A set of canonical problems in sloshing. Part 0: Experimental setup and data processing

In a series of attempts to research and document relevant sloshing type phenomena, a series of experiments have been conducted. The aim of this paper is to describe the setup and data processing of such experiments. A sloshing tank is subjected to angular motion. As a result pressure registers are obtained at several locations, together with the motion data, torque and a collection of image and video information. The experimental rig and the data acquisition systems are described. Useful information for experimental sloshing research practitioners is provided. This information is related to the liquids used in the experiments, the dying techniques, tank building processes, synchronization of acquisition systems, etc. A new procedure for reconstructing experimental data, that takes into account experimental uncertainties, is presented. This procedure is based on a least squares spline approximation of the data. Based on a deterministic approach to the first sloshing wave impact event in a sloshing experiment, an uncertainty analysis procedure of the associated first pressure peak value is described.

Moliner House, Zaragoza (Spain) 2003 - 2009

To build a house for a poet. To make a house for dreaming, living and dying. A house in which to read, to write and to think. = Levantar una casa para un poeta. Hacer una casa para soñar, vivir, morir. Para leer, escribir, pensar.

Functional response of Ulmus minor Mill. to drought, flooding and dutch elm disease

Ulmus minor es una especie arbórea originaria de Europa cuyas poblaciones han sido diezmadas por el hongo patógeno causante de la enfermedad de la grafiosis. La conservación de los olmos exige plantearse su propagación a través de plantaciones y conocer mejor su ecología y biología. Ulmus minor es un árbol de ribera, pero frecuentemente se encuentra alejado del cauce de arroyos y ríos, donde la capa freática sufre fuertes oscilaciones. Por ello, nuestra hipótesis general es que esta especie es moderadamente resistente tanto a la inundación como a la sequía. El principal objetivo de esta tesis doctoral es entender desde un punto de vista funcional la respuesta de U. minor a la inundación, la sequía y la infección por O. novo-ulmi; los factores que posiblemente más influyen en la distribución actual de U. minor. Con este objetivo se persigue dar continuidad a los esfuerzos de conservación de esta especie que desde hace años se dedican en varios centros de investigación a nivel mundial, ya que, entender mejor los mecanismos que contribuyen a la resistencia de U. minor ante la inoculación con O. novo-ulmi y factores de estrés abiótico ayudará en la selección y propagación de genotipos resistentes a la grafiosis. Se han planteado tres experimentos en este sentido. Primero, se ha comparado la tolerancia de brinzales de U. minor y U. laevis – otro olmo ibérico – a una inmersión controlada con el fin de evaluar su tolerancia a la inundación y comprender los mecanismos de aclimatación. Segundo, se ha comparado la tolerancia de brinzales de U. minor y Quercus ilex – una especie típica de ambientes Mediterránea secos – a la falta de agua en el suelo con el fin de evaluar el grado de tolerancia y los mecanismos de aclimatación a la sequía. El hecho de comparar dos especies contrastadas responde al interés en entender mejor cuales son los procesos que conducen a la muerte de una planta en condiciones de sequía – asunto sobre el que hay una interesante discusión desde hace algunos años. En tercer lugar, con el fin de entender mejor la resistencia de algunos genotipos de U. minor a la grafiosis, se han estudiado las diferencias fisiológicas y químicas constitutivas e inducidas por O. novo-ulmi entre clones de U. minor seleccionados a priori por su variable grado de resistencia a esta enfermedad. En el primer experimento se observó que los brinzales de U. minor sobrevivieron 60 días inmersos en una piscina con agua no estancada hasta una altura de 2-3 cm por encima del cuello de la raíz. A los 60 días, los brinzales de U. laevis se sacaron de la piscina y, a lo largo de las siguientes semanas, fueron capaces de recuperar las funciones fisiológicas que habían sido alteradas anteriormente. La conductividad hidráulica de las raíces y la tasa de asimilación de CO2 neta disminuyeron en ambas especies. Por el contrario, la tasa de respiración de hojas, tallos y raíces aumentó en las primeras semanas de la inundación, posiblemente en relación al aumento de energía necesario para desarrollar mecanismos de aclimatación a la inundación, como la hipertrofia de las lenticelas que se observó en ambas especies. Por ello, el desequilibrio del balance de carbono de la planta podría ser un factor relevante en la mortalidad de las plantas ante inundaciones prolongadas. Las plantas de U. minor (cultivadas en envases de 16 litros a media sombra) sobrevivieron por un prolongado periodo de tiempo en verano sin riego; la mitad de las plantas murieron tras 90 días sin riego. El cierre de los estomas y la pérdida de hojas contribuyeron a ralentizar las pérdidas de agua y tolerar la sequía en U. minor. Las obvias diferencias en tolerancia a la sequía con respecto a Q. ilex se reflejaron en la distinta capacidad para ralentizar la aparición del estrés hídrico tras dejar de regar y para transportar agua en condiciones de elevada tensión en el xilema. Más relevante es que las plantas con evidentes síntomas de decaimiento previo a su muerte exhibieron pérdidas de conductividad hidráulica en las raíces del 80% en ambas especies, mientras que las reservas de carbohidratos apenas variaron y lo hicieron de forma desigual en ambas especies. Árboles de U. minor de 5 y 6 años de edad (plantados en eras con riego mantenido) exhibieron una respuesta a la inoculación con O. novo-ulmi consistente con ensayos previos de resistencia. La conductividad hidráulica del tallo, el potencial hídrico foliar y la tasa de asimilación de CO2 neta disminuyeron significativamente en relación a árboles inoculados con agua, pero solo en los clones susceptibles. Este hecho enlaza con el perfil químico “más