral socio-spatial formations such as the Cathedral Quarter. Secondly it will examine this performance of neoliberal urbanism, as it ‘actually exists’ and demonstrate how market-led renewal has been extended through the clustering and non-sectarian interests, ‘soft’ arrangements of urban governance, cultural re-branding strategies, economic development incentives, and the development of various flagship projects. Critically this place-based grounding of neoliberalism is useful, as it also allows for the contestations of neoliberal urbanism to become real rather than just theoretical. The second part of the article will draw attention to the responses of local, and sometimes marginal, interests that have looked to challenge, adapt and, at times, divert the extension of market-led renewal. To be clear, this article does not want to overstate the performance of such interests. Nor does it want to claim that they significantly impact or obstruct the wider neoliberal urbanisation of Belfast. Instead it is interested in their behaviours and their different methods of working to explore what may be constituted as ‘alternative’, at least in the locality of the Cathedral Quarter. By studying how and why these interests have responded to the extension of neoliberal urbanism over time, it may just be possible to provide a better platform to articulate what more progressive forms of urban resistance might look like.

Production of extended-spectrum β-lactamases and the potential indirect pathogenic role of Prevotella isolates from the cystic fibrosis respiratory microbiota

Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) production and the prevalence of the β-lactamase-encoding gene blaTEM were determined in Prevotella isolates (n=50) cultured from the respiratory tract of adults and young people with cystic fibrosis (CF). Time-kill studies were used to investigate the concept of passive antibiotic resistance and to ascertain whether a β-lactamase-positive Prevotella isolate can protect a recognised CF pathogen from the action of ceftazidime in vitro. The results indicated that approximately three-quarters (38/50; 76%) of Prevotella isolates produced ESBLs. Isolates positive for ESBL production had higher minimum inhibitory concentrations (MICs) of β-lactam antibiotics compared with isolates negative for production of ESBLs (P<0.001). The blaTEM gene was detected more frequently in CF Prevotella isolates from paediatric patients compared with isolates from adults (P=0.002), with sequence analysis demonstrating that 21/22 (95%) partial blaTEM genes detected were identical to blaTEM-116. Furthermore, a β-lactamase-positive Prevotella isolate protected Pseudomonas aeruginosa from the antimicrobial effects of ceftazidime (P=0.03). Prevotella isolated from the CF respiratory microbiota produce ESBLs and may influence the pathogenesis of chronic lung infection via indirect methods, including shielding recognised pathogens from the action of ceftazidime.

A morte e o luto em contexto escolar: das vivências na primeira pessoa à (re) significação do conceito de escola acolhedora

