Structure and conformation of the calcium complex of cyclo(Ala-Leu-Pro-Gly)2 in two crystal forms

Crystal structures of two different forms of the calcium perchlorate complex of cyclo(Ala-Leu-Pro-Gly)2 have been determined and refined using X-ray crystallographic techniques. Orthorhombic form: C32H52N8O8.Ca(ClO4)2.7H2O.2CH3OH, space group C222(1), a = 14.366, b = 18.653, c = 19.824 A, Z = 4, R = 0.068 for 2208 observed reflections. Monoclinic form: C32H52N8O8.Ca(ClO4)2.4H2O, space group C2, a = 21.096, b = 10.182, c = 11.256 A, beta = 103.33 degrees, Z = 2, R = 0.075 for 2165 observed reflections. The cyclic peptide molecule in both the structures has the form of a twofold symmetric, slightly elongated bowl. Type II' beta-turns, involving Gly and Ala at the corners, exist at the two ends of the molecule. The interior of the molecule is substantially hydrophilic, and the external surface of the bowl is largely hydrophobic. The calcium ion is located at the centre of the mouth of the bowl-like molecule. In both crystal forms, four peptide carbonyl oxygens from the cyclic peptide and two solvent oxygens coordinate to the metal ion. The mode of complexation may be described as incomplete encapsulation as, for example, in the case of metal complexes of antamanide. In the crystal structures the complex ions are held together by hydrogen bonds involving perchlorate ions and water molecules. The molecular structure observed in the crystals is entirely consistent with the results of solution studies, which also indicate the conformation of the cyclic peptide in the complex to be similar to that of the uncomplexed molecule.

A novel ``pro-sensitizer'' based sensing of enzymes using Tb(III) luminescence in a hydrogel matrix

Chemically synthesized ``pro-sensitizers'' release the sensitizer in the presence of lipase or beta-glucosidase, triggering a significant luminescence response from a lanthanide based hydrogel.

Cytotoxic and pro-apoptotic effects of Abrus precatorius L. on human metastatic breast cancer cell line, MDA-MB-231

Abrus precatorius is highly regarded as a universal panacea in the herbal medicine with diverse pharmacological activity spectra. This experimental study on the mechanism of the anticancer activity of A. precatorius leaf extracts, may offer new evidence for A. precatorius in the treatment of breast cancer in clinical practice. Cell death was determined by using MTT assay. Further analyses were carried out by doing DNA laddering, PARP cleavage, FACS, semi-quantitative RT-PCR and detection of cellular reactive oxygen species (ROS) by DCFDA assay. A. precatorius showed very striking inhibition on MDA-MB-231 cells. MTT assay showed more than 75 % inhibition of the cells and treated cells indicated visible laddering pattern with thick compact band. PARP cleavage produced 89 kDa cleavage product which was associated with apoptosis. Flow cytometer exhibited a sub-G0/G1 peak as an indicative of apoptosis. mRNA expression level of apoptosis-related genes p21 and p53 was markedly increased in cells treated with the extract as compared to control. The up-regulation of p21 and p53 may be the molecular mechanisms by which A. precatorius extract which induces apoptosis. An increase in the concentration of A. precatorius extract does not generate ROS, instead it reduces ROS formation in MDA-MB-231 cells, as evident from the shift in fluorescence below untreated control. This is the first report showing that A. precatorius leaf extract exhibits a growth inhibitory effect by induction of apoptosis in MDA-MB-231 cells. Our results contribute towards validation of the A. precatorius extract as a potentially effective chemopreventive or therapeutic agent against breast cancer.

Crystal-structure analysis of cis-X-pro-containing peptidomimetics: understanding the steric interactions at cis X-pro amide bonds

Catch the twist: The cis Piv-Pro conformer (Piv=pivaloyl) of peptides is no longer inaccessible. Any cis X-Pro tertiary-amide-bond conformer can be stabilized in crystals of peptides by accommodating the unavoidable distortion of the dihedral angle of the peptide bond to the carbonyl group of the Pro residue (see picture), in this case through ni−1→πi* interactions. Steric clashes were not observed in the cis Piv-Pro rotamers studied.