defensivo” de los clones resistentes, es decir, con los mayores niveles de suberina, ácidos grasos y compuestos fenólicos en estos clones que en los susceptibles. Ello podría restringir la propagación del hongo en el árbol y preservar el comportamiento fisiológico de los clones resistentes al inocularlos con el patógeno. Los datos indican una respuesta fisiológica común de U. minor a la inundación, la sequía y la infección por O. novo-ulmi: pérdida de conductividad hidráulica, estrés hídrico y pérdida de ganancia neta de carbono. Pese a ello, U. minor desarrolla varios mecanismos que le confieren una capacidad moderada para vivir en suelos temporalmente anegados o secos. Por otro lado, el perfil químico es un factor relevante en la resistencia de ciertos genotipos a la grafiosis. Futuros estudios deberían examinar como este perfil químico y la resistencia a la grafiosis se ven alteradas por el estrés abiótico. ABSTRACT Ulmus minor is a native European elm species whose populations have been decimated by the Dutch elm disease (DED). An active conservation of this species requires large-scale plantations and a better understanding of its biology and ecology. U. minor generally grows close to water channels. However, of the Iberian riparian tree species, U. minor is the one that spread farther away from rivers and streams. For these reasons, we hypothesize that this species is moderately tolerant to both flooding and drought stresses. The main aim of the present PhD thesis is to better understand the functional response of U. minor to the abiotic stresses – flooding and drought – and the biotic stress – DED – that can be most influential on its distribution. The overarching goal is to aid in the conservation of this emblematic species through a better understanding of the mechanisms that contribute to resistance to abiotic and biotic stresses; an information that can help in the selection of resistant genotypes and their expansion in large-scale plantations. To this end, three experiments were set up. First, we compared the tolerance to experimental immersion between seedlings of U. minor and U. laevis – another European riparian elm species – in order to assess their degree of tolerance and understand the mechanisms of acclimation to this stress. Second, we investigated the tolerance to drought of U. minor seedlings in comparison with Quercus ilex (an oak species typical of dry Mediterranean habitats). Besides assessing and understanding U. minor tolerance to drought at the seedling stage, the aim was to shed light into the functional alterations that trigger drought-induced plant mortality – a matter of controversy in the last years. Third, we studied constitutive and induced physiological and biochemical differences among clones of variable DED resistance, before and following inoculation with Ophiostoma novo-ulmi. The goal is to shed light into the factors of DED resistance that is evident in some genotypes of U. minor, but not others. Potted seedlings of U. minor survived for 60 days immersed in a pool with running water to approximately 2-3 cm above the stem collar. By this time, U. minor seedlings died, whereas U. laevis seedlings moved out of the pool were able to recover most physiological functions that had been altered by flooding. For example, root hydraulic conductivity and leaf photosynthetic CO2 uptake decreased in both species; while respiration initially increased with flooding in leaves, stems and roots possibly to respond to energy demands associated to mechanisms of acclimation to soil oxygen deficiency; as example, a remarkable hypertrophy of lenticels was soon observed in flooded seedlings of both species. Therefore, the inability to maintain a positive carbon balance somehow compromises seedling survival under flooding, earlier in U. minor than U. laevis, partly explaining their differential habitats. Potted seedlings of U. minor survived for a remarkable long time without irrigation – half of plants dying only after 90 days of no irrigation in conditions of high vapour pressure deficit typical of summer. Some mechanisms that contributed to tolerate drought were leaf shedding and stomata closure, which reduced water loss and the risk of xylem cavitation. Obviously, U. minor was less tolerant to drought than Q. ilex, differences in drought tolerance resulting mostly from the distinct capacity to postpone water stress and conduct water under high xylem tension among species. More relevant was that plants of both species exhibited similar symptoms of root hydraulic failure (i.e. approximately 80% loss of hydraulic conductivity), but a slight and variable depletion of non-structural carbohydrate reserves preceding dieback. Five- and six-year-old trees of U. minor (planted in the field with supplementary watering) belonging to clones of contrasted susceptibility to DED exhibited a different physiological response to inoculation with O. novo-ulmi. Stem hydraulic conductivity, leaf water potential and photosynthetic CO2 uptake decreased significantly relative to control trees inoculated with water only in DED susceptible clones. This is consistent with the “more defensive” chemical profile observed in resistant clones, i.e. with higher levels of saturated hydrocarbons (suberin and fatty acids) and phenolic compounds than in susceptible clones. These compounds could restrict the spread of O. novo-ulmi and contribute to preserving the near-normal physiological function of resistant trees when exposed to the pathogen. These results evidence common physiological responses of U. minor to flooding, drought and pathogen infection leading to xylem water disruption, leaf water stress and reduced net carbon gain. Still, seedlings of U. minor develop various mechanisms of acclimation to abiotic stresses that can play a role in surviving moderate periods of flood and drought. The chemical profile appears to be an important factor for the resistance of some genotypes of U. minor to DED. How abiotic stresses such as flooding and drought affect the capacity of resistant U. minor clones to face O. novo-ulmi is a key question that must be contemplated in future research.

