Etiologia e perfil de sensibilidade aos antimicrobianos de pacientes ambulatoriais de Botucatu e região

As infecções do trato urinário (ITU) são definidas como a invasão e posterior multiplicação de microorganismos nos tecidos das vias urinárias, sendo a bactéria gram-negativa E.coli o principal uropatógeno envolvido nessa infecção. A avaliação para a presença de ITU é feita através do quadro clínico característico desse tipo de paciente e o exame de cultura de urina. As amostras positivas para as culturas são avaliadas quanto ao perfil de sensibilidade aos antimicrobianos dos agentes etiológicos encontrados. Descrever a porcentagem de ocorrência dos agentes etiológicos e o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos das Infecções do Trato Urinário em pacientes ambulatoriais de Botucatu e região. Foram incluídas neste estudo culturas de urinas de pacientes atendidos em UBS de Botucatu e região Pólo Cuesta, no período de Janeiro de 2008 a Maio de 2010. As culturas positivas foram avaliadas quanto a porcentagem de ocorrência dos uropatógenos segundo sexo, faixa etária e origem. Foi utilizado o teste do qui-quadrado para verificar associação entre cada antimicrobiano e as porcentagens de sensibilidade e resistência encontradas. Foram avaliadas 11.768 culturas de urina provenientes de 11 municípios da região, sendo consideradas as culturas positivas (28%). Quanto à ocorrência dos agentes etiológicos verificou-se que a E.coli é responsável 58,76% dos casos. A distribuição dos uropatógenos segundo sexo revelou maior ocorrência de E.coli nos dois sexos. O segundo agente etiológico de maior ocorrência foi, nos homens o Proteus mirabilis e nas mulheres, o S. saprophyticus. Dentre as faixas etárias, a E.coli foi o patógeno de maior ocorrência. O perfil de sensibilidade aos antimicrobianos revelou que a E.coli é mais sensível a Ertapenem, Imipenem, Meropenem, Fosfomicina, Amicacina, Ceftriaxona, Nitrofurantoína e Norfloxacina; e mais resistente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Determinação de comunidades em redes biológicas integradas

To understand how biological phenomena emerge, the nonlinear interactions among the components envolved in these and the correspondent connected elements, like genes, proteins, etc., can be represented by a mathematical object called graph or network, where interacting elements are represented by edges connecting pairs of nodes. The analysis of various graph-related properties of biological networks has revealed many clues about biological processes. Among these properties, the community structure, i.e. groups of nodes densely connected among themselves, but sparsely connected to other groups, are important for identifying separable functional modules within biological systems for the comprehension of the high-level organization of the cell. Communities' detection can be performed by many algorithms, but most of them are based on the density of interactions among nodes of the same community. So far, the detection and analysis of network communities in biological networks have only been pursued for networks composed by one type of interaction (e.g. protein-protein interactions or metabolic interactions). Since a real biological network is simultaneously composed by protein-protein, metabolic and transcriptional regulatory interactions, it would be interesting to investigate how communities are organized in this type of network. For this purpose, we detected the communities in an integrated biological network of the Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae by using the Clique Percolation Method and we veri ed, by calculating the frequency of each type of interaction and its related entropy, if components of communities... (Complete abstract click electronic access below)

Busca de fitofármacos com potencial atividade contra Mycobacterium tuberculosis a partir de óleos essenciais

