Interaction of GroEL with a highly structured folding intermediate: iterative binding cycles do not involve unfolding.

The GroE proteins are molecular chaperones involved in protein folding. The general mechanism by which they facilitate folding is still enigmatic. One of the central open questions is the conformation of the GroEL-bound nonnative protein. Several suggestions have been made concerning the folding stage at which a protein can interact with GroEL. Furthermore, the possibility exists that binding of the nonnative protein to GroEL results in its unfolding. We have addressed these issues that are basic for understanding the GroE-mediated folding cycle by using folding intermediates of an Fab antibody fragment as molecular probes to define the binding properties of GroEL. We show that, in addition to binding to an early folding intermediate, GroEL is able to recognize and interact with a late quaternary-structured folding intermediate (Dc) without measurably unfolding it. Thus, the prerequisite for binding is not a certain folding stage of a nonnative protein. In contrast, general surface properties of nonnative proteins seem to be crucial for binding. Furthermore, unfolding of a highly structured intermediate does not necessarily occur upon binding to GroEL. Folding of Dc in the presence of GroEL and ATP involves cycles of binding and release. Because in this system no off-pathway reactions or kinetic traps are involved, a quantitative analysis of the reactivation kinetics observed is possible. Our results indicate that the association reaction of Dc and GroEL in the presence of ATP is rather slow, whereas in the absence of ATP association is several orders of magnitude more efficient. Therefore, it seems that ATP functions by inhibiting reassociation rather than promoting release of the bound substrate.

Accelerated induction of experimental allergic encephalomyelitis in PL/J mice by a non-V beta 8-specific superantigen.

Superantigens such as the staphylococcal enterotoxins can play an important role in exacerbation of autoimmune disorders such as experimental allergic encephalomyelitis (EAE) in mice. In fact, superantigens can reactivate EAE in PL/J mice that have been sensitized to rat myelin basic protein (MBP). The T-cell subset predominantly responsible for disease in PL/J mice bears the V beta 8+ T-cell antigen receptor (TCR). The question arises as to whether T cells bearing other V beta specificities are involved in induction or reactivation of EAE with superantigen. Thus, we have investigated the ability of a non-V beta 8-specific superantigen, staphylococcal enterotoxin A (SEA) (V beta specificities 1, 3, 10, 11, and 17), to induce EAE in PL/J mice that have been previously protected from disease by anergy and deletion of V beta 8+ T cells. PL/J mice were first pretreated with the V beta 8-specific superantigen staphylococcal enterotoxin B (SEB) and then immunized with MBP. These mice exhibited V beta 8-specific anergy and depletion and did not develop EAE, even when further treated with SEB. However, administration of SEA to these same mice induced an initial episode of EAE which was characterized by severe hindleg paralysis and accelerated onset of disease. In contrast to SEB pretreatment, PL/J mice pretreated with SEA did develop EAE when immunized with MBP, and after resolution of clinical signs of disease these mice were susceptible to relapse of EAE induced by SEB but not by SEA. Thus, superantigens can activate encephalitogenic MBP-specific non-V beta 8+ T cells to cause EAE in PL/J mice. These data suggest that superantigens can play a central role in autoimmune disorders and that they introduce a profound complexity to autoimmune diseases such as EAE, akin to the complexity seen in multiple sclerosis.

Variação sazonal do metabolismo energético no primeiro ciclo anual de lagartos teiú Tupinambis merianae: correlatos com atividades diárias, adiposidade e proteção antioxidante

