Análise da expressão das proteínas celulares p53, p16 e ciclina D1 em amostras de tumores penianos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação parasitológica em amostras de alfaces (Lactuca sativa var. crispa) comercializadas no município de Quatá, São Paulo, Brasil

There is little research on the practices of sanitary inspection in the chain of production of vegetables to the consumer, especially those eaten raw, they are liable to serve microorganism such as bacteria, fungi and parasites, contributing to possible health hazards. The aim of this study was to assess qualitatively contamination by parasites and / or commensals of medical interest in lettuce leaves (Lactuca sativa) fresh market in the municipality of Quata Sao Paulo. A total of 15 random samples were analyzed every other day of the three different places that sell vegetables a grocery store, a supermarket and a vegetable garden during the month of May 2011. The parasites and / or commensals found in lettuce were Entamoeba coli (67%), Entamoeba histolytica (20%), Giardia sp (13%) and Ascaris lumbricoides (7%). The analysis showed the presence of parasites and / or commensals in all samples, except in the cultivated garden which showed poor sanitary conditions, probably due to contamination in the shipping and handling by third parties in supermarket and grocery store. The parasite monitoring sanitary conditions of vegetables sold in urban environments becomes relevant for preventive measures to avoid the continued parasitic cycle and possible future health complications.

Número de amostras na análise geoestatística e na krigagem de mapas de atributos do solo

The objective of this study was to analyze different intensities of soil sampling for accuracy in geostatistical analysis and interpolation maps for precision agriculture in the sugarcane area. Soil samples were collected at two regular grids at a depth of 0.00 to 0.20m for granulometric analysis (area 1) and soil fertility (area 2). We compared soil sampling intensities: 208, 105, 58 and 24 points in Area 1 and 206, 102 and 53 points in Area 2. The data were submitted to descriptive analysis and geostatistics. The variograms constructed with 105 points didn't differ from variograms with 208 points, which doesn't occur for 58 and 24 points. The increase of sampling interval and reducing the number of points promote greater error in kriging. Samples with more than 100 points per area did not result in significant improvements in the error of kriging, or differed in the amount of fertilizer applied to the field.

Caracterização de Aeromonas spp isoladas de amostras de ostras e água por método microbiológico e molecular

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Desenvolvimento e validação de método analítico empregando cromatografia gasosa ultrarrápida para quantificação de teor total de ésteres em amostras de biodiesel

Pós-graduação em Química - IQ

Detecção de DNA de micobactérias dos complexos M. tuberculosis e M. avium em amostras parafinadas de pacientes transplantados renais

Introduction: Tuberculosis (TB) is a granulomatous disease caused by Mycobacterium tuberculosis. The genus Mycobacteriumhas two different complexes: M. tuberculosis Complex and M. avium Complex. This is a global health epidemic and remains a major global health problem, besides, the clinical severity of TB is significantly higher in transplanted patients. The detection of these mycobacteria complexes in transplanted patients, by molecular methods, is fundamental for quick treatment of patients and can contribute for rapid and accuracy of diagnosis. Objective: To detect mycobacteria DNA of M. tuberculosis and M. avium Complexes in formalin fixed paraffin-embedded samples (FFPE) of two patients groups: non transplanted and transplanted. Materials and Methods: The study includes 40 FFPE biopsies separated in four groups: NTP – presence of epithelioid granuloma and positive ZN, non-transplanted patients – 9 samples; NTN - presence of epithelioid granuloma and negative ZN, non-transplanted patients – 10 samples; TP – positive ZN, transplanted patients – 9 samples; TN – negative ZN, transplanted patients – 7 samples. Sections were cut for DNA extraction. Samples were submitted to PCR for amplification of: a) β-actin, b) IS6110 insertion and c) IS1245 insertion. DNA evaluation was made by spectrophotometry and efficiency and PCR analysis was made by agarose gels under UV light. Results: In all samples processed, 97.1% were positive for human β-actin gene. In22.2% of NTP group were found the IS6110 insertion sequencebut the IS1245 wasn´t. In the NTN group was not found any sequence. In theTP group, 11.1% of the samples were positive for IS6110 and also 11,1% werepositive for IS1245. In the TN group, 14.3% of the samples were positive forIS6110 and for IS1245, 14.3% was also positive. Conclusion: Although factors such as DNA degradation after formalin fixation and paraffin embedding, were possible to detect DNA from the human gene ...

