Performance analysis and tuning in multicore environments

Performance analysis is the task of monitor the behavior of a program execution. The main goal is to find out the possible adjustments that might be done in order improve the performance. To be able to get that improvement it is necessary to find the different causes of overhead. Nowadays we are already in the multicore era, but there is a gap between the level of development of the two main divisions of multicore technology (hardware and software). When we talk about multicore we are also speaking of shared memory systems, on this master thesis we talk about the issues involved on the performance analysis and tuning of applications running specifically in a shared Memory system. We move one step ahead to take the performance analysis to another level by analyzing the applications structure and patterns. We also present some tools specifically addressed to the performance analysis of OpenMP multithread application. At the end we present the results of some experiments performed with a set of OpenMP scientific application.

The management of iron deficiency in inflammatory bowel disease--an online tool developed by the RAND/UCLA appropriateness method.

BACKGROUND: Iron deficiency is a common and undertreated problem in inflammatory bowel disease (IBD). AIM: To develop an online tool to support treatment choice at the patient-specific level. METHODS: Using the RAND/UCLA Appropriateness Method (RUAM), a European expert panel assessed the appropriateness of treatment regimens for a variety of clinical scenarios in patients with non-anaemic iron deficiency (NAID) and iron deficiency anaemia (IDA). Treatment options included adjustment of IBD medication only, oral iron supplementation, high-/low-dose intravenous (IV) regimens, IV iron plus erythropoietin-stimulating agent (ESA), and blood transfusion. The panel process consisted of two individual rating rounds (1148 treatment indications; 9-point scale) and three plenary discussion meetings. RESULTS: The panel reached agreement on 71% of treatment indications. 'No treatment' was never considered appropriate, and repeat treatment after previous failure was generally discouraged. For 98% of scenarios, at least one treatment was appropriate. Adjustment of IBD medication was deemed appropriate in all patients with active disease. Use of oral iron was mainly considered an option in NAID and mildly anaemic patients without disease activity. IV regimens were often judged appropriate, with high-dose IV iron being the preferred option in 77% of IDA scenarios. Blood transfusion and IV+ESA were indicated in exceptional cases only. CONCLUSIONS: The RUAM revealed high agreement amongst experts on the management of iron deficiency in patients with IBD. High-dose IV iron was more often considered appropriate than other options. To facilitate dissemination of the recommendations, panel outcomes were embedded in an online tool, accessible via http://ferroscope.com/.

Paro y libre comercio exterior: una contradicción incómoda para economistas y políticos

Liberalización mundial del comercio exterior, y deslocalización: ¿Este binomio hace que los países industrializados ayuden realmente a los subdesarrollados (más allá de beneficiar a las empresas importadoras -en los segundos- y a las deslocalizadoras –en los primeros)? Y, en caso afirmativo, ¿quines –en los países ‘industrializados’-soportan el coste de esa ayuda? Esto suscita cuestiones incómodas – generalmente no abordadas, precisamente por ello- entre los profesionales de la economía y los políticos. Distinguir entre quienes ganan o no y quienes pierden dentro de un mismo país (asalariados por una parte, empresas import-export por otra) resulta en cualquier caso necesario para esclarecer las probables consecuencias del libre comercio exterior entre países desiguales.

Experimentació amb un receptor software GPS-Galileo d'alta sensibilitat per a entorns interiors

Este proyecto se centra en el análisis de señales GPS, utilizando un receptor software desarrollado con Matlab en un proyecto de investigación para la Agencia Espacial Europea (ESA), llevado a cabo por parte del departamento de Telecomunicaciones e Ingeniería de Sistemas de la ETSE. Este software utiliza técnicas de procesado de señal de alta sensibilidad (HS-GNSS) que permite al usuario determinar su posición en entornos de difícil propagación como puede ser el caso de los escenarios interiores. Los datos experimentales se analizan en función del nivel de multipath que afecta a la señal de cada uno de los satélites, y la degradación que los escenarios interiores provocan en las señales, a causa del mobiliario, paredes, personas, etc. Para analizar los datos experimentales, se ha utilizado una métrica presentada en el congreso internacional EuCAP 2009, con la que es posible caracterizar las señales en función del nivel de multipath.

