Affymetrix Whole-Transcript Human Gene 1.0 ST array is highly concordant with standard 3' expression arrays.

The recently released Affymetrix Human Gene 1.0 ST array has two major differences compared with standard 3' based arrays: (i) it interrogates the entire mRNA transcript, and (ii) it uses DNA targets. To assess the impact of these differences on array performance, we performed a series of comparative hybridizations between the Human Gene 1.0 ST and the Affymetrix HG-U133 Plus 2.0 and the Illumina HumanRef-8 BeadChip arrays. Additionally, both RNA and DNA targets were hybridized on HG-U133 Plus 2.0 arrays. The results show that the overall reproducibility of the Gene 1.0 ST array is best. When looking only at the high intensity probes, the reproducibility of the Gene 1.0 ST array and the Illumina BeadChip array is equally good. Concordance of array results was assessed using different inter-platform mappings. Agreements are best between the two labeling protocols using HG-U133 Plus 2.0 array. The Gene 1.0 ST array is most concordant with the HG-U133 array hybridized with cDNA targets. This may reflect the impact of the target type. Overall, the high degree of correspondence provides strong evidence for the reliability of the Gene 1.0 ST array.

Què saben els pares dels infants de 0-3 anys, sobre l'ús del rentat nasal i els inhaladors amb cambra?

Aquest estudi insisteix en la importància de l’educació sanitària dirigida als pares per tald’assegurar l’eficàcia del tractament a administrar i consolidar els coneixements i habilitats del progenitors per tal de que aquests puguin dur a terme les tècniques requerides de forma adequada.Destacar la necessitat de conscienciar a tots els professionals de la salut, sobretot els quepassen més temps amb els familiars, de la importància que té la seva competència comeducador en l’àmbit de la salut.Evidenciar la importància de fer una avaluació continuada dels coneixements i les habilitatsadquirides pels cuidadors principals, sobre com dur a terme les tècniques del rentat de nas iadministració de la medicació inhalada amb cambra i mascareta, per detectar-ne els possibleserrors i poder posar-hi mesures correctores per pal·liar-los.Constatar la utilitat de preguntar i esbrinar “in situ” què saben els progenitors sobre lestècniques a avaluar (rentat de nas i administració de la medicació inhalada amb cambra i mascareta), abans de donar qualsevol explicació o iniciar l’educació sanitària per detectar lesnecessitats específiques de cada pare o mare i poder individualitzar el procés educatiu

InnovaCampus 2.0 redisseny d'una aplicació web d'ajut a l'autoavaluació formativa

InnovaCampus 2.0 és el redisseny de l'aplicació de programari lliure InnovaCampus utilitzant els frameworks Spring i JPA. InnovaCampus és una aplicació que permet l'autoavaluació d'estudiants universitaris a travé d'Internet. Posteriorment, un professor pot analitzar-ne els resultats i obtenir conclusions sobre el nivell general o d'un estudiant concret. El projecte consisteix en dissenyar i implementar novament totes les funcionalitats existents fins ara i usant una arquitectura que afovoreixi les ampliacions futures. El disseny d'InnovaCampus 2.0 s'ha fet usant tecnologies més actuals (Spring, JPA) i s'hi han afegit algunes funcionalitats.

MoniTo 4.0, una herramienta de monitorización de clusters

La herramienta de monitorización de clusters MoniTo debe estar preparada ante los constantes cambios en el kernel de Linux que la pudieran dejar inutilizable. Para evitarlo se ha modificado su implementación utilizando librerías Libgtop. También se ha modificado su interfaz web para adaptarla a los nuevos tiempos, optimizar su funcionamiento y dotarla de nuevas posibilidades.

Eina d'anàlisi de rendiment d'una xarxa : TaFanet v1.0

Treball de final de carrera que descriu el procés d'implementació de TaFanet v1.0.

Cibermedios y web 2.0: modelo de análisis y resultados de aplicación

Se propone un modelode análisis para cibermedios(periodismo digital) con elfin de determinar su calidad enrelación con un conjunto de parámetrosgenerales y, en especial,respecto a la adopción dela web 2.0. Este modelo se hatestado con el análisis de ochodiarios digitales cuyos resultadosse presentan también. Presentaun carácter modular quepermite por un lado su extensión,y por otro, su aplicacióntotal o parcial en contextos deanálisis diferentes.

Indicadores para la evaluación de la calidad en cibermedios: análisis de la interacción y de la adopción de la Web 2.0

La creciente adaptación de los medios de comunicación al entorno digital hace conveniente la utilización de metodologías de análisis que permitan determinar la calidad de sus sitios web. En este artículo, a partir del estudio de las características de las webs de algunos de los medios de comunicación más importantes a nivel internacional, se propone una metodología para la evaluación específica de este tipo de sitios web. El modelo propuesto se compone de treinta y seis indicadores, organizados en torno a ocho parámetros que permiten valorar, especialmente, la adaptación del medio de comunicación a la interacción de la Web 2.0. Otros aspectos a los que también se presta atención, pero en menor medida, son la arquitectura de la información, la usabilidad, la accesibilidad o las herramientas de interacción y comunicación que éste pone a disposición de sus usuarios.

