Facilitating a culture of responsible and effective sharing of cancer genome data

Rapid and affordable tumor molecular profiling has led to an explosion of clinical and genomic data poised to enhance the diagnosis, prognostication and treatment of cancer. A critical point has now been reached at which the analysis and storage of annotated clinical and genomic information in unconnected silos will stall the advancement of precision cancer care. Information systems must be harmonized to overcome the multiple technical and logistical barriers to data sharing. Against this backdrop, the Global Alliance for Genomic Health (GA4GH) was established in 2013 to create a common framework that enables responsible, voluntary and secure sharing of clinical and genomic data. This Perspective from the GA4GH Clinical Working Group Cancer Task Team highlights the data-aggregation challenges faced by the field, suggests potential collaborative solutions and describes how GA4GH can catalyze a harmonized data-sharing culture.

Modelling mortality: Are we heading in the right direction?

Predicting life expectancy has become of upmost importance in society. Pension providers, insurance companies, government bodies and individuals in the developed world have a vested interest in understanding how long people will live for. This desire to better understand life expectancy has resulted in an explosion of stochastic mortality models many of which identify linear trends in mortality rates by time. In making use of such models for forecasting purposes we rely on the assumption that the direction of the linear trend (determined from the data used for fitting purposes) will not change in the future, recent literature has started to question this assumption. In this paper we carry out a comprehensive investigation of these types of models using male and female data from 30 countries and using the theory of structural breaks to identify changes in the extracted trends by time. We find that structural breaks are present in a substantial number of cases, that they are more prevalent in male data than in female data, that the introduction of additional period factors into the model reduces their presence, and that allowing for changes in the trend improves the fit and forecast substantially.

Gestão de resíduos para uma construção sustentável

Os resíduos sólidos (RS) têm vindo a aumentar em quantidade e diversidade nas últimas décadas em todo o mundo, em resultado da explosão demográfica, do crescimento económico e do aumento da construção, acentuando-se também a produção de resíduos perigosos. Por estas mesmas razões têm surgido limitações do espaço disponível para deposição final de RS. A prática atual no sector da construção pode ser alterada através da introdução de uma gestão eficiente, optimizadora de custos, com a produção de menos resíduos produzidos e também através da implementação de medidas preventivas de produção de resíduos nas obras. Pretende-se, no âmbito deste trabalho, abordar a problemática da gestão de resíduos de construção em obra e contribuir para alterar a situação descrita, apresentando e validando ferramentas a utilizar na gestão de RS. O principal objetivo do trabalho é avaliar os impactes ambientais associados à gestão dos resíduos produzidos na obra na fase de construção. Nas obras em estudo foi recolhida informação sobre os resíduos (quantidades e tipologia) e analisada, tratada com a finalidade de criar uma ferramenta indispensável na gestão de resíduos de construção e compilado o inventário dos resíduos. Após esta compilação, procedeu-se à avaliação dos impactes. A aplicação da ferramenta de avaliação de ciclo de vida permitem avaliar o impacte das decisões na sustentabilidade da construção, nomeadamente no que diz respeito à geração de resíduos.

Decentralizing IP mobility management in future networks

The massive adoption of sophisticated mobile devices and applications led to the increase of mobile data in the last decade, which it is expected to continue. This increase of mobile data negatively impacts the network planning and dimension, since core networks are heavy centralized. Mobile operators are investigating atten network architectures that distribute the responsibility of providing connectivity and mobility, in order to improve the network scalability and performance. Moreover, service providers are moving the content servers closer to the user, in order to ensure high availability and performance of content delivery. Besides the e orts to overcome the explosion of mobile data, current mobility management models are heavy centralized to ensure reachability and session continuity to the users connected to the network. Nowadays, deployed architectures have a small number of centralized mobility anchors managing the mobile data and the mobility context of millions of users, which introduces issues related to performance and scalability that require costly network mechanisms. The mobility management needs to be rethought out-of-the box to cope with atten network architectures and distributed content servers closer to the user, which is the purpose of the work developed in this Thesis. The Thesis starts with a characterization of mobility management into well-de ned functional blocks, their interaction and potential grouping. The decentralized mobility management is studied through analytical models and simulations, in which di erent mobility approaches distinctly distribute the mobility management functionalities through the network. The outcome of this study showed that decentralized mobility management brings advantages. Hence, it was proposed a novel distributed and dynamic mobility management approach, which is exhaustively evaluated through analytical models, simulations and testbed experiments. The proposed approach is also integrated with seamless horizontal handover mechanisms, as well as evaluated in vehicular environments. The mobility mechanisms are also speci ed for multihomed scenarios, in order to provide data o oading with IP mobility from cellular to other access networks. In the pursuing of the optimized mobile routing path, a novel network-based strategy for localized mobility is addressed, in which a replication binding system is deployed in the mobility anchors distributed through the access routers and gateways. Finally, we go further in the mobility anchoring subject, presenting a context-aware adaptive IP mobility anchoring model that dynamically assigns the mobility anchors that provide the optimized routing path to a session, based on the user and network context. The integration of dynamic and distributed concepts in the mobility management, such as context-aware adaptive mobility anchoring and dynamic mobility support, allow the optimization of network resources and the improvement of user experience. The overall outcome demonstrates that decentralized mobility management is a promising direction, hence, its ideas should be taken into account by mobile operators in the deployment of future networks.