A high-throughput test to detect C.E.R.A. doping in blood.

C.E.R.A., a continuous erythropoietin receptor activator, is a new third-generation erythropoiesis-stimulating agent (ESA) that has recently been linked with abuse in endurance sports. In order to combat this new form of doping, we examined an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) designed to detect the presence of C.E.R.A. in serum samples. The performance of the assay was evaluated using a pilot excretion study that involved six subjects receiving C.E.R.A. Validation data demonstrated an excellent reproducibility and ensured the applicability of the assay for anti-doping purposes. To maximize the chances of detecting the drug in serum samples, we propose the use of this specific ELISA test as a high-throughput screening method, combined with a classic isoelectric focusing test as a confirmatory assay. This strategy should make C.E.R.A. abuse relatively easy to detect, thereby preventing the future use of this drug as a doping agent.

Less frequent dosing of erythropoiesis stimulating agents in patients undergoing dialysis: a European multicentre cost study.

OBJECTIVE: To calculate the variable costs involved with the process of delivering erythropoiesis stimulating agents (ESA) in European dialysis practices. METHODS: A conceptual model was developed to classify the processes and sub-processes followed in the pharmacy (ordering from supplier, receiving/storing/delivering ESA to the dialysis unit), dialysis unit (dose determination, ordering, receipt, registration, storage, administration, registration) and waste disposal unit. Time and material costs were recorded. Labour costs were derived from actual local wages while material costs came from the facilities' accounting records. Activities associated with ESA administration were listed and each activity evaluated to determine if dosing frequency affected the amount of resources required. RESULTS: A total of 21 centres in 8 European countries supplied data for 142 patients (mean) per hospital (range 42-648). Patients received various ESA regimens (thrice-weekly, twice-weekly, once-weekly, once every 2 weeks and once-monthly). Administering ESA every 2 weeks, the mean costs per patient per year for each process and the estimates of the percentage reduction in costs obtainable, respectively, were: pharmacy labour (10.1 euro, 39%); dialysis unit labour (66.0 euro, 65%); dialysis unit materials (4.11 euro, 61%) and waste unit materials (0.43 euro, 49%). LIMITATION: Impact on financial costs was not measured. CONCLUSION: ESA administration has quantifiable labour and material costs which are affected by dosing frequency.

Human biology: cibernética y biología humana en el nuevo discurso expositivo de la década de 1970

En este trabajo se explica cuáles fueron las estrategias utilizadas y los resultados obtenidos en la primera exposición del nuevo esquema museográfico del Museo de Historia Natural de Londres, concebido por Roger Miles, Jefe del Departamento de Servicios Públicos de esa prestigiada institución. Esta iniciativa pretendía atraer a un mayor número de visitantes a partir de exposiciones basadas en modelos y módulos interactivos que relegaban a los objetos de las colecciones a un segundo plano. La exposición se tituló Human Biology y fue inaugurada el 24 de mayo de 1977. El tema de la exposición fue la biología humana, pero como se argumenta en este trabajo, Human Biology sirvió también como medio para legitimar el discurso modernizador de la biología humana, en tanto disciplina más rigurosa por las herramientas y técnicas más precisas que las utilizadas por la antropología física tradicional. Se buscaba también generar una audiencia para reforzar el campo interdisciplinario de la ciencia cognitiva y en particular la inteligencia artificial. El equipo de asesores científicos de la exposición contó entre sus miembros con personalidades que jugaron un papel protagónico en el desarrollo de esas disciplinas, y necesitaban demostrar su validez y utilidad ante los no especialistas y el público en general.