Lagartos teiú eclodem no verão e enfrentam o desafio de crescer e armazenar substratos em um curto período de tempo, antes do início do período de jejum e depressão metabólica (≈80%) a temperaturas amenas durante o inverno (≈17 °C). No despertar, o aumento do metabolismo e a reperfusão de órgãos favoreceriam a ocorrência de estresse oxidativo. Na primeira parte do presente estudo investigou−se os ajustes que compatibilizam as demandas em teiús neonatos, especialmente na pré-hibernação, por meio da gravação do comportamento em vídeo e da análise da massa dos corpos gordurosos abdominais e do nível plasmático de corticosterona (CORT) durante o primeiro ciclo anual. No início do outono a massa corpórea dos teiús foi 27 g e o comprimento rostro−cloacal 9,3 cm e aumentaram 40% e 20%, respectivamente, ao longo do outono, enquanto que as taxas diminuíram progressivamente até atingirem o valor zero no início do inverno. Na primavera, a massa corpórea dos teiús aumentou 80% em relação ao despertar e dobrou em relação ao final do verão; o comprimento acumulou um aumento de 27% em relação ao final do verão. A massa relativa dos corpos gordurosos foi 3,7% no início do outono e diminuiu nos meses subsequentes; no despertar, este estoque acumulou uma perda de 63% da sua massa. No início do outono 74% dos teiús estavam ativos por 4,7 h e permaneceram 2 h assoalhando diariamente; ao longo do outono o número de animais ativos e o tempo em atividade diminuíram até que todos se tornaram inativos. Na primavera 83% dos teiús estavam ativos por 7 h e permaneceram 4 h assoalhando. Um padrão sazonal similar foi observado na atividade locomotora e na alimentação. No outono, a alimentação cessou antes da atividade diária e os teiús tornaram−se afágicos algumas semanas antes da entrada em hibernação. Os maiores níveis de CORT foram observados no início do outono, reduzindo progressivamente até valores 75 e 86% menores na dormência e despertar, respectivamente; na primavera os níveis de CORT foram 32% menores em comparação com o início do outono. Este padrão sugere um papel da CORT nos ajustes que promovem a ingestão de alimento e a deposição de substratos energéticos no outono. A redução da atividade geral no final do outono contribuiria para a economia energética e manutenção da massa corpórea, apesar da redução da ingestão de alimento. O curso temporal das alterações fisiológicas e comportamentais em neonatos reforça a ideia de que a dormência sazonal nos teiús é o resultado da expressão de um ritmo endógeno. Na segunda parte do estudo foi investigada a hipótese de que ocorreriam ajustes das defesas antioxidantes durante a hibernação, em antecipação ao despertar. Foram analisados marcadores de estresse oxidativo e antioxidantes em vários órgãos de teiús em diferentes fases do primeiro ciclo anual. A CS, um indicador do potencial oxidante, não variou no fígado e foi menor no rim e no pulmão na hibernação. As enzimas antioxidantes revelaram (1) um efeito abrangente de redução das taxas na hibernação e despertar; por exemplo, GR e CAT foram menores em todos órgãos analisados e a GST tendeu a diminuir no fígado e no rim, embora constante no coração e no pulmão. A G6PDH no fígado e no rim não variou. (2) No fígado, a GST, a Se−GPX e o teor de TBARS foram maiores na atividade de outono em relação à primavera e a Se−GPX permaneceu elevada na hibernação. (3) No fígado, a SOD foi maior na hibernação e despertar em relação ao outono e a Mn−SOD seguiu este padrão. Em contraste, no rim, coração e pulmão a SOD foi menor na hibernação e as taxas se recuperaram no coração e pulmão no despertar. A Mn−SOD seguiu este padrão no pulmão. A concentração e o estado redox da glutationa não variaram no fígado, rim e coração; no pulmão o teor de Eq−GSH e GSH foi menor na hibernação, com tendência à recuperação no despertar. O teor de PC no rim foi maior na hibernação e diminuiu no despertar. No fígado, as alterações no jejum se assemelham às sazonais, como sugerem a inibição da CAT e GR e aumento da Se−GPX. Os efeitos do jejum na primavera no rim diferem dos efeitos sazonais, como sugerem a redução do teor de Eq−GSH e GSH e o aumento da razão GSSG:GSH, a redução da G6PDH e o aumento de PC. No conjunto, houve um efeito predominante de redução das taxas enzimáticas na hibernação e no despertar, exceto pelas taxas aumentadas da SOD e Se−GPX no fígado e pela recuperação da SOD no coração e da GR, SOD e Mn−SOD no pulmão no despertar. As elevadas taxas das enzimas antioxidantes no teiú em comparação a outros ectotermos e a ausência de evidências de estresse oxidativo no despertar sugerem que a atividade enzimática remanescente é suficiente para prevenir danos aos tecidos face às flutuações do metabolismo

Macro- and microglial responses in the fellow eyes contralateral to glaucomatous eyes

Most studies employing experimental models of unilateral glaucoma have used the normotensive contralateral eye as the normal control. However, some studies have recently reported the activation of the retinal macroglia and microglia in the uninjured eye, suggesting that the eye contralateral to experimental glaucoma should not be used as a control. This review analyzes the studies describing the contralateral findings and discusses some of the routes through which the signals can reach the contralateral eye to initiate the glial reactivation.

