Potencial de hidrolisado de peixe para o controle de fitopatógenos.

Os produtos obtidos da fermentação de pescados marinhos frescos registrados como fertilizantes orgânicos são ricos em nutrientes, possuem em sua composição quitina e quitosana, podendo-se constituir em um produto alternativo adequado para o controle de fitopatógenos. O objetivo deste trabalho foi estudar o potencial de um hidrolisado de peixe em controlar o oídio em abobrinha, F. oxysporum f. sp. lycopersici raça 3 em tomate e Pythium spp. em pepino. Nesse sentido, um fertilizante orgânico obtido da fermentação de resíduos de pescados marinhos frescos foi pulverizado semanalmente nas plantas de abobrinha, com o auxílio de um compressor de pintura 10 1b/pol2 m a 0%, 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5% e 10% (v/v) para o controle do oídio. Este mesmo fertilizante foi incorporado ao substrato nas concentrações de 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% e 100% (por volume de água necessária para atingir a capacidade de campo), em experimento realizado dentro e fora de casa de vegetação. Outros experimentos realizados avaliaram a eficiência do hidrolisado de peixe no controle do tombamento causado por Pythium spp., em pepino e a murcha-de-fusário causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raça 3, em tomate. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação e o delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com dez repetições por tratamento. Para o pepino, foi utilizada a técnica de estimular a população original do solo com aveia. Assim, o hidrolisado de peixe foi incorporado ao solo dez dias após a mistura com aveia, em concentrações de 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% e 100% do volume de água, para atingir a capacidade de campo do solo e com incubação aberta e fechada. Após dez dias de incubação, 200 ml da mistura foram adicionados ao colo das plantas de pepino no estádio de 2° folhas verdadeiras. A avaliação foi realizada após cinco dias, determinando-se o número de plântulas tombadas. O hidrolisado de peixe, tanto pulverizado na folhas quanto incorporado no substrato, não controlou o oídio da abobrinha. Por outro lado, pode ser observado o efeito do hidrolisado de peixe no desenvolvimento das plantas e no desenvolvimento de Trichoderma no substrato. A partir da concentração de 30%, não houve tombamento de plantas. Por outro lado, o tombamento foi de 100% para os tratamentos com 0 e 5% do fertilizante. Para o experimento do Fusarium, foram utilizados três isolados da raça 3 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (isolados 145, 146 e 149). Após a infestação, o substrato foi incubado por quinze dias com o hidrolisado de peixe e foi incorporado ao substrato nas seguintes concentrações: 0%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40% e 50% volume de água necessária para atingir a capacidade de campo. Uma muda de tomate cultivar Santa Clara suscetível à raça 3 com 30 dias de idade, foi transferida para cada vaso. A severidade da doença foi avaliada após 40 dias, por meio de escala de notas para escurecimento vascular e sintomas externos. De modo geral, todas as doses do hidrolisado de peixe reduziram, significativamente, a severidade da doença.

Bioprospecting for culturable actinobacteria with antimicrobial properties isolated from rivers in Colombian Orinoquia

Purpose: To Isolate and characterize Actinobacteria with antimicrobial activity from Guaviare River (Colombia). Methods: Water and sediment samples were collected from Guaviare River. Direct plating, heat and CaCO3 methods were used to isolate Actinobacteria. Six bacterial strains were tested using T-Streak method: Escherichia coli ATCC 23724, Staphylococus aureus ATCC 25923, Acinetobacter baumannii ATCC 19606, Bacillus subtilis ATCC 21556, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Chromobacterium violaceum ATCC 31532. Strains of Fusarium sp. H24, Trichoderma harzianum H5 and Colletotrichum gloeosporioides were tested using Kirby-Bauer method. Isolates with high antimicrobial activity were selected for further taxonomic identification. Results: A total of 374 actinobacteria isolates were obtained. Seven isolates exhibited high antimicrobial activity (p < 0.05) and were confirmed as members of Streptomycetaceae family. Of these, three isolates showed differential phenotypic and genotypic profiles, indicating that they may represent new species. Conclusions: To date, this is the first study of this type in Colombian Orinoquia and indicates that this promising source of Actinobacteria from aquatic sediments with the ability to produce antimicrobial secondary metabolites.