Edward Cullen: el nuevo concepto de vampiro

El vampiro, como esa parte de sombra del inconsciente, evoluciona de diablo a ángel como se manifiesta en Crepúsculo de Stephenie Meyer. Para analizar este proceso, se traza el paso del vampiro moderno al post-moderno a través de tres figuras básicas: Drácula, Lestat y Edward Cullen, con la ayuda de los conceptos de Jung de sombra y héroe, y la teoría del cerebro triuno de McLean. Sangre, alma y sexo se desarrollan con este nuevo concepto de vampiro que comienza a revelar su reflejo para dejar de ser la sombra que fue exponiendo su evolución hacia la figura del héroe.

Estudi de la configuració magnètica de l'experiment LTP (LISA Technology Package)

La Teoria de la Relativitat General preveu que quan un objecte massiu és sotmès a una certa acceleració en certes condicions ha d’emetre ones gravitacionals. Es tracta d’un tipus d’on altament energètica però que interacciona amb la matèria de manera molt feble i el seu punt d’emissió és força llunyà. Per la qual cosa la seva detecció és una tasca extraordinàriament complicada. Conseqüentment, la detecció d’aquestes ones es creu molt més factible utilitzant instruments situats a l’espai. Amb aquest objectiu, neis la missió LISA (Laser Interferometer Space Antenna). Es tracta aquesta d’una missió conjunta entre la NASA i l’ESA amb llançament previst per 2020-2025. Per reduir els riscs que comporta una primera utilització de tecnologia no testejada, unit a l’alt cost econòmic de la missió LISA. Aquesta missió contindrà instruments molt avançats: el LTP (LISA Technoplogy Package), desenvolupat per la Unió Europea, que provarà la tecnologia de LISA i el Drag Free flying system, que s’encarregarà de provar una sèrie de propulsors (thrusters) utilitzats per al control d’actitud i posició de satèl•lit amb precisió de nanòmetres. Particularment, el LTP, està composat per dues masses de prova separades per 35 centímetres, i d’un interferòmetre làser que mesura la variació de la distància relativa entre elles. D’aquesta manera, el LTP mesurarà les prestacions dels equips i les possibles interferències que afecten a la mesura. Entre les fonts de soroll es troben, entre d’altres, el vent i pressió de radiació solar, les càrregues electrostàtiques, el gradient tèrmic, les fluctuacions de voltatge o les forces internes. Una de les possibles causes de soroll és aquella que serà l’objecte d’estudi en aquest projecte de tesi doctoral: la presència dintre del LTP de camps magnètics, que exerceixen una força sobre les masses de prova, la seva estimació i el seu control, prenent en compte les caracterírstiques magnètiques de l’experiment i la dinàmica del satèl•lit.

Use of darbepoetin alfa in the treatment of anaemia of chronic kidney disease: clinical and pharmacoeconomic considerations.

The introduction of erythropoiesis-stimulating agents (ESAs) into everyday clinical practice has greatly improved the care of patients with chronic kidney disease. ESAs have reduced the need for blood transfusions, improved survival, decreased cardiovascular complications and enhanced patient quality of life. The longer acting ESA, darbepoetin alfa (Aranesp(R)), which can be administered less frequently than traditional ESAs, provides further benefits to both patients and healthcare professionals relative to the epoetins. Clinical studies have shown that darbepoetin alfa administered once every 2 weeks or once every month allows enhanced convenience and cost savings with no compromise in efficacy, while maintaining patients within target haemoglobin ranges.

Detection of EPO doping and blood doping: the haematological module of the Athlete Biological Passport.