Corpos mortos e vivos: as cerimônias mortuárias e as representações da morte entre católicos brasileiros

Esta pesquisa procurou descrever, analisar e comparar as cerimônias mortuárias e as representações coletivas de católicos brasileiros da morte e do luto. Tivemos por objetivo estudar os sistemas simbólicos desenvolvidos em várias sociedades, começando com as culturas tribais, passando depois para o cristianismo dos primeiros séculos, antes da instauração do processo de institucionalização que originou o cristianismo católico e durante ele. Analisamos as práticas e representações católicas relacionadas com a morte e o morrer, na Idade Média, Idade Moderna e Contemporânea, tanto na Europa como no Brasil. O objetivo também foi apresentar os ritos mortuários como formas de dar sentido à vida, de reforçar e manter a coesão social, em que indivíduos vivem constantemente os desarranjos gerados pela presença da morte que arrebata um dos seus semelhantes provocando um desequilíbrio social. Ao realizar tal pesquisa sobre os rituais mortuários católicos, a meta consistiu em avançar um pouco mais no conhecimento sobre um fenômeno social religioso nem sempre abordado pelos pesquisadores: a morte do crente, as práticas mortuárias dos grupos católicos, seus hábitos e discurso quanto ao morto, dentro de um cenário brasileiro que se torna cada vez mais urbano e secularizado.(AU)

Corpos mortos e vivos: as cerimônias mortuárias e as representações da morte entre católicos brasileiros

Esta pesquisa procurou descrever, analisar e comparar as cerimônias mortuárias e as representações coletivas de católicos brasileiros da morte e do luto. Tivemos por objetivo estudar os sistemas simbólicos desenvolvidos em várias sociedades, começando com as culturas tribais, passando depois para o cristianismo dos primeiros séculos, antes da instauração do processo de institucionalização que originou o cristianismo católico e durante ele. Analisamos as práticas e representações católicas relacionadas com a morte e o morrer, na Idade Média, Idade Moderna e Contemporânea, tanto na Europa como no Brasil. O objetivo também foi apresentar os ritos mortuários como formas de dar sentido à vida, de reforçar e manter a coesão social, em que indivíduos vivem constantemente os desarranjos gerados pela presença da morte que arrebata um dos seus semelhantes provocando um desequilíbrio social. Ao realizar tal pesquisa sobre os rituais mortuários católicos, a meta consistiu em avançar um pouco mais no conhecimento sobre um fenômeno social religioso nem sempre abordado pelos pesquisadores: a morte do crente, as práticas mortuárias dos grupos católicos, seus hábitos e discurso quanto ao morto, dentro de um cenário brasileiro que se torna cada vez mais urbano e secularizado.(AU)