SelenoDB 1.0 : a database of selenoprotein genes, proteins and SECIS elements

Selenoproteins are a diverse group of proteinsusually misidentified and misannotated in sequencedatabases. The presence of an in-frame UGA (stop)codon in the coding sequence of selenoproteingenes precludes their identification and correctannotation. The in-frame UGA codons are recodedto cotranslationally incorporate selenocysteine,a rare selenium-containing amino acid. The developmentof ad hoc experimental and, more recently,computational approaches have allowed the efficientidentification and characterization of theselenoproteomes of a growing number of species.Today, dozens of selenoprotein families have beendescribed and more are being discovered in recentlysequenced species, but the correct genomic annotationis not available for the majority of thesegenes. SelenoDB is a long-term project that aims toprovide, through the collaborative effort of experimentaland computational researchers, automaticand manually curated annotations of selenoproteingenes, proteins and SECIS elements. Version 1.0 ofthe database includes an initial set of eukaryoticgenomic annotations, with special emphasis on thehuman selenoproteome, for immediate inspectionby selenium researchers or incorporation into moregeneral databases. SelenoDB is freely available athttp://www.selenodb.org.

Quality Assessment of Cardiac Magnetic Resonance Images at 1.5/3.0 T: Description and Validation of Standardized Criteria

PURPOSE: Cardiovascular magnetic resonance (CMR) has become a robust and important diagnostic imaging modality in cardiovascular medicine. However,insufficient image quality may compromise its diagnostic accuracy. No standardized criteria are available to assess the quality of CMR studies. We aimed todescribe and validate standardized criteria to evaluate the quality of CMR studies including: a) cine steady-state free precession, b) delayed gadoliniumenhancement, and c) adenosine stress first-pass perfusion. These criteria will serve for the assessment of the image quality in the setting of the Euro-CMR registry.METHOD AND MATERIALS: First, a total of 45 quality criteria were defined (35 qualitative criteria with a score from 0-3, and 10 quantitative criteria). Thequalitative score ranged from 0 to 105. The lower the qualitative score, the better the quality. The quantitative criteria were based on the absolute signal intensity (delayed enhancement) and on the signal increase (perfusion) of the anterior/posterior left ventricular wall after gadolinium injection. These criteria were then applied in 30 patients scanned with a 1.5T system and in 15 patients scanned with a 3.0T system. The examinations were jointly interpreted by 3 CMR experts and 1 study nurse. In these 45 patients the correlation between the results of the quality assessment obtained by the different readers was calculated.RESULTS: On the 1.5T machine, the mean quality score was 3.5. The mean difference between each pair of observers was 0.2 (5.7%) with a mean standarddeviation of 1.4. On the 3.0T machine, the mean quality score was 4.4. The mean difference between each pair of onservers was 0.3 (6.4%) with a meanstandard deviation of 1.6. The quantitative quality assessments between observers were well correlated for the 1.5T machine: R was between 0.78 and 0.99 (pCONCLUSION: The described criteria for the assessment of CMR image quality are robust and have a low inter-observer variability, especially on 1.5T systems.CLINICAL RELEVANCE/APPLICATION: These criteria will allow the standardization of CMR examinations. They will help to improve the overall quality ofexaminations and the comparison between clinical studies.

A context-based methodology for integrating Web 2.0 services in learning scenarios

The emergence of the Web 2.0 technologies in the last years havechanged the way people interact with knowledge. Services for cooperation andcollaboration have placed the user in the centre of a new knowledge buildingspace. The development of new second generation learning environments canbenefit from the potential of these Web 2.0 services when applied to aneducational context. We propose a methodology for designing learningenvironments that relates Web 2.0 services with the functional requirements ofthese environments. In particular, we concentrate on the design of the KRSMsystem to discuss the components of this methodology and its application.

La adaptación de los periódicos digitales al entorno de la Web 2.0.

El propósito de esta comunicación es analizar el estado actual de los periódicos digitales, prestandoespecial atención a la adaptación de éstos al entorno de la Web 2.0. Para llevar a cabo este trabajo sehan estudiado, entre otras, las siguientes variables: el tipo de herramientas propias de la Web 2.0que los periódicos digitales han incorporado a sus sitios web, la forma en que éstas ha cambiado elproceso de creación de los productos periodísticos, la respuesta que los periódicos digitales hanrecibido por parte de la audiencia y el nuevo tipo de interacción creado con los usuarios.

La incorporació de la Web 2.0 a les assignatures del Departament de Comunicació de la UPF

L’objectiu d’aquest treball és proposar, estudiar i analitzar un conjunt de models d’aplicació de les TIC, i més concretament d’eines associades a la Web 2.0, en la docència presencial de la Facultat de Comunicació de la Universitat Pompeu Fabra.Partint d’aquest objectiu, les idees principals que s’aporten en aquest treballsón: la necessitat d’actualitzar el model docent presencial amb les eines d’Internet que estan a l’abast dels estudiants, per tal d’innovar i arribar a superar els estàndards europeus de qualitat docent. Per donar validesa a aquest treball, s’ha fet una revisió dels models teòrics associats a laSocietat del Coneixement, les Tecnologies de la Informació i la Comunicació, la Tecnologia Educativa, Internet i la Web 2.0, i el sistema d’ensenyament superior a la Universitat Pompeu Fabra.Aquest treball és una porta oberta cap a una tesi on s’ha establert el següent esquema de treball:· Revisió de la bibliografia precedent i adquisició del coneixement de nous conceptes i models teòrics.· Disseny d’un marc pràctic per tal d’obtenir diverses variables per a la posterior anàlisi.· Aplicació de la matèria a la Universitat Pompeu Fabra.