A morte é, porventura, o grande tabu da sociedade ocidental contemporânea, fenómeno com clara ressonância na forma como os sobreviventes vivenciam o luto por perda de figura significativa. Numa sociedade que se mantém à margem da morte, as emoções decorrentes do luto são escamoteadas e reprimidas, com sérios riscos para a saúde mental dos enlutados. Essa conspiração do silêncio desagua também nos contextos educativos, onde os valores da juventude, do bem-estar, do prazer e da felicidade, quase não deixam espaço para o sofrimento e a morte. Deste modo, este estudo pretende ser uma contribuição para a compreensão dos efeitos do processo de luto em alunos adolescentes, nomeadamente ao nível do seu desempenho escolar, e, concomitantemente, para a análise do tipo de apoio que a comunidade educativa proporciona a esses alunos, com enfoque no papel dos professores (em geral) e dos diretores de turma (em particular). Pretende ainda apresentar estratégias interventivas, a implementar nas escolas, potenciadoras de uma educação para a vida, mesmo em circunstâncias de morte, e para a gestão do luto, que se revelem promotoras de um lidar pedagógico inclusivo. Sendo o luto um processo que afeta o indivíduo em todas as dimensões que o definem, um paradigma educacional que encontre na complexidade a sua matriz identitária, foi assumido neste estudo como o único capaz de resgatar a importância da gestão equilibrada dos afetos no processo de ensinoaprendizagem. À luz deste paradigma que assume um princípio de totalidade, partindo da totalidade, ou seja, que promove o desenvolvimento do ser humano na sua multidimensionalidade, assumimos também que a missão suprema e última da educação é a construção do sujeito ético. E é nos marcos de uma educação integral, humanista e ética, de responsabilidade pelo Outro, que ganha contornos a figura do professor cuidador, como sendo alguém atento às necessidades emocionais dos seus alunos. Do ponto de vista metodológico, esta investigação desenvolveu-se de acordo com uma abordagem de natureza predominantemente qualitativa, interpretativa e complexa e o estudo realizado centrou-se em três fases, tendo a recolha de dados decorrido entre setembro de 2009 e setembro de 2012: (i) Estudo exploratório, dirigido aos Diretores das 61 escolas secundárias do Distrito do Porto, com base num questionário adaptado, com o objetivo de sustentar a importância e pertinência do estudo principal e recolher indicadores para o orientar; (ii) Estudo de Caso Coletivo, envolvendo três alunas adolescentes em luto por perda de pai. Na primeira parte, e com vista à caracterização do contexto, a escola frequentada pelas três alunas, procedeuse à análise documental, concretamente do Projeto Educativo, mas também ao inquérito por entrevista a vários agentes da comunidade educativa: o Diretor, a Psicóloga, a Coordenadora dos Diretores de Turma do ensino secundário e seis Diretores de Turma. Na segunda parte, procedeu-se a uma abordagem holística e aprofundada da complexidade inerente a cada caso, procurando dar “voz” à forma única como cada uma das alunas vivenciou, significou e enfrentou a sua experiência de luto, tendo-se recorrido ao inquérito por entrevista. De forma a cruzar perspetivas de vários informantes, e identificar significados transversais, complementares ou alternativos, foram também entrevistadas as Encarregadas de Educação e os Diretores de Turma das alunas; (iii) Caraterização das conceções de professores sobre a temática em análise e validação de propostas de intervenção a implementar nas escolas, mobilizando-se, assim, dimensões emergentes das Fases I e II da investigação, mas também do quadro teórico que sustentou o estudo. Para a recolha de dados, foi construído um questionário que se aplicou aos professores do 2º e 3º ciclos do ensino básico e ensino secundário do Agrupamento onde se centrou o estudo de caso desenvolvido na Fase II. Procurando uma leitura global dos resultados obtidos e corroborando o que é amplamente defendido na literatura da especialidade, o estudo demonstra o impacto negativo que o luto tem no desempenho escolar e revela que o padrão afetivo da ambiência escolar não é favorável à expressão emocional de alunos enlutados, prevalecendo uma atitude de evitação por parte dos colegas e professores, o que sugere a necessidade de serem trilhados novos caminhos, por um lado, ao nível da formação de professores e, por outro lado, através da implementação em contexto escolar de uma intervenção pedagógica que eduque para a vida, mas sem descurar os fenómenos de perda afetiva significativa e respetivas vivências de luto. Deste estudo sai também reforçada a responsabilidade acrescida dos Diretores de Turma na constituição de um ethos de suporte envolvendo alunos em luto, cabendo-lhes um importante papel na articulação entre os vários agentes da comunidade educativa. Em suma: para além da necessidade de repensar o perfil de competências dos professores, mais consentâneo com o paradigma de escola acolhedora, deste estudo ressalta também a premência de validar na prática propostas de intervenção articuladas, consistentes e, sobretudo, éticas.

