Identification of 27 Porphyra lines (Rhodophyta) by DNA fingerprinting and molecular markers

Twenty-seven Porphyra lines, including lines widely used in China, wild lines and lines introduced to China from abroad in recent years, were screened by random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique with 120 operon primers. From the generated RAPD products, 11 bands that showed stable and repeatable RAPD patterns amplified by OPC-04, OPJ-18 and OPX-06, respectively were scored and used to develop the DNA fingerprints of the 27 Porphyra lines. Moreover, the DNA fingerprinting patterns were converted into computer language expressed with two digitals, 1 and 0, which represented the presence (numbered as 1) or absence (numbered as 0) of the corresponding band, respectively. Based on the above results, computerized DNA fingerprints were constructed in which each of the 27 Porphyra lines has its unique fingerprinting pattern and can be easily distinguished from others. Software named PGI (Porphyra germplasm identification) was designed for identification of the 27 Porphyra lines. In addition, seven specific RAPD markers from seven Porphyra lines were identified and two of them were successfully converted into SCAR (sequence characterized amplification region) markers. The developed DNA fingerprinting and specific molecular markers provide useful ways for the identification, classification and resource protection of the Porphyra lines.

三峡工程截流后长江口海区表层悬沙分布与河口锋带特征

本文收集了三峡截流前后长江口海区1988－2007年间十二景landsat TM遥感影像并进行了表层悬浮泥沙含量的反演，定性的描述了长江口海区洪、枯季的表层悬沙扩散外界和高浑浊水域范围的变化趋势，分析了河流泥沙输移入海形态的变化特征及表层悬沙浓度的变化特征。 通过对2002-2004年在长江口滨外区表层悬浮体取样数据的实验室处理，揭示了三峡截流后表层悬沙的分布特征；通过多船同步定点观测捕捉到了长江口河口锋带的位置并分析了河口锋带的动力特征，结果表明：长江口河口锋位于（122o10′E，30o50′N）至（122o20′E，31o00′N）一线附近，在河口锋带位置有着较为强烈的河海相互作用，流速不符合典型的对数流速曲线，河水与海水的相互消长局限于海面以下5m的表层范围，在河口锋面区悬浮泥沙为泥沙流伏在海水之上输运。长江口悬沙体浓度由于三峡蓄水作用表现为下降趋势，悬浮体扩散范围相比截流前向口门后退，长江口滨外区羽状锋带随之向口门后退。 利用二维潮流数值模型较成功地模拟出了每个季度长江河口外的流场情况及河口锋带的发育情况，模拟表明：春、夏、秋三季河口锋带较易出现，且小潮期间发育最好。冬季长江河口海洋动力较强，易于发生海水入侵，尤其是北支；夏季是长江三角洲的主要建设期，锋带作用的存在使得泥沙大部分在锋带的内外区域沉积；春秋两季是平衡期；冬季主要是冲刷的时期。

Simultaneous enumeration of diatom, protozoa and meiobenthos from marine sediments using Ludox-QPS method

The Ludox-QPS method is a newly developed technique, which combines the Ludox HS 40 density centrifugation and quantitative protargol stain, to enumerate marine ciliates with good taxonomic resolution. We tested the method for simultaneous enumeration of diatoms, protozoa and meiobenthos and compared its extraction efficiency for meiobenthos with that of the routine Ludox-TM centrifugation and a modified protocol using Ludox HS 40. We conducted the evaluation with a sample size of 8.3 ml each from sandy, muddy-sand and muddy sediments collected from the intertidal area of the Yellow Sea in summer 2006 and spring 2007. The Ludox-QPS method not only produced high extraction efficiencies of 97 +/- 1.3% for diatoms and 97.6 +/- 0.8% for ciliates, indicating a reliable enumeration for eukaryotic microbenthos, but also produced excellent extraction efficiencies of on average 97.3% for total meiobenthos, 97.9% for nematodes and 97.8% for copepods from sands, muddy sands and mud. By contrast, the routine Ludox-TM centrifugation obtained only about 74% of total meiobenthos abundance with one extraction cycle, and the modified Ludox HS 40 centrifugation yielded on average 93% of total meiobenthos: 89.4 +/- 2.0% from sands, 93 +/- 4.1% from muddy sands and 97.1 +/- 3.0% from mud. Apart from the sediment type, sample volume was another important factor affecting the extraction efficiency for meiobenthos. The extraction rate was increased to about 96.4% when using the same modified Ludox centrifugation for a 4 ml sediment sample. Besides the excellent extraction efficiency, the Ludox-QPS method obtained higher abundances of meiobenthos, in particular nematodes, than the routine Ludox centrifugation, which frequently resulted in an uncertain loss of small meiobenthos during the sieving process. Statistical analyses demonstrated that there were no significant differences between the meiobenthos communities revealed by the Ludox-QPS method and the modified Ludox HS 40 centrifugation, showing the high efficiency of the Ludox-QPS method for simultaneous enumeration of diatom, protozoa and meiobenthos. Moreover, the comparatively high taxonomic resolution of the method, especially for diatoms and ciliates, makes it feasible to investigate microbial ecology at community level.