Steric and Electronic Interactions Controlling the cis/trans Isomer Equilibrium at X-Pro Tertiary Amide Motifs in Solution

A systematic understanding of the noncovalent interactions that influence the structures of the cis conformers and the equilibrium between the cis and the trans conformers, of the X-Pro tertiary amide motifs, is presented based on analyses of H-1-, C-13-NMR and FTIR absorption spectra of two sets of homologous peptides, X-Pro-Aib-OMe and X-Pro-NH-Me (where X is acetyl, propionyl, isobutyryl and pivaloyl), in solvents of varying polarities. First, this work shows that the cis conformers of any X-Pro tertiary amide motif, including Piv-Pro, are accessible in the new motifs X-Pro-Aib-OMe, in solution. These conformers are uniquely observable by FTIR spectroscopy at ambient temperatures and by NMR spectroscopy from temperatures as high as 273 K. This is made possible by the persistent presence of n(i-1i)* interactions at Aib, which also influence the disappearance of steric effects at these cis X-Pro rotamers. Second, contrary to conventional understanding, the energy contribution of steric effects to the cis/trans equilibrium at the X-Pro motifs is found to be nonvariant (0.54 +/- 0.02 kcal/mol) with increase in steric bulk on the X group. Third, the current studies provide direct evidence for the weak intramolecular interactions namely the n(i-1i)*, the N-Pro center dot center dot center dot Hi+1 (C(5)a), and the C-7 hydrogen bond that operate and influence the structures, stabilities, and dynamics between different conformational states of X-Pro tertiary amide motifs. NMR and IR spectral data suggest that the cis conformers of X-Pro motifs are ensembles of short-lived rotamers about the C-X-N-Pro bond. (c) 2013 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers 101: 66-77, 2014.

Unconjugated Bilirubin exerts Pro-Apoptotic Effect on Platelets via p38-MAPK activation

Thrombocytopenia is one of the most frequently observed secondary complications in many pathological conditions including liver diseases, where hyperbilirubinemia is very common. The present study sought to find the cause of thrombocytopenia in unconjugated hyperbilirubinemic conditions. Unconjugated bilirubin (UCB), an end-product of heme catabolism, is known to have pro-oxidative and cytotoxic effects at high serum concentration. We investigated the molecular mechanism underlying the pro-apoptotic effect of UCB on human platelets in vitro, and followed it up with studies in phenylhydrazine-induced hyperbilirubinemic rat model and hyperbilirubinemic human subjects. UCB is indeed found to significantly induce platelet apoptotic events including elevated endogenous reactive oxygen species generation, mitochondrial membrane depolarization, increased intracellular calcium levels, cardiolipin peroxidation and phosphatidylserine externalization (p < 0.001) as evident by FACS analysis. The immunoblots show the elevated levels of cytosolic cytochrome c and caspase activation in UCB-treated platelets. Further, UCB is found to induce mitochondrial ROS generation leading to p38 activation, followed by downstream activation of p53, ultimately resulting in altered expression of Bcl-2 and Bax proteins as evident from immunoblotting. All these parameters conclude that elevated unconjugated bilirubin causes thrombocytopenia by stimulating platelet apoptosis via mitochondrial ROS-induced p38 and p53 activation.

Aplicación e instrumentalización de la doctrina de seguridad nacional en Colombia (1978- 1982) : efectos en materia de derechos humanos

Los estudios sobre seguridad en Colombia han incorporado en sus análisis las implicaciones políticas que la seguridad tiene para la consolidación de la democracia, la ciudadanía, la memoria, la verdad o los Derechos Humanos. Por esta razón, este artículo analiza la primera política estatal sobre seguridad que se implementó entre 1978 a 1982, conocida como el Estatuto de Seguridad y los efectos que tuvo en la institucionalización de la protección y defensa de los Derechos Humanos. El texto esta dividido en tres partes: La primera parte, analiza la instrumentalización del Estatuto a través de las relaciones cívico-militares, la ideologización y la ocupación y administración de las instituciones; la segunda parte, los alcances del Estatuto respecto a las violaciones de los derechos fundamentales y de los procedimientos legales, así como un intento por ver este fenómeno a través de la dinámica campo-ciudad. La última parte, explica el desmantelamiento del Estatuto en las postrimerías del gobierno en 1982.