Natural deduction system in paraconsistent setting: proof search for PCont

This paper continues a systematic approach to build natural deduction calculi and corresponding proof procedures for non-classical logics. Our attention is now paid to the framework of paraconsistent logics. These logics are used, in particular, for reasoning about systems where paradoxes do not lead to the `deductive explosion', i.e., where formulae of the type `A follows from false', for any A, are not valid. We formulate the natural deduction system for the logic PCont, explain its main concepts, define a proof searching technique and illustrate it by examples. The presentation is accompanied by demonstrating the correctness of these developments.

Promoção do empreendedorismo nas escolas: impacto da Junior Achievement Portugal, Associação Aprender a Empreender

Dissertação apresentada à Escola Superior de Comunicação Social como parte dos requisitos para obtenção de grau de mestre em Publicidade e Marketing.

Characterization of volatile organic gunshot residues in fired handgun cartridges by headspace sorptive extraction

In forensic investigation of firearm-related cases, determination of the residual amount of volatile compounds remaining inside a cartridge could be useful in estimating the time since its discharge. Published approaches are based on following the decrease of selected target compounds as a function of time by using solid phase micro-extraction (SPME). Naphthalene, as well as an unidentified decomposition product of nitrocellulose (referred to as "TEA2"), are usually employed for this purpose. However, reliability can be brought into question given their high volatility and the low reproducibility of their extracted quantities. In order to identify alternatives and therefore develop improved dating methods, an extensive study on the composition and variability of volatile residues in nine different types of cartridges was carried out. Analysis was performed using headspace sorptive extraction (HSSE), which is a more exhaustive technique compared to SPME. 166 compounds were identified (several of which for the first time), and it was observed that the final compositional characteristics of each residue were strongly dependent on its source. Variability of single identified compounds within and between different types of cartridge, as well as their evolution over time, was also studied. Many explosion products containing up to 4 aromatic rings were found to be globally present in high proportions amongst residues. 27 of them (excluding naphthalene) also presented detectable decreases during the first 24 h. Therefore, they could be used as complementary target analytes in future dating methods.

The backwoods of our backyards : Ontario pioneers and the crisis of ecology /

Early in his landmark ecocritical book The Comedy of Survival, Joseph Meeker develops an intriguing hypothesis about human behaviour. He remarks the species Homo sapiens tend to behave like an invasive or pioneering organism, entering a bio-geographical region and aggressively outcompeting all other species for space and resources. Moreover, he suggests, human cultural traditions, at least in the West, have reinforced such behaviour, continually insisting that the impulses he describes are both necessary and right. While Meeker's work goes on to assess a number of literary works in both the tragic and comic modes, his work never fully explores this hypothesis in the context of human pioneers; that is, there is no ~xploration o( how these themes manifest themselves within our culture and what role they might play in the culture of specific pioneering groups. This project is an attempt at just such an analysis, examining the validity of Meeker's hypothesis through a case study of settler literature in Upper Canada/Ontario between the . years 1800-1867. It explores Meeker's work within three main areas: first, Chapter Two situates his book historically within the field of ecocriticism, showing what came before and the explosion of ecocritical inquiry that followed its release. This chapter also delves into the rift between the natural sciences and humanities, arguing that a move towards deeper interdisciplinarity is r:tecessary for the future. Chapter Three examines the biological and ecological ground on which Meeker rests his hypothesis through exploring evolutionary biology as well as invasive and pioneer species behaviour. Lastly, Chapter Four examines how these ecological principles are manifested in the writings of early Canadian settlers, suggesting that Meeker's hypothesis indeed finds itself on stable footing.