A Tuberculose é um problema grave de Saúde Pública em todo o mundo, causada pelo Mycobacterium tuberculosis e considerada a principal causa de morte entre as doenças infecto-contagiosas. Cerca de 80% da população infectada habitam países subdesenvolvidos, onde o Brasil ocupa a 19ª posição entre os países mais afetados. Embora existam agentes anti-tuberculosos, que são razoavelmente eficazes no tratamento da tuberculose, há uma crescente prevalência de cepas resistentes à multiplos fármacos devido principalmente ao abandono do tratamento.Outros fatores como a co-infecção HIV/TB e a infecção com bactéria em estado de latência denotam a necessidade em se buscar novos fármacos contra TB. Este trabalho teve como objetivo verificar a atividade antimicrobiana do óleo extraído da planta Hedychium coronarium e seus marcadores fitoquímicos frente ao M. tuberculosis utilizando a técnica de Rezasurin Microtiter Assay (REMA), que utiliza como revelador a resazurina. Com a técnica de REMA pudemos verificar a atividade dos óleos essenciais de H. coronarium e seus marcadores fitoquímicos frente ao M. tuberculosis. Futuros estudos buscando o isolamento de compostos a partir desses óleos e testá-los para a verificação de suas atividades anti-tuberculose, é válido e deve ser encorajado, pois existem características antimicrobianas promissoras e é interessante que se realize estudos de sinergismo com outros compostos naturais, podendo assim dar continuidade na busca de novos fitofármacos na luta contra a tuberculose

Susceptibilidade do Staphylococcus aureus à terapia fotodinâmica (PDT)

A terapia fotodinâmica (PDT), de maneira simplificada pode ser aplicada utilizando um fotossensibilizador (FS) e uma fonte de luz com comprimento de onda específico, que combinados na presença do oxigênio produzem espécies citotóxicas que causam o dano celular. O objetivo deste estudo piloto foi verificar a susceptibilidade de Staphylococcus aureus (ATCC 25923) à PDT, empregando diferentes concentrações de azul de metileno. As amostras desta bactéria foram sensibilizadas com azul de metileno nas concentrações de 6,25 μg/mL; 12,5 μg/mL; 25,0 μg/mL; 50,0 μg/mL; 100,0 μg/mL e 200,0 μg/mL e expostas à luz LED vermelha (660nm) por 20 minutos. Após o tratamento de todos os grupos estudados a fração de sobrevivência foi calculada pela contagem das unidades formadoras de colônia (UFC). O resultado deste estudo mostrou que o fotossensibilizador no escuro foi tóxico (dark toxicity) nas concentrações de 100 e 200 μg/mL. Já no grupo onde utilizamos apenas a luz, não houve redução bacteriana significativa. Entretanto, o uso combinado do AM e da luz LED (Grupo PDT) mostrou que todas as concentrações testadas causaram uma redução significativa de S aureus. Desta forma concluímos que a terapia fotodinâmica antimicrobiana pode ser um tratamento alternativo para redução de Staphylococcus aureus.

Detecção de Salmonella Enteritidis em ovos de codornas japonesas submetidas a dietas com diferentes níveis de cálcio e fósforo

The eggs are pointed in several studies as the main cause of human salmonellosis. Have been identified that eggs are eaten raw or poorly processed are mainly responsible for outbreaks of human infection with Salmonella spp. Besides causing problems to public health, the presence of bacteria impedes or hinders the international food trade, as a sanitary barrier. Several factors predisposing to contamination of the internal contents of eggs for Salmonella spp., including the egg shell quality (shell quality), which is related to levels of calcium (Ca) and phosphorus (P) in the diet of quails . The experiment used eggs of Japanese quail under different diets containing two levels of Ca (2.0 and 3.5%) and two levels of available P (0.25 and 0.45%). Eggs of 120 japanese quails were divided into four treatments with three replicates. The experiment was divided into three production stages: initial, intermediate and final. Were assessed at each stage the presence of bacteria in internal and external content of experimentally contaminated eggs during periods of 0, 24, 96 and 168 hours after immersion in broth containing Salmonella Enteriditis. Salmonella Enteriditis was detected in the shell during all periods of storage, in decreasing amounts in all treatments. None of the treatments within the three production stages analyzed, we detected significant amounts of the bacteria inside the egg, in our experimental conditions. Therefore, the levels of Ca and P in the diets of quail do not determine higher or lower risks to public health represented by eggs

Perfil sanitário e pesquisa de Salmonella em frangos e lingüiças pela metodologia tradicional e pela PCR