Aplicação de técnicas eletroforéticas em amostras de musculos de aves de interesse comercial e de Tilápias (Oreochromis niloticus)

Junto ao Laboratório de Fracionamento de Proteínas, desenvolveu atividades aplicando técnicas eletroforéticas (gel de agarose, eletroforese nativa em gel de poliacrilamida) em amostras de músculos de aves de interesse comercial (frangos, perus e avestruzes), tendo como co-orientador o Prof. Paulo Tadeu Figueira da Faculdade de Medicina Veterinária, PUC/PR - Toledo, onde desenvolveu atividades de análise de géis de eletroforese. Aplicou as técnicas de eletroforeses citadas em amostras de músculos e soro sanguíneo (em andamento) de tilápias (Oreochromis niloticus), bem como desenvolveu atividades de análises computacionais (VDS – PHARMACIA) e estatísticas (ASSISTAT) nos dados obtidos, resultando na participação em 7 congressos com apresentação de trabalhos. Cursou a disciplina de Genética, como aluno especial, junto à turma de Licenciatura em Ciências Biológicas, num total de 8 créditos, sendo aprovado com média 7,2

Pesquisa do Paracoccidioides brasiliensis em aerossóis ambientais: padronização de metodologia e avaliação de amostras relacionadas ao habitat de tatus positivos

P.brasiliensis é o agente etiológico da Paracoccidioidomicose, micose sistêmica mais importante na América Latina. A fase saprofítica produtora dos propágulos infectantes e outros aspectos ecológicos deste patógeno são ainda pouco conhecidos, o que impede a adoção de medidas preventivas. Diversas evidências indicam que o fungo se desenvolve no solo, porém o seu isolamento a partir destes materiais é raro e apenas eventual. O presente projeto visou desenvolver uma metodologia para obtenção de amostras ambientais na forma de aerossóis em locais onde a ocorrência do fungo já foi evidenciada pelo seu isolamento em tatus Dasypus novemcinctus e avaliar a ocorrência do patógeno nestes materiais por cultura direta e por biologia molecular em reações de PCR com “primers” específicos, já desenvolvidos em nosso laboratório. Para tal, avaliamos o padrão de crescimento do P. brasiliensis em quatro diferentes meios ditos como seletivos. Entre estes meios, encontra-se o Meio Sólido de amônia que, por nunca ter sido testado em P. brasiliensis, necessitava de testes quanto à viabilidade de uso e ajuste de concentração. Depois de testado a funcionalidade dos meios e observado o padrão de crescimento que o fungo exibe nesses diferentes meios, partimos para a tentativa de isolamento ambiental do P. brasiliensis através de amostras de solo em forma de aerossóis com o auxílio deles. Tendo em vista os resultados obtidos, optamos, também, por realizar a coleta de teias de aranhas, devido a grande aderência que exerce sobre aerossóis ambientais. Os isolados de P. brasiliensis cultivados apresentaram desenvolvimento semelhante nos quatro meios utilizados, indicando a possibilidade de uso destes meios seletivos para estudos ambientais. P.brasiliensis não foi isolado nestas amostras ambientais... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Prevalência da excreção e caracterização molecular do poliomavírus humano JC em amostras de urina de pacientes com aids sem leucoencefalopatia multifocal pro-gressiva

The human poliomavirus is the etiologic agente of Progressive multifocal leukoencephalopathy (PML), a disease characterized by focal lesions not expansives of the central nervous system that develops in imunocompromissed patients, specially people with aids. The main aim of the study was to evalute the prevalence of the JCV excretion in urine samples of patients with aids, without PML, to compare two JCV DNA detection techniques through of two diferents genomic regions and to evaluate the genotypic characterization of the positive samples. A total of 75 samples were colected in the Instituto de Infectologia Emílio Ribas, in Sao Paulo, Brazil, between may and november, 2009. To detect the JC virus it was made the DNA extraction and then the polimerase chain reaction (PCR). Firstly a fragment of 215 bp was amplified, which corresponds to the codifying gene of the strutural protein of de JC vírus capsid VP1. All the samples were later submitted to another PCR that uses a pair of primers complementaries to the early region of the JCV (T antigen) amplifying a fragment of 173 bp. Followed by the digestion of the amplified product with the restriction enzime BamH1, resulting in two smaller fragments (120 bp and 53 bp). The JC vírus was detected in 53 samples, for both techniques (70,7% for VP1 PCR, and the restriction enzime BamH1), 34/46 were men (73,9%) and 19/29 were women (65,5%). The JCV excretion was higher in individuals that were over 46 years old. Regarding the seven genotypes described in the literature, the ones that were more prevalent among the JC positive patients were 3B and 3A with 10 samples each (21,0%), the 2B with 9 samples (19,0%) and genotype 6, with six samples (13,0%). As in the brown patients as the white ones, the most prevalent genotype was 3B. In the present study it was observed a high prevalence of JCV DNA (70,7%) and the genotype 3 (43,0%)... (Complete abstract click electronic access below)