Manpower development and nation-building : Singapore's experience

Manpower is a basic resource. It is the indispensable means of converting other resources to mankind '.s use and benefit. As a process· of increasing the knowledge, skills, and dexterity of the people of a society, manpower development is the most fundamental means of enabling a nation to acquire the capacities to bring about its desired future state of affairs -- a more mighty and wealthier nation. Singapore's brief nation-building history justifies the emphasis accorded to the importance of good quality human resources and manpower development in economic and socio-political developments. As a tiny island-state with a poor natural resource base, Singapore's long-term survival and development depend ultimately upon the quality and the creative energy of her people. In line with the nation-building goals and strategies of the Republic, as conditioned by her objective setting, Singapore's basic manpower development premise has been one of "quality and not quantity". While implementing the "stop-at-two" family planning and population control programs and the relevant immigration measures to guard against the prospect of a "population explosion", the Government has energetically fostered various educational programs, including vocational training schemes, adult education programs, the youth movement, and the national service scheme to improve the quality of Singaporeans. There is no denying that some of the manpower development measures taken by the Government have imposed sacrifice and hardship on the Singapore citizens. Nevertheless, they are the basic conditions for the island-Republic's long-term survival and development. It is essential iii to note that Singapore's continuing existence and phenomenal-success are largely attributable to the will, capacities and efforts of her leaders and people. In the final analysis, the wealth and the strength of a nation are based upon its ability to conserve, develop and utilize effectively the innate capacities of its people. This is true not only of Singapore but necessarily of other developing nations. It can be safely presumed that since most developing states' concerns about the quality of their human resources and the progress of their nation-building work are inextricably bound to those about the quantity of their population, the "quality and not quantity" motto of Singapore's manpower development programs can also be their guiding principle.

The Washingtonian, 17 May 1813 (vol. 3, no. 148) - Newspaper

Volumes of interest were published between 1812 and 1815 with articles about the War of 1812. Issue for July 12, 1813 includes an account of the capture of the Chesapeake, report of explosion of the schooner Eagle off New London, report Com. Hardy had detained a smack, was determined to destroy all smacks and other small craft he found, reports of recent events at Malden, Fort George, head of the Lake, Sacketts Harbour, two reports of attack on Hampton, report of British attack near point of Nansemond River/Craney Island, second report of battle on/near Craney Island, additional report of attack at Hampton, marine news from Baltimore, report that sickness rampant throughout Army, many deaths reported, report that British were fortifying Brownstown, but deserters from British believe Michigan could be retaken by 3000 troops, report Gen. Boyd remained at Fort George to supervise repair of fortifications, report British reinforced from Kingston in Niagara and in Malden, report Gen. Hampton arrived at Albany on way to Burlington, report Gen. Parker left Albany, headed to Burlington, report of 400 men marching from Greenbush to the frontier, report of battles at Stoney Creek, 40 Mile Creek, report that Gen. Boyd lost an action with British in which 8 to 10 hundred men killed and taken from Americans, reports British had captured stores at Black Rock, Sodus, and Oswego, report of British victory in a battle 5 miles from Queenston, troop strength under Dearborn in Niagara reported between 2 and 3 thousand, additional reports of Battle of Beaverdams, reports Dearborn had resumed command, after lengthy illness, Gen. Boyd remained at Fort George, reports natives had been sieging Fort Wayne.

La gestion du savoir à l’ère du numérique : Les politiques de choix, de développement et de gestion de collections

Présenté au 36e congrès de la Corporation des bibliothécaires professionnels du Québec (CBPQ).

Économie du document scientifique - Pour des archithécaires

Entre l'adaptation rapide des éditeurs au numérique, la popularité du libre accès et les hésitations des chercheurs, l'explosion du Web 2.0, l'économie du don et l'insolente vitalité des moteurs, une économie de l'édition numérique scientifique se reconfigure. Les institutions documentaires doivent, de leur côté, renouveler leur positionnement et repenser leurs savoir-faire.

The patentability of human genetic material in China : a comparative analysis

"Mémoire Présenté à la Faculté des Études Supérieures en vue de l'obtention du Grade de Maîtrise En Droit Option Recherche"

La vulnérabilité face aux risques environnementaux à Kigali (Rwanda) : enjeux et facteurs