The increase of the body's capacity to transport oxygen is a prime target for doping athletes in all endurance sports. For this pupose, blood transfusions or erythropoiesis stimulating agents (ESA), such as erythropoietin, NESP, and CERA are used. As direct detection of such manipulations is difficult, biomarkers that are connected to the haematopoietic system (haemoglobin concentration, reticulocytes) are monitored over time (Athlete Biological Passport (ABP)) and analyzed using mathematical models to identify patterns suspicious of doping. With this information, athletes can either be sanctioned directly based on their profile or targeted with conventional doping tests. Key issues for the appropriate use of the ABP are correct targeting and use of all available information (e.g. whereabouts, cross sectional population data) in a forensic manner. Future developments of the passport include the correction of all concentration-based variables for shifts in plasma volume, which might considerably increase sensitivity. New passport markers from the genomic, proteomic, and metabolomic level might add further information, but need to be validated before integration into the passport procedure. A first assessment of blood data of federations that have implemented the passport show encouraging signs of a decreased blood-doping prevalence in their athletes, which adds scientific credibility to this innovative concept in the fight against ESA- and blood doping. Copyright © 2012 John Wiley & Sons, Ltd.

La nación de "los otros". Afrodescendientes porteños y la construcción de la nación argentina a fines del siglo XIX

Investigación producida a partir de una estancia en Buenos Aires en septiembre del 2007. Los procesos de consolidación de las naciones-estado llevan consigo una serie de políticas y prácticas que se focalizan en la construcción del "pueblo". Particularmente, la construcción del estado nacional argentino en el siglo XIX implicó la definición -por parte de los grupos de poder- de un pueblo que cumpliera con las expectativas que se esperaban de una joven nación que se encaminaba hacia la civilización y el progreso, es decir, lo que en esa época se correspondía con un imaginario de pueblo blanco y europeo. Así, se propiciaron políticas de erosión de quienes habitaban en el territorio nacional pero que no cumplían con aquellos mandatos, promoviendo su “invisibilización”. Nosotros trabajamos una de estas comunidades erosionadas de la memoria y de la historia nacional argentina, la comunidad de afrodescendientes de Buenos Aires. El objeto de la investigación que se está llevando a cabo es justamente el análisis de la población afroargentina de Buenos Aires en las últimas décadas del siglo XIX, un momento en que su presencia e historia estaban siendo negadas de los discursos y de las prácticas. Esta investigación de corte histórico-antropológico necesita para su consecución de un trabajo exhaustivo de archivos, objetivo principal de la beca de investigación fuera de Cataluña. Lo que se intentó en el viaje fue encontrar y rescatar fuentes que permitieran entrever las dinámicas de esta comunidad, sus formas de resistir y/o de negociar un estado nacional cada vez más fuerte y que sentaba las bases de lo que debía ser el “pueblo argentino”.

Criminología positivista y anarqusimo en la España de entresiglos (XIX-XX): un debate sobre la naturaleza, la ciencia y el progreso

El estudio hasta el momento de la relación entre positivismo criminológico e ideario anarquista de entre siglos (XIX-XX), ha evidenciado la trascendencia del estudio de aquellos dos pensamiento en esa etapa histórica. El desarrollo de la Criminología como ciencia, así como del verdadero núcleo teórico y práctico del anarquismo español, se encuentra en aquel momento histórico de cambio de siglo. La construcción del tipo criminal anarquista, la política criminal desarrollada al efecto, así como las críticas, propuesta y posturas acerca de la cuestión criminal por parte de los anarquistas, revelan un auge discursivo y científico de ambas partes que estaban discutiendo sobre temas verdaderamente de fondo: aquellos sobre la naturaleza, el progreso y la forma de sociedad y Estado. Más allá de las disputas con aquellos autores de la Scuola Italiana, los anarquistas españoles, avivaron un interés decisivo en otro tipo de teorías como el darwinismo o el neomalthusianismo. Más allá del vehemente rechazo a la cárcel y al sistema estatal y capitalista en su conjunto, el desarrollo y utilización en propio sentido de la Ciencia, se fundamentó como herramienta política básica para el pensamiento anarquista. Por su parte, esa misma Ciencia positiva, era el comodín “objetivo” que se usaba de herramienta para una criminalización y persecución política de numerosas disidencias. Desentrañar, por un lado, cómo se articuló cada uno de esos discursos y qué implicaciones y relaciones tuvo, y por otro, qué herencia pervive de aquellas construcciones en nuestro sistema penal y político, son los puntos centrales de esta Tesis.