Imunização de bovinos com MSP1a e MSP2 recombinantes de Anaplasma marginale com CpG ODN 2006 como adjuvante, e desafio com isolado heterólogo.

A anaplasmose é uma importante enfermidade de bovinos de áreas tropicais e subtropicais do mundo, causada pela riquétsia intra-eritrocítica Anaplasma marginale. A vacinação tem sido a forma mais econômica e eficiente de controlar a anaplasmose bovina. Nos últimos anos, esses estudos têm se concentrado nas proteínas de membrana da riquétsia, sobretudo MSP1a e MSP2. Este trabalho teve como objetivos avaliar o grau de proteção induzido pelas proteínas de membrana MSP1a e MSP2 recombinantes de A. marginale, associadas com adjuvante CpG ODN 2006, perante desafio heterólogo e avaliar a resposta imune gerada. Novilhos da raça Aberdeen Angus foram imunizados três vezes com 200 ?g de MSP1a e/ou MSP2 recombinantes, associadas com CpG ODN 2006 e alúmen. Posteriormente, foram desafiados com 3 x 107 eritrócitos infectados com isolado heterólogo de A. marginale. Os animais experimentais apresentaram quadro clínico de anaplasmose (redução do volume globular, febre e riquetsemias detectáveis por distensões sangüíneas coradas). Não foram detectadas diferenças significativas entre os grupos imunizados e os controles quanto ao percentual de redução do volume globular, riquetsemias máximas e temperaturas retais máximas, indicando que as imunizações não foram protetoras. A despeito da significativa produção de IgG total contra MSP1a e MSP2, detectada no dia do desafio, os animais imunizados apresentaram produção significativa de IgG2 apenas contra MSP1a. As razões para as possíveis falhas de proteção são discutidas. Neste trabalho, é relatada a imunização de bovinos com MSP1a e MSP2 recombinantes de A. marginale, associadas com alúmen e CpG ODN 2006, e posterior desafio com isolado heterólogo, bem como a avaliação da resposta imune gerada.

PRINCIPAIS INDICADORES: AGRÍCOLAS, v. 3, n. 27, 2010.

2010

PRINCIPAIS INDICADORES: LEITE E DERIVADOS, v. 3, n. 27, 2010.

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PRINCIPAIS INDICADORES: MACROECONÔMICOS, v. 3, n. 27, 2010.

2010

Trajectory Mapping ("TM''): A New Non-Metric Scaling Technique

Trajectory Mapping "TM'' is a new scaling technique designed to recover the parameterizations, axes, and paths used to traverse a feature space. Unlike Multidimensional Scaling (MDS), there is no assumption that the space is homogenous or metric. Although some metric ordering information is obtained with TM, the main output is the feature parameterizations that partition the given domain of object samples into different categories. Following an introductory example, the technique is further illustrated using first a set of colors and then a collection of textures taken from Brodatz (1966).

Keeping Secrets in Hardware: the Microsoft Xbox(TM) Case Study

This paper discusses the hardware foundations of the cryptosystem employed by the Xbox(TM) video game console from Microsoft. A secret boot block overlay is buried within a system ASIC. This secret boot block decrypts and verifies portions of an external FLASH-type ROM. The presence of the secret boot block is camouflaged by a decoy boot block in the external ROM. The code contained within the secret boot block is transferred to the CPU in the clear over a set of high-speed busses where it can be extracted using simple custom hardware. The paper concludes with recommendations for improving the Xbox security system. One lesson of this study is that the use of a high-performance bus alone is not a sufficient security measure, given the advent of inexpensive, fast rapid prototyping services and high-performance FPGAs.

Adaptabilidade e estabilidade de cultivares de milho no Meio-Norte brasileiro, na safra 2007/2008.