Book of abstracts...

2016

Wheat blast and its effect on technological quality of grain from two sowing dates.

2016

Efficacy of fungicides for the control of wheat blast: collaborative tests results.

2016

Fine phenotyping unlocks wheat mechanisms of reaction to Magnaporthe oryzae.

2016

A systemic approach to incorporate the highest levels of FHB resistance with agronomic merit and quality in wheat.

2016

Beech bark disease distribution and resistance in Michigan and fungal endophyte ecology of resistant and susceptible beech (Fagus grandifolia Ehrh.)

Beech bark disease (BBD), a non-native association of the fungal pathogen Neonectria faginata and the beech scale insect Cryptococcus fagisuga, has dramatically affected American beech within North American forests. To monitor the spread and effects of BBD in Michigan, a network of forest health monitoring plots was established in 2001 following the disease discovery in Ludington State Park (Mason County). Forest health canopy condition and basic forestry measurements including basal area were reassessed on beech trees in these plots in 2011 and 2012. The influence of bark-inhabiting fungal endophytes on BBD resistance was investigated by collecting cambium tissue from apparently resistant and susceptible beech. Vigor rating showed significant influences of BBD in sample beech resulting in reduced health and substantiated by significant increases of dead beech basal area over time. C. fagisuga distribution was found to be spatially clustered and widespread in the 22 counties in Michigan's Lower Peninsula which contained monitoring plots. Neonectria has been found in Emmet, Cheboygan and Wexford in the Lower Peninsula which may coincide with additional BBD introduction locations. Surveys for BBD resistance resulted in five apparently resistant beech which were added to a BBD resistance database. The most frequently isolated endophytes from cambium tissue were identified by DNA sequencing primarily as Deuteromycetes and Ascomycetes including Chaetomium globosum, Neohendersonia kickxii and Fusarium flocciferum. N. faginata in antagonism trials showed significant growth reduction when paired with three beech fungal endophytes. The results of the antagonism trial and decay tests indicate that N. faginata may be a relatively poor competitor in vivo with limited ability to degrade cellulose.

Descripción del análisis microbológico realizado mediante maldi-tof en muestras de la fundación santa fe de Bogotá.

Introducción: La rápida detección e identificación bacteriana es fundamental para el manejo de los pacientes críticos que presentan una patología infecciosa, esto requiere de métodos rápidos para el inicio de un correcto tratamiento. En Colombia se usan pruebas microbiología convencional. No hay estudios de espectrofotometría de masas en análisis de muestras de pacientes críticos en Colombia. Objetivo general: Describir la experiencia del análisis microbiológico mediante la tecnología MALDI-TOF MS en muestras tomadas en la Fundación Santa Fe de Bogotá. Materiales y Métodos: Entre junio y julio de 2013, se analizaron 147 aislamientos bacterianos de muestras clínicas, las cuales fueron procesadas previamente por medio del sistema VITEK II. Los aislamientos correspondieron a 88 hemocultivos (60%), 28 urocultivos (19%), y otros cultivos 31 (21%). Resultados: Se obtuvieron 147 aislamientos con identificación adecuada a nivel de género y/o especie así: en el 88.4% (130 muestras) a nivel de género y especie, con una concordancia del 100% comparado con el sistema VITEK II. El porcentaje de identificación fue de 66% en el grupo de bacilos gram negativos no fermentadores, 96% en enterobacterias, 100% en gérmenes fastidiosos, 92% en cocos gram positivos, 100% bacilos gram negativos móviles y 100% en levaduras. No se encontró ninguna concordancia en bacilos gram positivos y gérmenes del genero Aggregatibacter. Conclusiones: El MALDI-TOF es una prueba rápida para la identificación microbiológica de género y especie que concuerda con los resultados obtenidos de manera convencional. Faltan estudios para hacer del MALDI-TOF MS la prueba oro en identificación de gérmenes.