Determinação de Levamisol em amostras de cocaína na cidade de Campinas e região

A cocaína, alcalóide extraído das folhas de coca, apresenta antigo histórico de uso para diversas finalidades. O uso vinculado à fim recreacional se dá na década de 70 e permanece até hoje com variações espaciais e temporais. Muitas são as substâncias usadas como adulterantes à cocaína, ou seja, adicionadas com o propósito de mimetizar ou potencializar o efeito da mesma, e o levamisol, antiparasitário de uso humano e veterinário no Brasil, tem sido reportado mundialmente, com notável crescimento desde 2003. Desde 2009, casos de agranulocitose e vasculite crônica tem sido associado à usuários de cocaína com o levamisol como adulterante. Visto o aumento no consumo de cocaína no Brasil entre 2010 e 2011, o presente trabalho teve como objetivo determinar a prevalência desta adulteração na cidade de Campinas e região entre outubro de 2012 e junho de 2013, fazendo uso de CCDC e CG/MS. As análises em CCDC mostraram um aumento na prevalência da adulteração de 15,5% para 26,5% no período de estudo. Os resultados encontrados reiteram a importância da discussão e difusão do tema perante a comunidade médica, principalmente, a fim de tomarem decisões mais acertadas frente aos casos envolvendo os usuários.

Desenvolvimento de métodos analíticos para determinação de fósforo e selênio em amostras biológicas

A determinação de fósforo em amostras de rações e fezes de peixes por espectrometria no visível e de selênio em amostras vegetais de cultura orgânica por espectrometria de absorção atômica em forno de grafite (GFAAS) representa o foco principal do trabalho desenvolvido. O fósforo e o selênio são macro e micronutrientes importantes para a nutrição vegetal e animal, no entanto, se utilizados sem um controle adequado podem poluir o solo e os recursos hídricos, atingindo todo o meio ambiente. Dessa forma, foram desenvolvidos métodos para extração dos analitos que diminuíram significativamente os resíduos químicos produzidos nas determinações de rotina feitas na área de nutrição de plantas e de piscicultura. No caso do fósforo foram otimizados parâmetros físico-químicos para extração desse elemento por ultra-som e posterior quantificação por espectrofotometria no visível. No caso do selênio foram otimizados parâmetros físico-químicos para amostragem em suspensão (slurry) e determinação direta por GFAAS. Os principais parâmetros físico-químicos avaliados e otimizados foram: granulometria da amostra sólida, tempo e potência de sonificação, soluções extratoras, agentes surfactantes para estabilização do slurry; temperatura de pirólise e atomização, tipos de modificadores químicos e volume de amostragem nas determinações de selênio por GFAAS e tempo de reação e relação ao agente cromogênico/volume de amostra nas determinações espectrofotométricas de fósforo. O método de extração por ultra-som foi aplicado na determinação de fósforo biodisponível em amostras de rações de peixes e o método de amostragem em suspensão para a determinação de selênio em amostras de vegetais orgânicos

Caracterização físico-química e microbiológica de diferentes amostras de uma precipitação coletada e armazenada após passagem por telhado

The decreasing availability of drinking water is a problem that has existed for a long time and continues to be aggravated, especially by the increase in population and pollution of water resources. Due to the need to find alternatives in order to ensure water supplies in sufficient quantity and quality for consumption by populations, rainwater collection arises as an alternative. The present study was developed in Ipeúna-SP, consisting of an experimental system of collection and storage of rainwater on the roofs of buildings. Samples of the same precipitation, differentiated through the initial disposal and treatment of the collected water, were stored during a period of six months and monitored through physical, chemical and microbiological analyses. With the results, the qualitative characteristics of the stored precipitation were found, the main differences among the samples were identified and the needs of treatment were studied.