Corpos Enlutados: Por um cuidado espiritual terapêutico em situações de luto

Esta tese tem como objetivo compreender o fenômeno do luto por morte a partir da fenomenologia, por meio das experiências de membros da Igreja Metodista no Grande ABC. Para alcançar o objetivo geral, tem como objetivos específicos: dialogar com teóricos do luto nas áreas da teologia e da psicologia; conhecer a fenomenologia do corpo existencial de Maurice Merleau-Ponty como parâmetro para a compreensão do estudo do luto por morte; contribuir para as pesquisas de Cuidado Espiritual em situações de luto por morte. A trajetória teórico-metodológica tem como lócus da pesquisa o relato oral de dez pessoas, que trazem sua vivência do luto a partir da pergunta norteadora: como você viveu a sua experiência do luto? Depois de transcritos e literalizados, esses relatos permitiram levantar as unidades de significado e estabelecer as categorias analíticas: dor, tipo de perda, desorganização do ser, corpo existencial, cuidado, fé, luto por morte como ordem natural, processo relacional, racionalização, saudade, luto antecipatório, dimensão material do viver, culpa, memória e serenidade. A partir dessas categorias, fenomenologicamente interpretadas, a construção de uma tabela nomotética tornou possível a identificação das convergências e divergências entre os relatos, bem como das idiossincrasias. No percurso em direção à compreensão da experiência do luto, os relatos foram submetidos à análise ideográfica, que é a tentativa de alcançar a psicologia individual dos sujeitos da pesquisa. A síntese de um pensar, como a expressão da fenomenologia do luto, desvela nuanças da práxis pastoral. Resultantes da construção desse novo saber em torno da vivência do luto por morte, foram significativas algumas percepções: o processo do luto no contexto religioso institucionalizado é similar ao de um contexto não-religioso; a teologia cristã tem espaço para a ressignificação da morte, por meio da criação de uma espiritualidade para o processo do morrer e, para que isso seja possível, destaca-se a necessidade, no interior das comunidades religiosas, de uma teologia da perda, que possibilite uma educação cristã voltada para o enfrentamento do luto, ou seja, de uma teologia de valorização da vida em meio às perdas; o corpo foi a linguagem mais presente na vivência do luto e, no entanto, o corpo enlutado é um paradoxo na igreja cristã, na medida em que esta se tem debruçado sobre o tema da corpo de forma tímida, no que se refere à educação da fé. Ficou patente a percepção da necessidade de fomentar um cuidado espiritual terapêutico abrangente e continuado em situações de luto, de forma a alcançar não apenas o indivíduo em situação de enlutamento, mas também de alcance comunitário, como parte do conjunto de ações públicas que acolham essa questão.(AU)

Corpos Enlutados: Por um cuidado espiritual terapêutico em situações de luto

Esta tese tem como objetivo compreender o fenômeno do luto por morte a partir da fenomenologia, por meio das experiências de membros da Igreja Metodista no Grande ABC. Para alcançar o objetivo geral, tem como objetivos específicos: dialogar com teóricos do luto nas áreas da teologia e da psicologia; conhecer a fenomenologia do corpo existencial de Maurice Merleau-Ponty como parâmetro para a compreensão do estudo do luto por morte; contribuir para as pesquisas de Cuidado Espiritual em situações de luto por morte. A trajetória teórico-metodológica tem como lócus da pesquisa o relato oral de dez pessoas, que trazem sua vivência do luto a partir da pergunta norteadora: como você viveu a sua experiência do luto? Depois de transcritos e literalizados, esses relatos permitiram levantar as unidades de significado e estabelecer as categorias analíticas: dor, tipo de perda, desorganização do ser, corpo existencial, cuidado, fé, luto por morte como ordem natural, processo relacional, racionalização, saudade, luto antecipatório, dimensão material do viver, culpa, memória e serenidade. A partir dessas categorias, fenomenologicamente interpretadas, a construção de uma tabela nomotética tornou possível a identificação das convergências e divergências entre os relatos, bem como das idiossincrasias. No percurso em direção à compreensão da experiência do luto, os relatos foram submetidos à análise ideográfica, que é a tentativa de alcançar a psicologia individual dos sujeitos da pesquisa. A síntese de um pensar, como a expressão da fenomenologia do luto, desvela nuanças da práxis pastoral. Resultantes da construção desse novo saber em torno da vivência do luto por morte, foram significativas algumas percepções: o processo do luto no contexto religioso institucionalizado é similar ao de um contexto não-religioso; a teologia cristã tem espaço para a ressignificação da morte, por meio da criação de uma espiritualidade para o processo do morrer e, para que isso seja possível, destaca-se a necessidade, no interior das comunidades religiosas, de uma teologia da perda, que possibilite uma educação cristã voltada para o enfrentamento do luto, ou seja, de uma teologia de valorização da vida em meio às perdas; o corpo foi a linguagem mais presente na vivência do luto e, no entanto, o corpo enlutado é um paradoxo na igreja cristã, na medida em que esta se tem debruçado sobre o tema da corpo de forma tímida, no que se refere à educação da fé. Ficou patente a percepção da necessidade de fomentar um cuidado espiritual terapêutico abrangente e continuado em situações de luto, de forma a alcançar não apenas o indivíduo em situação de enlutamento, mas também de alcance comunitário, como parte do conjunto de ações públicas que acolham essa questão.(AU)