Instrumentos musicales Guane : música precolombina de Santander, Colombia

Resumen: Los hallazgos de instrumentos musicales en entierros y cuevas de Santanderhan permitido reconstruir algunas de las características del arte musical Guane. El grupo de artefactos estudiado esta compuesto porocho quenas de caña, una quena de hueso, una ocarina de cerámica, una ocarina de caña, una zampoña de hueso y unas maracas; estos instrumentos son la única evidenciaen existencia de la práctica musical Guane más allá de los escritos realizados por los cronistas españoles, por lo que han sido estudiados y consignados aún cuando algunos presentan un avanzado estado de deterioro. El estudio acústico y la observación realizada con la aprobación de las instituciones en las cuales reposan estos artefactos han permitido obtenerinformación acerca de la organología, las técnicas de construcción y organización modal de los instrumentos, con lo cual se diluyen las nociones de una cultura musical caótica para dar paso al encuentro de los sistemas sonoros específicos utilizados por esta comunidad prehispánica.

Ética en la investigación psicológica : una mirada a los códigos de ética de Argentina, Brasil y Colombia

Resumen: En esta propuesta se discuten las consideraciones éticas sobre la investigación, hechas en tres códigos, a saber, la ley 1090 de 2006, que rige el ejercicio profesional del psicólogo en Colombia, el Código de Ética Profissional do Psicólogo do Conselho Federal de Psicología en Brasil y el Código Nacional de Ética de la Federación de Psicólogos de la República Argentina. El análisis de los preceptos sobre trato con personas, consentimiento informado y manejo de información, así como las investigaciones con animales, permiten apreciar carencias y fortalezas en cada país, además de las particularidades propias de una concepción del rol del psicólogo como investigador en la sociedad actual.

Ensayo : contexto político-legislativo de la crianza en Colombia: una reflexión psicológica

Este ensayo propone que la crianza debe ser objeto de renovada investigación. Esto con el fin de que una forma de crianza llamada humanizada, que es aquella en la que se educa con base en el reconocimiento de los derechos de los niños y adolescentes, se promocione y se posicione en las políticas sociales. Para ello se exponen someramente las condiciones político-legislativas colombianas e internacionales.

La economía familiar en sistemas de producción en comunidades del área de desarrollo territorial (ADT) del Municipio de Matigúas Matagalpa: Pasantías realizadas en Abril - Octubre en Fundación Ayuda en Acción proyecto " Desarrollo de la Economía Familiar (DEF.)"

Como una forma de culminación de estudios de la carrera de Licenciatura en Desarrollo Rural, las pasantías han sido realizadas en Fundación Ayuda en Acción (AeA), en el Área de Desarrollo Territorial (ADT) del Municipio de Matiguás-Matagalpa, en el período comprendido de Abril a Octubre del 2014. La Fundación AeA es una organización No Gubernamental de Desarrollo (ONGD) independiente, aconfesional y apartidista, fundada en España en 1981. Actualmente trabaja en 21 países en Asía, África y América Latina. En Nicaragua, la Fundación AeA está presente en: Matagalpa: Matiguás, Río Blanco y Tuma-La Dalia, Región Autónoma del Atlántico Sur (RAAS): Kukra Hill, León: Telica y Quezalguaque, Boaco: Boaco y Camoapa, Madriz: Totogalpa. Los proyectos que implementa son intersectoriales, articulando acciones en educación, salud, prevención de riesgos, gobernabilidad, seguridad y soberanía alimentaria entre otros, con la finalidad de impulsar cambios estructurales que contribuyan a la erradicación de la pobreza. El pasante a través de información primaria y secundaria consideró que la Fundación AeA era el organismo idóneo para realizar sus pasantías, ya que los proyectos que implementa se ajustan al perfil de la carrera de Licenciatura en Desarrollo Rural, al mismo tiempo se visualizó las condiciones favorables para su desempeño laboral. El área de trabajo asignada al pasante estuvo enfocada en proyectos productivos, dirigidos a mejorar los ingresos de las familias, dietas alimenticias, nutrición, así como la creación de conocimientos en diferentes temáticas a través capacitaciones. Entre las funciones asignadas al pasante se menciona: Realizar un estudio económico con productores sobre establecimiento de Sistemas Agroforestales (SAF) en cultivo de Cacao, fortalecer la organización comunitaria, levantar información primaria, elaborar herramientas para el levantamiento de base de datos, facilitar eventos de capacitación, reuniones, talleres e intercambios de experiencia, recolección de mensajes a niñez auspiciados, elaboración de informes, levantar información secundaria, coordinar y planificar con el equipo técnico. El análisis del estudio socioeconómico con productores sobre SAF en Cultivo de Cacao en el proyecto Desarrollo de Economía Familiar (DEF), demostró que el productor trabajando bajo un sistema técnico adecuado podrá obtener altos rendimientos productivos de hasta 15 quintales por manzana desde los 3 años. El pasante en el proyecto DEF, seleccionó en conjunto con el equipo técnico, 186 familias de 243 fichas analizadas los cuales trabajaron en componentes sobre establecimiento de SAF, hortalizas, cultivos en parra y crianza de especies menores. El proyecto de Soberanía y Seguridad Alimentaria y Nutricional (SSAN), ha estado enfocado en apoyar a 255 familias en 17 comunidades, estableciendo rubros, mejorando la calidad y consumo de agua (entrega de Rotoplas) a las familias y enriqueciendo sus conocimientos a través de capacitaciones en diferentes temas de género, comunicación asertiva, elaboración de alimentos, compartiendo experiencias con otras zonas de nuestro país. El pasante obtuvo lecciones como Identificación de diferentes actores locales en el municipio de Matiguás, como AeA, Alcaldía, Fundeser y Nitlapán, a través de iniciativa propia priorizó y gestionó las pasantías en la fundación AeA, relación con el equipo técnico recibiendo un proceso de inducción. La Fundación AeA debería continuar impartiendo talleres de capacitación en el ADT. En cuanto al desarrollo de las pasantías es necesario que desde un inicio se establezcan coordinaciones y planes entre la universidad y la institución donde el pasante desempeñara sus funciones.