Durante a safra de 2007/2008, no Meio-Norte brasileiro, foram executados ensaios de milho em blocos casualizados com três repetições para a avaliação de 42 cultivares de milho (16 variedades e 26 híbridos), objetivando conhecer a adaptabilidade e a estabilidade desses materiais para fins de recomendação. Detectaram-se, nas análises de variância conjuntas, diferenças entre as cultivares e inconsistência no comportamento nos diferentes ambientes, no que se refere à produtividade de grãos. Os híbridos apresentaram, em média, produtividade de grãos (7.382 kg ha-1) 19,0 % maior que as variedades. Entre os híbridos de melhor adaptação, os que evidenciaram adaptabilidade ampla consolidaram-se como alternativas importantes para a agricultura regional, destacando-se, entre eles, os híbridos SHS 4070 e AG 7088. As variedades que revelaram adaptabilidade ampla, a exemplo das variedades BRS Caimbé e AL 25, entre outras, têm importância fundamental nos sistemas de produção dos agricultores familiares da região.

Mapeamento e descrição do padráo de uso e cobertura da terra em municípios do sudoeste goiano a partir de imagens orbitais TM/Landsat-5.

A partir dos anos 1970, a ocupação pelo homem do espaço do centro-oeste brasileiro apresentou um elevado crescimento devido a políticas de expansão agrícola. Este fato ocorreu por meio do alto grau de mecanização agrícola e aplicação de fertilizantes, visando elevados níveis de produção em diversas localidades, como o sudoeste do Estado de Goiás. Tal predicado da alta produtividade mantém-se até os dias atuais, indicando a grande intensidade da dinâmica de uso e cobertura das terras nesta região. Desta forma, tornase necessário o conhecimento da dinâmica e distribuição espacial dos padrões de uso e cobertura da terra, podendo fornecer subsídios a ações de planejamento agrícola sobre o espaço em alguns municípios do sudoeste goiano. Para isto, imagens orbitais do satélite Landsat TM-5 foram adquiridas em diferentes períodos do ciclo agrícola ao longo de 2007. Informações complementares acerca do uso regional foram utilizadas para apoiar a interpretação e classificação, principalmente a partir dos dados obtidos em campo. Os mapas de uso e cobertura da terra para os municípios de Rio Verde, Acreúna, Santo Antônio da Barra, Santa Helena de Goiás, Montividiu e Paraúna foram obtidos utilizando ferramentas do programa Spring 4.3.3 como a segmentação de imagens, bem como o classificador semi-automático Bhattacharya Distance, sendo estabelecidas dez classes temáticas, com base na legenda proposta pelo IBGE e Corine. A análise multitemporal, assim como a segmentação mostraram-se eficientes na distinção das classes de uso e cobertura da terra da região. A classe de uso destinada ao plantio da soja apresentou o maior percentual da área, mudando para culturas safrinha, solo exposto ou pousio no inverno. Outras classes também merecem destaque como a Pastagem e a Cana-de-açúcar, que apresentaram distribuição espacial bastante concentrada. Este mapeamento fornece subsídios ao planejamento do uso e ocupação das terras na região, considerando os aspectos ambientais e sociais, assegurando maior produtividade agrícola, visando um manejo sustentável das terras e a qualidade de vida ao homem do campo.

Situação da ferrugem asiática da soja no Brasil e na América do Sul.

Nos últimos anos, a ferrugem asiática tem se tornado um dos mais relevantes problemas para o agronegócio dos principais países produtores da América do Sul, onde se destaca o Brasil. Isso porque pode causar acentuadas perdas técnicas e econômicas, que têm reflexos bastantes negativos na rentabilidade do produtor de soja e na própria economia desses países. Diante da importância dessa doença, buscou-se principalmente, levantar e analisar dados que demonstram a sua situação e os impactos técnicos e econômicos a ela associados, desde a safra 2000/01 até a de 2003/04, tanto no Brasil como na América do Sul. Para tanto, mediante reuniões técnicas, acompanhamento de propriedades rurais de diversas regiões e contatos com agentes atuantes em serviços de assistência técnica e extensão rural, no período em questão, foram identificados os principais locais de ocorrência da ferrugem e avaliados os impactos na produção e na economia decorrentes dessa doença. Após a primeira constatação no Paraguai e no estado do Paraná, em 2001, a ferrugem espalhou-se rapidamente por todo o Brasil, o Paraguai, a Bolívia e partes da Argentina, causando, assim, acentuados prejuízos ao agronegócio desses países.

Potencial das terras do Projeto Jequitaí (MG) para o cultivo de cana-de-açúcar sob três sistemas de irrigação.