Novos hábitos alimentares da população e as mudanças nos sistemas de produção e distribuição dos alimentos podem estar fortemente relacionados aos casos de doenças transmitidas pelo consumo de alimentos contaminados por microorganismos. Isso faz com que a preocupação com a qualidade microbiológica dos alimentos aumente mundialmente. Dentre os principais patógenos, destaca-se a Salmonella sp, que pertence à microbiota gatrentestinal de animais silvestres e de animais domésticos criados para o consumo humano (aves, bovinos e suínos). Este fato torna o problema de grande relevância para as autoridades de saúde pública, pois esses microrganismos podem estar associados às infecções ou surtos provocados pela ingestão de alimentos contaminados. Foram coletadas 35 amostras de lingüiças e 25 cortes de frango, nos principais supermercados do município de Botucatu-SP e avaliados quanto à qualidade higiênico-sanitária através da determinação do número mais provável de coliformes termotolerantes (CT), além da presença de Salmonella sp. Os resultados obtidos mostram que 31% das lingüiças e 84% das amostras de frango estavam fora dos padrões higiênico-sanitários estabelecido pela ANVISA (RDC n° 12), que determina uma quantidade máxima de 5x103 CT/g em lingüiça e 104 /g em carne de aves. Em relação à Salmonella sp, estabeleceu-se a ausência dessa bactéria em 25g de lingüiça e não determina nenhum parâmetro para o frango. Entre as 25 amostras de frango analisadas, duas (8%) foram positivas pela metodologia tradicional. Esse... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Comportamento de Escherichia coli produtora de toxina de Shiga em meios ácidos

Escherichia coli é uma bactéria Gram-negativa, pertencente à família Enterobacteriaceae, que habita o intestino de animais de sangue quente, com 90% sendo comensais para o ser humano e 10% patogênicas. Quando presente em alimentos esse grupo é considerado um bom indicador higiênico-sanitário de alimentos. Em alimentos, a cepa patogênica mais estudada é E. coli produtora de toxina de Shiga (STEC) O157:H7. Entretanto, muitos casos vêm ocorrendo em todo o mundo devido a cepas patogênicas não O157, como O103, O111, O145 e O26. As STECs são responsáveis por desde uma simples diarréia até diarréia sanguinolenta que pode evoluir ainda para síndrome hemolítica urêmica e púrpura trombótica trombocitopênica, que podem ocasionar danos crônicos como falência renal. A transmissão destas cepas se deve a carnes mal cozidas, leites e derivados não pasteurizados, água e vegetais contaminados. Uma característica interessante de E. coli O157:H7 é o seu mecanismo de resistência ao estresse ácido – ácido tolerância – de modo que os alimentos ácidos não podem mais ser considerados seguros contra tais organismos. A fim de ampliar o conhecimento acerca das cepas não O157 e dos mecanismos de ácido resistência, este trabalho teve por objetivo verificar o comportamento de linhagens de STEC não O157:H7 submetidas às condições de estresse de baixo pH utilizando para tanto meios de cultura acidificados e polpas de frutas como matriz alimentar. Constatou-se que quando mantidas em condições-controle e as ácido-adaptadas mantêm populações da ordem de 2 a 3 log UFC/mL quando em polpas de frutas sabor cajá (pH 2,3) e tamarindo (pH 2,3) armazenadas a 4 C por até 30 dias

Associação entre mesoplasma sp e formigas da tribo Attini (Hymenoptera, formicidae)

As formigas da tribo Attini apresentam reconhecida simbiose com microrganismos: fungos mutualistas basidiomicetos nas famílias Lepiotaceae e Pterulaceae cultivados pelas formigas, bactérias actinomicetas ou no gênero Burkholderia produtoras de antibióticos contra fungos entomopatogênicos, fungos ascomicetos do gênero Escovopsis micófagos para o mutualista, e comensais como fungos, leveduras e bactérias que degradam celulose. Um novo mutualista é descrito no presente trabalho: uma espécie de bactéria no gênero Mesoplasma, detectada via PCR para 16S no DNA genômico de Attini derivadas (gêneros Acromyrmex, Atta, Serycomyrmex e Cyphomyrmex), intermediárias (Trachymyrmex) e basais (Apterostigma, Mycetarotes, Mycocepurus e Mycetagroicos). Uma única linhagem de Mesoplasma com baixíssima diversidade 16S esteve presente nas Attini, mas não em formigas de tribos filogeneticamente próximas a Attini, como Dolichoderini (Tapinoma sp), Camponotini (Camponotus sp), Cephalotini (Cephalotes sp), Crematogastrini (Crematogaster sp), Pheidolini (Pheidole sp) e Ponerini (Pachycondyla sp), indicando uma simbiose Mesoplasma-Attini recente e específica.

