443 resultados para Bêta-hairpin
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Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Trinucleotide repeat (TNR) expansion is the cause of more than 40 types of human neurodegenerative diseases such as Huntington’s disease. Recent studies have linked TNR expansion with oxidative DNA damage and base excision repair (BER). In this research, we provided the first evidence that oxidative DNA damage can induce CAG repeat deletion/contraction via BER. We found that BER of an oxidized DNA base lesion, 8-oxoguanine in a CAG repeat tract, resulted in the formation of a CTG hairpin at the template strand. DNA polymerase β (pol b) then skipped over the hairpin creating a 5’-flap that was cleaved by flap endonuclease 1 (FEN1) leading to CAG repeat deletion. To further investigate whether BER may help to shorten an expanded TNR tract, we examined BER in a CAG repeat hairpin loop. We found that 8-oxoguanine DNA glycosylase removed the oxidized base located in the loop region of the hairpin leaving an abasic site. Apurinic/apyrimidinic (AP) endonuclease 1 then incised the 5’-end of the abasic site leaving a nick in the loop. This further converted the hairpin into an intermediate with a 3’-flap and a 5’-flap. As a 5’-3’ endonuclease, FEN1 cleaved the 5’-flap, whereas a 3’-5’ endonuclease, Mus81/Eme1, removed the 3’-flap. The coordination between FEN1 and Mus81/Eme1 ultimately resulted in removal of a CAG repeat hairpin attenuating or preventing TNR expansion. To further explore if pol β bypass of an oxidized base lesion, 5’,8-cyclodeoxyadenosine, may affect TNR instability, we examined pol β DNA synthesis in bypassing this base lesion and found that the lesion preferentially induced TNR deletion during BER and Okazaki fragment maturation. The repeat deletion was mediated by the formation of a loop in the template strand induced specifically by the damage. Pol β then skipped over the loop structure creating a 5’-flap that was efficiently removed by FEN1 leading to repeat deletion. Our study demonstrates that pol β-mediated BER plays an important role in mediating TNR deletion and removing a TNR hairpin to prevent TNR expansion. Our research provides a molecular basis for further developing BER as a target for prevention and treatment of neurodegenerative diseases caused by TNR expansion.
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Las características urbanísticas de las expansiones urbanas postindustriales desarrolladas en las últimas décadas en numerosas ciudades españolas presentan diferencias notables con las de barrios centrales y pericentrales más compactos preexistentes. Con el fin de estudiar cómo son percibidas por los ciudadanos de Vitoria-Gasteiz dichas diferencias urbanísticas, se realizaron 250 encuestas a residentes en los barrios compactos de la ciudad sobre sus preferencias entre el paisaje urbano de su barrio y el de los barrios postindustriales. Se observó que la gran mayoría de los encuestados prefirieron su compacto barrio en aspectos de sociabilidad, accesibilidad a servicios y bienestar global. Los resultados obtenidos se contrastaron con los de un estudio previo en el que una encuesta similar fue realizada a residentes en un barrio postindustrial. Se discuten las implicaciones de los resultados para desarrollar una práctica urbanística más sostenible y que integre la percepción de los usuarios de la ciudad.
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Kragten, L. (2016). Excelleren in een Passende Omgeving: een Verkennend Onderzoek naar Wenselijke Karakteristieken van Excellentieprogramma’s voor het Middelbaar Beroepsonderwijs. Juni, 21, 2016, Heerlen, Nederland: Open Universiteit.