DETECTION OF SPORES AND HYPHAE OF ARTWORKS’ BIODETERIOGENIC FILAMENTOUS FUNGI BY RNA-FISH

Filamentous fungi are a threat to the conservation of Cultural Heritage. Thus, detection and identification of viable filamentous fungi are crucial for applying adequate Safeguard measures. RNA-FISH protocols have been previously applied with this aim in Cultural Heritage samples. However, only hyphae detection was reported in the literature, even if spores and conidia are not only a potential risk to Cultural Heritage but can also be harmful for the health of visitors, curators and restorers. Thus, the aim of this work was to evaluate various permeabilizing strategies for their application in the detection of spores/conidia and hyphae of artworks’ biodeteriogenic filamentous fungi by RNA-FISH. Besides of this, the influence of cell aging on the success of the technique and on the development of fungal autofluorescence (that could hamper the RNA-FISH signal detection) were also investigated. Five common biodeteriogenic filamentous fungi species isolated from biodegradated artworks were used as biological model: Aspergillus niger, Cladosporium sp, Fusarium sp, Penicillium sp. and Exophialia sp. Fungal autofluorescence was only detected in cells harvested from Fusarium sp, and Exophialia sp. old cultures, being aging-dependent. However, it was weak enough to allow autofluorescence/RNA-FISH signals distinction. Thus, autofluorescence was not a limitation for the application of RNA-FISH for detection of the taxa investigated. All the permeabilization strategies tested allowed to detect fungal cells from young cultures by RNA-FISH. However, only the combination of paraformaldehyde with Triton X-100 allowed the detection of conidia/spores and hyphae of old filamentous fungi. All the permeabilization strategies failed in the Aspergillus niger conidia/spores staining, which are known to be particularly difficult to permeabilize. But, even in spite of this, the application of this permeabilization method increased the analytical potential of RNA FISH in Cultural Heritage biodeterioration. Whereas much work is required to validate this RNA-FISH approach for its application in real samples from Cultural Heritage it could represent an important advance for the detection, not only of hyphae but also of spores and conidia of various filamentous fungi taxa by RNA-FISH.

Flowchart for the production of perithecia of Gibberella zeae in wheat grains.

2016

Methodology to determine the number of infection points of Gibberella zeae in wheat spikes.

2016

Effects of sowing dates and wheat genetic resistance in FHB control.

2016

Effects of baking process on mycotoxin content in whole and white breads.

2016

Seleção de bactérias endofíticas com ação antagônica a fitopatógenos.

Muitos métodos rápidos e eficientes de seleção de agentes de biocontrole de fitopatógenos tem sido utilizados, visando reduzir tempo e custo dispendido em testes de campo. Neste trabalho realizou-se uma seleção de isolados endofíticos com potencial de uso no biocontrole de fitopatógenos em testes de antagonismo in vitro. De um total de 95 isolados de bactérias endofíticas do milho, seis foram selecionados quanto à inibição a Pythium aphanidermatum. A essa seleção, foram incluídos um isolado de Bacillus subtilis 0G, Bacillus lentimorbus e Streptomyces sp., para verificação de antagonismo a Rhizoctonia solani, Fusarium moniliforme, Sclerotium rolfsii e Exserohilum turcicum. Verificou-se que os endofíticos B. subtilis 0G, B. lentimorbus e Streptomyces sp., apresentaram ação antagônica superior aos demais, com taxas de inibição entre 32,0% e 53,8%. Dentre os endofíticos do milho, Bacillus agaradhaerens foi o que mais se destacou, com taxas de inibição variando entre 43,7% e 52,3% e indicando uma inespecificidade de ação. Este estudo, embora preliminar, permite vislumbrar a utilização desses endofíticos na supressão de doenças em diferentes sistemas patógeno-hospedeiro em testes subseqüentes, sob condições de casa-de-vegetação e a campo.