Efeito da temperatura de revenimento sobre o grau de sensitização e resistência à corrosão por pite de aços inoxidáveis supermartensíticos contendo 13% Cr, 5% Ni, com e sem adições de Nb e Mo.

O desenvolvimento dos aços inoxidáveis Super-Martensíticos (SM) nasce da necessidade de implementar novas tecnologias, mais econômicas e amigáveis ao meio ambiente. Os aços inoxidáveis SM são uma derivação dos aços inoxidáveis martensíticos convencionais, diferenciando-se basicamente no menor teor de carbono, na adição de Ni e Mo. Foram desenvolvidos como uma alternativa para aços inoxidáveis duplex no uso de dutos para a extração de petróleo offshore em meados dos anos 90. Para que esses aços apresentem as propriedades mecânicas de resistência à tração e tenacidade é necessário que sejam realizados tratamentos de austenitização, seguido de têmpera, e de revenimento, onde, particularmente para este último, há várias opções de tempos e temperaturas. Como os tratamentos térmicos geram as propriedades mecânicas através de transformações de fase (precipitação) podem ocorrer alterações da resistência à corrosão. São conhecidos os efeitos benéficos da adição de Nb em aços inoxidáveis tradicionais. Por isso, o objetivo desta pesquisa foi estudar aços inoxidáveis SM contendo Nb. Foi pesquisada a influência da temperatura de revenimento sobre a resistência à corrosão de três aços inoxidáveis SM, os quais contêm 13% Cr, 5% Ni, 1% a 2% Mo, com e sem adições de Nb. No presente trabalho, foram denominados de SM2MoNb, SM2Mo e SM1MoNb, que representam aços com 2% Mo, 1% Mo e 0,11% Nb. Dado que os principais tipos de corrosão para aços inoxidáveis são a corrosão por pite (por cloreto) e a corrosão intergranular (sensitização), optou-se por determinar os Potenciais de Pite (Ep) e os Graus de Sensitização (GS) em função da temperatura de revenimento. Os aços passaram por recozimento a 1050°C por 48 horas, para eliminação de fase ferrita delta. Em seguida foram tratados a 1050 °C por 30 minutos, com resfriamento ao ar, para uniformização do tamanho de grão. A estrutura martensítica obtida recebeu tratamentos de revenimento em temperaturas de: 550 °C, 575 °C, 600 °C, 625 °C, 650 °C e 700 °C, por 2 horas. O GS foi medido através da técnica de reativação eletroquímica potenciodinâmica na versão ciclo duplo (DL-EPR), utilizando-se eletrólito de 1M H2SO4 + 0,01M KSCN. Para determinar o Ep foram realizados ensaios de polarização potenciodinâmica em 0,6M NaCl. Os resultados obtidos foram discutidos através das variações microestruturais encontradas. Foram empregadas técnicas de microscopia ótica (MO), microscopia eletrônica de varredura (MEV), simulação termodinâmica de fases através do programa Thermo-Calc e determinação de austenita revertida mediante difração de raios X (DRX) e ferritoscópio. A quantificação da austenita por DRX identificou que a partir de 600 °C há formação desta fase, apresentando máximo em 650 °C, e novamente diminuindo para zero a 700 °C. Por sua vez, o método do ferritoscópio detectou austenita nas condições em que a analise de DRX indicou valor nulo, sendo as mais críticas a do material temperado (sem revenimento) e do aço revenido a 700 °C. Propõe-se que tais diferenças entre os dois métodos se deve à morfologia fina da austenia retida, a qual deve estar localizada entre as agulhas de martensita. Os resultados foram discutidos em termos da precipitação de Cr23C6, Mo6C, NbC, fase Chi, austenita e ferrita, bem como das consequências do empobrecimento em Cr e Mo, gerados por tais microconstituintes. São propostos três mecanismos para explicar a sensitização: o primeiro é devido a precipitação de Cr23C6, o segundo a precipitação de fase Chi (rica em Cr e Mo) e o terceiro é devido a formação de ferrita durante o revenimento. O melhor desempenho quanto ao GS foi obtido para os revenimentos a 575 °C e 600°C, por 2 horas. Os resultados de Ep indicaram que o aço SM2MoNb, revenido a 575°C, tem o melhor desempenho quanto à resistência à corrosão por cloreto. Isso associado ao baixo GS coloca este aço, com este tratamento térmico, numa posição de destaque para aplicações onde a resistência à corrosão é um critério de seleção de material, uma vez que, segundo a literatura a temperatura de 575 °C está no intervalo de temperaturas de revenimento onde são obtidas as melhores propriedades mecânicas.