Endocardite infecciosa em pequenos animais

Infective endocarditis is a process in which an infection attacks the heart endothelial surface, and is commonly caused by bacterial colonization, which is called bacterial endocarditis. It is a condition rarely found in dogs and cats, and is more prevalent in male dogs of large size. It mainly affects the left side of the heart, affecting the mitral and aortic valves with greater frequency. The circulation of the bacterium in the bloodstream is what gives rise endocarditis, and is caused by any non-aseptic process that serves as a gateway for bacterium in the body, as from a skin lesion, even as an invasive procedure, such as, catheterization and surgery. The ante-mortem diagnosis is difficult because the clinical signs of endocarditis are varied and common to other diseases, summing up the signs of infection (fever, lethargy, weight loss), and presence of heart murmur and may show signs of congestive heart failure. Thus, the diagnosis is most often through autopsy. To arrive at a diagnosis should be used, besides the history and physical examination, some laboratory tests, especially blood cultures and echocardiography. Treatment is accomplished through the use of antibiotics for long period of time, it is very important to follow the results of susceptibility after its outcome is revealed. The prognosis for bacterial endocarditis ranges from guarded to poor, and can be assessed mainly by the echocardiography. There are few studies in veterinary about the bacterial endocarditis, and the majority is case reports

Helibacter pylori: preaparação de Lapdesf-IUNI e ensaio de inibição de urease (IC50) de derivados de tiouréia e guanidínicos

O presente trabalho de conclusão de curso visou à otimização e preparação da síntese de Lapdesf-IUNI e avaliação do potencial de inibição de urease de três compostos previamente sintetizados, direcionados especificamente para o tratamento de infecções por Helicobacter pylori, bactéria mundialmente reconhecida como uma das principais causadoras de infecções no mundo, responsável pelos casos de infecções gástricas, como gastrites crônicas, úlceras (gástricas e duodenais) e carcinomas. Lapdesf-IUNI é um composto derivado de metronidazol, com atividade potencialmente inibidora de urease, enzima presente neste microrganismo e essencial a sua sobrevivência no ambiente gástrico. O produto foi obtido, porém com baixo rendimento, por isso sua metodologia ainda necessita ser aperfeiçoada, para que, em seguida este composto possa ser testado. Outros três compostos, um derivado de tiouréia e dois derivados guanidínicos, com potencial atividade inibidora de urease, T-6, R-17 e R-21, sintetizados pela equipe do Prof. Eduardo Perez, foram avaliados com relação a sua atividade inibidora frente à enzima urease e IC50, apresentando bons resultados, que permitem a continuidade dos estudos, comparando inclusive com fármacos utilizados nos protocolos de tratamento padrões para o tratamento das infecções causadas por H. pylori

Avaliação dos fatores de virulência de cepas de Staphylococcus aureus isoladas de pacientes submetidos à diálise peritoneal e correlação com a evolução clínica dos episódios de peritonite