Prothrombin deficiency results in embryonic and neonatal lethality in mice

The conversion of prothrombin (FII) to the serine protease, thrombin (FIIa), is a key step in the coagulation cascade because FIIa triggers platelet activation, converts fibrinogen to fibrin, and activates regulatory pathways that both promote and ultimately suppress coagulation. However, several observations suggest that FII may serve a broader physiological role than simply stemming blood loss, including the identification of multiple G protein-coupled, thrombin-activated receptors, and the well-documented mitogenic activity of FIIa in in vitro test systems. To explore in greater detail the physiological roles of FII in vivo, FII-deficient (FII−/−) mice were generated. Inactivation of the FII gene leads to partial embryonic lethality with more than one-half of the FII−/− embryos dying between embryonic days 9.5 and 11.5. Bleeding into the yolk sac cavity and varying degrees of tissue necrosis were observed in many FII−/− embryos within this gestational time frame. However, at least one-quarter of the FII−/− mice survived to term, but ultimately they, too, developed fatal hemorrhagic events and died within a few days of birth. This study directly demonstrates that FII is important in maintaining vascular integrity during development as well as postnatal life.

Cooperative functions of the reaper and head involution defective genes in the programmed cell death of Drosophila central nervous system midline cells

In Drosophila, the chromosomal region 75C1–2 contains at least three genes, reaper (rpr), head involution defective (hid), and grim, that have important functions in the activation of programmed cell death. To better understand how cells are killed by these genes, we have utilized a well defined set of embryonic central nervous system midline cells that normally exhibit a specific pattern of glial cell death. In this study we show that both rpr and hid are expressed in dying midline cells and that the normal pattern of midline cell death requires the function of multiple genes in the 75C1–2 interval. We also utilized the P[UAS]/P[Gal4] system to target expression of rpr and hid to midline cells. Targeted expression of rpr or hid alone was not sufficient to induce ectopic midline cell death. However, expression of both rpr and hid together rapidly induced ectopic midline cell death that resulted in axon scaffold defects characteristic of mutants with abnormal midline cell development. Midline-targeted expression of the baculovirus p35 protein, a caspase inhibitor, blocked both normal and ectopic rpr- and hid-induced cell death. Taken together, our results suggest that rpr and hid are expressed together and cooperate to induce programmed cell death during development of the central nervous system midline.

Ablation of P/Q-type Ca2+ channel currents, altered synaptic transmission, and progressive ataxia in mice lacking the α1A-subunit

The Ca2+ channel α1A-subunit is a voltage-gated, pore-forming membrane protein positioned at the intersection of two important lines of research: one exploring the diversity of Ca2+ channels and their physiological roles, and the other pursuing mechanisms of ataxia, dystonia, epilepsy, and migraine. α1A-Subunits are thought to support both P- and Q-type Ca2+ channel currents, but the most direct test, a null mutant, has not been described, nor is it known which changes in neurotransmission might arise from elimination of the predominant Ca2+ delivery system at excitatory nerve terminals. We generated α1A-deficient mice (α1A−/−) and found that they developed a rapidly progressive neurological deficit with specific characteristics of ataxia and dystonia before dying ≈3–4 weeks after birth. P-type currents in Purkinje neurons and P- and Q-type currents in cerebellar granule cells were eliminated completely whereas other Ca2+ channel types, including those involved in triggering transmitter release, also underwent concomitant changes in density. Synaptic transmission in α1A−/− hippocampal slices persisted despite the lack of P/Q-type channels but showed enhanced reliance on N-type and R-type Ca2+ entry. The α1A−/− mice provide a starting point for unraveling neuropathological mechanisms of human diseases generated by mutations in α1A.