The Effects of Molecular Chaperones on Tau Fibril Assembly

The accumulation of microtubule-associated protein tau into fibrillar aggregates is the hallmark of Alzheimer’s disease and other neurodegenerative disorders, collectively referred to as tauopathies. Fibrils can propagate from one cell to the next and spread throughout the brain. However, a study shows that only small aggregates can be taken up by cultured neuronal cells. The mechanisms that lead to the breakage of fibrils into smaller fragments remain unknown. In yeast, the AAA+ chaperone HSP104 processes the reactivation of protein aggregates and is responsible for fragmentation of fibrils. This study focused on investigating the effects of molecular chaperones on tau fibrils and using HSP104 as a model system to test whether we can monitor fibril fracturing. The assays used to detect the chaperone’s actions on tau utilized acrylodan fluorescence, thioflavin T fluorescence, and sedimentation. Tau fibrils were either formed with a cofactor, heparin, to accelerate assembly or without a cofactor. In the process of investigating the effects of HSP104 on tau fibrils, this study established an assay to determine the effects of breakage on the seeding properties of tau fibrils. Our findings demonstrated that the sonication of tau fibrils produces smaller fragments (seeds) that accelerate the conversion of monomeric tau into fibrils. The use of this assay with HSP104 provided evidence that HSP104 inhibits the elongation of tau fibrils. Indeed, HSP104 inhibits the aggregation of soluble tau into aggregates. However, tau fibril breakage and dissociation were not observed with HSP104, either alone or in combination with co-chaperones (HSP70 and HSP40). Our findings provide insights into the seeding properties of tau fibrils, and suggest that fragmentation is a critical part of tau assembly. This knowledge should be valuable for understanding tau fibril aggregation and propagation in the brain, which is necessary to identify new treatments for neurodegenerative diseases.

La tardía emergencia mediática de la vacuna contra la viruela, cobertura de noticias en prensa española (1999-2004)

Introducción. Las discusiones sobre la necesidad de conservación del virus de la viruela en 1999 pusieron de actualidad una enfermedad erradicada veinte años atrás. El escenario de alarma internacional creado tras los incidentes del 11-S en EE.UU vino a resituar a la viruela como potencial candidata para ser utilizada como arma bioterrorista. La consecuencia directa fue la reactivación de una vacuna que permanecía en el olvido y cuyos destinatarios iniciales eran los cuerpos de seguridad estadounidenses. España también se interesó por adquirir la vacuna antivariólica. El objetivo de este estudio es valorar la cobertura mediática que la viruela obtuvo en nuestro país. Métodos. Revisión sistemática en la base documental Dow Jones Factiva de las noticias publicadas durante el periodo 1999-2004 en los cuatro diarios de mayor tirada nacional (ABC, El Mundo, El País y La Vanguardia), utilizando como palabra clave “viruela”. Se efectuó un análisis cuantitativo y cualitativo de los datos obtenidos. Resultados. Se analizaron 416 noticias. El Mundo, con un total de 158 (37.98%), fue el diario con más publicaciones. El mayor número de noticias (152, 36,5%) se editaron en 2003, coincidiendo con la adquisición de vacunas por España. El tipo de mensajes emitidos fue variable a lo largo del sexenio, predominando los relacionados con “diplomacia y política”, “riesgo epidemiológico”, “bioterrorismo” y “vacuna”, concentrados en años diferentes. Conclusiones. La alarma creada en torno a la vacunación antivariólica fue un fenómeno mediático que obedeció a cuestiones de estrategia política más que a un problema real de salud pública.