Descriptions of new genera, species and subspecies of birds from Panama, Colombia, and Ecuador

The first of January, 1912, E. A. Goldman, of the Biological Survey, Department of Agriculture, was again detailed on the Smithsonian Biological Survey of the Canal Zone. He returned to Panama in January and remained there until the last of June passing most of this period in collecting birds and mammals on the slopes of Mount Pirri on the Pacific side of eastern Panama, near the Colombian border...(Document contains 27 pages)

Irakurle konpetenteak lortze aldera

[EUS] Irakurriaren ulermenaren eremu ezin zabalagora hurbiltzeko hainbat arlo ukituko ditugu artikulu honetan. Lehenik eta behin, gai honen gaineko garraztasunak arintzeko Wiki bat diseinatu dugu eta bertan hainbat atal ikuskatuko ditugu. Wiki hau, Lehen Hezkuntzako nahiz DBHko hainbat irakasleekin landu da, beti ere, irakurriaren ulermena eskolan zertan hobetu daitekeen ikusteko. Beraz, artikuluarekin batera wikiaren jarraipena egitea gomendatzen da. Hona hemen helbidea: www.letutaletu.wikispaces.com . Artikulu honek lau atal aski diferente izango ditu. Atal hauen helbururik behiena, Lehen Hezkuntzako hirugarren zikloko nahiz DBHko lehenengo zikloko irakasleei zein ikasleei irakurriaren ulermenaren gaineko hainbat lanabes praktiko ematea litzateke. Horretarako, lehen atalean, eskolak irakurriaren ulermenaren gainean diagnosia egin dezan hainbat gogoeta ekarpen gisara planteatuko dira. Bigarrenik, irakasleek klaseetan irakurketa estrategiak lan ditzaten lan eskema bat proposatuko da. Hirugarrenik, azalpen testuek dituzten zailtasunen inguruan hausnartuko da eta zailtasun horiek gainditze aldera irakasleari hainbat erreminta emango zaizkio. Eta azkenik, bibliografiak edota irakurketak errazteko hainbat ekarpen egingo dira.

Estudio de "gar" como marcador del discurso: "Pro corona" de Demóstenes

[ES] En este trabajo se estudia gár como marcador del discurso en un corpus del griego ático, el discurso Pro corona de Demóstenes. Gár introduce secciones informativas tanto en el nivel local como en el global. En el primero añade información complementaria, mientras que en el segundo indica la introducción de un nuevo tema como desarrollo de una información preliminar. La función común de gár en los dos casos es marcar la información que introduce como suplementaria.

Synthesis report with pro-poor trade research findings and policy recommandations

The purpose of the project was to investigate international trade in fisheries products and its relationship to poverty alleviation and livelihoods of poor aquatic resource users in developing countries in Asia, and to identify options to improve the effectiveness of poverty reduction through international seafood trade. The project directly addressed the EC-PREP priority area of trade and development, and indirectly provided valuable insight to two other priority areas: food security and sustainable rural development; and institutional capacity building. [PDF contains 60 pages.]