L’objectif de ce mémoire est de faire un état des lieux des connaissances produites sur les risques environnementaux et la vulnérabilité et appliquer ces connaissances à la ville de Kigali (Rwanda). Après avoir présenté différentes approches, nous avons retenu le cadre d’analyse qui s’inscrit dans l’approche de J.C. Thouret et R.D’Ercole (1996). Cette approche est articulée autour de trois dimensions : enjeux, facteurs de la vulnérabilité et réponses sociales. A travers l’application des éléments pertinents de ces trois dimensions dans le cas de la ville de Kigali, réalisée grâce à une analyse qualitative, centrée sur l’analyse des documents et des entrevues semi-dirigées, voici les principaux résultats que nous avons obtenus: l’analyse des enjeux a révélé que la ville de Kigali est confrontée à plusieurs dommages, parmi lesquels, on peut mentionner les pertes des vies humaines, la démolition des maisons, la contamination des rivières, la prolifération des maladies et la perturbation des besoins de base ( eau potable, électricité, transport) dues aux risques. Cette situation s’explique par la combinaison de plusieurs facteurs dont le relief collinaire, le sol granitique, les pluies violentes, le caractère centrifuge du réseau hydrographique, le sous-dimensionnement des ouvrages d’évacuation et le réseau d’assainissement insuffisant. D’autres facteurs amplifient la vulnérabilité dont l’explosion démographique consécutive à une urbanisation spontanée et inconsciente en zones inondables, l’ensablement des lits des rivières, le vide juridique, les politiques fragmentaires et le dysfonctionnement des acteurs impliqués dans la gestion des risques. Cette situation aurait probablement été améliorée si les réponses sociales étaient efficaces. Or, d’un côté, la faible perception de risque chez les résidants affectés par les risques accélère davantage la vulnérabilité et de l’autre côté, l’intervention significative des CIB n’est pas accompagnée d’actions complémentaires des institutions publiques et des agences internationales.

Le développement économique régional, la politique et les disparités régionales des grands territoires : le cas du Canada et de la Chine