Avaliação do perfil de cuidado de enfermagem geriátrico em hospitais de Portugal

A transição demográfica e epidemiológica da população portuguesa tem e terá um enorme impacto na utilização dos recursos de saúde. Atualmente, as pessoas idosas representam um dos grupos etários com taxas de internamento hospitalar mais significativos. Contudo, os dados sobre a hospitalização destas pessoas têm demonstrado resultados de saúde negativos, nomeadamente, o declínio funcional e cognitivo e o risco elevado de eventos adversos. Os/as enfermeiros/as têm um papel crucial na mudança desta realidade. Deste modo, a associação entre o contexto no qual decorre o cuidado de enfermagem geriátrica e os resultados deste cuidado relativos a/os utentes, enfermeiros/as e organizações têm sido proficuamente documentados. Algumas estratégias para promover a qualidade do cuidado geriátrico e a segurança das pessoas idosas hospitalizadas consistem em avaliar e (re)criar o ambiente de trabalho geriátrico dos/as enfermeiros/as (AGTE) e capacitar e treinar estes/as profissionais no cuidado à pessoa idosa. Embora, internacionalmente, os dados demonstrem a associação entre as características de hospitais e/ou enfermeiros/as e o AGTE, não existem estudos em Portugal nesta área, bem como sobre o conhecimento e as atitudes destes profissionais no contexto hospitalar. Por conseguinte, este estudo teve como objetivos: 1) traduzir, adaptar culturalmente e validar as escalas que compõem o questionário Geriatric Institucional Assessment Proflie (GIAP) para a população portuguesa; 2) analisar o AGTE (fatores intrínsecos e extrínsecos) que apoiam ou dificultam a adoção das melhores práticas geriátricas em hospitais portugueses; 3) analisar as atitudes e conhecimento de enfermeiros/as acerca de quatro síndromes geriátricas (úlceras de pressão, distúrbio do sono, contenção física e incontinência), destacando as boas práticas e os problemas encontrados nos hospitais portugueses; 4) analisar a relação entre as variáveis demográficas, profissionais e as características dos hospitais e as escalas que compõem o GIAP – versão portuguesa; 5) conhecer as perceções de enfermeiros/as acerca do cuidado às pessoas idosas hospitalizadas e dos obstáculos enfrentados para desenvolver um cuidado de boa qualidade; e 6) analisar a relação entre a perceção de enfermeiros/as sobre o AGTE e o conhecimento e atitudes geriátricas destes profissionais em função da região e unidade de internamento. Este estudo foi desenvolvido com base num método quantitativo do tipo exploratório-descritivo, transversal, prospetivo e correlacional. A amostra foi constituída por 1.068 enfermeiros/as de cinco hospitais da região norte e centro do país. A recolha de dados foi desenvolvida através de autopreenchimento do GIAP – versão portuguesa. De entre os principais resultados destacam-se: 1) a obtenção de um instrumento válido e fiável para avaliar o AGTE e conhecimentos e atitudes geriátricas; 2) a perceção de enfermeiros/as sobre o cuidado às pessoas idosas como sendo predominantemente negativa; 3) a perceção de enfermeiros/as sobre o apoio insuficiente dos líderes hospitalares para promover um AGTE favorável; 4) o cuidado a pessoas idosas com comportamentos inadequados e o uso de recursos geriátricos como os principais fatores que influenciam a eficácia e a qualidade do cuidado geriátrico; 5) a lacuna de conhecimento e atitudes negativas de enfermeiros/as acerca das quatro síndromes geriátricas; 6) a conceptualização de um modelo sobre a associação das características de enfermeiros/as, dos hospitais do estudo e das perceções destes/as profissionais sobre o cuidado geriátrico com o AGTE e o conhecimento e atitudes geriátricos; 7) a falta de apoio familiar, a descontinuidade e a escassez de tempo para o cuidado como principais obstáculos no cuidado à pessoa idosa hospitalizada; e 8) o perfil de cuidado geriátrico nos hospitais da região norte e centro de Portugal como tendencialmente homogéneo. Os resultados deste estudo sustentam a necessidade de um maior investimento dos decisores políticos, administradores hospitalares e docentes de Enfermagem na capacitação dos/as enfermeiros/as para o cuidado geriátrico e na promoção de um AGTE mais favorável. Também oferece recomendações significativas nos domínios da decisão política, da gestão institucional e da prática profissional que devem ser alvo de uma discussão alargada entre os vários agentes com responsabilidade nestes domínios. Espera-se que este estudo possa contribuir para a promoção de um contexto favorável ao desenvolvimento de um cuidado de enfermagem geriátrica de boa qualidade às pessoas hospitalizadas.

HIV positive men as fathers: Accounts of displacement, ir/responsibility and paternal emergence

It is now apparent that socio-cultural constructions of masculinity variously impact men’s experiences of their HIV positive status, yet how being a father can feature in this mix remains under-researched. This study employed in-depth semi-structured interviews and Foucauldian-informed discourse analysis to explore the accounts of six self-identifying heterosexual fathers (four black African migrants, two white European) who had been living with HIV from five to 24 years. While the HIV-related literature calls for the need to subvert ‘traditional’ expressions of masculinity as a means of promoting HIV prevention and HIV health, we argue that the lived experience for HIV positive men as fathers is more socially, discursively and thus more psychologically nuanced. We illustrate this by highlighting ways in which HIV positive men as fathers are not simply making sense of themselves as a HIV positive man for whom the modern (new) man and father positions are useful strategies for adapting to HIV and combating associated stigma. Discourses of modern and patriarchal fatherhoods, a gender-specific discourse of irresponsibility, and the neoliberal conflation of heath and self-responsibility are also at work in the sense making frames that HIV positive men, who are also fathers, can variously deploy. Our analysis shows how this discursive mix can underpin possibilities of often conflicted meaning and identity when living as a man and father with HIV in the UK, and specifically how discourses of fatherhood and HIV ‘positive’ health can complicate these men’s expressions and inhabitations of masculinity.