Desenvolvimento de metodologias analíticas para determinação de selênio, cobre e manganês por GFAAS em amostras de vegetais de cultura orgânica e convencional utilizando extração por ultra-som

No presente trabalho é proposto um método para determinação de cobre, manganês e selênio em amostras de vegetais de cultura orgânica e convencional utilizando ultra-som no processo de extração dos analitos e posterior quantificação por espectrometria de absorção atômica em forno de grafite (GFAAS). Utilizando como solução extratora HCl 0,10 mol L-1, as condições ótimas de extração estabelecidas foram: massa de amostra de 100 mg; granulometria da amostra < 60 m; tempo de sonificação de cinco ciclos de 40 s e potência de sonificação de 136 W. As determinações dos analitos por GFAAS foram feitas utilizando-se temperaturas de secagem de 90-250 oC, temperatura de pirólise de 1300 oC, temperatura de atomização de 2300 oC e temperatura de limpeza de 2800 oC. Foi utilizado como modificador químico nitrato de paládio co-injetado junto com as amostras e tungstênio como modificador permanente. A exatidão e precisão do método de extração proposto foram avaliadas utilizando-se padrão certificado Corn Bran, RM 8433 – National Institute of Standards and Technology. Os resultados obtidos pelo método de extração por ultra-som mostraram-se equivalentes aos obtidos pelo método utilizando-se mineralização ácida das amostras em forno de microondas. No entanto, a metodologia proposta diminui consideravelmente o tempo de análise, o que favorece a velocidade analítica. Além disso, a quantidade de resíduos gerados para o ambiente também é bastante minimizada

Otimização de um método cromatográfico de análise de pesticidas organoclorados em amostras de peixes

Considering that persistent organic pollutants (POPs) including synthetic substances belonging to differents organic functions, including organochlorine pesticides (OCPs), which are the most persistent and bioaccumulative, with high toxicity to humans and animals. Accordingly environmental and biological monitoring is necessary, in order to have greater control regarding the irresponsible use of these products. Though there are several analytical methodology reported in the literature to make determinations of this pesticide, they present some difficulties, requiring several steps to make the clean up of the sample. The proposed project aims to optimize a new analytical method that allows to perform the extraction of organochlorine pesticides in fish tissues, employing acetone as solvent assisted by ultrasound bath, making the method more quickly and not requiringfurther steps to purify the sample. Were analyzed the recoveries of pesticides in study in samples of tilapia average values: Heptachlor=84,7±9,8%; Aldrin=87,3±3,5%; Endosulfan=101,4±18,6%; DDE= 90,5± 3,3%, Endrin=102,2±13,8%., DDD=92,1±19,9%; DDT=90,8±6,8%. The real samples showed values granted for our legislation and low values of error

Caracterização morfológica e fenotípica de leveduras do gênero Cryptococcus com ênfase na pesquisa de Cryptococcus neoormans isoladas de amostras de água de mar e areia de três ambientes costeiros do estado de São Paulo: Canal de São Sebastião, Baixada Santista e Ubatuba

The yeast Cryptococcus neoformans is the etiologic agent of cryptococcosis, an infectious cosmopolitan disease that affects humans. Although rare, this disease is potentially fatal, especially for immunocompromised hosts. This pathogen is frequently isolated from excrements of pigeons and parrots, with many environmental sources such as birds, pigeon droppings, eucalyptus leaves, decaying trees, towers, churches and places of storage of grain (the port area). The isolation of this microorganism has been obtained also from the aquatic environment. The identification of environmental sources is needed to protect human health, especially susceptible populations such as immunocompromised. Therefore, this study investigated the presence of Cryptococcus neoformans in yeast isolates obtained from samples of sea water and sand from three regions of São Paulo: São Sebastião Channel, Santos and Ubatuba. Isolates were analyzed according to micro-and macroscopic characteristics and biochemical tests: microculture, urease, ink nankin, auxanograma, zymogram and phenol. We analyzed 199 isolates, 175 of which had features suggestive for Cryptococcus spp. in microculture. All these 175 isolates were sown in the Christensen urea middle to verify the production of urease and submitted to the technique nankin ink to visualize the capsule. Of these, only 24 were selected for the next test that was the auxanograma (assimilation of carbohydrate and nitrogen). Of the 24, 10 were tested in zymograms (fermented sugar), from which 5 were selected for the phenoloxidase test in medium containing dopamine. None of the 5 isolates tested had black or brown color characteristic of Cryptococcus neoformans. According to these tests, we arrived at 5 isolates identified to the genus Cryptococcus, but not the neoformans specie