RAD50 function is essential for telomere maintenance in Arabidopsis

We have identified and characterized an Arabidopsis thaliana rad50 mutant plant containing a T-DNA insertion in the AtRAD50 gene and showing both meiotic and DNA repair defects. We report here that rad50/rad50 mutant cells show a progressive shortening of telomeric DNA relative to heterozygous rad50/RAD50 controls and that the mutant cell population rapidly enters a crisis, with the majority of the cells dying. Surviving rad50 mutant cells have longer telomeres than wild-type cells, indicating the existence in plants of an alternative RAD50-independent mechanism for telomere maintenance. These results report the role of a protein essential for double-strand break repair in telomere maintenance in higher eukaryotes.

Distinct Modes of Macrophage Recognition for Apoptotic and Necrotic Cells Are Not Specified Exclusively by Phosphatidylserine Exposure

The distinction between physiological (apoptotic) and pathological (necrotic) cell deaths reflects mechanistic differences in cellular disintegration and is of functional significance with respect to the outcomes that are triggered by the cell corpses. Mechanistically, apoptotic cells die via an active and ordered pathway; necrotic deaths, conversely, are chaotic and passive. Macrophages and other phagocytic cells recognize and engulf these dead cells. This clearance is believed to reveal an innate immunity, associated with inflammation in cases of pathological but not physiological cell deaths. Using objective and quantitative measures to assess these processes, we find that macrophages bind and engulf native apoptotic and necrotic cells to similar extents and with similar kinetics. However, recognition of these two classes of dying cells occurs via distinct and noncompeting mechanisms. Phosphatidylserine, which is externalized on both apoptotic and necrotic cells, is not a specific ligand for the recognition of either one. The distinct modes of recognition for these different corpses are linked to opposing responses from engulfing macrophages. Necrotic cells, when recognized, enhance proinflammatory responses of activated macrophages, although they are not sufficient to trigger macrophage activation. In marked contrast, apoptotic cells profoundly inhibit phlogistic macrophage responses; this represents a cell-associated, dominant-acting anti-inflammatory signaling activity acquired posttranslationally during the process of physiological cell death.

The metallochaperone Atox1 plays a critical role in perinatal copper homeostasis

Copper plays a fundamental role in the biochemistry of all aerobic organisms. The delivery of this metal to specific intracellular targets is mediated by metallochaperones. To elucidate the role of the metallochaperone Atox1, we analyzed mice with a disruption of the Atox1 locus. Atox1−/− mice failed to thrive immediately after birth, with 45% of pups dying before weaning. Surviving animals exhibited growth failure, skin laxity, hypopigmentation, and seizures because of perinatal copper deficiency. Maternal Atox1 deficiency markedly increased the severity of Atox1−/− phenotype, resulting in increased perinatal mortality as well as severe growth retardation and congenital malformations among surviving Atox1−/− progeny. Furthermore, Atox1-deficient cells accumulated high levels of intracellular copper, and metabolic studies indicated that this defect was because of impaired cellular copper efflux. Taken together, these data reveal a direct role for Atox1 in trafficking of intracellular copper to the secretory pathway of mammalian cells and demonstrate that this metallochaperone plays a critical role in perinatal copper homeostasis.

Role for the class A macrophage scavenger receptor in the phagocytosis of apoptotic thymocytes in vitro.

Numerous immature thymocytes undergo apoptosis and are rapidly engulfed by phagocytic thymic macrophages. The macrophage surface receptors involved in apoptotic thymocyte recognition are unknown. We have examined the role of the class A macrophage scavenger receptor (SR-A) in the engulfment of apoptotic thymocytes. Uptake of steroid-treated apoptotic thymocytes by thymic and inflammatory-elicited SR-A positive macrophages is partially inhibited by an anti-SR-A mAb and more completely by a range of scavenger receptor ligands. Thymic macrophages from mice with targeted disruption of the SR-A gene show a 50% reduction in phagocytosis of apoptotic thymocytes in vitro. These data suggest that SR-A may play a role in the clearance of dying cells in the thymus.