Os zoneamentos agroecológicos são modelos de pacotes tecnológicos que contêm recomendações para o uso sustentável dos recursos naturais e têm sua aplicação mais oportuna na agricultura irrigada, onde é maior a intensidade de uso destes recursos, principalmente o solo. A metodologia do Sistema Brasileiro de Classificação de Terras para Irrigação (SiBCTI) teve por finalidade o desenvolvimento de uma sistemática adaptada à realidade brasileira, constituindo um sistema de suporte à decisão para subsidiar zoneamentos agroecológicos voltados a esta temática. O objetivo deste estudo foi avaliar o potencial de terras para irrigação na área do Projeto Jequitaí (MG) por meio do SiBCTI. A utilização do SiBCTI na área deste projeto indicou, no sistema de irrigação localizado, um total de 8.584 ha de terras classificadas na classe a1. No sistema de irrigação por aspersão, as terras enquadradas na classe a1 alcançaram apenas 2.635 ha; e para o sistema de irrigação superfície não houve indicação de terras enquadradas nesta classe. O resultado geral da utilização do SiBCTI para o Projeto Jequitaí mostrou haver, tanto para o sistema por aspersão quanto para localizada, um total de 39.839 ha de terras consideradas irrigáveis. Os principais fatores limitantes para os sistemas localizado e aspersão foram o pH em água e a capacidade de água disponível. Considerando o sistema por superfície, os principais fatores limitantes foram a capacidade de água disponível e a velocidade de infiltração.

Levantamento semidetalhado dos solos do Projeto Jaíba (etapa III), Estado de Minas Gerais.

Com o objetivo de prover informações dos recursos de solos da área de expansão do projeto de irrigação do Jaíba (Etapa III, que abrange 12.015 ha), a fim de possibilitar o adequado planejamento e monitoramento das atividades agrossilvipastoris e de preservação ambiental, foi realizado o levantamento de solos em nível de semidetalhe, na escala 1:50.000, conforme as normas preconizadas pela Embrapa. Predomina cobertura sedimentar cenozóica sobre rochas do Grupo Bambuí, dispostas em superfície aplainada, amplamente dominante, pontuada por dolinas e uvalas, além de um trecho de planície fluvial, ao longo do rio Ilha do Retiro. A região é caracterizada por temperaturas médias elevadas, precipitações médias abaixo dos 900 mm anuais e deficiência hídrica anual de 450 mm a 500 mm, evidenciando o curto período favorável ao crescimento das plantas em sequeiro, nas estações de primavera e verão. O ambiente seco também é evidenciado pela vegetação natural, dominada por florestas decíduas e caatingas, ou transição entre essas formações vegetais. A diferenciação de solos na área está bem condicionada ao nível topográfico relativo dos terrenos. Da superfície plana do topo da paisagem em direção às depressões semicirculares dispersas na área têm-se uma topossequência característica, com Latossolos Amarelos de caráter distrófico e textura média leve dominante na ampla área em nível topográfico superior; e solos dessa mesma classe, mas em geral com saturação por bases alta (eutróficos) e teores de argila ligeiramente mais elevados, localizados em depressões suavizadas, ou nas bordas ligeiramente inclinadas das dolinas; seguidos de Cambissolos Háplicos Tb Eutróficos (petroplínticos, endorredóxicos ou gleissólicos) de textura argilosa, em nível topográfico intermediário; aos quais se sucedem Planossolos e Gleissolos, que ocorrem associados nos fundos das dolinas e uvalas, mais rebaixadas. O vale do ribeirão Ilha do Retiro, por outro lado, apresenta um padrão de distribuição de solos distinto, com domínio de Neossolos Flúvicos, desenvolvidos de material de textura média ou argilosa de deposição aluvionar, ocorrendo nas partes topográficas inferiores, em associação com Chernossolos Rêndzicos, que tendem a predominar no segmento de nível topográfico um pouco mais alto, limitando-se no topo da encosta com a área de Latossolos Amarelos. A extensa área aplainada apresenta boas condições para agricultura intensiva com irrigação, porém com restrições decorrentes da baixa capacidade de água disponível, elevada taxa de infiltração e baixa fertilidade natural. Em direção aos níveis topográficos mais baixos, há uma tendência geral de aumentar as limitações à utilização agrícola, sobretudo em decorrência da deficiência de aeração, imposta pela dificuldade de drenagem e escoamento, assim como pela possibilidade de encharcamento por afluxo de água proveniente dos terrenos circundantes.