10 A diálise peritoneal (DP) é uma terapia de substituição renal utilizada em pacientes renais crônicos. A peritonite é uma das suas principais complicações; sendo o Staphylococcus aureus causador de episódios mais graves e reincidentes. Os fatores de virulência desta bactéria são responsáveis por essa alta patogenicidade. Esse estudo objetivou avaliar esses fatores e a presença do gene mecA em amostras de S.aureus obtidas de episódios de peritonites de pacientes tratados com DP. Foram estudadas 73 amostras de peritonites ocorridas entre janeiro de 1996 e setembro de 2008. O estudo dos fatores de patogenicidade consistiu na detecção da produção de biofilme, de enzimas hemolisinas α e β, lipase, lecitinase e nucleases; e das enterotoxinas A, B, C, D e da Toxina 1 da Síndrome do Choque Tóxico (TSST-1). Ainda foi verificado o perfil de sensibilidade dos isolados à oxacilina pelo Etest® e detecção do gene mecA por PCR. Dentre todos os resultados, a produção de toxina B e a resistência à oxacilina foram os dois fatores que influenciaram a evolução dos casos de nova infecção. Quanto aos casos recorrentes, características dos pacientes como idade, raça e presença de diabetes foram mais determinantes para a não resolução dos surtos de peritonite

Redução bacteriana via terapia fotodinâmica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Implementação do algoritmo de Newman para identificação de comunidades em placas gráficas

Communities are present on physical, chemical and biological systems and their identification is fundamental for the comprehension of the behavior of these systems. Recently, available data related to complex networks have grown exponentially, demanding more computational power. The Graphical Processing Unit (GPU) is a cost effective alternative suitable for this purpose. We investigate the convenience of this for network science by proposing a GPU based implementation of Newman community detection algorithm. We showed that the processing time of matrix multiplications of GPUs grow slower than CPUs in relation to the matrix size. It was proven, thus, that GPU processing power is a viable solution for community dentification simulation that demand high computational power. Our implementation was tested on an integrated biological network for the bacterium Escherichia coli

Atividade in vivo de parasporina extraída de B. thuringiensis sobre o câncer colorretal murino (CT‐26)

Bacillus thuringiensis (Bt), is an environmental Gram-positive spore-forming bacterium that produces crystalline parasporal protein (Cry) during sporulation. The inclusions often exhibit strong and specific insecticidal activity, making Bt an agent for agricultural controlling insects pest, mites, protozoa and nematodes. Recent studies reported that some of these Crys do not show cytotoxicity against insects but they are capable to kill some human and animal cancer cells. These proteins were denominated parasporins (PS). However, antitumor activity of Bt parasporin on the development of murine colorectal cancer (CT-26), are not well studies and these are no reports on the in vivo effect of these proteins. Thus, the present study evaluated the in vitro and in vivo anti-tumoral activity of Bt parasporin against the murine colorectal cancer line CT-26. Therefore, Balb/c mice were s.c. inoculated with CT-26 cells and weekly treated with parasporin (i.p.) pre-activated by enzymatic digestion with trypsin or proteinase K. Our results have shown, for the first time, that despite the anti-tumor activity in vitro, parasporin crystals couldn’t combat tumor growth in vivo. Instead, this protein was highly toxic, affecting the liver and spleen, with possible effect on other organs, decreasing the survival of treated animals. The results indicate the need for studies to better detoxification or manipulation of parasporin for therapeutic use and new studies for analysis of toxicological effects of repetitive exposure of farmers to this toxin

Rodococose equina: uma revisão com ênfase na fisiopatogenia e tratamento

The rhodococcosis affects humans and animals. Equine are the most important species for rhodococcosis, which is considered the most debilitating disease in the creation of foals, leading to a mortality rates greater than 50% in this category. The disease is caused by Rhodococcus equi, a bacteria considered as a soil-born opportunistic microorganism, intracellular and ubiquitous. The disease in horses is manifested mainly in the form of pyogranulomatous pneumonia and less often in the form of enteric disorders and / or joint disorders. Transmission occurs mainly by ingestion of contaminated food and water, and inhalation in contaminated environment. The organism has mechanisms of evasion of the immune system, maintain viable in inside phagocytic cells, and induces piogranulomatous infections, leading to lesions of difficult treatment using conventional antimicrobials. Lipophilic drugs with good intracellular activity are required to successful treatment. The conventional treatment for foals is based on the combination of erythromycin and rifampin. However, there is a growing concern about the emergence of resistant strains, which makes increasingly studies on the development of alternative antimicrobials for therapy