Biologic therapies and non-melanoma skin cancer rates in three chronic immune-mediated diseases

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

Linfoma não Hodgkin da órbita : o sucesso de um caso raro

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

On the periphery of global jihad. The North Caucasus: the illusion of stabilisation. OSW Point of View Number 45, November 2014

The situation in the North Caucasus has stabilised, in comparison with previous years, mainly as regards the activity of the Islamic military underground. This is an effect of ideological changes among the militants which have led to a dilution of the Caucasian armed struggle and its marginalisation in global jihad, since top priority has been granted to the Middle Eastern front. The factors which have contributed to this stabilisation are the organisational crisis in the Caucasus Emirate and the outflux of militants to the Middle East, as well the successful ‘carrot and stick’ policy adopted by Moscow. However, the partial stabilisation in the Caucasus is inherently precarious, being a contingent outcome of the situation rather than the result of systemic change. The region’s pressing problems remain unresolved; and these problems are generating chronic instability and cauing the Caucasus to drift away from Russia in civilisational terms. An economic or political crisis in the Russian Federation may result in the conflicts in the Caucasus unfreezing, including a reactivation of the idea of Chechen independence as well as the idea of the Caucasus Emirate, which is a part of global jihad.

Ramzanistan. Russia's Chechen Problem. OSW POINT OF VIEW Number 54, 2015-08-25

The political activity and growing independence of Chechnya’s leader Ramzan Kadyrov raises questions about his loyalty and the possibility of his openly renouncing his servitude to Moscow. Such a scenario seems unlikely because of the dependence of Kadyrov’s regime on Russia. He is burdened by his republic’s financial dependence, the stain of collaboration and the crimes committed on his own people, and so his regime cannot exist without Moscow’s support. However, Kadyrov’s dependence on Moscow and the apparent stability of the situation in Chechnya do not mean that a lasting peace has been established there. The current plan for governing the republic and the relationship between Moscow and Grozny is a temporary solution, based not on durable solutions, but on the situational convergence of the Kremlin and Kadyrov’s interests. A change of government in the Kremlin, or to an even greater degree a domestic crisis in Russia which weakens its position in the Caucasus, would mean the fall of Kadyrov’s regime, and the reactivation of pro-independence rhetoric in Chechnya.

The Commissioners’ Group on External Action – Key political facilitator. CEPS Special Report No. 125/December 2015

The reactivation of the Commissioners’ Group on External Action (CGEA) is one of the most important institutional initiatives in EU foreign policy-making since the merger of the position of the High Representative for CFSP with that of Vice-President of the Commission and the creation of the European External Action Service. In this report the authors examine the mandate and organisation of the CGEA and note that, in its first year of activity, the Group has injected much-needed political pragmatism into the way the Commission contributes to EU external action, thereby facilitating inter-service cooperation both within the Commission and with the EEAS. They argue that the CGEA has in fact become the logical counterpart to the Foreign Affairs Council, which allows the HRVP to deliver on her duty to assist the Council and the Commission in ensuring a comprehensive approach to EU external action, as indeed consistency in its implementation.

Sandbox experiments on basin inversion: testing the influence of basin orientation and basin fill

Analogue modelling experiments using brittle materials are performed to study the inversion of extensional structures. Asymmetric grabens of two different orientations are first created during a phase of extension and progressively filled. They are subsequently shortened in the same direction. The aim of our experiments is to determine factors affecting the style of deformation during inversion. We specifically investigate variations in thickness and distribution of strong and weak layers constituting the graben fill and in initial basin orientation. The main advantage of our experimental set-up is that we have a complete control on graben location, width, infill and orientation before inversion. The experiments show that shortening results only in limited reactivation of pre-existing normal faults. In general, forward thrusts and backthrusts cut across normal faults into the footwall of the graben. The forward thrusts either propagate parallel to the enveloping surface of faulted blocks or they cut across basin-limiting normal faults at various angles. The graben fill is mechanically extruded by displacement along forward thrusts that accommodate most of the shortening. Both pre-existing faults and weak graben fill act as zones of weakness during inversion and determine the orientation and location of both backthrusts and forward thrusts. The results of our experiments conform well to natural examples of inverted graben structures.