Résumé Depuis le début des années 1990, la recherche sur le développement régional a pris une importance considérable dans les disciplines de l’économie et de la géographie dans la plupart des pays. De nombreuses études ont été consacrées à ce sujet et l’on constate une approche analytique de plus en plus sophistiquée. Que les économies pauvres ont tendance à converger vers les pays riches, ou bien à diverger au fil du temps est une question qui a attiré l'attention des décideurs et des universitaires depuis quelques décennies. Convergence ou de divergence économique est un sujet d'intérêt et de débat, non seulement pour valider ou non les deux modèles principaux de croissance qui sont considérés comme concurrent (l’approche néo-classique et celle des approches de croissance endogène), mais aussi pour ses implications pour les publiques politiques. En se basant sur une analyse des politiques de développement régional et des analyses statistiques de la convergence et des disparités régionales, les objectifs de cette thèse sont de tenter de fournir une explication des différents processus et des modèles de développement économique régional poursuivis dans le cas de territoires immenses en utilisant le Canada et la Chine comme études de cas, d'entreprendre une analyse des différents facteurs et des forces motrices qui sous-tendent le développement régional dans ces deux pays, et d'explorer à la fois les réussites et les échecs apparents dans les politiques de développement régional en comparant et contrastant les expériences de développement régional et les modèles de ces deux pays. A fin d'atteindre cet objectif, la recherche utilise une approche multi-scalaire et des méthodes de mesure multidimensionnelle dans le cadre des analyses sur les disparités « régionales » entre les macro régions (sous-ensembles de provinces) des deux pays, des provinces et des régions urbaines sélectionnées, dans le but ultime d’identifier des problèmes existants en termes de développement régional et de pouvoir proposer des solutions. Les étapes principales de la recherche sont : 1. La cueillette des données statistiques pour le Canada et la Chine (incluant les provinces de Québec et de Xinjiang) pour une gamme d’indicateurs (voir ci-dessous). 2. D’entreprendre une analyse de chaque dimension dans les deux juridictions: Population (p.ex. composition, structure, changement); Ressources (p. ex. utilisation, exploitation de l’énergie); Environnement (p.ex. la pollution); et le Développement socioéconomique (p.ex. le développement et la transformation des secteurs clé, et les modèles de développement rural et urbain), et les disparités changeantes par rapport à ces dimensions. 3. La définition d’une typologie de différents types de région en fonction de leurs trajectoires de développement, ce qui servira pour critiquer l’hypothèse centre-périphérie. 4. Le choix d’une région métropolitaine dans chaque juridiction (province). 5. D’entreprendre une analyse temporelle des événements clé (politiques, investissements) dans chaque région et les facteurs impliqués dans chaque événement, en utilisant l’information documentaire générale et des agences institutionnelles impliqués actuellement et dans un passée récent. Cette étude a tenté d'expliquer les schémas et les processus des deux économies, ainsi que la présentation d'études de cas qui illustrent et examinent les différences dans les deux économies à partir de l’échelle nationale jusqu’au niveau régional et provincial et aussi pour certaines zones urbaines. Cette étude a essayé de répondre aux questions de recherche comme: Est-il vrai que les pays avec des plus grandes territoires sont associés avec des plus grandes disparités interrégionales? Quel est le résultat des comparaisons entre pays développés et pays en développement? Quels sont les facteurs les plus importants dans le développement économique de vastes territoires dans les pays développés et pays en développement? Quel est le mécanisme de convergence et de divergence dans les pays développés et, respectivement, les pays en développement? Dans l'introduction à la thèse, le cadre général de l'étude est présenté, suivie dans le chapitre 1 d'une discussion sur les théories et les concepts utilisés dans la littérature théorique principale qui est pertinent à l'étude. Le chapitre 2 décrit la méthodologie de recherche. Le chapitre 3 présente une vue d'ensemble des politiques de développement économique régional et les programmes du Canada et de la Chine dans des périodes différentes à différentes échelles. Au chapitre 4, la convergence des deux pays à l'échelle nationale et la convergence provinciale pour chaque pays sont examinés en utilisant différentes méthodes de mesure telles que les méthodes traditionnelles, la convergence bêta et la convergence sigma. Dans le chapitre le plus complexe, le chapitre 5, les analyses comparatives sont présentées à l'aide de données statistiques, à partir des analyses des cas régionaux et provinciaux retenus des deux pays. Au chapitre 6, ces dispositions sont complétées par une analyse des régions urbaines choisies, qui permet également des aperçus sur les régions les plus périphériques. Dans la recherche proposée pour cette thèse, la politique, la population, le revenu, l'emploi, la composition industrielle, l'investissement, le commerce et le facteur de la migration sont également pris en compte comme facteurs importants de l'analyse régionale compte tenu de la superficie du territoire des deux pays et les différences de population entre eux. Cette thèse a évalué dans quelle mesure les politiques gouvernementales ont réussi à induire la convergence régionale ou ont encore ont creusé davantage les disparités régionales, ce qui implique nécessairement une évaluation de la durabilité des patrons et des programmes de développement régional. Cette étude a également mis l'accent sur les disparités régionales et la politique de développement régional, les comparaisons entre pays, pour mesurer la convergence entre les pays et entre les régions, y compris l'analyse spatiale, d'identifier les facteurs les plus actifs tels que la population, les ressources, la politique, l'urbanisation, les migrations, l'ouverture économique et leurs différents rôles dans le développement économique de ces grands territoires (au Canada et Chine). Les résultats empiriques et les processus de convergence et de divergence offrent un cadre intéressant pour l'examen de la trajectoire de développement régionales et les disparités régionales dans les deux économies. L'approche adoptée a révélé les différentes mosaïques complexes du développement régional dans les deux pays. Les résultats de cette étude ont démontré que la disparité en termes de revenu régional est une réalité dans chaque zone géographique, et que les causes sont nombreuses et complexes. Les deux économies ont certains parallèles dans la mise en œuvre des politiques de développement économique régional, mais il existe des différences importantes aussi et elles se sont développées à différentes vitesses. Les deux économies se sont développées depuis la Seconde Guerre mondiale, mais la Chine a connu une croissance rapide que le Canada comme témoignent de nombreux indicateurs depuis 1980. Cependant, la Chine est maintenant confrontée à un certain nombre de problèmes économiques et sociaux, y compris les disparités régionales marquées, un fossé toujours croissant entre les revenus ruraux et urbains, une population vieillissante, le chômage, la pauvreté et la dégradation rapide de l'environnement avec toujours plus de demandes en énergie. Le développement économique régional en Chine est plus déséquilibré. Le Canada accuse un degré de disparités régionales et provinciales moins important que la Chine. Dans les cas provinciaux, il existe d'importantes différences et de disparités dans la structure économique et spatiale du Québec et du Xinjiang. Les disparités infra provinciales sont plus grandes que celles à l’échelle des provinces et des grandes régions (des sous-ensembles de provinces). Les mécanismes de convergence et de divergence dans les deux pays sont différents. Les résultats empiriques et les processus de convergence et de divergence offrent un cadre intéressant pour l'examen de la trajectoire de développement régionale et les disparités régionales dans les deux économies. Cette étude démontre également que l'urbanisation (les métropoles et les villes) s’avère être le facteur le plus actif et contribue à l'économie régionale dans ces grands territoires. L'ouverture a joué un rôle important dans les économies des deux pays. La migration est un facteur majeur dans la stimulation de l'économie des deux pays mais de façons différentes. Les résultats empiriques démontrent que les disparités régionales ne peuvent pas être évitées et elles existent presque partout. Il n'y a pas une formule universelle et de politiques spécifiques sont de mise pour chaque région. Mais il semble possible pour les décideurs politiques nationaux et régionaux d’essayer de maintenir l'écart à une échelle raisonnable pour éviter l'instabilité sociale.