An insight into the breakup of Gondwana: Identifying events through low-temperature thermochronology from the basement rocks of Madagascar

Fission track analysis was applied to the Precambrian suites of Madagascar in order to identify the lower-temperature cooling histories and their relationships to the Phanerozoic events that affected the island. Apatite ages range from 431 to 68 Ma, and zircon ages range from 452 to 238 Ma. Thermochronologically, the island can be divided into a southern, central, and northern region each with a subdivision on an east-west basis. The southern region is sharply separated from the central region by strongly contrasting apparent apatite ages over the northwest-southeast striking Ranotsara Shear Zone (RSZ). The change in apparent ages over the RSZ is indicative of later reactivation along younger brittle faults. The central region has the oldest ages of the island and has a diffuse contact to the third region northward. Along the entire western margin of the Precambrian basement initial Paleozoic exhumation was followed by heating (burial by sediments) during Jurassic and Cretaceous times. A decrease in ages along the eastern margin from 119 to 68 Ma coincides with the predicted positions of the Marion hot spot after effects of erosion are considered. On the other hand, these ages may represent progressive opening of the margin in a southward direction together with associated denudation of the rift shoulder. The eastern part of the central region has remained very stable since at least Devonian times, undergoing only long-term very slow exhumation at rates of 1–5 m/Myr.

(Table T1) Ages of white mica clasts in core samples of ODP Hole 210-1276A

Fifty-seven white mica clasts were separated from five samples taken from near the bases of turbidites ranging in age from early Albian to middle Eocene. Twenty two (39%) of the micas have ages between 260 and 340 Ma and five (9%) have older ages (~400-600 Ma). The former age range is characteristic of the North American Alleghenian orogeny and the Iberian Variscan orogeny. The latter range is characteristic of the North American Acadian orogeny and older basement rocks in the Grand Banks and Newfoundland areas. Both age ranges are present in the middle Eocene sample, but only the younger range occurs in the middle Albian sample. This difference could be a sampling artifact. If this is not the case, then the most likely explanation is that the Acadian-aged micas within the Meguma Zone underlying the Grand Banks were totally reset by Alleghenian reactivation of the zone, a feature which occurs extensively in Nova Scotia. The addition of Acadian-aged micas in the middle Eocene sample may reflect a change in sediment provenance as drainage systems unrelated to rift topography developed. With the exception of one clast dated at 186 Ma, the 12 other micas obtained from the upper Paleocene sample yielded ages between 55 and 74 Ma, with 7 falling within ±2 m.y. of the 57-Ma age of the sample indicated by the biostratigraphic age-depth plot for Site 1276. This, together with the volcaniclastic content of the sample, indicates an input from near-contemporaneous volcanism. The nearest known occurrences of near-contemporaneous late Paleocene volcanism that could have produced white micas are in Greenland and Portugal, some 2000 and 1500 km distant, respectively, from Site 1276 during the Paleocene. However, ages of volcanism in these areas indicate that they could probably not be sources of micas younger than 60 m.y., which suggests some as-yet unknown volcanic source in the North Atlantic area. Accumulation in the Grand Banks area of airborne-transported volcaniclastic material from eruptions of slightly different ages, followed by a single resedimentation event, could account for the spread of dates obtained from the sample. White micas from the lowermost Albian sample show a spread of ages between 37 and 284 Ma that is completely different from the age distribution pattern of the middle Albian and middle Eocene samples. The sample location is between, and at least 25 m above and below, two igneous sills dated at 98 and 105 Ma. The sills have narrow thermal aureoles and ages older than the youngest detrital micas in the sample. It is unlikely, therefore, that the spread of mica ages in the sample is due to partial resetting of ages caused by thermal effects associated with the intrusion of the sills. The resetting may have been associated with a longer lived thermal event.